Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1624 |
250.6 |
12620048 |
98.0% |
12367647 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,684,672 |
A→G |
intergenic (‑60/+83) |
fumC ← / ← fumA |
fumarase C/fumarase A |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,684,672 | 0 | A | G | 99.5%
| 629.9
/ NA
| 193 | intergenic (‑60/+83) | fumC/fumA | fumarase C/fumarase A |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (100/92); minor base C (1/0); total (101/92) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 194 total aligned reads displayed.
TCGAATCTTTTTCGCTGCGTACTGTATTCATGACCTGCTCCTCACCTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTAGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGTTTGGTCTTTCGTGCCATGTAAAAAAACCGCCCCGAAGGGCGGCTCTGTTTATTTC > NC_000913/1684582‑1684761
|
gAATCTTTTTCGCTGCGTACTGTATTCATGACCTGCTCCTCACCTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTc > 2:5422060/1‑93 (MQ=255)
gAATCTTTTTCGCTGCGTACTGTATTCATGACCTGCTCCTCACCTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTc < 1:5514643/93‑1 (MQ=255)
aTCTTTTTCGCTGCGTACTGTATTCATGACCTGCTCCTCACCTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCAc > 1:3517800/1‑93 (MQ=255)
aTCTTTTTCGCTGCGTACTGTATTCATGACCTGCTCCTCACCTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCAc < 2:2717033/93‑1 (MQ=255)
aTCTTTTTCGCTGCGTACTGTATTCATGACCTGCTCCTCACCTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCAc < 2:3543699/93‑1 (MQ=255)
cTTTTTCGCTGCGTACTGTATTCATGACCTGCTCCTCACCTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACtt < 2:6171165/93‑1 (MQ=255)
ttttCGCTGCGTACTGTATTCATGACCTGCTCCTCACCTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACttat < 1:4736540/93‑1 (MQ=255)
ttttCGCTGCGTACTGTATTCATGACCTGCTCCTCACCTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACttat < 2:4228840/93‑1 (MQ=255)
tttCGCTGCGTACTGTATTCATGACCTGCTCCTCACCTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACttatt < 1:2667899/93‑1 (MQ=255)
gCTGCGTACTGTATTCATGACCTGCTCCTCACCTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTAttt < 1:1099872/93‑1 (MQ=255)
cTGCGTACTGTATTCATGACCTGCTCCTCACCTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTa > 2:1483373/1‑93 (MQ=255)
cTGCGTACTGTATTCATGACCTGCTCCTCACCTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTa < 1:2708519/93‑1 (MQ=255)
tGCGTACTGTATTCATGACCTGCTCCTCACCTGATTATTTTTTTC‑TTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTAcc < 1:4348950/93‑1 (MQ=255)
tGCGTACTGTATTCATGACCTGCTCCTCACCTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTAc > 1:2288723/1‑93 (MQ=255)
gTACTGTATTCATGACCTGCTCCTCACCTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCAt > 2:5692879/1‑93 (MQ=255)
gTACTGTATTCATGACCTGCTCCTCACCTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCAt < 2:687641/93‑1 (MQ=255)
tACTGTATTCATGACCTGCTCCTCACCTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCAtt < 2:4410411/93‑1 (MQ=255)
tACTGTATTCATGACCTGCTCCTCACCTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCAtt > 1:5252313/1‑93 (MQ=255)
tACTGTATTCATGACCTGCTCCTCACCTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCAtt > 2:2823009/1‑93 (MQ=255)
aCTGTTTTCATGCCCTGCTCTTCACCTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTA‑TTACCATTTg < 2:5001018/93‑1 (MQ=255)
aCTGTATTCATGACCTGCTCCTCACCTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCAttt < 1:2170550/93‑1 (MQ=255)
tGTATTCATGACCTGCTCCTCACCTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGa > 2:303921/1‑93 (MQ=255)
gTATTCATGACCTGCTCCTCACCTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCGACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGAt > 2:3076389/1‑93 (MQ=255)
gTATTCATGACCTGCTCCTCACCTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGAt < 1:2866668/93‑1 (MQ=255)
gTATTCATGACCTGCTCCTCACCTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGAt < 1:2653014/93‑1 (MQ=255)
tATTCATGACCTGCTCCTCACCTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATa > 1:6120151/1‑93 (MQ=255)
tATTCATGACCTGCTCCTCACCTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATa < 2:5776639/93‑1 (MQ=255)
tATTCATGACCTGCTCCTCACCTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATa > 1:5588364/1‑93 (MQ=255)
tATTCATGACCTGCTCCTCACCTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATa > 1:5467545/1‑93 (MQ=255)
aTTCATGACCTGCTCCTCACCTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATaa < 2:3832357/93‑1 (MQ=255)
ttCATGACCTGCTCCTCACCTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATagc < 2:3293749/93‑3 (MQ=255)
ttCATGACCTGCTCCTCACCTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAAc > 1:646130/1‑93 (MQ=255)
ttCATGACCTGCTCCTCACCTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAAc < 2:207179/93‑1 (MQ=255)
tCATGACCTGCTCCTCACCTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACa < 2:4874382/93‑1 (MQ=255)
tCATGACCTGCTCCTCACCTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACa < 1:3664985/93‑1 (MQ=255)
tGACCTGCTCCTCACCTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAAt > 1:5641151/1‑93 (MQ=255)
gACCTGCTCCTCACCTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATg > 1:5729661/1‑93 (MQ=255)
gACCTGCTCCTCACCTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATg > 2:2934795/1‑93 (MQ=255)
gACCTGCTCCTCACCTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATg > 1:1882539/1‑93 (MQ=255)
ccTGCTCCTCACCTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGtt < 1:5155942/93‑1 (MQ=255)
ccTGCTCCTCACCTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGtt < 2:2507746/93‑1 (MQ=255)
cTGCTCCTCACCTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGttt < 2:7903/93‑1 (MQ=255)
tGCTCCTCACCTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGTTTg < 2:3616589/93‑1 (MQ=255)
tGCTCCTCACCTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGTTTg < 2:1705920/93‑1 (MQ=255)
tGCTCCTCACCTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGTTTg < 2:2872841/93‑1 (MQ=255)
tcctcACCTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGTTTGGTc < 1:5313764/93‑1 (MQ=255)
tcctcACCTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGTTTGGTc < 2:5430072/93‑1 (MQ=255)
tcACCTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGTTTGGTCttt < 1:5934330/93‑1 (MQ=255)
tcACCTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGTTTGGTCttt > 2:5110379/1‑93 (MQ=255)
tcACCTGATTAAGTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGTTTGGTCttt > 1:3406005/1‑93 (MQ=255)
cACCTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGTTTGGTCTTTc < 1:3235481/93‑1 (MQ=255)
cACCTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAAAGTTTGGTCTTTc < 1:3404053/93‑1 (MQ=255)
ccTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGTTTGGTCTTTCGt > 1:4329343/1‑93 (MQ=255)
ccTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGTTTGGTCTTTCGt > 2:3232054/1‑93 (MQ=255)
cTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGTTTGGTCTTTCGTg > 2:4037052/1‑93 (MQ=255)
cTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGTTTGGTCTTTCGTg > 2:4846376/1‑93 (MQ=255)
tGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGTTTGGTCTTTCGTGc > 2:3996006/1‑93 (MQ=255)
gATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGTTTGGTCTTTCGTGcc > 1:2960483/1‑93 (MQ=255)
aTTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGTTTGGTCTTTCGTGCCa < 2:1904579/93‑1 (MQ=255)
aTTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTCGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGTTTGGTCTTTCGTGCCa > 1:4437679/1‑93 (MQ=255)
tAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGTTTGGTCTTTCGTGCCATg > 1:628205/1‑93 (MQ=255)
aaTTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGTTTGGTCTTTCGTGCCATGt > 2:3875240/1‑93 (MQ=255)
tttttCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGTTTGGTCTTTCGTGCCATGTaaa > 2:2378621/1‑93 (MQ=255)
ttctttctGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGTTTGGTCTTTCGTGCCATGTaaaaaa > 2:2019503/1‑93 (MQ=255)
tctttctGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGTTTGGTCTTTCGTGCCATGTaaaaaaa > 2:3428574/1‑93 (MQ=255)
ctttctGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGTTTGGTCTTTCGTGCCATGTAAAAAAAc < 1:2135792/93‑1 (MQ=255)
ctttctGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGTTTGGTCTTTCGTGCCATGTAAAAAAAc < 1:6193418/93‑1 (MQ=255)
tttctGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGTTTGGTCTTTCGTGCCATGTAAAAAAAcc < 1:4987454/93‑1 (MQ=255)
tctGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGTTTGGTCTTTCGTGCCATGTAAAAAAACCGc < 2:2627047/93‑1 (MQ=255)
tctGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGTTTGGTCTTTCGTGCCATGTAAAAAAACCGc > 2:5207266/1‑93 (MQ=255)
tctGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGTTTGGTCTTTCGTGCCATGTAAAAAAACCGc < 2:446698/93‑1 (MQ=255)
ctGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGTTTGGTCTTTCGTGCCATGTAAAAAAACCGcc < 2:3276928/93‑1 (MQ=255)
ctGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGTTTGGTCTTTCGTGCCATGTAAAAAAACCGcc > 2:5995595/1‑93 (MQ=255)
tGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGTTTGGTCTTTCGTGCCATGTAAAAAAACCGccc < 2:6074372/93‑1 (MQ=255)
gTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGTTTGGTCTTTCGTGCCATGTAAAAAAACCGcccc < 1:507761/93‑1 (MQ=255)
ttGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGTTTGGTCTTTCGTGCCATGTAAAAAAACCGCCCCGaa > 2:127375/1‑93 (MQ=255)
ttGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGTTTGGTCTTTCGTGCCATGTAAAAAAACCGCCCCGaa < 2:1414580/93‑1 (MQ=255)
ttGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGTTTGGTCTTTCGTGCCATGTAAAAAAACCGCCCCGaa > 1:4759100/1‑93 (MQ=255)
ttGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGTTTGGTCTTTCGTGCCATGTAAAAAAACCGCCCCGaa > 2:5273100/1‑93 (MQ=255)
gCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGTTTGGTCTTTCGTGCCATGTAAAAAAACCGCCCCGAAgg > 1:1652571/1‑93 (MQ=255)
gCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGTTTGGTCTTTCGTGCCATGTAAAAAAACCGCCCCGAAgg > 2:2130797/1‑93 (MQ=255)
tttCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGTTTGGTCTTTCGTGCCATGTAAAAAAACCGCCCCGAAGggc > 2:5629035/1‑93 (MQ=255)
ttCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGTTTGGTCTTTCGTGCCATGTAAAAAAACCGCCCCGAAGggcg > 2:5392600/1‑93 (MQ=255)
ttCGTAAAGCATCTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGTTTGGTCTTTCGTGCCATGTAAAAAAACCGCCCCGAAGggcg < 2:6111487/93‑1 (MQ=255)
cGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGTTTGGTCTTTCGTGCCATGTAAAAAAACCGCCCCGAAGggcggc < 2:2424231/93‑1 (MQ=255)
gTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGTTTGGTCTTTCGTGCCATGTAAAAAAACCGCCCCGAAGGGCGGct < 1:1435551/93‑1 (MQ=255)
ttAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGTTTGGTCTTTCGTGCCATGTAAAAAAACCGCCCCGAAGAGCGGctc > 1:6044140/1‑93 (MQ=255)
tAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGTTTGGTCTTTCGTGCCATGTAAAAAAACCGCCCCGAAGGGCGGctct < 2:459184/93‑1 (MQ=255)
aaGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGTTTGGTCTTTCGTGCCATGTAAAAAAACCGCCCCGAAGGGCGGCTCTg > 1:1191977/1‑93 (MQ=255)
aaGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGTTTGGTCTTTCGTGCCATGTAAAAAAACCGCCCCGAAGGGCGGCTCTg < 2:3310199/93‑1 (MQ=255)
gCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGTTTGGTCTTTCGTGCCATGTAAAAAAACCGCCCCGAAGGGCGGCTCTGtt > 1:4296426/1‑93 (MQ=255)
aaCTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGTTTGGTCTTTCGTGCCATGTAAAAAAACCGCCCCGAAGGGCGGCTCTGTTTa > 2:5529197/1‑93 (MQ=255)
aaCTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGTTTGGTCTTTCGTGCCATGTAAAAAAACCGCCCCGAAGGGCGGCTCTGTTTa > 1:5350125/1‑93 (MQ=255)
aCTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGTTTGGTCTTTCGTGCCATGTAAAAAAACCGCCCCGAAGGGCGGCTCTGTTTAt > 1:3978825/1‑93 (MQ=255)
aCTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGTTTGGTCTTTCGTGCCATGTAAAAAAACCGCCCCGAAGGGCGGCTCTGTTTAt < 1:1742913/93‑1 (MQ=255)
aCTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGTTTGGTCTTTCGTGCCATGTAAAAAAACCGCCCCGAAGGGCGGCTCTGTTTAt > 2:5148492/1‑93 (MQ=255)
aCTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGTTTGGTCTTTCGTGCCATGTAAAAAAACCGCCCCGAAGGGCGGCTCTGTTTAt > 2:2525803/1‑93 (MQ=255)
ttttGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGTTTGGTCTTTCGTGCCATGTAAAAAAACCGCCCCGAAGGGCGGCTCTGTTTAttt > 1:2077460/1‑93 (MQ=255)
tttGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGTTTGGTCTTTCGTGCCATGTAAAAAAACCGCCCCGAAGGGCGGCTCTGTTTATTTc < 2:5158812/93‑1 (MQ=255)
tttGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGTTTGGTCTTTCGTGCCATGTAAAAAAACCGCCCCGAAGGGCGGCTCTGTTTATTTc > 1:5808912/1‑93 (MQ=255)
|
TCGAATCTTTTTCGCTGCGTACTGTATTCATGACCTGCTCCTCACCTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTAGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGTTTGGTCTTTCGTGCCATGTAAAAAAACCGCCCCGAAGGGCGGCTCTGTTTATTTC > NC_000913/1684582‑1684761
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CCATCGAATCTTTTTCGCTGCGTACTGTATTCATGACCTGCTCCTCACCTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTAGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGTTTGGTCTTTCGTGCCATGTAAAAAAACCGCCCCGAAGGGCGGCTCTGTTTATTTCACAC > NC_000913/1684579‑1684765
|
CCATCGAATCTTTTTCGCTGCGTACTGTATTCATGACCTGCTCCTCACCTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTG > SRR4302533.145523/1‑94 (MQ=60)
CCATCGAATCTTTTTCGCTGCGTACTGTATTCATGACCTGCTCCTCACCTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTG > SRR4302533.2300385/1‑94 (MQ=60)
CATCGAATCTTTTTCGCTGCGTACTGTATTCATGACCTGCTCCTCACCTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGG > SRR4302533.1423137/1‑94 (MQ=60)
ATCGAATCTTTTTCGCTGCGTACTGTATTCATGACCTGCTCCTCACCTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGC < SRR4302533.931607/94‑1 (MQ=60)
ATCGAATCTTTTTCGCTGCGTACTGTATTCATGACCTGCTCCTCACCTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGC > SRR4302533.3526716/1‑94 (MQ=60)
ATCGAATCTTTTTCGCTGCGTACTGTATTCATGACCTGCTCCTCACCTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGC < SRR4302533.5649138/94‑1 (MQ=60)
CGAATCTTTTTCGCTGCGTACTGTATTCATGACCTGCTCCTCACCTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTC > SRR4302533.2701623/1‑94 (MQ=60)
GAATCTTTTTCGCTGCGTACTGTATTCATGACCTGCTCCTCACCTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCA < SRR4302533.5547936/94‑1 (MQ=60)
AATCTTTTTCGCTGCGTACTGTATTCATGACCTGCTCCTCACCTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCAC > SRR4302533.3539488/1‑94 (MQ=60)
AATCTTTTTCGCTGCGTACTGTATTCATGACCTGCTCCTCACCTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCAC < SRR4302533.1878469/94‑1 (MQ=60)
TTTTTCGCTGCGTACTGTATTCATGACCTGCTCCTCACCTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTAT > SRR4302533.6080622/1‑94 (MQ=60)
TTTTCGCTGCGTACTGTATTCATGACCTGCTCCTCACCTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATT < SRR4302533.4765260/94‑1 (MQ=60)
TTTTCGCTGCGTACTGTATTCATGACCTGCTCCTCACCTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATT < SRR4302533.2677036/94‑1 (MQ=60)
TTTCGCTGCGTACTGTATTCATGACCTGCTCCTCACCTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTA < SRR4302533.2684270/94‑1 (MQ=60)
TTTCGCTGCGTACTGTATTCATGACCTGCTCCTCACCTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTA > SRR4302533.5585856/1‑94 (MQ=60)
TCGCTGCGTACTGTATTCATGACCTGCTCCTCACCTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATT > SRR4302533.6164481/1‑94 (MQ=60)
GCTGCGTACTGTATTCATGACCTGCTCCTCACCTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTA < SRR4302533.1106391/94‑1 (MQ=60)
GCTGCGTACTGTATTCATGACCTGCTCCTCACCTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTA > SRR4302533.5119210/1‑94 (MQ=60)
CTGCGTACTGTATTCATGACCTGCTCCTCACCTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTAC > SRR4302533.5364531/1‑94 (MQ=60)
CTGCGTACTGTATTCATGACCTGCTCCTCACCTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTAC < SRR4302533.2725140/94‑1 (MQ=60)
CTGCGTACTGTATTCATGACCTGCTCCTCACCTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTAC > SRR4302533.2302895/1‑94 (MQ=60)
TGCGTACTGTATTCATGACCTGCTCCTCACCTGATTATTTTTTTC‑TTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCA < SRR4302533.4375170/94‑1 (MQ=60)
GCGTACTGTATTCATGACCTGCTCCTCACCTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCA < SRR4302533.2881106/94‑1 (MQ=60)
CGTACTGTATTCATGACCTGCTCCTCACCTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCAT > SRR4302533.5721006/1‑94 (MQ=60)
CGTACTGTATTCATGACCTGCTCCTCACCTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCAT < SRR4302533.3564727/94‑1 (MQ=60)
GTACTGTATTCATGACCTGCTCCTCACCTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATT > SRR4302533.5944594/1‑94 (MQ=60)
GTACTGTATTCATGACCTGCTCCTCACCTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATT > SRR4302533.5283870/1‑94 (MQ=60)
TACTGTATTCATGACCTGCTCCTCACCTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTT > SRR4302533.5259943/1‑94 (MQ=60)
ACTGTATTCATGACCTGCTCCTCACCTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTG < SRR4302533.5671897/94‑1 (MQ=60)
ACTGTATTCATGACCTGCTCCTCACCTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTG < SRR4302533.2183898/94‑1 (MQ=60)
TGTATTCATGACCTGCTCCTCACCTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGAT < SRR4302533.3943786/94‑1 (MQ=60)
TGTATTCATGACCTGCTCCTCACCTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGAT > SRR4302533.4779861/1‑94 (MQ=60)
GTATTCATGACCTGCTCCTCACCTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATA < SRR4302533.2669312/94‑1 (MQ=60)
GTATTCATGACCTGCTCCTCACCTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATA > SRR4302533.5500498/1‑94 (MQ=60)
GTATTCATGACCTGCTCCTCACCTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATA > SRR4302533.6157057/1‑94 (MQ=60)
GTATTCATGACCTGCTCCTCACCTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATA < SRR4302533.2884305/94‑1 (MQ=60)
GTATTCATGACCTGCTCCTCACCTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATA > SRR4302533.5622128/1‑94 (MQ=60)
ATTCATGACCTGCTCCTCACCTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAAC > SRR4302533.649937/1‑94 (MQ=60)
TTCATGACCTGCTCCTCACCTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACA < SRR4302533.493199/94‑1 (MQ=60)
TCATGACCTGCTCCTCACCTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAA < SRR4302533.3687513/94‑1 (MQ=60)
CATGACCTGCTCCTCACCTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGATTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAA > SRR4302533.1213402/1‑94 (MQ=60)
ATGACCTGCTCCTCACCTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAAT < SRR4302533.4331225/94‑1 (MQ=60)
ATGACCTGCTCCTCACCTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAAT > SRR4302533.5675249/1‑94 (MQ=60)
TGACCTGCTCCTCACCTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATG > SRR4302533.1894001/1‑94 (MQ=60)
TGACCTGCTCCTCACCTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATG > SRR4302533.5764260/1‑94 (MQ=60)
CCTGCTCCTCACCTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGTTT < SRR4302533.5187075/94‑1 (MQ=60)
TGCTCCTCACCTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGTTTGG < SRR4302533.2286643/94‑1 (MQ=60)
GCTCCTCACCTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGTTTGGT > SRR4302533.441167/1‑94 (MQ=60)
TCCTCACCTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGTTTGGTCT < SRR4302533.5345605/94‑1 (MQ=60)
CCTCCCCTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGTTTGGTCTT < SRR4302533.1616915/94‑1 (MQ=60)
CTCACCTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGTTTGGTCTTT < SRR4302533.216774/94‑1 (MQ=60)
CTCACCTGATTAAGTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGTTTGGTCTTT > SRR4302533.3427042/1‑94 (MQ=60)
TCACCTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGTTTGGTCTTTC > SRR4302533.5394153/1‑94 (MQ=60)
TCACCTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGTTTGGTCTTTC < SRR4302533.5970205/94‑1 (MQ=60)
CACCTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGTTTGGTCTTTCG < SRR4302533.3255417/94‑1 (MQ=60)
CACCTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAAAGTTTGGTCTTTCG < SRR4302533.3425071/94‑1 (MQ=60)
ACCTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGTTTGGTCTTTCGT > SRR4302533.4355427/1‑94 (MQ=60)
TGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGTTTGGTCTTTCGTGCC > SRR4302533.2978581/1‑94 (MQ=60)
GATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTCGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGTTTGGTCTTTCGTGCCA > SRR4302533.4464505/1‑94 (MQ=60)
ATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGTTTGGTCTTTCGTGACAT < SRR4302533.2974708/94‑1 (MQ=60)
TTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGTTTGGTCTTTCGTGCCATG > SRR4302533.631898/1‑94 (MQ=60)
TAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGTTTGGTCTTTCGTGCCATGT > SRR4302533.5822909/1‑94 (MQ=60)
AATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGTTTGGTCTTTCGTGCCATGTA < SRR4302533.460393/94‑1 (MQ=60)
ATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGTTTGGTCTTTCGTGCCATGTAA < SRR4302533.3362469/94‑1 (MQ=60)
CTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGTTTGGTCTTTCGTGCCATGTAAAAAAACC < SRR4302533.6230583/94‑1 (MQ=60)
CTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGTTTGGTCTTTCGTGCCATGTAAAAAAACC < SRR4302533.2148961/94‑1 (MQ=60)
TTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGTTTGGTCTTTCGTGCCATGTAAAAAAACCG < SRR4302533.5017694/94‑1 (MQ=60)
TTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGTTTGGTCTTTCGTGCCATGTAAAAAAACCGC > SRR4302533.6111670/1‑94 (MQ=60)
TTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGTTTGGTCTTTCGTGCCATGTAAAAAAACCGC > SRR4302533.6326019/1‑94 (MQ=60)
TCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGTTTGGTCTTTCGTGCCATGTAAAAAAACCGCC > SRR4302533.2035387/1‑94 (MQ=60)
CTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGTTTGGTCTTTCGTGCCATGTAAAAAAACCGCCC > SRR4302533.3201657/1‑94 (MQ=60)
GTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGTTTGGTCTTTCGTGCCATGTAAAAAAACCGCCCCG < SRR4302533.510776/94‑1 (MQ=60)
TTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGTTTGGTCTTTCGTGCCATGTAAAAAAACCGCCCCGA > SRR4302533.1734221/1‑94 (MQ=60)
TTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATCTTTGGTATTTCGTGCCATGTAAAAAAACCGCCCCGA > SRR4302533.4200914/1‑94 (MQ=60)
TTTGCTTTCGTTAGGCACCTGGTGGCTCACTAATTATTTCCCATTTGATAACAAATGTGTGGTCTTGCGGGCCATGTAAAAAAACCGCCCCGAA < SRR4302533.2382698/94‑1 (MQ=44)
TTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGTTTGGTCTTTCGTGCCATGTAAAAAAACCGCCCCGAA > SRR4302533.4787971/1‑94 (MQ=60)
TTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATTTTTGTTCTTCCGTGCCATGAAAAAAAACCGCCCCGAAG < SRR4302533.5461447/94‑1 (MQ=60)
TGCTTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGTTTGGTCTTTCGTGCCATGTAAAAAAACCGCCCCGAAGG > SRR4302533.1662579/1‑94 (MQ=60)
TTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGTTTGGTCTTTCGTGCCATGTAAAAAAACCGCCCCGAAGGGCG < SRR4302533.2137957/94‑1 (MQ=60)
TTTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGTTTGGTCTTTCGTGCCATGTAAAAAAACCGCCCCGAAGGGCG < SRR4302533.2414676/94‑1 (MQ=60)
TTCGTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGTTTGGTCTTTCGTGCCATGTAAAAAAACCGCCCCGAAGGGCGG < SRR4302533.5290766/94‑1 (MQ=60)
GTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGTTTGGTCTTTCGTGCCATGTAAAAAAACCGCCCCGAAGGGCGGCTC < SRR4302533.1444218/94‑1 (MQ=60)
GTTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGTTTGGTCTTTCGTGCCATGTAAAAAAACCGCCCCGAAGAGCGGCTC > SRR4302533.6080757/1‑94 (MQ=60)
TTAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGTTTGGTCTTTCGTGCCATGTAAAAAAACCGCCCCGAAGGGCGGCTCT > SRR4302533.5038912/1‑94 (MQ=60)
TAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGTTTGGTCTTTCGTGCCATGTAAAAAAACTGCCCCGAAGGGCGGCTCTG > SRR4302533.437183/1‑94 (MQ=60)
TAAGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGTTTGGTCTTTCGTGCCATGTAAAAAAACCGCCCCGAAGGGCGGCTCTG > SRR4302533.1199138/1‑94 (MQ=60)
AGCAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGTTTGGTCTTTCGTGCCATGTAAAAAAACCGCCCCGAAGGGCGGCTCTGTT > SRR4302533.4322265/1‑94 (MQ=60)
CAACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGTTTGGTCTTTCGTGCCATGTAAAAAAACCGCCCCGAAGGGCGGCTCTGTTTA > SRR4302533.5382227/1‑94 (MQ=60)
AACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGTTTGGTCTTTCGTGCCATGTAAAAAAACCGCCCCGAAGGGCGGCTCTGTTTAT > SRR4302533.4003049/1‑94 (MQ=60)
ACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGTTTGGTCTTTCGTGCCATGTAAAAAAACCGCCCCGAAGGGCGGCTCTGTTTATT < SRR4302533.1753509/94‑1 (MQ=60)
ACTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGTTTGGTCTTTCGTGCCATGTAAAAAAACCGCCCCGAAGGGCGGCTCTGTTTATT > SRR4302533.6244633/1‑94 (MQ=60)
CTTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGTTTGGTCTTTCGTGCCATGTAAAAAAACCGCCCCGAAGGGCGGCTCTGTTTATTT > SRR4302533.2090246/1‑94 (MQ=60)
TTTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGTTTGGTCTTTCGTGCCATGTAAAAAAACCGCCCCGAAGGGCGGCTCTGTTTATTTC > SRR4302533.5843990/1‑94 (MQ=60)
TTTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGTTTGGTCTTTCGTGCCATGTAAAAAAACCGCCCCGAAGGGCGGCTCTGTTTATTTCA > SRR4302533.891476/1‑94 (MQ=60)
TTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGTTTGGTCTTTCGTGCCATGTAAAAAAACCGCCCCGAAGGGCGGCTCTGTTTATTTCAC > SRR4302533.1909936/1‑94 (MQ=60)
TTGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGTTTGGTCTTTCGTGCCATGTAAAAAAACCGCCCCGAAGGGCGGCTCTGTTTATTTCAC < SRR4302533.6181206/94‑1 (MQ=60)
TGGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGTTTGGTCTTTCGTGCCATGTAAAAAAACCGCCCCGAAGGGCGGCTCTGTTTATTTCACA > SRR4302533.1250871/1‑94 (MQ=60)
GGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGTTTGGTCTTTCGTGCCATGTAAAAAAACCGCCCCGAAGGGCGGCTCTGTTTATTTCACAC > SRR4302533.1151122/1‑94 (MQ=60)
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CCATCGAATCTTTTTCGCTGCGTACTGTATTCATGACCTGCTCCTCACCTGATTAATTTTTTCTTTCTGTTTTGCTTTCGTTAAGCAACTTTTAGCTCACTTATTATTTACCATTTGATAACAAATGTTTGGTCTTTCGTGCCATGTAAAAAAACCGCCCCGAAGGGCGGCTCTGTTTATTTCACAC > NC_000913/1684579‑1684765
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
