Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1624 |
250.6 |
12620048 |
98.0% |
12367647 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,033,730 |
C→T |
I418I (ATC→ATT) |
hyaB → |
hydrogenase‑1 large subunit |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,033,730 | 0 | C | T | 100.0%
| 665.4
/ NA
| 178 | I418I (ATC→ATT) | hyaB | hydrogenase‑1 large subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (87/91); total (87/91) |
Only 100 of 182 total aligned reads displayed.
GCTGAATGAACAGGAACGCTACTCGTGGATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATCGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTCGGCGTTGAACCTGCCGCTTTCCGGTATCCAGTCAAC > NC_000913/1033640‑1033819
|
gcTGAATGAACAGGAACGCTACTCGTGGATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGc > 1:1520861/1‑93 (MQ=255)
tgaatgaaCAGGAACGCTACTCGTGGATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCtt > 1:2485564/1‑93 (MQ=255)
gaatgaaCAGGAACGCTACTCGTGTATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGTCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTa < 2:2218293/93‑1 (MQ=255)
gaatgaaCAGGAACGCTACTCGTGGATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTa > 1:3618107/1‑93 (MQ=255)
gaatgaaCAGGAACGCTACTCGTGGATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTa > 1:5515927/1‑93 (MQ=255)
gaatgaaCAGGAACGCTACTCGTGGATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTa < 1:4909359/93‑1 (MQ=255)
aatgaaCAGGAACGCTACTCGTGGATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTAt < 2:226914/93‑1 (MQ=255)
aatgaaCAGGAACGCTACTCGTGGATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTAt < 2:4728611/93‑1 (MQ=255)
atgaaCAGGAACGCTACTCGTGGATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATc < 1:2185573/93‑1 (MQ=255)
gaaCAGGAACGCTACTCGTGGATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATcac < 1:3604483/93‑1 (MQ=255)
aaCAGGAACGCTACTCGTGGATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATcaca > 1:1684837/1‑93 (MQ=255)
aaCAGGAACGCTACTCGTGGATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATcaca < 2:4755909/93‑1 (MQ=255)
aCAGGAACGCTACTCGTGGATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACaa > 2:1331559/1‑93 (MQ=255)
aCAGGAACGCTACTCGTGGATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACaa > 2:4099816/1‑93 (MQ=255)
cAGGAACGCTACTCGTGGATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACaaa < 1:5989618/93‑1 (MQ=255)
aGGAACGCTACTCGTGGATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAg > 2:4386843/1‑93 (MQ=255)
aGGAACGCTACTCGTGGATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAg < 2:3124562/93‑1 (MQ=255)
aGGAACGCTACTCGTGGATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAg < 1:5627362/93‑1 (MQ=255)
aaCGCTACTCGTGGATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCg > 2:147242/1‑93 (MQ=255)
aCGCTACTCGTGGATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGTCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGa < 1:3107753/93‑1 (MQ=255)
aCGCTACTCGTGGATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGa < 1:1295207/93‑1 (MQ=255)
cGCTACTCGTGGATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGAt > 1:3823262/1‑93 (MQ=255)
cGCTACTCGTGGATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGAt > 2:2115208/1‑93 (MQ=255)
gCTACTCGTGGATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGAtg > 2:2965211/1‑93 (MQ=255)
cTACTCGTGGATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGAtgc < 1:2819035/93‑1 (MQ=255)
cTACTCGTGGATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGAtgc < 1:1874226/93‑1 (MQ=255)
tACTCGTGGATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGAtgct < 1:3989639/93‑1 (MQ=255)
aCTCGTGGATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGAtgctg < 2:2381340/93‑1 (MQ=255)
aCTCGTGGATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGAtgctg > 2:2267103/1‑93 (MQ=255)
cTCGTGGATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGAtgctgc < 1:2072783/93‑1 (MQ=255)
cTCGTGGATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGAtgctgc < 1:6108724/93‑1 (MQ=255)
cGTGGATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGa < 1:5859250/93‑1 (MQ=255)
gTGGATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGAc < 1:4874922/93‑1 (MQ=255)
gTGGATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGAc < 2:4049605/93‑1 (MQ=255)
gTGGATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGAc < 2:4951223/93‑1 (MQ=255)
tGGATCAAAGCGCGACGCGGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGAcc < 1:186331/93‑1 (MQ=255)
tGGATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGAcc > 2:4344535/1‑93 (MQ=255)
ggATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCg < 2:2935228/93‑1 (MQ=255)
gATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGt > 2:265764/1‑93 (MQ=255)
gATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGt < 1:5334633/93‑1 (MQ=255)
aTCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGATGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGtt < 1:993962/93‑1 (MQ=255)
aTCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGTCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGtt < 1:514822/93‑1 (MQ=255)
aTCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGtt < 2:747730/93‑1 (MQ=255)
tCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTg > 2:3406310/1‑93 (MQ=255)
tCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGGGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTg > 2:885888/1‑93 (MQ=255)
aaGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAgt > 1:1179619/1‑93 (MQ=255)
gcCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAgtcggt < 1:1153221/93‑1 (MQ=255)
gcCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAgtcggt > 1:452605/1‑93 (MQ=255)
ccACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAgtcggtc > 1:3740286/1‑93 (MQ=255)
cACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAgtcggtcg < 1:2528620/93‑1 (MQ=255)
cGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGTGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGAt > 2:3558420/1‑93 (MQ=255)
cGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGAt < 2:1055103/93‑1 (MQ=255)
cGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGAt < 1:3907782/93‑1 (MQ=255)
gCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATc < 1:3630050/93‑1 (MQ=255)
ccTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTCGATCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATc < 1:2325526/92‑1 (MQ=255)
ggCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCa < 2:1615578/93‑1 (MQ=255)
gcgcGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCat < 2:3308164/93‑1 (MQ=255)
gcgGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCatga < 1:2645903/93‑1 (MQ=255)
ggaaCGCGATGGAAGGGGGGGCGCTGGCGCGCACGCTTATTGCTTTTTACAAAAGGGATGCTGCGGCCCTTTAGTCGGGCGATCCCATGATGt > 2:1860433/3‑93 (MQ=255)
gTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGt < 1:4367144/93‑1 (MQ=255)
gTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGt > 1:2691623/1‑93 (MQ=255)
gTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGt > 1:3234956/1‑93 (MQ=255)
gTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGt > 1:6153720/1‑93 (MQ=255)
gTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGt > 1:3562973/1‑93 (MQ=255)
gTAACGCGATGGAAGTGGGCCCCCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTAACACAAAGGCGATGCTGCGACCGTAGAGTCGGTCGATCGCATGATGt < 2:4196470/93‑1 (MQ=255)
aaCGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTCg > 1:4066171/1‑93 (MQ=255)
aaCGCGAGAGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTCg < 1:3378052/93‑1 (MQ=255)
aCGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTCgg > 2:1925934/1‑93 (MQ=255)
aCGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTCgg < 2:5655747/93‑1 (MQ=255)
cgcgATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTCGGc < 2:3632133/93‑1 (MQ=255)
gATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTCGGCGtt < 1:4221702/93‑1 (MQ=255)
aTGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTCGGCGTTg < 1:867143/93‑1 (MQ=255)
aTGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTCGGCGTTg < 2:3700439/93‑1 (MQ=255)
aTGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTCGGCGTTg < 2:5094905/93‑1 (MQ=255)
tGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTCGGCGTTGa > 2:4331408/1‑93 (MQ=255)
tGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATCATGTCGGCGTTGa > 2:4740868/1‑93 (MQ=255)
gAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTCGGCGTTGAAc < 1:6013917/93‑1 (MQ=255)
gAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTCGGCGTTGAAc < 2:5777782/93‑1 (MQ=255)
gAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTCGGCGTTGAAc < 1:4796248/93‑1 (MQ=255)
gAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTCGGCGTTGAAc < 2:4510200/93‑1 (MQ=255)
aGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTCGGCGTTGAACCt < 2:1291483/93‑1 (MQ=255)
aGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTCGGCGTTGAACCt > 2:4945667/1‑93 (MQ=255)
aGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTCGGCGTTGAACCt > 2:3994668/1‑93 (MQ=255)
tGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTCGGCGTTGAACCTGc < 1:569124/93‑1 (MQ=255)
gggCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTCGGCGTTGAACCTGCCg > 2:5482599/1‑93 (MQ=255)
ccGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTCGGCGTTGAACCTGCCGCtt > 2:5599440/1‑93 (MQ=255)
gCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTCGGCGTTGAACCTGCCGCTTTc < 1:4548089/93‑1 (MQ=255)
cTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTCGGCGTTGAACCTGCCGCTTTcc > 2:4141720/1‑93 (MQ=255)
cTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTCGGCGTTGAACCTGCCGCTTTcc < 2:5587950/93‑1 (MQ=255)
gcgcgcACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTCGGCGTTGAACCTGCCGCTTTCCGGt > 2:4830869/1‑93 (MQ=255)
gcACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTCGGCGTTGAACCTGCCGCTTTCCGGTATcc > 1:5170457/1‑93 (MQ=255)
gcACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTCGGCGTTGAACCTGCCGCTTTCCGGTATcc > 2:5020973/1‑93 (MQ=255)
gcACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTCGGCGTTGAACCTGCCGCTTTCCGGTATca > 2:6248099/1‑92 (MQ=255)
cACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTCGGCGTTGAACCTGCCGCTTTCCGGTATCCa > 1:3005618/1‑93 (MQ=255)
cACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTCGGCGTTGAACCTGCCGCTTTCCGGTATCCa < 2:5025516/93‑1 (MQ=255)
aCGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTCGGCGTTGAACCTGCCGCTTTCCGGTATCCAg > 1:2600184/1‑93 (MQ=255)
ttAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTCGGCGTTGAACCTGCCGCTTTCCGGTATCCAGTCa > 2:1228676/1‑93 (MQ=255)
ttAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTCGGCGTTGAACCTGCCGCTTTCCGGTATCCAGTCa > 1:2796431/1‑93 (MQ=255)
tAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTCGGCGTTGAACCTGCCGCTTTCCGGTATCCAGTCaa > 2:2308182/1‑93 (MQ=255)
aaTTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTCGGCGTTGAACCTGCCGCTTTCCGGTATCCAGTCAAc > 1:4062542/1‑93 (MQ=255)
|
GCTGAATGAACAGGAACGCTACTCGTGGATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATCGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTCGGCGTTGAACCTGCCGCTTTCCGGTATCCAGTCAAC > NC_000913/1033640‑1033819
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GCAGCTGAATGAACAGGAACGCTACTCGTGGATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATCGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTCGGCGTTGAACCTGCCGCTTTCCGGTATCCAGTCAACGTTA > NC_000913/1033637‑1033823
|
GCAGCTGAATGAACAGGAACGCTACTCGTGGATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATT < SRR4302533.5274935/94‑1 (MQ=60)
CAGCTGAATGAACAGGAACGCTACTCGTGGATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTG < SRR4302533.2073841/94‑1 (MQ=60)
CAGCTGAATGAACAGGAACGCTACTCGTGGATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTG > SRR4302533.1825421/1‑94 (MQ=60)
CAGCTGAATGAACAGGAACGCTACTCGTGGATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTG > SRR4302533.2508109/1‑94 (MQ=60)
AGCTGAATGAACAGGAACGCTACTCGTGGATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGTCGCTGGCGCGCACGTTAATTGC > SRR4302533.6146481/1‑94 (MQ=60)
AGCTGAATGAACAGGAACGCTACTCGTGGATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGC > SRR4302533.1530017/1‑94 (MQ=60)
AGCTGAATGAACAGGAACGCTACTCGTGGATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGC > SRR4302533.570243/1‑94 (MQ=60)
CTGAATGAACAGGAACGCTACTCGTGGATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTT > SRR4302533.2500880/1‑94 (MQ=60)
CTGAATGAACAGGAACGCTACTCGTGGATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTT > SRR4302533.2828517/1‑94 (MQ=60)
CTGAATGAACAGGAACGCTACTCGTGGATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTT < SRR4302533.5084558/94‑1 (MQ=60)
TGAATGAACAGGAACGCTACTCGTGGATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTA > SRR4302533.5549228/1‑94 (MQ=60)
TGAATGAACAGGAACGCTACTCGTGGATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTA > SRR4302533.3640362/1‑94 (MQ=60)
GAATGAACAGGAACGCTACTCGTGGATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTAT > SRR4302533.4178831/1‑94 (MQ=60)
GAATGAACAGGAACGCTACTCGTGGATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTAT < SRR4302533.4939101/94‑1 (MQ=60)
ATGAACAGGAACGCTACTCGTGGATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCA < SRR4302533.2199045/94‑1 (MQ=60)
ATGAACAGGAACGCTACTCGTGGATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCA < SRR4302533.155008/94‑1 (MQ=60)
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GAACAGGAACGCTACTCGTGGATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACA < SRR4302533.3626668/94‑1 (MQ=60)
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AACAGGAACGCTACTCGTGGATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAA > SRR4302533.3610381/1‑94 (MQ=60)
CAGGAACGCTACTCGTGGATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAG < SRR4302533.6025896/94‑1 (MQ=60)
CAGGAACGCTACTCGTGGATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAG < SRR4302533.1489443/94‑1 (MQ=60)
AGGAACGCTACTCGTGGATCAAAGCGCCGCGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGG > SRR4302533.2189219/1‑94 (MQ=60)
AGGAACGCTACTCGTGGATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGG < SRR4302533.5661385/94‑1 (MQ=60)
AGGAACGCTACTCGTGGATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGG > SRR4302533.3645121/1‑94 (MQ=60)
AGGAACGCTACTCGTGGATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGG < SRR4302533.5303613/94‑1 (MQ=60)
AGGAACGCTACTCGTGGATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGG > SRR4302533.2234175/1‑94 (MQ=60)
ACGCTACTCGTGGATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGTCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGAT < SRR4302533.3126854/94‑1 (MQ=60)
ACGCTACTCGTGGATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGAT < SRR4302533.1303004/94‑1 (MQ=60)
ACGCTACTCGTGGATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGAT > SRR4302533.3846639/1‑94 (MQ=60)
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CTACTCGTGGATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCT < SRR4302533.1885646/94‑1 (MQ=60)
CTACTCGTGGATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCT < SRR4302533.2836381/94‑1 (MQ=60)
TACTCGTGGATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTG < SRR4302533.4013939/94‑1 (MQ=60)
CTCGTGGATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCG < SRR4302533.4867861/94‑1 (MQ=60)
CTCGTGGATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCG > SRR4302533.4016989/1‑94 (MQ=60)
CTCGTGGATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCG < SRR4302533.6145603/94‑1 (MQ=60)
CTCGTGGATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCG < SRR4302533.2085551/94‑1 (MQ=60)
CGTGGATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGAC < SRR4302533.5894672/94‑1 (MQ=60)
GTGGATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACC < SRR4302533.4904457/94‑1 (MQ=60)
TGGATCAAAGCGCGACGCGGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCG < SRR4302533.187489/94‑1 (MQ=60)
GATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTT < SRR4302533.5366610/94‑1 (MQ=60)
ATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGATGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTG < SRR4302533.999771/94‑1 (MQ=60)
ATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGTCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTG < SRR4302533.517880/94‑1 (MQ=60)
ATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTG < SRR4302533.3064259/94‑1 (MQ=60)
CAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAG > SRR4302533.4934568/1‑94 (MQ=60)
AAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGT > SRR4302533.1186706/1‑94 (MQ=60)
AAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGT > SRR4302533.2811163/1‑94 (MQ=60)
CGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGT > SRR4302533.455314/1‑94 (MQ=60)
GCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTC < SRR4302533.1160128/94‑1 (MQ=60)
GCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTC > SRR4302533.3763225/1‑94 (MQ=60)
CCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCG > SRR4302533.603858/1‑94 (MQ=60)
CACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGA < SRR4302533.2544188/94‑1 (MQ=60)
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GCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCG < SRR4302533.2367320/94‑1 (MQ=60)
CCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTCGATCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCG < SRR4302533.2339924/94‑1 (MQ=60)
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GTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTC < SRR4302533.4520681/94‑1 (MQ=60)
GTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTC < SRR4302533.4393509/94‑1 (MQ=60)
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AACGCGAGAGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTCGG < SRR4302533.3398909/94‑1 (MQ=60)
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GATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTCGGCGTTG < SRR4302533.4247231/94‑1 (MQ=60)
ATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTCGGCGTTGA > SRR4302533.5424629/1‑94 (MQ=60)
ATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTCGGCGTTGA < SRR4302533.872225/94‑1 (MQ=60)
ATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTCGGCGTTGA > SRR4302533.6145274/1‑94 (MQ=60)
TGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTCGGCGTTGAA < SRR4302533.1222392/94‑1 (MQ=60)
GGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTCGGCGTTGAAC > SRR4302533.4090535/1‑94 (MQ=60)
GAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTCGGCGTTGAACC < SRR4302533.6050360/94‑1 (MQ=60)
GAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTCGGCGTTGAACC < SRR4302533.3304727/94‑1 (MQ=60)
GAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTCGGCGTTGAACC < SRR4302533.4825301/94‑1 (MQ=60)
AGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTCGGCGTTGAACCTG < SRR4302533.4267364/94‑1 (MQ=60)
TGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTCGGCGTTGAACCTGCC < SRR4302533.572490/94‑1 (MQ=60)
GGGGGCCGCTGGCGCGCGCGTGAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTCGGCGTTGAACCTGCC < SRR4302533.3129288/94‑1 (MQ=60)
GGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTCGGCGTTGAACCTGCC < SRR4302533.2689177/94‑1 (MQ=60)
GCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTCGGCGTTGAACCTGCCGCTT < SRR4302533.3749045/94‑1 (MQ=60)
GCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTCGGCGTTGAACCTGCCGCTTTCC < SRR4302533.4575634/94‑1 (MQ=60)
GCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTCGGCGTTGAACCTGCCGCTTTCCGGTATC < SRR4302533.5891600/94‑1 (MQ=60)
CGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTCGGCGTTGAACCTGCCGCTTTCCGGTATCC > SRR4302533.5201661/1‑94 (MQ=60)
GCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTCGGCGTTGAACCTGCCGCTTTCCGGTATCCA > SRR4302533.3024004/1‑94 (MQ=60)
CACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTCGGCGTTGAACCTGCCGCTTTCCGGTATCCAG > SRR4302533.2616161/1‑94 (MQ=60)
GTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTCGGCGTTGAACCTGCCGCTTTCCGGTATCCAGTCA > SRR4302533.2813629/1‑94 (MQ=60)
GTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTCGGCGTTGAACCTGCCGCTTTCCGGTATCCAGTCA < SRR4302533.1719432/94‑1 (MQ=60)
TAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTCGGCGTTGAACCTGCCGCTTTCCGGTATCCAGTCAAC > SRR4302533.4087272/1‑94 (MQ=60)
AATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTCGGCGTTGAACCTGCCGCTTTCCGGTATCCAGTCAccc > SRR4302533.4378565/1‑91 (MQ=60)
AATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTCGGCGTTGAACCTGCCGCTTTCCGGTATCCAGTCAACG > SRR4302533.4623449/1‑94 (MQ=60)
AATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTCGGCGTTGAACCTGCCGCTTTCCGGTATCCAGTCAACG > SRR4302533.1551129/1‑94 (MQ=60)
AATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTCGGCGTTGAACCTGCCGCTTTCCGGTATCCAGTCAACG < SRR4302533.2543034/94‑1 (MQ=60)
AATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTCGGCGTTGAACCTGCCGCTTTCCGGTATCCAGTCAACG > SRR4302533.4851650/1‑94 (MQ=60)
AATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCCATCGCATGATGTCGGCGTTGAACCTGCCGCTTTCCGGTATCCAGTCAACG > SRR4302533.4470022/1‑94 (MQ=60)
ATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTCGGCGTTGAACCTGCCGCTTTCCGGTATCCAGTCAACGT < SRR4302533.1544904/94‑1 (MQ=60)
TTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACTGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTCGGCGTTGAACCTGCCGCTTTCCGGTATCCAGTCAACGTT < SRR4302533.51895/94‑1 (MQ=60)
TTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTCGGCGTTGAACCTGCCGCTTTCCGGTATCCAGTCAACGTT > SRR4302533.6066805/1‑94 (MQ=60)
TTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTCGGCGTTGAACCTGCCGCTTTCCGGTATCCAGTCAACGTT > SRR4302533.4033601/1‑94 (MQ=60)
TGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTCGGCGTTGAACCTGCCGCTTTCCGGTATCCAGTCAACGTTA > SRR4302533.1845334/1‑94 (MQ=60)
TGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTCGGCGTTGAACCTGCCGCTTTCCGGTATCCAGTCAACGTTA > SRR4302533.381897/1‑94 (MQ=60)
TGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTCGGCGTTGAACCTGCCGCTTTCCGGTATCCAGTCAACGTTA < SRR4302533.3112673/94‑1 (MQ=60)
|
GCAGCTGAATGAACAGGAACGCTACTCGTGGATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATCGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTCGGCGTTGAACCTGCCGCTTTCCGGTATCCAGTCAACGTTA > NC_000913/1033637‑1033823
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 7 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
