Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1624 |
250.6 |
12620048 |
98.0% |
12367647 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,977,687 |
T→C |
intergenic (‑448/‑90) |
insA5 ← / → yecG |
IS1 protein InsA/putative regulator |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,977,687 | 0 | T | C | 99.4%
| 575.5
/ NA
| 178 | intergenic (‑448/‑90) | insA5/yecG | IS1 protein InsA/putative regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/0); new base C (116/61); total (117/61) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 |
Only 100 of 178 total aligned reads displayed.
GTACACTATTTTCTTATAATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAGTTCACAGAATAAGGAACAGGTT > NC_000913/1977598‑1977776
|
gTACACTATTTTCTTATAATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCAcc < 2:1749817/93‑1 (MQ=255)
gTACACTATTTTCTTATAATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCAcc < 1:4227823/93‑1 (MQ=255)
tACACTATTTTCTTATAATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCt > 2:1148688/1‑93 (MQ=255)
tACACTATTTTCTTATAATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCt < 1:1732860/93‑1 (MQ=255)
cTATTTTCTTATAATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGttt > 1:3419678/1‑93 (MQ=255)
ttttCTTATAATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGAc < 2:4594722/93‑1 (MQ=255)
ttttCTTATAATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGAc < 1:4985467/93‑1 (MQ=255)
tttCTTATAATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGAcc > 1:6158702/1‑93 (MQ=255)
tttCTTATAATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGCTTGAcc > 1:5758151/1‑93 (MQ=255)
ttCTTATAATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCg < 1:3188057/93‑1 (MQ=255)
cTTATAATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAg > 1:1097535/1‑93 (MQ=255)
tataATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGtt > 2:639/1‑93 (MQ=255)
ataATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTg > 2:952651/1‑93 (MQ=255)
ataATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTg < 2:679163/93‑1 (MQ=255)
ataATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGGGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTg > 1:2872506/1‑93 (MQ=255)
taATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTgg > 2:4501803/1‑93 (MQ=255)
aaTTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTggg > 1:552784/1‑93 (MQ=255)
aaTTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTggg > 1:609916/1‑93 (MQ=255)
aaTTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTggg > 1:2093776/1‑93 (MQ=255)
aaTTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTggg > 2:1541627/1‑93 (MQ=255)
aTTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGa < 1:2323648/93‑1 (MQ=255)
aTTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGa < 2:3806088/93‑1 (MQ=255)
ttACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGAt > 1:4796207/1‑93 (MQ=255)
aCATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTg > 2:6177088/1‑93 (MQ=255)
aCATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTg < 2:88395/93‑1 (MQ=255)
cATTTGAAATTATATGATCTCCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGc < 1:3474292/93‑1 (MQ=255)
aTTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCATTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGcg > 1:4446221/1‑93 (MQ=255)
tttGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGcgt < 1:6303666/93‑1 (MQ=255)
tttGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGcgt > 1:2709024/1‑93 (MQ=255)
ttGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGcgtc < 2:2445581/93‑1 (MQ=255)
aaaTTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGtt > 1:5677391/1‑93 (MQ=255)
aTTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTtc < 1:4349592/93‑1 (MQ=255)
aTTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTtc < 2:3136430/93‑1 (MQ=255)
ttATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTtct > 1:4512100/1‑93 (MQ=255)
ttATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTtct > 1:5700938/1‑93 (MQ=255)
ttATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTtct > 1:6129716/1‑93 (MQ=255)
tataTGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTtctc < 1:5183235/93‑1 (MQ=255)
atatGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTcc > 1:4532661/1‑93 (MQ=255)
tatGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCa > 2:5093683/1‑93 (MQ=255)
atGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCAt > 1:1632506/1‑93 (MQ=255)
tGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCAtt > 1:919261/1‑93 (MQ=255)
gATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTa < 1:4145935/93‑1 (MQ=255)
aTCACCGGGAGAGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAg > 2:30381/1‑93 (MQ=255)
tCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAgg > 1:2074445/1‑93 (MQ=255)
cACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGa < 1:6247075/93‑1 (MQ=255)
cGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTa > 1:5715563/1‑93 (MQ=255)
gggAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTaa < 1:3010518/93‑1 (MQ=255)
gggAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTaa < 2:1867755/93‑1 (MQ=255)
ggAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTaaa > 2:6027309/1‑93 (MQ=255)
ggAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTaaa < 2:5444169/93‑1 (MQ=255)
aGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGc < 2:3503546/93‑1 (MQ=255)
aGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGc > 2:3276373/1‑93 (MQ=255)
tgattgatTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCtt > 2:4865420/1‑93 (MQ=255)
gattgattAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCttt > 2:3696407/1‑93 (MQ=255)
gattgattAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCttt > 1:4509207/1‑93 (MQ=255)
gattgattAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCttt > 2:5927904/1‑93 (MQ=255)
gattgattAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCttt > 2:5865237/1‑93 (MQ=255)
attgattAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTa > 1:4597518/1‑93 (MQ=255)
ttgattAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTaa > 1:642669/1‑93 (MQ=255)
ttgattAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTaa > 2:1756394/1‑93 (MQ=255)
gattAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAATGCTTTAATg > 1:453152/1‑93 (MQ=255)
gattAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATg < 1:1381962/93‑1 (MQ=255)
aattaTCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCAc > 1:3394834/1‑93 (MQ=255)
attaTCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCAcc > 2:2968377/1‑93 (MQ=255)
taTCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTg > 1:3988192/1‑93 (MQ=255)
taTCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTg > 2:3711575/1‑93 (MQ=255)
aTCTTTACTAATAATCAGCCTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCCGa > 2:1906955/1‑93 (MQ=255)
aTCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGa > 2:3248031/1‑93 (MQ=255)
tCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCAGCTGaa > 1:1415010/1‑93 (MQ=255)
tttACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAGt > 2:5799733/1‑93 (MQ=255)
ttACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAGtt < 1:6064209/93‑1 (MQ=255)
tACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAGTTc > 2:5882931/1‑93 (MQ=255)
aCTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAGTTca > 1:2250002/1‑93 (MQ=255)
cTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAGTTcac > 1:822746/1‑93 (MQ=255)
taataaTCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAGTTcaca < 1:5478121/93‑1 (MQ=255)
taataaTCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAGTTcaca > 2:342422/1‑93 (MQ=255)
taataaTCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAGTTcaca < 1:1876487/93‑1 (MQ=255)
ataatCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAGTTCACAGa < 1:4664313/93‑1 (MQ=255)
ataatCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGGTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAGATCACAGa > 1:3455232/1‑93 (MQ=255)
taatCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAGTTCACAGaa > 1:577382/1‑93 (MQ=255)
taatCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAGTTCACAGaa > 1:648940/1‑93 (MQ=255)
taatCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAGTTCACAGaa < 2:4337728/93‑1 (MQ=255)
atCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAGTTCACAGAATa > 1:5390487/1‑93 (MQ=255)
atCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAGTTCACAGAATa < 2:2341593/93‑1 (MQ=255)
atCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAGTTCACAGAATa > 2:1045090/1‑93 (MQ=255)
atCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAGTTCACAAAATa > 2:2474859/1‑93 (MQ=255)
gACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGGGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAGTTCACAGAATAAGGa > 1:1052827/1‑93 (MQ=255)
gACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAGTTCACAGAATAAGGa > 1:2432134/1‑93 (MQ=255)
gACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAGTTCACAGAATAAGGa > 2:5669290/1‑93 (MQ=255)
cTAATATTTACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAGTTCACAGAATAAGGAAc > 2:1439861/1‑93 (MQ=255)
tAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAGTTCACAGAATAAGGAACa > 2:2211426/1‑93 (MQ=255)
tAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAGTTCACAGAATAAGGAACa > 1:2874315/1‑93 (MQ=255)
tAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAGTTCACAGAATAAGGAACa < 1:4572026/93‑1 (MQ=255)
tAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAGTTCACAGAATAAGGAACa > 2:4367553/1‑93 (MQ=255)
aaTATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAGTTCACAGAATAAGGAACAg < 2:4769228/93‑1 (MQ=255)
atatTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAGTTCACAGAATAAGGAACAgg < 2:5337742/93‑1 (MQ=255)
tatTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAGTTCACAGAATAAGGAACAGGt < 1:4116074/93‑1 (MQ=255)
tatTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAGTTCACAGAATAAGGAACAGGt > 1:5553231/1‑93 (MQ=255)
tatTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAGTTCACAGAATAAGGAACAGGt < 1:474181/93‑1 (MQ=255)
atTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAGTTCACAGAATAAGGAACAGGtt < 2:1439421/93‑1 (MQ=255)
|
GTACACTATTTTCTTATAATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAGTTCACAGAATAAGGAACAGGTT > NC_000913/1977598‑1977776
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
ATCAGTACACTATTTTCTTATAATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAGTTCACAGAATAAGGAACAGGTTATGA > NC_000913/1977594‑1977780
|
ATCAGTACACTATTTTCTTATAATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTC < SRR4302533.2430755/94‑1 (MQ=60)
GTACACTATTTTCTTATAATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCT < SRR4302533.4253385/94‑1 (MQ=60)
TACACTATTTTCTTATAATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTG > SRR4302533.410914/1‑94 (MQ=60)
TACACTATTTTCTTATAATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTG < SRR4302533.1743365/94‑1 (MQ=60)
ACTATTTTCTTATAATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTT > SRR4302533.3440807/1‑94 (MQ=60)
ACTATTTTCTTATAATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTT < SRR4302533.2193916/94‑1 (MQ=60)
CTATTTTCTTATAATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTG > SRR4302533.1754985/1‑94 (MQ=60)
TTTTCTTATAATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACC > SRR4302533.5271162/1‑94 (MQ=60)
TTTTCTTATAATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACC < SRR4302533.5015695/94‑1 (MQ=60)
TTTTCTTATAATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACC > SRR4302533.6195744/1‑94 (MQ=60)
TTTTCTTATAATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACC > SRR4302533.61802/1‑94 (MQ=60)
TTTTCTTATAATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGCTTGACC > SRR4302533.5792899/1‑94 (MQ=60)
TTCTTATAATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGA < SRR4302533.3207668/94‑1 (MQ=60)
TCTTATAATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAG > SRR4302533.1104035/1‑94 (MQ=60)
TATAATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTG < SRR4302533.5728867/94‑1 (MQ=60)
TATAATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGGGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTG > SRR4302533.2890179/1‑94 (MQ=60)
ATAATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGG > SRR4302533.1235637/1‑94 (MQ=60)
TAATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGG > SRR4302533.2106669/1‑94 (MQ=60)
TAATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGG > SRR4302533.556060/1‑94 (MQ=60)
TAATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGG > SRR4302533.2893647/1‑94 (MQ=60)
TAATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGG > SRR4302533.613503/1‑94 (MQ=60)
ATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGAT < SRR4302533.2338031/94‑1 (MQ=60)
ATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGAT > SRR4302533.4825260/1‑94 (MQ=60)
TACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTG < SRR4302533.3072460/94‑1 (MQ=60)
ACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGC > SRR4302533.4545532/1‑94 (MQ=60)
ACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGC < SRR4302533.4809657/94‑1 (MQ=60)
CATTTGAAATTATATGATCTCCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCG < SRR4302533.3495729/94‑1 (MQ=60)
CATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCATTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCG > SRR4302533.4473113/1‑94 (MQ=60)
ATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGT > SRR4302533.5601253/1‑94 (MQ=60)
ATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGT > SRR4302533.2725648/1‑94 (MQ=60)
TTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTC < SRR4302533.6341351/94‑1 (MQ=60)
GAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTT > SRR4302533.5711679/1‑94 (MQ=60)
AAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTT < SRR4302533.447052/94‑1 (MQ=60)
AATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTC > SRR4302533.2780341/1‑94 (MQ=60)
AATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTC > SRR4302533.3951359/1‑94 (MQ=60)
ATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCT > SRR4302533.4539423/1‑94 (MQ=60)
ATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCT < SRR4302533.4375814/94‑1 (MQ=60)
ATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCT > SRR4302533.5735364/1‑94 (MQ=60)
ATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCT > SRR4302533.6166652/1‑94 (MQ=60)
TATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCC > SRR4302533.4560105/1‑94 (MQ=60)
TATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCC < SRR4302533.5214528/94‑1 (MQ=60)
ATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCA > SRR4302533.634686/1‑94 (MQ=60)
TATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCAT > SRR4302533.1642395/1‑94 (MQ=60)
ATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATT > SRR4302533.924661/1‑94 (MQ=60)
ATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATT < SRR4302533.2059055/94‑1 (MQ=60)
TGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTA > SRR4302533.4667720/1‑94 (MQ=60)
GATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAG < SRR4302533.4171059/94‑1 (MQ=60)
ATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGG > SRR4302533.2087219/1‑94 (MQ=60)
TCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGA > SRR4302533.1400149/1‑94 (MQ=60)
CACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAG < SRR4302533.6284461/94‑1 (MQ=60)
CCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTA > SRR4302533.5750085/1‑94 (MQ=60)
CCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTA > SRR4302533.4963178/1‑94 (MQ=60)
GGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAA < SRR4302533.348940/94‑1 (MQ=60)
GGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAA < SRR4302533.3028936/94‑1 (MQ=60)
GGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAG < SRR4302533.2102734/94‑1 (MQ=60)
GAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGC < SRR4302533.5854781/94‑1 (MQ=60)
GTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTT > SRR4302533.6107485/1‑94 (MQ=60)
GTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTT > SRR4302533.3323815/1‑94 (MQ=60)
TGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTT > SRR4302533.5739824/1‑94 (MQ=60)
TGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTT > SRR4302533.2404572/1‑94 (MQ=60)
TGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTT > SRR4302533.5506881/1‑94 (MQ=60)
TGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTT > SRR4302533.4536517/1‑94 (MQ=60)
GATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTA < SRR4302533.5780747/94‑1 (MQ=60)
GATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTA > SRR4302533.4625369/1‑94 (MQ=60)
GATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTA > SRR4302533.6162205/1‑94 (MQ=60)
ATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAA > SRR4302533.646446/1‑94 (MQ=60)
TGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAATGCTTTAATG > SRR4302533.455862/1‑94 (MQ=60)
TGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATG > SRR4302533.455863/1‑94 (MQ=60)
GATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGT < SRR4302533.1390283/94‑1 (MQ=60)
TAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCAC > SRR4302533.3415801/1‑94 (MQ=60)
TTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTG > SRR4302533.4012486/1‑94 (MQ=60)
ATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCAGCTGAA > SRR4302533.1423571/1‑94 (MQ=60)
ATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAA < SRR4302533.2541944/94‑1 (MQ=60)
TTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAGTTC < SRR4302533.4741736/94‑1 (MQ=60)
TTACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAGTTC < SRR4302533.6100918/94‑1 (MQ=60)
TACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAGTTCA > SRR4302533.2263909/1‑94 (MQ=60)
ACTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAGTTCAC > SRR4302533.827573/1‑94 (MQ=60)
CTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAGTTCACA > SRR4302533.4235184/1‑94 (MQ=60)
CTAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAGTTCACA < SRR4302533.835549/94‑1 (MQ=60)
TAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAGTTCACAG < SRR4302533.5511144/94‑1 (MQ=60)
TAATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAGTTCACAG < SRR4302533.1887925/94‑1 (MQ=60)
AATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGGTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAGATCACAGA > SRR4302533.3476558/1‑94 (MQ=60)
ATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAGTTCACAGAA < SRR4302533.4692574/94‑1 (MQ=60)
ATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAGTTCACAGAA > SRR4302533.580786/1‑94 (MQ=60)
ATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAGTTCACAGAA > SRR4302533.652765/1‑94 (MQ=60)
ATAATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAGTTCACAGAA > SRR4302533.652766/1‑94 (MQ=60)
AATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAGTTCACAGAATA > SRR4302533.5422878/1‑94 (MQ=60)
AATCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAGTTCACAGAATA > SRR4302533.6332134/1‑94 (MQ=60)
TCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAGTTCACAGAATAAG < SRR4302533.4587373/94‑1 (MQ=60)
TCAGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAGTTCACAGAATAAG < SRR4302533.3416783/94‑1 (MQ=60)
AGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGGGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAGTTCACAGAATAAGGA > SRR4302533.1059027/1‑94 (MQ=60)
AGACTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAGTTCACAGAATAAGGA > SRR4302533.2447164/1‑94 (MQ=60)
CTAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAGTTCACAGAATAAGGAACA > SRR4302533.2891998/1‑94 (MQ=60)
TAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAGTTCACAGAATAAGGAACAG < SRR4302533.4599731/94‑1 (MQ=60)
TAATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAGTTCACAGAATAAGGAACAG < SRR4302533.4270984/94‑1 (MQ=60)
ATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAGTTCACAGAATAAGGAACAGGT < SRR4302533.1509630/94‑1 (MQ=60)
ATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAGTTCACAGAATAAGGAACAGGT > SRR4302533.5586767/1‑94 (MQ=60)
ATATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAGTTCACAGAATAAGGAACAGGT > SRR4302533.448895/1‑94 (MQ=60)
TATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAGTTCACAGAATAAGGAACAGGTT > SRR4302533.5551204/1‑94 (MQ=60)
TATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAGTTCACAGAATAAGGAACAGGTT < SRR4302533.477012/94‑1 (MQ=60)
TATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAGTTCACAGAATAAGGAACAGGTT < SRR4302533.4141081/94‑1 (MQ=60)
ATTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAGTTCACAGAATAAGGAACAGGTTA > SRR4302533.3316131/1‑94 (MQ=60)
TTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAGTTCACAGAATAAGGAACAGGTTAT < SRR4302533.5651454/94‑1 (MQ=60)
TTCACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAGTTCACAGAATAAGGAACAGGTTAT < SRR4302533.4396461/94‑1 (MQ=60)
CACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAGTTCACAGAATAAGGAACAGGTTATGA < SRR4302533.2341883/94‑1 (MQ=60)
CACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAGTTCACAGAATAAGGAACAGGTTATGA > SRR4302533.1251997/1‑94 (MQ=60)
|
ATCAGTACACTATTTTCTTATAATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAGTTCACAGAATAAGGAACAGGTTATGA > NC_000913/1977594‑1977780
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
