Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1624 |
250.6 |
12620048 |
98.0% |
12367647 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,698,072 |
C→T |
R232C (CGT→TGT) |
malX → |
MalX |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,698,072 | 0 | C | T | 100.0%
| 722.8
/ NA
| 193 | R232C (CGT→TGT) | malX | MalX |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (79/114); total (79/114) |
Only 100 of 199 total aligned reads displayed.
TGGCCGATTTTCGCCATGGGTATTAGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAACGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCGGCACGCAGGAAGTCTGCGGTCA > NC_000913/1697982‑1698160
|
tGGCCGATTTTCGCCATGGGTATTAGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGt < 1:2371380/93‑1 (MQ=255)
ggCCGATTTTCGCCATGGGTATTAGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTc < 1:3271383/93‑1 (MQ=255)
ggCCGATTTTCGCCATGGGTATTAGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTc < 2:2551274/93‑1 (MQ=255)
ggCCGATTTTCGCCATGGGTATTAGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTc > 2:3252660/1‑93 (MQ=255)
ggCCGATTTTCGCCATGGGTATTAGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTc < 2:4579989/93‑1 (MQ=255)
ggCCGATTTTCGCCATGGGTATTAGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTc < 2:4431215/93‑1 (MQ=255)
gCCGATTTTCGCCATGGGTATTAGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTct < 1:3722288/93‑1 (MQ=255)
cGATTTTCGCCATGGGTATTAGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTctgc > 2:3951092/1‑93 (MQ=255)
cGATTTTCGCCATGGGTATTAGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTctgc > 2:3630548/1‑93 (MQ=255)
cGATTTTCGCCATGGGTATTAGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTctgc > 1:399723/1‑93 (MQ=255)
gATTTTCGCCATGGGTATTAGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTctgct > 2:3286465/1‑93 (MQ=255)
gATTTTCGCCATGGGTATTAGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTctgct > 1:2677049/1‑93 (MQ=255)
gATTTTCGCCATGGGTATTAGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTctgct < 2:4073346/93‑1 (MQ=255)
ttttCGCCATGGGTATTAGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGt < 2:3716511/93‑1 (MQ=255)
tttCGCCATGGGTATTAGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGtt < 2:5251681/93‑1 (MQ=255)
tCGCCATGGGTATTAGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGc < 1:5600466/93‑1 (MQ=255)
cGCCATGGGTATTAGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGcc < 2:435337/93‑1 (MQ=255)
cGCCATGGGTATTAGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGcc < 2:2937201/93‑1 (MQ=255)
cGCCATGGGTATTAGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGcc < 2:838843/93‑1 (MQ=255)
gCCATGGGTATTAGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCg > 2:26347/1‑93 (MQ=255)
gCCATGGGTATTAGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCg < 1:488152/93‑1 (MQ=255)
ccATGGGTATTAGCGGCTTGTGCCATATGATAAACAGCGAGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGt < 1:2967178/93‑1 (MQ=255)
cATGGGTATTAGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGtt < 2:1403337/93‑1 (MQ=255)
aTGGGTATTAGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGCTTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGttt > 1:836052/1‑93 (MQ=255)
tGGGTATTAGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTg < 2:5055534/93‑1 (MQ=255)
ggTATTAGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGt < 1:1018305/93‑1 (MQ=255)
ggTATTAGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGt > 1:1970794/1‑93 (MQ=255)
tATTAGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCt > 1:1457986/1‑93 (MQ=255)
tATTAGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCt > 2:1998865/1‑93 (MQ=255)
cGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATca > 1:3862126/1‑93 (MQ=255)
ggCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATcac > 1:5659041/1‑93 (MQ=255)
ggCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATcac < 2:1099581/93‑1 (MQ=255)
ggCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGGGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATcac > 2:1251389/1‑93 (MQ=255)
gCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATcaca < 2:1576182/93‑1 (MQ=255)
gCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATcaca < 2:3347719/93‑1 (MQ=255)
gCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATcaca < 1:2127884/93‑1 (MQ=255)
gCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATcaca > 1:3663137/1‑93 (MQ=255)
cTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACAt < 1:667453/93‑1 (MQ=255)
gCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCtgg < 2:5318820/93‑1 (MQ=255)
gCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGCTTGGTCTGCATCACATTCtgg > 2:5397685/1‑93 (MQ=255)
ccATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTCCCGGGGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCtggt < 1:2544321/93‑1 (MQ=255)
ccATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCtggt < 2:1634934/93‑1 (MQ=255)
ccATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCtggt > 1:306125/1‑93 (MQ=255)
cATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCtggtg > 2:2727741/1‑93 (MQ=255)
tatGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGc > 1:5272456/1‑93 (MQ=255)
atGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCa < 2:5412249/93‑1 (MQ=255)
tGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCAt > 2:3482929/1‑93 (MQ=255)
aTAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTa > 1:1463695/1‑93 (MQ=255)
tAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTaa < 2:1811485/93‑1 (MQ=255)
tAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTaa < 2:5474961/93‑1 (MQ=255)
aCAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTc < 1:3193919/93‑1 (MQ=255)
aCAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTc > 1:3092912/1‑93 (MQ=255)
cAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCg < 2:1218589/93‑1 (MQ=255)
aGCGCGCGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACTGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGc < 2:6064884/93‑1 (MQ=255)
gcgcGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCt < 1:785988/93‑1 (MQ=255)
gcgcGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCt < 1:4342805/93‑1 (MQ=255)
gcgGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCttt > 2:2531615/1‑93 (MQ=255)
cgGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTa > 1:2936014/1‑93 (MQ=255)
cgGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTa < 1:5030/93‑1 (MQ=255)
cgGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTa > 2:6193476/1‑93 (MQ=255)
cgGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTa > 1:2337644/1‑93 (MQ=255)
gggTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTAc > 2:4227249/1‑93 (MQ=255)
gggTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTAc > 1:445713/1‑93 (MQ=255)
ggTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTAcc < 1:3463056/93‑1 (MQ=255)
ggTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTAcc < 2:4909418/93‑1 (MQ=255)
ggTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTAcc > 2:4967846/1‑93 (MQ=255)
ggTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTAcc < 2:5965466/93‑1 (MQ=255)
ggTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTAcc < 1:3417061/93‑1 (MQ=255)
gTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCg > 1:5199916/1‑93 (MQ=255)
tGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGa < 1:2488712/93‑1 (MQ=255)
gATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGAc < 1:1016432/93‑1 (MQ=255)
tttCGGACCGATGCTGGTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTTGTCTGCATCACATTCTGGTTGCATTAATTTGCTTTACCGACGc > 2:2058831/1‑93 (MQ=255)
tCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAg < 1:3970113/93‑1 (MQ=255)
tCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAg < 1:4810371/93‑1 (MQ=255)
ggACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAggc > 1:3313499/1‑93 (MQ=255)
gACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAggcg > 1:6034544/1‑93 (MQ=255)
cGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAggcggcc > 1:1618988/1‑92 (MQ=255)
cGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCGGCa > 1:4581056/1‑93 (MQ=255)
caTGCTGTTTGGTACCGGTGAAGGTCGACTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCGGCAc < 2:4283785/92‑1 (MQ=255)
gCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCGGCACGCa > 1:2726/1‑93 (MQ=255)
gCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCGGCACGCa < 2:6131981/93‑1 (MQ=255)
cTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCGGCACGCAg > 1:6221834/1‑93 (MQ=255)
tGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCGGCACGCAgg < 1:3819392/93‑1 (MQ=255)
tGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCGGCACGCAgg > 2:5566088/1‑93 (MQ=255)
tGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCGGCACGCAgg > 2:1124884/1‑93 (MQ=255)
gTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCGGCACGCAGGa < 2:2206273/93‑1 (MQ=255)
tttGGTACCGTTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCGGCACGCAGGaa < 2:1695054/93‑1 (MQ=255)
ttGGTACCGGTGAATGTCTTCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCGGCACGCAGGAAg < 1:6132632/93‑1 (MQ=255)
ttGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCGGCACGCAGGAAg < 1:1300911/93‑1 (MQ=255)
ggTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCGGCACGCAGGAAGTc < 2:471663/93‑1 (MQ=255)
ggTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCGGCACGCAGGAAGTc < 1:6078067/93‑1 (MQ=255)
ggTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCGGCACGCAGGAAGTc < 1:1383687/93‑1 (MQ=255)
aCCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCGGCACGCAGGAAGTCTGc < 1:1069509/93‑1 (MQ=255)
aCCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCGGCACGCAGGAAGTCTGc > 1:1838334/1‑93 (MQ=255)
ccGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCGGCACGCAGGAAGTCTGCg < 2:4849266/93‑1 (MQ=255)
ccGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCGGCACGCAGGAAGTCTGCg > 1:414389/1‑93 (MQ=255)
cGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCGGCACGCAGGAAGTCTGCgg > 2:3866556/1‑93 (MQ=255)
ggTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCGGCACGCAGGAAGTCTGCGGt > 1:4812213/1‑93 (MQ=255)
ggTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCGGCACGCAGGAAGTCTGCGGt < 2:3117795/93‑1 (MQ=255)
tGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCGGCACGCAGGAAGTCTGCGGTCa > 1:5999582/1‑93 (MQ=255)
|
TGGCCGATTTTCGCCATGGGTATTAGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAACGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCGGCACGCAGGAAGTCTGCGGTCA > NC_000913/1697982‑1698160
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GTCTGGCCGATTTTCGCCATGGGTATTAGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAACGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCGGCACGCAGGAAGTCTGCGGTCAAACCG > NC_000913/1697979‑1698165
|
GTCTGGCCGATTTTCGCCATGGGTATTAGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAAT < SRR4302533.1109798/94‑1 (MQ=60)
TCTGGTCGATTTTCGCCATGGGTATTAGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATG < SRR4302533.3883954/94‑1 (MQ=60)
TCTGGCCGATTTTCGCCATGGGTATTAGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATG > SRR4302533.1296504/1‑94 (MQ=60)
CTGGCCGATTTTCGCCATGGGTATTAGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGT < SRR4302533.1258596/94‑1 (MQ=60)
CTGGCCGATTTTCGCCATGGGTATTAGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGT > SRR4302533.1512059/1‑94 (MQ=60)
TGGCCGATTTTCGCCATGGGTATTAGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTC < SRR4302533.2386052/94‑1 (MQ=60)
GGCCGATTTTCGCCATGGGTATTAGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCT < SRR4302533.3291571/94‑1 (MQ=60)
GCCGATTTTCGCCATGGGTATTAGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTG < SRR4302533.3745130/94‑1 (MQ=60)
GCCGATTTTCGCCATGGGTATTAGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTG > SRR4302533.6233274/1‑94 (MQ=60)
CCGATTTTCGCCATGGGTATTAGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGC > SRR4302533.402135/1‑94 (MQ=60)
CGATTTTCGCCATGGGTATTAGCGGCTTGGGCCATATGATTAACAGCGCGGGGGATTTCGGACGGATGCTGTTTTGTACCGGTGAATGTCTGCT > SRR4302533.3882926/1‑94 (MQ=60)
CGATTTTCGCCATGGGTATTAGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCT > SRR4302533.2693462/1‑94 (MQ=60)
CGATTTTCGCCATGGGTATTAGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCT > SRR4302533.6049000/1‑94 (MQ=60)
TTTTCGCCATGGGTATTAGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTT < SRR4302533.146146/94‑1 (MQ=60)
TTTTCGCCATGGGTATTAGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTT < SRR4302533.3732507/94‑1 (MQ=60)
TTTCGCCATGGGTATTAGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTG < SRR4302533.3090936/94‑1 (MQ=60)
TTCGCCATGGGTATTAGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGC < SRR4302533.2560788/94‑1 (MQ=60)
TCGCCATGGGTATTAGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCC < SRR4302533.3154272/94‑1 (MQ=60)
TCGCCATGGGTATTAGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCC < SRR4302533.5634303/94‑1 (MQ=60)
CGCTAGGGGTATTAGCGGCTTGGACCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCG < SRR4302533.2240329/94‑1 (MQ=60)
GCCATGGGTATTAGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGT < SRR4302533.491072/94‑1 (MQ=60)
CCATGGGTATTAGCGGCTTGTGCCATATGATAAACAGCGAGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTT < SRR4302533.2985317/94‑1 (MQ=60)
CATGGGTATTAGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGCTTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTT > SRR4302533.840951/1‑94 (MQ=60)
ATGGGTATTAGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTG > SRR4302533.517058/1‑94 (MQ=60)
ATGGGTATTAGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTG < SRR4302533.4005106/94‑1 (MQ=60)
GGGTATTAGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGT < SRR4302533.2556147/94‑1 (MQ=60)
GGGTATTAGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGT > SRR4302533.1982851/1‑94 (MQ=60)
GGTATTAGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTC < SRR4302533.1024290/94‑1 (MQ=60)
GTATTAGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCT > SRR4302533.1466777/1‑94 (MQ=60)
ATTAGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGC > SRR4302533.4790380/1‑94 (MQ=60)
ATTAGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGC > SRR4302533.4966576/1‑94 (MQ=60)
AGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTGCCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATC < SRR4302533.4295810/94‑1 (MQ=60)
GCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCA > SRR4302533.3885701/1‑94 (MQ=60)
CGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCAC > SRR4302533.5693238/1‑94 (MQ=60)
GGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACT > SRR4302533.2963650/1‑94 (MQ=60)
GGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACA > SRR4302533.3685656/1‑94 (MQ=60)
GCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACAT < SRR4302533.2141007/94‑1 (MQ=60)
GTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATT < SRR4302533.5639328/94‑1 (MQ=60)
CTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATT < SRR4302533.671396/94‑1 (MQ=60)
TTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTC < SRR4302533.4572708/94‑1 (MQ=60)
GGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTG < SRR4302533.3573697/94‑1 (MQ=60)
GCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGT > SRR4302533.307995/1‑94 (MQ=60)
GCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGT < SRR4302533.1971888/94‑1 (MQ=60)
GCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGT < SRR4302533.3483700/94‑1 (MQ=60)
CCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTCCCGGGGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTG < SRR4302533.2559979/94‑1 (MQ=60)
CCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTG > SRR4302533.2009948/1‑94 (MQ=60)
CATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGG < SRR4302533.4066601/94‑1 (MQ=60)
CATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGG < SRR4302533.780506/94‑1 (MQ=60)
CATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGG < SRR4302533.523740/94‑1 (MQ=60)
CATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGG < SRR4302533.2364386/94‑1 (MQ=60)
CATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGG > SRR4302533.330956/1‑94 (MQ=60)
ATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGC > SRR4302533.5304074/1‑94 (MQ=60)
ATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCAT < SRR4302533.5428478/94‑1 (MQ=60)
TGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATT < SRR4302533.643391/94‑1 (MQ=60)
GATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTA > SRR4302533.1472519/1‑94 (MQ=60)
AACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTC < SRR4302533.4891109/94‑1 (MQ=60)
AACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTC > SRR4302533.3111927/1‑94 (MQ=60)
ACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCG < SRR4302533.3052889/94‑1 (MQ=60)
ACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCG < SRR4302533.3213567/94‑1 (MQ=60)
ACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCG < SRR4302533.838142/94‑1 (MQ=60)
GCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTT < SRR4302533.4368977/94‑1 (MQ=60)
GCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTT < SRR4302533.790608/94‑1 (MQ=60)
GCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTA < SRR4302533.3339875/94‑1 (MQ=60)
GCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTA > SRR4302533.2953964/1‑94 (MQ=60)
GCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTA < SRR4302533.240699/94‑1 (MQ=60)
GCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTA > SRR4302533.2352111/1‑94 (MQ=60)
CGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTAC < SRR4302533.5078/94‑1 (MQ=60)
CGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTAC > SRR4302533.448379/1‑94 (MQ=60)
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GGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACC > SRR4302533.609973/1‑94 (MQ=60)
GGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCG > SRR4302533.5231264/1‑94 (MQ=60)
GGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCG < SRR4302533.3484433/94‑1 (MQ=60)
GGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCG < SRR4302533.3438173/94‑1 (MQ=60)
TGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGAC < SRR4302533.2504039/94‑1 (MQ=60)
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attcACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCTACGCAGG < SRR4302533.1385617/90‑1 (MQ=60)
TCGGACCGATTCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGG < SRR4302533.2730670/94‑1 (MQ=60)
TCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGG < SRR4302533.3994290/94‑1 (MQ=60)
TCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGG < SRR4302533.4839526/94‑1 (MQ=60)
CGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGC > SRR4302533.3333956/1‑94 (MQ=60)
GGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCG > SRR4302533.6071116/1‑94 (MQ=60)
CCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCGGCC > SRR4302533.1628795/1‑94 (MQ=60)
CCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCGGCA > SRR4302533.4608815/1‑94 (MQ=60)
CCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCGGCA > SRR4302533.1145713/1‑94 (MQ=60)
CGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCGGCAC < SRR4302533.4840356/94‑1 (MQ=60)
GATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCGGCACG > SRR4302533.1052916/1‑94 (MQ=60)
TGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCGGCACGCA < SRR4302533.3218047/94‑1 (MQ=60)
TGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCGGCACGCA > SRR4302533.2747/1‑94 (MQ=60)
GCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCGGCACGCAG > SRR4302533.6259126/1‑94 (MQ=60)
CTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCGGCACGCAGG < SRR4302533.907834/94‑1 (MQ=60)
TGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCGGCACGCAGGA < SRR4302533.3842746/94‑1 (MQ=60)
TTGGTACCGGTGAATGTCTTCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCGGCACGCAGGAAGT < SRR4302533.6169580/94‑1 (MQ=60)
TTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCGGCACGCAGGAAGT < SRR4302533.1308735/94‑1 (MQ=60)
TGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCGGCACGCAGGAAGTC > SRR4302533.2831922/1‑94 (MQ=60)
TGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCGGCACGCAGGAAGTC < SRR4302533.1467958/94‑1 (MQ=60)
TGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCCCTTTACCGACGCAGGCGGCACGCAGGAAGTC < SRR4302533.3806/94‑1 (MQ=60)
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TACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCGGCACGCAGGAAGTCTGC > SRR4302533.1849545/1‑94 (MQ=60)
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CGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCGGCACGCAGGAAGTCTGCGGT > SRR4302533.1800466/1‑94 (MQ=60)
CGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCGGCACGCAGGAAGTCTGCGGT > SRR4302533.4841380/1‑94 (MQ=60)
GGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCGGCACGCAGGAAGTCTGCGGTC < SRR4302533.5824893/94‑1 (MQ=60)
GTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCGGCACGCAGGAAGTCTGCGGTCA > SRR4302533.6035921/1‑94 (MQ=60)
AATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCGGCACGCAGGAAGTCTGCGGTCAAAC < SRR4302533.4184287/94‑1 (MQ=60)
ATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCGGCACGCAGGAAGTCTGCGGTCAAACC < SRR4302533.405499/94‑1 (MQ=60)
ATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTACCCGACGCAGGCGGCACGCAGGAAGTCTGCGGTCAAACC < SRR4302533.4582441/94‑1 (MQ=60)
TGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCGGCACGCAGGAAGTCTGCGGTCAAACCG > SRR4302533.1771029/1‑94 (MQ=60)
TGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCGGCACGCAGGAAGTCTGCGGTCAAACCG > SRR4302533.4630926/1‑94 (MQ=60)
|
GTCTGGCCGATTTTCGCCATGGGTATTAGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAACGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCGGCACGCAGGAAGTCTGCGGTCAAACCG > NC_000913/1697979‑1698165
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
