Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1624 |
250.6 |
12620048 |
98.0% |
12367647 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,572,444 |
C→T |
P261P (CCG→CCA) |
pqqL ← |
putative peptidase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,572,444 | 0 | C | T | 100.0%
| 728.2
/ NA
| 194 | P261P (CCG→CCA) | pqqL | putative peptidase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (103/91); total (103/91) |
Only 100 of 199 total aligned reads displayed.
CATTGGCAGGCGATAATAGAGTGCGATGCCGTTCACCCGGTTTTCTTTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTCGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACTTAAATTATCCTTTATCAGCGCCAGCGCTTCTTTACTGTCGATAT > NC_000913/1572354‑1572532
|
cATTGGCAGGCGATAATAGAGTGCGATGCCGTTCACCCGGTTTTCTTTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTgg > 1:3227214/1‑93 (MQ=255)
cATTGGCAGGCGATAATAGAGTGCGATGCCGTTCACCCGGTTTTCTTTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTgg > 1:1168193/1‑93 (MQ=255)
cATTGGCAGGCGATAATAGAGTGCGATGCCGTTCACCCGGTTTTCTTTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTgg < 2:3821036/93‑1 (MQ=255)
aTTGGCAGGCGATAATAGAGTGCGATGCCGTTCACCCGGTTTTCTTTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGc > 2:528430/1‑93 (MQ=255)
ttGGCAGGCGATAATAGAGTGCGATGCCGTTCACCCGGTTTTCTTTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGcc > 2:6282203/1‑93 (MQ=255)
ttGGCAGGCGATAATAGAGTGCGATGCCGTTCACCCGGTTTTCTTTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGcc < 1:5779595/93‑1 (MQ=255)
tGGCAGGCGATAATAGAGTGCGATGCCGTTCACCCGGTTTTCTTTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCa < 1:3994161/93‑1 (MQ=255)
gCAGGCGATAATAGAGTGCGATGCCGTTCACCCGGTTTTCTTTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGa < 2:1175520/93‑1 (MQ=255)
cAGGCGATAATAGAGTGCGATGCCGTTCACCCGGTTTTCTTTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGAc < 1:577237/93‑1 (MQ=255)
aGGCGATAATAGAGTGCGATGCCGTTCACCCGGTTTTCTTTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGAcg < 1:6173963/93‑1 (MQ=255)
aGGCGATAATAGAGTGCGATGCCGTTCACCCGGTTTTCTTTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGAcg < 1:4613667/93‑1 (MQ=255)
ggCGATAATAGAGTGCGATGCCGTTCACCCGGTTTTCTTTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGAcgc < 1:1000963/93‑1 (MQ=255)
gCGATAATAGAGTGCGATGCCGTTCACCCGGTTTTCTTTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGAcgcg < 1:4499772/93‑1 (MQ=255)
cGATAATAGAGTGCGATGCCGTTCACCCGGTTTTCTTTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGa > 1:1836541/1‑93 (MQ=255)
cGATAATAGAGTGCGATGCCGTTCACCCGGTTTTCTTTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGa > 1:4509196/1‑93 (MQ=255)
gATAATAGAGTGCGATGCCGTTCACCCGGTTTTCTTTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGAt > 2:1280413/1‑93 (MQ=255)
gATAATAGAGTGCGATGCCGTTCACCCGGTTTTCTTTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGAt < 1:5094869/93‑1 (MQ=255)
taataGAGTGCGATGCCGTTCACCCGGTTTTCTTTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGAttt > 2:1477412/1‑93 (MQ=255)
taataGAGTGCGATGCCGTTCACCCGGTTTTCTTTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGAttt > 2:2395007/1‑93 (MQ=255)
ataGAGTGCGATGCCGTTCACCCGGTTTTCTTTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTc > 1:3880981/1‑93 (MQ=255)
taGAGTGCGATGCCGTTCACCCGGTTTTCTTTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCa < 1:1623561/93‑1 (MQ=255)
taGAGTGCGATGCCGTTCACCCGGTTTTCTTTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCa < 1:4126529/93‑1 (MQ=255)
taGAGTGCGATGCCGTTCACCCGGTTTTCTTTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGACCAGACGCGATTTTCa > 2:4273255/1‑93 (MQ=255)
agagTGCGATGCCGTTCACCCGGTTTTCTTTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAg > 1:3048267/1‑93 (MQ=255)
agagTGCGATGCCGTTCACCCGGTTTTCTTTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAg > 1:1271399/1‑93 (MQ=255)
agagTGCGATGCCGTTCACCCGGTTTTCTTTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAg < 2:4976993/93‑1 (MQ=255)
gTGCGATGCCGTTCACCCGGTTTTCTTTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAgctg > 1:349428/1‑93 (MQ=255)
gCGATGCCGTTCACCCGGTTTTCTTTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAgctgct < 2:5609244/93‑1 (MQ=255)
cGATGCCGTTCACCCGGTTTTCTTTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCtt < 1:3287949/93‑1 (MQ=255)
gATGCCGTTCGCCCGGTTTTCTTTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCttt < 1:1065248/93‑1 (MQ=255)
gCCGTTCACCCGGTTTTCTTTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGtt < 2:1996066/93‑1 (MQ=255)
gCCGTTCACCCGGTTTTCTTTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGtt < 2:5853394/93‑1 (MQ=255)
ccGTTCACCCGGTTTTCTTTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTa < 2:2493058/93‑1 (MQ=255)
ccGTTCACCCGGTTTTCTTTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTa < 1:791857/93‑1 (MQ=255)
gTTCACCCGGTTTTCTTTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGc > 2:1924733/1‑93 (MQ=255)
gTTCACCCGGTTTTCTTTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGc < 2:306851/93‑1 (MQ=255)
gTTCACCCGGTTTTCTTTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGc < 2:4724107/93‑1 (MQ=255)
ccGGTTTTCTTTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAg > 2:5779957/1‑93 (MQ=255)
cGGTTTTCTTTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGc > 2:2158235/1‑93 (MQ=255)
cGGTTTTCTTTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGc > 1:2523147/1‑93 (MQ=255)
cGGTTTTCTTTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGc > 2:4501668/1‑93 (MQ=255)
ggTTTTCTTTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGct < 2:852215/93‑1 (MQ=255)
ggTTTTCTTTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGct > 1:4270653/1‑93 (MQ=255)
ggTTTTCTTTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGct < 1:4444463/93‑1 (MQ=255)
gTTTTCTTTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACTCGATTTTCACCTGCTTTGTTTGCCGGAAGctt > 1:2041860/1‑93 (MQ=255)
ttttCTTTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGctta > 1:5608569/1‑93 (MQ=255)
ttttCTTTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGctta > 1:3441295/1‑93 (MQ=255)
ttttCTTTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGctta > 2:2710250/1‑93 (MQ=255)
ttCTTTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGcttact > 1:2324187/1‑93 (MQ=255)
ttCTTTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGGTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGCAGcttact > 2:4027002/1‑93 (MQ=255)
tttATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACTTaa > 1:1412672/1‑93 (MQ=255)
ttATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACTTaaa > 2:3440618/1‑93 (MQ=255)
tATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACTTAAAt < 2:4584389/93‑1 (MQ=255)
tATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACTTAAAt > 1:1488565/1‑93 (MQ=255)
tCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACTTAAATTa < 2:4189492/93‑1 (MQ=255)
cATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACTTAAATTAt < 1:371413/93‑1 (MQ=255)
aTTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACTTAAATTATc > 2:2922702/1‑93 (MQ=255)
aaTGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACTTAAATTATCCtt > 2:4869510/1‑93 (MQ=255)
aaTGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACTTAAATTATCCtt < 2:912186/93‑1 (MQ=255)
aaTGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACTTAAATTATCCtt > 1:3662434/1‑93 (MQ=255)
aaTGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACTTAAATTATCCtt < 2:1352054/93‑1 (MQ=255)
aTGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACTTAAATTATCCttt > 1:4846240/1‑93 (MQ=255)
tGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACTTAAATTATCCTTTa > 2:6285177/1‑93 (MQ=255)
tGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACTTAAATTATCCTTTa > 1:2449935/1‑93 (MQ=255)
atatTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACTTAAATTATCCTTTATc > 1:5019935/1‑93 (MQ=255)
tatTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACTTAAATTATCCTTTATca < 2:4533793/93‑1 (MQ=255)
tatTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACTTAAATTATCCTTTATca < 2:3591706/93‑1 (MQ=255)
atTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACTTAAATTATCCTTTATcag > 2:5379157/1‑93 (MQ=255)
atTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACTTAAATTATCCTTTATcag < 2:2537343/93‑1 (MQ=255)
atTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACTTAAATTATCCTTTATcag > 2:3190023/1‑93 (MQ=255)
ttAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACTTAAATTATCCTTTATcagc < 1:154417/93‑1 (MQ=255)
tAAAGCGCAGGTGGTTTTCGTCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACTTAAATTATCCTTTATcagcg < 1:3242270/93‑1 (MQ=255)
aaaGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACTTAAATTATCCTTTATcagcgc < 2:3228801/93‑1 (MQ=255)
aaaGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACTTAAATTATCCTTTATcagcgc > 1:6304586/1‑93 (MQ=255)
cgcAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACTTAAATTATCCTTTATcagcgccagc < 1:5879693/93‑1 (MQ=255)
gcAGGGGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACTTAAATTATCCTTTATcagcgccagcg > 2:5721932/1‑93 (MQ=255)
cAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACTTAAATTATCCTTTATcagcgccagcgc > 2:4791321/1‑93 (MQ=255)
cAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACTTAAATTATCCTTTATcagcgccagcgc < 1:6133563/93‑1 (MQ=255)
cAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACTTAAATTATCCTTTATcagcgccagcgc < 2:4918355/93‑1 (MQ=255)
aGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACTTAAATTATCCTTTATCAGCGCCAGCGct > 1:4778265/1‑93 (MQ=255)
aGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACTTAAATTATCCTTTATCAGCGCCAGCGct > 2:4495007/1‑93 (MQ=255)
aGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACTTAAATTATCCTTTATCAGCGCCAGCGct > 2:1253920/1‑93 (MQ=255)
ggtggtTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACTTAAATTATCCTTTAtcagcgtcagcgata > 2:635717/1‑90 (MQ=255)
ggtggtTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACTTAAATTATCCTTTATCAGCGCCAGCGctt > 1:764586/1‑93 (MQ=255)
gtggtTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACTTAAATTATCCTTTATCAGCGCCAGCGcttc < 1:2666780/93‑1 (MQ=255)
gtggtTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACTTAAATTATCCTTTATCAGCGCCAGCGcttc > 1:1078884/1‑93 (MQ=255)
gtggtTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACTTAAATTATCCTTTATCAGCGCCAGCGcttc > 2:1818810/1‑93 (MQ=255)
tggtTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACTTAAATTATCCTTTATCAGCGCCAGCGcttct < 2:3154328/93‑1 (MQ=255)
ggtTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGACGCTTACTTAAATTATCCTTTATCAGCGCCAGCGcttctt < 1:4557949/93‑1 (MQ=255)
tttCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACTTAAATTATCCTTTATCAGCGCCAGCGCTTCTTTAc < 1:2617614/93‑1 (MQ=255)
tCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACTTAAATTATCCTTTATCAGCGCCAGCGCTTCTTTACTg > 2:1064965/1‑93 (MQ=255)
tCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACTTAAATTATCCTTTATCAGCGCCAGCGCTTCTTTACTg < 2:2335510/93‑1 (MQ=255)
ggCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACTTAAATTATCCTTTATCAGCGCCAGCGCTTCTTTACTgcc > 1:5588568/1‑91 (MQ=255)
cTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACTTAAATTATCCTTTATCAGCGCCAGCGCTTCTTTACTGCCGa < 2:4996444/93‑1 (MQ=255)
cTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACTTAAATTATCCTTTATCAGCGCCAGCGCTTCTTTACTGCCGa < 2:1618059/93‑1 (MQ=255)
cTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACTTAAATTATCCTTTATCAGCGCCAGCGCTTCTTTACTGCCGa > 1:2566435/1‑93 (MQ=255)
ttttGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACTTAAATTATCCTTTATCAGCGCCAGCGCTTCTTTACTGCCGat > 1:5669410/1‑93 (MQ=255)
tttGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACTTAAATTATCCTTTATCAGCGCCAGCGCTTCTTTACTGCCGata < 2:6060643/93‑1 (MQ=255)
tttGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACTTAAATTATCCTTTATCAGCGCCAGCGCTTCTTTACTGCCGata < 1:4704063/93‑1 (MQ=255)
ttgttgGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACTTAAATTATCCTTTATCAGCGCCAGCGCTTCTTTACTGCCGatat > 1:2398829/1‑93 (MQ=255)
|
CATTGGCAGGCGATAATAGAGTGCGATGCCGTTCACCCGGTTTTCTTTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTCGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACTTAAATTATCCTTTATCAGCGCCAGCGCTTCTTTACTGTCGATAT > NC_000913/1572354‑1572532
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
TACCATTGGCAGGCGATAATAGAGTGCGATGCCGTTCACCCGGTTTTCTTTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTCGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACTTAAATTATCCTTTATCAGCGCCAGCGCTTCTTTACTGTCGATATCGCCG > NC_000913/1572351‑1572537
|
TACCATTGGCAGGCGATAATAGAGTGCGATGCCGTTCACCCGGTTTTCTTTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTT > SRR4302533.2912105/1‑94 (MQ=60)
TACCATTGGCAGGCGATAATAGAGTGCGATGCCGTTCACCCGGTTTTCTTTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTT < SRR4302533.4528109/94‑1 (MQ=60)
TACCATTGGCAGGCGATAATAGAGTGCGATGCCGTTCACCCGGTTTTCTTTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTT < SRR4302533.2478492/94‑1 (MQ=60)
TACCATTGGCAGGCGATAATAGAGTGCGATGCCGTTCACCCGGTTTTCTTTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTT > SRR4302533.753693/1‑94 (MQ=60)
ACCATTGGCAGGCGATAATAGAGTGCGATGCCGTTCACCCGGTTTTCTTTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTG < SRR4302533.4562541/94‑1 (MQ=60)
CCATTGGCAGGCGATAATAGAGTGCGATGCCGTTCACCCGGTTTTCTTTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGG > SRR4302533.3247109/1‑94 (MQ=60)
CCATTGGCAGGCGATAATAGAGTGCGATGCCGTTCACCCGGTTTTCTTTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGG > SRR4302533.1175201/1‑94 (MQ=60)
CCATTGGCAGGCGATAATAGAGTGCGATGCCGTTCACCCGGTTTTCTTTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGG < SRR4302533.3394521/94‑1 (MQ=60)
TTGGCAGGCGATAATAGAGTGCGATGCCGTTCACCCGGTTTTCTTTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCA < SRR4302533.5814500/94‑1 (MQ=60)
TGGCAGGCGATAATAGAGTGCGATGCCGTTCACCCGGTTTTCTTTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAG < SRR4302533.4755239/94‑1 (MQ=60)
TGGCAGGCGATAATAGAGTGCGATGCCGTTCACCCGGTTTTCTTTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAG < SRR4302533.4018481/94‑1 (MQ=60)
GGCAGGCGATAATAGAGTGCGATGCCGTTCACCCGGTTTTCTTTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGA > SRR4302533.1548767/1‑94 (MQ=60)
CAGGCGATAATAGAGTGCGATGCCGTTCACCCGGTTTTCTTTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACG < SRR4302533.2585038/94‑1 (MQ=60)
CAGGCGATAATAGAGTGCGATGCCGTTCACCCGGTTTTCTTTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACG < SRR4302533.580641/94‑1 (MQ=60)
CAGGCGATAATAGAGTGCGATGCCGTTCACCCGGTTTTCTTTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACG > SRR4302533.3928819/1‑94 (MQ=60)
AGGCGATAATAGAGTGCGATGCCGTTCACCCGGTTTTCTTTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGC < SRR4302533.6211066/94‑1 (MQ=60)
AGGCGATAATAGAGTGCGATGCCGTTCACCCGGTTTTCTTTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGC < SRR4302533.4641614/94‑1 (MQ=60)
GGCGATAATAGAGTGCGATGCCGTTCACCCGGTTTTCTTTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCG < SRR4302533.1006807/94‑1 (MQ=60)
GCGATAATAGAGTGCGATGCCGTTCACCCGGTTTTCTTTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGA < SRR4302533.4527021/94‑1 (MQ=60)
GCGATAATAGAGTGCGATGCCGTTCACCCGGTTTTCTTTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGA > SRR4302533.1847743/1‑94 (MQ=60)
GCGATAATAGAGTGCGATGCCGTTCACCCGGTTTTCTTTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGA > SRR4302533.4536506/1‑94 (MQ=60)
GATAATAGAGTGCGATGCCGTTCACCCGGTTTTCTTTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATT < SRR4302533.5125647/94‑1 (MQ=60)
GATAATAGAGTGCGATGCCGTTCACCCGGTTTTCTTTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATT > SRR4302533.2363028/1‑94 (MQ=60)
GATAATAGAGTGCCATGCCGTTCACCCGGTTTTCTTTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATT > SRR4302533.5807255/1‑94 (MQ=60)
ATAATAGAGTGCGATGCCGTTCACCCGGTTTTCTTTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTT > SRR4302533.3258122/1‑94 (MQ=60)
AATAGAGTGCGATGCCGTTCACCCGGTTTTCTTTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTC > SRR4302533.3904663/1‑94 (MQ=60)
AATAGAGTGCGATGCCGTTCACCCGGTTTTCTTTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTC > SRR4302533.2485201/1‑94 (MQ=60)
ATAGAGTGCGATGCCGTTCACCCGGTTTTCTTTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCA > SRR4302533.3262708/1‑94 (MQ=60)
ATAGAGTGCGATGCCGTTCACCCGGTTTTCTTTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCA < SRR4302533.596103/94‑1 (MQ=60)
TAGAGTGCGATGCCGTTCACCCGGTTTTCTTTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAG < SRR4302533.1633395/94‑1 (MQ=60)
TAGAGTGCGATGCCGTTCACCCGGTTTTCTTTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAG < SRR4302533.4151579/94‑1 (MQ=60)
TAGAGTGCGATGCCGTTCACCCGGTTTTCTTTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAG > SRR4302533.1279003/1‑94 (MQ=60)
TAGAGTGCGATGCCGTTCACCCGGTTTTCTTTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAG > SRR4302533.3066929/1‑94 (MQ=60)
AGTGCGATGCCGTTCACCCGGTTTTCTTTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTG > SRR4302533.351560/1‑94 (MQ=60)
AGTGCGATGCCGTTCACCCGGTTTTCTTTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTG > SRR4302533.4164626/1‑94 (MQ=60)
CGATGCCGTTCACCCGGTTTTCTTTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTT < SRR4302533.3308243/94‑1 (MQ=60)
GATGCCGTTCGCCCGGTTTTCTTTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTG < SRR4302533.1071503/94‑1 (MQ=60)
GCCGTTCACCCGGTTTTCTTTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTA > SRR4302533.1467273/1‑94 (MQ=60)
CCGTTCACCCGGTTTTCTTTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAG > SRR4302533.712182/1‑94 (MQ=60)
CCGTTCACCCGGTTTTCTTTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAG < SRR4302533.796517/94‑1 (MQ=60)
CGTTCACCCGGTTTTCTTTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGC < SRR4302533.2543381/94‑1 (MQ=60)
GTTCACCCGGTTTTCTTTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCC < SRR4302533.1563098/94‑1 (MQ=60)
TTCACCCGGTTTTCTTTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCG > SRR4302533.311540/1‑94 (MQ=60)
ACCCGGTTTTCTTTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAA > SRR4302533.1107147/1‑94 (MQ=60)
CCCGGTTTTCTTTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAG < SRR4302533.2126917/94‑1 (MQ=60)
CCGGTTTTCTTTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGC > SRR4302533.2538692/1‑94 (MQ=60)
CGGTTTTCTTTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCT > SRR4302533.4296359/1‑94 (MQ=60)
GGTTTTCTTTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACTCGATTTTCACCTGCTTTGTTTGCCGGAAGCTT > SRR4302533.2054444/1‑94 (MQ=60)
GGTTTTCTTTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTT < SRR4302533.4471345/94‑1 (MQ=60)
GGTTTTCTTTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTT > SRR4302533.5273334/1‑94 (MQ=60)
GTTTTCTTTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTA > SRR4302533.3462546/1‑94 (MQ=60)
GTTTTCTTTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTA > SRR4302533.5642463/1‑94 (MQ=60)
TTTCTTTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACT > SRR4302533.2338575/1‑94 (MQ=60)
TTCTTTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACTT < SRR4302533.3430620/94‑1 (MQ=60)
TTCTTTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACTT < SRR4302533.6340637/94‑1 (MQ=60)
TTTTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACTTAA < SRR4302533.1649127/94‑1 (MQ=60)
CTTTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACTTAA > SRR4302533.1421216/1‑94 (MQ=60)
TTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACTTAAAT > SRR4302533.1497543/1‑94 (MQ=60)
TATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACTTAAATT < SRR4302533.4689081/94‑1 (MQ=60)
TCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACTTAAATTAT < SRR4302533.4519487/94‑1 (MQ=60)
CATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACTTAAATTATC > SRR4302533.4564894/1‑94 (MQ=60)
CATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACTTAAATTATC < SRR4302533.373654/94‑1 (MQ=60)
TTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACTTAAATTATCCT < SRR4302533.4074139/94‑1 (MQ=60)
TTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACTTAAATTATCCT > SRR4302533.4988736/1‑94 (MQ=60)
TTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACTTAAATTATCCT > SRR4302533.5839560/1‑94 (MQ=60)
TAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACTTAAATTATCCTT > SRR4302533.3684948/1‑94 (MQ=60)
AATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACTTAAATTATCCTTT < SRR4302533.563566/94‑1 (MQ=60)
AATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACTTAAATTATCCTTT > SRR4302533.4875610/1‑94 (MQ=60)
AATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACTTAAATTATCCTTT < SRR4302533.3720623/94‑1 (MQ=60)
AATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACTTAAATTATCCTTT < SRR4302533.2643072/94‑1 (MQ=60)
ATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACTTAAATTATCCTTTT > SRR4302533.779186/1‑94 (MQ=60)
ATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACTTAAATTATCCTTTA > SRR4302533.1420746/1‑94 (MQ=60)
ATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACTTAAATTATCCTTTA > SRR4302533.2465055/1‑94 (MQ=60)
TGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACTTAAATTATCCTTTAT < SRR4302533.4532425/94‑1 (MQ=60)
GATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACTTAAATTATCCTTTATC < SRR4302533.5767803/94‑1 (MQ=60)
GATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACTTAAATTATCCTTTATC > SRR4302533.5050338/1‑94 (MQ=60)
ATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACTTAAATTATCCTTTATCA < SRR4302533.2453178/94‑1 (MQ=60)
TATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACTTAAATTATCCTTTATCAG > SRR4302533.4618228/1‑94 (MQ=60)
TTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACTTAAATTATCCTTTATCAGCG < SRR4302533.155403/94‑1 (MQ=60)
TAAAGCGCAGGTGGTTTTCGTCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACTTAAATTATCCTTTATCAGCGC < SRR4302533.3262251/94‑1 (MQ=60)
TAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACTTAAATTATCCTTTATCAGCGC > SRR4302533.6342293/1‑94 (MQ=60)
TAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACTTAAATTATCCTTTATCAGCGC > SRR4302533.3814789/1‑94 (MQ=60)
AAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACTTAAATTATCCTTTATCAGCGCCA > SRR4302533.3534593/1‑94 (MQ=60)
AGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACTTAAGTTATCCTTTATCAGCGCCAG > SRR4302533.5653076/1‑94 (MQ=60)
AGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACTTAAATTATCCTTTATCAGCGCCAG < SRR4302533.4848255/94‑1 (MQ=60)
AGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACTTAAATTATCCTTTATCAGCGCCAG < SRR4302533.1269040/94‑1 (MQ=60)
GCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACTTAAATTATCCTTTATCAGCGCCAGC < SRR4302533.5079509/94‑1 (MQ=60)
CGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACTTAAATTATCCTTTATCAGCGCCAGCG < SRR4302533.5915228/94‑1 (MQ=60)
GAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACTTAAATTATCCTTTATCAGCGCCAGCGCT < SRR4302533.6170520/94‑1 (MQ=60)
CAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACTTAAATTATCCTTTATCAGCGCCAGCGCT > SRR4302533.4807208/1‑94 (MQ=60)
CAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACTTAAATTATCCTTTATCAGCGCCAGCGCT < SRR4302533.6170519/94‑1 (MQ=60)
AGGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACTTAAATTATCCTTTATCAGCGCCAGCGCTT > SRR4302533.769090/1‑94 (MQ=60)
GGTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACTTAAATTATCCTTTATCAGCGCCAGCGCTTC > SRR4302533.1085243/1‑94 (MQ=60)
GTGTTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACTTAAATTATCCTTTATCAGCGCCAGCGCTTCT < SRR4302533.4445282/94‑1 (MQ=60)
GTGGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACTTAAATTATCCTTTATCAGCGCCAGCGCTTCT < SRR4302533.2683143/94‑1 (MQ=60)
GGTTTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGACGCTTACTTAAATTATCCTTTATCAGCGCCAGCGCTTCTTT < SRR4302533.4585589/94‑1 (MQ=60)
TTTCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACTTAAATTATCCTTTATCAGCGCCAGCGCTTCTTTACT < SRR4302533.2633679/94‑1 (MQ=60)
TCGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACTTAAATTATCCTTTATCAGCGCCAGCGCTTCTTTACTGC > SRR4302533.1955695/1‑94 (MQ=60)
CGGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACTTAAATTATCCTTTATCAGCGCCAGCGCTTCTTTACTGCC > SRR4302533.5622332/1‑94 (MQ=60)
GGCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACTTAAATTATCCTTTATCAGCGCCAGCGCTTCTTTACTGCCG > SRR4302533.1071835/1‑94 (MQ=60)
GCTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACTTAAATTATCCTTTATCAGCGCCAGCGCTTCTTTACTGCCGA > SRR4302533.2582230/1‑94 (MQ=60)
CTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACTTAAATTATCCTTTATCAGCGCCAGCGCTTCTTTACTGCCGAT > SRR4302533.2994500/1‑94 (MQ=60)
CTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACTTAAATTATCCTTTATCAGCGCCAGCGCTTCTTTACTGCCGAT > SRR4302533.5703654/1‑94 (MQ=60)
CTTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACTTAAATTATCCTTTATCAGCGCCAGCGCTTCTTTACTGCCGAT > SRR4302533.3481710/1‑94 (MQ=60)
TTTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACTTAAATTATCCTTTATCAGCGCCAGCGCTTCTTTACTGCCGATA < SRR4302533.92336/94‑1 (MQ=60)
TTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACTTAAATTATCCTTTATCAGCGCCAGCGCTTCTTTACTGCCGATAT < SRR4302533.4732577/94‑1 (MQ=60)
TTTGTTGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACTTAAATTATCCTTTATCAGCGCCAGCGCTTCTTTACTGCCGATAT > SRR4302533.2413641/1‑94 (MQ=60)
TGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACTTAAATTATCCTTTATCAGCGCCAGCGCTTCTTTACTGCCGATATCGCCG < SRR4302533.5889231/94‑1 (MQ=60)
TGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACTTAAATTATCCTTTATCAGCGCCAGCGCTTCTTTACTGCCGATATCGCCG > SRR4302533.5195527/1‑94 (MQ=60)
TGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACTTAAATTATCCTTTATCAGCGCCAGCGCTTCTTTACTGCCGATATCGCCG > SRR4302533.4826785/1‑94 (MQ=60)
TGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACTTAAATTATCCTTTATCAGCGCCAGCGCTTCTTTACTGCCGATATCGCCG > SRR4302533.1589851/1‑94 (MQ=60)
TGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACTTAAATTATCCTTTATCAGCGCCAGCGCTTCTTTACTGCCGATATCGCCG > SRR4302533.2568965/1‑94 (MQ=60)
|
TACCATTGGCAGGCGATAATAGAGTGCGATGCCGTTCACCCGGTTTTCTTTATCATTAATGATATTAAAGCGCAGGTGGTTTTCGGCTTTTGTCGGCCAGACGCGATTTTCAGCTGCTTTGTTAGCCGGAAGCTTACTTAAATTATCCTTTATCAGCGCCAGCGCTTCTTTACTGTCGATATCGCCG > NC_000913/1572351‑1572537
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
