Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1624 |
250.6 |
12620048 |
98.0% |
12367647 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,385,769 |
T→C |
N342N (AAT→AAC) |
tyrR → |
TyrR |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,385,769 | 0 | T | C | 99.5%
| 705.9
/ ‑4.7
| 218 | N342N (AAT→AAC) | tyrR | TyrR |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/0); new base C (104/113); total (105/113) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.82e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.03e-01 |
Only 100 of 223 total aligned reads displayed.
GCGTTTCCTTAATGATGGCACTTTCCGTCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAATCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGATCTCTATTATCGTCTGAACGTGTTGACGCTCAATCTGCCGCCGCTACGTGA > NC_000913/1385679‑1385858
|
gCGTTTCCTTAATGATGGCACTTTCCGTCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCt < 2:4466922/93‑1 (MQ=255)
gCGTTTCCTTAATGATGGCACTTTCCGTCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCt > 2:3372776/1‑93 (MQ=255)
cGTTTCCTTAATGATGGCACTTTCCGTCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTg < 2:1776281/93‑1 (MQ=255)
gTTTCCTTAATGATGGCACTTTCCGTCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTgg > 2:2828900/1‑93 (MQ=255)
tttCCTTAATGATGGCACTTTCCGTCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAATCTggc > 1:4762858/1‑92 (MQ=255)
ttCCTTAATGATGGCACTTTCCGTCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTc < 2:3745295/93‑1 (MQ=255)
cTTAATGATGGCACTTTCCGTCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGaa > 1:6046186/1‑93 (MQ=255)
ttAATGATGGCACTTTCCGTCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAAc > 1:2016142/1‑93 (MQ=255)
ttAATGATGGCACTTTCCGTCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAAc < 1:5004742/93‑1 (MQ=255)
ttAATGATGGCACTTTCCGTCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAAc > 2:1910794/1‑93 (MQ=255)
ttAATGATGGCACTTTCCGTCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAAc > 1:1333995/1‑93 (MQ=255)
tAATGATGGCACTTTCCGTCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACt < 1:5026946/93‑1 (MQ=255)
tAATGATGGCACTTTCCGTCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACt > 2:601443/1‑93 (MQ=255)
tAATGATGGCACTTTCCGTCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACt < 2:537304/93‑1 (MQ=255)
tAATGATGGCACTTTCCGTCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACt > 2:5309469/1‑93 (MQ=255)
tAATGATGGCACTTTCCGTCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACt > 2:4847032/1‑93 (MQ=255)
aaTGATGGCACTTTCCGTCGGGTTGGCGAAGACCCTGAGGTGCATGTCGCTGTGCGGGGGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTg > 2:878497/1‑93 (MQ=255)
aaTGATGGCACTTTCCGTCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTg < 2:5810910/93‑1 (MQ=255)
atgatgGCACTTTCCGTCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTgg < 2:4874965/93‑1 (MQ=255)
atgatgGCACTTTCCGTCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTgg < 2:5678716/93‑1 (MQ=255)
atgatgGCACTTTCCGTCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTgg < 1:2480277/93‑1 (MQ=255)
atgatgGCACTTTCCGTCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTgg < 1:466194/93‑1 (MQ=255)
atgatgGCACTTTCCGTCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTgg < 2:5488509/93‑1 (MQ=255)
tgatgGCACTTTCCGTCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGt < 2:4501274/93‑1 (MQ=255)
gatgGCACTTTCCGTCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTg > 2:3243534/1‑93 (MQ=255)
tgGCACTTTCCGTCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCa > 1:5741007/1‑93 (MQ=255)
ggCACTTTCCGTCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCaa > 1:4072124/1‑93 (MQ=255)
cACTTTCCGTCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCaaaa < 2:313299/93‑1 (MQ=255)
aCTTTCCGTCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCaaaag < 2:273125/93‑2 (MQ=255)
cTTTCCGTCGGGTTGGCTAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTAATTTGCGCTACGCAGAAGCACGTCGTCGAACTGGGGCAAAAAg < 2:823147/93‑1 (MQ=255)
cTTTCCGTCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAg > 1:2215862/1‑93 (MQ=255)
cTTTCCGTCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAg > 2:2166882/1‑93 (MQ=255)
tttCCGTCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAgg > 2:3460314/1‑93 (MQ=255)
tgtCCGTCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGACTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAgg < 1:4430604/91‑1 (MQ=255)
ttCCGTCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGc < 2:290087/93‑1 (MQ=255)
tCCGTCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCa < 1:2361686/93‑1 (MQ=255)
tCCGTCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCa < 1:3907687/93‑1 (MQ=255)
tCCGTCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCa < 1:138531/93‑1 (MQ=255)
tCCGTCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCa < 2:5068558/93‑1 (MQ=255)
tcGTCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCAt < 2:5167417/92‑1 (MQ=255)
ccGTCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCAt > 1:1207954/1‑93 (MQ=255)
ccGTCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCAt < 1:3685084/93‑1 (MQ=255)
cGTCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATg > 1:2879902/1‑93 (MQ=255)
gTCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGt > 1:5995812/1‑93 (MQ=255)
tCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGtt > 1:4690389/1‑93 (MQ=255)
tCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGtt > 1:3855357/1‑93 (MQ=255)
tCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGtt < 1:2367890/93‑1 (MQ=255)
gggTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTcc > 1:1680296/1‑93 (MQ=255)
gggTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTcc > 2:373858/1‑93 (MQ=255)
gggTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTcc < 2:2452494/93‑1 (MQ=255)
gggTTGACGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTcc < 1:864451/93‑1 (MQ=255)
ggTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCg < 2:5452967/93‑1 (MQ=255)
gTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGt < 2:5912322/93‑1 (MQ=255)
tGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGa < 2:4746963/93‑1 (MQ=255)
gCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAg < 2:2100803/93‑1 (MQ=255)
gCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAg < 2:3654952/93‑1 (MQ=255)
cGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGa < 2:4005687/93‑1 (MQ=255)
aaGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGAtc > 1:4889616/1‑93 (MQ=255)
aGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGAtct > 2:5601215/1‑93 (MQ=255)
aGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGAtct > 2:3051177/1‑93 (MQ=255)
gACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGAtctc < 1:110543/93‑1 (MQ=255)
gACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGAtctc > 2:4411809/1‑93 (MQ=255)
gACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGAtctc > 1:3211557/1‑93 (MQ=255)
ccATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGATCTCta < 1:3994549/93‑1 (MQ=255)
ccATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGATCTCta < 1:3953647/93‑1 (MQ=255)
cATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGATCTCtat < 2:1160482/93‑1 (MQ=255)
cATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGATCTCtat > 2:163029/1‑93 (MQ=255)
gAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGATCTCtattat > 1:4202209/1‑93 (MQ=255)
aGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGATCTCTATTATc > 2:172698/1‑93 (MQ=255)
aGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGATCTCTATTATc < 2:5236872/93‑1 (MQ=255)
ggTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGATCTCTATTATCg > 1:5985974/1‑93 (MQ=255)
gTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGATCTCTATTATCGt < 1:1815696/93‑1 (MQ=255)
tGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGATCTCTATTATCGTc < 1:5087508/93‑1 (MQ=255)
tGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGATCTCTATTATCGTc > 1:5814763/1‑93 (MQ=255)
tGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGATCTCTATTATCGTc < 2:12748/93‑1 (MQ=255)
cATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGATCTCTATTATCGTCTg < 1:4750976/93‑1 (MQ=255)
aTGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGATCTCTATTATCGTCTGa < 1:4349471/93‑1 (MQ=255)
tGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGATCTCTATTATCGTCTGaa < 1:6153744/93‑1 (MQ=255)
gTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGATCTCTATTATCGTCTGAAc > 2:4062980/1‑93 (MQ=255)
gTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGATCTCTATTATCGTCTGAAc < 1:3139056/93‑1 (MQ=255)
gTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGATCTCTATTATCCTCTGAAc > 1:1669802/1‑93 (MQ=255)
cGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGATCTCTATTATCGTCTGAACgt < 1:3458044/93‑1 (MQ=255)
gATGTGCGTGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGATCTCTATTATCGTCTGAACgtg < 1:5625796/93‑1 (MQ=255)
gATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGATCTCTATTATCGTCTGAACgtg > 1:762632/1‑93 (MQ=255)
tgtgCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGATCTCTATTATCGTCTGAACGTGtt > 2:4952173/1‑93 (MQ=255)
tgCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGATCTCTATTATCGTCTGACCGTGTTGa < 1:515221/93‑1 (MQ=255)
gCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGATCTCTATTATCGTCTGAACGTGTTGAc < 2:6284470/93‑1 (MQ=255)
gggTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGATCTCTATTATCGTCTGAACGTGTTGACGc > 2:77068/1‑93 (MQ=255)
gTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGATCTCTATTATCGTCTGAACGTGTTGACGCTc > 1:4587496/1‑93 (MQ=255)
tGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGATCTCTATTATCGTCTGAACGTGTTGACGCTCa < 1:3028365/93‑1 (MQ=255)
gATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGATCTCTATTATCGTCTGAACGGGTTGACGCTCaa < 1:2393129/93‑1 (MQ=255)
tttGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGATCTCTATTATCGTCTGCACGTGTTGACGCTCAATc > 1:5429660/1‑93 (MQ=255)
tttGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGATCTCTATTATCGTCTGAACGTGTTGACGCTCAATc > 1:1250480/1‑93 (MQ=255)
gcgcTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGATCTCTATTATCGTCTGAACGTGTTGACGCTCAATCTgc < 1:5199310/93‑1 (MQ=255)
cTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGATCTCTATTATCGTCTGAACGTGTTGACGCTCAATCTgccgc < 1:4920923/93‑1 (MQ=255)
tACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGATCTCTATTATCGTCTGAACGTGTTGACGCTCAATCTgccgcc > 2:2236417/1‑93 (MQ=255)
cGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGATCTCTATTATCGTCTGAACGTGTTGACGCTCAATCTGCcgccgc < 2:4825982/93‑1 (MQ=255)
cAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGATCTCTATTATCGTCTGAACGTGTTGACGCTCAATCTGCCGCCGCTa > 2:5511524/1‑93 (MQ=255)
aagaaCCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGATCTCTATTATCGTCTGAACGTGTTGACGCTCAATCTGCCGCCGCTACGt > 1:73202/1‑93 (MQ=255)
aagaaCCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGATCTCTATTATCGTCTGAACGTGTTGACGCTCAATCTGCCGCCGCTACGt < 2:5532511/93‑1 (MQ=255)
|
GCGTTTCCTTAATGATGGCACTTTCCGTCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAATCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGATCTCTATTATCGTCTGAACGTGTTGACGCTCAATCTGCCGCCGCTACGTGA > NC_000913/1385679‑1385858
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
ACTGCGTTTCCTTAATGATGGCACTTTCCGTCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAATCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGATCTCTATTATCGTCTGAACGTGTTGACGCTCAATCTGCCGCCGCTACGTGACTGT > NC_000913/1385676‑1385862
|
ACTGCGTTTCCTTAATGATGGCACTTTCCGTCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAAC > SRR4302533.254626/1‑94 (MQ=60)
ACTGCGTTTCCTTAATGATGGCACTTTCCGTCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAAC > SRR4302533.4641561/1‑94 (MQ=60)
ACTGCGTTTCCTTAATGATGGCACTTTCCGTCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAAC < SRR4302533.2577126/94‑1 (MQ=60)
ACTGCGTTTCCTTAATGATGGCACTTTCCGTCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAAC < SRR4302533.1342489/94‑1 (MQ=60)
CTGCGTTTCCTTAATGATGGCACTTTCCGTCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACC < SRR4302533.5736657/94‑1 (MQ=60)
CTGCGTTTCCTTAATGATGGCACTTTCCGTCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACC > SRR4302533.3325205/1‑94 (MQ=60)
GCGTTTCCTTAATGATGGCACTTTCCGTCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTG > SRR4302533.5617010/1‑94 (MQ=60)
CGTTTCCTTAATGATGGCACTTTCCGTCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGG < SRR4302533.2949776/94‑1 (MQ=60)
CGTTTCCTTAATGATGGCACTTTCCGTCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGG < SRR4302533.5056947/94‑1 (MQ=60)
GTTTCCTTAATGATGGCACTTTCCGTCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAATCTGGC > SRR4302533.4791743/1‑94 (MQ=60)
GTTTCCTTAATGATGGCACTTTCCGTCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGT < SRR4302533.3900074/94‑1 (MQ=60)
CCTTAATGATGGCACTTTCCGTCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAA > SRR4302533.6082816/1‑94 (MQ=60)
CTTAATGATGGCACTTTCCGTCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAAC > SRR4302533.1342001/1‑94 (MQ=60)
CTTAATGATGGCACTTTCCGTCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAAC > SRR4302533.2028563/1‑94 (MQ=60)
TTAATGATGGCACTTTCCGTCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACT > SRR4302533.3058866/1‑94 (MQ=60)
TTAATGATGGCACTTTCCGTCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACT < SRR4302533.1823863/94‑1 (MQ=60)
TTAATGATGGCACTTTCCGTCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACT < SRR4302533.5035073/94‑1 (MQ=60)
TAATGATGGCACTTTCCGTCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTG < SRR4302533.5057386/94‑1 (MQ=60)
AATGATGGCACTTTCCGTCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGG < SRR4302533.602900/94‑1 (MQ=60)
ATGATGGCACTTTCCGTCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGT < SRR4302533.468980/94‑1 (MQ=60)
ATGATGGCACTTTCCGTCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGT < SRR4302533.2495571/94‑1 (MQ=60)
TGATGGCACTTTCCGTCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTG > SRR4302533.4759934/1‑94 (MQ=60)
TGATGGCACTTTCCGTCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTG < SRR4302533.4403268/94‑1 (MQ=60)
TGATGGCACTTTCCGTCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTG > SRR4302533.224595/1‑94 (MQ=60)
ATGGCACTTTCCGTCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCA > SRR4302533.5775650/1‑94 (MQ=60)
TGGCACTTTCCGTCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAA > SRR4302533.3934712/1‑94 (MQ=60)
TGGCACTTTCCGTCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAA < SRR4302533.807076/94‑1 (MQ=60)
TGGCACTTTCCGTCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAA > SRR4302533.4096914/1‑94 (MQ=60)
GCACTTTCCGTCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAA < SRR4302533.1625718/94‑1 (MQ=60)
CACTTTCCGTCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAA > SRR4302533.2386265/1‑94 (MQ=60)
CACTTTCCGTCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAA > SRR4302533.5289099/1‑94 (MQ=60)
ACTTTCCGTCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAG < SRR4302533.2466018/94‑1 (MQ=60)
ACTTTCCGTCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAG > SRR4302533.2229542/1‑94 (MQ=60)
ACTTTCCGTCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAG < SRR4302533.197690/94‑1 (MQ=60)
CTTTCCGTCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGG < SRR4302533.1322049/94‑1 (MQ=60)
TTTCCGTCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGC < SRR4302533.3997058/94‑1 (MQ=60)
TGTCCGTCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGACTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGC < SRR4302533.4457388/94‑1 (MQ=60)
TCCGTCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCAT < SRR4302533.2376300/94‑1 (MQ=60)
TCCGTCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCAT < SRR4302533.1348731/94‑1 (MQ=60)
TCCGTCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCAT < SRR4302533.3931553/94‑1 (MQ=60)
TCCGTCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCAT < SRR4302533.139412/94‑1 (MQ=60)
TCCGTCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCAT > SRR4302533.1215207/1‑94 (MQ=60)
CCGTCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATG < SRR4302533.3707734/94‑1 (MQ=60)
CCGTCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATG > SRR4302533.2897619/1‑94 (MQ=60)
CGTCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGT > SRR4302533.6032126/1‑94 (MQ=60)
GTCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTT > SRR4302533.4718822/1‑94 (MQ=60)
GTCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTT > SRR4302533.738018/1‑94 (MQ=60)
GTCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTT > SRR4302533.3878899/1‑94 (MQ=60)
TCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTC < SRR4302533.6046319/94‑1 (MQ=60)
TCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTC > SRR4302533.3964993/1‑94 (MQ=60)
TCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTC < SRR4302533.2382541/94‑1 (MQ=60)
CGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCC > SRR4302533.1690475/1‑94 (MQ=60)
GGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCG > SRR4302533.2377216/1‑94 (MQ=60)
GGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCG > SRR4302533.4764542/1‑94 (MQ=60)
GGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCG < SRR4302533.3186523/94‑1 (MQ=60)
GGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCG > SRR4302533.4947390/1‑94 (MQ=60)
GGGTTGACGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCG < SRR4302533.869515/94‑1 (MQ=60)
GGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAG < SRR4302533.3603593/94‑1 (MQ=60)
GCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGA < SRR4302533.4968157/94‑1 (MQ=60)
GAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGATC > SRR4302533.4919245/1‑94 (MQ=60)
AGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGATCTC > SRR4302533.3231340/1‑94 (MQ=60)
AGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGATCTC < SRR4302533.887389/94‑1 (MQ=60)
GACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGATCTCT < SRR4302533.111244/94‑1 (MQ=60)
CCATTAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGATCTCTAT < SRR4302533.4782051/94‑1 (MQ=60)
CCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGATCTCTAT < SRR4302533.3977752/94‑1 (MQ=60)
CCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGATCTCTAT < SRR4302533.545130/94‑1 (MQ=60)
CCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGATCTCTAT > SRR4302533.5179308/1‑94 (MQ=60)
CCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGATCTCTAT < SRR4302533.4018870/94‑1 (MQ=60)
CATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGCTCTCTATT > SRR4302533.5731415/1‑94 (MQ=60)
CATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGATCTCTATT < SRR4302533.5207051/94‑1 (MQ=60)
TGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGATCTCTATTAT > SRR4302533.4227632/1‑94 (MQ=60)
TGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGATCTCTATTAT > SRR4302533.6104023/1‑94 (MQ=60)
AGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGATCTCTATTATCG > SRR4302533.6022224/1‑94 (MQ=60)
AGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGATCTCTATTATCG < SRR4302533.3270443/94‑1 (MQ=60)
GTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGATCTCTATTATCGTC < SRR4302533.1826781/94‑1 (MQ=60)
GTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGATCTCTATTATCGTC > SRR4302533.5849883/1‑94 (MQ=60)
TGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGATCTCTATTATCGTCT < SRR4302533.5118248/94‑1 (MQ=60)
CATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGATCTCTATTATCGTCTGA > SRR4302533.708221/1‑94 (MQ=60)
CATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGATCTCTATTATCGTCTGA < SRR4302533.4779780/94‑1 (MQ=60)
ATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGATCTCTATTATCGTCTGAA > SRR4302533.6312304/1‑94 (MQ=60)
ATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGATCTCTATTATCGTCTGAA < SRR4302533.4375693/94‑1 (MQ=60)
TGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGATCTCTATTATCGTCTGAAC < SRR4302533.6190775/94‑1 (MQ=60)
TGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGATCTCTATTATCGTCTGAAC < SRR4302533.4082589/94‑1 (MQ=60)
TGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGATCTCTATTATCCTCTGAAC > SRR4302533.1679891/1‑94 (MQ=60)
GTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGATCTCTATTATCGTCTGAACG < SRR4302533.3158353/94‑1 (MQ=60)
CGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGATCTCTATTATCGTCTGAACGTG > SRR4302533.767123/1‑94 (MQ=60)
CGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGATCTCTATTATCGTCTGAACGTG < SRR4302533.3479390/94‑1 (MQ=60)
GATGTGCGTGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGATCTCTATTATCGTCTGAACGTGT < SRR4302533.5659810/94‑1 (MQ=60)
ATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGATCTCTATTATCGTCTGAACGTGTT < SRR4302533.2546741/94‑1 (MQ=60)
TGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGATCTCTATTATCGTCTGAACGTGTTG < SRR4302533.4697233/94‑1 (MQ=60)
GTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGATCTCTATTATCGTCTGAACGTGTTGA > SRR4302533.2041416/1‑94 (MQ=60)
TGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGATCTCTATTATCGTCTGACCGTGTTGAC < SRR4302533.518280/94‑1 (MQ=60)
GCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGATCTCTATTATCGTCTGAACGTGTTGACG < SRR4302533.1661076/94‑1 (MQ=60)
GGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGATCTCTATTATCGTCTGAACGTGTTGACGCT < SRR4302533.125568/94‑1 (MQ=60)
GGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGATCTCTATTATCGTCTGAACGTGTTGACGCTC > SRR4302533.4615284/1‑94 (MQ=60)
GGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGATCTCTATTATCGTCTGAACGTGTTGACGCTC > SRR4302533.4388913/1‑94 (MQ=60)
TGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGATCTCTATTATCGTCTGAACGTGTTGACGCTCAA < SRR4302533.1683764/94‑1 (MQ=60)
TGATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGATCTCTATTATCGTCTGAACGTGTTGACGCTCAA < SRR4302533.3046898/94‑1 (MQ=60)
GATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGATCTCTATTATCGTCTGAACGTGTTGACGCTCAAT > SRR4302533.4973375/1‑94 (MQ=60)
GATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGATCTCTATTATCGTCTGAACGGGTTGACGCTCAAT < SRR4302533.2407901/94‑1 (MQ=60)
ATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGATCTCTATTATCGTCTGCACGTGTTGACGCTCAATC > SRR4302533.5462360/1‑94 (MQ=60)
ATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGATCTCTATTATCGTCTGAACGTGTTGACGCTCAATC > SRR4302533.1257950/1‑94 (MQ=60)
ATTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGATCTCTATTATCGTCTGAACGTGTTGACGCTCAATC > SRR4302533.5975855/1‑94 (MQ=60)
TTTGCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGATCTCTATTATCGTCTGAACGTGTTGACGCTCAATCT < SRR4302533.4312970/94‑1 (MQ=60)
GCGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGATCTCTATTATCGTCTGAACGTGTTGACGCTCAATCTGCC < SRR4302533.5230658/94‑1 (MQ=60)
CGCTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGATCTCTATTATCGTCTGAACGTGTTGACGCTCAATCTGCCG > SRR4302533.4478589/1‑94 (MQ=60)
CTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGATCTCTATTATCGTCTGAACGTGTTGACGCTCAATCTGCCGCC > SRR4302533.5116402/1‑94 (MQ=60)
CTACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGATCTCTATTATCGTCTGAACGTGTTGACGCTCAATCTGCCGCC < SRR4302533.4950732/94‑1 (MQ=60)
TACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGATCTCTATTATCGTCTGAACGTGTTGACGCTCAATCTGCCGCCG > SRR4302533.4826100/1‑94 (MQ=60)
ACGCAGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGATCTCTATTATCGTCTGAACGTGTTGACGCTCAATCTGCCGCCGC < SRR4302533.3776378/94‑1 (MQ=60)
AGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGATCTCTATTATCGTCTGAACGTGTTGACGCTCAATCTGCCGCCGCTACG > SRR4302533.1121859/1‑94 (MQ=60)
AGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGATCTCTATTATCGTCTGAACGTGTTGACGCTCAATCTGCCGCCGCTACG > SRR4302533.5775968/1‑94 (MQ=60)
AGAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGATCTCTATTATCGTCTGAACGTGTTGACGCTCAATCTGCCGCCGCTACG < SRR4302533.2062911/94‑1 (MQ=60)
GAAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGATCTCTATTATCGTCTGAACGTGTTGACGCTCAATCTGCCGCCGCTACGT > SRR4302533.73672/1‑94 (MQ=60)
AAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGATCTCTATTATCGTCTGAACGTGTTGACGCTCAATCTGCCGCCGCTACGTG < SRR4302533.5915103/94‑1 (MQ=60)
AAGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGATCTCTATTATCGTCTGAACGTGTTGACGCTCAATCTGCCGCCGCTACGTG > SRR4302533.2616125/1‑94 (MQ=60)
AGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGATCTCTATTATCGTCTGAACGTGTTGACGCTCAATCTGCCGCCGCTACGTGA > SRR4302533.4123556/1‑94 (MQ=60)
AGAACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGATCTCTATTATCGTCTGAACGTGTTGACGCTCAATCTGCCGCCGCTACGTGA > SRR4302533.3460402/1‑94 (MQ=60)
AACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGATCTCTATTATCGTCTGAACGTGTTGACGCTCAATCTGCCGCCGCTACGTGACT > SRR4302533.4729925/1‑94 (MQ=60)
AACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGATCTCTATTATCGTCTGAACGTGTTGACGCTCAATCTGCCGCCGCTACGTGACT < SRR4302533.388018/94‑1 (MQ=60)
AACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGATCTCTATTATCGTCTGAACGTGTTGACGCTCAATCTGCCGCCGCTACGTGACT > SRR4302533.367532/1‑94 (MQ=60)
ACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGATCTCTATTATCGTCTGAACGTGTTGACGCTCAATCTGCCGCCGCTACGTGACTG > SRR4302533.4952320/1‑94 (MQ=60)
ACCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGATCTCTATTATCGTCTGAACGTGTTGACGCTCAATCTGCCGCCGCTACGTGACTG < SRR4302533.477178/94‑1 (MQ=60)
CCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGATCTCTATTATCGTCTGAACGTGTTGACGCTCAATCTGGCGCCGCTACGTGACTGT > SRR4302533.4792380/1‑94 (MQ=60)
CCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGATCTCTATTATCGTCTGAACGTGTTGACGCTCAATCTGCCGCCGCTACGTGACTGT > SRR4302533.4248319/1‑94 (MQ=60)
CCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGATCTCTATTATCGTCTGAACGTGTTGACGCTCAATCTGCCGCCGCTACGTGACTGT > SRR4302533.3365234/1‑94 (MQ=60)
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ACTGCGTTTCCTTAATGATGGCACTTTCCGTCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAATCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGTGAAGATCTCTATTATCGTCTGAACGTGTTGACGCTCAATCTGCCGCCGCTACGTGACTGT > NC_000913/1385676‑1385862
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
