Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1624 |
250.6 |
12620048 |
98.0% |
12367647 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,841,661 |
A→G |
T423A (ACC→GCC) |
gdhA → |
NADP‑specific glutamate dehydrogenase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,841,661 | 0 | A | G | 100.0%
| 768.2
/ NA
| 235 | T423A (ACC→GCC) | gdhA | NADP‑specific glutamate dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (110/125); total (110/125) |
Only 100 of 237 total aligned reads displayed.
TGGAAAGCCGAGAAAGTTGACGCACGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAACCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGTAAATGCC > NC_000913/1841571‑1841750
|
ggAAAGCCGAGAAAGTTGACGCACGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCa > 1:4188010/1‑93 (MQ=255)
ggAAAGCCGAGAAAGTTGACGCACGTTTGCATCACATCAAGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCa > 1:4552007/1‑93 (MQ=255)
gAAAGCCGAGAAAGTTGACGCACGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCaa > 1:5703830/1‑93 (MQ=255)
aaaGCCGAGAAAGTTGACGCACGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAAc > 1:6242534/1‑93 (MQ=255)
aaaGCCGAGAAAGTTGACGCACGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAAc < 2:3346914/93‑1 (MQ=255)
gCCGAGAAAGTTGACGCACGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTAc > 2:914668/1‑93 (MQ=255)
gCCGAGAAAGTTGACGCACGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTAc < 1:3675218/93‑1 (MQ=255)
ccGAGAAAGTTGACGCACGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACg < 2:4086353/93‑1 (MQ=255)
gagaAAGTTGACGCACGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTg > 1:1494266/1‑93 (MQ=255)
gagaAAGTTGACGCACGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTg > 2:3835855/1‑93 (MQ=255)
agaAAGTTGACGCACGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGc > 2:2414128/1‑93 (MQ=255)
gaAAGTTGACGCACGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCa > 1:5214156/1‑93 (MQ=255)
gaAAGTTGACGCACGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCa < 2:463751/93‑1 (MQ=255)
gaAAGTTGACGCACGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCa > 2:4330788/1‑93 (MQ=255)
aaaGTTGACGCACGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAg > 2:2047660/1‑93 (MQ=255)
aaGTTGACGCACGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAgg > 1:2744/1‑93 (MQ=255)
aGTTGACGCACGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAggg < 1:3957193/93‑1 (MQ=255)
gTTGACGCACGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGgc > 1:1127042/1‑93 (MQ=255)
tGACGCACGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGgcgc < 2:1972296/93‑1 (MQ=255)
gCACGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAAc > 2:261873/1‑93 (MQ=255)
cGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACAtt > 2:3996497/1‑93 (MQ=255)
gTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTg < 2:3432799/93‑1 (MQ=255)
gTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTg > 2:79403/1‑93 (MQ=255)
tttGCATCACATCATGCTGGATATTCACCATGCCTGTGTTTATTATTGTTGTTAAGGTTAGCAAGCCAATTACTGTCAGGGCGAGAACATTgg > 2:3941602/1‑92 (MQ=255)
tttGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGc < 1:4613177/93‑1 (MQ=255)
tttGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGc > 1:3812151/1‑93 (MQ=255)
tttGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGc < 2:5256814/93‑1 (MQ=255)
tGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCg < 1:1927576/93‑1 (MQ=255)
tGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCg < 2:3644318/93‑1 (MQ=255)
gCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCgg < 1:4718481/93‑1 (MQ=255)
atcacatcaTGCTGGATATCCACCATGCCTGTGGTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCggct > 2:4940763/1‑91 (MQ=255)
tcacatcaTGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGttt > 1:2655295/1‑93 (MQ=255)
tcacatcaTGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGttt > 2:3582671/1‑93 (MQ=255)
tcacatcaTGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGttt > 1:3303759/1‑93 (MQ=255)
tcacatcaTGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGttt > 2:3610676/1‑93 (MQ=255)
cacatcaTGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGtttt > 2:2929468/1‑93 (MQ=255)
acatcaTGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGNAGGGCGCGAACATNGNCGGTTTtg > 2:1403465/1‑93 (MQ=255)
catcatGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTtgt < 1:5817598/93‑1 (MQ=255)
catcatGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTtgt > 1:703813/1‑93 (MQ=255)
catcatGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTtgt < 1:2338558/93‑1 (MQ=255)
catGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGaa < 1:5192802/93‑1 (MQ=255)
catGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGaa < 1:2386234/93‑1 (MQ=255)
catGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGaa < 2:4527517/93‑1 (MQ=255)
catGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGaa < 1:3930580/93‑1 (MQ=255)
atGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAg < 2:177781/93‑1 (MQ=255)
gCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGt < 1:4452817/93‑1 (MQ=255)
gCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGt > 2:6067989/1‑93 (MQ=255)
gCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGt > 1:4815399/1‑93 (MQ=255)
gCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGt < 2:4723757/93‑1 (MQ=255)
gCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGt > 2:5909789/1‑93 (MQ=255)
gCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGt > 1:6149213/1‑93 (MQ=255)
cTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGtt < 1:5345625/93‑1 (MQ=255)
cTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGtt > 2:1516685/1‑93 (MQ=255)
cTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGtt < 2:2682515/93‑1 (MQ=255)
tGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGCACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTg > 2:3090853/1‑93 (MQ=255)
tGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTg > 2:6239074/1‑93 (MQ=255)
tGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTg > 2:539650/1‑93 (MQ=255)
gATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGcc > 1:2593807/1‑93 (MQ=255)
gATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGcc < 2:5682040/93‑1 (MQ=255)
gATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGcc < 1:2963428/93‑1 (MQ=255)
tatCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCcga > 2:2850183/1‑93 (MQ=255)
atCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCcgat < 1:2056486/93‑1 (MQ=255)
tCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCcgatg > 2:1117415/1‑93 (MQ=255)
ccaccaTGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCcgatgc < 1:3232534/93‑1 (MQ=255)
caccaTGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGCTGCcgatgcg < 1:228046/93‑1 (MQ=255)
ccaTGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCCACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCcgatgcgat > 1:892328/1‑93 (MQ=255)
ccaTGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCcgatgcgat > 2:1281490/1‑93 (MQ=255)
aTGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCgatgcgatgc > 2:5017350/1‑93 (MQ=255)
tGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCt < 1:1685414/93‑1 (MQ=255)
gCCTGTGTAGAGCATGGTGGTTAAGGTGAGCAAGCCGAGTACGTGCAGGGCGCGATCGTTGCCGGTTTTGGGAAGGTTGACGAGGCGATGCTg < 2:5554594/93‑1 (MQ=255)
ccTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTgg < 2:4782389/93‑1 (MQ=255)
ccTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTgg < 2:3022489/93‑1 (MQ=255)
ccTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTgg < 2:704067/93‑1 (MQ=255)
ccTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTgg < 2:5429241/93‑1 (MQ=255)
cTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGgc > 2:5300207/1‑93 (MQ=255)
tgtgTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGgcg > 2:1671409/1‑93 (MQ=255)
gtgtTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGgcgc < 1:2462459/93‑1 (MQ=255)
tgtTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCa < 2:2456760/93‑1 (MQ=255)
gtTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAg < 1:1853353/93‑1 (MQ=255)
ttGAGCGTGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTACAGGGCGCGAACATTGCCGGGTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGTCGCAgg > 2:5821490/1‑93 (MQ=255)
ttGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAgg < 1:789604/93‑1 (MQ=255)
gtGAGCATGGGGGTGAAGGTGAACCAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAgg < 1:1837338/92‑1 (MQ=255)
tGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAggg < 2:4457946/93‑1 (MQ=255)
gAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGgt < 1:4228415/93‑1 (MQ=255)
gCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGgtgt < 1:4957606/93‑1 (MQ=255)
tggtggTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGCCGCAGGGTGTGAt < 2:6050764/93‑1 (MQ=255)
ggtggtGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGAtt < 1:1242714/93‑1 (MQ=255)
gtggtgAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGAttt > 2:897962/1‑93 (MQ=255)
gtgAAGTTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAg < 1:3878643/93‑1 (MQ=255)
gAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGtt > 1:3457401/1‑93 (MQ=255)
gAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGtt < 1:1429157/93‑1 (MQ=255)
aaGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTg > 2:1421159/1‑93 (MQ=255)
aGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGgtgt < 1:196954/93‑1 (MQ=255)
ggTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGTa > 1:1575723/1‑93 (MQ=255)
tGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGTaaa < 2:5196506/93‑1 (MQ=255)
tGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGTaaa < 1:2414128/93‑1 (MQ=255)
tGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGTaaa < 1:1624227/93‑1 (MQ=255)
gAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTCGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGTAAAt < 1:2818337/93‑1 (MQ=255)
gCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGGGATTTAAGTTGTAAATGc > 2:1215233/1‑93 (MQ=255)
cAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGTAAATGcc < 1:4248564/93‑1 (MQ=255)
|
TGGAAAGCCGAGAAAGTTGACGCACGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAACCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGTAAATGCC > NC_000913/1841571‑1841750
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GCTGGAAAGCCGAGAAAGTTGACGCACGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAACCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGTAAATGCCTG > NC_000913/1841569‑1841752
|
GCTGGAAAGCCGAGAAAGTTGACGCACGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGC < SRR4302533.143305/94‑1 (MQ=60)
CTGGAAAGCCGAGAAAGTTGACGCACGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCC > SRR4302533.1940959/1‑94 (MQ=60)
CTGGAAAGCCGAGAAAGTTGACGCACGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCC < SRR4302533.2255080/94‑1 (MQ=60)
TGGAAAGCCGAGAAAGTTGACGCACGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCA > SRR4302533.4213370/1‑94 (MQ=60)
TGGAAAGCCGAGAAAGTTGACGCACGTTTGCATCACATCAAGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCA > SRR4302533.4579614/1‑94 (MQ=60)
GGAAAGCCGAGAAAGTTGACGCACGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAA > SRR4302533.5738283/1‑94 (MQ=60)
GGAAAGCCGAGAAAGTTGACGCACGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAA > SRR4302533.2453865/1‑94 (MQ=60)
GAAAGCCGAGAAAGTTGACGCACGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAAC > SRR4302533.6279905/1‑94 (MQ=60)
AAAGCCGAGAAAGTTGACGCACGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACT > SRR4302533.1868243/1‑94 (MQ=60)
GCCGAGAAAGTTGACGCACGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACG < SRR4302533.3697804/94‑1 (MQ=60)
GCCGAGAAAGTTGACGCACGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACG < SRR4302533.3193557/94‑1 (MQ=60)
CCGAGAAAGTTGACGCACGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGT > SRR4302533.2721996/1‑94 (MQ=60)
CCGAGAAAGTTGACGCACGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGT > SRR4302533.5850030/1‑94 (MQ=60)
CGAGAAAGTTGACGCACGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTG < SRR4302533.1244721/94‑1 (MQ=60)
CGAGAAAGTTGACGCACGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTG > SRR4302533.1670594/1‑94 (MQ=60)
CGAGAAAGTTGACGCACGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTG > SRR4302533.1503272/1‑94 (MQ=60)
GAGAAAGTTGACGCACGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGC > SRR4302533.4237822/1‑94 (MQ=60)
AGAAAGTTGACGCACGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCA > SRR4302533.5245556/1‑94 (MQ=60)
AGAAAGTTGACGCACGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCA > SRR4302533.4708542/1‑94 (MQ=60)
GAAAGTTGACGCACGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAG < SRR4302533.3878267/94‑1 (MQ=60)
AAAGTTGACGCACGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGG > SRR4302533.2765/1‑94 (MQ=60)
AAAGTTGACGCACGTGTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGG < SRR4302533.3770913/94‑1 (MQ=60)
AAGTTGACGCACGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGG < SRR4302533.1832419/94‑1 (MQ=60)
AAGTTGACGCACGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGG < SRR4302533.5224676/94‑1 (MQ=60)
AGTTGACGCACGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGC > SRR4302533.3979874/1‑94 (MQ=60)
AGTTGACGCACGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGC < SRR4302533.3981312/94‑1 (MQ=60)
AGTTGACGCACGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGC > SRR4302533.1133736/1‑94 (MQ=60)
GTTGACGCACGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCG < SRR4302533.4620943/94‑1 (MQ=60)
GTTGACGCACGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCG < SRR4302533.350839/94‑1 (MQ=60)
GTTGACGCACGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCG < SRR4302533.4261985/94‑1 (MQ=60)
TTGACGCACGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGC < SRR4302533.4848806/94‑1 (MQ=60)
TTGACGCACGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGC < SRR4302533.2069163/94‑1 (MQ=60)
GCACGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACA > SRR4302533.1287343/1‑94 (MQ=60)
ACGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATT > SRR4302533.235358/1‑94 (MQ=60)
CGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTG > SRR4302533.2598157/1‑94 (MQ=60)
GTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGC > SRR4302533.4355405/1‑94 (MQ=60)
GTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGC > SRR4302533.3835465/1‑94 (MQ=60)
TTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCC < SRR4302533.3331962/94‑1 (MQ=60)
TTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCC < SRR4302533.4475826/94‑1 (MQ=60)
TTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCC < SRR4302533.4641122/94‑1 (MQ=60)
TTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCG < SRR4302533.5441542/94‑1 (MQ=60)
TGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGG < SRR4302533.1939337/94‑1 (MQ=60)
GCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGT > SRR4302533.1449617/1‑94 (MQ=60)
GCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGT < SRR4302533.4747095/94‑1 (MQ=60)
CATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTT > SRR4302533.2714395/1‑94 (MQ=60)
ATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTT > SRR4302533.2671603/1‑94 (MQ=60)
ATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTT > SRR4302533.5001971/1‑94 (MQ=60)
ATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTT > SRR4302533.3324162/1‑94 (MQ=60)
CACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTG < SRR4302533.1669883/94‑1 (MQ=60)
ACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGT > SRR4302533.707973/1‑94 (MQ=60)
ACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGT < SRR4302533.239750/94‑1 (MQ=60)
CATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTG > SRR4302533.2637815/1‑94 (MQ=60)
CATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTG < SRR4302533.5852741/94‑1 (MQ=60)
CATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTG < SRR4302533.2353038/94‑1 (MQ=60)
ATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGA > SRR4302533.4767799/1‑94 (MQ=60)
TCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAA < SRR4302533.278182/94‑1 (MQ=60)
TCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAA < SRR4302533.3257073/94‑1 (MQ=60)
CATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAG < SRR4302533.3954574/94‑1 (MQ=60)
CATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAG < SRR4302533.2400980/94‑1 (MQ=60)
CATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAG < SRR4302533.5224124/94‑1 (MQ=60)
ATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGG < SRR4302533.2045958/94‑1 (MQ=60)
ATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGG > SRR4302533.6167081/1‑94 (MQ=60)
TGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGT > SRR4302533.6186229/1‑94 (MQ=60)
TGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGT > SRR4302533.4844585/1‑94 (MQ=60)
GCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTT < SRR4302533.4479739/94‑1 (MQ=60)
CTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTG > SRR4302533.3134627/1‑94 (MQ=60)
CTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTG > SRR4302533.866886/1‑94 (MQ=60)
CTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTG < SRR4302533.5377687/94‑1 (MQ=60)
CTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTG > SRR4302533.3923740/1‑94 (MQ=60)
CTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTG < SRR4302533.5247343/94‑1 (MQ=60)
TGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGGTTTGTGAAGGTTGC > SRR4302533.98224/1‑94 (MQ=60)
GGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCC > SRR4302533.2609745/1‑94 (MQ=60)
GATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCG > SRR4302533.1863696/1‑94 (MQ=60)
GATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCG < SRR4302533.2981545/94‑1 (MQ=60)
ATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATG < SRR4302533.2069170/94‑1 (MQ=60)
CCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCG < SRR4302533.3252452/94‑1 (MQ=60)
CACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGA > SRR4302533.6279407/1‑94 (MQ=60)
CACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGCTGCCGATGCGA < SRR4302533.229462/94‑1 (MQ=60)
ACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCCACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGAT > SRR4302533.897573/1‑94 (MQ=60)
CCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATG < SRR4302533.2849117/94‑1 (MQ=60)
CATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGC > SRR4302533.2420054/1‑94 (MQ=60)
ATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCT < SRR4302533.2254458/94‑1 (MQ=60)
ATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCT < SRR4302533.6344343/94‑1 (MQ=60)
TGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTG < SRR4302533.1695626/94‑1 (MQ=60)
CCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGC < SRR4302533.2334291/94‑1 (MQ=60)
CCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGC < SRR4302533.1465532/94‑1 (MQ=60)
CCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGC < SRR4302533.6337306/94‑1 (MQ=60)
GTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCA < SRR4302533.2477650/94‑1 (MQ=60)
GTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGG < SRR4302533.1864651/94‑1 (MQ=60)
TTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGG < SRR4302533.1522409/94‑1 (MQ=60)
TTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGG < SRR4302533.794250/94‑1 (MQ=60)
GTGAGCATGGGGGTGAAGGTGAACCAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGG < SRR4302533.1848544/94‑1 (MQ=60)
GAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCTCAGGGTG < SRR4302533.71286/94‑1 (MQ=60)
GAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTG < SRR4302533.4253980/94‑1 (MQ=60)
GCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTG < SRR4302533.4987641/94‑1 (MQ=60)
CATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGA < SRR4302533.3694213/94‑1 (MQ=60)
CATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGA > SRR4302533.3950321/1‑94 (MQ=60)
ATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGCTGCTGGCGCAGGGTGTGAT > SRR4302533.4202213/1‑94 (MQ=60)
GGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTT < SRR4302533.1250135/94‑1 (MQ=60)
TGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAA < SRR4302533.496003/94‑1 (MQ=60)
GTGAAGTTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGT < SRR4302533.3902313/94‑1 (MQ=60)
TGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTT > SRR4302533.1929357/1‑94 (MQ=60)
TGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTT > SRR4302533.3478747/1‑94 (MQ=60)
GAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTG < SRR4302533.1437798/94‑1 (MQ=60)
GAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTG < SRR4302533.1618979/94‑1 (MQ=60)
GAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTG < SRR4302533.4663514/94‑1 (MQ=60)
AGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGTA > SRR4302533.1585210/1‑94 (MQ=60)
AGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGGTGTA < SRR4302533.198196/94‑1 (MQ=60)
TGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGTAAAT < SRR4302533.2429041/94‑1 (MQ=60)
TGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGTAAAT < SRR4302533.5942445/94‑1 (MQ=60)
TGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGTAAAT < SRR4302533.1634064/94‑1 (MQ=60)
GAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGTAAATG < SRR4302533.2601602/94‑1 (MQ=60)
GAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGTAAATG < SRR4302533.4542046/94‑1 (MQ=60)
GAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTCGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGTAAATG < SRR4302533.2835682/94‑1 (MQ=60)
GCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGTAAATGCC < SRR4302533.5256171/94‑1 (MQ=60)
CAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGTAAATGCCT < SRR4302533.4274205/94‑1 (MQ=60)
CAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGTAAATGCCT < SRR4302533.4129225/94‑1 (MQ=60)
AAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGTAAATGCCTG < SRR4302533.2132421/94‑1 (MQ=60)
|
GCTGGAAAGCCGAGAAAGTTGACGCACGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAACCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGTAAATGCCTG > NC_000913/1841569‑1841752
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
