Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1624 |
250.6 |
12620048 |
98.0% |
12367647 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,712,211 |
A→G |
V473V (GTA→GTG) |
ydgR → |
putative transport protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,712,211 | 0 | A | G | 100.0%
| 749.7
/ NA
| 227 | V473V (GTA→GTG) | ydgR | putative transport protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (129/98); total (129/98) |
Only 100 of 231 total aligned reads displayed.
GCCGGATAACGTTACCGATCCGCTGATGTCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTACTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAGACAAAGCGGCGAAAGCAGCCGTAGCGTAAAATTC > NC_000913/1712121‑1712300
|
gCCGGATAACGTTACCGATCCGCTGATGTCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCt > 2:2475665/1‑93 (MQ=255)
ccGGATAACGTTACCGATCCGCTGATGTCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTg > 2:3859372/1‑93 (MQ=255)
cGGATAACGTTACCGATCCGCTGATGTCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGa > 2:4043664/1‑93 (MQ=255)
ggATAACGTTACCGATCCGCTGATGTCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGAt > 2:2429344/1‑93 (MQ=255)
ggATAACGTTACCGATCCGCTGATGTCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGAt > 2:5162297/1‑93 (MQ=255)
gATAACGTTACCGATCCGCTGATGTCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGAtg > 2:3052845/1‑93 (MQ=255)
aTAACGTTACCGATCCGCTGATGTCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGAtgc > 1:4585180/1‑93 (MQ=255)
tAACGTTACCGATCCGCTGATGTCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGAtgct < 1:80560/93‑1 (MQ=255)
tAACGTTACCGATCCGCTGATGTCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCCTTATTGCAGTGCTGAtgct > 2:3630947/1‑93 (MQ=255)
aaCGTTACCGATCCGCTGATGTCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGAtgctg > 2:2017339/1‑93 (MQ=255)
aCGTTACCGATCCGCTGATGTCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGAtgctgc > 1:4055065/1‑93 (MQ=255)
aCGTTACCGATCCGCTGATGTCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGAtgctgc > 2:5215946/1‑93 (MQ=255)
aCGTTACCGATCCGCTGATGTCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGAtgctgc > 1:1452511/1‑93 (MQ=255)
cGTTACCGATCCGCTGATGTCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATgctgct > 1:432743/1‑93 (MQ=255)
cGTTACCGATCCGCTGATGTCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATgctgct < 1:765821/93‑1 (MQ=255)
gTTACCGATCCGCTGATGTCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGctgctg > 2:1473424/1‑93 (MQ=255)
ttACCGATCCGCTGATGTCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGa > 2:628500/1‑93 (MQ=255)
ttACCGATCCGCTGATGTCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGa < 1:6109561/93‑1 (MQ=255)
tACCGATCCGCTGATGTCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGAc > 2:1877206/1‑93 (MQ=255)
tACCGATCCGCTGATGTCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGAc < 1:3379218/93‑1 (MQ=255)
ccGATCCGCTGATGTCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACcg > 1:2679178/1‑93 (MQ=255)
gATCCGCTGATGTCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACcgcg > 2:5703570/1‑93 (MQ=255)
aTCCGCTGATGTCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCgcgc < 1:988724/93‑1 (MQ=255)
aTCCGCTGATGTCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCgcgc > 1:1075557/1‑93 (MQ=255)
aTCCGCTGATGTCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCgcgc > 2:4798536/1‑93 (MQ=255)
tCCGCTGATGTCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGcc > 2:2132766/1‑93 (MQ=255)
tCCGCTGATGTCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGcc > 2:1811275/1‑93 (MQ=255)
cGCTGATGTCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGa > 1:2219365/1‑93 (MQ=255)
cGCTGATGTCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACCGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGa > 2:5035102/1‑93 (MQ=255)
gCTGATGTCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGaa > 1:3817243/1‑93 (MQ=255)
tGATGTCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCATGGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGaaat > 1:5328930/1‑92 (MQ=255)
tGATGTCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAAc < 2:4766236/93‑1 (MQ=255)
tGATGTCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAAc > 2:914257/1‑93 (MQ=255)
tGATGTCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAAc < 1:5933240/93‑1 (MQ=255)
tGATGTCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAAc < 1:1308554/93‑1 (MQ=255)
gATGTCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACt > 1:5431707/1‑93 (MQ=255)
gATGTCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACt < 2:3528310/93‑1 (MQ=255)
tCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCAc > 1:1261926/1‑93 (MQ=255)
tGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCa > 1:3930638/1‑93 (MQ=255)
ggAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGCTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCAt < 1:1793706/93‑1 (MQ=255)
gAAGTCTATGGTCGCGTATCCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCGCCGCATg < 2:6232941/93‑1 (MQ=255)
aaGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGa > 2:2944326/1‑93 (MQ=255)
aaGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGa < 2:6193895/93‑1 (MQ=255)
aaGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGa < 2:1286388/93‑1 (MQ=255)
aaGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGa < 2:456227/93‑1 (MQ=255)
tCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGc > 2:60192/1‑93 (MQ=255)
aTGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAgg > 1:563371/1‑93 (MQ=255)
tGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGa < 1:4761451/93‑1 (MQ=255)
ggTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGAt < 2:5663543/93‑1 (MQ=255)
gTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATg < 1:567115/93‑1 (MQ=255)
tCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGa < 1:4999493/93‑1 (MQ=255)
tCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGa < 2:1785329/93‑1 (MQ=255)
tCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGa < 2:4417386/93‑1 (MQ=255)
tCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGa < 1:1685135/93‑1 (MQ=255)
gcgcgTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGa < 1:5196469/92‑1 (MQ=255)
cgcgTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGAc > 2:4195626/1‑93 (MQ=255)
cgcgTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGAc < 1:334635/93‑1 (MQ=255)
cgcgTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGAc < 1:5524361/93‑1 (MQ=255)
cgcgTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGAc > 1:4642097/1‑93 (MQ=255)
cgTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGc < 1:2515443/93‑1 (MQ=255)
tATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTg > 1:4828989/1‑93 (MQ=255)
tATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTg > 2:3758370/1‑93 (MQ=255)
tATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTg > 2:3429514/1‑93 (MQ=255)
aTTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGc < 1:6070456/93‑1 (MQ=255)
aTTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGc < 2:2245446/93‑1 (MQ=255)
ttCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCa > 2:2310139/1‑93 (MQ=255)
ttCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCa < 2:1082049/93‑1 (MQ=255)
ttCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCa > 2:4668956/1‑93 (MQ=255)
tCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAg < 1:2623177/93‑1 (MQ=255)
aGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAGACAAAg > 2:87558/1‑93 (MQ=255)
aGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAGACAAAg > 2:625759/1‑93 (MQ=255)
aGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAGACAAAg > 2:1760933/1‑93 (MQ=255)
gATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAGACAAAgc > 2:2601360/1‑93 (MQ=255)
gATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAGACAAAgc > 1:3290191/1‑93 (MQ=255)
aTTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAGACAAAgcg < 1:345472/93‑1 (MQ=255)
aTTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAGACAAAgcg < 2:5861560/93‑1 (MQ=255)
tGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAGACAAAgcggc > 2:1174312/1‑93 (MQ=255)
gtCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAGACAAAGCGGCGaaa < 2:6138349/93‑1 (MQ=255)
gtCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAGACAAAGCGGCGaaa < 1:2299472/93‑1 (MQ=255)
tCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAGACAAAGCGGCGAAag > 1:3587490/1‑93 (MQ=255)
tCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAGACAAAGCGGCGAAag > 2:1652978/1‑93 (MQ=255)
tCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAGACAAAGCGGCGAAag < 1:4237809/93‑1 (MQ=255)
cGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAGACAAAGCGGCGAAagc < 1:4320292/93‑1 (MQ=255)
gCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAGACAAAGCGGCGAAagca < 2:2771360/93‑1 (MQ=255)
cTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAGACAAAGCGGCGAAagcag > 2:3811392/1‑93 (MQ=255)
tACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAGACAAAGCGGCGAAagcagc > 1:2352361/1‑93 (MQ=255)
tACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAGACAAAGCGGCGAAagcagc > 1:4456411/1‑93 (MQ=255)
tACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAGACAAAGCGGCGAAagcagc > 1:622436/1‑93 (MQ=255)
tACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAGACAAAGCGGCGAAagcagc < 1:3213506/93‑1 (MQ=255)
tACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAGACAAAGCGGCGAAagcagc < 2:1365586/93‑1 (MQ=255)
aCTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAGACAAAGCGGCGAAAGCAGcc < 2:411736/93‑1 (MQ=255)
aCTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAGACAAAGCGGCGAAAGCAGcc > 2:3189392/1‑93 (MQ=255)
gCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAGACAAAGCGGCGAAAGCAGCCGTa > 2:5535403/1‑93 (MQ=255)
cGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAGACAAAGCGGCGAAAGCAGCCGTAGc > 2:4489713/1‑93 (MQ=255)
ttATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAGACAAAGCGGCGAAAGCAGCCGTAGCGt > 1:4920538/1‑93 (MQ=255)
ttATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAGACAAAGCGGCGAAAGCAGCCGTAGCGt > 2:5145181/1‑93 (MQ=255)
aTTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAGACAAAGCGGCGAAAGCAGCCGTAGCGTaa > 2:1530475/1‑93 (MQ=255)
gCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAGACAAAGCGGCGAAAGCAGCCGTAGCGTAAAAt > 1:1736078/1‑93 (MQ=255)
cAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAGACAAAGCGGCGAAAGCAGCCGTAGCGTAAAAtt < 2:4875896/93‑1 (MQ=255)
aGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAGACAAAGCGGCGAAAGCAGCCGTAGCGTAAAATTc < 2:1334751/93‑1 (MQ=255)
|
GCCGGATAACGTTACCGATCCGCTGATGTCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTACTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAGACAAAGCGGCGAAAGCAGCCGTAGCGTAAAATTC > NC_000913/1712121‑1712300
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
TGTGCCGGATAACGTTACCGATCCGCTGATGTCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTACTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAGACAAAGCGGCGAAAGCAGCCGTAGCGTAAAATTCAGG > NC_000913/1712118‑1712303
|
TGTGCCGGATAACGTTACCGATCCGCTGATGTCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTG < SRR4302533.5728718/94‑1 (MQ=60)
TGTGCCGGATAACGTTACCGATCCGCTGATGTCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTG < SRR4302533.4505827/94‑1 (MQ=60)
GTGCCGGATAACGTTACCGATCCGCTGATGTCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGC < SRR4302533.2319269/94‑1 (MQ=60)
TGCCGGATAACGTTACCGATCCGCTGATGTCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCT < SRR4302533.4594958/94‑1 (MQ=60)
GCCGGATAACGTTACCGATCCGCTGATGTCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTG < SRR4302533.2928383/94‑1 (MQ=60)
CGGATAACGTTACCGATCCGCTGATGTCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGAT < SRR4302533.3642961/94‑1 (MQ=60)
GGATAACGTTACCGATCCGCTGATGTCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATG < SRR4302533.3943450/94‑1 (MQ=60)
GGATAACGTTACCGATCCGCTGATGTCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATG < SRR4302533.4055414/94‑1 (MQ=60)
GATAACGTTACCGATCCGCTGATGTCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGC > SRR4302533.4612957/1‑94 (MQ=60)
TAACGTTACCGATCCGCTGATGTCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTG > SRR4302533.1281056/1‑94 (MQ=60)
TAACGTTACCGATCCGCTGATGTCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTG < SRR4302533.81074/94‑1 (MQ=60)
AACGTTACCGATCCGCTGATGTCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGC > SRR4302533.4079755/1‑94 (MQ=60)
AACGTTACCGATCCGCTGATGTCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGC > SRR4302533.1461274/1‑94 (MQ=60)
ACGTTACCGATCCGCTGATGTCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCT > SRR4302533.435320/1‑94 (MQ=60)
ACGTTACCGATCCGCTGATGTCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCT < SRR4302533.1197480/94‑1 (MQ=60)
CGTTACCGATCCGCTGATGTCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTG < SRR4302533.770337/94‑1 (MQ=60)
GTTACCGATCCGCTGATGTCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGA > SRR4302533.6046850/1‑94 (MQ=60)
TTACCGATCCGCTGATGTCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGAC < SRR4302533.4361815/94‑1 (MQ=60)
TTACCGATCCGCTGATGTCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGAC < SRR4302533.6146442/94‑1 (MQ=60)
TACCGATCCGCTGATGTCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACC < SRR4302533.3400079/94‑1 (MQ=60)
ACCGATCCGCTGATGTCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCG > SRR4302533.325603/1‑94 (MQ=60)
ACCGATCCGCTGATGTCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCG > SRR4302533.2695601/1‑94 (MQ=60)
CGATCCGCTGATGTCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCG > SRR4302533.1712274/1‑94 (MQ=60)
GATCCGCTGATGTCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGC > SRR4302533.1081897/1‑94 (MQ=60)
ATCCGCTGATGTCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCC > SRR4302533.434976/1‑94 (MQ=60)
ATCCGCTGATGTCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCC > SRR4302533.4714286/1‑94 (MQ=60)
ATCCGCTGATGTCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCC < SRR4302533.994509/94‑1 (MQ=60)
TCCGCTGATGTCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCG > SRR4302533.526219/1‑94 (MQ=60)
CCGCTGATGTCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGA > SRR4302533.2233067/1‑94 (MQ=60)
CCGCTGATGTCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGA > SRR4302533.2302701/1‑94 (MQ=60)
CGCTGATGTCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTTCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAA > SRR4302533.2451975/1‑94 (MQ=60)
CGCTGATGTCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAA > SRR4302533.3840584/1‑94 (MQ=60)
CGCTGATGTCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAA < SRR4302533.2126005/94‑1 (MQ=60)
CGCTGATGTCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAA > SRR4302533.1794792/1‑94 (MQ=60)
CTGATGTCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCATGGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAAT > SRR4302533.5360866/1‑94 (MQ=60)
TGATGTCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACT < SRR4302533.1316408/94‑1 (MQ=60)
TGATGTCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACT > SRR4302533.5464416/1‑94 (MQ=60)
TGATGTCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACT < SRR4302533.5969109/94‑1 (MQ=60)
ATGTCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGC < SRR4302533.2688440/94‑1 (MQ=60)
TGTCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCA < SRR4302533.4882573/94‑1 (MQ=60)
GTCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCAC > SRR4302533.1269472/1‑94 (MQ=60)
TCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACC < SRR4302533.3466818/94‑1 (MQ=60)
CTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCA > SRR4302533.3954632/1‑94 (MQ=60)
GGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGCTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATG < SRR4302533.1804622/94‑1 (MQ=60)
GAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGA > SRR4302533.2143292/1‑94 (MQ=60)
AGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACG < SRR4302533.3222744/94‑1 (MQ=60)
GTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGC > SRR4302533.3467513/1‑94 (MQ=60)
CTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAG > SRR4302533.5754364/1‑94 (MQ=60)
TATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGG > SRR4302533.566710/1‑94 (MQ=60)
TGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGAT < SRR4302533.4790335/94‑1 (MQ=60)
TGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGAT > SRR4302533.1403354/1‑94 (MQ=60)
TGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGAT < SRR4302533.677418/94‑1 (MQ=60)
GGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATG > SRR4302533.386180/1‑94 (MQ=60)
GTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGA < SRR4302533.570472/94‑1 (MQ=60)
TCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGAC < SRR4302533.1695343/94‑1 (MQ=60)
TCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGAC > SRR4302533.4670221/1‑94 (MQ=60)
TCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGAC < SRR4302533.5029797/94‑1 (MQ=60)
GCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGAC < SRR4302533.5227806/94‑1 (MQ=60)
CGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACG < SRR4302533.5557713/94‑1 (MQ=60)
CGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACG < SRR4302533.336680/94‑1 (MQ=60)
CGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCT < SRR4302533.5361488/94‑1 (MQ=60)
CGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCT > SRR4302533.773512/1‑94 (MQ=60)
CGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCT > SRR4302533.1551729/1‑94 (MQ=60)
CGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCT < SRR4302533.2530942/94‑1 (MQ=60)
GTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTG > SRR4302533.4858253/1‑94 (MQ=60)
GTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTG > SRR4302533.6144327/1‑94 (MQ=60)
GTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTG > SRR4302533.831276/1‑94 (MQ=60)
TATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGC < SRR4302533.4309645/94‑1 (MQ=60)
ATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCA > SRR4302533.1147318/1‑94 (MQ=60)
ATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCA > SRR4302533.4586681/1‑94 (MQ=60)
ATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCA < SRR4302533.6107187/94‑1 (MQ=60)
ATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCA > SRR4302533.2366124/1‑94 (MQ=60)
TTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAG > SRR4302533.5325130/1‑94 (MQ=60)
TTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAG > SRR4302533.2383218/1‑94 (MQ=60)
TCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAGA < SRR4302533.2639277/94‑1 (MQ=60)
TTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAGACA > SRR4302533.6269125/1‑94 (MQ=60)
CAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAGACAAAG > SRR4302533.4802887/1‑94 (MQ=60)
CAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAGACAAAG < SRR4302533.1653135/94‑1 (MQ=60)
CAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAGACAAAG > SRR4302533.4583340/1‑94 (MQ=60)
AGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAGACAAAGC > SRR4302533.3310505/1‑94 (MQ=60)
GATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAGACAAAGCG > SRR4302533.2559031/1‑94 (MQ=60)
ATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAGACAAAGCGG < SRR4302533.347584/94‑1 (MQ=60)
ATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAGACAAAGCGG < SRR4302533.6152245/94‑1 (MQ=60)
GTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAGACAAAGCGGCGAAAG < SRR4302533.2313727/94‑1 (MQ=60)
GTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAGACAAAGCGGCGAAAG > SRR4302533.3609580/1‑94 (MQ=60)
TCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAGACAAAGCGGCGAAAGC < SRR4302533.4263406/94‑1 (MQ=60)
TCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCCAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAGACAAAGCGGCGAAAGC < SRR4302533.3527297/94‑1 (MQ=60)
CGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAGACAAAGCGGCGAAAGCA < SRR4302533.4346313/94‑1 (MQ=60)
CGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAGACAAAGCGGCGAAAGCA < SRR4302533.5504280/94‑1 (MQ=60)
GCTCCTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGGTGCTGACCGAGCCGAAACTGCACCGCATGACGactgctgacgctgcagacaacgcggagacaccag > SRR4302533.5577509/1‑60 (MQ=55)
GCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAGACAAAGCGGCGAAAGCAG > SRR4302533.5577508/1‑94 (MQ=60)
CTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAGACAAAGCGGCGAAAGCAGC > SRR4302533.4483359/1‑94 (MQ=60)
CTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAGACAAAGCGGCGAAAGCAGC > SRR4302533.626094/1‑94 (MQ=60)
CTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAGACAAAGCGGCGAAAGCAGC > SRR4302533.2366913/1‑94 (MQ=60)
TACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAGACAAAGCGGCGAAAGCAGCC < SRR4302533.3363556/94‑1 (MQ=60)
TACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAGACAAAGCGGCGAAAGCAGCC < SRR4302533.3233313/94‑1 (MQ=60)
ACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACGGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAGCCAAAGCGGCGAAAGCAGCCG < SRR4302533.2538174/94‑1 (MQ=60)
CTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAGACAAAGCGGCGAAAGCAGCCGT > SRR4302533.4921887/1‑94 (MQ=60)
GCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAGACAAAGCGGCGAAAGCAGCCGTAG > SRR4302533.4127915/1‑94 (MQ=60)
CGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAGACAAAGCGGCGAAAGCAGCCGTAGCG < SRR4302533.601362/94‑1 (MQ=60)
GTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAGACAAAGCGGCGAAAGCAGCCGTAGCGT < SRR4302533.4653815/94‑1 (MQ=60)
GTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAGACAAAGCGGCGAAAGCAGCCGTAGCGT > SRR4302533.4950344/1‑94 (MQ=60)
GTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAGACAAAGCGGCGAAAGCAGCCGTAGCGT > SRR4302533.4950583/1‑94 (MQ=60)
TATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAGACAAAGCGGCGAAAGCAGCCGTAGCGTAA > SRR4302533.5700192/1‑94 (MQ=60)
ATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAGACAAAGCGGCGAAAGCAGCCGTAGCGTAAA > SRR4302533.5127458/1‑94 (MQ=60)
TGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAGACAAAGCGGCGAAAGCAGCCGTAGCGTAAAAT > SRR4302533.433870/1‑94 (MQ=60)
TGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAGACAAAGCGGCGAAAGCAGCCGTAGCGTAAAAT > SRR4302533.1746612/1‑94 (MQ=60)
GCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGACGACGCTGCAGACAAAGCGGCGAAAGCAGCCGTAGCGTAAAATT < SRR4302533.3396373/94‑1 (MQ=60)
AGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAGACAAAGCGGCGAAAGCAGCCGTAGCGTAAAATTCA > SRR4302533.4431704/1‑94 (MQ=60)
GTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAGACAAAGCGGCGAAAGCAGCCGTAGCGTAAAATTCAG < SRR4302533.1664018/94‑1 (MQ=60)
GTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAGACAAAGCGGCGAAAGCAGCCGTAGCGTAAAATTCAG > SRR4302533.1271907/1‑94 (MQ=60)
TGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAGACAAAGCGGCGAAAGCAGCCGTAGCGTAAAATTCAGG < SRR4302533.5407727/94‑1 (MQ=60)
|
TGTGCCGGATAACGTTACCGATCCGCTGATGTCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTACTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAGACAAAGCGGCGAAAGCAGCCGTAGCGTAAAATTCAGG > NC_000913/1712118‑1712303
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
