Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1624 |
250.6 |
12620048 |
98.0% |
12367647 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,762,307 |
T→C |
Q35R (CAG→CGG) |
ydiC ← |
hypothetical protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,762,307 | 0 | T | C | 100.0%
| 663.4
/ NA
| 207 | Q35R (CAG→CGG) | ydiC | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (110/97); total (110/97) |
Only 100 of 211 total aligned reads displayed.
GTCCGGCTCGCTAACACTGTCGAGCACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCTGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGGGTTAAAGGTTCCT > NC_000913/1762219‑1762396
|
gTCCGGCTCGCTAACACTGTCGAGCACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCtt < 1:5201202/93‑1 (MQ=255)
gTCCGGCTCGCTAACACTGTCGAGCACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCtt > 1:2991369/1‑93 (MQ=255)
gTCCGGCTCGCTAACACTGTCGAGCACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCtt < 2:5160043/93‑1 (MQ=255)
tCCGGCTCGCTAACACTGTCGAGCACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCttt < 1:6243442/93‑1 (MQ=255)
ccGGCTCGCTAACACTGTCGAGCACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATCCCCGGCCGCTTTg < 1:5723104/93‑1 (MQ=255)
cGGCTCGCTAACACTGTCGAGCACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGc > 2:5897594/1‑93 (MQ=255)
cGGCTCGCTAACACTGTCGAGCACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGc > 2:4868627/1‑93 (MQ=255)
ggCTCGCTAACACTGTCGAGCACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCCGCCGCTTTGcc > 2:4526701/1‑93 (MQ=255)
ggCTCGCTAACACTGTCGAGCACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCCGCCGCTTTGcc > 1:2586247/1‑93 (MQ=255)
cTCGCTAACACTGTCGAGCACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGccac < 1:1179764/93‑1 (MQ=255)
tCGCTAACACTGTCGAGCACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGccacc < 2:2835181/93‑1 (MQ=255)
gCTAACACTGTCGAGCACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAg < 2:5787680/93‑1 (MQ=255)
cTAACACTGTCGAGCACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGc > 2:4428439/1‑93 (MQ=255)
tAACACTGTCGAGCACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCt < 1:3796807/93‑1 (MQ=255)
tAACACTGTCGAGCACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCt > 1:5446445/1‑93 (MQ=255)
acacTGTCGAGCACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCa < 2:4263204/93‑1 (MQ=255)
cacTGTCGAGCACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCAc < 1:570694/93‑1 (MQ=255)
acTGTCGAGCACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACg > 2:5015764/1‑93 (MQ=255)
acTGTCGAGCACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACg > 1:5085859/1‑93 (MQ=255)
acTGTCGAGCACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACg > 1:1317419/1‑93 (MQ=255)
tGTCGAGCACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGa > 1:5272941/1‑93 (MQ=255)
gTCGAGCACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGAt > 1:2421149/1‑93 (MQ=255)
tCGAGCACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGAtg < 2:2311575/93‑1 (MQ=255)
cGAGCACATAGCCAAATCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGAtgt < 2:4246431/93‑1 (MQ=255)
cGAGCACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGAtgt > 1:6195301/1‑93 (MQ=255)
aGCACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATgtgt < 2:6151449/93‑1 (MQ=255)
gCACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTa < 1:2164574/93‑1 (MQ=255)
cacaTAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTAt < 1:4563794/93‑1 (MQ=255)
cacaTAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTAt < 2:4735748/93‑1 (MQ=255)
acaTAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATc < 2:2536482/93‑1 (MQ=255)
caTAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATcg > 1:3277287/1‑93 (MQ=255)
tAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATcgcc > 2:4883520/1‑93 (MQ=255)
aGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATcgccg > 1:3612264/1‑93 (MQ=255)
gCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATcgccgc > 2:1526750/1‑93 (MQ=255)
gCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATcgccgc > 2:3587432/1‑93 (MQ=255)
gCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATcgccgc > 1:4480482/1‑93 (MQ=255)
ccAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCt > 2:4552073/1‑93 (MQ=255)
cAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCAGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTg > 1:3386835/1‑93 (MQ=255)
aaaGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGc > 2:5602039/1‑93 (MQ=255)
aaGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGct < 2:6025681/93‑2 (MQ=255)
gCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCggg > 2:3336906/1‑93 (MQ=255)
cccGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCgggg > 2:771938/1‑92 (MQ=255)
ccGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGgtg > 1:2268800/1‑93 (MQ=255)
ccGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGgtg > 2:5245269/1‑93 (MQ=255)
cgcgCAGCGCGTTTGCTTCAGGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGgtgt < 2:1155369/93‑1 (MQ=255)
gcgcAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTc > 2:1754149/1‑93 (MQ=255)
cggcAGCCCGTTGGCTTCACGCCTAAGCACGCGCCGACCATACCCGGGCTCTTTGCCACCTGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTc < 2:4174433/91‑1 (MQ=255)
gCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGt > 1:5491460/1‑93 (MQ=255)
gCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGt > 1:4586510/1‑93 (MQ=255)
gCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGt < 2:2864237/93‑1 (MQ=255)
cGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTaa < 1:3150102/93‑1 (MQ=255)
cGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTaa > 1:3902941/1‑93 (MQ=255)
cGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTaa < 2:6085908/93‑1 (MQ=255)
gTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAg < 1:3080679/93‑1 (MQ=255)
gTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAg > 1:871224/1‑93 (MQ=255)
gTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAg > 2:5537932/1‑93 (MQ=255)
ttGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGcc > 1:2643711/1‑93 (MQ=255)
ttGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGcc < 2:1701186/93‑1 (MQ=255)
tGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCt > 1:5580726/1‑93 (MQ=255)
gCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCtt > 2:6052961/1‑93 (MQ=255)
gCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCtt < 2:2252894/93‑1 (MQ=255)
gCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCtt < 2:107273/93‑1 (MQ=255)
gCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCtt < 2:4375052/93‑1 (MQ=255)
cTTCACGCCGAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTg < 2:1972050/93‑1 (MQ=255)
ttCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGc > 2:2954849/1‑93 (MQ=255)
tCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGcc > 2:2693228/1‑93 (MQ=255)
cACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCa < 2:5203751/93‑1 (MQ=255)
aCGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAg < 2:3150515/93‑1 (MQ=255)
aCGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAg > 1:4839621/1‑93 (MQ=255)
cGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAgg < 1:3055747/93‑1 (MQ=255)
cGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGCTAAGCCTTGCCacg > 1:1727622/1‑91 (MQ=255)
ccTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCg > 1:1468416/1‑93 (MQ=255)
ccTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCg > 1:4190636/1‑93 (MQ=255)
cTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGa > 2:3555531/1‑93 (MQ=255)
cTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGa > 2:3130227/1‑93 (MQ=255)
tAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGaa > 2:3230045/1‑93 (MQ=255)
tAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGaa > 1:5810719/1‑93 (MQ=255)
aaGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGaaa < 2:2105908/93‑1 (MQ=255)
aGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAAt < 1:4393636/93‑1 (MQ=255)
aGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAAt > 1:1609008/1‑93 (MQ=255)
cgcccGACCATACCCGGCTGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTtgt < 1:3594497/90‑1 (MQ=255)
aCGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTtgt < 1:2887292/93‑1 (MQ=255)
cGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTtgtg < 1:1923578/93‑1 (MQ=255)
ccGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTggg > 2:157002/1‑93 (MQ=255)
ccGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTCAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTggg > 1:6056915/1‑93 (MQ=255)
cGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGGGt < 1:4809220/93‑1 (MQ=255)
cGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGGGt < 2:1352102/93‑1 (MQ=255)
gACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGGGtt > 2:1235132/1‑93 (MQ=255)
aCCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGGGTTa > 1:334117/1‑93 (MQ=255)
aCCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGGGTTa > 2:3398351/1‑93 (MQ=255)
aCCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGGGTTa > 2:545904/1‑93 (MQ=255)
aCCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGGGTTa > 1:4774404/1‑93 (MQ=255)
aTACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGGGTTAAAg > 2:3825511/1‑93 (MQ=255)
aTACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGGGTTAAAg > 2:5411763/1‑93 (MQ=255)
tACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGCAATCTTGGGGGTTAAAgg > 2:2368308/1‑93 (MQ=255)
tACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGGGTTAAAgg > 2:3065488/1‑93 (MQ=255)
tACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGGGTTAAAgg > 2:5930995/1‑93 (MQ=255)
tACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGGGTTAAAgg < 1:100470/93‑1 (MQ=255)
ccGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGGGTTAAAGGTTc < 1:5380579/93‑1 (MQ=255)
cGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGGGTTAAAGGTTcc > 1:1532376/1‑93 (MQ=255)
|
GTCCGGCTCGCTAACACTGTCGAGCACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCTGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGGGTTAAAGGTTCCT > NC_000913/1762219‑1762396
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
TCTTTGTCCGGCTCGCTAACACTGTCGAGCACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCTGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGGGTTAAAGGTTCCTGAAT > NC_000913/1762214‑1762400
|
TCTTTGTCCGGCTCGCTAACACTGTCGAGCACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCC < SRR4302533.3336564/94‑1 (MQ=60)
TTTGTCCGGCTCGCTAACACTGTCGAGCACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGC < SRR4302533.4613877/94‑1 (MQ=60)
TGTCCGGCTCGCTAACACTGTCGAGCACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTT > SRR4302533.2599615/1‑94 (MQ=60)
TGTCCGGCTCGCTAACACTGTCGAGCACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTT > SRR4302533.3009663/1‑94 (MQ=60)
GTCCGGCTCGCTAACACTGTCGAGCACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTT < SRR4302533.5232553/94‑1 (MQ=60)
TCCGGCTCGCTAACACTGTCGAGCACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTG < SRR4302533.6280814/94‑1 (MQ=60)
CCGGCTCGCTAACACTGTCGAGCACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATCCCCGGCCGCTTTGC < SRR4302533.5757657/94‑1 (MQ=60)
CGGCTCGCTAACACTGTCGAGCACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCCGCCGCTTTGCC > SRR4302533.2602147/1‑94 (MQ=60)
CGGCTCGCTAACACTGTCGAGCACATAGCCAAAGCCCGCGCAACCCGTTTGCCTCACGCCTTAGCGCACGCCGACCATACCCCGCCGCTTTGCC > SRR4302533.4044429/1‑94 (MQ=60)
GGCTCGCTAACACTGTCGAGCACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCA > SRR4302533.3506666/1‑94 (MQ=60)
GCTCGCTAACACTGTCGAGCACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCAC > SRR4302533.4840204/1‑94 (MQ=60)
CTCGCTAACACTGTCGAGCACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACC < SRR4302533.1186852/94‑1 (MQ=60)
CGCTAACACTGTCGAGCACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAG < SRR4302533.4608323/94‑1 (MQ=60)
GCTAACACTGTCGAGCACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGC > SRR4302533.1666410/1‑94 (MQ=60)
CTAACACTGTCGAGCACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCT > SRR4302533.5038739/1‑94 (MQ=60)
CTAACACTGTCGAGCACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCT > SRR4302533.5479256/1‑94 (MQ=60)
CTAACACTGTCGAGCACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCT < SRR4302533.5427892/94‑1 (MQ=60)
TAACACTGTCGAGCACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTC < SRR4302533.3820048/94‑1 (MQ=60)
AACACTGTCGAGCACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGTGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCA > SRR4302533.3069599/1‑94 (MQ=60)
AACACTGTCGAGCACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCA > SRR4302533.4512187/1‑94 (MQ=60)
ACACTGTCGAGCACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCAC < SRR4302533.3297782/94‑1 (MQ=60)
CACTGTCGAGCACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACG < SRR4302533.574062/94‑1 (MQ=60)
CACTGTCGAGCACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACG > SRR4302533.5116590/1‑94 (MQ=60)
CACTGTCGAGCACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACG > SRR4302533.1325322/1‑94 (MQ=60)
ACTGTCGAGCACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGG < SRR4302533.1233749/94‑1 (MQ=60)
CTGTCGAGCACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGA > SRR4302533.5304559/1‑94 (MQ=60)
CTGTCGAGCACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGA > SRR4302533.4187835/1‑94 (MQ=60)
TGTCGAGCACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGAT > SRR4302533.2436099/1‑94 (MQ=60)
TCGAGCACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGT > SRR4302533.6232472/1‑94 (MQ=60)
GAGCACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGT < SRR4302533.3780979/94‑1 (MQ=60)
GCACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTAT < SRR4302533.2177890/94‑1 (MQ=60)
CACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATC < SRR4302533.4591468/94‑1 (MQ=60)
ACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCG > SRR4302533.3297527/1‑94 (MQ=60)
ACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCG < SRR4302533.6313535/94‑1 (MQ=60)
TAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCG > SRR4302533.2337480/1‑94 (MQ=60)
TAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCG > SRR4302533.3634496/1‑94 (MQ=60)
AGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGC > SRR4302533.4507586/1‑94 (MQ=60)
GCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATCCCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCT < SRR4302533.4669724/94‑1 (MQ=60)
CCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCAGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTG > SRR4302533.3407744/1‑94 (MQ=60)
CAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGC < SRR4302533.5656222/94‑1 (MQ=60)
AAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGG > SRR4302533.2628334/1‑94 (MQ=60)
GCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGT < SRR4302533.2281319/94‑1 (MQ=60)
CCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTG > SRR4302533.2282837/1‑94 (MQ=60)
CAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCG < SRR4302533.5832478/94‑1 (MQ=60)
AGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGT > SRR4302533.4614294/1‑94 (MQ=60)
AGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGT > SRR4302533.5524587/1‑94 (MQ=60)
CCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTA > SRR4302533.5542923/1‑94 (MQ=60)
CCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAA > SRR4302533.3926778/1‑94 (MQ=60)
CCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAA < SRR4302533.1075572/94‑1 (MQ=60)
CGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAG > SRR4302533.876338/1‑94 (MQ=60)
CGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAG < SRR4302533.3169472/94‑1 (MQ=60)
GTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGC > SRR4302533.3336964/1‑94 (MQ=60)
GTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGC < SRR4302533.3099579/94‑1 (MQ=60)
TTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCC > SRR4302533.2659955/1‑94 (MQ=60)
TTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCT > SRR4302533.5614451/1‑94 (MQ=60)
CTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGC > SRR4302533.1506060/1‑94 (MQ=60)
TTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCC < SRR4302533.5369217/94‑1 (MQ=60)
TTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCC < SRR4302533.1467322/94‑1 (MQ=60)
TCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCA < SRR4302533.3006891/94‑1 (MQ=60)
TCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCA < SRR4302533.3086472/94‑1 (MQ=60)
CACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAG < SRR4302533.3616643/94‑1 (MQ=60)
CACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAG > SRR4302533.4868954/1‑94 (MQ=60)
CACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAG < SRR4302533.677282/94‑1 (MQ=60)
CCGCCTAAGCGCACGCCGACCATCCCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGG < SRR4302533.5233603/94‑1 (MQ=60)
ACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCATGCCAGG < SRR4302533.5138181/94‑1 (MQ=60)
ACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGCTAAGCCTTGCCACG > SRR4302533.1738104/1‑94 (MQ=60)
CGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGC < SRR4302533.3183154/94‑1 (MQ=60)
CGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGC < SRR4302533.3074483/94‑1 (MQ=60)
GCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCG > SRR4302533.1477271/1‑94 (MQ=60)
GCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCG > SRR4302533.4216001/1‑94 (MQ=60)
CTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAA > SRR4302533.5845807/1‑94 (MQ=60)
AAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAAT > SRR4302533.1618768/1‑94 (MQ=60)
AAGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAAT < SRR4302533.3833622/94‑1 (MQ=60)
AGCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATC < SRR4302533.4420161/94‑1 (MQ=60)
GCGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCT > SRR4302533.5445124/1‑94 (MQ=60)
CGCACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTT < SRR4302533.6119871/94‑1 (MQ=60)
CACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGT < SRR4302533.3162338/94‑1 (MQ=60)
cgcCCGACCATACCCGGCTGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTG < SRR4302533.3616613/91‑1 (MQ=60)
ACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTG < SRR4302533.4534223/94‑1 (MQ=60)
ACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTG > SRR4302533.5742996/1‑94 (MQ=60)
ACGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTG < SRR4302533.2905043/94‑1 (MQ=60)
CGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGG < SRR4302533.4360352/94‑1 (MQ=60)
CGCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGG < SRR4302533.1935315/94‑1 (MQ=60)
GCCGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTCAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGGG > SRR4302533.6093590/1‑94 (MQ=60)
CGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGGGAAATCTTGGGGGTT > SRR4302533.1759808/1‑94 (MQ=60)
CGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGGGTT < SRR4302533.3379984/94‑1 (MQ=60)
CGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGGGTT < SRR4302533.4838369/94‑1 (MQ=60)
CGACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGGGTT > SRR4302533.5488633/1‑94 (MQ=60)
GACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGGGTTA > SRR4302533.336160/1‑94 (MQ=60)
GACCATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGGGTTA > SRR4302533.4803332/1‑94 (MQ=60)
ATACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGGGTTAAAGG > SRR4302533.6009651/1‑94 (MQ=60)
TTCCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGGGTTAAAGGT < SRR4302533.1562763/94‑1 (MQ=60)
TACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGGGTTAAAGGT > SRR4302533.2412862/1‑94 (MQ=60)
TACCCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGGGTTAAAGGT < SRR4302533.101096/94‑1 (MQ=60)
CCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGGGTTAAAGGTTCC > SRR4302533.1541582/1‑94 (MQ=60)
CCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGGGTTAAAGGTTCC > SRR4302533.2852688/1‑94 (MQ=60)
CCGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGGGTTAAAGGTTCC < SRR4302533.5412904/94‑1 (MQ=60)
CGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGGGTTAAAGGTTCCT < SRR4302533.4424385/94‑1 (MQ=60)
CGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGGGTTAAAGGTTCCT < SRR4302533.4805960/94‑1 (MQ=60)
CGGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGGGTTAAAGGTTCCT > SRR4302533.199674/1‑94 (MQ=60)
GGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGGGTTAAAGGTTCCTG > SRR4302533.4496798/1‑94 (MQ=60)
GGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGGGTTAAAGGTTCCTG < SRR4302533.6272383/94‑1 (MQ=60)
GGCCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGGGTTAAAGGTTCCTG > SRR4302533.4284009/1‑94 (MQ=60)
CCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGGGTTAAAGGTTCCTGAA < SRR4302533.5930682/94‑1 (MQ=60)
CCGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGGGTTAAAGGTTCCTGAA < SRR4302533.732390/94‑1 (MQ=60)
CGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGGGTTAAAGGTTTCTGAAT > SRR4302533.755628/1‑94 (MQ=60)
CGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGGGTTAAAGGTTCCTGAAT > SRR4302533.5345181/1‑94 (MQ=60)
CGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGGGTTAAAGGTTCCTGAAT < SRR4302533.2204084/94‑1 (MQ=60)
CGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGGGTTAAAGGTTCCTGAAT < SRR4302533.5549873/94‑1 (MQ=60)
|
TCTTTGTCCGGCTCGCTAACACTGTCGAGCACATAGCCAAAGCCCGCGCAGCCCGTTTGCTTCACGCCTAAGCGCACGCCGACCATACCCGGCTGCTTTGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGGGTTAAAGGTTCCTGAAT > NC_000913/1762214‑1762400
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
