Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1624 |
250.6 |
12620048 |
98.0% |
12367647 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,050,477 |
A→G |
intergenic (‑79/‑207) |
cspH ← / → cspG |
cold shock‑like protein/CspG |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,050,477 | 0 | A | G | 100.0%
| 562.0
/ NA
| 174 | intergenic (‑79/‑207) | cspH/cspG | cold shock‑like protein/CspG |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (84/90); total (84/90) |
Only 100 of 177 total aligned reads displayed.
TTTACGGGACAAACAAATTCCTTACTGAAAATACTGCGCTGCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGACGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAAGACAGACAGCATACAAAGTAGTTTACT > NC_000913/1050387‑1050566
|
tttACGGGACAAACAAATTCCTTACTGAAAATACTGCGCTGCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCg < 1:2635913/93‑1 (MQ=255)
tACGGGACAAACAAATTCCTTACTGAAAATACTGCGCTGCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATGTAAGACCGCCGggcggc < 2:1826824/93‑1 (MQ=255)
cGGGACAAACAAATTCCTTACTGAAAATACTGCGCTGCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCta < 1:6243825/93‑1 (MQ=255)
ggACAAACAAATTCCTTACTGAAAATACTGCGCTGCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCtaaa > 1:1928032/1‑93 (MQ=255)
ggACAAACAAATTCCTTACTGAAAATACTGCGCTGCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCtaaa < 2:4205987/93‑1 (MQ=255)
gACAAACAAATTCCTTACTGAAAATACTGCGCTGCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCtaaaa < 2:4303504/93‑1 (MQ=255)
gACAAACAAATTCCTTACTGAAAATACTGCGCTGCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCtaaaa > 2:1301600/1‑93 (MQ=255)
acaaacaaATTCCTTACTGAAAATACTGCGCTGCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCtaaaat > 1:5149934/1‑93 (MQ=255)
acaaacaaATTCCTTACTGAAAATACTGCGCTGCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCtaaaat < 2:5726221/93‑1 (MQ=255)
acaaacaaATTCCTTACTGAAAATACTGCGCTGCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCtaaaat < 2:3716824/93‑1 (MQ=255)
caaacaaaTTCCTTACTGAAAATACTGCGCTGCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCtaaaata > 2:747597/1‑93 (MQ=255)
acaaaTTCCTTACTGAAAATACTGCGCTGCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCtaaaataaaa < 1:4575540/93‑1 (MQ=255)
acaaaTTCCTTACTGAAAATACTGCGCTGCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCtaaaataaaa < 2:2076791/93‑1 (MQ=255)
aaaTTCCTTACTGAAAATACTGCGCTGCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAAtt < 1:4842426/93‑1 (MQ=255)
aaTTCCTTACTGAAAATACTGCGCTGCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAAttt > 2:2645162/1‑93 (MQ=255)
aaTTCCTTACTGAAAATACTGCGCTGCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAAttt > 1:754378/1‑93 (MQ=255)
aaTTCCTTACTGAAAATACTGCGCTGCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAAttt > 1:5405030/1‑93 (MQ=255)
ttCCTTACTGAAAATACTGCGCTGCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGc < 2:1559315/93‑1 (MQ=255)
ccTTACTGAAAATACTGCGCTGCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCtt < 2:2709845/93‑1 (MQ=255)
ccTTACTGAAAATACTGCGCTGCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCtt < 1:1134476/93‑1 (MQ=255)
ccTTACTGAAAATACTGCGCTGCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCtt < 1:3950896/93‑1 (MQ=255)
cTTACTGAAAATACTGCGCTGCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTa < 1:3170231/93‑1 (MQ=255)
ttACTGAAAATACTGCGCTGCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTaa > 2:4009786/1‑93 (MQ=255)
ttACTGAAAATACTGCGCTGCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTaa < 1:4744158/93‑1 (MQ=255)
ttACTGAAAATACTGCGCTGCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTaa > 1:121739/1‑93 (MQ=255)
ttACTGAAAATACTGCGCTGCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTaa > 1:2276325/1‑93 (MQ=255)
aCTGAAAATACTGCGCTGCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAAtc > 1:4387753/1‑93 (MQ=255)
aCTGAAAATACTGCGCTGCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAAtc < 2:595899/93‑1 (MQ=255)
cTGAAAATACTGCGCTGCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAAtct > 1:2258448/1‑93 (MQ=255)
gAAAATACTGCGCTGCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCa < 2:3330318/93‑1 (MQ=255)
aaaaTACTGCGCTGCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCaa > 1:4575762/1‑93 (MQ=255)
aaaTACTGCGCTGCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAAt < 1:2712296/93‑1 (MQ=255)
aaaTACTGCGCTGCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAAt < 1:4956403/93‑1 (MQ=255)
aTACTGCGCTGCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTa > 1:3750573/1‑93 (MQ=255)
aTACTGCGCTGCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTa < 1:3878269/93‑1 (MQ=255)
tACTGCGCTGCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTAt > 2:4039740/1‑93 (MQ=255)
tACTGCGCTGCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTAt > 1:4839206/1‑93 (MQ=255)
aCTGCGCTGCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATc < 2:4433018/93‑1 (MQ=255)
gcgcTGCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATg > 1:5952859/1‑93 (MQ=255)
gcgcTGCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATg < 1:354541/93‑1 (MQ=255)
gcTGCACTATACGGGTTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCg > 1:1854705/1‑93 (MQ=255)
gcTGCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCACAATTATCATGCg > 1:3602509/1‑93 (MQ=255)
tGCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGtt > 2:6270897/1‑93 (MQ=255)
tGCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGtt > 2:4751158/1‑93 (MQ=255)
tGCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGtt < 1:6031872/93‑1 (MQ=255)
gCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTa > 1:4257344/1‑93 (MQ=255)
gCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTa > 2:485936/1‑93 (MQ=255)
gCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTa < 1:5349567/93‑1 (MQ=255)
cACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTaa < 1:2548827/93‑1 (MQ=255)
aCTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAAt > 1:6095656/1‑93 (MQ=255)
aCTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAAt < 2:2027738/93‑1 (MQ=255)
aCTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAAt > 2:2491197/1‑93 (MQ=255)
cTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATa > 2:374665/1‑93 (MQ=255)
cTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATa > 1:1971010/1‑93 (MQ=255)
cTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATa > 2:1632177/1‑93 (MQ=255)
cGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGc < 2:5156842/93‑1 (MQ=255)
ggggTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCg > 2:3097235/1‑93 (MQ=255)
gggTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGt < 2:1289777/93‑1 (MQ=255)
ggTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTc > 2:5338991/1‑93 (MQ=255)
ggTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTc > 2:3166525/1‑93 (MQ=255)
ggTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTc > 2:5193316/1‑93 (MQ=255)
gTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCg < 1:586800/93‑1 (MQ=255)
taataaAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGt > 1:4086945/1‑93 (MQ=255)
taataaAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGt < 1:5713977/93‑1 (MQ=255)
taataaAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGt > 2:1338783/1‑93 (MQ=255)
aataaaataaAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGtt < 2:4844413/93‑1 (MQ=255)
aataaaataaAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGtt < 1:5052733/93‑1 (MQ=255)
ataaaataaaGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGttt < 2:5493534/93‑1 (MQ=255)
ataaaataaaGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGttt < 2:5399760/93‑1 (MQ=255)
aaaataaaGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGa > 1:5477392/1‑93 (MQ=255)
aaataaaGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGaa > 2:464726/1‑93 (MQ=255)
aataaaGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGaaa < 1:961836/93‑1 (MQ=255)
ataaaGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAag > 2:3173488/1‑93 (MQ=255)
ataaaGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAag < 2:5758522/93‑1 (MQ=255)
taaaGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAaga < 1:3231216/93‑1 (MQ=255)
aaaGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAagac < 2:2133631/93‑1 (MQ=255)
aaaGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAagac < 2:4381538/93‑1 (MQ=255)
aaaGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAagac < 1:1648977/93‑1 (MQ=255)
aaaGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAagac < 2:3056153/93‑1 (MQ=255)
gCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAagacaga < 2:1941099/93‑1 (MQ=255)
cAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAAgacagaca > 1:5129054/1‑93 (MQ=255)
cAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAAgacagaca < 2:1623757/93‑1 (MQ=255)
gCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAAGACAGACAGc > 1:2201116/1‑93 (MQ=255)
gCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAAGACAGACAGc < 2:2323733/93‑1 (MQ=255)
gATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAAGACAGACAGCAt < 2:5899303/93‑1 (MQ=255)
atatTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGT‑GGTTTGAAAGACAGACAGCATAc > 1:4013992/1‑93 (MQ=255)
tatTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAAGACAGACAGCATAc < 1:5799119/93‑1 (MQ=255)
ttAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAAGACAGACAGCATACaaa < 1:1468864/93‑1 (MQ=255)
ttAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAAGACAGACAGCATACaaa > 2:5622166/1‑93 (MQ=255)
aaGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAAGACAGACAGCATACAAagt > 2:6001657/1‑93 (MQ=255)
aGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAAGACAGACAGCATACAAagta < 2:1237938/93‑1 (MQ=255)
aGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAAGACAGACAGCATACAAagta < 2:5532230/93‑1 (MQ=255)
aGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAAGACAGACAGCATACAAagta < 1:2007133/93‑1 (MQ=255)
gACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAAGACAGACAGCATACAAagtag > 2:380629/1‑93 (MQ=255)
gACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAAGACAGACAGCATACAAagtag < 1:4902151/93‑1 (MQ=255)
cgccgGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAAGACAGACAGCATACAAAGTAGttt < 1:2763837/93‑1 (MQ=255)
gccgGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAAGACAGACAGCATACAAAGTAGTTTa > 2:1316231/1‑93 (MQ=255)
ccgGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAAGACAGACAGCATACAAAGTAGTTTAc < 2:1222125/93‑1 (MQ=255)
ccgGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAAGACAGACAGCATACAAAGTAGTTTAc > 2:336300/1‑93 (MQ=255)
cgGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAAGACAGACAGCATACAAAGTAGTTTACt < 1:944899/93‑1 (MQ=255)
|
TTTACGGGACAAACAAATTCCTTACTGAAAATACTGCGCTGCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGACGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAAGACAGACAGCATACAAAGTAGTTTACT > NC_000913/1050387‑1050566
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CATTTTACGGGACAAACAAATTCCTTACTGAAAATACTGCGCTGCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGACGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAAGACAGACAGCATACAAAGTAGTTTACTAAAG > NC_000913/1050384‑1050570
|
CATTTTACGGGACAAACAAATTCCTTACTGAAAATACTGCGCTGCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGG < SRR4302533.3039003/94‑1 (MQ=60)
CATTTTACGGGACAAACAAATTCCTTACTGAAAATACTGCGCTGCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGG > SRR4302533.2777084/1‑94 (MQ=60)
CATTTTACGGGACAAACAAATTCCTTACTGAAAATACTGCGCTGCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGG < SRR4302533.1860646/94‑1 (MQ=60)
TTTTACGGGACAAACAAATTCCTTACTGAAAATACTGCGCTGCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCG < SRR4302533.2622313/94‑1 (MQ=60)
TTTACGGGACAAACAAATTCCTTACTGAAAATACTGCGCTGCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGG < SRR4302533.2652115/94‑1 (MQ=60)
TTACGGGACAAACAAATTCCTTACTGAAAATACTGCGCTGCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGC > SRR4302533.653371/1‑94 (MQ=60)
CGGGACAAACAAATTCCTTACTGAAAATACTGCGCTGCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAA < SRR4302533.6281201/94‑1 (MQ=60)
GGGACAAACAAATTCCTTACTGAAAATACTGCGCTGCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAA > SRR4302533.1939794/1‑94 (MQ=60)
GACAAACAAATTCCTTACTGAAAATACTGCGCTGCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAAT > SRR4302533.5181047/1‑94 (MQ=60)
ACAAACAAATTCCTTACTGAAAATACTGCGCTGCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATA > SRR4302533.620166/1‑94 (MQ=60)
ACAAACAAATTCCTTACTGAAAATACTGCGCTGCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATA > SRR4302533.5097036/1‑94 (MQ=60)
AAACAAATTCCTTACTGAAAATACTGCGCTGCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAA < SRR4302533.4745860/94‑1 (MQ=60)
AAACAAATTCCTTACTGAAAATACTGCGCTGCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAA > SRR4302533.931130/1‑94 (MQ=60)
AACAAATTCCTTACTGAAAATACTGCGCTGCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAA < SRR4302533.3456309/94‑1 (MQ=60)
ACAAATTCCTTACTGAAAATACTGCGCTGCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAAT < SRR4302533.4603268/94‑1 (MQ=60)
ACAAATTCCTTACTGAAAATACTGCGCTGCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAAT < SRR4302533.4175076/94‑1 (MQ=60)
AAATTCCTTACTGAAAATACTGCGCTGCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTT < SRR4302533.4871775/94‑1 (MQ=60)
AAATTCCTTACTGAAAATACTGCGCTGCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTT > SRR4302533.5437512/1‑94 (MQ=60)
AAATTCCTTACTGAAAATACTGCGCTGCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTT > SRR4302533.758818/1‑94 (MQ=60)
AATTCCTTACTGAAAATACTGCGCTGCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTG > SRR4302533.506125/1‑94 (MQ=60)
ATTCCTTACTGAAAATACTGCGCTGCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGC > SRR4302533.545296/1‑94 (MQ=60)
CCTTACTGAAAATACTGCGCTGCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTA > SRR4302533.2091290/1‑94 (MQ=60)
CCTTACTGAAAATACTGCGCTGCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTA < SRR4302533.3974981/94‑1 (MQ=60)
CCTTACTGAAAATACTGCGCTGCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTA < SRR4302533.1141220/94‑1 (MQ=60)
CTTACTGAAAATACTGCGCTGCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAA < SRR4302533.3189746/94‑1 (MQ=60)
CTTACTGAAAATACTGCGCTGCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAA > SRR4302533.122506/1‑94 (MQ=60)
CTTACTGAAAATACTGCGCTGCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAA > SRR4302533.2290420/1‑94 (MQ=60)
TTACTGAAAATACTGCGCTGCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAAT < SRR4302533.4772918/94‑1 (MQ=60)
TACTGAAAATACTGCGCTGCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATC > SRR4302533.4414243/1‑94 (MQ=60)
ACTGAAAATACTGCGCTGCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCT > SRR4302533.2272422/1‑94 (MQ=60)
TGAAAATACTGCGCTGCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCA < SRR4302533.1397877/94‑1 (MQ=60)
TGAAAATACTGCGCTGCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCA > SRR4302533.321575/1‑94 (MQ=60)
GAAAATACTGCGCTGCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAA > SRR4302533.4603490/1‑94 (MQ=60)
AAATACTGCGCTGCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATT > SRR4302533.4979252/1‑94 (MQ=60)
AAATACTGCGCTGCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATT < SRR4302533.2728948/94‑1 (MQ=60)
AAATACTGCGCTGCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATT < SRR4302533.4986426/94‑1 (MQ=60)
AATACTGCGCTGCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTA > SRR4302533.3773569/1‑94 (MQ=60)
ATACTGCGCTGCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTAT < SRR4302533.3901936/94‑1 (MQ=60)
ATACTGCGCTGCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTAT > SRR4302533.4868537/1‑94 (MQ=60)
ATACTGCGCTGCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTAT > SRR4302533.4868538/1‑94 (MQ=60)
TACTGCGCTGCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATC > SRR4302533.2275896/1‑94 (MQ=60)
TGCGCTGCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATG > SRR4302533.5988868/1‑94 (MQ=60)
TGCGCTGCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATG < SRR4302533.4041348/94‑1 (MQ=60)
GCGCTGCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGC < SRR4302533.356702/94‑1 (MQ=60)
CGCTGCACTATACGGGTTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCG > SRR4302533.1866015/1‑94 (MQ=60)
CGCTGCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCACAATTATCATGCG > SRR4302533.3624681/1‑94 (MQ=60)
GCTGCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGT < SRR4302533.5683987/94‑1 (MQ=60)
TGCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTA > SRR4302533.4283010/1‑94 (MQ=60)
TGCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTA < SRR4302533.6068428/94‑1 (MQ=60)
GCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAA < SRR4302533.5381665/94‑1 (MQ=60)
CACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAAT > SRR4302533.6132479/1‑94 (MQ=60)
CACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAAT < SRR4302533.2564518/94‑1 (MQ=60)
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ACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATA > SRR4302533.3877385/1‑94 (MQ=60)
CTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAG < SRR4302533.2551311/94‑1 (MQ=60)
TATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGC > SRR4302533.5229363/1‑94 (MQ=60)
ACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGC > SRR4302533.5381993/1‑94 (MQ=60)
CGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCG > SRR4302533.4443261/1‑94 (MQ=60)
TGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGT < SRR4302533.597189/94‑1 (MQ=60)
GGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCG < SRR4302533.3972269/94‑1 (MQ=60)
GTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGG < SRR4302533.590264/94‑1 (MQ=60)
TTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGT > SRR4302533.4111825/1‑94 (MQ=60)
TTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGT > SRR4302533.2708217/1‑94 (MQ=60)
TAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTT < SRR4302533.5748490/94‑1 (MQ=60)
AATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTT < SRR4302533.5083283/94‑1 (MQ=60)
TAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGA > SRR4302533.5510407/1‑94 (MQ=60)
AAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAA > SRR4302533.1548610/1‑94 (MQ=60)
AATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAAG < SRR4302533.967486/94‑1 (MQ=60)
AATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAAG > SRR4302533.5844446/1‑94 (MQ=60)
AATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAAG > SRR4302533.4847224/1‑94 (MQ=60)
ATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAAGA < SRR4302533.3729978/94‑1 (MQ=60)
TAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAAGAC < SRR4302533.3251133/94‑1 (MQ=60)
AAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAAGACA < SRR4302533.1658969/94‑1 (MQ=60)
GCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAAGACAGAC > SRR4302533.1764516/1‑94 (MQ=60)
CCAGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAAGACAGACA > SRR4302533.5160036/1‑94 (MQ=60)
AGCGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAAGACAGACAGC > SRR4302533.2214679/1‑94 (MQ=60)
CGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAAGACAGACAGCAT < SRR4302533.432535/94‑1 (MQ=60)
CGATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAAGACAGACAGCAT < SRR4302533.1945124/94‑1 (MQ=60)
GATATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGT‑GGTTTGAAAGACAGACAGCATAC > SRR4302533.4038434/1‑94 (MQ=60)
TATTTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAAGACAGACAGCATACA < SRR4302533.5834155/94‑1 (MQ=60)
TTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAGAGACAGACAGCATACAAAG > SRR4302533.2853176/1‑94 (MQ=60)
TTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAAGACAGACAGCATACAAAG > SRR4302533.264072/1‑94 (MQ=60)
TTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAAGACAGACAGCATACAAAG < SRR4302533.1477720/94‑1 (MQ=60)
TTAAGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAAGACAGACAGCATACAAAG > SRR4302533.2014181/1‑94 (MQ=60)
AGACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAAGACAGACAGCATACAAAGTAG < SRR4302533.2019495/94‑1 (MQ=60)
GACCGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAAGACAGACAGCATACAAAGTAGT < SRR4302533.4931855/94‑1 (MQ=60)
CGCCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAAGACAGACAGCATACAAAGTAGTTTA < SRR4302533.2780782/94‑1 (MQ=60)
CCGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAAGACAGACAGCATACAAAGTAGTTTACT < SRR4302533.6046946/94‑1 (MQ=60)
CGGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAAGACAGACAGCATACAAAGTAGTTTACTA < SRR4302533.950456/94‑1 (MQ=60)
GGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAAGACAGACAGCATACAAAGTAGTTTACTAA > SRR4302533.2650691/1‑94 (MQ=60)
GGGCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAAGACAGACAGCATACAAAGTAGTTTACTAA > SRR4302533.1317982/1‑94 (MQ=60)
GCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAAGACAGACAGCATACAAAGTAGTTTACTAAAG > SRR4302533.4832234/1‑94 (MQ=60)
GCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAAGACAGACAGCATACAAAGTAGTTTACTAAAG < SRR4302533.1302321/94‑1 (MQ=60)
GCGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAAGACAGACAGCATACAAAGTAGTTTACTAAAG < SRR4302533.569172/94‑1 (MQ=60)
|
CATTTTACGGGACAAACAAATTCCTTACTGAAAATACTGCGCTGCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGACGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAAGACAGACAGCATACAAAGTAGTTTACTAAAG > NC_000913/1050384‑1050570
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
