Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A0 F0 I1 R1
|
245 |
579.6 |
28867798 |
97.7% |
28203838 |
96.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,008,473 |
+G |
intergenic (+40/‑193) |
b4555 → / → yigM |
hypothetical protein/hypothetical protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,008,472 | 1 | . | G | 98.9%
| 1404.2
/ 3.9
| 371 | intergenic (+39/‑194) | b4555/yigM | hypothetical protein/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (2/2); new base G (185/182); total (187/184) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.94e-01 |
Only 100 of 379 total aligned reads displayed.
AACTGGCTACAG‑C‑TGAAGGATTG‑ATTGCG‑TT‑‑G‑TGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATGG‑C‑GGGAAA‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGGCCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCT‑GAAGTGATTGGTACTAATGCCGACGACGCGGTGCCGC > NC_000913/4008399‑4008561
|
actgggCTACAGCC‑TGAAGGATTGTATTGCG‑TTTGG‑TGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGGAAAGG‑CTGCATTATGGGCAg < 2:6198175/92‑1 (MQ=255)
ctgggCTACAGCC‑TGAAGGATTGTATTGCG‑TTTGG‑TGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGGAAAGG‑CTGCATTATGGGCAGt > 1:7196977/4‑96 (MQ=255)
tgggCTACAGCC‑TGAAGGATTGTATTGCG‑TTTGG‑TGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGGAAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTg > 2:14020536/3‑96 (MQ=255)
gggCTACAGCC‑TGAAGGATTGTATTGCG‑TTTGG‑TGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGGAAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTgc < 2:12041227/95‑2 (MQ=255)
gggCTACAGCC‑TGAAGGATTGTATTGCG‑TTTGG‑TGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGGAAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTgc < 2:3477950/95‑2 (MQ=255)
ggCTACAGCC‑TGAAGGATTGTATTGCG‑TTTGG‑TGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGGAAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTgcg > 1:7076684/1‑94 (MQ=255)
ggCTACAG‑CGTGAAGGATTGTATTGCG‑TTTGG‑TGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGGAAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTgcg < 2:13437271/96‑3 (MQ=255)
gCTACAGCC‑TGAAGGATTGTATTGCG‑TTTGG‑TGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGGAAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTgcgc > 2:7685925/1‑93 (MQ=255)
cTACAGCC‑TGAAGGATTGTATTGCG‑TTTGG‑TGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGGAAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTgcgca > 2:198723/1‑92 (MQ=255)
tACAGCC‑TGAAGGATTGTATTGCG‑TTTGG‑TGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGGAAAGG‑CTGCATTAt > 2:14250077/1‑83 (MQ=255)
cagcc‑TGAAGGATTGTATTGCG‑TTTGG‑TGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGGAAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCgcacca < 1:14422890/92‑1 (MQ=255)
cagcc‑TGAAGGATTGTATTGCG‑TTTGG‑TGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGGAAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCgcacca < 2:3572644/92‑1 (MQ=255)
aagcc‑TGAAGGATTGTATTGCG‑TTTGG‑TGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGGAAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCgcacca > 1:11336053/5‑96 (MQ=255)
agcc‑TGAAGGATTGTATTGCG‑TTTGG‑TGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGGAAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAg > 1:8056151/4‑96 (MQ=255)
gcc‑TGAAGGATTGTATTGCG‑TTTGG‑TGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGGAAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGc > 2:8000064/3‑96 (MQ=255)
gcc‑TGAAGGATTGTATTGCG‑TTTGG‑TGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGGAAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGc > 2:7169485/3‑96 (MQ=255)
gcc‑TGAAGGATTGTATTGCG‑TTTGG‑TGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGGAAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGc < 2:9198338/94‑1 (MQ=255)
cc‑TGAAGGATTGTATTGCGTTT‑‑GCTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATTG‑CGGGGAAA‑GCCTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCg < 2:10184571/95‑1 (MQ=255)
cc‑TGAAGGATTGTATTGCG‑TTTGG‑TGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGGAAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCg > 1:5733034/2‑96 (MQ=255)
cc‑TGAAGGATTGTACTGCG‑TTTGG‑GGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGGAAAGG‑CTGCAGTATGGGCAGTGCGCACCAGCg > 2:4580742/2‑96 (MQ=255)
c‑TGAAGGATTGTATTGCG‑TTTGG‑TGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGGAAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGt > 1:4717965/1‑96 (MQ=255)
c‑TGAAGGATTGTATTGCG‑TTTGG‑TGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGGAAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGt > 2:9355629/1‑96 (MQ=255)
tGAAGGTTTGTATTGCG‑TTTGG‑TGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATGGCC‑GGCAAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGAGCACCAGCGTc > 1:10000040/1‑96 (MQ=255)
tGAAGGATTGTATTGCG‑TTTGG‑TGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGGAAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTc > 1:10854513/1‑96 (MQ=255)
tGAAGGATTGTATTGCG‑TTTGG‑TGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGGAAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTc > 2:12779655/1‑96 (MQ=255)
tGAAGGATTGTATTGCG‑TTTGG‑TGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGGAAAGG‑CTGCATTATGGGCAGGGCGCACCAGCGTc > 1:330447/1‑96 (MQ=255)
aaGGATTGTATTGCG‑TTTGG‑TGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGGAAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTg > 1:6964135/1‑96 (MQ=255)
ggATTGTATTGCG‑TTTGG‑TGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGGAAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGaa > 1:6141413/1‑96 (MQ=255)
tttt‑‑G‑TGACGGGATGAACGACGCCTAAATGCTGTCGATGG‑CGGGGAAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATccc < 1:13245395/94‑1 (MQ=255)
tttgg‑tgACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGGAAAGG‑CTGCATTATGTGCAGTGAGCACCAGTGTCTGAAAGACCGTCATccc > 1:5092274/5‑96 (MQ=255)
tttgg‑tgACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGGAAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATccc < 2:9934253/92‑1 (MQ=255)
ttgg‑tgACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGGAAAGG‑CGGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCg > 2:667754/4‑96 (MQ=255)
ctgg‑tgACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGGAAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCg > 1:8869207/4‑96 (MQ=255)
tgg‑tgACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGGAAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGa > 1:13187070/3‑96 (MQ=255)
g‑tgACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGGAAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGc > 2:5019823/1‑96 (MQ=255)
tgACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGGAAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCt < 2:8539751/96‑1 (MQ=255)
tgACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGGAAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCt > 1:12160187/1‑96 (MQ=255)
gACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGGAAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCT‑g > 2:11592110/1‑96 (MQ=255)
gACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGGAAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCT‑g > 2:11053208/1‑96 (MQ=255)
gACGCGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGGAAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCT‑g < 1:2012447/96‑1 (MQ=255)
aCGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGGAAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCT‑gg > 1:12434257/1‑95 (MQ=255)
cGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGGAAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCT‑gga > 1:8685149/1‑94 (MQ=255)
gggATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGGAAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCT‑ggaa < 1:9130859/96‑4 (MQ=255)
gggATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGGAAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCT‑ggaa > 2:13587071/1‑93 (MQ=255)
gggATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGGAAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGAGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCT‑ggaa > 2:6383718/1‑93 (MQ=255)
gggATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGGAAAGG‑CTGCATTATGGGCAGGGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCT‑ggaa > 2:5675779/1‑93 (MQ=255)
aTGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGGAAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTg > 2:1559585/1‑96 (MQ=255)
tGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGGAAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGa < 2:7039376/96‑1 (MQ=255)
gAACGACGCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGGAAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGGCCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGAt < 1:3650023/96‑1 (MQ=255)
aaCGACGCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGGAAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGAtt > 2:9511239/1‑96 (MQ=255)
acgacgCCGACATGCTGTCGATGG‑CGGGGAAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTg < 1:10446427/96‑1 (MQ=255)
acgacgCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGGAAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTg < 1:1342954/96‑1 (MQ=255)
cgacgCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGGAAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTgg > 2:3437713/1‑96 (MQ=255)
cgacgCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGGAAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTga < 1:13792932/96‑2 (MQ=255)
gccgCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGGAAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGt < 2:13414290/94‑1 (MQ=255)
gacgCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGGAAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGt > 1:3907276/1‑96 (MQ=255)
acgCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGGAAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTa > 1:5201485/1‑96 (MQ=255)
acgCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGGAAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTa > 1:6395801/1‑96 (MQ=255)
gCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGGAAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACt > 2:327963/1‑96 (MQ=255)
gCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGGAAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACt < 2:4288595/96‑1 (MQ=255)
gCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGGAAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGGGATTGGTACt > 1:2883237/1‑96 (MQ=255)
gCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGGAAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCACCCCGGGCTGGAAGTGATTGGTACt < 1:4551446/96‑1 (MQ=255)
ccGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGGAAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTa < 2:583212/96‑1 (MQ=255)
ccGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGGAAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTa < 1:9500971/96‑1 (MQ=255)
cGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGGAAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAGGTGATTGGTACTaa > 1:5445168/1‑96 (MQ=255)
gAAATGCTGTCGATGG‑CGGGGAAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAAt < 2:313102/96‑1 (MQ=255)
gAAATGCTGTCGATGG‑CGGGGAAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGGCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAAt > 2:1055763/1‑96 (MQ=255)
aaaTGCTGTCGATGG‑CGGGGAAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCCCCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATg < 2:2593835/96‑1 (MQ=255)
aaaTGCTGTCGATGG‑CGGGGAAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATg > 2:9593158/1‑96 (MQ=255)
aaaTGCTGTCGATGG‑CGGGGAAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATg > 2:13125727/1‑96 (MQ=255)
aaaTGCTGTCGATGG‑CGGGGAAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATg < 1:11681880/96‑1 (MQ=255)
aaaTGCTGTCGATGG‑CGGGGAAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATg < 1:2478460/96‑1 (MQ=255)
aaaTGCTGTCGATGG‑CGGGGAAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATg > 1:4869010/1‑96 (MQ=255)
aTGCTGTCGATGG‑CGGGGAAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATGcc < 1:3112074/96‑1 (MQ=255)
aTGCTGTCGATGG‑CGGGGAAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATGcc < 2:11831566/96‑1 (MQ=255)
ggtGTCGATGG‑CGGGGAAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATGCcga > 1:7521313/3‑96 (MQ=255)
gCTGTCGATGG‑CGGGGAAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATGCcga < 2:11280995/96‑1 (MQ=255)
cTGTCGATGG‑CGGGGAAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGTCCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATGCcgac < 1:14065070/96‑1 (MQ=255)
cTGTCGATGG‑CGGGGAAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATGCcgac > 1:6755947/1‑96 (MQ=255)
cTGTCGATGG‑CGGGGAAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATGCcgac < 1:9543973/96‑1 (MQ=255)
cTGTCGATGG‑CGGGGAAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATGCcgac < 1:1902855/96‑1 (MQ=255)
cTGTCGATGG‑CGGGGAAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATGCcgac > 2:4433339/1‑96 (MQ=255)
tGTCGATGG‑CGGGGAAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGGCCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATGCcgacn < 1:4189712/96‑2 (MQ=255)
tGTCGATGG‑CGGGGAAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATGCcgacg < 1:12779655/96‑1 (MQ=255)
tGTCGATGG‑CGGGGAAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATGCcgacg < 2:7485192/96‑1 (MQ=255)
gTCGATGG‑CGGGGAAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGCCCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATGCcgacga < 2:2379647/96‑1 (MQ=255)
tCGATGG‑CGGGGAAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATGCCgacgac > 1:4409288/1‑96 (MQ=255)
cGATGG‑CGGGGAAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATGCCGacgacg < 2:4841377/96‑1 (MQ=255)
gATGG‑CGGGGAAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATGCCGACGAcgc > 2:6557579/1‑96 (MQ=255)
gATGG‑CGGGGAAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATGCCGACGAcgc > 2:4046019/1‑96 (MQ=255)
gATGG‑CGGGGAAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATGCCGACGAcgc > 2:13001925/1‑96 (MQ=255)
gATGG‑CGGGGAAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATGCCGACGAcgc < 1:11590987/96‑1 (MQ=255)
aTGG‑CGGGGAAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATGCCGACGAcgcg < 2:5226627/96‑1 (MQ=255)
aTGG‑CGGGGAAA‑GTCTGCATTATGGGCAGTGCGCCCCAGCGTCTGAACGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATGCCGACGAcgcg < 2:12519757/96‑1 (MQ=255)
ggcggggAAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATGCCGACGACGCGGt > 1:9971213/5‑96 (MQ=255)
ggcggggAAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATGCCGACGACGCGGt < 2:12289099/92‑1 (MQ=255)
ggggAAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATGCCGACGACGCGGTGcc > 2:12841156/2‑96 (MQ=255)
ggggAAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATGCCGACGACGCGGTGcc < 2:881401/95‑1 (MQ=255)
gggAAA‑GACTGCATTATGGAGAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGATCTGGAAGTGATTGGTACTAATGCCGACGACTCGGTGCCg > 1:6505205/1‑96 (MQ=255)
ggAAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATGCCGACGACGCGGTGCCGc < 1:14237029/96‑1 (MQ=255)
|
AACTGGCTACAG‑C‑TGAAGGATTG‑ATTGCG‑TT‑‑G‑TGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATGG‑C‑GGGAAA‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGGCCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCT‑GAAGTGATTGGTACTAATGCCGACGACGCGGTGCCGC > NC_000913/4008399‑4008561
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 310 total aligned reads displayed.
CATGCGCTGGAAGGCTGGCGAACT‑GGCTACAG‑CTGAAGGATT‑G‑ATTGCGTT‑‑GTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑G‑‑AAA‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGGC‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCT‑GAAGTGATTGGTACTAATGCCGACGACGCGGTGCCGCATTATCTGCGTA > NC_000913/4008379‑4008573
|
gctggaagcggtggcgaagaaactgGGCTACAGCCTGAAGGATT‑GTATTGCGTTTGGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GCG‑GG‑G‑‑AAA‑‑G < SRR4302518.464257/76‑1 (MQ=53)
gctggaagcggtggcgaagaaactgGGCTACAGCCTGAAGGATT‑GTATTGCGTTTGGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GCG‑GG‑G‑‑AAA‑‑G > SRR4302518.3561432/26‑101 (MQ=53)
agcggtggcgaagaaactgGGCTACAGCCTGAAGGATT‑GTATTGCGTTTGGTGACGGGATGAACGCCGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCA < SRR4302518.6350775/82‑1 (MQ=38)
agcggtggcgaagaaactgGGCTACAGCCTGAAGGATT‑GTATTGCGTTTGGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCA < SRR4302518.5972639/82‑1 (MQ=50)
agcggtggcgaagaaactgGGCTACAGCCTGAAGGATT‑GTATTGCGTTTGGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCA < SRR4302518.594404/82‑1 (MQ=50)
nnntggcgaagaaactgGGCTACAGCCTGAAGGATT‑GTATTGCGTTTGGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATT < SRR4302518.12103275/84‑1 (MQ=49)
ggtggcgaagaaactgGGCTACAGCCTGAAGGATT‑GTATTGCGTTTGGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTA < SRR4302518.1136692/85‑1 (MQ=48)
ggtggcgaagaaactgGGCTACAGCCTGAAGGATT‑GTATTGCGTTTGGTGACGGCATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTA < SRR4302518.4727505/85‑1 (MQ=37)
gtggcgaagaaactgGGCTACAGCCTGAAGGATT‑GTATTGCGTTTGGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTAT < SRR4302518.5520491/86‑1 (MQ=48)
tggcgaagaaactgGGCTACAGCCTGAAGGATT‑GTATTGCGTTTGGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATG < SRR4302518.4745017/87‑1 (MQ=49)
tggcgaagaaactgGGCTACAGCCTGAAGGATT‑GTATTGCGTTTGGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATG > SRR4302518.2718212/15‑101 (MQ=49)
gtggcgaagaaactgggctacagcctgaaggattgtattgcggttgGTGACGGGGTGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTAT > SRR4302518.3388148/47‑101 (MQ=40)
ggcgaagaaactgGGCTACAGCCTGAAGGATT‑GTATTGCGTTTGGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGG < SRR4302518.1521354/88‑1 (MQ=51)
nnnaagaaactgGGCTACAGCCTGAAGGATT‑GTATTGCGTTTGGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAT‑‑G‑CTGCATTATGGG < SRR4302518.14526685/89‑1 (MQ=53)
nnnaagaaactgGGCTACAGCCTGAAGGATT‑GTATTGCGTTTGGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGG < SRR4302518.7882123/89‑1 (MQ=53)
gcgaagaaactgGGCTACAGCCTGAAGGATT‑GTATTGCGTTTGGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGG > SRR4302518.63966/13‑101 (MQ=53)
nnnagaaactgGGCTACAGCCTGAAGGATT‑GTATTGCGTTTGGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGC < SRR4302518.9332267/90‑1 (MQ=55)
cgaagaaactgGGCTACAGCCTGAAGGATT‑GTATTGCGTTTGGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGC > SRR4302518.2495117/12‑101 (MQ=55)
gaagaaactgggctacagcctggaggattgG‑ATTGCGTTTGGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCG > SRR4302518.1257162/31‑101 (MQ=57)
gaagaaactgGGCTACAGCCTGAAGGATT‑GTATTGCGTTTGGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑TC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGagaa > SRR4302518.498692/11‑97 (MQ=38)
gaagaaactgGGCTACAGCCTGAAGGATT‑GTATTGCGTTTGGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCA > SRR4302518.1533440/11‑101 (MQ=57)
gaagaaactgggctacagcctgaaggattgtattgagtttgGTGACGGGATGAACGACGCCGAAAGGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCA > SRR4302518.4214654/42‑101 (MQ=52)
nnnactgGGCTACAGCCTGAAGGATT‑GTATTGCGTTTGGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTC < SRR4302518.11887451/94‑1 (MQ=60)
gaaactgGGCTACAGCCTGAAGGATT‑GTATTGCGTTTGGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGtcannn > SRR4302518.8312034/8‑95 (MQ=51)
gaaactgGGCTACAGCCTGAAGGATT‑GTATTGCGTTTGGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTG > SRR4302518.5432985/8‑101 (MQ=60)
nnntgGGCTACAGCCTGAAGGATT‑GTATTGCGTTTGGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGcg < SRR4302518.13848542/96‑3 (MQ=60)
nnnctgggctacagcctgaagcattgtattgcgtttgGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGC < SRR4302518.13380438/64‑1 (MQ=60)
AACTGGGCTACAGCCTGAAGGATT‑GTATTGCGTTTGGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGggcg > SRR4302518.782287/1‑97 (MQ=56)
AACTGGGCTACAGCCTGAAGGATT‑GTATTGCGTTTGGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTNNN > SRR4302518.14097003/1‑101 (MQ=56)
ctgGGCTACAGCCTGAAGGATT‑GTATTGCGTTTGGTGACGGGATGAACGACGCCGCAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGcgca < SRR4302518.537833/98‑5 (MQ=50)
ctgGGCTACAGCCTGAAGGATT‑GTATTGCGTTTGGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGcnnn > SRR4302518.7574363/4‑97 (MQ=60)
tgGGCTACAGCCTGAAGGATT‑GTATTGCGTTTGGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGcgnnn > SRR4302518.10005154/3‑96 (MQ=60)
ctgggctacagcctgatggattgtattgcgtttgGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGcgca > SRR4302518.1432560/35‑97 (MQ=60)
GGCTACAGCCTGAAGGATT‑GTATTGCGTTTGGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGcgcannn > SRR4302518.7450506/1‑94 (MQ=60)
GGCTACAGCCTGAAGGATT‑GTATTGCGTTTGGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCA < SRR4302518.3297311/101‑1 (MQ=58)
GCTACAGCCTGAAGGATT‑GTATTGCGTTTGGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAG > SRR4302518.4010129/1‑101 (MQ=56)
nnncagcCTGAAGGATT‑GTATTGCGTTTGGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGC < SRR4302518.13842606/94‑1 (MQ=60)
nnnacagcctgaaggattgtcttgcgtttgGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGcgcacccg < SRR4302518.9477296/71‑9 (MQ=60)
TACAGCCTGAAGGATT‑GTATTGCGTTTGGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGcgcaccannn > SRR4302518.8915013/1‑91 (MQ=60)
TACAGCCTGAAGGATT‑GTATTGCGTTTGGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCG > SRR4302518.461668/1‑101 (MQ=56)
nnngcCTGAAGGATT‑GTATTGCGTTTGGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGT < SRR4302518.12139774/96‑1 (MQ=60)
ACAGCCTGAAGGATT‑GTATTGCGTTTGGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GCG‑GG‑G‑‑AAA‑‑GCCTGCATTATGGGCAGTccgcaccagnnn > SRR4302518.13160693/1‑89 (MQ=58)
agcCTGAAGGATT‑GTATTGCGTTTGGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGNNN > SRR4302518.8457010/4‑101 (MQ=57)
C‑CTGAAGGATT‑GTATTGCGTTTGGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGA > SRR4302518.6023663/1‑101 (MQ=60)
C‑CTGAAGGATT‑GTATTGCGTTTGGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCNNN > SRR4302518.14943133/1‑101 (MQ=60)
cctgaaggtttgtattgcgtttgGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGA > SRR4302518.6272478/24‑101 (MQ=60)
CTGAAGGATT‑GTATTGCGTTTGGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGCGCG‑CACCAGCGTCTNNN > SRR4302518.11911103/1‑101 (MQ=52)
CTGAAGGAAT‑GTATTGCGTTTGGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAA > SRR4302518.6822864/1‑101 (MQ=60)
TGAAGGATT‑GTATTGCGTTTGGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGNNN > SRR4302518.11363911/1‑101 (MQ=60)
TGAAGGATT‑GTATTGCGTTTGGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGACA > SRR4302518.4892487/1‑101 (MQ=60)
TGAAGGATT‑GTATTGCGTTTGGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAA > SRR4302518.815220/1‑101 (MQ=60)
TGAAGGATT‑GTATTGCGTTTGGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGGGCG‑CACCAGCGTCTGAAA > SRR4302518.343684/1‑101 (MQ=58)
TGAAGGATT‑GTATTGCGTTTGGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGC‑GAGGCGCACCAGCGGCTGAAA > SRR4302518.6841188/1‑101 (MQ=45)
TAAAGGATT‑GTATTGCGTTTGGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGNNN > SRR4302518.11132113/1‑101 (MQ=58)
NNNAGGATT‑GTATTGCGTTTGGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAA < SRR4302518.7731361/101‑1 (MQ=60)
GAAGGATTGG‑ATTGCGTTTGGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTAGGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGANNN > SRR4302518.7711107/1‑101 (MQ=52)
AAGGATT‑GTATTGCGTTTGGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGC > SRR4302518.7334146/1‑101 (MQ=60)
AAGGATT‑GTATTGCGTTTGGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGA < SRR4302518.2537259/101‑1 (MQ=60)
nnngattgtattgcgtttgGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGA < SRR4302518.9809423/82‑1 (MQ=60)
AGGATT‑GTATTGCGTTTGGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAANNN > SRR4302518.9625538/1‑101 (MQ=60)
AGGATT‑GTATTGCGTTTGGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGAC > SRR4302518.1393417/1‑101 (MQ=60)
AGGATT‑GTATTGCGTTTGGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGGCTGAAANNN > SRR4302518.13792003/1‑101 (MQ=52)
nnnttgtattgcgtttgGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACC < SRR4302518.13861593/84‑1 (MQ=60)
cgatcttattgcgtttgGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACC < SRR4302518.488831/84‑1 (MQ=60)
GATT‑GTATTGCGTTTGGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGANNN > SRR4302518.9097783/1‑101 (MQ=60)
GATT‑GTATTGCGTTTGGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACAAGCGACTGAAAGACCT > SRR4302518.3925679/1‑101 (MQ=52)
TT‑GTATTGCGTTTGGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTC < SRR4302518.5004258/101‑1 (MQ=60)
NN‑N‑ATTGCGTTTGGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTTA < SRR4302518.12236479/101‑1 (MQ=60)
tggtattgcgtttgGTGACGGGATGAACGCCGCCGAAATGCTGCCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTC < SRR4302518.5770622/87‑1 (MQ=60)
nnntattgcgtttgGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTC < SRR4302518.10248812/87‑1 (MQ=60)
nnntattgcgtttgGTGACGAGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GGCG‑‑AAAG‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CCCAAGCGTCTGAAAGACCTTC < SRR4302518.10378522/87‑1 (MQ=49)
N‑N‑NTTGCGTTTGGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTCAT < SRR4302518.9074244/101‑1 (MQ=60)
tgtattgcgtttgGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTCT > SRR4302518.5828079/14‑101 (MQ=60)
gtattgcgtttgggGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCATGGTCTGAAAGACATTCAC > SRR4302518.525901/15‑101 (MQ=49)
nnntgcgtttgGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTCAGC < SRR4302518.12345275/90‑1 (MQ=60)
ATTGCGTTTGGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCC < SRR4302518.1971793/101‑1 (MQ=60)
ATTGCGTTTGGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGGCGATG‑‑GT‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGAG‑CACCAGCGCCTGAAAGACCTTCANNN > SRR4302518.8900534/1‑101 (MQ=47)
nnncgtttgGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCT < SRR4302518.7548070/92‑1 (MQ=60)
TTGCGTTTGGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATNNN > SRR4302518.9733130/1‑101 (MQ=60)
nnngtttgGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCG < SRR4302518.14760777/93‑1 (MQ=60)
TGCGTTTGGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCG < SRR4302518.1471827/101‑1 (MQ=60)
TGCGTTTGGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCG < SRR4302518.2772931/101‑1 (MQ=60)
TGCGTTTGGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCG < SRR4302518.3326341/101‑1 (MQ=60)
gggtttgGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCTA < SRR4302518.3119552/94‑1 (MQ=60)
GCGTTTGGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GCGGGG‑G‑‑AAG‑‑G‑CTGCATTATGTGGAGGGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGG > SRR4302518.5122529/1‑101 (MQ=58)
CGTTTGGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAG > SRR4302518.2746015/1‑101 (MQ=60)
CGTTTGGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAG < SRR4302518.7340205/101‑1 (MQ=60)
CGTTTGGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGGGCG‑CCCCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGGG > SRR4302518.3152411/1‑101 (MQ=60)
nnntgGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGC < SRR4302518.7411149/96‑1 (MQ=60)
GTTG‑GTGAAGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCT < SRR4302518.3894752/101‑1 (MQ=60)
tttgGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGTGCAGTGAG‑CACCAGTGTCTGAAAGACCGTCATCCCGAGCT > SRR4302518.5355796/5‑101 (MQ=60)
NN‑‑NTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCT‑GG < SRR4302518.9158314/101‑1 (MQ=60)
ttgGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGNN‑N > SRR4302518.13094735/4‑101 (MQ=60)
ttgGTGACGCGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCT‑G < SRR4302518.2105175/98‑1 (MQ=60)
N‑‑NNGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCT‑GGA < SRR4302518.9556257/101‑1 (MQ=60)
G‑‑GTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCT‑GGA > SRR4302518.915496/1‑101 (MQ=60)
GTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCT‑Ggaa > SRR4302518.5265102/1‑98 (MQ=60)
TGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCT‑Ggnnn > SRR4302518.12737407/1‑97 (MQ=60)
NNNCGGCATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATC‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CCCCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAG < SRR4302518.10362605/101‑1 (MQ=60)
GACGGGCTGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑G‑‑GAAGGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCCGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGCGCTGGAAGT < SRR4302518.6113427/101‑1 (MQ=60)
GACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGT < SRR4302518.87649/101‑1 (MQ=60)
ACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCT‑Ggaannn > SRR4302518.13019759/1‑95 (MQ=60)
CGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGA > SRR4302518.2877628/1‑101 (MQ=60)
GGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGGCCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGAT < SRR4302518.3821173/101‑1 (MQ=60)
GGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGAT > SRR4302518.6326211/1‑101 (MQ=60)
GGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGAT > SRR4302518.5761323/1‑101 (MQ=60)
GGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCT‑Ggaagtnnn > SRR4302518.9552768/1‑93 (MQ=60)
nnntAACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTG < SRR4302518.13949968/97‑1 (MQ=60)
NNNGAACGACGCCGACATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTG < SRR4302518.10936004/101‑1 (MQ=60)
GATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑G‑‑GAACGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAAACCTACATCCCGAtctgagcgtatatg > SRR4302518.1288019/1‑87 (MQ=60)
NNNAACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGA < SRR4302518.14424378/101‑1 (MQ=60)
ATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTAATCCCGAGCTGGAAGTGATTGG > SRR4302518.4644685/1‑101 (MQ=60)
TGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTNNN > SRR4302518.12916847/1‑101 (MQ=60)
TGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGT < SRR4302518.544892/101‑1 (MQ=60)
NNNCGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTA < SRR4302518.8076478/101‑1 (MQ=60)
ACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GCT‑GG‑G‑‑AAAG‑G‑CTGCATTATGGGCCGTGCG‑CCCCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACT < SRR4302518.4459599/101‑1 (MQ=60)
ACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTNNN > SRR4302518.12861262/1‑101 (MQ=60)
ACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACT > SRR4302518.7113379/1‑101 (MQ=60)
NNNCGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTA < SRR4302518.9961928/101‑1 (MQ=60)
GGCGCCGAGATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACNNN > SRR4302518.13572444/1‑101 (MQ=60)
GACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAA < SRR4302518.3632379/101‑1 (MQ=60)
GACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACNNN > SRR4302518.11147132/1‑101 (MQ=60)
GACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGGACTAA > SRR4302518.4093308/1‑101 (MQ=60)
ACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAAT > SRR4302518.5469194/1‑101 (MQ=60)
NNNCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATG < SRR4302518.12233391/101‑1 (MQ=60)
NNNCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATG < SRR4302518.7523475/101‑1 (MQ=60)
CGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATG < SRR4302518.6818937/101‑1 (MQ=60)
CGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATG > SRR4302518.1552384/1‑101 (MQ=60)
CGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATG < SRR4302518.2597962/101‑1 (MQ=60)
CGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATG > SRR4302518.6064135/1‑101 (MQ=60)
GCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATGC > SRR4302518.4594983/1‑101 (MQ=60)
nnnatATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATGCC < SRR4302518.9991138/96‑1 (MQ=60)
NNNAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATGCC < SRR4302518.10290733/101‑1 (MQ=60)
CCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGGCTGAAAGACCGTCATCCCGAGCTGGTAGTGATTGGTACTAAggcg > SRR4302518.5056698/1‑97 (MQ=51)
NNNAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATGCCG < SRR4302518.11679583/101‑1 (MQ=60)
NNNAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATGCCG < SRR4302518.10983714/101‑1 (MQ=60)
CGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAGGTGATTGGTACTAATGCCG > SRR4302518.5722797/1‑101 (MQ=60)
CGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGAACTAATGNNN > SRR4302518.12171454/1‑101 (MQ=60)
CGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCAATATGGGAAGTGCG‑CACAAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTAATAATGaca > SRR4302518.102991/1‑98 (MQ=42)
NNNTGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGTCCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATGCCGAC < SRR4302518.14708944/101‑1 (MQ=60)
NNNTGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATGCCGAC < SRR4302518.10006030/101‑1 (MQ=60)
CAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATGCCGAC < SRR4302518.1989113/101‑1 (MQ=60)
AAATGCTGTCGATGCAGG‑‑GG‑A‑‑AAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATGCCGAC < SRR4302518.2509128/101‑1 (MQ=60)
AAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGGAGTGATTGGTACTAATGCCNNN > SRR4302518.10270721/1‑101 (MQ=60)
AAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATGCCGAC < SRR4302518.5016247/101‑1 (MQ=60)
NNNGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATGCCGACG < SRR4302518.13375098/101‑1 (MQ=60)
NATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGGCCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATGCCGACN < SRR4302518.4393938/101‑1 (MQ=60)
ATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATGCCGANNN > SRR4302518.8785197/1‑101 (MQ=60)
TGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATGCCGACGAC < SRR4302518.2067483/101‑1 (MQ=60)
NNNTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATGCCGACGCC < SRR4302518.9664730/101‑1 (MQ=60)
NNNTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATGCCGACGAC < SRR4302518.12469742/101‑1 (MQ=60)
AGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATGCCGACGAC < SRR4302518.780360/101‑1 (MQ=60)
NNNGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATGCCGACGACG < SRR4302518.14662215/101‑1 (MQ=60)
NNNTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATGCCGACGACGC < SRR4302518.12136847/101‑1 (MQ=60)
CTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATGCCGACGACGC > SRR4302518.4478301/1‑101 (MQ=60)
CTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATGCCGACGACGC > SRR4302518.7108670/1‑101 (MQ=60)
CTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATGCCGACGACGC > SRR4302518.2146809/1‑101 (MQ=60)
NNNCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATGCCGACGACGCG < SRR4302518.9310370/101‑1 (MQ=60)
GTCGATG‑‑GG‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATGCCGACGACGCGG > SRR4302518.4917718/1‑101 (MQ=60)
GTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATGCCGACGACGNNN > SRR4302518.14120480/1‑101 (MQ=60)
GTCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATGCCGACGACGCGG < SRR4302518.3748051/101‑1 (MQ=60)
TCGATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATGCCGACGACGCGGT < SRR4302518.7256431/101‑1 (MQ=60)
ATG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATGCCGACGACGCGGTGCC < SRR4302518.6954292/101‑1 (MQ=60)
TG‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATGCCGACGACGCGGTGCCG > SRR4302518.2833018/1‑101 (MQ=60)
G‑‑GC‑‑GG‑GGAAAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATGCCGACGACGCGGTGCNNN > SRR4302518.10445951/1‑101 (MQ=60)
nnntggcggggaaagG‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATGCCGACGACGCGGCG < SRR4302518.11584778/86‑1 (MQ=60)
nnnggggaaagG‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATGCCGACGACGCGGTGCCGC < SRR4302518.14892535/90‑1 (MQ=60)
gcggggaaagG‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATGCCGACGACGCGGTGCCGCA > SRR4302518.5657693/11‑101 (MQ=60)
gcggggaaagG‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATGCCGACGACGCGGTGCCGCA > SRR4302518.6628485/11‑101 (MQ=60)
G‑G‑‑AAAG‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATGCCGACGACGCGGTGCCGCATNNN > SRR4302518.11614517/1‑101 (MQ=60)
nnnggaaagG‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATGCCGACGACGCGGTGCCGCAT < SRR4302518.8410940/92‑1 (MQ=60)
cggggaaagG‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAGTGCCGACGACGCGGTGCCGCAT > SRR4302518.66017/10‑101 (MQ=60)
cggggaaagG‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATGCCGACGACGCGGTGCatctt > SRR4302518.1950517/10‑96 (MQ=60)
cggggaaagG‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATGCCGACGACGCGGTGCCGCAT > SRR4302518.494987/10‑101 (MQ=60)
cggggaaagG‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATGCCGACGACGCGGTGCCGCAT < SRR4302518.4134895/92‑1 (MQ=60)
cggggaaagG‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATGCCGACGACGCGGTGCCGCAT < SRR4302518.582887/92‑1 (MQ=60)
cggggaaagG‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATGCCGACGACGCGGTGCCGCAT < SRR4302518.7231478/92‑1 (MQ=60)
nnngaaagG‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑AACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATGCCGACGACGCGGTGCCGCATT < SRR4302518.10713311/93‑1 (MQ=60)
ggggaaagG‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATGCCGACGACGCGGTGCCGCNNN > SRR4302518.8626770/9‑101 (MQ=60)
ggggaaagG‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATGCCGACGACGCGGTGCCGCATT < SRR4302518.730304/93‑1 (MQ=60)
G‑‑AAAG‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CCCCAGCGTCTGACAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATGCCGACGACGCGGTGCCGCATTATC < SRR4302518.6762132/101‑1 (MQ=60)
G‑‑AAAG‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTGCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATGCCGACGACGCGGTGCCGCATTNNN > SRR4302518.10594526/1‑101 (MQ=60)
nnnaaagG‑CTGCATTGTGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATGCCGACGACGCGGTGCCGCATTA < SRR4302518.10784925/94‑1 (MQ=60)
nnnaaagG‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATGCCGACGACGCGGTGCCGCATTA < SRR4302518.12859628/94‑1 (MQ=60)
nnnaaagG‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATGCCGACGACGCGGTGCCGCATTA < SRR4302518.12609820/94‑1 (MQ=60)
nnnaagG‑CTGCATTATGGGAAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGGCCTTCAACCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATGCCGGCGACGCGGTGCCGCATTAT < SRR4302518.7522580/95‑1 (MQ=60)
nnnagG‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATGCCGACGACGCGGTGCCGCATTATC < SRR4302518.10450598/96‑1 (MQ=60)
nnnagG‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATGCCGACGACGCGGTGCCGCATTATC < SRR4302518.9615685/96‑1 (MQ=60)
AAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CCCCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATGCCGACGACGCGGTGCCGCATTATCTG < SRR4302518.5219618/101‑1 (MQ=60)
AAG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATGCCGACGACGCGGTGCCGCAATATCTG > SRR4302518.436870/1‑101 (MQ=60)
AAAG‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATGCCGACGACGCGGTGCCGCATTATCT < SRR4302518.5541774/101‑1 (MQ=60)
AAAG‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATGCCGACGACGCGGTGCCGCATTATCT > SRR4302518.4034811/1‑101 (MQ=60)
AG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATGCCGACGACGCGGTGCCGCATTATCTGC < SRR4302518.5203115/101‑1 (MQ=60)
AG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATGCCGACGACGCGGTGCCGCATTATCTGC < SRR4302518.474628/101‑1 (MQ=60)
AG‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑AACCATCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGTAGTGATTGGTACTAATGCCTACGACGCGGTGCCGCTTTATCTGC > SRR4302518.1692633/1‑101 (MQ=60)
N‑‑N‑NTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATGCCGACGACGCGGTGCCGCATTATCTGCG < SRR4302518.13274244/101‑1 (MQ=60)
N‑‑N‑NTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATGCCGACGACGCGGTGCCGCATTATCTGCG < SRR4302518.8089005/101‑1 (MQ=60)
G‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATGCCGACGACGCGGTGCCGCATTATCTGCG < SRR4302518.3651715/101‑1 (MQ=60)
G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATGCCGACGACGCGGTGCCGCATTATCTGCGT < SRR4302518.206777/101‑1 (MQ=60)
G‑CTGCATTATGGGCAGTGCG‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACT‑ATGCCGACGACGCGGTGCCGCCTTATCTGCNNN > SRR4302518.13113857/1‑101 (MQ=60)
|
CATGCGCTGGAAGGCTGGCGAACT‑GGCTACAG‑CTGAAGGATT‑G‑ATTGCGTT‑‑GTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATG‑‑GC‑‑GG‑G‑‑AAA‑‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGGC‑CACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCT‑GAAGTGATTGGTACTAATGCCGACGACGCGGTGCCGCATTATCTGCGTA > NC_000913/4008379‑4008573
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 7 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
