Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1624 |
250.6 |
12620048 |
98.0% |
12367647 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
752,007 |
T→C |
G4G (GGA→GGG) |
ybgD ← |
putative fimbrial‑like protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 752,007 | 0 | T | C | 100.0%
| 641.3
/ NA
| 198 | G4G (GGA→GGG) | ybgD | putative fimbrial‑like protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (43/155); total (43/155) |
Only 100 of 203 total aligned reads displayed.
CTTAAAGTGAATTTCGCCAGAACCTTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGTCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTTGATTATTGCTAGTTTTTAGTT > NC_000913/751917‑752096
|
cTTAAAGTGAATTTCGCCAGAACCTTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGccc < 2:1141529/93‑1 (MQ=255)
ttAAAGTGAATTTCGCCAGAACCTTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCt < 2:4493684/93‑1 (MQ=255)
tAAAGTGAATTTCGCCAGAACCTTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCtt < 2:4193251/93‑1 (MQ=255)
tAAAGTGAATTTCGCCAGAACCTTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCtt < 1:5095825/93‑1 (MQ=255)
aaGTGAATTTCGCCAGAACCTTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTa < 1:1561538/93‑1 (MQ=255)
aaGTGAATTTCGCCAGAACCTTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTa < 2:185088/93‑1 (MQ=255)
aGTGAATTTCGCCAGAACCTTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTaa > 2:5393397/1‑93 (MQ=255)
aGTGAATTTCGCCAGAACCTTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTaa < 2:6026894/93‑1 (MQ=255)
gTGAATTTCGCCAGAACCTTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTaaa > 2:2357686/1‑93 (MQ=255)
gAATTTCGCCAGAACCTTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACa < 1:4191145/93‑1 (MQ=255)
aaTTTCGCCAGAACCTTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACAt < 2:93456/93‑1 (MQ=255)
aTTTCGCCAGAACCTTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATa < 2:2836790/93‑1 (MQ=255)
ttCGCCAGAACCTTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAAc < 2:5684217/93‑1 (MQ=255)
ttCGCCAGAACCTTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAAc < 2:3265001/93‑1 (MQ=255)
ttCGCCAGAACCTTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAAc < 1:1198765/93‑1 (MQ=255)
tCGCCAGAACCTTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACa < 2:4115315/93‑1 (MQ=255)
tCGCCAGAACCTTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACa < 2:6240383/93‑1 (MQ=255)
cgacAGAACCTTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACag < 1:1889065/90‑1 (MQ=255)
cGCCAGAACCTTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACag > 1:4634045/1‑93 (MQ=255)
gCCAGAACCTTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACaga < 2:4988392/93‑1 (MQ=255)
gCCAGAACCTTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACaga < 2:4847172/93‑1 (MQ=255)
ccAGAACCTTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACagag > 1:33505/1‑93 (MQ=255)
aGAACCTTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTc < 2:6107487/93‑1 (MQ=255)
gAACCTTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTcc > 2:2148191/1‑93 (MQ=255)
gAACCTTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTcc > 2:3775926/1‑93 (MQ=255)
cTTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTa > 1:943110/1‑93 (MQ=255)
tcatcaGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAg < 1:5450996/93‑1 (MQ=255)
catcaGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTTCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAgg < 1:2857637/93‑1 (MQ=255)
atcaGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGa < 1:3170383/93‑1 (MQ=255)
atcaGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGa < 1:3606782/93‑1 (MQ=255)
tcaGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGat < 2:705572/93‑1 (MQ=255)
cagcagCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGata < 2:4706798/93‑1 (MQ=255)
cagcagCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGata < 2:2437626/93‑1 (MQ=255)
agcagcATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGatat < 1:2828673/93‑1 (MQ=255)
agcagcATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGatat < 2:5616444/93‑1 (MQ=255)
cagcaTAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAg < 2:4916593/93‑1 (MQ=255)
agcaTAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGa < 2:5882353/93‑1 (MQ=255)
gcaTAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGaa < 2:2138089/93‑1 (MQ=255)
caTAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAAt > 2:2729258/1‑93 (MQ=255)
aaaCAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAgg < 1:563667/93‑1 (MQ=255)
aaaCAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAgg < 2:1877166/93‑1 (MQ=255)
aaaCAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAgg < 1:763651/93‑1 (MQ=255)
aaCAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAggg < 2:3629572/93‑1 (MQ=255)
aaCAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAggg < 1:531018/93‑1 (MQ=255)
aCAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAgggg > 2:2904895/1‑93 (MQ=255)
cAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGt < 2:2186332/93‑1 (MQ=255)
aGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGta < 1:3246836/93‑1 (MQ=255)
aGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGta < 1:2449938/93‑1 (MQ=255)
aGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGta < 2:1938446/93‑1 (MQ=255)
ggTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGtat < 2:5783793/93‑1 (MQ=255)
ggTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGtat < 2:6011106/93‑1 (MQ=255)
ggTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGtat < 1:3719686/93‑1 (MQ=255)
gTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGtata < 2:776044/93‑1 (MQ=255)
gTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGtata < 1:520128/93‑1 (MQ=255)
gTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGtata < 1:2981428/93‑1 (MQ=255)
tGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAg < 2:3316927/93‑1 (MQ=255)
gCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGc > 1:2268282/1‑93 (MQ=255)
gCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGc < 2:626628/93‑1 (MQ=255)
aGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTa < 2:4273014/93‑1 (MQ=255)
gTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTAc > 1:1060546/1‑93 (MQ=255)
gTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTAc > 1:446994/1‑93 (MQ=255)
gTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTAc < 2:412301/93‑1 (MQ=255)
gTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTAc < 1:3549008/93‑1 (MQ=255)
tGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACg > 2:657547/1‑93 (MQ=255)
gAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGc > 2:4406219/1‑93 (MQ=255)
aCAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCa > 1:1983138/1‑93 (MQ=255)
aCAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCa < 1:4731408/93‑1 (MQ=255)
cagcagAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAg < 2:3543257/93‑1 (MQ=255)
agcagAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGa < 2:1624250/93‑1 (MQ=255)
agcagAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGa < 1:4402693/93‑1 (MQ=255)
gcagAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGaa < 2:4142059/93‑1 (MQ=255)
cagAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAat < 2:3495756/93‑1 (MQ=255)
agagATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAata < 2:2155682/93‑1 (MQ=255)
agagATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAata > 1:1744326/1‑93 (MQ=255)
agagATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAata > 1:811746/1‑93 (MQ=255)
aTACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGt > 1:4700744/1‑93 (MQ=255)
tACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTa < 2:229784/93‑1 (MQ=255)
tACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTa > 2:527192/1‑93 (MQ=255)
tACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTa > 2:1421633/1‑93 (MQ=255)
aCGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTAt < 1:5051152/93‑1 (MQ=255)
cGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTAtt < 2:352236/93‑1 (MQ=255)
cGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTAtt < 1:2928085/93‑1 (MQ=255)
cGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTAtt < 2:3012096/93‑1 (MQ=255)
cGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTAtt < 1:4314437/93‑1 (MQ=255)
cGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGCAtt < 2:3142555/93‑1 (MQ=255)
ccAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTTGa < 2:1048338/93‑1 (MQ=255)
gTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTTGatta > 1:4051648/1‑93 (MQ=255)
gTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTTGatta < 1:4829421/93‑1 (MQ=255)
gTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTTGatta < 2:4081226/93‑1 (MQ=255)
gTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTTGatta < 1:112292/93‑1 (MQ=255)
tGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAACATCGTATTTGattat < 2:6170503/93‑1 (MQ=255)
gCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTTGattatt < 2:1713909/93‑1 (MQ=255)
gCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTTGATTATTGCt < 1:5397438/93‑1 (MQ=255)
gCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTTGATTATTGCt > 2:1376733/1‑93 (MQ=255)
cAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTTGATTATTGCtag < 2:5033500/93‑1 (MQ=255)
aTGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTTGATTATTGCtagtt < 2:308754/93‑1 (MQ=255)
tGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTTGATTATTGCtagttt > 2:4147504/1‑93 (MQ=255)
tttttGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTTGATTATTGCtagttttta < 2:1482621/93‑1 (MQ=255)
tttttGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTTGATTATTGCtagttttta < 2:4786154/93‑1 (MQ=255)
ttGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTTGATTATTGCtagtttttagtt < 2:889853/93‑1 (MQ=255)
|
CTTAAAGTGAATTTCGCCAGAACCTTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGTCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTTGATTATTGCTAGTTTTTAGTT > NC_000913/751917‑752096
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CCCTTAAAGTGAATTTCGCCAGAACCTTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGTCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTTGATTATTGCTAGTTTTTAGTTTTGC > NC_000913/751915‑752100
|
CCCTTAAAGTGAATTTCGCCAGAACCTTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCC > SRR4302533.2549995/1‑94 (MQ=60)
CCCTTAAAGTGAATTTCGCCAGAACCTTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCC > SRR4302533.4862719/1‑94 (MQ=60)
CTTAAAGTGAATTTCGCCAGAACCTTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCT > SRR4302533.3441850/1‑94 (MQ=60)
CTTAAAGTGAATTTCGCCAGAACCTTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCT < SRR4302533.2188806/94‑1 (MQ=60)
TTAAAGTGAATTTCGCCAGAACCTTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTT < SRR4302533.1764316/94‑1 (MQ=60)
TAAAGTGAATTTCGCCAGAACCTTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTT < SRR4302533.5126615/94‑1 (MQ=60)
AAGTGAATTTCGCCAGAACCTTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAA > SRR4302533.905564/1‑94 (MQ=60)
AAGTGAATTTCGCCAGAACCTTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAA < SRR4302533.1570941/94‑1 (MQ=60)
AGCGAATTTCGCCAGAACCTTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCAAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAA > SRR4302533.3060043/1‑94 (MQ=60)
TGAATTTCGCCAGAACCTTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACA < SRR4302533.5132665/94‑1 (MQ=60)
GAATTTCGCCAGAACCTTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACAT < SRR4302533.4216512/94‑1 (MQ=60)
AATTTCGCCAGAACCTTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATA > SRR4302533.4557934/1‑94 (MQ=60)
TTCGCCAGAACCTTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACA < SRR4302533.5324529/94‑1 (MQ=60)
TTCGCCAGAACCTTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACA < SRR4302533.1205966/94‑1 (MQ=60)
TTCGCCAGAACCTTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACA < SRR4302533.3677878/94‑1 (MQ=60)
TGCGCCAGAACATTCATCAGCAGAATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGTTACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACA < SRR4302533.4461577/94‑1 (MQ=60)
TCGCCAGAACCTTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAG > SRR4302533.4662126/1‑94 (MQ=60)
CGACAGAACCTTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGA < SRR4302533.1900603/94‑1 (MQ=60)
GCCAGAACCTTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAG > SRR4302533.33733/1‑94 (MQ=60)
CCAGAACCTTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGT < SRR4302533.5604672/94‑1 (MQ=60)
CCAGAACCTTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGT > SRR4302533.1093360/1‑94 (MQ=60)
ACCTTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTT < SRR4302533.5425801/94‑1 (MQ=60)
ACCTTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTT < SRR4302533.4434560/94‑1 (MQ=60)
ACCTTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTT < SRR4302533.3603943/94‑1 (MQ=60)
CCTTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTA > SRR4302533.948657/1‑94 (MQ=60)
TTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAG < SRR4302533.3250763/94‑1 (MQ=60)
TCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGG < SRR4302533.5483835/94‑1 (MQ=60)
CATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTTCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGA < SRR4302533.2875219/94‑1 (MQ=60)
ATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGAT < SRR4302533.3189899/94‑1 (MQ=60)
ATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGAT < SRR4302533.3628986/94‑1 (MQ=60)
CAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATAT < SRR4302533.2986204/94‑1 (MQ=60)
CAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATAT < SRR4302533.4750004/94‑1 (MQ=60)
AGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATA < SRR4302533.2846076/94‑1 (MQ=60)
AGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAA < SRR4302533.1440379/94‑1 (MQ=60)
TAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGG < SRR4302533.5050625/94‑1 (MQ=60)
AAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGG < SRR4302533.567006/94‑1 (MQ=60)
AAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGG < SRR4302533.768150/94‑1 (MQ=60)
AACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGG < SRR4302533.534176/94‑1 (MQ=60)
AGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTAT < SRR4302533.3266857/94‑1 (MQ=60)
AGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTAT < SRR4302533.2465058/94‑1 (MQ=60)
GGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATA < SRR4302533.3742518/94‑1 (MQ=60)
GTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAG < SRR4302533.2999665/94‑1 (MQ=60)
GTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAG < SRR4302533.523216/94‑1 (MQ=60)
TGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGC > SRR4302533.2282316/1‑94 (MQ=60)
GCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCT < SRR4302533.1901174/94‑1 (MQ=60)
GCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCT < SRR4302533.2738873/94‑1 (MQ=60)
AGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTAC > SRR4302533.1066781/1‑94 (MQ=60)
AGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTAC > SRR4302533.449668/1‑94 (MQ=60)
GTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACG < SRR4302533.3570876/94‑1 (MQ=60)
GTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACG < SRR4302533.4258575/94‑1 (MQ=60)
AACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCA > SRR4302533.1995276/1‑94 (MQ=60)
AACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCA < SRR4302533.4669596/94‑1 (MQ=60)
ACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAG < SRR4302533.4760093/94‑1 (MQ=60)
AGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAA < SRR4302533.4429274/94‑1 (MQ=60)
CAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATA > SRR4302533.816502/1‑94 (MQ=60)
CAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATA > SRR4302533.1754930/1‑94 (MQ=60)
AGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATAT < SRR4302533.771017/94‑1 (MQ=60)
GATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGT > SRR4302533.4729246/1‑94 (MQ=60)
ATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTA < SRR4302533.4144066/94‑1 (MQ=60)
TACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTAT < SRR4302533.3957739/94‑1 (MQ=60)
TACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTAT < SRR4302533.2850741/94‑1 (MQ=60)
TACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTAT < SRR4302533.5449232/94‑1 (MQ=60)
ACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATT < SRR4302533.5081697/94‑1 (MQ=60)
CGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTT < SRR4302533.4340413/94‑1 (MQ=60)
CGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTT < SRR4302533.3313701/94‑1 (MQ=60)
CGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTT < SRR4302533.2945998/94‑1 (MQ=60)
GGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTTG < SRR4302533.231654/94‑1 (MQ=60)
GCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTTGA < SRR4302533.4347722/94‑1 (MQ=60)
AGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTTGATTA > SRR4302533.4076325/1‑94 (MQ=60)
GTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTTGATTAT < SRR4302533.4858688/94‑1 (MQ=60)
GTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTTGATTAT < SRR4302533.4858687/94‑1 (MQ=60)
GTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTTGATTAT < SRR4302533.112999/94‑1 (MQ=60)
GCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTTGATTATTG < SRR4302533.1197802/94‑1 (MQ=60)
CGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTTGATTATTGC > SRR4302533.1580653/1‑94 (MQ=60)
GCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTTGATTATTGCTA < SRR4302533.5429872/94‑1 (MQ=60)
CAATTTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTTGATTATTGCTAGT > SRR4302533.2933461/1‑94 (MQ=60)
CAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTTGATTATTGCTAGT < SRR4302533.5646604/94‑1 (MQ=60)
TTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTTGATTATTGCTAGTTTTTAGTT < SRR4302533.758688/94‑1 (MQ=60)
TTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTTGATTATTGCTAGTTTTTAGTTT < SRR4302533.5120875/94‑1 (MQ=60)
TTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTTGATTATTGCTAGTTTTTAGTTT > SRR4302533.6267025/1‑94 (MQ=60)
GCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTTGATTATTGCTAGTTTTTAGTTTTG < SRR4302533.5915006/94‑1 (MQ=60)
CCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTTGATTATTGCTAGTTTTTAGTTTTGC > SRR4302533.3669336/1‑94 (MQ=60)
CCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTTGATTATTGCTAGTTTTTAGTTTTGC > SRR4302533.3257610/1‑94 (MQ=60)
|
CCCTTAAAGTGAATTTCGCCAGAACCTTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGTCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTTGATTATTGCTAGTTTTTAGTTTTGC > NC_000913/751915‑752100
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
