Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1624 |
250.6 |
12620048 |
98.0% |
12367647 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,185,646 |
A→G |
T194A (ACT→GCT) |
pepT → |
putative peptidase T |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,185,646 | 0 | A | G | 100.0%
| 718.8
/ NA
| 223 | T194A (ACT→GCT) | pepT | putative peptidase T |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (120/103); total (120/103) |
Only 100 of 224 total aligned reads displayed.
GATATTCGCGTCGCCTTTACCCCGGATGAAGAAGTGGGCAAAGGGGCGAAACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACACTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCAACGCCGCGTCGGTCAATATCAAAATTGTCGGTAACAATGTTCA > NC_000913/1185556‑1185734
|
gATATTCGCGTCGCCTTTACCCCGGATGAAGAAGTGGGCAAAGGGGCGAAACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCt > 1:5949692/1‑93 (MQ=255)
gATATTCGCGTCGCCTTTACCCCGGATGAAGAAGTGGGCAAAGGGGCGAAACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCt < 2:6176250/93‑1 (MQ=255)
atatTCGCGTCGCCTTTACCCCGGATGAAGAAGTGGGCAAAGGGGCGAAACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTg > 2:3497460/1‑93 (MQ=255)
atTCGCGTCGCCTTTACCCCGGATGAAGAAGTGGGCAAAGGGGCGAAACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGtt > 1:5122538/1‑93 (MQ=255)
tCGCGTCGCCTTTACCCCGGATGAAGAAGTGGGCAAAGGGGCGAAACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGttta < 2:3976295/93‑3 (MQ=255)
tCGCGTCGCCTTTACCCCGGATGAAGAAGTGGGCAAAGGGGCGAAACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTgt > 2:5421128/1‑92 (MQ=255)
tCGCGTCGCCTTTACCCCGGATGAAGAAGTGGGCAAAGGGGCGAAACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGa > 1:4005275/1‑93 (MQ=255)
gcgTCGCCTTTAACCCGGATGAAGAAGTGGGCAAAGGGTCGAAACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGAtg < 1:3579307/93‑1 (MQ=255)
cgTCGCCTTTACCCCGGATGAAGAAGTGGGCAAAGGGGCGAAACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGAtgg > 2:1854927/1‑93 (MQ=255)
cgTCGCCTTTACCCCGGATGAAGAAGTGGGCAAAGGGGCGAAACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGAtgg < 1:4648782/93‑1 (MQ=255)
gTCGCCTTTACCCCGGATGAAGAAGTGGGCAAAGGGGCGAAACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGAtggt < 1:3249729/93‑1 (MQ=255)
tCGCCTTTACCCCGGATGAAGAAGTGGGCAAAGGGGCGAAACATTTTGATGTTGACGACTTCGATGACCGCTGGGCTTACGCTGTTGAtggtg > 1:4211033/1‑93 (MQ=255)
tCGCCTTTACCCCGGATGAAGAAGTGGGCAAAGGGGCGAAACATTTTGATATTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGAtggtg < 1:4433684/93‑1 (MQ=255)
cGCCTTTCCCCCGGATGAAGAAGTGGGCAAAGGGGCGAAACATTTTGATGTTGACGCGTTCGATGCCCTCTTGGCTTACGCTGTTGAtggtgg < 1:368906/93‑1 (MQ=255)
cGCCTTTACCCCGGATGAAGAAGTGGGCAAAGGGGCGAAACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGAtggtgg < 1:4932465/93‑1 (MQ=255)
cGCCTTTACCCCGGATGAAGAAGTGGGCAAAGGGGCGAAACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGAtggtgg < 2:4937842/93‑1 (MQ=255)
gCCTTTACCCCGGATGAAGAAGTGGGCAAAGGGGCGAAACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGAtggtggt < 2:3307979/93‑1 (MQ=255)
ccTTTACCCCGGATGAAGAAGTGGGCAAAGGGGCGAAACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGAtggtggtg > 1:998425/1‑93 (MQ=255)
ccTTTACCCCGGATGAAGAAGTGGGCAAAGGGGCGAAACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGAtggtggtg > 1:5788079/1‑93 (MQ=255)
tttACCCCGGATGAAGAAGTGGGCAAAGGGGCGAAACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGc > 2:1545724/1‑93 (MQ=255)
tttACCCCGGATGAAGAAGTGGGCAAAGGGGCGAAACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGc > 1:5277112/1‑93 (MQ=255)
cccccGGATGAAGAAGTGGGCAAAGGGGCGAAACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTa < 2:697059/92‑1 (MQ=255)
aCCCCGGATGAAGAAGTGGGCAAAGGGGCGAAACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTa < 1:3655793/93‑1 (MQ=255)
ccccGGATGAAGAAGTGGGCAAAGGGGCGAAACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAg < 1:1034673/93‑1 (MQ=255)
ccccGGATGAAGAAGTGGGCAAAGGGGCGAAACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAg > 2:1789358/1‑93 (MQ=255)
cccGGATGAAGAAGTGGGCAAAGGGGCGAAACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAgg < 1:6123414/93‑1 (MQ=255)
cccGGATGAAGAAGTGGGCAAAGGGGCGAAACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAgg < 1:6161529/93‑1 (MQ=255)
ccGGATGAAGAAGTGGGCAAAGGGGCGAAACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGc > 1:5840936/1‑93 (MQ=255)
ccGGATGAAGAAGTGGGCAAAGGGGCGAAACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGc > 2:102237/1‑93 (MQ=255)
ccGGATGAAGAAGTGGGCAAAGGGGCGAAACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGc > 1:2263285/1‑93 (MQ=255)
ggATGAAGAAGTGGGCAAAGGGGCGAAACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGa > 2:1735340/1‑93 (MQ=255)
aTGAAGAAGTGGGCAAAGGGGCGAAACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAAc < 2:1946698/93‑1 (MQ=255)
tGAAGAAGTGGGCAAAGGGGCGAAACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACt < 2:951123/93‑1 (MQ=255)
tGAAGAAGTGGGCAAAGGGGCGAAACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACt < 1:1902423/93‑1 (MQ=255)
aagaagTGGGCAAAGGGGCGAAACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTgg < 1:5472064/93‑1 (MQ=255)
aagaagTGGGCAAAGGGGCGAAACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTgg < 1:2341856/93‑1 (MQ=255)
aagaagCGGGCAAAGGGGCGAAACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTgg > 2:1649968/1‑93 (MQ=255)
agaagTGGGCAAAGGGGCGAAACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGa < 1:17439/93‑1 (MQ=255)
agaagTGGGCAAAGGGGCGAAACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGa > 2:6017577/1‑93 (MQ=255)
aagTGGGCAAAGGGGCGAAACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGt < 1:4294418/93‑1 (MQ=255)
aagTGGGCAAAGGGGCGAAACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGt < 2:4022390/93‑1 (MQ=255)
agTGGGCAAAGGGGCGAAACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGtt > 2:5119441/1‑93 (MQ=255)
cAAAGGGGCGAAACATTTTGATGTGGACGCCTTCTATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGaaaa < 2:1579529/93‑1 (MQ=255)
aaaGGGGCGAAACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAAc > 2:6224614/1‑93 (MQ=255)
aaaGGGGCGAAACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAAc > 2:2003593/1‑93 (MQ=255)
aaaGGGGCGAAACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAAc < 1:2581875/93‑1 (MQ=255)
aGGGGCGAAACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACtt > 2:3797837/1‑93 (MQ=255)
ggggCGAAACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTc < 1:84735/93‑1 (MQ=255)
ggCGAAACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCaa < 2:2131966/93‑1 (MQ=255)
ggCGAAACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCaa > 1:1444377/1‑93 (MQ=255)
ggCGAAACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCaa > 1:5357415/1‑93 (MQ=255)
gAAACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCAAcgc < 2:5741353/93‑1 (MQ=255)
aaaCATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCAAcgcc > 2:4205686/1‑93 (MQ=255)
aaCATTTTGATGTGGACTCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGGGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCAAcgccg < 2:1285784/93‑1 (MQ=255)
aCATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCAAcgccgc > 1:4979162/1‑93 (MQ=255)
aCATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCAAcgccgc < 1:1262028/93‑1 (MQ=255)
cATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCAACGCcgcg > 1:5847612/1‑93 (MQ=255)
cATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCAACGCcgcg > 1:3922885/1‑93 (MQ=255)
cATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTCTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCAACGCcgcg > 1:3388086/1‑93 (MQ=255)
aTTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCAACGCCGCGt < 1:3104806/93‑1 (MQ=255)
aTTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCAACGCCGCGt > 1:1210539/1‑93 (MQ=255)
aTTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCAACGCCGCGt > 2:441584/1‑93 (MQ=255)
aTTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCAACGCCGCGt > 1:655260/1‑93 (MQ=255)
ttttGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCAACGCCGCGTc < 2:5476242/93‑1 (MQ=255)
ttGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCAACGCCGCGTCgg < 1:2950794/93‑1 (MQ=255)
tGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCAACGCCGCGTCGGt < 2:5843422/93‑1 (MQ=255)
gATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCAACGCCGCGTCGGTc > 2:4769470/1‑93 (MQ=255)
tGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGCGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTCGAGATTGAAAACTTCCACGCCGCGTCGGTCaa > 1:3958701/1‑93 (MQ=255)
gTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCAACGCCGCGTCGGTCAat > 2:3256793/1‑93 (MQ=255)
ttGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCAACGCCGCGTCGGTCAata < 2:5702876/93‑1 (MQ=255)
ttGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCAACGCCGCGTCGGTCAata < 2:928014/93‑1 (MQ=255)
ttGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCAACGCCGCGTCGGTCAata > 2:1228041/1‑93 (MQ=255)
ttGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCAACGCCGCGTCGGTCAata < 2:2905281/93‑1 (MQ=255)
tGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCAACGCCGCGTCGGTCAatat < 2:2627915/93‑1 (MQ=255)
gACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCAACGCCGCGTCGGTCAATATc > 1:1137332/1‑93 (MQ=255)
gACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCAACGCCGCGTCGGTCAATATc > 2:1814794/1‑93 (MQ=255)
aCGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCAACGCCGCGTCGGTCAATATCa < 2:2560894/93‑1 (MQ=255)
aCGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCAACGCCGCGTCGGTCAATATCa > 2:4657272/1‑93 (MQ=255)
ccTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCAACGCCGCGTCGGTCAATATCaaaa > 1:1532911/1‑93 (MQ=255)
ccTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCAACGCCGCGTCGGTCAATATCaaaa > 2:5910183/1‑93 (MQ=255)
cTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCAACGCCGCGTCGGTCAATATCAAAAt > 1:1118998/1‑93 (MQ=255)
ttCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCAACGCCGCGTCGGTCAATATCAAAAtt > 1:93503/1‑93 (MQ=255)
tCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCAACGCCGCGTCGGTCAATATCAAAATTg > 1:2882376/1‑93 (MQ=255)
tCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCAACGCCGCGTCGGTCAATATCAAAATTg > 1:3659971/1‑93 (MQ=255)
cccGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCAACGCCGCGTCGGTCAATATCAAAATTGTCGGTa > 2:4262235/1‑93 (MQ=255)
cccGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGGTTGAAAACTTCAACGCCGCGTCGGTCAATATCAAGATTGTCGGTa > 2:3094196/1‑93 (MQ=255)
ccGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCAACGCCGCGTCGGTCAATATCAAAATTGTCGGTaa > 1:329730/1‑93 (MQ=255)
cGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCAACGCCGCGTCGGTCAATATCAAAATTGTCGGTAAc < 2:810075/93‑1 (MQ=255)
gCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCAACGCCGCGTCGGTCAATATCAAAATTGTCGGTAACa > 2:5255523/1‑93 (MQ=255)
gCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCAACGCCGCGTCGGTCAATATCAAAATTGTCGGTAACa > 2:2082061/1‑93 (MQ=255)
cTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCAACGCCGCGTCGGTCAATATCAAAATTGTCGGTAACaa > 2:5818047/1‑93 (MQ=255)
cTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCAACGCCGCGTCGGTCAATATCAAAATTGTCGGTAACaa > 2:2260372/1‑93 (MQ=255)
cTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCAACGCCGCGTCGGTCAATATCAAAATTGTCGGTAACaa > 2:3886887/1‑93 (MQ=255)
gggCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCAACGCCGCGTCGGTCAATATCAAAATTGTCGGTAACAATg < 1:5748270/93‑1 (MQ=255)
gggCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCAACGCCGCGTCGGTCAATATCAAAATTGTCGGTAACAATg > 2:227147/1‑93 (MQ=255)
gggCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCAACGCCGCGTCGGTCAATATCAAAATTGTCGGTAACAATg < 1:3083119/93‑1 (MQ=255)
gggCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCAACGCCGCGTCGGTCAATATCAAAATTGTCGGTAACAATg > 1:2446883/1‑93 (MQ=255)
ggCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCAACGCCGCGTCGGTCAATATCAAAATTGTCGGTAACAATGt < 1:3497460/93‑1 (MQ=255)
ttACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCAACGCCGCGTCGGTCAATATCAAAATTGTCGGTAACAATGTTCa < 2:3684646/93‑1 (MQ=255)
ttACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCAACGCCGCGTCGGTCAATATCAAAATTGTCGGTAACAATGTTCa > 2:4615388/1‑93 (MQ=255)
|
GATATTCGCGTCGCCTTTACCCCGGATGAAGAAGTGGGCAAAGGGGCGAAACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACACTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCAACGCCGCGTCGGTCAATATCAAAATTGTCGGTAACAATGTTCA > NC_000913/1185556‑1185734
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GGTGATATTCGCGTCGCCTTTACCCCGGATGAAGAAGTGGGCAAAGGGGCGAAACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACACTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCAACGCCGCGTCGGTCAATATCAAAATTGTCGGTAACAATGTTCATCCGG > NC_000913/1185553‑1185739
|
GGTGATATTCGCGTCGCCTTTACCCCGGATGAAGAAGTGGGCAAAGGGGCGAAACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACG < SRR4302533.6219093/94‑1 (MQ=60)
GGTGATATTCGCGTCGCCTTTACCCCGGATGAAGAAGTGGGCAAAGGGGCGAAACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACG > SRR4302533.1201841/1‑94 (MQ=60)
GTGATATTCGCGTCGCCTTTACCCCGGATGAAGAAGTGGGCAAAGGGGCGAAACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGC > SRR4302533.378788/1‑94 (MQ=60)
GTGATATTCGCGTCGCCTTTACCCCGGATGAAGAAGTGGGCAAAGGGGCGAAACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGC > SRR4302533.1291531/1‑94 (MQ=60)
TGATATTCGCGTCGCCTTTACCCCGGATGAAGAAGTGGGCAAAGGGGCGAAACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCT > SRR4302533.5985676/1‑94 (MQ=60)
TGATATTCGCGTCGCCTTTACCCCGGATGAAGAAGTGGGCAAAGGGGCGAAACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCT > SRR4302533.5880713/1‑94 (MQ=60)
ATATTCGCGTCGCCTTTACCCCGGATGAAGAAGTGGGCAAAGGGGCGAAACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGT > SRR4302533.1048173/1‑94 (MQ=60)
ATATTCGCGTCGCCTTTACCCCGGATGAAGAAGTGGGCAAAGGGGCGAAACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGT > SRR4302533.4136153/1‑94 (MQ=60)
TATTCGCGTCGCCTTTACCCCGGATGAAGAAGTGGGCAAAGGGGCGAAACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTT < SRR4302533.1140110/94‑1 (MQ=60)
TATTCGCGTCGCCTTTACCCCGGATGAAGAAGTGGGCAAAGGGGCGAAACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTT > SRR4302533.5153489/1‑94 (MQ=60)
TTCGCGTCGCCTTTACCCCGGATGAAGAAGTGGGCAAAGGGGCGAAACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGA > SRR4302533.100577/1‑94 (MQ=60)
TTCGCGTCGCCTTTACCCCGGATGAAGAAGTGGGCAAAGGGGCGAAACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGA > SRR4302533.4029656/1‑94 (MQ=60)
CGCGTCGCCTTTACCCCGGATGAAGAAGTGGGCAAAGGGGCGAAACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATG > SRR4302533.3228636/1‑94 (MQ=60)
GCGTCGCCTTTAACCCGGATGAAGAAGTGGGCAAAGGGTCGAAACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGG < SRR4302533.3601363/94‑1 (MQ=60)
CGTCGCCTTTACCCCGGATGAAGAAGTGGGCAAAGGGGCGAAACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGT < SRR4302533.4676948/94‑1 (MQ=60)
CGTCGCCTTTACCCCGGATGAAGAAGTGGGCAAAGGGGCGAAACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGT < SRR4302533.73933/94‑1 (MQ=60)
GTCGCCTTTACCCCGGATGAAGAAGTGGGCAAAGGGGCGAAACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTG > SRR4302533.986574/1‑94 (MQ=60)
GTCGCCTTTACCCCGGATGAAGAAGTGGGCAAAGGGGCGAAACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTG > SRR4302533.283336/1‑94 (MQ=60)
GTCGCCTTTACCCCGGATGAAGAAGTGGGCAAAGGGGCGAAACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTG < SRR4302533.3269767/94‑1 (MQ=60)
GTCGCCTTTACCCCGGATGAAGAAGTGGGCAAAGGGGCGAAACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTG < SRR4302533.5122909/94‑1 (MQ=60)
GTCGCCTTTACCCCGGATGAAGAAGTGGGCAAAGGGGCGAAACATTTTGATGTTGACGACTTCGATGACCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTG > SRR4302533.4236504/1‑94 (MQ=60)
TCGCCTTTACCCCGGATGAAGAAGTGGGCAAAGGGGCGAAACATTTTGATATTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGG < SRR4302533.4460489/94‑1 (MQ=60)
CGCCTTTCCCCCGGATGAAGAAGTGGGCAAAGGGGCGAAACATTTTGATGTTGACGCGTTCGATGCCCTCTTGGCTTACGCTGTTGATGGTGGT < SRR4302533.371134/94‑1 (MQ=60)
CGCCTTTACCCCGGATGAAGAAGTGGGCAAAGGGGCGAAACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGT < SRR4302533.4962334/94‑1 (MQ=60)
GCCTTTACCCCGGATGAAGAAGTGGGCAAAGGGGCGAAACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTG > SRR4302533.1004253/1‑94 (MQ=60)
GCCTTTACCCCGGATGAAGAAGTGGGCAAAGGGGCGAAACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTG > SRR4302533.5823049/1‑94 (MQ=60)
GCCTTTACCCCGGATGAAGAAGTGGGCAAAGGGGCGAAACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTG < SRR4302533.194796/94‑1 (MQ=60)
GCCTTTACCCCGGATGAAGAAGTGGGCAAAGGGGCGAAACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTG > SRR4302533.5165885/1‑94 (MQ=60)
CCTTTACCCCGGATGAAGAAGTGGGCAAAGGGGCGAAACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGG > SRR4302533.4255826/1‑94 (MQ=60)
CTTTACCCCGGATGAAGAAGTGGGCAAAGGGGCGAAACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGC > SRR4302533.5308747/1‑94 (MQ=60)
CTTTACCCCGGATGAAGAAGTGGGCAAAGGGGCGAAACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGC > SRR4302533.6224968/1‑94 (MQ=60)
TTACCCCGGATGAAGAAGTGGGCAAAGGGGCGAAACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGT < SRR4302533.5385477/94‑1 (MQ=60)
ACCCCGGATGAAGAAGTGGGCAAAGGGGCGAAACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAG < SRR4302533.3678266/94‑1 (MQ=60)
CCCCGGATGAAGAAGTGGGCAAAGGGGCGAAACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGG < SRR4302533.1040760/94‑1 (MQ=60)
CCGGGATGAAGAAGTGGGCAAAGGGGCGAAACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGC < SRR4302533.2414326/94‑1 (MQ=60)
CCCGGATGAAGAAGTGGGCAAAGGGGCGAAACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGC > SRR4302533.2277290/1‑94 (MQ=60)
CCCGGATGAAGAAGTGGGCAAAGGGGCGAAACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGC > SRR4302533.3956617/1‑94 (MQ=60)
CCCGGATGAAGAAGTGGGCAAAGGGGCGAAACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGC > SRR4302533.5876251/1‑94 (MQ=60)
CCCGGATGAAGAAGTGGGCAAAGGGGCGAAACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGC < SRR4302533.6160329/94‑1 (MQ=60)
CCCGGATGAAGAAGTGGGCAAAGGGGCGAAACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGC < SRR4302533.6198581/94‑1 (MQ=60)
GATGAAGAAGTGGGCAAAGGGGCGAAACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAAC < SRR4302533.6161912/94‑1 (MQ=60)
TGAAGAAGTGGGCAAAGGGGCGAAACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTG < SRR4302533.1914034/94‑1 (MQ=60)
AAGAAGTGGGCAAAGGGGCGAAACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGA < SRR4302533.2356356/94‑1 (MQ=60)
AAGAAGTGGGCAAAGGGGCGAAACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGA < SRR4302533.5505040/94‑1 (MQ=60)
AGAAGTGGGCAAAGGGGCGAAACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAG < SRR4302533.17559/94‑1 (MQ=60)
GAAGTGGGCAAAGGGGCGAAACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGT < SRR4302533.909466/94‑1 (MQ=60)
AAGTGGGCAAAGGGGCGAAACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTT < SRR4302533.4320245/94‑1 (MQ=60)
AAGTGGGCAAAGGGGCGAAACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTT > SRR4302533.2311289/1‑94 (MQ=60)
GTGGGCAAAGGGGCGAAACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTG < SRR4302533.3895149/94‑1 (MQ=60)
GTGGGCAAAGGGGCGAAACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTG < SRR4302533.5971611/94‑1 (MQ=60)
TGGGCAAAGGGGCGAAACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGA < SRR4302533.3009643/94‑1 (MQ=60)
GCAAAGGGGCGAAACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAA < SRR4302533.5784366/94‑1 (MQ=60)
AAAGGGGCGAAACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACT < SRR4302533.2597756/94‑1 (MQ=60)
GGGGCGAAACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCA < SRR4302533.1630542/94‑1 (MQ=60)
GGGGCGAAACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCA < SRR4302533.85278/94‑1 (MQ=60)
GGGCGAAACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCAA > SRR4302533.5389575/1‑94 (MQ=60)
GGGCGAAACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCAA > SRR4302533.1453090/1‑94 (MQ=60)
GGCGAAACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCAAC < SRR4302533.3283524/94‑1 (MQ=60)
GGCGAAACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTCGAAAACTTCAAC < SRR4302533.3704519/94‑1 (MQ=60)
GAAACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCAACGCC > SRR4302533.3465114/1‑94 (MQ=60)
AAACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCAACGCCG < SRR4302533.3379921/94‑1 (MQ=60)
AACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCAACGCCGC > SRR4302533.5009353/1‑94 (MQ=60)
ACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCAACGCCGCG > SRR4302533.3946837/1‑94 (MQ=60)
ACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCAACGCCGCG > SRR4302533.5882961/1‑94 (MQ=60)
ACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCAACGCCGCG < SRR4302533.1269575/94‑1 (MQ=60)
ACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTCTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCAACGCCGCG > SRR4302533.3409006/1‑94 (MQ=60)
CATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCAACGCCGCGT > SRR4302533.659128/1‑94 (MQ=60)
CATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCAACGCCGCGT > SRR4302533.1217807/1‑94 (MQ=60)
ATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCAACGCCGCGTC < SRR4302533.3123892/94‑1 (MQ=60)
TTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCAACGCCGCGTCGGT < SRR4302533.2968836/94‑1 (MQ=60)
TTGATGTTGACGCCTGCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCAACGCCGCGTCGGT < SRR4302533.4409650/94‑1 (MQ=60)
TGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCAACGCCGCGTCGGTC < SRR4302533.1243982/94‑1 (MQ=60)
ATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCAACGCCGCGTCGGTCAA > SRR4302533.1517052/1‑94 (MQ=60)
ATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCAACGCCGCGTCGGTCAA > SRR4302533.604626/1‑94 (MQ=60)
ATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGCGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTCGAGATTGAAAACTTCCACGCCGCGTCGGTCAA > SRR4302533.3982825/1‑94 (MQ=60)
TGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGCAAACTTCAACGCCGCGTCGGTCAAT > SRR4302533.3238284/1‑94 (MQ=60)
TGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTATGAAAAATTCAACGCCTCGTCGGTCACT > SRR4302533.499166/1‑94 (MQ=60)
GTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCAACGCAGCGTCGGTCAATA > SRR4302533.3627573/1‑94 (MQ=60)
TTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCAACGCCGCGTCGGTCAATAT < SRR4302533.2522420/94‑1 (MQ=60)
TGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCAACGCCGCGTCGGTCAATATC > SRR4302533.1144096/1‑94 (MQ=60)
TGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCAACGCCGCGTCGGTCAATATC > SRR4302533.208991/1‑94 (MQ=60)
GACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCAACGCCGCGTCGGTCAATATCA > SRR4302533.1416338/1‑94 (MQ=60)
GCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCAACGCCGCGTCGGTCAATATCAAAA > SRR4302533.1391084/1‑94 (MQ=60)
GCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCAACGCCGCGTCGGTCAATATCAAAA < SRR4302533.5853631/94‑1 (MQ=60)
GCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCAACGCCGCGTCGGTCAATATCAAAA > SRR4302533.1542118/1‑94 (MQ=60)
CCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCAACGCCGCGTCGGTCAATATCAAAAT > SRR4302533.1125636/1‑94 (MQ=60)
CCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCAACGCCGCGTCGGTCAATATCAAAAT > SRR4302533.5469325/1‑94 (MQ=60)
CTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCAACGCCGCGTCGGTCAATATCAAAATT > SRR4302533.94093/1‑94 (MQ=60)
CTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCAACGCCCCGTCGGTCAATATCAAAATT < SRR4302533.3587280/94‑1 (MQ=60)
CTTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTACAACGCCGCGTCGGTCAATATCAAAATT < SRR4302533.5921956/94‑1 (MQ=60)
TTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCAACGCCGCGTCGGTCAATATCAAAATTG > SRR4302533.2900106/1‑94 (MQ=60)
TTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCAACGCCGCGTCGGTCAATATCAAAATTG > SRR4302533.3682474/1‑94 (MQ=60)
TTCGATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCAACGCCGCGTCGGTCAATATCAAAATTG > SRR4302533.3682475/1‑94 (MQ=60)
ATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCAACGCCGCGTCGGTCAATATCAAAATTGTCGG < SRR4302533.3113048/94‑1 (MQ=60)
ATGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCAACGCCGCGTCGGTCAATATCAAAATTGTCGG < SRR4302533.3597947/94‑1 (MQ=60)
TGCCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCAACGCCGCGTCGGTCAATATCAAAATTGTCGGT < SRR4302533.4583860/94‑1 (MQ=60)
CCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCAACGCCGCGTCGGTCAATATCAAAATTGTCGGTAA > SRR4302533.331744/1‑94 (MQ=60)
CCCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCAACGCCGCGTCGGTCAATATCAAAATTGTCGGTAA > SRR4302533.4024485/1‑94 (MQ=60)
CCGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCAACGCCGCGTCGGTCAATATCAAAATTGTCGGTAAC > SRR4302533.1901149/1‑94 (MQ=60)
CGCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCAACGCCGCGTCGGTCAATATCAAAATTGTCGGTAACA > SRR4302533.4951964/1‑94 (MQ=60)
GCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCAACGCCGCGTCGGTCAATATCAAAATTGTCGGTAACAA > SRR4302533.4379716/1‑94 (MQ=60)
GCTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCAACGCCGCGTCGGTCAATATCAAAATTGTCGGTAACAA > SRR4302533.377020/1‑94 (MQ=60)
CTGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCAACGCCGCGTCGGTCAATATCAAAATTGTCGGTAACAAT < SRR4302533.514633/94‑1 (MQ=60)
TGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCAACGCCGCGTCGGTCAATATCAAAATTGTCGGTAACAATG < SRR4302533.5579576/94‑1 (MQ=60)
TGGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCAACGCCGCGTCGGTCAATATCAAAATTGTCGGTAACAATG > SRR4302533.2461983/1‑94 (MQ=60)
GGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCAACGCCGCGTCGGTCAATATCAAAATTGTCGGTAACAATGT < SRR4302533.5782948/94‑1 (MQ=60)
GGGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCAACGCCGCGTCGGTCAATATCAAAATTGTCGGTAACAATGT < SRR4302533.3102072/94‑1 (MQ=60)
GGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCAACGCCGCGTCGGTCAATATCAAAATTGTCGGTAACAATGTT < SRR4302533.3519026/94‑1 (MQ=60)
GGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCAACGCCGCGTCGGTCAATATCAAAATTGTCGGTAACAATGTT < SRR4302533.794831/94‑1 (MQ=60)
GGCTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCAACGCCGCGTCGGTCAATATCAAAATTGTCGGTAACAATGTT < SRR4302533.1146551/94‑1 (MQ=60)
CTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCAACGCCGCGTCGGTCAATATCAAAATTGTCGGTAACAATGTTCA > SRR4302533.5607870/1‑94 (MQ=60)
CTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCAACGCCGCGTCGGTCAATATCAAAATTGTCGGTAACAATGTTCA > SRR4302533.2958436/1‑94 (MQ=60)
CTTACGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCAACGCCGCGTCGGTCAATATCAAAATTGTCGGTAACAATGTTCA > SRR4302533.2802905/1‑94 (MQ=60)
CGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCAACGCCGCGTCGGTCAATATCAAAATTGTCGGTAACAATGTTCATCCG > SRR4302533.1783958/1‑94 (MQ=60)
CGCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCAACGCCGCGTCGGTCAATATCAAAATTGTCGGTAACAATGTTCATCCG > SRR4302533.5248468/1‑94 (MQ=60)
GCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCAACGCCGCGTCGGTCACTATCAAAATTGTCGGTAACAATCTTCATCCGG > SRR4302533.4938452/1‑94 (MQ=60)
GCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCAACGCCGCGTCGGTCAATATCAAAATTGTCGGTAACAATGTTCATCCGG < SRR4302533.5163863/94‑1 (MQ=60)
GCTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCAACGCCGCGTCGGTCAATATCAAAATTGTCGGTAACAATGTTCATCCGG < SRR4302533.5132453/94‑1 (MQ=60)
|
GGTGATATTCGCGTCGCCTTTACCCCGGATGAAGAAGTGGGCAAAGGGGCGAAACATTTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACACTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCAACGCCGCGTCGGTCAATATCAAAATTGTCGGTAACAATGTTCATCCGG > NC_000913/1185553‑1185739
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 7 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
