Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1624 |
250.6 |
12620048 |
98.0% |
12367647 |
93.0 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 232 total aligned reads displayed.
AGCACAATAACAGTATCAACCATATCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAACACCACG > NC_000913/1949343‑1949529
|
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ATCATATCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCT < SRR4302533.2638264/94‑1 (MQ=60)
ATCATATCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCT < SRR4302533.3526156/94‑1 (MQ=60)
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aaccaacccgcccgccccccggggcctaacgttgaagatgaccctcacgccgTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATG < SRR4302533.2152597/42‑1 (MQ=60)
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TCCCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGT < SRR4302533.1001803/94‑1 (MQ=60)
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TACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGT < SRR4302533.5773992/94‑1 (MQ=60)
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GCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGT > SRR4302533.4529845/1‑94 (MQ=60)
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CGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTT > SRR4302533.734831/1‑94 (MQ=60)
CGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTT > SRR4302533.4215450/1‑94 (MQ=60)
CGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTT > SRR4302533.1045584/1‑94 (MQ=60)
GCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTG > SRR4302533.1655413/1‑94 (MQ=60)
GCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTG > SRR4302533.3230796/1‑94 (MQ=60)
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ATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGG > SRR4302533.3171461/1‑94 (MQ=60)
ATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGG > SRR4302533.366048/1‑94 (MQ=60)
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TCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGG < SRR4302533.1143914/94‑1 (MQ=60)
CGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTA < SRR4302533.3398527/94‑1 (MQ=60)
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GCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGAT > SRR4302533.4924116/1‑94 (MQ=60)
CCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATC < SRR4302533.5121957/94‑1 (MQ=60)
CCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCA < SRR4302533.5545360/94‑1 (MQ=60)
CCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCA > SRR4302533.2023793/1‑94 (MQ=60)
CCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCA > SRR4302533.1973422/1‑94 (MQ=60)
CGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCAC < SRR4302533.1030247/94‑1 (MQ=60)
CGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTGGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCAC < SRR4302533.807953/94‑1 (MQ=60)
CGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCAC > SRR4302533.6077143/1‑94 (MQ=60)
GTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACC > SRR4302533.500398/1‑94 (MQ=60)
GTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACC > SRR4302533.3252072/1‑94 (MQ=60)
GTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACC > SRR4302533.3050041/1‑94 (MQ=60)
TGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCA < SRR4302533.2285559/94‑1 (MQ=60)
GTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAG < SRR4302533.1596994/94‑1 (MQ=60)
GTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAG < SRR4302533.4604165/94‑1 (MQ=60)
GTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAG < SRR4302533.3606672/94‑1 (MQ=60)
TGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGC < SRR4302533.1293164/94‑1 (MQ=60)
GCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCC < SRR4302533.4443113/94‑1 (MQ=60)
CGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCT > SRR4302533.5132959/1‑94 (MQ=60)
CGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCT < SRR4302533.4436167/94‑1 (MQ=60)
CGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCT < SRR4302533.358733/94‑1 (MQ=60)
GTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTT > SRR4302533.4895915/1‑94 (MQ=60)
TAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTG > SRR4302533.1747668/1‑94 (MQ=60)
GCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAA < SRR4302533.861535/94‑1 (MQ=60)
GCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAA < SRR4302533.1889485/94‑1 (MQ=60)
CGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAG < SRR4302533.1707315/94‑1 (MQ=60)
GTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGA < SRR4302533.2585402/94‑1 (MQ=60)
GTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGA > SRR4302533.4635736/1‑94 (MQ=60)
GTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGA < SRR4302533.1878156/94‑1 (MQ=60)
TGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAG > SRR4302533.5843523/1‑94 (MQ=60)
GGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGA > SRR4302533.1260318/1‑94 (MQ=60)
GGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGT < SRR4302533.4920068/94‑1 (MQ=60)
GAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTA > SRR4302533.4167130/1‑94 (MQ=60)
GAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTA < SRR4302533.2588133/94‑1 (MQ=60)
GAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTA < SRR4302533.4926693/94‑1 (MQ=60)
AAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTAT < SRR4302533.1221734/94‑1 (MQ=60)
AAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTAT < SRR4302533.34124/94‑1 (MQ=60)
AAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTAT < SRR4302533.2080/94‑1 (MQ=60)
AAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTAT < SRR4302533.1497747/94‑1 (MQ=60)
AGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATG < SRR4302533.1137355/94‑1 (MQ=60)
AGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATG > SRR4302533.1915964/1‑94 (MQ=60)
AGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATG < SRR4302533.5423429/94‑1 (MQ=60)
GAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATGC < SRR4302533.2492299/94‑1 (MQ=60)
AGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCC > SRR4302533.3494824/1‑94 (MQ=60)
AGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCC > SRR4302533.1301934/1‑94 (MQ=60)
GATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCC < SRR4302533.1525736/94‑1 (MQ=60)
GATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCC < SRR4302533.2495262/94‑1 (MQ=60)
ATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCG > SRR4302533.5810644/1‑94 (MQ=60)
ATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGACTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGGGCGGTTGGGGATCACTAGCCTTGAAGAGGATGCCCG > SRR4302533.1391365/1‑94 (MQ=60)
TCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGC > SRR4302533.4839312/1‑94 (MQ=60)
TCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGC > SRR4302533.3126838/1‑94 (MQ=60)
TCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGC > SRR4302533.4762451/1‑94 (MQ=60)
AACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTT > SRR4302533.2991598/1‑94 (MQ=60)
CGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTA > SRR4302533.22169/1‑94 (MQ=60)
CGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTA > SRR4302533.1407765/1‑94 (MQ=60)
GCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGAAAGGGCCGCATCCTAAATGGGTGCGGTGGGGTACCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAA < SRR4302533.4327076/94‑1 (MQ=60)
CGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAAC > SRR4302533.5607948/1‑94 (MQ=60)
GTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACT > SRR4302533.1411869/1‑94 (MQ=60)
GTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACT > SRR4302533.2108117/1‑94 (MQ=60)
GTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACT < SRR4302533.2510046/94‑1 (MQ=60)
GTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACT > SRR4302533.3001269/1‑94 (MQ=60)
TTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTG > SRR4302533.2517637/1‑94 (MQ=60)
TATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGC < SRR4302533.1436490/94‑1 (MQ=60)
TATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGC > SRR4302533.945606/1‑94 (MQ=60)
TATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGTCCGCCACTTTAACTGC < SRR4302533.2197799/94‑1 (MQ=60)
TATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGC > SRR4302533.941520/1‑94 (MQ=60)
ATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCG > SRR4302533.3663819/1‑94 (MQ=60)
ATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCG > SRR4302533.6156937/1‑94 (MQ=60)
TGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCAAAATGGGTGCGGTTGGGTATCCCCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGT < SRR4302533.4118930/94‑1 (MQ=60)
TGATTTACATCGGTCTGCCGAAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGTTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGT < SRR4302533.1395300/94‑1 (MQ=60)
TGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGT > SRR4302533.4310418/1‑94 (MQ=60)
GATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTG > SRR4302533.1216524/1‑94 (MQ=60)
ATTTACATCGTTCTCCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGG < SRR4302533.618590/94‑1 (MQ=60)
ATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGG > SRR4302533.1268299/1‑94 (MQ=60)
TTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGA > SRR4302533.4490485/1‑94 (MQ=60)
TTACATCGGTCTCCCGAAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCCCCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAG < SRR4302533.823247/94‑1 (MQ=60)
TTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCAAAATGGGTGCGTTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAG < SRR4302533.1915053/94‑1 (MQ=60)
TACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgc > SRR4302533.6064690/1‑90 (MQ=60)
CATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgg > SRR4302533.1664008/1‑88 (MQ=60)
CATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgg > SRR4302533.4949557/1‑88 (MQ=60)
CATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGC > SRR4302533.6081558/1‑94 (MQ=60)
ATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcggg > SRR4302533.1545150/1‑87 (MQ=60)
ATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcggg > SRR4302533.3310219/1‑87 (MQ=60)
ATCGGTCTACCGCAAGGGTCCCACCCTAATTGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTGGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCA < SRR4302533.1705981/94‑1 (MQ=60)
GCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAAGGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggc < SRR4302533.1022221/94‑9 (MQ=60)
GGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcct > SRR4302533.5336202/1‑84 (MQ=60)
GGTCTGCCGCAAGGGTCGCATCCTAAGTGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCTTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcat < SRR4302533.2985613/94‑11 (MQ=60)
GGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAACA > SRR4302533.4477909/1‑94 (MQ=60)
GGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAACA > SRR4302533.573051/1‑94 (MQ=60)
GTCTTCCGCAATGTTCGCATCCTAAAGGGGTGCGTTGGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAACAC < SRR4302533.3560937/94‑1 (MQ=60)
TCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAATTGGGTGCGGTTGGTTATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcattt < SRR4302533.5371286/94‑13 (MQ=60)
TCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcattt > SRR4302533.690925/1‑82 (MQ=60)
TCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAACACC > SRR4302533.35480/1‑94 (MQ=60)
CTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcatttt > SRR4302533.333396/1‑81 (MQ=60)
CTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcatttt > SRR4302533.3807313/1‑81 (MQ=60)
TGCCGCAATGGTCGCATCCAAAAGGGGTGCGGTGGGGTACCCCCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcatttta < SRR4302533.3801698/94‑15 (MQ=59)
TGCCGCAAGGGTCGCATCATAAAGGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcatttta < SRR4302533.3122010/94‑15 (MQ=60)
TGCCGAAATGGTCGCATCTTAAAGGGGTGCGGTGGGGGAGCACCAGCCTTGAAGATTAGCCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAACACCAC < SRR4302533.2700169/94‑1 (MQ=60)
CACCGCAATGGTCGCATCCTAAGTGGGTGCGGTTGGGGACCACCAGCTTAAAAGAGTGTGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAACACCAC < SRR4302533.6238172/94‑1 (MQ=60)
GCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcattttaa > SRR4302533.5252596/1‑79 (MQ=60)
GCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcattttaa > SRR4302533.1921736/1‑79 (MQ=60)
ACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAACACCACG > SRR4302533.3324322/1‑94 (MQ=60)
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AGCACAATAACAGTATCAACCATATCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAACACCACG > NC_000913/1949343‑1949529
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
