Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1624 |
250.6 |
12620048 |
98.0% |
12367647 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,511,995 |
G→A |
S47S (TCG→TCA) |
b1442 → |
putative transport system permease protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,511,995 | 0 | G | A | 100.0%
| 792.0
/ NA
| 215 | S47S (TCG→TCA) | b1442 | putative transport system permease protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (108/107); total (108/107) |
Only 100 of 236 total aligned reads displayed.
GTCCGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGAACTGACGCTGGCGAATATCCGTGC > NC_000913/1511905‑1512084
|
gtCCGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCact > 2:544976/1‑93 (MQ=255)
tCCGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCactg > 2:5111664/1‑93 (MQ=255)
ccGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCactgc > 1:5795141/1‑93 (MQ=255)
ccGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCactgc < 2:4628580/93‑1 (MQ=255)
ccGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCactgc < 2:4877417/93‑1 (MQ=255)
cGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCtctgct < 2:6309435/93‑1 (MQ=255)
cGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCactgct < 2:1307537/93‑1 (MQ=255)
ggTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCActgctg > 1:4358610/1‑93 (MQ=255)
ggTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCActgctg < 1:3315196/93‑1 (MQ=255)
gTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGa < 2:509/93‑1 (MQ=255)
tttCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGac < 1:4925498/93‑1 (MQ=255)
ttcttcTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGaca < 2:3438755/93‑1 (MQ=255)
tcttctGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGacac < 1:4412483/93‑1 (MQ=255)
cttctGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACt > 1:551825/1‑93 (MQ=255)
ttctGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTg > 2:1813497/1‑93 (MQ=255)
tctGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGt < 2:5986577/93‑1 (MQ=255)
ctGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGtt < 2:3653538/93‑1 (MQ=255)
tGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTa < 1:2164262/93‑1 (MQ=255)
tGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTa < 2:6269596/93‑1 (MQ=255)
tGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTa < 2:4730973/93‑1 (MQ=255)
gCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATg < 2:5333602/93‑1 (MQ=255)
cATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATgg > 1:3991003/1‑93 (MQ=255)
tAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCa > 1:3087501/1‑93 (MQ=255)
aaTCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAg < 1:3464385/93‑1 (MQ=255)
aTCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAgg < 2:4658263/93‑1 (MQ=255)
aTCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAgg < 2:48179/93‑1 (MQ=255)
aTCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAgg > 2:3924481/1‑93 (MQ=255)
ccGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGa > 2:1422894/1‑93 (MQ=255)
ggggctggggctGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGAtt < 2:3373622/93‑1 (MQ=255)
gctggggctgTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGGGTTta > 2:4320707/1‑93 (MQ=255)
gctggggctgTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTta < 2:2205795/93‑1 (MQ=255)
gctggggctgTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTta < 1:4508751/93‑1 (MQ=255)
ctggggctgTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTtat < 1:3492394/93‑1 (MQ=255)
ctggggctgTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTtat < 2:2700178/93‑1 (MQ=255)
tggggctgTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGGTTTtata > 1:427699/1‑93 (MQ=255)
tggggctgTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTtatt > 1:1845833/1‑92 (MQ=255)
ggggctgTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTtatat > 1:2400952/1‑92 (MQ=255)
gggctgTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGGTTTTTTACt > 1:6291905/1‑93 (MQ=255)
gggctgTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACt < 1:6250815/93‑1 (MQ=255)
gctgTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGGTTTTATACttt > 2:5537357/1‑93 (MQ=255)
gctgTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACttt < 2:3311146/93‑1 (MQ=255)
gctgTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACttt < 2:4547716/93‑1 (MQ=255)
ctgTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACtttt < 1:6030967/93‑1 (MQ=255)
ctgTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACtttt < 2:1666701/93‑1 (MQ=255)
ctgTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACtttt < 1:670697/93‑1 (MQ=255)
tgTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTTTACttttt > 2:573716/1‑92 (MQ=255)
gTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGa < 1:2933212/93‑1 (MQ=255)
gTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGa < 1:2595112/93‑1 (MQ=255)
tttttACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGCATTTTTACCTTTgcc > 1:3749618/1‑91 (MQ=255)
tttttACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGAc < 1:1903696/93‑1 (MQ=255)
tttACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGa < 2:3488411/93‑1 (MQ=255)
tACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGAtt < 2:4758067/93‑1 (MQ=255)
aCTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGAttt > 2:1919672/1‑93 (MQ=255)
aCTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGAttt < 2:670387/93‑1 (MQ=255)
aCTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGAttt > 1:704385/1‑93 (MQ=255)
ctgctgCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTc < 1:472637/93‑1 (MQ=255)
ctgctgCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTc < 1:2075447/93‑1 (MQ=255)
gctgctTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGGTTTTATACTTTTTACGATTTCAc > 1:1399586/1‑93 (MQ=255)
ctgctTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCAcc < 1:919232/93‑1 (MQ=255)
tgctTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCa < 1:5830737/93‑1 (MQ=255)
gctTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCAt > 2:5489431/1‑93 (MQ=255)
ttGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGGTTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGt > 1:2997906/1‑93 (MQ=255)
ttGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGt > 1:3043125/1‑93 (MQ=255)
ttGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGt < 1:1324458/93‑1 (MQ=255)
tGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGGTTTTTTACTTTTGACGATTTCCCCATGtt > 1:3409753/1‑92 (MQ=255)
tGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTTACGATTTCAACATGTc > 1:3531600/1‑93 (MQ=255)
gCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCgg > 2:2052727/1‑93 (MQ=255)
gCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAAc > 1:5251912/1‑93 (MQ=255)
cTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGGTTTTATACTTTTGACGATTTCCCCATGTCGGTAACg > 2:1720014/1‑93 (MQ=255)
cTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTTACCATGTCGGTAACg > 1:1046337/1‑93 (MQ=255)
cTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACg < 2:4348678/93‑1 (MQ=255)
tAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGGTTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGc > 1:1210361/1‑93 (MQ=255)
tAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCCACATGTCGGTAAAGc > 2:5264529/1‑93 (MQ=255)
actgtgGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGcc < 2:2336339/91‑1 (MQ=255)
aaTGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGGTTTTATACTTTTGACGATTTTACCATGTCGGTAACGcc > 1:6216779/1‑93 (MQ=255)
aaTGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGcc < 1:302779/93‑1 (MQ=255)
aTGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAAAGCCg > 1:2766850/1‑93 (MQ=255)
tgtgGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCgg > 2:5064986/1‑93 (MQ=255)
tgtgGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCgg > 2:4222178/1‑93 (MQ=255)
tgGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGaa < 2:786383/93‑1 (MQ=255)
tgGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGaa < 2:3756931/93‑1 (MQ=255)
ggTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGAAc < 1:3392217/93‑1 (MQ=255)
gTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGGTTTTATACTTTTGACGATTTTACCATGTCTGTAACGCCGGAACt > 2:5681735/1‑93 (MQ=255)
tGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGAACTGAc < 1:1813497/93‑1 (MQ=255)
gCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGAAATAACGc > 2:306427/1‑93 (MQ=255)
gCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTGATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGAACTGACGc < 2:2514279/93‑1 (MQ=255)
cATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGAACTGACGCt < 2:1656495/93‑1 (MQ=255)
cATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGAACTGACGCt < 1:1974972/93‑1 (MQ=255)
cATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGAACTGACGCt > 1:2460545/1‑93 (MQ=255)
aTTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGAACTGACGCTg < 1:2581846/93‑1 (MQ=255)
aTTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGAGTTTATTCTTTTGACGATTTTACCATGTCGGGAACGGCGGGAATGACGCTg > 1:5604308/1‑93 (MQ=255)
gTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGAACTGACGCTGGCg > 2:86258/1‑93 (MQ=255)
tATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGAACTGACGCTGGCGAat > 1:3188771/1‑93 (MQ=255)
tATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGAACTGACGCTGGCGAat < 2:2256699/93‑1 (MQ=255)
tATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGAACTGACGCTGGCGAat > 2:2735595/1‑93 (MQ=255)
aTTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGAACTGACGCTGGCGAata > 1:3284198/1‑93 (MQ=255)
cGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCCTGTCGGTAACGCCGGAACTGACGCTGGCGGATATCCg > 1:1424103/1‑93 (MQ=255)
ggCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGGTTTTATACTTTTGACGATTTTACCATGTCGGTAACGCCGGAACTGACGCTGGCGAATATCCGt > 2:4432983/1‑93 (MQ=255)
ggCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGAACTGACGCTGGCGAATATCCGt < 1:5111664/93‑1 (MQ=255)
ggCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGAACTGACGCTGGCGAATATCCGt > 1:1624706/1‑93 (MQ=255)
|
GTCCGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGAACTGACGCTGGCGAATATCCGTGC > NC_000913/1511905‑1512084
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GTGTCCGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGAACTGACGCTGGCGAATATCCGTGCG > NC_000913/1511903‑1512085
|
GTGTCCGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCAC > SRR4302533.752420/1‑94 (MQ=60)
GTCCGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTG > SRR4302533.1940098/1‑94 (MQ=60)
GTCCGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTG > SRR4302533.373965/1‑94 (MQ=60)
GTCCGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTG > SRR4302533.902382/1‑94 (MQ=60)
TCCGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGC > SRR4302533.5859256/1‑94 (MQ=60)
TCCGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGC > SRR4302533.5830153/1‑94 (MQ=60)
TCCGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGC > SRR4302533.3509925/1‑94 (MQ=60)
CCGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCT > SRR4302533.3534017/1‑94 (MQ=60)
CGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTG < SRR4302533.1889597/94‑1 (MQ=60)
CGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTG > SRR4302533.2602359/1‑94 (MQ=60)
CGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTG > SRR4302533.4384917/1‑94 (MQ=60)
GGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGA < SRR4302533.3335663/94‑1 (MQ=60)
TTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACA < SRR4302533.4955329/94‑1 (MQ=60)
TTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACAC > SRR4302533.2344956/1‑94 (MQ=60)
TCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACT < SRR4302533.4439127/94‑1 (MQ=60)
TCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACT < SRR4302533.3299456/94‑1 (MQ=60)
TCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACT > SRR4302533.555096/1‑94 (MQ=60)
TTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGT > SRR4302533.2548141/1‑94 (MQ=60)
TCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTT < SRR4302533.638677/94‑1 (MQ=60)
TCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTT < SRR4302533.6344159/94‑1 (MQ=60)
TCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTT > SRR4302533.828969/1‑94 (MQ=60)
TGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTAT < SRR4302533.2177577/94‑1 (MQ=60)
GGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATG < SRR4302533.1407614/94‑1 (MQ=60)
GCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGG > SRR4302533.4015307/1‑94 (MQ=60)
ATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCA > SRR4302533.3106484/1‑94 (MQ=60)
TAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAG < SRR4302533.4422027/94‑1 (MQ=60)
TAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAG < SRR4302533.2936026/94‑1 (MQ=60)
AATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGG < SRR4302533.5560871/94‑1 (MQ=60)
AATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGG > SRR4302533.4333684/1‑94 (MQ=60)
AATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGG < SRR4302533.3485770/94‑1 (MQ=60)
TCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGA < SRR4302533.2332932/94‑1 (MQ=60)
GCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTAT < SRR4302533.4536057/94‑1 (MQ=60)
CTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGGTTTTATA > SRR4302533.430251/1‑94 (MQ=60)
CTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATT > SRR4302533.1857088/1‑94 (MQ=60)
CTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATA > SRR4302533.3423594/1‑94 (MQ=60)
CTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATA < SRR4302533.3513930/94‑1 (MQ=60)
TGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATAT > SRR4302533.2415780/1‑94 (MQ=60)
TGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATAC < SRR4302533.4721630/94‑1 (MQ=60)
TGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATAC < SRR4302533.3804637/94‑1 (MQ=60)
TGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGGGGTTTGGCATTGACTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATtg > SRR4302533.2821954/1‑92 (MQ=60)
GGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGGTTTTTTACT > SRR4302533.6329421/1‑94 (MQ=60)
GGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTTACACTGTTATGGCAGGGGTTTTTTAATT > SRR4302533.552424/1‑94 (MQ=60)
GGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGGTTTTATACTT > SRR4302533.1732959/1‑94 (MQ=60)
GGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTT < SRR4302533.6288210/94‑1 (MQ=60)
GGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTT < SRR4302533.4790257/94‑1 (MQ=60)
CTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTG < SRR4302533.6067516/94‑1 (MQ=60)
CTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTG < SRR4302533.674659/94‑1 (MQ=60)
TGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGGTTTTATACTTTTGA > SRR4302533.6248915/1‑94 (MQ=60)
TGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTttattttttc > SRR4302533.1219977/1‑84 (MQ=60)
TGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGA > SRR4302533.2991078/1‑94 (MQ=60)
TGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGA > SRR4302533.5782963/1‑94 (MQ=60)
GTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGcatttttacctttgcc > SRR4302533.3772604/1‑78 (MQ=60)
GTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGAC < SRR4302533.2951149/94‑1 (MQ=60)
GTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGAC < SRR4302533.2611062/94‑1 (MQ=60)
TTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACG < SRR4302533.1662674/94‑1 (MQ=60)
TTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACG < SRR4302533.1915314/94‑1 (MQ=60)
TTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGAT < SRR4302533.4236855/94‑1 (MQ=60)
TACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGGTTTTATACTTTTGACGATTT > SRR4302533.2946360/1‑94 (MQ=60)
TACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTT > SRR4302533.708546/1‑94 (MQ=60)
TACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTT < SRR4302533.6066431/94‑1 (MQ=60)
ACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTTTACTTTTGACGATTTC > SRR4302533.1356787/1‑94 (MQ=60)
ACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTC > SRR4302533.576677/1‑94 (MQ=60)
CTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCA < SRR4302533.475464/94‑1 (MQ=60)
CTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCA < SRR4302533.2088224/94‑1 (MQ=60)
TGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTTACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCAC < SRR4302533.2020031/94‑1 (MQ=60)
TGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGGTTTTATACTTTTTACGATTTCAC > SRR4302533.1408022/1‑94 (MQ=60)
CTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGCTTTTACCA > SRR4302533.4844947/1‑94 (MQ=60)
CTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCA < SRR4302533.924632/94‑1 (MQ=60)
TGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCTCCAT > SRR4302533.6308220/1‑94 (MQ=60)
TGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCAT < SRR4302533.2616691/94‑1 (MQ=60)
TGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCAT < SRR4302533.5865972/94‑1 (MQ=60)
CTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGGTTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGT > SRR4302533.3016236/1‑94 (MQ=60)
CTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGT > SRR4302533.3061754/1‑94 (MQ=60)
TTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGGTTTTTTACTTTTGACGATTTCCCCATGTT > SRR4302533.3430812/1‑94 (MQ=60)
TTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTTACGATTTCAACATGTC > SRR4302533.3553364/1‑94 (MQ=60)
TTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTC < SRR4302533.1332402/94‑1 (MQ=60)
GGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTTACGATTTCACCATGTCGG > SRR4302533.3256801/1‑94 (MQ=60)
GCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGT > SRR4302533.1975910/1‑94 (MQ=60)
CGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAAC > SRR4302533.5265307/1‑94 (MQ=60)
CGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAAC > SRR4302533.5283468/1‑94 (MQ=60)
CGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAAC > SRR4302533.3324833/1‑94 (MQ=60)
GCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTTACCATGTCGGTAACG > SRR4302533.1052485/1‑94 (MQ=60)
GCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACG > SRR4302533.2446187/1‑94 (MQ=60)
CTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGGTTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGC > SRR4302533.1217629/1‑94 (MQ=60)
TAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGGTTTTATACTTTTGACGATTTTACCATGTCGGTAACGCC > SRR4302533.6254057/1‑94 (MQ=60)
AATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCG > SRR4302533.3505606/1‑94 (MQ=60)
AATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCG < SRR4302533.304629/94‑1 (MQ=60)
AATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAAAGCCG > SRR4302533.2783822/1‑94 (MQ=60)
ATGTGGTTTGGGATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGG < SRR4302533.3371880/94‑1 (MQ=60)
GTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGAA > SRR4302533.3173614/1‑94 (MQ=60)
GGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGGTTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGAACT > SRR4302533.305387/1‑94 (MQ=60)
GGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCCTGTCGGTACCGCCGGAACC > SRR4302533.4417288/1‑94 (MQ=60)
GGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGGACT > SRR4302533.1429775/1‑94 (MQ=60)
GGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGAACT < SRR4302533.3413167/94‑1 (MQ=60)
GGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGAACT > SRR4302533.5273261/1‑94 (MQ=60)
GGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGAACT > SRR4302533.3434002/1‑94 (MQ=60)
TTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGAACTGAC < SRR4302533.1838725/94‑1 (MQ=60)
TTGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGAACTGAC < SRR4302533.6142248/94‑1 (MQ=60)
TGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGAACTGACG < SRR4302533.1824570/94‑1 (MQ=60)
TGGCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGAACTGACG > SRR4302533.3022098/1‑94 (MQ=60)
GCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGAACTGACGCT > SRR4302533.2475730/1‑94 (MQ=60)
GCATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTAACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGAACTGACGCT < SRR4302533.45185/94‑1 (MQ=60)
CATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGAACTGACGCTG < SRR4302533.1987066/94‑1 (MQ=60)
CATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGAACTGACGCTG < SRR4302533.211651/94‑1 (MQ=60)
CATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGAGTTTATTCTTTTGACGATTTTACCATGTCGGGAACGGCGGGAATGACGCTG > SRR4302533.5638168/1‑94 (MQ=60)
ATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGAACTGACGCTGG > SRR4302533.1062257/1‑94 (MQ=60)
ATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGAACTGACGCTGG < SRR4302533.2597727/94‑1 (MQ=60)
ATTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGAACTGACGCTGG > SRR4302533.3994135/1‑94 (MQ=60)
TTGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGAACTGACGCTGGC < SRR4302533.3053682/94‑1 (MQ=60)
TGTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGAACTGACGCTGGCG < SRR4302533.2540060/94‑1 (MQ=60)
GTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGGTTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGAACTGACGCTGGCGA > SRR4302533.6272004/1‑94 (MQ=60)
GTCTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATAATTTTGACGATTTTACCATGTCGGTAAAGCCGGAACTGACGCTGGCGA > SRR4302533.3080690/1‑94 (MQ=60)
CTATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGAACTGACGCTGGCGAAT > SRR4302533.3208387/1‑94 (MQ=60)
TATTTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGAACTGACGCTGGCGAATA > SRR4302533.3304471/1‑94 (MQ=60)
TTCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGAACTGACGCTGGCGAATATCC < SRR4302533.691080/94‑1 (MQ=60)
TCGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCCTGTCGGTAACGCCGGAACTGACGCTGGCGGATATCCG > SRR4302533.1432717/1‑94 (MQ=60)
CGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGAACTGACGCTGGCGAATATCCGT < SRR4302533.5062662/94‑1 (MQ=60)
CGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGAACTGACGCTGGCGAATATCCGT > SRR4302533.1634546/1‑94 (MQ=60)
CGGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGAACTGACGCTGGCGAATATCCGT < SRR4302533.1602192/94‑1 (MQ=60)
GGCTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGAACTGACGCTGGCGAATATCCGTG < SRR4302533.5142556/94‑1 (MQ=60)
CTCACTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGAACTGACGCTGGCGAATATCCGTGCG < SRR4302533.3366275/94‑1 (MQ=60)
|
GTGTCCGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGAACTGACGCTGGCGAATATCCGTGCG > NC_000913/1511903‑1512085
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
