Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1624 |
250.6 |
12620048 |
98.0% |
12367647 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,718,074 |
T→C |
S59P (TCC→CCC) |
slyB → |
putative outer membrane protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,718,074 | 0 | T | C | 100.0%
| 769.2
/ NA
| 237 | S59P (TCC→CCC) | slyB | putative outer membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (106/131); total (106/131) |
Only 100 of 240 total aligned reads displayed.
TATACCGCTTCTGAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATTCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCGTTCTCTGGCTACT > NC_000913/1717984‑1718163
|
tataCCGCTTCTGAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATccc < 2:3770936/93‑1 (MQ=255)
ataCCGCTTCTGAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCa < 2:3139073/93‑1 (MQ=255)
ataCCGCTTCTGAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCa > 1:5864976/1‑93 (MQ=255)
taCCGCTTCTGAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCaa > 1:19689/1‑93 (MQ=255)
aCCGCTTCTGAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAAc < 2:1591809/93‑1 (MQ=255)
ccGCTTCTGAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACg > 2:256310/1‑93 (MQ=255)
cGCTTCTGAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGt < 2:4050485/93‑1 (MQ=255)
gCTTCTGAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGtt > 2:539028/1‑93 (MQ=255)
gCTTCTGAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGtt > 1:3028897/1‑93 (MQ=255)
ctccTGAAGCGACACATGTACAGAATATCAGCTATGGCACCATCGTTACCGTACGTCCGCTACAGATTCAGGGCGGTGGTGATCCCAACGTTa < 2:1864842/90‑1 (MQ=255)
cTTCTGAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTa < 1:5294289/93‑1 (MQ=255)
cTTCTGAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTa > 1:5744227/1‑93 (MQ=255)
ttCTGAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTAt > 1:4637021/1‑93 (MQ=255)
ttCTGAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTAt < 2:2214185/93‑1 (MQ=255)
tCTGAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATc > 1:2942969/1‑93 (MQ=255)
gAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGt < 1:5977064/93‑1 (MQ=255)
aGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGc < 2:2351396/93‑1 (MQ=255)
aGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGc > 1:2677058/1‑93 (MQ=255)
gCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCa > 1:6281480/1‑93 (MQ=255)
gAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAAt > 1:1840319/1‑93 (MQ=255)
gAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAAt > 1:1465382/1‑93 (MQ=255)
aaCAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTg < 1:4676172/93‑1 (MQ=255)
aCAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTgg < 2:719254/93‑1 (MQ=255)
aCAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTgg > 1:3683552/1‑93 (MQ=255)
cAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGc < 2:1076942/93‑1 (MQ=255)
gTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGGGCAATTGGCggg > 1:624332/1‑92 (MQ=255)
tACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTg > 1:912858/1‑93 (MQ=255)
aCAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGc < 1:4069883/93‑1 (MQ=255)
cAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCt < 2:4413724/93‑1 (MQ=255)
gAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGt < 1:550776/93‑1 (MQ=255)
gAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGt < 1:763151/93‑1 (MQ=255)
gAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGt > 1:602912/1‑93 (MQ=255)
aaTGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGtt > 2:2987760/1‑93 (MQ=255)
tGTCAGCTATGGCACTATCGTTAACGTACGTCGGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCt < 2:5716053/93‑1 (MQ=255)
tGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCt < 1:3461285/93‑1 (MQ=255)
gTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCtt < 2:2461904/93‑1 (MQ=255)
tCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGCGCTGTTCTtg > 2:684435/1‑93 (MQ=255)
cAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTtgg < 2:2774496/93‑1 (MQ=255)
gCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTtggtg > 1:1918716/1‑93 (MQ=255)
tATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTggtggt < 1:2772874/93‑1 (MQ=255)
tATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTggtggt > 1:441517/1‑93 (MQ=255)
aTGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGtt < 2:2963818/93‑1 (MQ=255)
aTGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGtt > 1:4342392/1‑93 (MQ=255)
tGGTACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGttt > 1:5302986/1‑93 (MQ=255)
tGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGttt < 2:2000598/93‑1 (MQ=255)
tGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGttt > 2:4725736/1‑93 (MQ=255)
ggCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTc < 1:1649322/93‑1 (MQ=255)
ggCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATAGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTc > 2:6180694/1‑93 (MQ=255)
gCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTcc < 2:5165545/93‑1 (MQ=255)
aCCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTg < 1:1266604/93‑1 (MQ=255)
ccATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTgg > 1:1072375/1‑93 (MQ=255)
ccATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTgg < 1:3705286/93‑1 (MQ=255)
ccATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTgg < 1:2269183/93‑1 (MQ=255)
cGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGaa < 2:5078029/93‑1 (MQ=255)
cGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGaa < 1:173128/93‑1 (MQ=255)
cGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGaa < 2:6035923/93‑1 (MQ=255)
gTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAAt > 1:464889/1‑93 (MQ=255)
ttAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATa > 2:82719/1‑93 (MQ=255)
ttAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATa > 1:1049935/1‑93 (MQ=255)
tAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATAc > 2:4016107/1‑93 (MQ=255)
aaCGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACt < 1:2380571/93‑1 (MQ=255)
aaCGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACt < 2:5583656/93‑1 (MQ=255)
aaCGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACt > 2:2289680/1‑93 (MQ=255)
aaCGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACt < 2:1565787/93‑1 (MQ=255)
aaCGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACt > 1:6132858/1‑93 (MQ=255)
cgtacgtCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGt < 2:1305310/93‑1 (MQ=255)
acgtCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTtgg > 2:2022285/1‑93 (MQ=255)
cgtCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTtggt < 1:5833462/93‑1 (MQ=255)
cgtCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTtggt < 1:211042/93‑1 (MQ=255)
gtCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTtggtg < 2:5863735/93‑1 (MQ=255)
tCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTtggtgg > 2:2785531/1‑93 (MQ=255)
tCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTtggtgg < 2:2852483/93‑1 (MQ=255)
gccGGTATAGATTCATGTCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCTGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCGTTGGAATACTGTtggtag < 2:3255885/92‑3 (MQ=255)
ccGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGc < 1:3897988/93‑1 (MQ=255)
cGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCg > 2:3498236/1‑93 (MQ=255)
ggTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCgg < 1:3798390/93‑1 (MQ=255)
gTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGa > 2:3800731/1‑93 (MQ=255)
gTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGa > 1:6149726/1‑93 (MQ=255)
tgcAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGaa < 1:5116264/91‑1 (MQ=255)
tACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTTGCGGTTCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGaa < 1:483866/93‑1 (MQ=255)
aCAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAAc < 2:3978419/93‑1 (MQ=255)
aGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTCTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCg < 1:3379591/93‑1 (MQ=255)
gATTCAGGGCGGTGATGATCCCAGCGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCgg < 2:3538565/93‑1 (MQ=255)
gATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCgg < 1:86121/93‑1 (MQ=255)
gATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCgg > 2:843891/1‑93 (MQ=255)
gATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCgg < 1:2765725/93‑1 (MQ=255)
cAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTTCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCGt < 2:949150/93‑1 (MQ=255)
ggCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCGTtct < 1:5481093/93‑1 (MQ=255)
gCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCGTtctc < 1:99985/93‑1 (MQ=255)
gCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCGTtctc > 1:826921/1‑93 (MQ=255)
cGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCGTTctct < 1:245342/93‑1 (MQ=255)
ggTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCGTTCTCTg < 2:5292933/93‑1 (MQ=255)
ggTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCGTTCTCTg < 2:1268156/93‑1 (MQ=255)
gTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCGTTCTCTgg < 1:3473536/93‑1 (MQ=255)
gTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCGTTCTCTgg > 1:4929966/1‑93 (MQ=255)
gatgatCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCGTTCTCTgggt > 1:2092002/1‑91 (MQ=255)
tgatCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCGTTCTCTGGCTAc < 2:4318682/93‑1 (MQ=255)
tgatCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCGTTCTCTGGCTAc > 2:3563438/1‑93 (MQ=255)
gatCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCGTTCTCTGGCTACt < 1:5917228/93‑1 (MQ=255)
gatCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCGTTCTCTGGCTACt > 1:1439167/1‑93 (MQ=255)
|
TATACCGCTTCTGAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATTCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCGTTCTCTGGCTACT > NC_000913/1717984‑1718163
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GTTTATACCGCTTCTGAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATTCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCGTTCTCTGGCTACTGCAG > NC_000913/1717981‑1718167
|
GTTTATACCGCTTCTGAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATC > SRR4302533.4559592/1‑94 (MQ=60)
TTATACCGCTTCTGAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCC < SRR4302533.1343527/94‑1 (MQ=60)
TTATACCGCTTCTGAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCC < SRR4302533.2899201/94‑1 (MQ=60)
TTATACCGCTTCTGAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCC < SRR4302533.2736718/94‑1 (MQ=60)
TATACCGCTTCTGAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCA > SRR4302533.5900434/1‑94 (MQ=60)
ATACCGCTTCTGAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAA > SRR4302533.19822/1‑94 (MQ=60)
AACCGCTTCTGAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAAC < SRR4302533.1649705/94‑1 (MQ=60)
ACCGCTTCTGAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACG < SRR4302533.3809993/94‑1 (MQ=60)
ACCGCTTCTGAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACG < SRR4302533.6044501/94‑1 (MQ=60)
CCGCTTCTGAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGT > SRR4302533.836546/1‑94 (MQ=60)
CGCTTCTGAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTT > SRR4302533.3047431/1‑94 (MQ=60)
GCTTCTGAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTA > SRR4302533.5778888/1‑94 (MQ=60)
CTTCTGAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTAT > SRR4302533.4665120/1‑94 (MQ=60)
CTTCTGAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTAT < SRR4302533.5325979/94‑1 (MQ=60)
CTTCTGAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTAT < SRR4302533.5328557/94‑1 (MQ=60)
TTCTGAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATC > SRR4302533.2960935/1‑94 (MQ=60)
TGAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGT < SRR4302533.1899585/94‑1 (MQ=60)
TGAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGGGATCATCCCAACGTTATCGGT > SRR4302533.455422/1‑94 (MQ=60)
GAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTG < SRR4302533.2717393/94‑1 (MQ=60)
GAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTG > SRR4302533.6309032/1‑94 (MQ=60)
GAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTG > SRR4302533.4931474/1‑94 (MQ=60)
GAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTG > SRR4302533.1976851/1‑94 (MQ=60)
GAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTG < SRR4302533.6013267/94‑1 (MQ=60)
AAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGC > SRR4302533.2693471/1‑94 (MQ=60)
AGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCA > SRR4302533.6318970/1‑94 (MQ=60)
CGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAAT > SRR4302533.1851540/1‑94 (MQ=60)
CGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAAT > SRR4302533.1474218/1‑94 (MQ=60)
GAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATT > SRR4302533.168599/1‑94 (MQ=60)
AAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTG < SRR4302533.5458513/94‑1 (MQ=60)
AAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTG > SRR4302533.6040276/1‑94 (MQ=60)
AAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTG < SRR4302533.2494966/94‑1 (MQ=60)
AACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGG > SRR4302533.3706191/1‑94 (MQ=60)
AACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGG < SRR4302533.4704514/94‑1 (MQ=60)
ACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGC > SRR4302533.2897260/1‑94 (MQ=60)
AAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGGGG > SRR4302533.2006603/1‑94 (MQ=60)
AGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGGGCAATTGGCGGG > SRR4302533.627996/1‑94 (MQ=60)
GTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTG > SRR4302533.918215/1‑94 (MQ=60)
GTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTG > SRR4302533.5948460/1‑94 (MQ=60)
GTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTG < SRR4302533.5978815/94‑1 (MQ=60)
ACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCT < SRR4302533.4094658/94‑1 (MQ=60)
ACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCT > SRR4302533.2873191/1‑94 (MQ=60)
AGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGT > SRR4302533.606455/1‑94 (MQ=60)
GAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTT > SRR4302533.2441602/1‑94 (MQ=60)
GAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTT > SRR4302533.910695/1‑94 (MQ=60)
GAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTT < SRR4302533.554042/94‑1 (MQ=60)
GAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTT < SRR4302533.767644/94‑1 (MQ=60)
TGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTT < SRR4302533.3482650/94‑1 (MQ=60)
TGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTT < SRR4302533.6177468/94‑1 (MQ=60)
GTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTG < SRR4302533.3029963/94‑1 (MQ=60)
CAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGT > SRR4302533.129051/1‑94 (MQ=60)
AGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTG < SRR4302533.5534501/94‑1 (MQ=60)
AGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTG > SRR4302533.1930428/1‑94 (MQ=60)
AGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTG > SRR4302533.3493627/1‑94 (MQ=60)
AGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTAGCGGTGCTGTTCTTGGTG < SRR4302533.637127/94‑1 (MQ=60)
CTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGT > SRR4302533.3721295/1‑94 (MQ=60)
CTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGT > SRR4302533.444156/1‑94 (MQ=60)
CTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGATGTTCTTGGTGGT > SRR4302533.3621952/1‑94 (MQ=60)
TATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTT > SRR4302533.4368561/1‑94 (MQ=60)
TATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTT < SRR4302533.2789891/94‑1 (MQ=60)
ATGGTACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTT > SRR4302533.5334756/1‑94 (MQ=60)
TGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTC < SRR4302533.5543463/94‑1 (MQ=60)
TGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTC > SRR4302533.4762481/1‑94 (MQ=60)
TGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTC > SRR4302533.4153066/1‑94 (MQ=60)
GGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCC < SRR4302533.1659316/94‑1 (MQ=60)
GCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCT < SRR4302533.2368855/94‑1 (MQ=60)
CACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTG < SRR4302533.5170541/94‑1 (MQ=60)
ACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGG < SRR4302533.1274182/94‑1 (MQ=60)
ACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGG > SRR4302533.6268389/1‑94 (MQ=60)
ACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGG > SRR4302533.1078696/1‑94 (MQ=60)
CCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGG < SRR4302533.3728046/94‑1 (MQ=60)
CCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGG < SRR4302533.5786393/94‑1 (MQ=60)
CCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGG > SRR4302533.2118521/1‑94 (MQ=60)
CCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGG > SRR4302533.3976375/1‑94 (MQ=60)
CCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGG < SRR4302533.2786568/94‑1 (MQ=60)
CCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGG < SRR4302533.2283222/94‑1 (MQ=60)
CCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGG > SRR4302533.2311772/1‑94 (MQ=60)
ATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGA > SRR4302533.2006424/1‑94 (MQ=60)
TCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAA < SRR4302533.5667869/94‑1 (MQ=60)
CGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAAT < SRR4302533.174220/94‑1 (MQ=60)
CGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAAT < SRR4302533.6199180/94‑1 (MQ=60)
CGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAAT > SRR4302533.467664/1‑94 (MQ=60)
GTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGGATA > SRR4302533.3556977/1‑94 (MQ=60)
GTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATA > SRR4302533.1056107/1‑94 (MQ=60)
GTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATA < SRR4302533.3841964/94‑1 (MQ=60)
GTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATA < SRR4302533.457114/94‑1 (MQ=60)
GTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATA > SRR4302533.4183073/1‑94 (MQ=60)
GTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGGTTCCTGGGGAATA > SRR4302533.1807843/1‑94 (MQ=60)
TAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACT > SRR4302533.6169808/1‑94 (MQ=60)
AACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTG < SRR4302533.2395296/94‑1 (MQ=60)
GTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTG < SRR4302533.3223534/94‑1 (MQ=60)
GTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTG > SRR4302533.4408918/1‑94 (MQ=60)
GTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTG > SRR4302533.3361034/1‑94 (MQ=60)
CGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTG < SRR4302533.5868717/94‑1 (MQ=60)
CGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTG > SRR4302533.1453865/1‑94 (MQ=60)
CGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTG < SRR4302533.5086019/94‑1 (MQ=60)
CGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTG < SRR4302533.212372/94‑1 (MQ=60)
tccgagcCAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACCGTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGC < SRR4302533.4863696/87‑1 (MQ=60)
TCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGC < SRR4302533.1195458/94‑1 (MQ=60)
TCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGC < SRR4302533.4863695/94‑1 (MQ=60)
TCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGC < SRR4302533.6088383/94‑1 (MQ=60)
CCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCG < SRR4302533.3921771/94‑1 (MQ=60)
GGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGA > SRR4302533.6186744/1‑94 (MQ=60)
GGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGA < SRR4302533.3821641/94‑1 (MQ=60)
TGCAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAAC < SRR4302533.5147183/94‑1 (MQ=60)
TACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTTGCGGTTCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAAC < SRR4302533.486757/94‑1 (MQ=60)
ACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACC > SRR4302533.2492263/1‑94 (MQ=60)
ACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACC < SRR4302533.5923857/94‑1 (MQ=60)
ACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACC < SRR4302533.882338/94‑1 (MQ=60)
ACAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACC < SRR4302533.1060825/94‑1 (MQ=60)
CAGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCG < SRR4302533.4693522/94‑1 (MQ=60)
AGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGG < SRR4302533.4668980/94‑1 (MQ=60)
AGATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTCTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGG < SRR4302533.3400453/94‑1 (MQ=60)
GATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGG < SRR4302533.2782682/94‑1 (MQ=60)
GATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGG < SRR4302533.86674/94‑1 (MQ=60)
GATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGG > SRR4302533.5355168/1‑94 (MQ=60)
ATTCAGGGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGC < SRR4302533.1447388/94‑1 (MQ=60)
TTCAGGGCGGGGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCG > SRR4302533.373679/1‑94 (MQ=60)
GGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCGTTCTC > SRR4302533.831773/1‑94 (MQ=60)
GGCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCGTTCTC < SRR4302533.5514137/94‑1 (MQ=60)
GCGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCGTTCTCT < SRR4302533.100605/94‑1 (MQ=60)
CGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGGGTTCTCTG < SRR4302533.588241/94‑1 (MQ=60)
CGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCGTTCTCTG < SRR4302533.246861/94‑1 (MQ=60)
CGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCGTTCTCTG > SRR4302533.2133661/1‑94 (MQ=60)
CGGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCGTTCTCTG < SRR4302533.5114732/94‑1 (MQ=60)
GGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCGTTCTCTGG > SRR4302533.954497/1‑94 (MQ=60)
GGTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCGTTCTCTGG > SRR4302533.4959820/1‑94 (MQ=60)
GTGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCGTTCTCTGGC < SRR4302533.3494970/94‑1 (MQ=60)
TGATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCGTTCTCTGGGT > SRR4302533.2104885/1‑94 (MQ=60)
GATGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCGTTCTCTGGCTA > SRR4302533.821034/1‑94 (MQ=60)
TGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCTTTCTCTGGCTACT < SRR4302533.3423982/94‑1 (MQ=60)
TGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCGTTCTCTGGCTACT > SRR4302533.188887/1‑94 (MQ=60)
TGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCGTTCTCTGGCTACT > SRR4302533.639885/1‑94 (MQ=60)
TGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCGTTCTCTGGCTACT > SRR4302533.1447853/1‑94 (MQ=60)
TGATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCGTTCTCTGGCTACT < SRR4302533.1537209/94‑1 (MQ=60)
GATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCGTTCTCTGGCTACTG > SRR4302533.39506/1‑94 (MQ=60)
GATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCGTTCTCTGGCTACTG > SRR4302533.4281581/1‑94 (MQ=60)
GATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCGTTCTCTGGCTACTG < SRR4302533.5952988/94‑1 (MQ=60)
ATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCGTTCTCTGGCTACTGC < SRR4302533.6048733/94‑1 (MQ=60)
ATCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCGTTCTCTGGCTACTGC > SRR4302533.5010324/1‑94 (MQ=60)
TCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCGTTCTCTGGCTTCTGCA > SRR4302533.475619/1‑94 (MQ=60)
TCCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCGTTCTCTGGCTACTGCA < SRR4302533.1427193/94‑1 (MQ=60)
CCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTTTTGGTGGCGGAACCGGGCGTTCTCTGGCTACTGCAG > SRR4302533.5929994/1‑94 (MQ=60)
CCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCGTTCTCTGGCTACTGCAG > SRR4302533.626982/1‑94 (MQ=60)
CCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCGTTCTCTGGCTACTGCAG < SRR4302533.2598227/94‑1 (MQ=60)
|
GTTTATACCGCTTCTGAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTATGGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATTCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTTGGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCGTTCTCTGGCTACTGCAG > NC_000913/1717981‑1718167
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
