Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A0 F0 I1 R1
|
245 |
579.6 |
28867798 |
97.7% |
28203838 |
96.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,005,601 |
+C |
coding (237/282 nt) |
b4568 → |
hypothetical protein |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,005,600 | 1 | . | C | 99.8%
| 1947.9
/ NA
| 497 | G79A (GGC→GCC) | b4568 | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/0); major base C (266/230); minor base A (1/0); total (267/230) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 540 total aligned reads displayed.
CGGCGTAATGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGG‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTGGCG > NC_000913/4005505‑4005690
|
cagcgTAATGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTgg > 1:11093348/3‑96 (MQ=255)
ggcgTAATGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGG‑c > 1:12977951/1‑96 (MQ=255)
cgTAATGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGG‑cct < 1:9424361/96‑3 (MQ=255)
cgTAATGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGGGG‑cct > 2:4061051/1‑94 (MQ=255)
tAATGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGG‑cctgt < 2:1297237/96‑5 (MQ=255)
tGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTAtc > 2:338526/1‑96 (MQ=255)
tGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTAtc > 2:7208041/1‑96 (MQ=255)
tGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTAtc < 1:6960126/96‑1 (MQ=255)
tGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTAtc < 1:8731939/96‑1 (MQ=255)
tGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTAtc > 1:6642987/1‑96 (MQ=255)
ggTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTAtct > 1:8636615/1‑96 (MQ=255)
gTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTAtctc > 1:13357622/1‑96 (MQ=255)
gTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTAtctc > 1:6347830/1‑96 (MQ=255)
gTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTAtctc > 2:1743574/1‑96 (MQ=255)
tttGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATctct < 1:2908840/96‑1 (MQ=255)
gggCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGTATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTctgct < 2:1352300/96‑1 (MQ=255)
gggCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTctgct < 2:8244297/96‑1 (MQ=255)
cTGGGATTGCGCTGCGTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGTGGGTGGCCTTCATCTCTGCTGGa > 1:12324606/1‑96 (MQ=255)
tcggATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGGGGCCTGTATCTCTGCTGGAt > 1:3408224/3‑96 (MQ=255)
tGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGAt > 2:6470028/1‑96 (MQ=255)
tGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGAt > 2:3084973/1‑96 (MQ=255)
tGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGAt > 1:13167150/1‑96 (MQ=255)
ggATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATgg > 1:7350768/1‑96 (MQ=255)
gcgcTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGGTGGGTTAc > 2:4933981/1‑96 (MQ=255)
cgcTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTAcc < 2:13790384/96‑1 (MQ=255)
gctgctTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCa > 1:4977729/1‑96 (MQ=255)
gctgctTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCa > 1:5771893/1‑96 (MQ=255)
gctgctTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCa < 1:7171179/96‑1 (MQ=255)
gctTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGAt > 2:10924287/1‑96 (MQ=255)
ttGGCCTGCATTTGATTATCGGAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGc > 1:14231010/1‑96 (MQ=255)
ggCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGGTTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTa > 2:6694641/1‑96 (MQ=255)
gCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTAc < 1:835385/96‑1 (MQ=255)
gCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTAc > 1:11603629/1‑96 (MQ=255)
gCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGCTACCAGATGCTAc < 1:13454542/96‑1 (MQ=255)
ccTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACg < 2:13941475/96‑1 (MQ=255)
cTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACgt < 1:8048397/96‑1 (MQ=255)
tGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTCTGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACgtg < 1:11900484/96‑1 (MQ=255)
tGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACgtg > 1:2283884/1‑96 (MQ=255)
aTTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACgtggtg > 2:7714893/1‑96 (MQ=255)
tttGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGc > 2:3787877/1‑96 (MQ=255)
ttGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATATCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCa > 1:5543678/1‑96 (MQ=255)
tGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCAc > 1:12724223/1‑96 (MQ=255)
gATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACt < 1:9658279/96‑1 (MQ=255)
gATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACt < 2:14296752/96‑1 (MQ=255)
gATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACt > 1:7612155/1‑96 (MQ=255)
gATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGATACGTGGTGCAca < 1:13888834/96‑2 (MQ=255)
aTTATCGAAAAAATGGCCTGGCTTCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTCCCAGATGCTACGTGGTGCACTg < 2:6064332/96‑1 (MQ=255)
aTTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCGCTg < 2:12583165/96‑1 (MQ=255)
aTTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTg < 2:8733349/96‑1 (MQ=255)
ttATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGa > 1:1725093/1‑96 (MQ=255)
ttATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGa < 2:11299804/96‑1 (MQ=255)
ttATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGa < 2:11035744/96‑1 (MQ=255)
gaTCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGaa > 1:11347451/2‑96 (MQ=255)
cGAAATAATGGCCTGGCTGCATAAGATGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCCCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTATGTGGTGCACTGaaaaa < 1:10378988/96‑1 (MQ=255)
cGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGaaaaa < 1:2509201/96‑1 (MQ=255)
ggaaaaaTGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGaaaaaa > 1:10143519/3‑96 (MQ=255)
aaaaTGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAagag > 2:8520989/1‑96 (MQ=255)
aaTGGCCTGGCTGCATCCGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAagagcc < 1:7766023/96‑3 (MQ=255)
tGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCgg > 1:19338/1‑96 (MQ=255)
tGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCgg > 1:4289653/1‑96 (MQ=255)
gCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGtt < 2:7583137/96‑1 (MQ=255)
ccTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGGGGttt > 2:10205388/1‑96 (MQ=255)
ccTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGttt > 2:10656695/1‑96 (MQ=255)
ccTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGttt > 1:5932031/1‑96 (MQ=255)
cTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTc < 1:27210/96‑1 (MQ=255)
cTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTc > 1:3623486/1‑96 (MQ=255)
tGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCt < 2:4327649/96‑1 (MQ=255)
tGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCt < 1:13583920/96‑1 (MQ=255)
ggCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTg > 1:4080420/1‑96 (MQ=255)
gCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGc < 1:9204694/96‑1 (MQ=255)
cTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCa < 2:9861643/96‑1 (MQ=255)
gCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCAcc > 2:9286094/1‑96 (MQ=255)
cATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCt > 1:3928916/1‑96 (MQ=255)
aTACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCCCCTg < 2:7821559/96‑1 (MQ=255)
aCGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCTCTGAAAAAAGAGGCGGGTTCTGCACCTgcg > 2:14134283/1‑96 (MQ=255)
gCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTgcgtc < 1:10570168/96‑3 (MQ=255)
tGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCcac > 1:12134046/1‑96 (MQ=255)
tGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCcac > 1:3790977/1‑96 (MQ=255)
tGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCcac < 1:6062689/96‑1 (MQ=255)
gATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCcaca > 2:2315786/1‑96 (MQ=255)
gATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCcaca > 2:277851/1‑96 (MQ=255)
aTTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAg > 2:13325021/1‑96 (MQ=255)
aTTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAg < 2:5430514/96‑1 (MQ=255)
ttATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGTATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAgg < 1:1554412/96‑1 (MQ=255)
ttATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAgg < 2:12136495/96‑1 (MQ=255)
tATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGt < 2:5159953/96‑1 (MQ=255)
aTGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTc < 1:8895506/96‑1 (MQ=255)
aTGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTc > 1:3241168/1‑96 (MQ=255)
aTGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTc < 2:9001233/96‑1 (MQ=255)
ggtggtCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGa < 2:12729794/96‑1 (MQ=255)
ggtggGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGa < 1:9949602/96‑1 (MQ=255)
ggtggGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGa < 2:11809769/96‑1 (MQ=255)
gtggGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAg > 1:5159727/1‑96 (MQ=255)
tggGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGc < 1:14052780/96‑1 (MQ=255)
gggCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCt < 2:11530591/96‑1 (MQ=255)
ggCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTg > 2:4493495/1‑96 (MQ=255)
ggCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTg > 2:8886556/1‑96 (MQ=255)
gCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTgg < 1:3084973/96‑1 (MQ=255)
cGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTGGc < 2:5771893/96‑1 (MQ=255)
ggTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTGGCg > 2:2011979/1‑96 (MQ=255)
|
CGGCGTAATGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGG‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTGGCG > NC_000913/4005505‑4005690
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 329 total aligned reads displayed.
CCTGCGGCGTAATGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GG‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTGGCGAAAAGTGGGCG > NC_000913/4005501‑4005701
|
CCTGCGGCGTAATGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GG‑C < SRR4302518.3295840/101‑1 (MQ=60)
TGCGGCGTAATGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GG‑Cct > SRR4302518.4376293/1‑99 (MQ=60)
tccgatctATGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GG‑Cctg < SRR4302518.5898894/93‑4 (MQ=60)
CGGCGTAATGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGT > SRR4302518.805705/1‑101 (MQ=60)
CAGCGTAATGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GG‑Ccnnn > SRR4302518.11612291/1‑97 (MQ=60)
GGCGTAATGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTA > SRR4302518.6145946/1‑101 (MQ=60)
GGCGTAATGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GG‑Cctnnn > SRR4302518.13579388/1‑96 (MQ=60)
GGCGTAATGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GG‑Cctnnn > SRR4302518.7477528/1‑96 (MQ=60)
GTAATGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GG‑Cctgtatca < SRR4302518.280824/101‑9 (MQ=60)
NNNTGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATGTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTC < SRR4302518.8648385/101‑1 (MQ=60)
AATGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCT < SRR4302518.4121198/101‑1 (MQ=60)
AATGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCT < SRR4302518.3045421/101‑1 (MQ=60)
nnntgTTGGGCTGGGATTGCGCTTCTTGGCCTGCATTTGATTATCGACAAAATGTCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTG < SRR4302518.7884662/96‑1 (MQ=60)
NNNGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTG < SRR4302518.7573169/101‑1 (MQ=60)
NNNGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTG < SRR4302518.10149856/101‑1 (MQ=60)
TGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGC < SRR4302518.4463971/101‑1 (MQ=60)
TGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCNNN > SRR4302518.8260168/1‑101 (MQ=60)
nnntgGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCT < SRR4302518.12526681/96‑1 (MQ=60)
GGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTNNN > SRR4302518.9057063/1‑101 (MQ=60)
GGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCT > SRR4302518.3251522/1‑101 (MQ=60)
GGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCT < SRR4302518.712182/101‑1 (MQ=60)
GGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCT > SRR4302518.2283091/1‑101 (MQ=60)
GGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGGGGGCGGT‑GGCCCGTATCTCTGCT > SRR4302518.6458680/1‑101 (MQ=60)
GTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGGGGT‑GGCCTGTATCTCTGNNN > SRR4302518.8153290/1‑101 (MQ=60)
GTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTG > SRR4302518.6671623/1‑101 (MQ=60)
TTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGTGGT‑GG‑Cctgactctatgctgg > SRR4302518.1001494/1‑86 (MQ=60)
NNNGGGATGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGG < SRR4302518.13498090/101‑1 (MQ=60)
NNNCTGGGCTTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATG < SRR4302518.9881072/101‑1 (MQ=60)
NNNTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATTG < SRR4302518.12408616/101‑1 (MQ=60)
GGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGANNN > SRR4302518.9372278/1‑101 (MQ=60)
GGCTGCGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGG < SRR4302518.6403605/101‑1 (MQ=60)
NNNGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGT < SRR4302518.14583451/101‑1 (MQ=60)
CTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGNNN > SRR4302518.8283630/1‑101 (MQ=60)
CTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGNNN > SRR4302518.9653080/1‑101 (MQ=60)
TGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCATGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GG‑Cctgtaacgctgctgggtgggta > SRR4302518.4784500/1‑79 (MQ=60)
TGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGACTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGTTT > SRR4302518.1399119/1‑101 (MQ=60)
NNNATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTA < SRR4302518.14841133/101‑1 (MQ=60)
GGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTA > SRR4302518.3136106/1‑101 (MQ=60)
NNNTTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTCC < SRR4302518.11174243/101‑1 (MQ=60)
GGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTAC > SRR4302518.6835285/1‑101 (MQ=60)
GGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTNNN > SRR4302518.7732319/1‑101 (MQ=60)
NNNGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACACTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCA < SRR4302518.13855406/101‑1 (MQ=60)
TTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAG < SRR4302518.6361315/101‑1 (MQ=60)
TTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGG‑GGCCTGTATCTCTGCGGGATGGGTTACCAG > SRR4302518.1704266/1‑101 (MQ=60)
NNNCGCTTCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCTG < SRR4302518.14241698/101‑1 (MQ=60)
ATGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GG‑Catgtatgtcttccgggtgggttacaag > SRR4302518.4280692/1‑74 (MQ=60)
NNNCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCCGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCCCTGCTGGATGGGTTACCAGAT < SRR4302518.13455378/101‑1 (MQ=60)
GCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGAT > SRR4302518.3694137/1‑101 (MQ=60)
NNNTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATG < SRR4302518.10332709/101‑1 (MQ=60)
CGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATG > SRR4302518.1067544/1‑101 (MQ=60)
NNNGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGC < SRR4302518.9535022/101‑1 (MQ=60)
GCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGC > SRR4302518.6064332/1‑101 (MQ=60)
CTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATNNN > SRR4302518.7575270/1‑101 (MQ=60)
NNNTGGCCTGTATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCCGATGCTTC < SRR4302518.11003630/101‑1 (MQ=60)
NNNTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGCTACCAGATGCTAC < SRR4302518.14072773/101‑1 (MQ=60)
GCTTGGCCTGGATTTGATTATCGCAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTAC < SRR4302518.2399161/101‑1 (MQ=60)
GCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTAC < SRR4302518.1647524/101‑1 (MQ=60)
GCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTAC > SRR4302518.5707633/1‑101 (MQ=60)
GCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTAC < SRR4302518.867730/101‑1 (MQ=60)
TTGGCCTGCATTTGATTATCGGAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTANNN > SRR4302518.14885821/1‑101 (MQ=60)
TTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGT < SRR4302518.6254425/101‑1 (MQ=60)
NNNGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGT < SRR4302518.8777905/101‑1 (MQ=60)
TGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTTCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTAannn > SRR4302518.13534659/1‑97 (MQ=60)
NNNCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTCTGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTG < SRR4302518.12467076/101‑1 (MQ=60)
TGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGNNN > SRR4302518.11823984/1‑101 (MQ=60)
GGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGG < SRR4302518.2671644/101‑1 (MQ=60)
GCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTNNN > SRR4302518.12150148/1‑101 (MQ=60)
GCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGT > SRR4302518.418805/1‑101 (MQ=60)
GCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGT < SRR4302518.64801/101‑1 (MQ=60)
CCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCGTGGCTGCATACGTAGATGATGGTGGGCGGTGGG‑CTGGAGCTCTGCTGGATGGGTTACCCGATGATACGTGGTG > SRR4302518.3071079/1‑101 (MQ=58)
NNNCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGTTGCTACGTGGTGC < SRR4302518.14526997/101‑1 (MQ=60)
CTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGC < SRR4302518.1430658/101‑1 (MQ=60)
CTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGC > SRR4302518.184702/1‑101 (MQ=60)
CTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGNNN > SRR4302518.13282970/1‑101 (MQ=60)
CTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGAGC > SRR4302518.4282902/1‑101 (MQ=60)
CAGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGNNN > SRR4302518.13737065/1‑101 (MQ=60)
TGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTNNN > SRR4302518.12816280/1‑101 (MQ=60)
GCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCAC < SRR4302518.2942989/101‑1 (MQ=60)
NNNTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACT < SRR4302518.10123794/101‑1 (MQ=60)
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CATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCNNN > SRR4302518.14761101/1‑101 (MQ=60)
ATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCANNN > SRR4302518.7385953/1‑101 (MQ=60)
ATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGGATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGGTACGTTGTGCANNN > SRR4302518.15036391/1‑101 (MQ=60)
TTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGA < SRR4302518.92028/101‑1 (MQ=60)
TTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATATCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAA > SRR4302518.5825298/1‑101 (MQ=60)
TCGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGTTGCTACGAGGTGCACTNNN > SRR4302518.12012889/1‑101 (MQ=60)
TGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATGTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGNNN > SRR4302518.13318542/1‑101 (MQ=60)
TGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGNNN > SRR4302518.8008760/1‑101 (MQ=60)
NNNTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAA < SRR4302518.10852665/101‑1 (MQ=60)
NNNTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCCGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAA < SRR4302518.9175739/101‑1 (MQ=60)
GATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGANNN > SRR4302518.8000780/1‑101 (MQ=60)
GATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGANNN > SRR4302518.9141642/1‑101 (MQ=60)
GATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGANNN > SRR4302518.7638226/1‑101 (MQ=60)
GATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGANNN > SRR4302518.10960853/1‑101 (MQ=60)
GATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAA < SRR4302518.3763486/101‑1 (MQ=60)
ATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAA < SRR4302518.1611281/101‑1 (MQ=60)
ATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGG‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAANNN > SRR4302518.8354976/1‑101 (MQ=60)
TTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAA > SRR4302518.1801780/1‑101 (MQ=60)
TTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAA < SRR4302518.851950/101‑1 (MQ=60)
TATCGAAAAAATGCCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAANNN > SRR4302518.14043359/1‑101 (MQ=60)
NNNCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAG < SRR4302518.14783388/101‑1 (MQ=60)
GATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAANNN > SRR4302518.11879300/1‑101 (MQ=60)
NNNGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGA < SRR4302518.9347073/101‑1 (MQ=60)
ATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGA < SRR4302518.2404101/101‑1 (MQ=60)
TCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAG > SRR4302518.3173560/1‑101 (MQ=60)
CGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGGGGGGCACTGAAAGAAGAGG > SRR4302518.6797472/1‑101 (MQ=60)
NNNAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACGAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGC < SRR4302518.12763651/101‑1 (MQ=60)
GAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGC < SRR4302518.4065197/101‑1 (MQ=60)
GAAAAAATGGACTGGCTGCATACGCTGATTATGCTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGC < SRR4302518.2911716/101‑1 (MQ=60)
GAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGNNN > SRR4302518.14407824/1‑101 (MQ=60)
NNNAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGG < SRR4302518.13979351/101‑1 (MQ=60)
AAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGGTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGNNN > SRR4302518.9890359/1‑101 (MQ=60)
AAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGGGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGGGCACTGAAAAAAGAGGCGG > SRR4302518.1970107/1‑101 (MQ=60)
GAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGGGGT‑GGCCTGTTTCTCTGCTGGATGGGTTAacagtagctacgaggggcactgtataaagaggtnnn > SRR4302518.11971328/1‑65 (MQ=60)
AGAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCNNN > SRR4302518.11005562/1‑101 (MQ=60)
AAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCNNN > SRR4302518.12740789/1‑101 (MQ=60)
NNNTGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTT < SRR4302518.11449525/101‑1 (MQ=60)
AATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTT > SRR4302518.3160254/1‑101 (MQ=60)
ATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGGGGTNNN > SRR4302518.13864031/1‑101 (MQ=60)
ATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTC < SRR4302518.2865287/101‑1 (MQ=60)
ATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTC < SRR4302518.3426035/101‑1 (MQ=60)
ATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTC < SRR4302518.893657/101‑1 (MQ=60)
ATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTC < SRR4302518.28287/101‑1 (MQ=60)
ATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTC < SRR4302518.2773956/101‑1 (MQ=60)
ACGGCGTGGCTTCATACGGTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTTCCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTC < SRR4302518.6986245/101‑1 (MQ=60)
TGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCT > SRR4302518.4502057/1‑101 (MQ=60)
TGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCT < SRR4302518.1969089/101‑1 (MQ=60)
TGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACCTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTNNN > SRR4302518.12927646/1‑101 (MQ=60)
NNNCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTTT < SRR4302518.9074118/101‑1 (MQ=60)
NNNCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCT < SRR4302518.14207019/101‑1 (MQ=60)
nnnctggatgcctaaGCTGATTATGGTGGACGGC‑GGCCTGTAGCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAACGAGGCGGTTTCTA < SRR4302518.11948225/86‑1 (MQ=60)
NNNCTGGCTGCATACGCTGATCATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTG < SRR4302518.10836392/101‑1 (MQ=60)
GGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTG > SRR4302518.4276268/1‑101 (MQ=60)
GCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGC > SRR4302518.5571717/1‑101 (MQ=60)
CCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCA < SRR4302518.2544028/101‑1 (MQ=60)
CCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCA > SRR4302518.6232884/1‑101 (MQ=60)
CTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCAC < SRR4302518.155952/101‑1 (MQ=60)
CTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCAC > SRR4302518.3793328/1‑101 (MQ=60)
TGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTCCGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTCCTGCACC > SRR4302518.7071063/1‑101 (MQ=60)
TGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACC > SRR4302518.971680/1‑101 (MQ=60)
TGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACC > SRR4302518.4597154/1‑101 (MQ=60)
TGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACC < SRR4302518.354024/101‑1 (MQ=60)
NNNCTGCACACGCTGATTATGGTGGTCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCCCTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACC < SRR4302518.13614087/101‑1 (MQ=60)
tcCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCANNN > SRR4302518.11830948/3‑101 (MQ=60)
GGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCANNN > SRR4302518.14694516/1‑101 (MQ=60)
GCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCGCTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTG > SRR4302518.5166731/1‑101 (MQ=60)
CTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGCT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGC < SRR4302518.342656/101‑1 (MQ=60)
TGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTNNN > SRR4302518.7862820/1‑101 (MQ=60)
GCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGC < SRR4302518.390468/101‑1 (MQ=60)
CATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCNNN > SRR4302518.9147523/1‑101 (MQ=60)
ATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCGCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGGTTCTGCAGCTGCGCCA > SRR4302518.4857773/1‑101 (MQ=60)
TACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCAC > SRR4302518.2343893/1‑101 (MQ=60)
TACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCAC < SRR4302518.6370351/101‑1 (MQ=60)
TCGCTGGTTATTGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACA < SRR4302518.5383474/101‑1 (MQ=60)
ACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACA > SRR4302518.2045369/1‑101 (MQ=60)
ACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACA < SRR4302518.6941967/101‑1 (MQ=60)
CGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCANNN > SRR4302518.14118295/1‑101 (MQ=60)
NNNGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGG < SRR4302518.8752291/101‑1 (MQ=60)
GCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCCCCTGCGCCACAGG > SRR4302518.2828296/1‑101 (MQ=60)
GCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGGCACAGG > SRR4302518.5241705/1‑101 (MQ=60)
GCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACNNN > SRR4302518.8058475/1‑101 (MQ=60)
GCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGG < SRR4302518.3921680/101‑1 (MQ=60)
CTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACANNN > SRR4302518.12182539/1‑101 (MQ=60)
CTGATTATGGGGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGGTGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACANNN > SRR4302518.14438972/1‑101 (MQ=60)
TGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTC > SRR4302518.3969698/1‑101 (MQ=60)
NNNTTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTC < SRR4302518.11067197/101‑1 (MQ=60)
GATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCG > SRR4302518.4070007/1‑101 (MQ=60)
nnnattGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGA < SRR4302518.14903472/95‑1 (MQ=60)
TTTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTNNN > SRR4302518.9241717/1‑101 (MQ=60)
NNNATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCcc < SRR4302518.12316973/101‑3 (MQ=60)
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NNNATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGA < SRR4302518.12512113/101‑1 (MQ=60)
NNNATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCCA < SRR4302518.9854289/101‑1 (MQ=60)
ATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGGCGA > SRR4302518.4103593/1‑101 (MQ=60)
TTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAC > SRR4302518.996036/1‑101 (MQ=60)
TGATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCNNN > SRR4302518.11635460/1‑101 (MQ=60)
ATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCT > SRR4302518.3391787/1‑101 (MQ=60)
TGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTG < SRR4302518.6324958/101‑1 (MQ=60)
TGGTGGGCGGA‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCTGATGCTACTTGGTGCACTGAAAAAAAGGCCGATTTCTGCACCGGCGCCACAGGACGACCTG > SRR4302518.6911554/1‑101 (MQ=41)
GGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTGG < SRR4302518.3229807/101‑1 (MQ=60)
NNNGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGTTGCTCTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTGGC < SRR4302518.14137546/101‑1 (MQ=60)
GTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTGGC > SRR4302518.5425974/1‑101 (MQ=60)
GGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTGGCGA > SRR4302518.1907644/1‑101 (MQ=60)
GGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTGGCGA > SRR4302518.3572604/1‑101 (MQ=60)
nnngaggcCTGTATCTCTCCTGCACGGGTTACCAGATGCTGCGTCGTGCACTGAAAAGAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTGGCGAAA < SRR4302518.7430613/93‑1 (MQ=60)
gcgctggcCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTGGCGAAA < SRR4302518.2258530/93‑1 (MQ=60)
CGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTGGCGAAAA < SRR4302518.6021967/101‑1 (MQ=60)
GGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTGGCGAAAAG > SRR4302518.5957079/1‑101 (MQ=60)
nnnggcCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTGGCGAAAAG < SRR4302518.10006332/95‑1 (MQ=60)
gctggcCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAACAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGATCTGGCcaannn > SRR4302518.12661997/7‑95 (MQ=60)
GT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTGGCGCAAAGG > SRR4302518.1741887/1‑101 (MQ=60)
T‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGCTGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTGGCGAAAAGTG < SRR4302518.3608318/101‑1 (MQ=60)
N‑NN‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTGGCGAAAAGTGG < SRR4302518.13360166/101‑1 (MQ=60)
ggcCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTGGCGAAAAGNNN > SRR4302518.7433215/4‑101 (MQ=60)
N‑NNGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTGGCGAAAAGTGGGA < SRR4302518.9303396/101‑1 (MQ=60)
C‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTGGCGAAAAGTGGGC < SRR4302518.4351777/101‑1 (MQ=60)
CTGTCTCTCTGCTGAATGGGTTACCAGATGCTACGTGGGGCACTGAAGAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTCGCGAAAAGgggnnn > SRR4302518.12916526/1‑95 (MQ=60)
CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGTCACAGGTCGAGCTGGCGAAAAGTGGNNN > SRR4302518.10545810/1‑101 (MQ=60)
CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTGGCGAAAAGTGGNNN > SRR4302518.13963595/1‑101 (MQ=60)
CGGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTGGCGAAAAGTGGNNN > SRR4302518.11098631/1‑101 (MQ=60)
|
CCTGCGGCGTAATGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GG‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTGGCGAAAAGTGGGCG > NC_000913/4005501‑4005701
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |