Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A0 F0 I1 R1
|
245 |
579.6 |
28867798 |
97.7% |
28203838 |
96.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,013,772 |
+C |
intergenic (‑53/‑246) |
ysgA ← / → udp |
hypothetical protein/uridine phosphorylase |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,013,770 | 1 | . | C | 99.4%
| 2133.0
/ 1.0
| 530 | intergenic (‑51/‑248) | ysgA/udp | hypothetical protein/uridine phosphorylase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (1/2); new base C (291/236); total (292/238) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.90e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 |
Only 100 of 578 total aligned reads displayed.
ATCGCGTCGTCCGGGGTCTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGC‑ATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTA‑CCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTGCAG > NC_000913/4013676‑4013860
|
tCGCGTCGTCCGGGGTCTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTA‑c < 2:8338657/96‑1 (MQ=255)
cgtcgtCCGGGGTCTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTA‑ccct > 2:1287682/1‑94 (MQ=255)
gtcgtcCGGGGTCTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTA‑ccctt < 1:3212511/96‑4 (MQ=255)
gtcgtcCGGGGTCTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTA‑ccctt < 1:3451484/96‑4 (MQ=255)
tcgtcCGGGGTCTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTA‑ccctta < 2:6740910/96‑5 (MQ=255)
gtcCGGGGTCTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACCCTtata > 1:9564147/1‑96 (MQ=255)
gtcCGGGGTCTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACCCTtata < 1:8795938/96‑1 (MQ=255)
gtcCGGGGTCTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACCCTtata > 1:10302275/1‑96 (MQ=255)
tcCGGGGTCTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACCCTTATaa < 1:13834076/96‑1 (MQ=255)
caggggTCTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACCCTTATaaa > 1:10579780/3‑96 (MQ=255)
ggggTCTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACCCTTATaaaaa < 2:6431587/96‑1 (MQ=255)
gTCTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACCCTTATAAAAATGt > 2:9475519/1‑96 (MQ=255)
gTCTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACCCTTATAAAAATGt > 2:1460169/1‑96 (MQ=255)
gTCTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACCCTTATAAAAATGt > 2:1036455/1‑96 (MQ=255)
tCTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACCCTTATAAAAATGtt > 1:8221800/1‑96 (MQ=255)
cTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACCCTTATAAAAATGTTg > 1:1543483/1‑96 (MQ=255)
cTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACCCTTATAAAAATGTTg > 1:7534441/1‑96 (MQ=255)
aCGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACCCTTATAAAAATGTTGCGCa < 2:13540951/96‑1 (MQ=255)
gATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACCCTTATAAAAATGTTGCGCAAt < 2:2409115/96‑1 (MQ=255)
gATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACCCTTATAAAAATGTTGCGCAAt < 2:9769059/96‑1 (MQ=255)
gATGGTCGAAGCGAGACGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACCCTTATAAAAATGTTGCGCaac < 1:9756327/96‑2 (MQ=255)
ggTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGtt > 2:5314939/1‑96 (MQ=255)
gTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTa < 2:5604025/96‑1 (MQ=255)
gAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACt > 1:13708775/1‑96 (MQ=255)
gAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACt > 1:14123323/1‑96 (MQ=255)
cGAGAGGCGATGCAGCAGGGGCAAATCCAGGTTGTTGAGGTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAg > 1:4100154/1‑96 (MQ=255)
gagaGGCGATGCAGCTGGGGCAAATCCAGATTGTTGGGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGt > 1:6740662/1‑96 (MQ=255)
gagaGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGt > 2:7261958/1‑96 (MQ=255)
ggcgaTGCAGCAGGTGCAAGTCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACCCTTAGAAAAATGTTGCGCAATCTTAACTATAGTCAGc < 1:1211857/92‑1 (MQ=255)
cgaTGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGTCATGGTATTCTCCGTACCCTTATAAAAATGTTGAGCAATGTTAACTATAGTCAGCAt > 2:10163116/3‑96 (MQ=255)
cgaTGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCAt > 1:6559766/3‑96 (MQ=255)
gaTGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATg > 1:6168994/2‑96 (MQ=255)
gaTGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATg > 2:9227006/2‑96 (MQ=255)
gaTGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATg < 1:4856823/95‑1 (MQ=255)
tGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGca > 2:9057583/1‑96 (MQ=255)
tGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGca > 1:2548233/1‑96 (MQ=255)
gcagcaGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGcaa < 1:12770710/96‑1 (MQ=255)
cagcagGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATTcaac < 1:1111890/96‑1 (MQ=255)
cagcagGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGcaac > 2:421447/1‑96 (MQ=255)
agcagGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGcaaca > 2:6991706/1‑96 (MQ=255)
agcagGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGcaaca > 2:2545868/1‑96 (MQ=255)
cagGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACaaa > 1:13606275/1‑96 (MQ=255)
tGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATcac > 2:1128619/1‑96 (MQ=255)
gCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATcaca > 1:11508613/1‑96 (MQ=255)
aaaTCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACAtt < 2:11923077/96‑1 (MQ=255)
aaaTCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGAATTCTCCGTACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACAtt > 1:4326952/1‑96 (MQ=255)
aaTCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAATTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTg < 2:11425959/96‑1 (MQ=255)
aaTCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTg < 2:1725353/96‑1 (MQ=255)
aaTCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTg < 2:2725468/96‑1 (MQ=255)
aaTCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTg < 2:8628423/96‑1 (MQ=255)
aTCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGc > 2:7908446/1‑96 (MQ=255)
aTCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACGATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGc < 2:13890598/96‑1 (MQ=255)
tCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGcc < 1:7193570/96‑1 (MQ=255)
ccAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCt < 2:5031774/96‑1 (MQ=255)
aGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGa < 2:10720467/96‑1 (MQ=255)
gATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTCTTCTCCGTACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGaa < 1:10100279/96‑1 (MQ=255)
gATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGaa > 1:8439493/1‑96 (MQ=255)
gATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGaa < 2:1512453/96‑1 (MQ=255)
aTTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAAt > 2:6362556/1‑96 (MQ=255)
ttgttgTGTTGTTGCCATGTTATTCTCCGTACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATc < 2:7534441/96‑1 (MQ=255)
ttgttgTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATc < 1:10923175/96‑1 (MQ=255)
ttgttgTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATc < 1:7891666/96‑1 (MQ=255)
ttgttgTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATc < 2:13100724/96‑1 (MQ=255)
tgttgtgttgTTGCCATGGTATTCTCCGTACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCg > 1:5826813/1‑96 (MQ=255)
tgttgtgttgTTGCCATGGTATTCTCCGTACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCg > 2:10507110/1‑96 (MQ=255)
tgttgtgttgTTGCCATGGTATTCTCCGTACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCg > 1:543442/1‑96 (MQ=255)
gttgtgttgtTGCCATGGTATTCTCCGTACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCgg > 2:2137510/1‑96 (MQ=255)
gttgtgttgtTGCCATGGTATTCTCCGTACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCgg > 1:888739/1‑96 (MQ=255)
tgtgttgtTGCCATGGTATTCTCCGTACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCt > 1:1897485/1‑96 (MQ=255)
tgtgttgtTGCCATGGTATTCTCCGTACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCt > 1:14386806/1‑96 (MQ=255)
tgtgttgtTGCCATGGTATTCTCCGTACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCt > 2:13661836/1‑96 (MQ=255)
gtgttgtTGCCATGGTATTCTCCGTACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACCTTGCCTGAATCGGCTc < 2:6188566/96‑1 (MQ=255)
tgttgtTGCCATGGTATTCTCCGTACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCa < 1:2709821/96‑1 (MQ=255)
tgttgtTGCCATGGTATCCTCCGTACCCTTACAAAAATGGTTCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCa < 1:2833275/96‑1 (MQ=255)
gttgttGCCATGGTATTCTCCGTACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCAt < 2:12055103/96‑1 (MQ=255)
tgttgCCATGGTATTCTCCGTACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCt > 1:12667000/1‑96 (MQ=255)
tgttgCCATGGTATTCTCCGTACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCt > 1:11739157/1‑96 (MQ=255)
tgttgCCATGGTATTCTCCGTACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCt < 1:6880147/96‑1 (MQ=255)
gttgCCATGGTATTCTCCGTACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCtt > 1:2363123/1‑96 (MQ=255)
tgCCATGGTATTCTCCGTACCCTTATAAAAATGTTGCGAAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACCTTGCCTGAATCGGCTCATCtttt > 2:12618143/1‑96 (MQ=255)
ccATGGTATTCTCCGTACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTAt < 1:13009431/96‑1 (MQ=255)
cATGGTATTCTCCGTACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATg > 2:4403358/1‑96 (MQ=255)
cATGGTATTCTCCGTACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATg > 2:12405989/1‑96 (MQ=255)
cATGGTATTCTCCGTACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATg > 2:3446798/1‑96 (MQ=255)
aTGGTATTCTCCGTACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGc > 2:3826711/1‑96 (MQ=255)
aTGGTATTCTCCGTACCCTTATAAAAATGTTGCACAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATAACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGc > 2:14090745/1‑96 (MQ=255)
tGGTATTCTCCGTACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCa < 1:9956912/96‑1 (MQ=255)
tGGTATTCTCCGTACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCa > 2:13383583/1‑96 (MQ=255)
ggTATTCTCCGTACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAg < 1:4636260/96‑1 (MQ=255)
ggTATTCTCCGTACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAg < 1:2131301/96‑1 (MQ=255)
ggTATTCTCCGTACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGGTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCCTCTTTTATGCAg > 1:1988926/1‑96 (MQ=255)
gTATTCTCCGTACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGt > 2:3278313/1‑96 (MQ=255)
aTTCTCCGTACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTcc > 2:8192141/1‑96 (MQ=255)
ttCTCCGTACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCt < 1:9132755/96‑1 (MQ=255)
ttCTCCGTACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCt > 1:3850746/1‑96 (MQ=255)
ttCTCCGTACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCt < 2:4764380/96‑1 (MQ=255)
tctcCGTACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTg > 1:5151499/1‑96 (MQ=255)
tctcCGTACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTg > 2:3133159/1‑96 (MQ=255)
ctcCGTACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTGc > 1:5652916/1‑96 (MQ=255)
ccGTACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTGCAg > 2:14342624/1‑96 (MQ=255)
|
ATCGCGTCGTCCGGGGTCTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGC‑ATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTA‑CCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTGCAG > NC_000913/4013676‑4013860
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 351 total aligned reads displayed.
ACAATCGCGTCGTCCGGGGTCTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGC‑ATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑A‑CCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTGCAGAATGAAGGGTGA > NC_000913/4013673‑4013872
|
CCAATCGCGTCGTCCGGGGTCTGAACGATGGGCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑A‑CC < SRR4302518.1818575/101‑1 (MQ=60)
CAATCGCGTCGTCCGGGGTCTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑A‑NNN > SRR4302518.9627286/1‑101 (MQ=60)
CAATCGCGTCGTCCGGGGTCTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑A‑CCC > SRR4302518.3902964/1‑101 (MQ=60)
NNNCGCGTCGTCCGGGGTCTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑A‑CCCT < SRR4302518.10418353/101‑1 (MQ=60)
NNNCGCGTCGTCCGGGGTCTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATAGTATTCTCCGT‑A‑CCCT < SRR4302518.13794144/101‑1 (MQ=60)
AATCGCGTCGTCCGGGGTCTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑A‑CNNN > SRR4302518.8024516/1‑101 (MQ=60)
AATCGCGTCGTCCGGGGTCTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑A‑CCCT > SRR4302518.6600750/1‑101 (MQ=60)
ATCGCGTCGTCCGGGGTCTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑A‑CCctt < SRR4302518.3612158/101‑4 (MQ=60)
ATCGCGTCGTCCGGGGTCTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑A‑CCctt < SRR4302518.3362005/101‑4 (MQ=60)
ATCGCGTCGTCCGGGGTCTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGGATTCTCCGT‑A‑CCNNN > SRR4302518.11753429/1‑101 (MQ=60)
TCGCGTCGTCCGGGGTCTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTA < SRR4302518.4737127/101‑1 (MQ=60)
NNNCGTCGTCCGGGGTCTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTA < SRR4302518.12919402/101‑1 (MQ=60)
NNNCGTCGGCCGGGGTCTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTA < SRR4302518.9472575/101‑1 (MQ=60)
CGCGTCGTCCGGGGTCTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTAT < SRR4302518.289202/101‑1 (MQ=60)
CGCGTCGTCCGGGGTCTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGGGCAATTCCAGATTGTTCTGTTCTTGCCATGGTATTCTCCGT‑A‑CCctnnn > SRR4302518.7505359/1‑96 (MQ=60)
NNNTCGTCCGGGGTCTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATA < SRR4302518.10192783/101‑1 (MQ=60)
GCGTCGTCCGGGGTATGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATA < SRR4302518.3149433/101‑1 (MQ=60)
NNNCGTCCGGGGTCTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑A‑CCcttatac < SRR4302518.14457495/101‑8 (MQ=60)
GTCGTCCGGGGTCTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAA > SRR4302518.1642828/1‑101 (MQ=60)
GTCGTCCGGGGTCTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAA < SRR4302518.2041985/101‑1 (MQ=60)
GTCGTCCGGGGTCTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑A‑CCcttatnnn > SRR4302518.13264981/1‑93 (MQ=60)
GTCGTCCGGGGGCTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAA > SRR4302518.5408313/1‑101 (MQ=60)
TCGTCCGGGGTCTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAA < SRR4302518.6069510/101‑1 (MQ=60)
tcTCCGGGGTCTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAA < SRR4302518.6079747/99‑1 (MQ=60)
GTCCGGGGTCTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAANNN > SRR4302518.14829070/1‑101 (MQ=60)
GTCCGGGGTCTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAANNN > SRR4302518.10026840/1‑101 (MQ=60)
GTCCGGGGTCTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAANNN > SRR4302518.10788004/1‑101 (MQ=60)
GTCCGGGGTCTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAAT < SRR4302518.2964913/101‑1 (MQ=60)
GTCCGGGGTCTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAAT > SRR4302518.2564759/1‑101 (MQ=60)
CAGGGGTCTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAANNN > SRR4302518.11076283/1‑101 (MQ=60)
CGGGGTCTGAACGCTGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTT < SRR4302518.3599629/101‑1 (MQ=60)
NNNGTCTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTC < SRR4302518.14375538/101‑1 (MQ=60)
GGGTCTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCAATTCAGCAGGGGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGCATTCTCCGTGC‑CCTTATAAAACTGATGC > SRR4302518.5178517/1‑101 (MQ=60)
GGTCTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTCTTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTNNN > SRR4302518.10594048/1‑101 (MQ=60)
GGTCTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTNNN > SRR4302518.12615988/1‑101 (MQ=60)
GGTCTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCG > SRR4302518.176901/1‑101 (MQ=60)
NNNGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCA < SRR4302518.10343866/101‑1 (MQ=60)
CTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGNNN > SRR4302518.7921051/1‑101 (MQ=60)
CTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAA > SRR4302518.1609923/1‑101 (MQ=60)
TGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAAT > SRR4302518.2308339/1‑101 (MQ=60)
TAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGAGTTGTTGCCAGGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCANNN > SRR4302518.9240266/1‑101 (MQ=60)
GAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATG < SRR4302518.3573377/101‑1 (MQ=60)
NNNGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGT < SRR4302518.9598857/101‑1 (MQ=60)
NNNATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTT < SRR4302518.12066458/101‑1 (MQ=60)
NNNTGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTA < SRR4302518.10712484/101‑1 (MQ=60)
CGATGGTCTAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATNTTA < SRR4302518.416040/101‑1 (MQ=60)
CGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTA > SRR4302518.1321284/1‑101 (MQ=60)
CGAGGGGCGAAGCCAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGAATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTA < SRR4302518.2352083/101‑1 (MQ=60)
ATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAAC < SRR4302518.2392899/101‑1 (MQ=60)
TGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACT < SRR4302518.1084971/101‑1 (MQ=60)
TGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGGGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACT > SRR4302518.5172813/1‑101 (MQ=60)
NNNTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACT < SRR4302518.8611498/101‑1 (MQ=60)
NNNTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACT < SRR4302518.10362924/101‑1 (MQ=60)
GTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACNNN > SRR4302518.14950286/1‑101 (MQ=60)
TCGAAGCGAGAAGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATTTTGCGCAATGTTAACTTTA > SRR4302518.7065306/1‑101 (MQ=60)
NNNAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATA < SRR4302518.14477063/101‑1 (MQ=60)
gatgcgagcgtcgatacagtcGGTGCAAATCCAGATTGTTGTTTTGTTGCCATGGTATTCGCCCT‑ACCCTTATAAACATGTTTCGCAATGTTAACCATAGT < SRR4302518.2235867/80‑1 (MQ=44)
AAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTC < SRR4302518.5087474/101‑1 (MQ=60)
AGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCA > SRR4302518.2222555/1‑101 (MQ=60)
AGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCA < SRR4302518.637870/101‑1 (MQ=60)
nnngaggcgATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCATC < SRR4302518.14923073/92‑1 (MQ=60)
CGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAGTCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTAGAAAAATGTTGCGCAATCTTAACTATAGTCAGC < SRR4302518.1260946/101‑1 (MQ=60)
CGAGAGGCGATGCAGCAGGGGCAAATCCAGGTTGTTGAGGTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGC > SRR4302518.4298767/1‑101 (MQ=60)
CAAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCNNN > SRR4302518.11617800/1‑101 (MQ=60)
GAGAGGCGATGCAGCTGGGGCAAATCCAGATTGTTGGGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCA > SRR4302518.7092018/1‑101 (MQ=60)
GAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCA > SRR4302518.4774978/1‑101 (MQ=60)
AGAGGCGATGCAGCAGGGGCAAATCCAGGTTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTACGCAATGTTAACTATAGTCAGgag > SRR4302518.7231765/1‑98 (MQ=60)
GAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCNNN > SRR4302518.14348186/1‑101 (MQ=60)
aagcgATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCANNN > SRR4302518.11291148/6‑101 (MQ=60)
AGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGC > SRR4302518.4153237/1‑101 (MQ=60)
NNN‑ATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAA < SRR4302518.13365966/101‑1 (MQ=60)
GGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATNNN > SRR4302518.14732628/1‑101 (MQ=60)
GGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCA > SRR4302518.466639/1‑101 (MQ=60)
GGCGATGCAGCAGGGGCAAATCACGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCA < SRR4302518.2071783/101‑1 (MQ=60)
cgATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATTCAAC < SRR4302518.1155938/99‑1 (MQ=60)
cgATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAAC > SRR4302518.6896675/3‑101 (MQ=60)
N‑NNGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAAAA < SRR4302518.8287378/101‑1 (MQ=60)
G‑ATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCANNN > SRR4302518.13358966/1‑101 (MQ=60)
G‑ATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACA > SRR4302518.3399207/1‑101 (MQ=60)
NNNCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAA < SRR4302518.14271080/101‑1 (MQ=60)
ATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAA > SRR4302518.922520/1‑101 (MQ=60)
TGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACNNN > SRR4302518.8678472/1‑101 (MQ=60)
TGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACNNN > SRR4302518.15098328/1‑101 (MQ=60)
TGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAA > SRR4302518.5014076/1‑101 (MQ=60)
TGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAA > SRR4302518.1010324/1‑101 (MQ=60)
GCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAAT < SRR4302518.755941/101‑1 (MQ=60)
NNNCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATC < SRR4302518.12002229/101‑1 (MQ=60)
CAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATC > SRR4302518.2736525/1‑101 (MQ=60)
CAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATC > SRR4302518.5843917/1‑101 (MQ=60)
AGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCA > SRR4302518.3664805/1‑101 (MQ=60)
AGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCA > SRR4302518.2831212/1‑101 (MQ=60)
NNNGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCCTGCAACAAATCAC < SRR4302518.11480715/101‑1 (MQ=60)
GCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCAC < SRR4302518.5444105/101‑1 (MQ=60)
GAAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATNNN > SRR4302518.11145414/1‑101 (MQ=60)
CAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCNNN > SRR4302518.14230295/1‑101 (MQ=60)
CAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACA < SRR4302518.212136/101‑1 (MQ=60)
CAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACA > SRR4302518.4017064/1‑101 (MQ=60)
CAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACA > SRR4302518.1431052/1‑101 (MQ=60)
CAGGGGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACA > SRR4302518.6542446/1‑101 (MQ=60)
AGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCANNN > SRR4302518.10796700/1‑101 (MQ=60)
GGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATT > SRR4302518.5452728/1‑101 (MQ=60)
GGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATT < SRR4302518.4272521/101‑1 (MQ=60)
GGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATT > SRR4302518.6748224/1‑101 (MQ=60)
GGTGCAAATCCAGATTGGTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTACGCAATGTTAACTATATTCAGCATACAACAAATTACATT > SRR4302518.712561/1‑101 (MQ=60)
GTGCCAGTCCAGAATGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCACTGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTG < SRR4302518.4480640/101‑1 (MQ=60)
GTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTG < SRR4302518.3149255/101‑1 (MQ=60)
GTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTG > SRR4302518.1577248/1‑101 (MQ=60)
GTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTG > SRR4302518.208190/1‑101 (MQ=60)
GTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACANNN > SRR4302518.14331020/1‑101 (MQ=60)
TGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGC > SRR4302518.4931714/1‑101 (MQ=60)
TGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGC > SRR4302518.2592677/1‑101 (MQ=60)
GCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTNNN > SRR4302518.12048574/1‑101 (MQ=60)
CAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGNNN > SRR4302518.14832982/1‑101 (MQ=60)
NNNTCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTG < SRR4302518.12494612/101‑1 (MQ=60)
AAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTG < SRR4302518.7156890/101‑1 (MQ=60)
AAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTG > SRR4302518.7225588/1‑101 (MQ=60)
AAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGAATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTG > SRR4302518.4542897/1‑101 (MQ=60)
NNNCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTAA < SRR4302518.12203597/101‑1 (MQ=60)
AATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCNNN > SRR4302518.8014486/1‑101 (MQ=60)
NNNCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTCTTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAA < SRR4302518.10578303/101‑1 (MQ=60)
ATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAA > SRR4302518.588425/1‑101 (MQ=60)
TCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGNNN > SRR4302518.8948915/1‑101 (MQ=60)
NNNGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATC < SRR4302518.11435070/101‑1 (MQ=60)
CCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATC > SRR4302518.5938080/1‑101 (MQ=60)
CCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATC < SRR4302518.6418777/101‑1 (MQ=60)
CCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACAATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGANNN > SRR4302518.13343778/1‑101 (MQ=60)
NNNTTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCCG < SRR4302518.13576561/101‑1 (MQ=60)
GATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCNNN > SRR4302518.8852723/1‑101 (MQ=60)
ATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCT > SRR4302518.830663/1‑101 (MQ=60)
ATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCT > SRR4302518.1456272/1‑101 (MQ=60)
GTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGNNN > SRR4302518.13697166/1‑101 (MQ=60)
TGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCA < SRR4302518.627431/101‑1 (MQ=60)
TGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCA < SRR4302518.2838788/101‑1 (MQ=60)
TGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCNNN > SRR4302518.9407935/1‑101 (MQ=60)
GTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTNNN > SRR4302518.10140878/1‑101 (MQ=60)
TTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATC < SRR4302518.6122798/101‑1 (MQ=60)
TTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATC > SRR4302518.580839/1‑101 (MQ=60)
TGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCT > SRR4302518.1983428/1‑101 (MQ=60)
TGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCANNN > SRR4302518.15053943/1‑101 (MQ=60)
NNNGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCT < SRR4302518.9436970/101‑1 (MQ=60)
GTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTT < SRR4302518.2058913/101‑1 (MQ=60)
NNNTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTT < SRR4302518.9934689/101‑1 (MQ=60)
TTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTA > SRR4302518.5643379/1‑101 (MQ=60)
TGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTTCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATAGCCTGAATCGGCTCATCTTTTAT > SRR4302518.5987240/1‑101 (MQ=60)
TGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTAT < SRR4302518.5553304/101‑1 (MQ=60)
TGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTNNN > SRR4302518.12294575/1‑101 (MQ=60)
TGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTNNN > SRR4302518.13076280/1‑101 (MQ=60)
GTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTNNN > SRR4302518.9223531/1‑101 (MQ=60)
GTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATG > SRR4302518.737149/1‑101 (MQ=60)
TTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTANNN > SRR4302518.11212740/1‑101 (MQ=60)
TTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTANNN > SRR4302518.7649606/1‑101 (MQ=60)
NNNCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGC < SRR4302518.8812587/101‑1 (MQ=60)
NNNCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATCC < SRR4302518.12659279/101‑1 (MQ=60)
TGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATNNN > SRR4302518.9168548/1‑101 (MQ=60)
TGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATACTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCA > SRR4302518.442820/1‑101 (MQ=60)
NNNCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCA < SRR4302518.10431087/101‑1 (MQ=60)
GCCATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAG < SRR4302518.906361/101‑1 (MQ=60)
CATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCANNN > SRR4302518.7722344/1‑101 (MQ=60)
CATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTC < SRR4302518.1418837/101‑1 (MQ=60)
CATGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTC < SRR4302518.1524365/101‑1 (MQ=60)
TGGTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTNNN > SRR4302518.11666077/1‑101 (MQ=60)
nnnattctccgttcCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCATCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTG < SRR4302518.13120380/87‑1 (MQ=60)
GTATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGAAGTCCTGC > SRR4302518.2891920/1‑101 (MQ=60)
TATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTGCA < SRR4302518.724792/101‑1 (MQ=60)
TATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGGCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGCCTCATCTTTTAGTCAGTCCTNNN > SRR4302518.9881428/1‑101 (MQ=60)
ATTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTGCAG < SRR4302518.2560623/101‑1 (MQ=60)
TTCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTGCAGA < SRR4302518.7135389/101‑1 (MQ=60)
NNNTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTGCAGA < SRR4302518.7363071/101‑1 (MQ=60)
TCTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTGCAGAA > SRR4302518.6500127/1‑101 (MQ=60)
CTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAGCTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTGCAGNNN > SRR4302518.11425315/1‑101 (MQ=60)
CTCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTGCAGNNN > SRR4302518.9328154/1‑101 (MQ=60)
TCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTGCAGANNN > SRR4302518.8535473/1‑101 (MQ=60)
TCCGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTGCAGAATG < SRR4302518.4615783/101‑1 (MQ=60)
CGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTGCAGAATGAG > SRR4302518.3011099/1‑101 (MQ=60)
CGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTGCAGAATGAA > SRR4302518.1229013/1‑101 (MQ=60)
CGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTGCAGAATGAA > SRR4302518.4061847/1‑101 (MQ=60)
CGT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATATTTTATGCAGTCCTGCAGAATGAA > SRR4302518.2708099/1‑101 (MQ=60)
nnnacCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTGCAGAATGAA < SRR4302518.11304057/96‑1 (MQ=60)
ngtacCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTGCAGAATGAA < SRR4302518.903744/96‑1 (MQ=60)
NN‑N‑CCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTGCAGAATGAAGG < SRR4302518.8701074/101‑1 (MQ=60)
GT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTGCAGAATGNNN > SRR4302518.11783595/1‑101 (MQ=60)
GT‑ACCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTGCAGAATGNNN > SRR4302518.8496914/1‑101 (MQ=60)
tacCCTTATAAAAATTTTCCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTTCCTGAATCGGTTCATCGTTTATGCAGTCCTGgcgaatcannn > SRR4302518.14414020/4‑90 (MQ=60)
tacCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTGCAGCATGANNN > SRR4302518.8743383/4‑101 (MQ=60)
tacCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTGCAGAATGANNN > SRR4302518.7834768/4‑101 (MQ=60)
tacCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTGCAGAATGAAGG > SRR4302518.6846651/4‑101 (MQ=60)
tacCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTGCAGAATGAAGG > SRR4302518.309356/4‑101 (MQ=60)
acCCTTATAAAAATGTTGCGCTATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTGCAGAACGAANNN > SRR4302518.13468464/3‑101 (MQ=60)
acCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTGCAGAATGAANNN > SRR4302518.12281042/3‑101 (MQ=60)
acCCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTGCAGAATGAANNN > SRR4302518.14499049/3‑101 (MQ=60)
C‑CCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTGCAGAATGAAGNNN > SRR4302518.10473919/1‑101 (MQ=60)
C‑CCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTGCAGAATGAAGGGT < SRR4302518.5151109/101‑1 (MQ=60)
C‑CCTTATAAAAATGGTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGTCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCTGTCCTGCAGCATGAAGGGG > SRR4302518.501151/1‑101 (MQ=60)
NNNTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTGCAGAATGAAGGGTG < SRR4302518.13564498/101‑1 (MQ=60)
CCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTGCAGAATGAAGGNNN > SRR4302518.9647160/1‑101 (MQ=60)
CCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTGCAGAATGAAGGGTG < SRR4302518.2765325/101‑1 (MQ=60)
CCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTGCAGAATGAAGGGTG > SRR4302518.2525096/1‑101 (MQ=60)
CCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTAAATTAAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTGCAGAATGAAGGGTG < SRR4302518.7296433/101‑1 (MQ=60)
CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTGCAGAATGAAGGGTGA < SRR4302518.4079097/101‑1 (MQ=60)
CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTGCAGAATGAAGGGTGA > SRR4302518.951356/1‑101 (MQ=60)
|
ACAATCGCGTCGTCCGGGGTCTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGC‑ATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑A‑CCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTGCAGAATGAAGGGTGA > NC_000913/4013673‑4013872
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |