Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1624 |
250.6 |
12620048 |
98.0% |
12367647 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
832,142 |
A→G |
V11A (GTC→GCC) |
ybiA ← |
hypothetical protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 832,142 | 0 | A | G | 100.0%
| 597.1
/ NA
| 186 | V11A (GTC→GCC) | ybiA | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (80/106); total (80/106) |
Only 100 of 188 total aligned reads displayed.
CCGTCAACCTTGATGGGCCAGGCGGCAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGACGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTCCAGAAACAGAAAAACCATT > NC_000913/832052‑832231
|
cGTCAACCTTGATGGGCCAGGCGGCAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCgt < 1:905102/93‑1 (MQ=255)
aaCCTTGATGGGCCAGGCGGCAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTg > 1:3158877/1‑93 (MQ=255)
aaCCTTGATGGGCCAGGCGGCAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTg > 2:5590368/1‑93 (MQ=255)
aCCTTGATGGGCCAGGCGGCAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTgg < 2:815671/93‑1 (MQ=255)
aCCTTGATGGGCCAGGCGGCAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTgg < 1:2811340/93‑1 (MQ=255)
aCCTTGATGGGCCAGGCGGCAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTgg > 2:5183970/1‑93 (MQ=255)
ccTTGATGGGCCAGGCGGCAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGa > 1:3579076/1‑93 (MQ=255)
ccTTGATGGGCCAGGCGGCAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGa < 1:3374511/93‑1 (MQ=255)
tGATGGGCCAGGCGGCAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATcc < 1:2604348/93‑1 (MQ=255)
tGAGGGGCGAGGCGGCAAAGTTAGAATAATCACCGTAGTCATCGCGGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATcc < 2:3063749/93‑1 (MQ=255)
gATGGGCCAGGCGGCAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCt < 1:3432423/93‑1 (MQ=255)
tGGGCCAGGCGGCAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCttt < 2:3084626/93‑1 (MQ=255)
gggCCAGGCGGCAGAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTtg < 2:5788898/93‑1 (MQ=255)
gggCCAGGCGGCAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTtg < 2:425643/93‑1 (MQ=255)
gggCCAGGCGGCAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTtg < 2:1830025/93‑1 (MQ=255)
ccAGGCGGCAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGc > 1:3497414/1‑93 (MQ=255)
aGGCGGCAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTc > 2:339245/1‑93 (MQ=255)
aGGCGGCAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTc < 2:1255826/93‑1 (MQ=255)
aGGCGGCAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTc > 1:4474250/1‑93 (MQ=255)
ggcggcAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCg > 2:1502103/1‑93 (MQ=255)
ggcggcAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCg > 2:101699/1‑93 (MQ=255)
ggcggcAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCg > 1:3030183/1‑93 (MQ=255)
gcggcAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGa < 2:345063/93‑1 (MQ=255)
gcAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAAca < 2:4131946/93‑2 (MQ=255)
gcAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACg < 1:640974/93‑1 (MQ=255)
cAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACgg < 1:538665/93‑1 (MQ=255)
cAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACgg < 2:2123848/93‑1 (MQ=255)
cAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACgg < 2:4659471/93‑1 (MQ=255)
cAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACgg < 2:4473594/93‑1 (MQ=255)
gTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGTTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCAt < 2:6028448/93‑1 (MQ=255)
gTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCAt > 2:492726/1‑93 (MQ=255)
ttAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCAtt < 2:3750640/93‑1 (MQ=255)
ttAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCAtt > 2:3585070/1‑93 (MQ=255)
aGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTaa < 2:2147623/93‑1 (MQ=255)
aaaaaTCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAAc < 1:3523725/93‑1 (MQ=255)
aaaaaTCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAAc < 1:5797530/93‑1 (MQ=255)
aaaTCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCg > 1:2483466/1‑93 (MQ=255)
aaaTCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCg > 1:114306/1‑93 (MQ=255)
aaTCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGc > 1:5119626/1‑93 (MQ=255)
tCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCAt < 2:6170323/93‑1 (MQ=255)
aCCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTa > 2:3807410/1‑93 (MQ=255)
ccGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTAt > 1:1169463/1‑93 (MQ=255)
cGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATg < 1:2961427/93‑1 (MQ=255)
gTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGt > 1:3689737/1‑93 (MQ=255)
tAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGtt > 1:5759334/1‑93 (MQ=255)
tAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGtt < 1:5970852/93‑1 (MQ=255)
tAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGtt < 1:1598751/93‑1 (MQ=255)
tAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGtt > 2:4021739/1‑93 (MQ=255)
aGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTtg < 1:4710611/93‑1 (MQ=255)
gTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTtgg > 1:201115/1‑93 (MQ=255)
gTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTtgg > 1:4254922/1‑93 (MQ=255)
cATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTtggtg > 2:6115180/1‑93 (MQ=255)
cATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTtggtg > 2:5852224/1‑93 (MQ=255)
aTCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTtggtgg < 2:201115/93‑1 (MQ=255)
aTCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTtggtgg > 1:1809332/1‑93 (MQ=255)
gCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTa > 2:470473/1‑93 (MQ=255)
gCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTa > 1:4084839/1‑93 (MQ=255)
gCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTa < 1:5231486/93‑1 (MQ=255)
cTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTAt < 2:2421669/93‑1 (MQ=255)
tGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTAtt < 1:2813293/93‑1 (MQ=255)
tGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTAtt < 2:5366582/93‑1 (MQ=255)
ggTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTg < 1:4672911/93‑1 (MQ=255)
ggTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTg < 2:1215614/93‑1 (MQ=255)
agTGCTGTAGAGATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTg < 1:2587962/92‑1 (MQ=255)
gTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGc < 1:4816002/93‑1 (MQ=255)
tGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCg > 1:3708910/1‑93 (MQ=255)
tGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCg > 2:4929061/1‑93 (MQ=255)
gCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCgg > 2:4775619/1‑92 (MQ=255)
gCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGa < 1:4878429/93‑1 (MQ=255)
cTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAg > 2:1592906/1‑93 (MQ=255)
cTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAg > 2:2575428/1‑93 (MQ=255)
tGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGc < 2:4958774/93‑1 (MQ=255)
aGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGc < 2:3124299/93‑1 (MQ=255)
aGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGc > 2:4106959/1‑93 (MQ=255)
gAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCt < 1:4495524/93‑1 (MQ=255)
aaaTTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCtt < 2:5743375/93‑1 (MQ=255)
aaTTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCttt < 2:1417017/93‑1 (MQ=255)
aTTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTc > 2:5775116/1‑93 (MQ=255)
aTTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTc < 1:2307861/93‑1 (MQ=255)
tttATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTcc < 1:2309246/93‑1 (MQ=255)
tttATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTcc > 1:1719081/1‑93 (MQ=255)
tttATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTcc < 1:5561719/93‑1 (MQ=255)
ttATGATGGTGTCTTGCATGGTGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTCca < 1:2438013/93‑1 (MQ=255)
ttATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTCca > 2:5505865/1‑93 (MQ=255)
tATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTCcag > 1:5118328/1‑93 (MQ=255)
tATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTCcag > 1:2243030/1‑93 (MQ=255)
tgGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAACCCGCATTATGTGGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTCcagaaaca < 2:2550911/93‑1 (MQ=255)
tgGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTCcagaaaca > 1:54424/1‑93 (MQ=255)
tgGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTCcagaaaca < 2:3545258/93‑1 (MQ=255)
ggTGTCTTTCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTCcagaaacag > 1:6069238/1‑93 (MQ=255)
gtgtCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTCcagaaacaga > 2:696660/1‑93 (MQ=255)
gtCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTCcagaaacagaaa < 2:2539379/93‑1 (MQ=255)
gtCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTCcagaaacagaaa > 2:323070/1‑93 (MQ=255)
tCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTCCAGAAACAGaaaa > 2:5814941/1‑93 (MQ=255)
tCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTCCAGAAACAGaaaa < 1:2761371/93‑1 (MQ=255)
gcTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTCCAGAAACAGaaaa < 2:2309389/92‑1 (MQ=255)
tGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTCCAGAAACAGAAAAAcc > 1:385452/1‑93 (MQ=255)
gCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTCCAGAAACAGAAAAACCa < 1:5255912/93‑1 (MQ=255)
gCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTCCAGAAACAGAAAAACCa < 1:2721460/93‑1 (MQ=255)
aTGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTCCAGAAACAGAAAAACCAtt > 1:1416696/1‑93 (MQ=255)
|
CCGTCAACCTTGATGGGCCAGGCGGCAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGACGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTCCAGAAACAGAAAAACCATT > NC_000913/832052‑832231
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
TTCCCGTCAACCTTGATGGGCCAGGCGGCAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGACGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTCCAGAAACAGAAAAACCATTACCC > NC_000913/832049‑832235
|
TTCCCGTCAACCTTGATGGGCCAGGCGGCAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGG > SRR4302533.713431/1‑94 (MQ=60)
CCGTCAACCTTGATGGGCCAGGCGGCAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGT > SRR4302533.4789891/1‑94 (MQ=60)
CGTCAACCTTGATGGGCCAGGCGGCAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTG < SRR4302533.910407/94‑1 (MQ=60)
CGTCAACCTTGATGGGCCAGGCGGCAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTG < SRR4302533.2756820/94‑1 (MQ=60)
CAACCTTGATGGGCCAGGCGGCAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTG > SRR4302533.3178317/1‑94 (MQ=60)
ACCTTGATGGGCCAGGCGGCAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGA < SRR4302533.2828643/94‑1 (MQ=60)
ACCTTGATGGGCCAGGCGGCAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGA > SRR4302533.3601128/1‑94 (MQ=60)
CCTTGATGGGCCAGGCGGCAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGAT < SRR4302533.3395348/94‑1 (MQ=60)
ACTTGATGGGCCAGGCGGCAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGAT < SRR4302533.1883434/94‑1 (MQ=60)
TGATGGGCCAGGCGGCAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCT < SRR4302533.2620345/94‑1 (MQ=60)
GATGGGCCAGGCGGCAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTT < SRR4302533.3453627/94‑1 (MQ=60)
GGGCCAGGCGGCAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGT < SRR4302533.180462/94‑1 (MQ=60)
GCCAGGCGGCAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGC > SRR4302533.3518980/1‑94 (MQ=60)
CCAGGCGGCAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCT < SRR4302533.3039181/94‑1 (MQ=60)
CCAGGCGGCAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCT < SRR4302533.2810127/94‑1 (MQ=60)
CAGGCGGCAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTC > SRR4302533.2076754/1‑94 (MQ=60)
CAGGCGGCAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTC > SRR4302533.4501308/1‑94 (MQ=60)
CAGGCGGCAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTC < SRR4302533.2660172/94‑1 (MQ=60)
AGGCGGCAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCG > SRR4302533.3048727/1‑94 (MQ=60)
CGGCAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAAC > SRR4302533.4365646/1‑94 (MQ=60)
GGCAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACG > SRR4302533.22842/1‑94 (MQ=60)
GGCAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACG > SRR4302533.5276891/1‑94 (MQ=60)
GCAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGG < SRR4302533.644742/94‑1 (MQ=60)
CAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGG < SRR4302533.5051033/94‑1 (MQ=60)
CAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGG < SRR4302533.377369/94‑1 (MQ=60)
CAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGG < SRR4302533.541866/94‑1 (MQ=60)
CAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGG > SRR4302533.5582460/1‑94 (MQ=60)
CAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATAGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGG > SRR4302533.5361844/1‑94 (MQ=60)
AGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCAT < SRR4302533.1179560/94‑1 (MQ=60)
TAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAA < SRR4302533.5149289/94‑1 (MQ=60)
AGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAA > SRR4302533.5836510/1‑94 (MQ=60)
AGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAA < SRR4302533.2483268/94‑1 (MQ=60)
AAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACC < SRR4302533.5832556/94‑1 (MQ=60)
AAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACC < SRR4302533.3545443/94‑1 (MQ=60)
AAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCG > SRR4302533.2498777/1‑94 (MQ=60)
AAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCG > SRR4302533.115030/1‑94 (MQ=60)
AAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGC > SRR4302533.5150558/1‑94 (MQ=60)
ATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCAT > SRR4302533.3724798/1‑94 (MQ=60)
ACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTAT < SRR4302533.838024/94‑1 (MQ=60)
ACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTAT > SRR4302533.1176482/1‑94 (MQ=60)
CCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATG < SRR4302533.2582939/94‑1 (MQ=60)
CGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGT > SRR4302533.3712406/1‑94 (MQ=60)
CGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGT < SRR4302533.935412/94‑1 (MQ=60)
CGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGT < SRR4302533.354706/94‑1 (MQ=60)
CGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGT > SRR4302533.6211755/1‑94 (MQ=60)
CGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGT < SRR4302533.2979530/94‑1 (MQ=60)
GTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTT > SRR4302533.354503/1‑94 (MQ=60)
GTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTT > SRR4302533.5794087/1‑94 (MQ=60)
GTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTT > SRR4302533.4522685/1‑94 (MQ=60)
GTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTT > SRR4302533.4157245/1‑94 (MQ=60)
TAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTG < SRR4302533.6006997/94‑1 (MQ=60)
TAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTG < SRR4302533.1608430/94‑1 (MQ=60)
AGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGG > SRR4302533.202394/1‑94 (MQ=60)
AGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGG < SRR4302533.4906033/94‑1 (MQ=60)
AGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGG < SRR4302533.4739160/94‑1 (MQ=60)
AGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGG > SRR4302533.4280578/1‑94 (MQ=60)
AGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGG < SRR4302533.3160659/94‑1 (MQ=60)
GTCATCGCTGGTACTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGT < SRR4302533.5221474/94‑1 (MQ=60)
ACATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTG < SRR4302533.6084413/94‑1 (MQ=60)
CATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGG > SRR4302533.1820344/1‑94 (MQ=60)
CGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTA > SRR4302533.4109706/1‑94 (MQ=60)
GCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTAT < SRR4302533.5262952/94‑1 (MQ=60)
TGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTG < SRR4302533.2830609/94‑1 (MQ=60)
GGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGC < SRR4302533.4701228/94‑1 (MQ=60)
AGTGCTGTAGAGATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGC < SRR4302533.2603870/94‑1 (MQ=60)
GTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCG > SRR4302533.3731691/1‑94 (MQ=60)
GTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCG < SRR4302533.4845190/94‑1 (MQ=60)
GTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCG > SRR4302533.5826586/1‑94 (MQ=60)
GCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAG < SRR4302533.4907983/94‑1 (MQ=60)
TAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGC < SRR4302533.3239256/94‑1 (MQ=60)
GAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTT < SRR4302533.4522746/94‑1 (MQ=60)
AAATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTT < SRR4302533.4670501/94‑1 (MQ=60)
ATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTCC < SRR4302533.2322158/94‑1 (MQ=60)
ATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTCC < SRR4302533.5749616/94‑1 (MQ=60)
ATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTCC > SRR4302533.1729506/1‑94 (MQ=60)
ATTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTCC < SRR4302533.3445123/94‑1 (MQ=60)
ATTTATGATGGTGTCTCGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTCC < SRR4302533.3516476/94‑1 (MQ=60)
TTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTCCA < SRR4302533.2323551/94‑1 (MQ=60)
TTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTCCA > SRR4302533.1564646/1‑94 (MQ=60)
TTTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTCCA < SRR4302533.5595329/94‑1 (MQ=60)
TTATGATGGTGTCTTGCATGGTGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTCCAG < SRR4302533.2453067/94‑1 (MQ=60)
TTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTCCAG > SRR4302533.5149254/1‑94 (MQ=60)
TTATGATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTCCAG > SRR4302533.2256895/1‑94 (MQ=60)
ATGGTGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTCCAGAAACA > SRR4302533.54792/1‑94 (MQ=60)
TGGTGTCTTTCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTCCAGAAACAG > SRR4302533.6105960/1‑94 (MQ=60)
TGTCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTCCAGAAACAGAAA < SRR4302533.4053415/94‑1 (MQ=60)
TCTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTCCAGAAACAGAAAAA < SRR4302533.2778297/94‑1 (MQ=60)
CTTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTCCAGAAACAGAAAAAC < SRR4302533.285313/94‑1 (MQ=60)
TTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTCCAGAAACAGAAAAACC > SRR4302533.2613541/1‑94 (MQ=60)
TTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTCCAGAAACAGAAAAACC < SRR4302533.2422120/94‑1 (MQ=60)
TTGCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTCCAGAAACAGAAAAACC > SRR4302533.387777/1‑94 (MQ=60)
GCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTCCAGAAACAGAAAAACCAT < SRR4302533.2738162/94‑1 (MQ=60)
GCATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTCCAGAAACAGAAAAACCAT < SRR4302533.5287481/94‑1 (MQ=60)
CATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTCCAGAAACAGAAAAACCATT > SRR4302533.1425267/1‑94 (MQ=60)
ATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTCCAGAAACAGAAAAACCATTA < SRR4302533.1666446/94‑1 (MQ=60)
ATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTCCAGAAACAGAAAAACCATTA > SRR4302533.1605891/1‑94 (MQ=60)
ATGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTCCAGAAACAGAAAAACAATTA > SRR4302533.1750060/1‑94 (MQ=60)
TGGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTCCAGAAACAGAAAAACCATTAC > SRR4302533.634839/1‑94 (MQ=60)
GGCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTCCAGAAACAGAAAAACCATTACC < SRR4302533.4919083/94‑1 (MQ=60)
GCGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTCCAGAAACAGAAAAACCATTACCC < SRR4302533.5567663/94‑1 (MQ=60)
|
TTCCCGTCAACCTTGATGGGCCAGGCGGCAAAGTTAGAAAAATCACCGTAGTCATCGCTGGTGCTGTAGAAATTTATGATGGTGTCTTGCATGACGTGTTGGATCCTTTGTGCTCGAACGGGCATTAAACCGCATTATGTTGGTGGTTATTGCGAGCCGCTTTCCAGAAACAGAAAAACCATTACCC > NC_000913/832049‑832235
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
