Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1624 |
250.6 |
12620048 |
98.0% |
12367647 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,216,420 |
A→G |
intergenic (+201/‑89) |
ymgC → / → b1168 |
hypothetical protein/putative proteases |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,216,420 | 0 | A | G | 100.0%
| 862.9
/ NA
| 262 | intergenic (+201/‑89) | ymgC/b1168 | hypothetical protein/putative proteases |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (143/119); total (143/119) |
Only 100 of 264 total aligned reads displayed.
ATGGAGAGTTCTCGCTCTCCATTCTTGACGCCTGATATCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTAGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTATGCTCTCTACCATGCTCTCTGTAGATGCCAGCGCGAGCGAATGAA > NC_000913/1216330‑1216509
|
aTGGAGAGTTCTCGCTCTCCATTCTTGACGCCTGATATCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGa < 2:6294813/93‑1 (MQ=255)
gagTTCTCGCTCTCCATTCTTGACGCCTGATATCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAg < 2:196886/93‑1 (MQ=255)
agTTCTCGCTCTCCATTCTTGACGCTTGATATCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGa < 2:1630287/93‑1 (MQ=255)
agTTCTCGCTCTCCATTCTTGACGCCTGATATCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGa < 1:3026781/93‑1 (MQ=255)
agTTCTCCCTCTCCATTCTTGACGCCTGATATCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGa < 1:3645271/93‑1 (MQ=255)
tctcGCTCTCCATTCTTGACGCCTGATATCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATgg > 1:5723623/1‑93 (MQ=255)
ctcGCTCTCCATTCTTGACGCCTGATATCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGga > 2:4482477/1‑93 (MQ=255)
ctcGCTCTCCATTCTTGACGCCTGATATCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGga > 2:2869720/1‑93 (MQ=255)
gCTCTCCATTCTTGACGCCTGATATCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGaa > 2:2632989/1‑93 (MQ=255)
gCTCTCCATTCTTGACGCCTGATATCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGaa < 2:3081541/93‑1 (MQ=255)
ctctCCATTCTTGACGCCTGATATCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGaaa > 1:60888/1‑93 (MQ=255)
ctctCCATTCTTGACGCCTGATATCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGaaa > 1:5492/1‑93 (MQ=255)
tctcCATTCTTGACGCCTGATATCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGaaaa > 2:2374670/1‑93 (MQ=255)
tctcCATTCTTGACGCCTGATATCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGaaaa > 2:6031344/1‑93 (MQ=255)
tctcCATTCTTGACGCCTGATATCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGaaaa > 1:1443098/1‑93 (MQ=255)
tctcCATTCTTGACGCCTGATATCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGaaaa > 1:3337714/1‑93 (MQ=255)
ctcCATTCTTGACGCCTGATATCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAAt > 1:1484346/1‑93 (MQ=255)
tcCATTCTTGACGCCTGATATCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAAtt > 2:3002676/1‑93 (MQ=255)
ccATTCTTGACGCCTGATATCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAAttt < 2:3140671/93‑1 (MQ=255)
ccATTCTTGACGCCTGATATCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAAttt > 1:563985/1‑93 (MQ=255)
ttCTTGACGCCTGATATCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTAt < 2:840291/93‑1 (MQ=255)
tCTTGACGCCTGATATCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATc > 2:20719/1‑93 (MQ=255)
cTTGACGCCTGATATCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCt > 1:2326378/1‑93 (MQ=255)
cTTGACGCCTGATATCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCt < 1:4811955/93‑1 (MQ=255)
ttGACGCCTGATATCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCtt > 2:154852/1‑93 (MQ=255)
ttGACGCCTGATATCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCtt < 2:4622267/93‑1 (MQ=255)
tGACGCCTGATATCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTc < 1:1224906/93‑1 (MQ=255)
gACGCCTGATATCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCg > 2:3778988/1‑93 (MQ=255)
aCGCCTGATATCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCgg > 1:2634373/1‑93 (MQ=255)
aCGCCTGATATCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCgg < 1:2645218/93‑1 (MQ=255)
gCCTGATATCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCg > 1:1649066/1‑93 (MQ=255)
cggATACCCCGCCTAACTTATTGTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTg < 2:3270514/91‑1 (MQ=255)
tGATATCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTgg > 1:913888/1‑93 (MQ=255)
tGATATCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTgg < 1:1897806/93‑1 (MQ=255)
gATATCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGa < 2:1819856/93‑1 (MQ=255)
gATATCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGa > 1:5749741/1‑93 (MQ=255)
atatCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGat < 2:2402821/93‑1 (MQ=255)
atatCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGat < 1:3867694/93‑1 (MQ=255)
tatCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGata < 2:5790349/93‑1 (MQ=255)
atCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGACGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGatat < 2:5116804/93‑1 (MQ=255)
atCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGATGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGatat > 2:5348687/1‑93 (MQ=255)
tCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATAtt < 1:5222352/93‑1 (MQ=255)
tCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATAtt < 2:5698232/93‑1 (MQ=255)
tCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATAtt > 1:668412/1‑93 (MQ=255)
cccGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATAttt < 2:5941291/93‑1 (MQ=255)
ccGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTc < 2:2296537/93‑1 (MQ=255)
cGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCt < 1:4894471/93‑1 (MQ=255)
cGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCt < 1:5605165/93‑1 (MQ=255)
gCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCtt > 2:1932866/1‑93 (MQ=255)
ccTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTa < 2:5653415/93‑1 (MQ=255)
ccTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTa < 2:4839781/93‑1 (MQ=255)
cTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTAt > 2:5866283/1‑93 (MQ=255)
cTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTAt < 1:1992971/93‑1 (MQ=255)
tAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTATg > 1:2368891/1‑93 (MQ=255)
tAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTATg > 1:4627669/1‑93 (MQ=255)
tAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTATg > 2:642107/1‑93 (MQ=255)
tAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTATg > 1:4394708/1‑93 (MQ=255)
aaCTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTATGc > 2:1316060/1‑93 (MQ=255)
ttATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTATGctct > 2:428551/1‑93 (MQ=255)
aTTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAACTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTATGctctct < 2:3879698/93‑1 (MQ=255)
ttttGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTATGCTCTCTa < 1:468272/93‑1 (MQ=255)
aCTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTATGCTCTCTACCATGc < 2:2011860/93‑1 (MQ=255)
tGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTATGCTCTCTACCATGctc > 2:5481030/1‑93 (MQ=255)
gCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTATGCTCTCTACCATGctct < 1:3012791/93‑1 (MQ=255)
gCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTATGCTCTCTACCATGctct > 2:4156948/1‑93 (MQ=255)
gCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTATGCTCTCTACCATGctct > 2:2921473/1‑93 (MQ=255)
cTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTATGCTCTCTACCATGctctct > 2:1701584/1‑93 (MQ=255)
tACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTATGCTCTCTACCATGCTCTCTg > 2:4766781/1‑93 (MQ=255)
tACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTATGCTCTCTACCATGCTCTCTg > 2:2470531/1‑93 (MQ=255)
tACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTATGCTCTCTACCATGCTCTCTg < 1:354332/93‑1 (MQ=255)
aTTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTATGCTCTCTACCATGCTCTCTGTAg > 1:2593316/1‑93 (MQ=255)
aTTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTATGCTCTCTACCATGCTCTCTGTAg > 2:2170055/1‑93 (MQ=255)
aTTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTATGCTCTCTACCATGCTCTCTGTAg > 1:855529/1‑93 (MQ=255)
ttATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTATGCTCTCTACCATGCTCTCTGTAGa > 1:4925500/1‑93 (MQ=255)
ttATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTATGCTCTCTACCATGCTCTCTGTAGa < 2:2692448/93‑1 (MQ=255)
ttATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTATGCTCTCTACCATGCTCTCTGTAGa < 1:4986375/93‑1 (MQ=255)
ttATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTATGCTCTCTACCATGCTCTCTGTAGa > 2:4227001/1‑93 (MQ=255)
ttATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTATGCTCTCTACCATGCTCTCTGTAGa < 2:148535/93‑1 (MQ=255)
tATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTATGCTCTCTACCATGCTCTCTGTAGAt > 1:4091858/1‑93 (MQ=255)
cTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTATGCTCTCTACCATGCTCTCTGTAGATGCCa > 1:3715655/1‑93 (MQ=255)
tCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTATGCTCTCTACCATGCTCTCTGTAGATGCCAg < 1:2468568/93‑1 (MQ=255)
aataatTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTATGCTCTCTACCATGCTCTCTGTAGATGCCAgcg > 2:6198674/1‑93 (MQ=255)
ataatTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTATGCTCTCTACCATGCTCTCTGTAGATGCCAgcgc < 1:2276618/93‑1 (MQ=255)
ataatTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTATGCTCTCTACCATGCTCTCTGTAGATGCCAgcgc < 1:5349907/93‑1 (MQ=255)
ataatTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTATGCTCTCTACCATGCTCTCTGTAGATGCCAgcgc < 1:5986025/93‑1 (MQ=255)
ataatTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTATGCTCTCTACCATGCTCTCTGTAGATGCCAgcgc > 1:2898835/1‑93 (MQ=255)
taattaatGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTATGCTCTCTACCATGCTCTCTGTAGATGCCAGcgcg > 2:3532817/1‑93 (MQ=255)
aattaatGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTATGCTCTCTACCATGCTCTCTGTAGATGCCAGCgcga > 1:3121584/1‑93 (MQ=255)
ttaatGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTATGCTCTCTACCATGCTCTCTGTAGATGCCAGCgcgagc < 1:3786338/93‑1 (MQ=255)
ttaatGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTATGCTCTCTACCATGCTCTCTGTAGATGCCAGCgcgagc > 1:2707614/1‑93 (MQ=255)
ttaatGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTATGCTCTCTACCATGCTCTCTGTAGATGCCAGCgcgagc > 2:3637878/1‑93 (MQ=255)
atGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTATGCTCTCTACCATGCTCTCTGTAGATGCCAGCGCGAGCgaa < 2:3956436/93‑1 (MQ=255)
atGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTATGCTCTCTACCATGCTCTCTGTAGATGCCAGCGCGAGCgaa < 1:1058938/93‑1 (MQ=255)
tGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTATGCTCTCTACCATGCTCTCTGTAGATGCCAGCGCGAGCgaat < 2:5341030/93‑1 (MQ=255)
tGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTATGCTCTCTACCATGCTCTCTGTAGATGCCAGCGCGAGCgaat > 1:2094277/1‑93 (MQ=255)
gggTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTATGCTCTCTACCATGCTCTCTGTAGATGCCAGCGCGAGCgaatg < 1:4485603/93‑1 (MQ=255)
ggTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTATGCTCTCTACCATGCTCTCTGTAGATGCCAGCGCGAGCgaatga > 2:5431417/1‑93 (MQ=255)
gTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTATGCTCTCTACCATGCTCTCTGTAGATGCCAGCGCGAGCgaatgaa < 1:6127036/93‑1 (MQ=255)
gTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTATGCTCTCTACCATGCTCTCTGTAGATGCCAGCGCGAGCgaatgaa > 1:2805869/1‑93 (MQ=255)
gTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTATGCTCTCTACCATGCTCTCTGTAGATGCCAGCGCGAGCgaatgaa < 2:4401358/93‑1 (MQ=255)
|
ATGGAGAGTTCTCGCTCTCCATTCTTGACGCCTGATATCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTAGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTATGCTCTCTACCATGCTCTCTGTAGATGCCAGCGCGAGCGAATGAA > NC_000913/1216330‑1216509
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
AGAATGGAGAGTTCTCGCTCTCCATTCTTGACGCCTGATATCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTAGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTATGCTCTCTACCATGCTCTCTGTAGATGCCAGCGCGAGCGAATGAATGGC > NC_000913/1216327‑1216513
|
AGAATGGAGAGTTCTCGCTCTCCATTCTTGACGCCTGATATCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTG < SRR4302533.1866404/94‑1 (MQ=60)
GAATGGAGAGTTCTCGCTCTCCATTCTTGACGCCTGATATCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGG < SRR4302533.5054202/94‑1 (MQ=60)
ATGGAGAGTTCTCGCTCTCCATTCTTGACGCCTGATATCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGAT > SRR4302533.5222191/1‑94 (MQ=60)
TGGAGAGTTCTCGCTCTCCATTCTTGACGCCTGATATCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATC < SRR4302533.4216487/94‑1 (MQ=60)
GGAGAGTTCTCGCTCTCCATTCTTGACGCCTGATATCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCA > SRR4302533.2365749/1‑94 (MQ=60)
GAGAGTTCTCGCTCTCCATTCTTGACGCCTGATATCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAA > SRR4302533.4936264/1‑94 (MQ=60)
AGAGTTCTCGCTCTCCATTCTTGACGCCTGATATCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAG > SRR4302533.2708949/1‑94 (MQ=60)
AGTTCTCGCTCTCCATTCTTGACGCCTGATATCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGAT < SRR4302533.3045305/94‑1 (MQ=60)
AGTTCTCGCTCTCCATTCTTGACGCCTGATATCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGAT < SRR4302533.3007660/94‑1 (MQ=60)
AGTTCTCCCTCTCCATTCTTGACGCCTGATATCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGAT < SRR4302533.3667683/94‑1 (MQ=60)
TTCTCGCTCTCCATTCTTGACGCCTGATATCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGG > SRR4302533.2617237/1‑94 (MQ=60)
TTCTCGCTCTCCATTCTTGACGCCTGATATCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGG > SRR4302533.5758179/1‑94 (MQ=60)
TCTCCCTCTCCATTCTTGACGCCTGATATCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCGCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGA < SRR4302533.2773288/94‑1 (MQ=60)
CTCGCTCTCCATTCTTGACGCCTGATATCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAG > SRR4302533.2402301/1‑94 (MQ=60)
GCTCTCCATTCTTGACGCCTGATATCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAA > SRR4302533.5542/1‑94 (MQ=60)
GCTCTCCATTCTTGACGCCTGATATCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAA < SRR4302533.497369/94‑1 (MQ=60)
GCTCTCCATTCTTGACGCCTGATATCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAA > SRR4302533.61287/1‑94 (MQ=60)
GCTCTCCATTCTTGACGCCTGATATCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGACAAA > SRR4302533.1100900/1‑94 (MQ=60)
CTCTCCATTCTTGACGCCTGATATCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAA > SRR4302533.3358342/1‑94 (MQ=60)
CTCTCCATTCTTGACGCCTGATATCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAA > SRR4302533.1451804/1‑94 (MQ=60)
TCTCCATTCTTGACGCCTGATATCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAAT > SRR4302533.1493305/1‑94 (MQ=60)
TCCATTCTTGACGCCTGATATCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTT > SRR4302533.567325/1‑94 (MQ=60)
TCCATTCTTGACGCCTGATATCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTT > SRR4302533.567326/1‑94 (MQ=60)
CCATTCTTGACGCCTGATATCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTT > SRR4302533.263327/1‑94 (MQ=60)
CATTCTTGACGCCTGATATCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTA < SRR4302533.1470020/94‑1 (MQ=60)
ATTCTTGACGCCTGATATCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTAT < SRR4302533.5602324/94‑1 (MQ=60)
ATTCTTGACGCCTGATATCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTAT > SRR4302533.355983/1‑94 (MQ=60)
ATTCTTGACGCCTGATATCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTAT > SRR4302533.467838/1‑94 (MQ=60)
TTCTTGACGCCTGATATCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATC > SRR4302533.2651245/1‑94 (MQ=60)
TCTTGACGCCTGATATCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCT < SRR4302533.2487743/94‑1 (MQ=60)
TCTTGACGCCTGATATCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCT > SRR4302533.2340780/1‑94 (MQ=60)
CTTGACGCCTGATATCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTT < SRR4302533.3449254/94‑1 (MQ=60)
CTTGACGCCTGATATCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTT < SRR4302533.4841120/94‑1 (MQ=60)
TTCACGCCTGATATCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTC < SRR4302533.1919475/94‑1 (MQ=60)
TGACGCCTGATATCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCG > SRR4302533.2095864/1‑94 (MQ=60)
TGACGCCTGATATCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCG < SRR4302533.3043957/94‑1 (MQ=60)
TGACGCCTGATATCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCG < SRR4302533.4742246/94‑1 (MQ=60)
TGACGCCTGATATCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCG < SRR4302533.1232247/94‑1 (MQ=60)
TGACGCCTGATATCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCG < SRR4302533.3620611/94‑1 (MQ=60)
TGACGCCTGATATCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCG > SRR4302533.4880831/1‑94 (MQ=60)
GACGCCTGATATCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGG > SRR4302533.2650562/1‑94 (MQ=60)
GACGCCTGATATCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGG < SRR4302533.2371447/94‑1 (MQ=60)
GACGCCTGATATCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGG > SRR4302533.503737/1‑94 (MQ=60)
ACGCCTGATATCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGC > SRR4302533.4030024/1‑94 (MQ=60)
ACGCCTGATATCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGC > SRR4302533.242091/1‑94 (MQ=60)
ACGCCTGATATCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGC > SRR4302533.867109/1‑94 (MQ=60)
ACGCCTGATATCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGC < SRR4302533.2661874/94‑1 (MQ=60)
ACGCCTGATATCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGC < SRR4302533.2661473/94‑1 (MQ=60)
CGCCTGATATCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCG > SRR4302533.611212/1‑94 (MQ=60)
CGCCTGATATCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCG > SRR4302533.1659058/1‑94 (MQ=60)
GCCTGATATCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGT > SRR4302533.2962803/1‑94 (MQ=60)
GCCTGATATCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGT > SRR4302533.4650404/1‑94 (MQ=60)
GCCTGATATCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGT > SRR4302533.703056/1‑94 (MQ=60)
CCTGATATCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTG > SRR4302533.819033/1‑94 (MQ=60)
CTGATATCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGG > SRR4302533.4455509/1‑94 (MQ=60)
CTGATATCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGG > SRR4302533.4975786/1‑94 (MQ=60)
CTGATATCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGG > SRR4302533.919260/1‑94 (MQ=60)
TGATATCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGA > SRR4302533.5784428/1‑94 (MQ=60)
TGATATCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGA < SRR4302533.1909394/94‑1 (MQ=60)
TGATATCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATCAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGA < SRR4302533.5402860/94‑1 (MQ=60)
ATATCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATA < SRR4302533.3891304/94‑1 (MQ=60)
TATCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTTGATAT < SRR4302533.5724026/94‑1 (MQ=60)
TATCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATAT < SRR4302533.6071652/94‑1 (MQ=60)
ATCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATT > SRR4302533.2725271/1‑94 (MQ=60)
ATCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATT > SRR4302533.672362/1‑94 (MQ=60)
TCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCATGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTT < SRR4302533.6180698/94‑1 (MQ=60)
TCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTT < SRR4302533.5253774/94‑1 (MQ=60)
CCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTC < SRR4302533.2180779/94‑1 (MQ=60)
CCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCT > SRR4302533.174508/1‑94 (MQ=60)
CGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTT < SRR4302533.1639082/94‑1 (MQ=60)
CGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTT < SRR4302533.5639034/94‑1 (MQ=60)
CGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTT < SRR4302533.4924134/94‑1 (MQ=60)
CCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTAT > SRR4302533.5736673/1‑94 (MQ=60)
CTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTATG > SRR4302533.4655716/1‑94 (MQ=60)
CTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTATG < SRR4302533.4803976/94‑1 (MQ=60)
CTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTATG > SRR4302533.4421242/1‑94 (MQ=60)
CTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTATG > SRR4302533.2383549/1‑94 (MQ=60)
CTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTATG > SRR4302533.3088092/1‑94 (MQ=60)
CTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTATG < SRR4302533.2005193/94‑1 (MQ=60)
CTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTATGCTCT < SRR4302533.232098/94‑1 (MQ=60)
TTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTATGCTCTCTAC < SRR4302533.471068/94‑1 (MQ=60)
TTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTATGCTCTCTACCA < SRR4302533.484106/94‑1 (MQ=60)
TTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTATGCTCTCTACCA > SRR4302533.1557779/1‑94 (MQ=60)
CTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTATGCTCTCTACCATGCTC > SRR4302533.6235720/1‑94 (MQ=60)
TGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTATGCTCTCTACCATGCTCT > SRR4302533.2055857/1‑94 (MQ=60)
GCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTATGCTCTCTACCATGCTCTC < SRR4302533.3031222/94‑1 (MQ=60)
CTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTATGCTCTCTACCATGCTCTCTG > SRR4302533.3230236/1‑94 (MQ=60)
CTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTATGCTCTCTACCATGCTCTCTG > SRR4302533.1274361/1‑94 (MQ=60)
CTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTATGCTCTCTACCATGCTCTCTG > SRR4302533.5472002/1‑94 (MQ=60)
CTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTATGCTCTCTACCATGCTCTCTG > SRR4302533.1446710/1‑94 (MQ=60)
TACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTATGCTCTCTACCATGCTCTCTGT < SRR4302533.356492/94‑1 (MQ=60)
ACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTATGCTCTCTACCATGCTCTCTGTA > SRR4302533.3798407/1‑94 (MQ=60)
CATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTATGCTCTCTACCATGCTCTCTGTAG > SRR4302533.2609251/1‑94 (MQ=60)
CATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTATGCTCTCTACCATGCTCTCTGTAG > SRR4302533.5826463/1‑94 (MQ=60)
CATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTATGCTCTCTACCATGCTCTCTGTAG > SRR4302533.860543/1‑94 (MQ=60)
ATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTATGCTCTCTACCATGCTCTCTGTAGA > SRR4302533.4955331/1‑94 (MQ=60)
ATTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTATGCTCTCTACCATGCTCTCTGTAGA > SRR4302533.5660369/1‑94 (MQ=60)
TTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTATGCTCTCTACCATGCTCTCTGTAGAT > SRR4302533.4116763/1‑94 (MQ=60)
TTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTATGCTCTCTACCATGCTCTCTGTAGAT < SRR4302533.5016609/94‑1 (MQ=60)
TTATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTATGCTCTCTACCATGCTCTCTGTAGAT < SRR4302533.3921858/94‑1 (MQ=60)
TATGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTATGCTCTCTACCATGCTCTCTGTAGATG < SRR4302533.189140/94‑1 (MQ=60)
TGCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTATGCTCTCTACCATGCTCTCTGTAGATGCC < SRR4302533.2247064/94‑1 (MQ=60)
GCTCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTATGCTCTCTACCATGCTCTCTGTAGATGCCA > SRR4302533.3738466/1‑94 (MQ=60)
TCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTATGCTCTCTACCATGCTCTCTGTAGATGCCAGC < SRR4302533.4451239/94‑1 (MQ=60)
TCAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTATGCTCTCTACCATGCTCTCTGTAGATGCCAGC < SRR4302533.2483794/94‑1 (MQ=60)
CAATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTATGCTCTCTACCATGCTCTCTGTAGATGCCAGCG < SRR4302533.3825382/94‑1 (MQ=60)
AATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTATGCTCTCTACCATGCTCTCTGTAGATGCCAGCGC > SRR4302533.2916649/1‑94 (MQ=60)
AATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTATGCTCTCTACCATGCTCTCTGTAGATGCCAGCGC < SRR4302533.2889069/94‑1 (MQ=60)
ATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTATGCTCTCTACCATGCTCTCTGTAGATGCCAGCGCG < SRR4302533.6022276/94‑1 (MQ=60)
ATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTATGCTCTCTACCATGCTCTCTGTAGATGCCAGCGCG < SRR4302533.5382007/94‑1 (MQ=60)
ATAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTATGCTCTCTACCATGCTCTCTGTAGATGCCAGCGCG < SRR4302533.2290716/94‑1 (MQ=60)
TAATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTATGCTCTCTACCATGCTCTCTGTAGATGCCAGCGCGA > SRR4302533.3140777/1‑94 (MQ=60)
AATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTATGCTCTCTACCATGCTCTCTGTAGATGCCAGCGCGAG > SRR4302533.3724781/1‑94 (MQ=60)
ATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTATGCTCTCTACCATGCTCTCTGTAGATGCCAGCGCGAGC > SRR4302533.6142785/1‑94 (MQ=60)
ATTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTATGCTCTCTACCATGCTCTCTGTAGATGCCAGCGCGAGC > SRR4302533.2724224/1‑94 (MQ=60)
TTAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTATGCTCTCTACCATGCTCTCTGTAGATGCCAGCGCGAGCG < SRR4302533.3809521/94‑1 (MQ=60)
TAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTATGCTCTCTACCATGCTCTCTGTAGATGCCAGCGCGAGCGA > SRR4302533.3143362/1‑94 (MQ=60)
TAATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTATGCTCTCTACCATGCTCTCTGTAGATGCCAGCGCGAGCGA > SRR4302533.5833755/1‑94 (MQ=60)
AATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTATGCTCTCTACCATGCTCTCTGTAGATGCCAGCGCGAGCGAA > SRR4302533.5373330/1‑94 (MQ=60)
AATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTATGCTCTCTACCATGCTCTCTGTAGATGCCAGCGCGAGCGAA > SRR4302533.4573078/1‑94 (MQ=60)
AATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTATGCTCTCTACCATGCTCTCTGTAGATGCCAGCGCGAGCGAA < SRR4302533.3684928/94‑1 (MQ=60)
ATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTATGCTCTCTACCATGCTCTCTGTAGATGCCAGCGCGAGCGAAT > SRR4302533.2107174/1‑94 (MQ=60)
ATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTATGCTCTCTACCATGCTCTCTGTAGATGCCAGCGCGAGCGAAT < SRR4302533.3045100/94‑1 (MQ=60)
ATGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTATGCTCTCTACCATGCTCTCTGTAGATGCCAGCGCGAGCGAAT < SRR4302533.1065164/94‑1 (MQ=60)
TGGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTATGCTCTCTACCATGCTCTCTGTAGATGCCAGCGCGAGCGAATG < SRR4302533.5773060/94‑1 (MQ=60)
GGGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTATGCTCTCTACCATGCTCTCTGTAGATGCCAGCGCGAGCGAATGA < SRR4302533.4512760/94‑1 (MQ=60)
GGTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTATGCTCTCTACCATGCTCTCTGTAGATGCCAGCGCGAGCGAATGAA > SRR4302533.2823137/1‑94 (MQ=60)
GTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTATGCTCTCTACCATGCTCTCTGTAGATGCCAGCGCGAGCGAATGAAT < SRR4302533.6163964/94‑1 (MQ=60)
GTTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTATGCTCTCTACCATGCTCTCTGTAGATGCCAGCGCGAGCGAATGAAT < SRR4302533.3754490/94‑1 (MQ=60)
TTGGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTATGCTCTCTACCATGCTCTCTGTAGATGCCAGCGCGAGCGAATGAATG < SRR4302533.3608531/94‑1 (MQ=60)
GGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTATGCTCTCTACCATGCTCTCTGTAGATGCCAGCGCGAGCGAATGAATGGC > SRR4302533.5671124/1‑94 (MQ=60)
GGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTATGCTCTCTACCATGCTCTCTGTAGATGCCAGCGCGAGCGAATGAATGGC > SRR4302533.70035/1‑94 (MQ=60)
|
AGAATGGAGAGTTCTCGCTCTCCATTCTTGACGCCTGATATCCCGCCTAACTTATTTTGTACTGCCTACATTATGCTCAATAATTAATGGGTTAGATCAAGATGGAGAAAATTTTATCTTCGGCGTGGATATTTCTTATGCTCTCTACCATGCTCTCTGTAGATGCCAGCGCGAGCGAATGAATGGC > NC_000913/1216327‑1216513
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
