Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
1548 |
369.5 |
20095359 |
96.9% |
19472402 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,698,072 |
C→T |
R232C (CGT→TGT) |
malX → |
MalX |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,698,072 | 0 | C | T | 99.5%
| 736.8
/ ‑5.2
| 204 | R232C (CGT→TGT) | malX | MalX |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base T (99/104); total (100/104) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.90e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.23e-01 |
Only 100 of 212 total aligned reads displayed.
TGGCCGATTTTCGCCATGGGTATTAGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAACGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCGGCACGCAGGAAGTCTGCGGTCAA > NC_000913/1697982‑1698161
|
tGGCCGATTTTCGCCATGGGTATTAGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGt > 1:638901/1‑93 (MQ=255)
ggCCGATTTTCGCCATGGGTATTAGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTc < 2:4461820/93‑1 (MQ=255)
gCCGATTTTCGCCATGGGTATTAGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTct > 1:1412485/1‑93 (MQ=255)
gCCGATTTTCGCCATGGGTATTAGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTct > 2:4731934/1‑93 (MQ=255)
ccGATTTTCGCCATGGGTATTAGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTctg < 1:6814610/93‑1 (MQ=255)
ttttCGCCATGGGTATTAGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGt > 2:2139874/1‑93 (MQ=255)
ttttCGCCATGGGTATTAGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGt < 1:8151419/93‑1 (MQ=255)
ttttCGCCATGGGTATTAGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGt > 1:2942124/1‑93 (MQ=255)
ttCGCCATGGGTATTAGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTg < 2:4988557/93‑1 (MQ=255)
tCGCCATGGGTATTAGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGc < 1:7641853/93‑1 (MQ=255)
tCGCCATGGGTATTAGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGc < 1:5221406/93‑1 (MQ=255)
cGCCATGGGTATTAGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGcc > 2:4107722/1‑93 (MQ=255)
ccATGGGTATTAGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGt > 2:9843777/1‑93 (MQ=255)
ccATGGGTATTAGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGt < 1:3884615/93‑1 (MQ=255)
tGGGTATTAGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTg > 2:7838113/1‑93 (MQ=255)
ggTATTAGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGGTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGt > 1:611143/1‑93 (MQ=255)
gTATTAGCGGCTTGGGCCATATGATAACCAGCGCGGGTGGTTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTc < 1:1322550/93‑1 (MQ=255)
gTATTAGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTc < 2:6405055/93‑1 (MQ=255)
tATTAGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGGTTGGTCt > 2:374311/1‑93 (MQ=255)
ttAGCGGCTTGGGCCATATGGTAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTGCCCGTTTGGTCTGc > 1:8685411/1‑93 (MQ=255)
tAGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCa < 1:9379976/93‑1 (MQ=255)
tAGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCa > 2:2450786/1‑93 (MQ=255)
aGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCAt < 2:7978731/93‑1 (MQ=255)
ggCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATcac > 1:2951791/1‑93 (MQ=255)
ggCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATcac > 1:2278832/1‑93 (MQ=255)
ttGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACAtt < 1:9934487/93‑1 (MQ=255)
gCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCtgg < 2:9454835/93‑1 (MQ=255)
cATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCtggtg > 2:3379613/1‑93 (MQ=255)
atatGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCtggtgg < 1:5785497/93‑1 (MQ=255)
atatGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCtggcgg > 1:4841849/1‑93 (MQ=255)
tatGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGc > 2:10016598/1‑93 (MQ=255)
tatGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGc > 1:833535/1‑93 (MQ=255)
atGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCa > 2:2318161/1‑93 (MQ=255)
tGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCAt < 1:2602601/93‑1 (MQ=255)
tGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCAt < 2:6731687/93‑1 (MQ=255)
tGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCAt < 2:5614681/93‑1 (MQ=255)
tGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCAt < 1:4612917/93‑1 (MQ=255)
gATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCAtt < 1:6606691/93‑1 (MQ=255)
gATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCAtt > 2:8796031/1‑93 (MQ=255)
aTAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTa < 2:6463098/93‑1 (MQ=255)
aTAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTa < 2:8010414/93‑1 (MQ=255)
tAAACAGCGCGGGTGAGTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTaa < 1:7017085/93‑1 (MQ=255)
aaaCAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAAt > 2:5832268/1‑93 (MQ=255)
aaaCAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAAt > 2:9919090/1‑93 (MQ=255)
aCAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTc < 2:1354299/93‑1 (MQ=255)
aCAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTc > 1:4402417/1‑93 (MQ=255)
aCAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTc > 1:7531521/1‑93 (MQ=255)
aGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGc < 2:960950/93‑1 (MQ=255)
aGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGc > 2:180222/1‑93 (MQ=255)
gcgcGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCt > 2:7123374/1‑93 (MQ=255)
gcgcGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCt < 1:5474329/93‑1 (MQ=255)
gcgcGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCt < 2:5979944/93‑1 (MQ=255)
cgcgGGTGATTTCGGACCGATTCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCtt < 2:1902301/93‑1 (MQ=255)
cgcgGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCtt > 2:2464730/1‑93 (MQ=255)
gcgGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCttt < 2:7333909/93‑1 (MQ=255)
gggTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTAc < 1:3382698/93‑1 (MQ=255)
gggTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTAc < 1:2542720/93‑1 (MQ=255)
gggTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTAc > 2:1302098/1‑93 (MQ=255)
gggTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTAc < 1:8593790/93‑1 (MQ=255)
gggTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTAc < 1:614311/93‑1 (MQ=255)
gggTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGGCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTAc < 2:9048116/93‑1 (MQ=255)
ggTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTAcc < 2:4195499/93‑1 (MQ=255)
ggTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTAcc > 2:3024402/1‑93 (MQ=255)
gATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGAc < 1:5888859/93‑1 (MQ=255)
aTTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACg > 2:9172611/1‑93 (MQ=255)
aTTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACg > 1:9840307/1‑93 (MQ=255)
tttCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGc < 1:6747860/93‑1 (MQ=255)
tttCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGc > 2:1659243/1‑93 (MQ=255)
ttCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGcg > 1:1545624/1‑92 (MQ=255)
ttCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCa < 1:5576747/93‑1 (MQ=255)
cGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAgg < 2:3932765/93‑1 (MQ=255)
aCCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGGCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAggcgg > 2:3491355/1‑93 (MQ=255)
aCCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAggcgg > 1:6247599/1‑93 (MQ=255)
ccGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAggcggc > 2:7152718/1‑93 (MQ=255)
cGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCGGCa > 2:4515944/1‑93 (MQ=255)
cGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCGGCa < 1:91181/93‑1 (MQ=255)
gATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCGGCAc < 2:1461597/93‑1 (MQ=255)
aTGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATGCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCGGCACg < 2:46547/93‑1 (MQ=255)
tGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCGGCACGc < 1:8222808/93‑1 (MQ=255)
gCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCGGCACGCa > 1:3960466/1‑93 (MQ=255)
gCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCGGCACGCa < 2:2643831/93‑1 (MQ=255)
gTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCGGCACGCAGGa > 1:4258908/1‑93 (MQ=255)
tttGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCGGCACGCAGGaa < 2:7945427/93‑1 (MQ=255)
ggTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCGGCACGCAGGAAGTc < 2:319566/93‑1 (MQ=255)
ggTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCGGCACGCAGGAAGTc < 2:6988173/93‑1 (MQ=255)
gTACCGGTGAATTCCTGCTGTTTCAGGTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCGGCACGCAGGAAGTCt < 2:2422008/93‑1 (MQ=255)
gTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTTCCGACGCAGGCGGCACGCAGGAAGTCt > 2:671986/1‑93 (MQ=255)
tACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCGGCACGCAGGAAGTCTg < 1:9201062/93‑1 (MQ=255)
aCCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCGGCACGCAGGAAGTCTGc < 1:2979605/93‑1 (MQ=255)
aCCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCGGCACGCAGGAAGTCTGc < 2:2758710/93‑1 (MQ=255)
ccGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCGGCACGCAGGAAGTCTGCg < 2:5904392/93‑1 (MQ=255)
ggTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCGGCACGCAGGAAGTCTGCGGt < 1:3470830/93‑1 (MQ=255)
ggTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCGGCACGCAGGAAGTCTGCGGt > 1:1624865/1‑93 (MQ=255)
gTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCGGCACGCAGGAAGTCTGCGGTc < 1:3270205/93‑1 (MQ=255)
gTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCGGCACGCAGGAAGTCTGCGGTc > 1:2137926/1‑93 (MQ=255)
gTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCGGCACGCAGGAAGTCTGCGGTc > 2:9738976/1‑93 (MQ=255)
gTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCGGCACGCAGGAAGTCTGCGGTc < 2:4577477/93‑1 (MQ=255)
tGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCGGCACGCAGGAAGTCTGCGGTCa < 1:616074/93‑1 (MQ=255)
gAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCGGCACGCAGGAAGTCTGCGGTCaa < 1:2413014/93‑1 (MQ=255)
gAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCGGCACGCAGGAAGTCTGCGGTCaa > 2:9281660/1‑93 (MQ=255)
|
TGGCCGATTTTCGCCATGGGTATTAGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAACGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCGGCACGCAGGAAGTCTGCGGTCAA > NC_000913/1697982‑1698161
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CTGGCCGATTTTCGCCATGGGTATTAGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAACGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCGGCACGCAGGAAGTCTGCGGTCAAACCG > NC_000913/1697981‑1698165
|
CTGGCCGATTTTCGCCATGGGTATTAGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGT > SRR4302540.645697/1‑94 (MQ=60)
GGCCGATTTTCGCCATGGGTATTAGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCT > SRR4302540.1427724/1‑94 (MQ=60)
CCGATTTTCGCCATGGGTATTAGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGC < SRR4302540.6890036/94‑1 (MQ=60)
GATTTTCGCCATGGGTATTAGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTG > SRR4302540.4784892/1‑94 (MQ=60)
GATTTTCGCCATGGGTATTAGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTG < SRR4302540.4069015/94‑1 (MQ=60)
ATTTTCGCCATGGGTATTAGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGT < SRR4302540.4242367/94‑1 (MQ=60)
ATTTTCGCCATGGGTATTAGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGT > SRR4302540.2974453/1‑94 (MQ=60)
TTTTCGCCATGGGTATTAGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTT < SRR4302540.8246048/94‑1 (MQ=60)
TTTTCGCCATGGGTATTAGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTT > SRR4302540.297205/1‑94 (MQ=60)
TTTTCGCCATGGGTATTAGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTT < SRR4302540.2441294/94‑1 (MQ=60)
TTCGCCATGGGTATTAGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGC < SRR4302540.1653279/94‑1 (MQ=60)
TCGCCATGGGTATTAGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCC < SRR4302540.5278330/94‑1 (MQ=60)
TCGCCATGGGTATTAGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCC < SRR4302540.6193963/94‑1 (MQ=60)
TCGCCATGGGTATTAGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCC < SRR4302540.7727858/94‑1 (MQ=60)
CCATGGGTATTAGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTT < SRR4302540.3926815/94‑1 (MQ=60)
ATGGGTATTAGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTG > SRR4302540.10114990/1‑94 (MQ=60)
GGGTATTAGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGT > SRR4302540.3998461/1‑94 (MQ=60)
GGGTATTAGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGGTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGT > SRR4302540.617671/1‑94 (MQ=60)
GTATTAGCGGCTTGGGCCATATGATAACCAGCGCGGGTGGTTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCT < SRR4302540.1336331/94‑1 (MQ=60)
GTATTAGCGGCTTGGGCCATATGATAAAGAGCGCGGGTGATTTTGGTCTGATGCTGTTTGGTACCGGTGATTGCCTGCTGTTTCCGTTTTGTCT > SRR4302540.5874506/1‑94 (MQ=55)
GTATTAGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCT > SRR4302540.5874505/1‑94 (MQ=60)
ATTAGCGGCTTGGGCCATATGGTAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTGCCCGTTTGGTCTGC > SRR4302540.8786264/1‑94 (MQ=60)
ATTAGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGC < SRR4302540.771918/94‑1 (MQ=60)
ATTAGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGC > SRR4302540.7317115/1‑94 (MQ=60)
ATTAGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGGGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGC > SRR4302540.2701232/1‑94 (MQ=60)
TTAGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCT > SRR4302540.6418423/1‑94 (MQ=60)
TTAGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCAGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCA < SRR4302540.2596144/94‑1 (MQ=60)
TAGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCAT < SRR4302540.9491631/94‑1 (MQ=60)
AGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATC > SRR4302540.9384011/1‑94 (MQ=60)
CGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGTTACCGGTGAATGGCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCAC > SRR4302540.2303310/1‑94 (MQ=60)
CGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCAC > SRR4302540.2984292/1‑94 (MQ=60)
CGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCAC > SRR4302540.2984291/1‑94 (MQ=60)
CGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCAC > SRR4302540.2303309/1‑94 (MQ=60)
GGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACA > SRR4302540.7854810/1‑94 (MQ=60)
TTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTC < SRR4302540.10050429/94‑1 (MQ=60)
TGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCT < SRR4302540.675869/94‑1 (MQ=60)
TGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCT < SRR4302540.1345949/94‑1 (MQ=60)
CCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTG < SRR4302540.6217907/94‑1 (MQ=60)
CCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTG < SRR4302540.1523829/94‑1 (MQ=60)
CATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGCGG > SRR4302540.4893708/1‑94 (MQ=60)
ATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGC < SRR4302540.5849408/94‑1 (MQ=60)
ATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGC > SRR4302540.842385/1‑94 (MQ=60)
ATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGAGGC > SRR4302540.5902342/1‑94 (MQ=60)
TGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATT < SRR4302540.6152385/94‑1 (MQ=60)
TGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATT < SRR4302540.3497615/94‑1 (MQ=60)
TGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATT < SRR4302540.4662417/94‑1 (MQ=60)
TGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATT < SRR4302540.2630673/94‑1 (MQ=60)
GATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTA < SRR4302540.6679844/94‑1 (MQ=60)
ATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAA > SRR4302540.555939/1‑94 (MQ=60)
ATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAA > SRR4302540.3223749/1‑94 (MQ=60)
TAAACAGCGCGGGTGAGTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAAT < SRR4302540.7095005/94‑1 (MQ=60)
AAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATT > SRR4302540.8394366/1‑94 (MQ=60)
AACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTC > SRR4302540.7615850/1‑94 (MQ=60)
AACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTC > SRR4302540.4450157/1‑94 (MQ=60)
GCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTT < SRR4302540.5534586/94‑1 (MQ=60)
GGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACC < SRR4302540.3419622/94‑1 (MQ=60)
GGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACC > SRR4302540.28703/1‑94 (MQ=60)
GGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACC < SRR4302540.2570134/94‑1 (MQ=60)
GGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACC < SRR4302540.620869/94‑1 (MQ=60)
GGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACC < SRR4302540.8693686/94‑1 (MQ=60)
GGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCG < SRR4302540.9246546/94‑1 (MQ=60)
GTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGA > SRR4302540.8803081/1‑94 (MQ=60)
GATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACG < SRR4302540.5953923/94‑1 (MQ=60)
GATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACG > SRR4302540.9955353/1‑94 (MQ=60)
GATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACG < SRR4302540.3366936/94‑1 (MQ=60)
TTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCG > SRR4302540.1562681/1‑94 (MQ=60)
TTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCA < SRR4302540.6822423/94‑1 (MQ=60)
TTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAG < SRR4302540.5638144/94‑1 (MQ=60)
TCGGACAGCTGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGG < SRR4302540.6473693/94‑1 (MQ=60)
GGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCG < SRR4302540.5833752/94‑1 (MQ=60)
GGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCG > SRR4302540.9202651/1‑94 (MQ=60)
GACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCGG < SRR4302540.3742722/94‑1 (MQ=60)
GACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCGG > SRR4302540.6317123/1‑94 (MQ=60)
CGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCGGCAC < SRR4302540.92144/94‑1 (MQ=60)
CGATGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCGGCAC < SRR4302540.9981452/94‑1 (MQ=60)
TGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCGGCACGCG > SRR4302540.1584446/1‑94 (MQ=60)
TGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCGGCACGCA > SRR4302540.4003183/1‑94 (MQ=60)
TGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCGGCACGCA < SRR4302540.8318395/94‑1 (MQ=60)
TGCTGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCGGCACGCA < SRR4302540.8318396/94‑1 (MQ=60)
TGCTGATTGGTACCGGAGAATGTCTGCTGTGGCCGTTTGGTCTGCATCACCGTCTGGTGGCATTACATCGCTTTACCGACGCAGGCGGCACGCG > SRR4302540.4003469/1‑94 (MQ=60)
TGTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCGGCACGCAGGA > SRR4302540.4305237/1‑94 (MQ=60)
TTTTGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCGGCACGCAGGAA < SRR4302540.969046/94‑1 (MQ=60)
TGGTACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCGGCACGCAGGAAGTC > SRR4302540.8776302/1‑94 (MQ=60)
TACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCGGCACGCAGGAAGTCTGC < SRR4302540.9311451/94‑1 (MQ=60)
ACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCGGCACGCAGGAAGTCTGCG > SRR4302540.4550724/1‑94 (MQ=60)
ACCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCGGCACGCAGGAAGTCTGCG < SRR4302540.3012514/94‑1 (MQ=60)
CCGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCGGCACGCAGGAAGTCTGCGG > SRR4302540.5350874/1‑94 (MQ=60)
CGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACCTTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCGGCACGCAGGAAGTCTGCGGC > SRR4302540.8549383/1‑94 (MQ=60)
CGGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCGGCACGCAGGAAGTCTGCGGT > SRR4302540.1642661/1‑94 (MQ=60)
GGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCGGCACGCAGGAAGTCTGCGGTC > SRR4302540.2160893/1‑94 (MQ=60)
GGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCGGCACGCAGGAAGTCTGCGGTC < SRR4302540.3508616/94‑1 (MQ=60)
GGTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCGGCACGCAGGAAGTCTGCGGTC > SRR4302540.7001300/1‑94 (MQ=60)
GTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCGGCACGCAGGAAGTCTGCGGTCA < SRR4302540.3305897/94‑1 (MQ=60)
GTGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCGGCACGCAGGAAGTCTGCGGTCA < SRR4302540.5099481/94‑1 (MQ=60)
TGAATGTCTGCTGTTTCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCGGCACGCAGGAAGTCTGCGGTCAA < SRR4302540.6242448/94‑1 (MQ=60)
TGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCGGCACGCAGGAAGTCTGCGGTCAA < SRR4302540.2245852/94‑1 (MQ=60)
TGAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCGGCACGCAGGAAGTCTGCGGTCAA < SRR4302540.622645/94‑1 (MQ=60)
TGAACGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCGGCACGCAGGAAGTCTGCGGTCAA > SRR4302540.7045366/1‑94 (MQ=60)
GAATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCGGCACGCAGGAAGTCTGCGGTCAAA < SRR4302540.2439023/94‑1 (MQ=60)
ATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCGGCACGCAGGAAGTCTGCGGTCAAACC > SRR4302540.3962744/1‑94 (MQ=60)
ATGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCGGCACGCAGGAAGTCTGCGGTCAAACC < SRR4302540.6673514/94‑1 (MQ=60)
TGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCGGCACGCAGGAAGTCTGCGGTCAAACCG < SRR4302540.3767495/94‑1 (MQ=60)
TGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCGGCACGCAGGAAGTCTGCGGTCAAACCG < SRR4302540.5935631/94‑1 (MQ=60)
|
CTGGCCGATTTTCGCCATGGGTATTAGCGGCTTGGGCCATATGATAAACAGCGCGGGTGATTTCGGACCGATGCTGTTTGGTACCGGTGAACGTCTGCTGTTGCCGTTTGGTCTGCATCACATTCTGGTGGCATTAATTCGCTTTACCGACGCAGGCGGCACGCAGGAAGTCTGCGGTCAAACCG > NC_000913/1697981‑1698165
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
