Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
1548 |
369.5 |
20095359 |
96.9% |
19472402 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,005,601 |
+C |
coding (237/282 nt) |
b4568 → |
hypothetical protein |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,005,600 | 1 | . | C | 98.6%
| 1153.0
/ 5.1
| 356 | coding (236/282 nt) | b4568 | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (4/1); new base C (194/157); total (198/158) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.87e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 404 total aligned reads displayed.
CGTAATGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATT‑ATGGTGGGC‑GG‑T‑GG‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTG > NC_000913/4005508‑4005687
|
cgTAATGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATT‑ATGGTGGGC‑GG‑T‑gg > 1:5402156/1‑93 (MQ=255)
cgTAATGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATT‑ATGGTGGGC‑GG‑T‑gg < 1:8457755/93‑1 (MQ=255)
tAATGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATT‑ATGGTGGGC‑GG‑T‑GG‑cc < 2:8341556/93‑2 (MQ=255)
tAATGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATT‑ATGGTGGGC‑GG‑T‑GG‑cc < 1:5316905/93‑2 (MQ=255)
tAATGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATT‑ATGGTGGGC‑GG‑T‑GG‑cc < 1:6287531/93‑2 (MQ=255)
aaTGGTTTGGGCTGGGATTGGGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATT‑ATGGTGGGC‑GG‑T‑GG‑cct < 2:1259696/93‑3 (MQ=255)
aaTGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATT‑ATGGTGGGC‑GG‑T‑GG‑cct > 1:8706774/1‑91 (MQ=255)
aTGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATT‑ATGGTGGGC‑GG‑T‑GG‑cctg > 1:4714649/1‑90 (MQ=255)
tGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATT‑ATGGTGGGC‑GG‑T‑GG‑cctgt > 1:2258045/1‑89 (MQ=255)
tGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATT‑ATGGTGGGC‑GG‑T‑GG‑cctgt < 2:1195939/93‑5 (MQ=255)
tGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATT‑ATGGTGGGC‑GG‑T‑GG‑cctgt > 1:7820543/1‑89 (MQ=255)
tGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATT‑ATGGTGGGC‑GG‑T‑GG‑cctgt > 2:3577901/1‑89 (MQ=255)
tGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATT‑ATGGTGGGC‑GG‑T‑GG‑cctgt > 1:4761872/1‑89 (MQ=255)
tGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATT‑ATGGTGGGC‑GG‑T‑GG‑cctgt < 2:5247102/93‑5 (MQ=255)
tGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATT‑ATGGTGGGC‑GG‑T‑GG‑cctgt > 1:4604174/1‑89 (MQ=255)
gTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATT‑ATGGTGGGC‑GG‑T‑GGCCTGTAt > 2:6647824/1‑93 (MQ=255)
tttGGGCTGGGATTGCGCTTCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGTGT‑ATTGTGTGT‑GG‑T‑GGCCTGTAtc > 1:8933249/1‑93 (MQ=255)
tttGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATT‑ATGGTGGGC‑GG‑T‑GGCCTGTAtc > 2:1100461/1‑93 (MQ=255)
tctGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATT‑ATGGTGGGC‑GG‑T‑GGCCTGTAtc < 1:9451578/91‑1 (MQ=255)
ttGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATT‑ATGGTGGGC‑GG‑T‑GGCCTGTAtct < 1:1479017/93‑1 (MQ=255)
tGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATT‑ATGGTGGGC‑GG‑T‑GGCCTGTAtctc < 2:4374255/93‑1 (MQ=255)
cTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATGTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATT‑ATGGTGGGC‑GG‑T‑GGCCTGTATCTctgct < 2:6542522/93‑1 (MQ=255)
cTGGGATTGCGCTGCTCGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATT‑ATGGTGGGC‑GG‑T‑GGCCTGTATCTctgct < 2:946253/93‑1 (MQ=255)
tGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGTTT‑ATGGTGGGC‑GG‑T‑GGCCTGTATCTctgctg > 1:7679842/1‑93 (MQ=255)
ggATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATT‑ATGGTGGGC‑GG‑T‑GGCCTGTATCTCTGCTGGa < 2:8485399/93‑1 (MQ=255)
gATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATT‑ATGGTGGGC‑GG‑T‑GGCCTGTATCTCTGCTGGAt < 2:2192074/93‑1 (MQ=255)
ttGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATT‑ATGGTGGGC‑GGTT‑GC‑CTGTATCTCTGCTGGATgg > 1:10000472/1‑93 (MQ=255)
ttGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATT‑ATGGTGGGC‑GG‑T‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATgg > 1:3715376/1‑93 (MQ=255)
gcgcTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATT‑ATGGTGGGC‑GG‑T‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGt > 2:4718344/1‑93 (MQ=255)
gcgcTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATT‑ATGGTGGGC‑GG‑T‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGt < 2:6462178/93‑1 (MQ=255)
gctgctTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATT‑ATGGTGGGC‑GG‑T‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTa > 2:3986473/1‑93 (MQ=255)
ctgctTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATT‑ATGGTGGGC‑GG‑T‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTAc < 1:8578436/93‑1 (MQ=255)
tgctTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATT‑ATGGTGGGC‑GG‑T‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTAcc > 1:5690937/1‑93 (MQ=255)
tgctTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTACATACGCTGATT‑ATGGTGGGC‑GG‑TGGG‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTAcc > 2:3774513/1‑93 (MQ=255)
gctTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATT‑ATGGTGGGC‑GG‑T‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCa > 2:4887101/1‑93 (MQ=255)
gctTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATT‑ATGGTGGGC‑GG‑T‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCa > 2:277239/1‑93 (MQ=255)
ctTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATT‑ATGGTGGGC‑GG‑T‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAg > 1:3929881/1‑93 (MQ=255)
ctTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATT‑ATGGTGGGC‑GG‑T‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAg < 1:7554331/93‑1 (MQ=255)
ctTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATT‑ATGGTGGGC‑GG‑T‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAg > 2:8717084/1‑93 (MQ=255)
ctTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATT‑ATGGTGGCC‑GG‑T‑GGCCTGTATCTCTGCTGGGTGGGGTACCAg > 2:1690244/1‑93 (MQ=255)
ttGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATT‑ATGGTGGGC‑GG‑T‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGa < 1:201903/93‑1 (MQ=255)
ttGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATT‑ATGGTGGGC‑GG‑T‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGa < 1:1140008/93‑1 (MQ=255)
ttGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATT‑ATGGTGGGC‑GG‑T‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGa < 1:4950000/93‑1 (MQ=255)
ttGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATT‑ATGGTGGGC‑GG‑T‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGa > 1:3026701/1‑93 (MQ=255)
ggCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATT‑ATGGTGGGC‑GG‑T‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATg > 2:7907341/1‑93 (MQ=255)
ggCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATT‑ATGGTGGGC‑GG‑T‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATg > 1:1225058/1‑93 (MQ=255)
ccTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATT‑ATGGTGGGC‑GG‑T‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCt < 1:7910053/93‑1 (MQ=255)
ccTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATT‑ATGGTGGGC‑GG‑T‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCt > 1:481897/1‑93 (MQ=255)
cTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATT‑ATGGTGGGC‑GG‑T‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTa > 2:6819525/1‑93 (MQ=255)
gCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATT‑ATGGTGGGC‑GG‑T‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACg > 2:7525654/1‑93 (MQ=255)
gCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATT‑ATGGTGGGC‑GG‑T‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACg < 2:9838489/93‑1 (MQ=255)
tttttATTATCGAAAAATTGGCCTGGCTGCATACGCTGATT‑ATGGTGGGC‑GG‑T‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACTAGATGCTACgtg > 2:8961608/2‑93 (MQ=255)
aTTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATT‑ATGGTGGGC‑GG‑T‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACgtg > 1:4184584/1‑93 (MQ=255)
tttGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATT‑ATGGTGGGC‑GG‑T‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACgtgg < 2:882966/93‑1 (MQ=255)
tGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATT‑ATGGTGGGC‑GG‑T‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACgtggtg > 1:9223166/1‑93 (MQ=255)
gATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATT‑ATGGTGGGC‑GG‑T‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGc < 2:2610251/93‑1 (MQ=255)
gATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATT‑ATGGTGGGC‑GG‑T‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGc > 2:2464658/1‑93 (MQ=255)
aTTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATT‑ATGGTGGGC‑GG‑T‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCa > 1:8110204/1‑93 (MQ=255)
tATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATT‑ATGGTGGGC‑GG‑T‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACt > 2:6504315/1‑93 (MQ=255)
tATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATT‑ATGGTGGGC‑GG‑T‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACt < 1:3398037/93‑1 (MQ=255)
aaaTGGCCTGGCTGCATACGCTGATT‑ATGGTGGGC‑GG‑T‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAag > 2:7212833/1‑93 (MQ=255)
aaTGGCCTGGCTGCATACGCTGATT‑ATGGTGGGC‑GG‑T‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAaga > 1:4311602/1‑93 (MQ=255)
aaTGGCCTGGCTGCATACGCTGATT‑ATGGTGGGC‑GG‑T‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAaga < 2:6046134/93‑1 (MQ=255)
aTGGCCTGGCTGCATACGCTGATT‑ATGGTGGGC‑GG‑T‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAagag > 1:1859941/1‑93 (MQ=255)
tGGCCTGGCTGCATACGCTGATT‑ATGGTGGGC‑GG‑T‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAgg > 2:2304161/1‑93 (MQ=255)
tGGCCTGGCTGCATACGCTGATT‑ATGGTGGGC‑GG‑T‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAgg > 1:283225/1‑93 (MQ=255)
ggCCTGGCTGCATACGCTGATT‑ATGGTGGGC‑GG‑T‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGc < 2:3276978/93‑1 (MQ=255)
ggCCTGGCTGCATACGCTGATT‑ATGGTGGGC‑GG‑T‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGc < 2:2006347/93‑1 (MQ=255)
ggCCTGGCGGCATACGCTGATT‑ATGGTGGGC‑GG‑T‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGc < 2:9643366/93‑1 (MQ=255)
ccTGGCTGCATACGCTGATT‑ATGGTGGGC‑GG‑T‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCgg > 2:5175121/1‑93 (MQ=255)
cTGGCTGCATACGCTGATT‑ATGGTGGGC‑GG‑T‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGt > 2:5437667/1‑93 (MQ=255)
tGGCTGCATACGCTGATT‑ATGGTGGGC‑GG‑T‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGtt > 1:3287608/1‑93 (MQ=255)
tGGCTGCATACGCTGATT‑ATGGTGGGC‑GG‑T‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGtt > 1:9654413/1‑93 (MQ=255)
tgCTTCATACGGTGATTAATGGTGGCC‑GT‑T‑GC‑CTTGTTCTTTTGTTGAATGGTTTCCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGttt < 2:4591133/92‑1 (MQ=255)
ggCTGCATACGCTGATT‑ATGGTGGGC‑GG‑T‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGttt < 1:5558957/93‑1 (MQ=255)
gCTGCATACGCTGATT‑ATGGTGGGC‑GG‑T‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTc < 2:622774/93‑1 (MQ=255)
gCTGCATACGCTGATT‑ATGGTGGGC‑GG‑T‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTc < 2:1441338/93‑1 (MQ=255)
gCATACGCTGATT‑ATGGTGGGC‑GG‑T‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGc > 1:6838493/1‑93 (MQ=255)
gCATACGCTGATT‑ATGGTGGGC‑GG‑T‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGGTTCTGc > 1:6736122/1‑93 (MQ=255)
aTACGCTGATT‑ATGGTGGGC‑GG‑T‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCAc > 1:6112677/1‑93 (MQ=255)
tACGCTGATT‑ATGGTGGGC‑GG‑T‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCAcc > 1:7235615/1‑93 (MQ=255)
tACGCTGATT‑ATGGTGGGC‑GG‑T‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCAcc > 2:9270655/1‑93 (MQ=255)
tACGCTGATT‑ATGGTGGGC‑GG‑T‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCAcc > 1:5899984/1‑93 (MQ=255)
gCTGATT‑ATGGTGGGC‑GG‑T‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTgc < 1:2371814/93‑1 (MQ=255)
gCTGATT‑ATGGTGGGC‑GG‑T‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTgc < 1:1740161/93‑1 (MQ=255)
tGATT‑ATGGTGGGC‑GG‑T‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTgcgc > 1:4516082/1‑93 (MQ=255)
tt‑ATGGTGGGC‑GG‑T‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCcac > 2:350985/1‑93 (MQ=255)
t‑ATGGTGGGCGGG‑T‑GC‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGTCGGTTTCTGCACCTGCGCcaca < 2:2890877/93‑1 (MQ=255)
t‑ATGGTGGGC‑GG‑T‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCcaca > 1:6499822/1‑93 (MQ=255)
aTGGTGGGC‑GG‑T‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAg > 2:8086615/1‑93 (MQ=255)
tggtggGC‑GG‑T‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAgg > 1:7027295/1‑93 (MQ=255)
gtggGC‑GG‑T‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTc > 2:3016868/1‑93 (MQ=255)
gtggGC‑GG‑T‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTc < 2:2656211/93‑1 (MQ=255)
gggC‑GG‑T‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGa > 2:5743531/1‑93 (MQ=255)
ggC‑GG‑T‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAg > 2:3874466/1‑93 (MQ=255)
ggC‑GG‑T‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAg > 1:9338847/1‑93 (MQ=255)
ggC‑GG‑T‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAg < 1:985884/93‑1 (MQ=255)
gC‑GG‑T‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGc < 1:8842207/93‑1 (MQ=255)
gg‑T‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTg < 1:6603017/93‑1 (MQ=255)
gg‑T‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTg > 1:8249656/1‑93 (MQ=255)
|
CGTAATGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATT‑ATGGTGGGC‑GG‑T‑GG‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTG > NC_000913/4005508‑4005687
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 235 total aligned reads displayed.
CGTAATGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑G‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTGGCGAAAA > NC_000913/4005508‑4005694
|
CGTAATGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTTCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑G‑C < SRR4302540.6149333/94‑1 (MQ=60)
CGTAATGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑G‑C < SRR4302540.8555959/94‑1 (MQ=60)
TAATGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑G‑Cct > SRR4302540.8807837/1‑92 (MQ=60)
TAATGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑G‑Cct < SRR4302540.5375121/94‑3 (MQ=60)
TAATGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑G‑Cct > SRR4302540.3660019/1‑92 (MQ=60)
AATGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑G‑Cctg < SRR4302540.2261200/94‑4 (MQ=60)
AATGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑G‑Cctg > SRR4302540.4765016/1‑91 (MQ=60)
ATGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGACAAAATGGCCTGGCTGCATGCGCTGATTGTGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGT > SRR4302540.5182095/1‑94 (MQ=60)
ATGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGT > SRR4302540.4812698/1‑94 (MQ=60)
ATGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGT > SRR4302540.169766/1‑94 (MQ=60)
ATGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGT > SRR4302540.4653633/1‑94 (MQ=60)
ATGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGT > SRR4302540.7911938/1‑94 (MQ=60)
ATGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGT > SRR4302540.6630363/1‑94 (MQ=60)
ATGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGT > SRR4302540.2282282/1‑94 (MQ=60)
GGTTTGGGGTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTAT < SRR4302540.2871199/94‑1 (MQ=60)
GGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTAATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTAT < SRR4302540.5496287/94‑1 (MQ=60)
GTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCCGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATC > SRR4302540.2878887/1‑94 (MQ=60)
TCTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCT < SRR4302540.9563765/94‑1 (MQ=60)
TTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTC < SRR4302540.2431572/94‑1 (MQ=60)
TTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTC < SRR4302540.1495210/94‑1 (MQ=60)
GGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTG > SRR4302540.5902776/1‑94 (MQ=60)
GCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCT < SRR4302540.9623090/94‑1 (MQ=60)
GCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCT < SRR4302540.6834746/94‑1 (MQ=60)
GCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCT < SRR4302540.824445/94‑1 (MQ=60)
CTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGTTTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTG > SRR4302540.7766755/1‑94 (MQ=60)
CTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTG > SRR4302540.4811743/1‑94 (MQ=60)
TGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGG > SRR4302540.137929/1‑94 (MQ=60)
TGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGG > SRR4302540.566719/1‑94 (MQ=60)
TGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGG < SRR4302540.2391214/94‑1 (MQ=60)
TGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGG < SRR4302540.9334584/94‑1 (MQ=60)
TGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGACTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTCTCTCTGCTGG > SRR4302540.566720/1‑94 (MQ=60)
GGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGAT < SRR4302540.8162347/94‑1 (MQ=60)
GGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGAT < SRR4302540.6870948/94‑1 (MQ=60)
GGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGAT < SRR4302540.1246890/94‑1 (MQ=60)
GGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGAT < SRR4302540.6870947/94‑1 (MQ=60)
ATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTT‑G‑C‑CTGTATCTCTGCTGGATGG > SRR4302540.10116977/1‑94 (MQ=60)
ATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGG > SRR4302540.4693604/1‑94 (MQ=60)
ATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGG > SRR4302540.3755914/1‑94 (MQ=60)
GCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTT < SRR4302540.9719807/94‑1 (MQ=60)
CGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTA > SRR4302540.6110677/1‑94 (MQ=60)
GCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTAC > SRR4302540.3389798/1‑94 (MQ=60)
CTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACC > SRR4302540.5753590/1‑94 (MQ=60)
CTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACC < SRR4302540.8678145/94‑1 (MQ=60)
CTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACC > SRR4302540.6779725/1‑94 (MQ=60)
TGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCA < SRR4302540.5350397/94‑1 (MQ=60)
TGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑G‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCA > SRR4302540.7923198/1‑94 (MQ=60)
GCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAG > SRR4302540.3972377/1‑94 (MQ=60)
GCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAG < SRR4302540.6238174/94‑1 (MQ=60)
CTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGA > SRR4302540.3059944/1‑94 (MQ=60)
CTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGA < SRR4302540.7639038/94‑1 (MQ=60)
CTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGA < SRR4302540.8956086/94‑1 (MQ=60)
TTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGAT < SRR4302540.98446/94‑1 (MQ=60)
TTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGAT < SRR4302540.203894/94‑1 (MQ=60)
TTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGAT < SRR4302540.5003479/94‑1 (MQ=60)
TTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGAT < SRR4302540.1151931/94‑1 (MQ=60)
TGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATG > SRR4302540.1237585/1‑94 (MQ=60)
TGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATG < SRR4302540.1898637/94‑1 (MQ=60)
TGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACACTGATTATGGTGGGCGG‑T‑GCC‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACGAGATG > SRR4302540.8784403/1‑94 (MQ=60)
GGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGC > SRR4302540.1160488/1‑94 (MQ=60)
GCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCT > SRR4302540.487058/1‑94 (MQ=60)
CTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTAC < SRR4302540.3086012/94‑1 (MQ=60)
CTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTAC > SRR4302540.8650040/1‑94 (MQ=60)
CTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTAC > SRR4302540.1840981/1‑94 (MQ=60)
CTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTAC > SRR4302540.1838276/1‑94 (MQ=60)
TGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACG < SRR4302540.5494601/94‑1 (MQ=60)
CATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTG < SRR4302540.4276036/94‑1 (MQ=60)
ATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGG > SRR4302540.6601708/1‑94 (MQ=60)
ATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGG > SRR4302540.8642279/1‑94 (MQ=60)
ATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGGTACCAGATGCTACGTGG > SRR4302540.9074913/1‑94 (MQ=60)
TTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGT < SRR4302540.884760/94‑1 (MQ=60)
TTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGT > SRR4302540.8478439/1‑94 (MQ=60)
TTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGG > SRR4302540.404664/1‑94 (MQ=60)
TTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTG > SRR4302540.9333764/1‑94 (MQ=60)
TTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTG < SRR4302540.10011190/94‑1 (MQ=60)
TTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTG < SRR4302540.8870537/94‑1 (MQ=60)
TTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTG > SRR4302540.893694/1‑94 (MQ=60)
TGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGC < SRR4302540.4866306/94‑1 (MQ=60)
TGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGC > SRR4302540.773523/1‑94 (MQ=60)
GATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCA > SRR4302540.8204335/1‑94 (MQ=60)
ATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCAC < SRR4302540.2290639/94‑1 (MQ=60)
agttccagatcggaagagGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTTCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACT > SRR4302540.9792924/19‑94 (MQ=60)
TTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATAGGCTGATTATGGGGGGAGG‑C‑G‑GCCTGTACCTCTGCTGGATGGGTTggtagctgctgctgggtgccct > SRR4302540.3047557/1‑72 (MQ=40)
TTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACT < SRR4302540.1923419/94‑1 (MQ=60)
TATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGTGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTG > SRR4302540.4872819/1‑94 (MQ=60)
TATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGTGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTG > SRR4302540.4872820/1‑94 (MQ=60)
TATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTG < SRR4302540.3435091/94‑1 (MQ=60)
TATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTG > SRR4302540.4464547/1‑94 (MQ=60)
ATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGA > SRR4302540.8353906/1‑94 (MQ=60)
TCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAA < SRR4302540.6725906/94‑1 (MQ=60)
TCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAA < SRR4302540.6725907/94‑1 (MQ=60)
CGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAA > SRR4302540.9741574/1‑94 (MQ=60)
GAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAA > SRR4302540.4626080/1‑94 (MQ=60)
GAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAA < SRR4302540.7160800/94‑1 (MQ=60)
GAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGGGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAA > SRR4302540.1576017/1‑94 (MQ=60)
AAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAA < SRR4302540.8690146/94‑1 (MQ=60)
AAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAA < SRR4302540.1097612/94‑1 (MQ=60)
AAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAA < SRR4302540.7991031/94‑1 (MQ=60)
AAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAA > SRR4302540.9196618/1‑94 (MQ=60)
AAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGA > SRR4302540.4358540/1‑94 (MQ=60)
AAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGA > SRR4302540.4174293/1‑94 (MQ=60)
AAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGA > SRR4302540.3392518/1‑94 (MQ=60)
AATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAG > SRR4302540.10068724/1‑94 (MQ=60)
AATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAG > SRR4302540.1880341/1‑94 (MQ=60)
AATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAG > SRR4302540.2502829/1‑94 (MQ=60)
AATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAG < SRR4302540.2598846/94‑1 (MQ=60)
AATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAG > SRR4302540.2881250/1‑94 (MQ=60)
AATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAG > SRR4302540.3003521/1‑94 (MQ=60)
ATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGG > SRR4302540.1231401/1‑94 (MQ=60)
ATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGG > SRR4302540.428418/1‑94 (MQ=60)
ATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGG < SRR4302540.3923719/94‑1 (MQ=60)
TGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGC < SRR4302540.5376736/94‑1 (MQ=60)
TGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGC < SRR4302540.779697/94‑1 (MQ=60)
GCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGG > SRR4302540.5474592/1‑94 (MQ=60)
GCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGG < SRR4302540.4790786/94‑1 (MQ=60)
GCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGG > SRR4302540.9462630/1‑94 (MQ=60)
CCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGT > SRR4302540.6469038/1‑94 (MQ=60)
CTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTT > SRR4302540.3271341/1‑94 (MQ=60)
CTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTT > SRR4302540.3323567/1‑94 (MQ=60)
CTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCGGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTT < SRR4302540.7783102/94‑1 (MQ=60)
TGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTT > SRR4302540.6525241/1‑94 (MQ=60)
TGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTT < SRR4302540.7196612/94‑1 (MQ=60)
TGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTT < SRR4302540.3463085/94‑1 (MQ=60)
GGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTT > SRR4302540.7578594/1‑94 (MQ=60)
GGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTC < SRR4302540.5620180/94‑1 (MQ=60)
GGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTC < SRR4302540.932110/94‑1 (MQ=60)
GCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCT < SRR4302540.4615114/94‑1 (MQ=60)
TGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGC < SRR4302540.9528828/94‑1 (MQ=60)
TGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGC < SRR4302540.8419827/94‑1 (MQ=60)
TGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGC < SRR4302540.5632593/94‑1 (MQ=60)
TGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGC > SRR4302540.6914239/1‑94 (MQ=60)
GCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑TGG‑G‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGGGGTGCACTGAAAAAAGAGGggggttttgcc > SRR4302540.7050525/1‑83 (MQ=60)
GCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAACAGAGGCGGTTTCTGCG > SRR4302540.4058325/1‑94 (MQ=60)
GCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCA > SRR4302540.8324921/1‑94 (MQ=60)
GCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCA > SRR4302540.5760569/1‑94 (MQ=60)
GCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCA < SRR4302540.6184011/94‑1 (MQ=60)
GCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACCGAAAAAAGAGcacgtttagtaa > SRR4302540.4058324/1‑82 (MQ=60)
CATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCAC > SRR4302540.6180748/1‑94 (MQ=60)
ATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACC > SRR4302540.7316326/1‑94 (MQ=60)
ATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACC > SRR4302540.4364737/1‑94 (MQ=60)
ATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACC > SRR4302540.5965139/1‑94 (MQ=60)
TACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCT > SRR4302540.3406844/1‑94 (MQ=60)
ACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTG < SRR4302540.481760/94‑1 (MQ=60)
ACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTG < SRR4302540.6608882/94‑1 (MQ=60)
GCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCG > SRR4302540.4352295/1‑94 (MQ=60)
GCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCG < SRR4302540.1758983/94‑1 (MQ=60)
GCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCG > SRR4302540.5452377/1‑94 (MQ=60)
GCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCG < SRR4302540.2397371/94‑1 (MQ=60)
GCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCG > SRR4302540.7959317/1‑94 (MQ=60)
CTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGC > SRR4302540.4565006/1‑94 (MQ=60)
TGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCC > SRR4302540.7460076/1‑94 (MQ=60)
TGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCC > SRR4302540.7104579/1‑94 (MQ=60)
TGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCC > SRR4302540.4768111/1‑94 (MQ=60)
TGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCC < SRR4302540.8078765/94‑1 (MQ=60)
GATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAACAACGAGGCGGTTTCTGCACCTGgccca > SRR4302540.8908036/1‑89 (MQ=60)
GATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCA < SRR4302540.2043610/94‑1 (MQ=60)
GATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCA > SRR4302540.9604952/1‑94 (MQ=60)
GATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCA > SRR4302540.8908035/1‑94 (MQ=60)
GATTATGGGGTGCGG‑T‑G‑GCCTGGATCTCTGCTGGATTGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCA < SRR4302540.2043611/94‑1 (MQ=60)
ATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCAC > SRR4302540.9416979/1‑94 (MQ=60)
TTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGACAATCGACGCGGTCTCTGCACCTGCGCCCCA > SRR4302540.5266530/1‑94 (MQ=60)
TTATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACA > SRR4302540.6572087/1‑94 (MQ=60)
TATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAG < SRR4302540.6278050/94‑1 (MQ=60)
ATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGG < SRR4302540.7108719/94‑1 (MQ=60)
ATGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGG > SRR4302540.7105372/1‑94 (MQ=60)
TGGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGT > SRR4302540.5522381/1‑94 (MQ=60)
GGTGGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGGC > SRR4302540.3833479/1‑94 (MQ=60)
GGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAG > SRR4302540.9812653/1‑94 (MQ=60)
GGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAG < SRR4302540.775684/94‑1 (MQ=60)
GGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAG > SRR4302540.9450148/1‑94 (MQ=60)
GGGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGACACAGGTCGAG < SRR4302540.6527308/94‑1 (MQ=60)
GGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGC < SRR4302540.995960/94‑1 (MQ=60)
GGCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGC < SRR4302540.10153127/94‑1 (MQ=60)
GCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCT < SRR4302540.4609003/94‑1 (MQ=60)
GCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCT > SRR4302540.7461823/1‑94 (MQ=60)
GCGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCT < SRR4302540.8944487/94‑1 (MQ=60)
GCGG‑T‑G‑GCCTGTATCCCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTCGTGCACTCAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCT < SRR4302540.1588123/94‑1 (MQ=60)
CGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTG > SRR4302540.8345547/1‑94 (MQ=60)
CGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTG < SRR4302540.816356/94‑1 (MQ=60)
CGG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTG < SRR4302540.1231582/94‑1 (MQ=60)
GG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTGG > SRR4302540.8648778/1‑94 (MQ=60)
GG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTGG > SRR4302540.1010379/1‑94 (MQ=60)
GG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTGG < SRR4302540.6676135/94‑1 (MQ=60)
GG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTGG < SRR4302540.7818478/94‑1 (MQ=60)
GG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTGG > SRR4302540.7955726/1‑94 (MQ=60)
GG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTGG > SRR4302540.2883067/1‑94 (MQ=60)
GG‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTGG < SRR4302540.4752850/94‑1 (MQ=60)
G‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTGGC > SRR4302540.29074/1‑94 (MQ=60)
G‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTGGC < SRR4302540.7801428/94‑1 (MQ=60)
G‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTGGC < SRR4302540.9163582/94‑1 (MQ=60)
G‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTGGC > SRR4302540.3252062/1‑94 (MQ=60)
G‑T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTGGC < SRR4302540.3910221/94‑1 (MQ=60)
T‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTGGCG > SRR4302540.9831441/1‑94 (MQ=60)
G‑C‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTGGCGAA > SRR4302540.7878467/1‑94 (MQ=60)
ggcCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTGGCGA > SRR4302540.632534/4‑94 (MQ=60)
CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTGGCGAAAA < SRR4302540.563041/94‑1 (MQ=60)
CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTGGCGAAAA > SRR4302540.2382808/1‑94 (MQ=60)
CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTGGCGAAAA > SRR4302540.308704/1‑94 (MQ=60)
CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTGGCGAAAA < SRR4302540.5559435/94‑1 (MQ=60)
CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTGGCGAAAA > SRR4302540.7008880/1‑94 (MQ=60)
CTGTATCTCTGCTGGATGGGCTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGGTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTGGCGAAAA > SRR4302540.6306440/1‑94 (MQ=60)
|
CGTAATGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑T‑G‑G‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTGGCGAAAA > NC_000913/4005508‑4005694
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |