Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A0 F0 I1 R1
|
245 |
579.6 |
28867798 |
97.7% |
28203838 |
96.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,043,272 |
A→G |
S130G (AGT→GGT) |
b1978 → |
hypothetical protein |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,043,272 | 0 | A | G | 99.8%
| 2380.2
/ ‑5.3
| 606 | S130G (AGT→GGT) | b1978 | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (276/329); minor base T (0/1); total (276/330) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.97e-01 |
Only 100 of 623 total aligned reads displayed.
GGAGCGTTGGAATCGGCCCAAAGCGTTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAAGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCGGCACAAGTTAGTGAAAAAAAATTAACCCCGCCGCCGGGTAATAGCAGTGAC > NC_000913/2043179‑2043364
|
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gAGCGTTGGAATCGGCCCAAAGCGTTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGtt > 1:13274020/1‑96 (MQ=255)
aGCGTTGGAATCGGCCCAAAGCGTTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGttt < 2:4021044/96‑1 (MQ=255)
gggTTGGAATCGGCCCAAAGCGTTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGattt > 1:10041092/3‑96 (MQ=255)
gCGTTGGAATCGGCCCAAAGCGTTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGtttt > 2:8400779/1‑96 (MQ=255)
cGTTGGAATCGGCCCAAAGCGTTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTg < 2:10574145/96‑1 (MQ=255)
gTTGGAATCGGCCCAAAGCGTGGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGa > 1:11700611/1‑96 (MQ=255)
tGGAATCGGCCCAAAGCGTTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGGTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATa > 2:5026944/1‑96 (MQ=255)
tGGAATCGGCCCAAAGCGTTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATa < 1:284803/96‑1 (MQ=255)
tGGAATCGGCCCAAAGCGTTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATa > 1:8868033/1‑96 (MQ=255)
tGGAATCGGCCCAAAGCGTTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATa > 2:12735619/1‑96 (MQ=255)
gAATCGGCCCAAAGCGTTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAAt < 1:5473633/96‑1 (MQ=255)
aTCGGCACAAAGCGTTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGt < 2:74458/96‑1 (MQ=255)
tCGGCCCAAAGCGTTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTc < 1:4511703/96‑1 (MQ=255)
tCGGCCCAAAGCGTTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTc < 2:8147884/96‑1 (MQ=255)
cGGCCCAAAGCGTTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTATGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTcc < 2:10287012/96‑1 (MQ=255)
cGGCCCAAAGCGTTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTcc < 2:2194342/96‑1 (MQ=255)
cGGCCCAAAGCGTTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTcc < 2:5856101/96‑1 (MQ=255)
ggCCCAAAGCGTTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCg < 1:4172613/96‑1 (MQ=255)
gCCCAAAGCGTTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGc < 2:10897065/96‑1 (MQ=255)
gCCCAAAGCGTTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGc > 1:5054109/1‑96 (MQ=255)
aaaGCGTTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAgg < 2:1870370/96‑1 (MQ=255)
aaaGCGTTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAgg > 1:8546923/1‑96 (MQ=255)
aaGCGTTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAggg > 1:10361932/1‑96 (MQ=255)
aaGCGTTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAggg < 2:3222371/96‑1 (MQ=255)
aaGCGTTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAggg < 1:1849747/96‑1 (MQ=255)
aGCGTTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGt < 2:2813854/96‑1 (MQ=255)
gCGTTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGtg > 1:5608520/1‑96 (MQ=255)
cGTTGCCGAATGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGtga < 2:13187027/96‑1 (MQ=255)
cGTTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGtga < 1:7984485/96‑1 (MQ=255)
gTTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGtgat > 2:1507248/1‑96 (MQ=255)
gTTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGtgat > 2:6479473/1‑96 (MQ=255)
ttGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGtgatg > 1:10902407/1‑96 (MQ=255)
ttGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGtgatg > 1:6028966/1‑96 (MQ=255)
gCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGaa > 1:13789800/1‑96 (MQ=255)
gCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGaa < 2:6183355/96‑1 (MQ=255)
gCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTGCGTACGTTTGCTCGAGGGGTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGaa > 1:4019161/1‑96 (MQ=255)
ccGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAAc > 2:3840102/1‑96 (MQ=255)
aaCGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTgg < 1:9413842/96‑1 (MQ=255)
aCGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGa > 1:14311967/1‑96 (MQ=255)
cGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGAt < 1:11892061/96‑1 (MQ=255)
cGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGAt < 1:1994859/96‑1 (MQ=255)
gTTTCTGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATg < 2:1746133/96‑1 (MQ=255)
ttCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACAAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTc < 2:5637348/96‑1 (MQ=255)
tCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTcc > 2:423481/1‑96 (MQ=255)
cGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTccc < 1:12945425/96‑1 (MQ=255)
cGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTccc < 2:531572/96‑1 (MQ=255)
ggTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCg < 2:9026096/96‑1 (MQ=255)
ggTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCg > 2:14273599/1‑96 (MQ=255)
ggTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCg < 1:11453214/96‑1 (MQ=255)
tATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCGGc > 1:13950990/1‑96 (MQ=255)
aTTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCGGca > 1:6324724/1‑96 (MQ=255)
aTTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCGGca < 2:2368175/96‑1 (MQ=255)
tttCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGCGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCGGctc < 1:12096020/96‑3 (MQ=255)
tttCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCGGcac > 1:12375877/1‑96 (MQ=255)
tttCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCGGcac < 2:4566575/96‑1 (MQ=255)
tttCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCGGcac > 1:7261841/1‑96 (MQ=255)
tCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCGGCACaa < 1:11261084/96‑1 (MQ=255)
ggTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCGGCACAAGt < 1:3105417/96‑1 (MQ=255)
gTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCGGCACAAGtt < 2:3045543/96‑1 (MQ=255)
gTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCGGCACAAGtt > 2:5791842/1‑96 (MQ=255)
gTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTAGTACGTTTGCTCGAGGGTTTGATAATGTCAGCCAGGGTGATGAACTGGATGGCCCGGCACAAGtt > 2:7588684/1‑96 (MQ=255)
tGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCGGCACAAGTTa > 1:7095043/1‑96 (MQ=255)
tGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCGGCACAAGTTa < 2:11483689/96‑1 (MQ=255)
ggCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCGGCACAAGTTAg < 1:8411338/96‑1 (MQ=255)
cTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCGGCACAAGTTAGTg < 2:9577548/96‑1 (MQ=255)
tGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGACCTGGATGTCCCGGCACAAGTTAGTGa < 2:13753920/96‑1 (MQ=255)
tGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCGGCACAAGTTAGTGa < 1:1507203/96‑1 (MQ=255)
tGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCGGCACAAGTTAGTGa > 2:3462629/1‑96 (MQ=255)
tGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCGGCACAAGTTAGTGa < 1:10753518/96‑1 (MQ=255)
tGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCGGCACAAGTTAGTGa < 2:3371730/96‑1 (MQ=255)
tGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCGGCACAAGTTAGTGa < 2:1218818/96‑1 (MQ=255)
aGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCGGCACAAGTTAGTGaaa > 1:3701159/1‑96 (MQ=255)
aGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCGGCACAAGTTAGTGaaa > 1:3355276/1‑96 (MQ=255)
ttACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCGGCACAAGTTAGTGaaaaa < 2:9760255/96‑1 (MQ=255)
ttACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCAAGGGTGATGAACTGGATGTCCCGGCACAAGTTAGTGaaaaa < 2:254180/96‑1 (MQ=255)
tACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCGGCACAAGTTAGTGaaaaaa < 1:8706506/96‑1 (MQ=255)
aCGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCGGCACAAGTTAGTGaaaaaaa < 2:6820366/96‑1 (MQ=255)
aaaCTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCGGCACAAGTTAGTGAAAAAAAATTa > 2:2057144/1‑96 (MQ=255)
aaaCTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCGGCACAAGTTAGTGAAAAAAAATTa > 2:7126582/1‑96 (MQ=255)
aaaCTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCGGCACAAGTTAGTGAAAAAAAATTa > 2:10815977/1‑96 (MQ=255)
aaaCTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGGCCCGGCACAAGTTAGTGAAAAACAATTa > 1:2290823/1‑96 (MQ=255)
cTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCGGCACAAGTTAGTGAAAAAAAATTAAcc < 2:14041725/96‑1 (MQ=255)
cAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCGGCACAAGTTAGTGAAAAAAAATTAAcccc < 1:4869222/96‑1 (MQ=255)
aCCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCGGCACAAGTTAGTGAAAAAAAATTAACCccgc < 1:9803784/96‑1 (MQ=255)
ccAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGACCTGGATGTCCCGGCACAAGTTAGTGAAAAAAAATTAACCccgcc < 2:543569/96‑1 (MQ=255)
ccAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCGGCACAAGTTAGTGAAAAAAAATTAACCccgcc < 2:7052478/96‑1 (MQ=255)
ccAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCGGCACAAGTTAGTGAAAAAAAATTAACCccgcc < 2:11867324/96‑1 (MQ=255)
cAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCGGCACAAGTTAGTGAAAAAAAATTAACCccgccg > 1:899985/1‑96 (MQ=255)
aGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCGGCACAAGTTAGTGAAAAAAAATTAACCccgccgc > 2:8599508/1‑96 (MQ=255)
gTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCGGCACAAGTTAGTGAAAAAAAATTAACCccgccgcc < 1:6702318/96‑1 (MQ=255)
tCGTCCTTTTGCGCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCGCCACAAGTTAGTGAAAAAAAATTAACCCCGCCGCCggg < 1:13531053/96‑1 (MQ=255)
aCGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCGGCACAAGTTAGTGAAAAAAAATTAACCCCGCCGCCGGGTact < 1:8244573/96‑3 (MQ=255)
aCGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCGGCACAAGTTAGTGAAAAAAAATTAACCCCGCCGCCGGGTAAt < 2:11361037/96‑1 (MQ=255)
gTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCGGCACAAGTTAGTGAAAAAAAATTAACCCCGCCGCCGGGTAATAg < 1:6479473/96‑1 (MQ=255)
gTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCGGCACAAGTTAGTGAAAAAAAATTAACCCCGCCGCCGGGTAATAg > 1:5803950/1‑96 (MQ=255)
gTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGGGATGAACTGGATGTCCCGGCACAAGTTAGTGAAAAAAAATTAACCCCGCCGCCGGGTAATAg > 1:5283421/1‑96 (MQ=255)
tGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCGGCACAAGTTAGTGAAAAAAAATTAACCCCGCCGCCGGGTAATAGCAg < 1:7416988/96‑1 (MQ=255)
tGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCGGCACAAGTTAGTGAAAAAAAATTAACCCCGCCGCCGGGTAATAGCAg > 2:9312107/1‑96 (MQ=255)
gCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCGGCACAAGTTAGTGAAAAAAAATTAACCCCGCCGCCGGGTAATAGCAGt > 2:1257501/1‑96 (MQ=255)
|
GGAGCGTTGGAATCGGCCCAAAGCGTTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAAGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCGGCACAAGTTAGTGAAAAAAAATTAACCCCGCCGCCGGGTAATAGCAGTGAC > NC_000913/2043179‑2043364
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 341 total aligned reads displayed.
CACCCTTGGAGCGTTGGAATCGGCCCAAAGCGTTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAAGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCGGCACAAGTTAGTGAAAAAAAATTAACCCCGCCGCCGGGTAATAGCAGTGACAACCTCGA > NC_000913/2043172‑2043372
|
NNNCCTAGGAGCGTTGGAATCGGCCCAAAGCGTTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAGCAAGTTTCGTACGTTTGCTCGAG < SRR4302518.13478044/101‑1 (MQ=60)
CACCCTTGGAGCGTTGGAATCGGCCCAAAGCGTTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAG < SRR4302518.7028893/101‑1 (MQ=60)
CCCCTTGGAGCGTTGGAATCGGCCCAAAGCGTTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGG < SRR4302518.1231583/101‑1 (MQ=60)
ACCCTTGGAGCGTTGGAATCGGCCCAAAGCGTTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGG < SRR4302518.1019372/101‑1 (MQ=60)
ACCCTTGGAGCGTTGGAATCGGCCCAAAGCGTTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGG > SRR4302518.7245544/1‑101 (MQ=60)
NNNTTGGAGCGTTGGAATCGGCCCAAAGCGTTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGT < SRR4302518.14355442/101‑1 (MQ=60)
ACCTTGGAGCGCTGGAATCGGCCCAAAGCGTTGCCGCACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTCCGGAAATTCACCCTTTTTCGTACGTTTGCTCGAGGT < SRR4302518.674276/101‑1 (MQ=60)
CCTTGGAGCGTTGGAATCGGCCCAAAGCGTTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTT > SRR4302518.2686833/1‑101 (MQ=60)
NNNGGAGCGTTGGAATCGGCCCAAAGCGTTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGATGTTT < SRR4302518.9186538/101‑1 (MQ=60)
TTGGAGCGTTGGAATCGGCCCAAAGCGTTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTT < SRR4302518.877769/101‑1 (MQ=60)
CTGGAGCGTTGGAATCGGCCCAAAGCGTTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTT < SRR4302518.4964396/101‑1 (MQ=60)
TGGAGCGTTGGAATCGGCCCAAAGCGTTGCCGAACGTTTCGGTCTTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTNNN > SRR4302518.12463322/1‑101 (MQ=60)
NNNAGCGTTGGAATCGGCCCAAAGCGTTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTT < SRR4302518.11981316/101‑1 (MQ=60)
NNNAGCGTTGGAATCGGCCCAAAGCGTTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTG < SRR4302518.8948860/101‑1 (MQ=60)
GGAGCGTTGGAATTGGCCCAACGCCTTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAACCTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGA < SRR4302518.3351718/101‑1 (MQ=60)
GGAGCGTTGGAATCGGCCCAAAGCGTTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGA < SRR4302518.898432/101‑1 (MQ=60)
NNNCGTTGGAATCGGCCCAAAGCGTTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGAT < SRR4302518.13826761/101‑1 (MQ=60)
AAGCGTTGGAATCGGCCCAAAGCGTTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTNNN > SRR4302518.11848352/1‑101 (MQ=60)
NNNGTTGGAATCGGCCCAAAGCCTTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATA < SRR4302518.14294894/101‑1 (MQ=60)
AGCGTTGGAATCGGCCCAAAGCGTTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGTCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATA < SRR4302518.3676565/101‑1 (MQ=60)
AGCGGTGGAATCGGCCCAAAGCGTTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATA < SRR4302518.296288/101‑1 (MQ=60)
nnnttggactgggcacacagccTTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCACCCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAA < SRR4302518.13369574/79‑1 (MQ=60)
GCGTTGGAATCGGCCCAAAGCGTTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAA > SRR4302518.860703/1‑101 (MQ=60)
NNNTGGAATCGGCCCAAAGCGTTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAAT < SRR4302518.12719778/101‑1 (MQ=60)
CGTTGGAATCGGCCCAAAGCGTTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAAT < SRR4302518.5752353/101‑1 (MQ=60)
GTTGGAATCGGCCCAAAGCGTTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATG > SRR4302518.6008166/1‑101 (MQ=60)
GTTGGAATCGGCCCAAAGCGTGGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATANNN > SRR4302518.12253626/1‑101 (MQ=60)
GTTGGAATCGGCCCAAAGCGTCGCCGAACGGTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATG > SRR4302518.5632982/1‑101 (MQ=60)
TTGGAATCGGCCCAAAGCGTTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGGTTTGATAANNN > SRR4302518.9206614/1‑101 (MQ=60)
NNNGAATCGGCCCAAAGCGTTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGT < SRR4302518.12787521/101‑1 (MQ=60)
TGGAATCGGCCCAAAGCGTTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATNNN > SRR4302518.9298032/1‑101 (MQ=60)
TGGAATCGGCCCAAAGCGTTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATNNN > SRR4302518.7726477/1‑101 (MQ=60)
TAGAATCGGCCCAAAGCGTTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTC < SRR4302518.4746443/101‑1 (MQ=60)
NNNAATCGGCCCAAAGCGTTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTC < SRR4302518.14723997/101‑1 (MQ=60)
GGGAATCGGCCCAAAGCGGTGCCGAACGTTTCGGTATTTGGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGGACGTTTGCTCGAGGTTTGGATAAgggg > SRR4302518.4513200/1‑97 (MQ=60)
TGAATCGGCCCAAAGCGTTGCCGAGCGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTCCGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCC < SRR4302518.2304574/101‑1 (MQ=60)
NNNATCGGCCCAAAGCGTTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCC < SRR4302518.14044825/101‑1 (MQ=60)
NNNATCGGCCCAAAGCGTTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCC < SRR4302518.9332096/101‑1 (MQ=60)
NNNATCGGCCCAAAGCGTTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCC < SRR4302518.12983795/101‑1 (MQ=60)
NNNTCGGCCCAAAGCGTTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCAG < SRR4302518.12358949/101‑1 (MQ=60)
AATCGGCCCAAAGCGTTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGC > SRR4302518.4638175/1‑101 (MQ=60)
AATCGGCCCAAAGCGTTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGC < SRR4302518.6708376/101‑1 (MQ=60)
AATCGGCCCAAAGCGTTGCCGAACGTTTCGGTAGTTCGGTGGCTGCGGTACGCAAACTCAACCAGGTTCGTACGTTTGCTCGAGTTTTTGATAATGTCCGC > SRR4302518.1799692/1‑101 (MQ=60)
ATCGGCCCAAAGCGTTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCC < SRR4302518.855341/101‑1 (MQ=60)
ATCGGCCCAAAGCGTTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCC > SRR4302518.964106/1‑101 (MQ=60)
NNNGCCCAAAGCGTTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCA < SRR4302518.8739876/101‑1 (MQ=60)
CGGCCCAAAGCGTTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAG > SRR4302518.6496429/1‑101 (MQ=60)
GGCCCAAAGCGTTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGG > SRR4302518.5881076/1‑101 (MQ=60)
GGCCCAAAGCGTTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGATTGGTACAATTGCTCGAGGTTTTAATAATATCCTCCAGG > SRR4302518.6280069/1‑101 (MQ=60)
GCCCCAAGCGTTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGG < SRR4302518.1932921/101‑1 (MQ=60)
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GCCCAAAGCGTTGCCGAACGGTTCGGGATTTCGGTGGCTGAGGTACGCAAACTCAAACAGGTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTGTGATAATGTGCGCCAGGG > SRR4302518.5328355/1‑101 (MQ=60)
CCAAAGCGTTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACGCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTG > SRR4302518.4254814/1‑101 (MQ=60)
CAAAGCGTTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGNNN > SRR4302518.11271249/1‑101 (MQ=60)
CAAAGCGTTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGGTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGA > SRR4302518.5066613/1‑101 (MQ=60)
AAAACGTTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGGGAT > SRR4302518.342810/1‑101 (MQ=60)
AGGCGTTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGGTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGNNN > SRR4302518.11330680/1‑101 (MQ=60)
AAGCGTTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGNNN > SRR4302518.10849017/1‑101 (MQ=60)
AAGCGTTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATG > SRR4302518.3519807/1‑101 (MQ=60)
AAGCGTTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATG < SRR4302518.1759994/101‑1 (MQ=60)
AGCGTTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGGTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGA > SRR4302518.4384811/1‑101 (MQ=60)
AGCGTTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGGGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGA > SRR4302518.6675809/1‑101 (MQ=60)
GCGTTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAA > SRR4302518.5892922/1‑101 (MQ=60)
CCGTTGCCGAACGGTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATNNN > SRR4302518.14485331/1‑101 (MQ=60)
CGTTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAAC > SRR4302518.1993085/1‑101 (MQ=60)
GTTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACT > SRR4302518.3203675/1‑101 (MQ=60)
GCTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGANNN > SRR4302518.12400473/1‑101 (MQ=60)
cttCCGAACGTTTCGGTGTTTCGGTTGCTGAGTTACGCAAACCCAATCAGTTTCGTCCGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTG < SRR4302518.2553949/98‑1 (MQ=60)
TTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAANNN > SRR4302518.11413547/1‑101 (MQ=60)
TGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGG > SRR4302518.3274605/1‑101 (MQ=60)
GCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTNNN > SRR4302518.14421096/1‑101 (MQ=60)
GCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTGCGTACGTTTGCTCGAGGGGTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGA > SRR4302518.4211887/1‑101 (MQ=60)
NNNAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGAT < SRR4302518.12458240/101‑1 (MQ=60)
CCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGAT < SRR4302518.2086502/101‑1 (MQ=60)
ACGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGNNN > SRR4302518.14464760/1‑101 (MQ=60)
NNNACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATG < SRR4302518.8870968/101‑1 (MQ=60)
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NNNCGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGT < SRR4302518.12492100/101‑1 (MQ=60)
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NNNGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTC < SRR4302518.9831049/101‑1 (MQ=60)
AGCGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATNNN > SRR4302518.13758382/1‑101 (MQ=60)
ACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGNNN > SRR4302518.14973788/1‑101 (MQ=60)
NNNTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCC < SRR4302518.13545687/101‑1 (MQ=60)
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CGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCC < SRR4302518.109951/101‑1 (MQ=60)
CGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTACGCCAGGGTGATGAACTGTATGTCCG > SRR4302518.6300597/1‑101 (MQ=60)
GTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGCTAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCG < SRR4302518.2113401/101‑1 (MQ=60)
GTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCG < SRR4302518.7022921/101‑1 (MQ=60)
TTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCGG < SRR4302518.3850218/101‑1 (MQ=60)
TTCTGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCGGC < SRR4302518.6271170/101‑1 (MQ=60)
NNNGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCGGCA < SRR4302518.11371296/101‑1 (MQ=60)
NNNTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGCGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCGGCTC < SRR4302518.12671189/101‑1 (MQ=60)
CGGTTCTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCATCCAGTTTCGTACGTTTGCTCTAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCGGCAC < SRR4302518.769580/101‑1 (MQ=60)
CGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCGGNNN > SRR4302518.14537581/1‑101 (MQ=60)
GGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCGGCACA < SRR4302518.741436/101‑1 (MQ=60)
NNNTTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCGGCACAA < SRR4302518.11788168/101‑1 (MQ=60)
GTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCGGCACAG > SRR4302518.3495841/1‑101 (MQ=60)
TATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCGGCACNNN > SRR4302518.14589386/1‑101 (MQ=60)
GATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCGGCACAAG < SRR4302518.4328352/101‑1 (MQ=60)
ATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCGGCACANNN > SRR4302518.12621244/1‑101 (MQ=60)
TTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCGGCACAANNN > SRR4302518.7641074/1‑101 (MQ=60)
TTCGGTGGCTGAGTTCCGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGGCCCGGCACAAGTTA < SRR4302518.5730925/101‑1 (MQ=60)
TCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCGGCACAAGTTAG < SRR4302518.826585/101‑1 (MQ=60)
CGGTGGCTGCGTTACGCAACCTCCCCCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCCCCCGGGTGATGAACTGGATGTCCCGGCGCAAGTTAGT < SRR4302518.690975/101‑1 (MQ=60)
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CGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCGGCACAAGTTAGG > SRR4302518.783355/1‑101 (MQ=60)
NNNGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCGGCACAAGTTAGTG < SRR4302518.9037405/101‑1 (MQ=60)
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GGTGGCTGAGTTATGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCGGCACAAGTTANNN > SRR4302518.14504542/1‑101 (MQ=60)
GGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCGGCACAAGTTAGTG < SRR4302518.385806/101‑1 (MQ=60)
GGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCGGCACAAGTTAGTG < SRR4302518.5226532/101‑1 (MQ=60)
NNNGCTGAGTGACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCGGCACAAGTTAGTAA < SRR4302518.11577365/101‑1 (MQ=60)
GTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCGGCACAAGTTAGTGA < SRR4302518.1571667/101‑1 (MQ=60)
GTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCGGAACAAGTTAGNNN > SRR4302518.8797029/1‑101 (MQ=60)
TGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGGACTGGATGTCCCGGCACAAGTTAGTNNN > SRR4302518.10574700/1‑101 (MQ=60)
TGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCGGCACAAGTTAGTNNN > SRR4302518.7469441/1‑101 (MQ=60)
NNNCTGAGTTTCGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGTTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCGGCACAAGTTAGTGAA < SRR4302518.15079041/101‑1 (MQ=60)
NNNCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCGGCACAAGTTAGTGCA < SRR4302518.14932820/101‑1 (MQ=60)
NNNTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCGGCACAAGTTAGTGACA < SRR4302518.12020265/101‑1 (MQ=60)
GGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCCGGGGGATGAACTGGATGTCCCGGCACAAGTCAGTGAAA > SRR4302518.5921016/1‑101 (MQ=60)
GCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCGGCACAAGTTAGTGAAAA < SRR4302518.5285992/101‑1 (MQ=60)
GCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCGGCACAAGCTAGTGAAAA > SRR4302518.2005229/1‑101 (MQ=60)
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TGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCGGCACAAGTTAGTGAAANNN > SRR4302518.7555721/1‑101 (MQ=60)
TGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCGGCACAAGTTAGTGAAAAAA < SRR4302518.2208830/101‑1 (MQ=60)
NNNTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCGGCACAAGTTAGTGAAAAAAA < SRR4302518.7529678/101‑1 (MQ=60)
AGTTGCGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCGGCACAAGTTAGTGAAAAAAAA < SRR4302518.648951/101‑1 (MQ=60)
AGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCGGCACAAGTTAGTGAAAAAAAA > SRR4302518.5459542/1‑101 (MQ=60)
ACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCGGCACAAGTTAGTGAAAAAAAATTAA > SRR4302518.3997507/1‑101 (MQ=60)
NNNAAACTCAACCAGTTTCGTGCGTTTGCGCGAGGTTTTGATAATGTCCGCAAGGGTGATGAACTGGATGTCCCGGCACAAGTTAGTGAAAAAAAATTAAC < SRR4302518.13944527/101‑1 (MQ=60)
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CGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCGGCCCAAGTTAGTGAAAAAAAATTAAC < SRR4302518.2794127/101‑1 (MQ=60)
GCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCGGCACAAGTTAGTGAAAAAAAATTAACC > SRR4302518.797701/1‑101 (MQ=60)
GCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCGGCACAAGTTAGTGAAAAAAAATTAACC > SRR4302518.628118/1‑101 (MQ=60)
NNNACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCGGCACAAGTTAGTGAAAAAAAATTAACCC < SRR4302518.10042135/101‑1 (MQ=60)
NNNACTCAACCAGTTTCGCACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCGGCACAAGTTAGTGAAAAAAAATTAACCC < SRR4302518.11227589/101‑1 (MQ=60)
NNNCTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCCCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCGGCACAAGTTAGTGAAAAAAAATTAACCCC < SRR4302518.9578815/101‑1 (MQ=60)
AATCTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCGGCACAAGTTAGTGAAAAAAAATTAACCCC < SRR4302518.5123460/101‑1 (MQ=60)
AAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCGGCACAAGTTAGTGAAAAAAAATTAACNNN > SRR4302518.11893421/1‑101 (MQ=60)
AAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCGGCACAAGTTAGTGAAAAAAAATTAACNNN > SRR4302518.14812786/1‑101 (MQ=60)
AAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCGGCACAAGTTAGTGAAAAAAAATTAACNNN > SRR4302518.13518750/1‑101 (MQ=60)
AAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCGGCACAAGTTAGTGAAAAAAAATTAACCCC < SRR4302518.2061511/101‑1 (MQ=60)
AAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCGGCACAAGTTAGTGAAAAAAAATTAACCAC > SRR4302518.479861/1‑101 (MQ=60)
AAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGGCCCGGCACAAGTTAGTGAAAAACAATTAACCCC > SRR4302518.2402131/1‑101 (MQ=60)
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NNNCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCGGCACAAGTTAGTGAAAAAAAATTAACCCCGCCGCCGGGTAT < SRR4302518.11880042/101‑1 (MQ=60)
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NNNCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCGGCACAAGTTAGTGAAAAAAAATTAACCCCGCCGCCGGGTAA < SRR4302518.8237797/101‑1 (MQ=60)
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TCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCGGCACAAGTTAGTGAAAAAAAATTAACCCCGCCGCCGGGTAATA < SRR4302518.886699/101‑1 (MQ=60)
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GTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCGGCACAAGTTAGTGAAAAAAAATTAACCCCGCCGCCGGGTAATAGC > SRR4302518.1402517/1‑101 (MQ=60)
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NNNTTTTGATAATGTCCGCGAGGGTGATGAACTGGATGTCCCGGCACAAGTTAGTGAAAAAAAATTAACCCCGCCGCCGGGTAATAGCAGTGACAACCTCG < SRR4302518.9374731/101‑1 (MQ=60)
AGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCGGCACAAGTTAGTGAAAAAAAATTAACCCCGCCGCCGGGTAATAGCAGTGACAACCTCG > SRR4302518.4373040/1‑101 (MQ=60)
AGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCGGCACAAGTTAGTGAAAAAAAATTAACCCCGCCGCCGGGTAATAGCAGTGACAACCTCG > SRR4302518.1533090/1‑101 (MQ=60)
GGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCGGCACAAGTTAGTGAAAAAAAATTAACCCCGCCGCCGGGTAATAGCAGTGACAACCTCGA < SRR4302518.1289469/101‑1 (MQ=60)
|
CACCCTTGGAGCGTTGGAATCGGCCCAAAGCGTTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAAGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCGGCACAAGTTAGTGAAAAAAAATTAACCCCGCCGCCGGGTAATAGCAGTGACAACCTCGA > NC_000913/2043172‑2043372
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |