Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1624 |
250.6 |
12620048 |
98.0% |
12367647 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,012,629 |
T→C |
V460A (GTA→GCA) |
fliF → |
FliF |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,012,629 | 0 | T | C | 100.0%
| 679.6
/ NA
| 208 | V460A (GTA→GCA) | fliF | FliF |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (125/83); total (125/83) |
Only 100 of 210 total aligned reads displayed.
ATAGCAGTGACGAAAGCGGCGGAGAACTGCCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGCTGTACAGCAACAGG > NC_000913/2012539‑2012718
|
aTAGCAGTGACGAAAGCGGCGGAGAACTGCCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCAc > 2:2354069/1‑93 (MQ=255)
aGTGACGAAAGCGGCGGAGAACTGCCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGATGGCActgctg > 1:4646752/1‑93 (MQ=255)
gTGACGAAAGCGGCGGAGAACTGCCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCtgg > 1:2827130/1‑93 (MQ=255)
gTGACGAAAGCGGCGGAGAACTGCCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCtgg < 2:3410818/93‑1 (MQ=255)
gACGAAAGCGGCGGAGAACTGCCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCtggtg < 2:1428363/93‑1 (MQ=255)
aCGAAAGAGGCGGAGAACTGCCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCtggtgg > 2:3523041/1‑93 (MQ=255)
aaaGCGGCGGAGAACTGCCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGgtggcgt < 1:561937/93‑1 (MQ=255)
aaGCGGCGGAGAACTGCCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGgtggcgtg > 1:3449022/1‑93 (MQ=255)
gcggcgGAGAACTGCCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGgtggcgtggc > 2:6094914/1‑93 (MQ=255)
gcggcgGAGAACTGCCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGgtggcgtggc > 2:4928360/1‑93 (MQ=255)
gcggcgGAGAACTGCCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGgtggcgtggc < 1:5790257/93‑1 (MQ=255)
gcggcgGAGAACTGCCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGgtggcgcggc > 2:850450/1‑93 (MQ=255)
cggcggAGAACTGCCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGgct > 1:3425818/1‑93 (MQ=255)
ggcggAGAACTGCCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGgctg > 1:1720042/1‑93 (MQ=255)
gcggAGAACTGCCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGgctgc > 2:3255793/1‑93 (MQ=255)
ggAGAACTGCCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGctgctg > 2:5056459/1‑93 (MQ=255)
gagaACTGCCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCtgt > 2:1216276/1‑93 (MQ=255)
gagaACTGCCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCtgt < 2:1093863/93‑1 (MQ=255)
gagaACTGCCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCtgt > 1:5764376/1‑93 (MQ=255)
agaACTGCCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCtgtg < 2:2523863/93‑1 (MQ=255)
gaACTGCCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTgg < 2:2086508/93‑1 (MQ=255)
tGCCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGa < 1:4317591/93‑1 (MQ=255)
cATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAg > 2:4756782/1‑93 (MQ=255)
cATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAg > 1:3784284/1‑93 (MQ=255)
cATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAg < 1:6096544/93‑1 (MQ=255)
cATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAg > 1:1132536/1‑93 (MQ=255)
aTTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGc > 2:1966766/1‑93 (MQ=255)
ttCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCg > 1:5959956/1‑93 (MQ=255)
ttCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCg < 1:165485/93‑1 (MQ=255)
tCTGTCACCAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGTCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCgg < 1:5568106/93‑1 (MQ=255)
tGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGGAAGTGGTa > 1:2794150/1‑93 (MQ=255)
tGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTa > 2:3594404/1‑93 (MQ=255)
ggCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTAc < 2:2778914/93‑1 (MQ=255)
ggCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTAc < 1:2179047/93‑1 (MQ=255)
gCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACg > 1:2021277/1‑93 (MQ=255)
aaCAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTc < 1:3111881/93‑1 (MQ=255)
aaCAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTc > 1:1877419/1‑93 (MQ=255)
aaCAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTc < 2:5304567/93‑1 (MQ=255)
cAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCg > 1:4738007/1‑93 (MQ=255)
aGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGc > 2:180582/1‑93 (MQ=255)
cAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGGAAGCGGTACGTCCGCAg > 2:1510104/1‑93 (MQ=255)
aaGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGc > 2:4347316/1‑93 (MQ=255)
aaGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGc < 2:3290947/93‑1 (MQ=255)
gCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTa > 1:4244547/1‑93 (MQ=255)
gCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTa > 2:5943452/1‑93 (MQ=255)
cGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTaa < 2:1542682/93‑1 (MQ=255)
gTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAac < 2:3985836/93‑1 (MQ=255)
tttATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCCGTACGTCCGCAGCTAaca > 1:3959883/1‑93 (MQ=255)
ttATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAacac < 1:127543/93‑1 (MQ=255)
tATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACg > 2:3857041/1‑93 (MQ=255)
aTCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGt < 1:5478123/93‑1 (MQ=255)
tCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTc < 1:2347227/93‑1 (MQ=255)
tCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTc < 2:3699361/93‑1 (MQ=255)
tCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTc < 1:3237084/93‑1 (MQ=255)
gATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTcgc > 1:1603423/1‑93 (MQ=255)
gATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTcgc < 2:1899227/93‑1 (MQ=255)
tCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCgcgc > 2:5624455/1‑93 (MQ=255)
tCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCgcgc > 1:2625519/1‑93 (MQ=255)
cAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCt > 1:1068741/1‑93 (MQ=255)
cAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCt > 1:1228291/1‑93 (MQ=255)
cAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCt > 1:1218148/1‑93 (MQ=255)
aGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTg > 2:4054300/1‑93 (MQ=255)
ttACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAg < 1:6036395/93‑1 (MQ=255)
ttACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAg > 1:5041241/1‑93 (MQ=255)
ttACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAg < 2:6114219/93‑1 (MQ=255)
ttACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAg > 1:783337/1‑93 (MQ=255)
tACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAgg < 2:2736311/93‑1 (MQ=255)
aCTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGc > 1:4631626/1‑93 (MQ=255)
ctgcCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGa < 2:4889963/93‑1 (MQ=255)
tgcCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGaa > 2:5501894/1‑93 (MQ=255)
tgcCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGaa < 1:67100/93‑1 (MQ=255)
tgcCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGaa > 2:5701308/1‑93 (MQ=255)
tgcCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGaa > 1:3353250/1‑93 (MQ=255)
gcCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGaaa > 1:445926/1‑93 (MQ=255)
gcCGGTCGCTGGATGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTTCGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGcaa > 1:3661979/1‑93 (MQ=255)
ccGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAg > 1:5724313/1‑93 (MQ=255)
cGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGc > 1:3590876/1‑93 (MQ=255)
cGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGc > 2:2138310/1‑93 (MQ=255)
ggTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGCt > 1:1989862/1‑93 (MQ=255)
cGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGCTGTa < 2:3754865/93‑1 (MQ=255)
cGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGCTGTa < 1:1470773/93‑1 (MQ=255)
cGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGCTGTa > 2:4153421/1‑93 (MQ=255)
gCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGCTGTAc > 1:1815363/1‑93 (MQ=255)
gCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGCTGTAc > 1:1779031/1‑93 (MQ=255)
cTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGCTGTACa < 2:4279339/93‑1 (MQ=255)
tGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGCTGTACAg > 2:2570917/1‑93 (MQ=255)
tGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGCTGTACAg > 2:4837093/1‑93 (MQ=255)
tGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGCTGTACAg > 2:1330745/1‑93 (MQ=255)
tGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGCTGTACAg > 1:5375147/1‑93 (MQ=255)
gTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGCTGTACAGCa > 1:616587/1‑93 (MQ=255)
gTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGCTGTACAGCa < 1:5946813/93‑1 (MQ=255)
ttGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTTCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGCTGTACAGCaa > 2:746006/1‑93 (MQ=255)
ttGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGCTGTACAGCaa > 1:1953324/1‑93 (MQ=255)
tGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGCTGTACAGCAAc < 2:1955957/93‑1 (MQ=255)
tGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGCTGTACAGCAAc < 2:543144/93‑1 (MQ=255)
gCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGCTGTACAGCAACa < 2:2407524/93‑1 (MQ=255)
gCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGCTGTACAGCAACa < 1:4215635/93‑1 (MQ=255)
cTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGCGGCGATGAGAGCTGCACAGCAACAg > 1:5271640/1‑93 (MQ=255)
tGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGCTGTACAGCAACAgg > 1:2555742/1‑93 (MQ=255)
tGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGCTGTACAGCAACAgg > 1:5056082/1‑93 (MQ=255)
|
ATAGCAGTGACGAAAGCGGCGGAGAACTGCCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGCTGTACAGCAACAGG > NC_000913/2012539‑2012718
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
TCAATAGCAGTGACGAAAGCGGCGGAGAACTGCCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGCTGTACAGCAACAGGCG > NC_000913/2012536‑2012720
|
TCAATAGCAGTGACGAAAGCGGCGGAGAACTGCCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGC < SRR4302533.2983557/94‑1 (MQ=60)
CAATAGCAGTGACGAAAGCGGCGGAGAACTGCCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCA > SRR4302533.5343291/1‑94 (MQ=60)
AATAGCAGTGACGAAAGCGGCGGAGAACTGCCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCAC < SRR4302533.5502421/94‑1 (MQ=60)
AATAGCAGTGACGAAAGCGGCGGAGAACTGCCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCAC < SRR4302533.4768328/94‑1 (MQ=60)
ATAGCAGTGACGAAAGCGGCGGAGAACTGCCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACT < SRR4302533.2842322/94‑1 (MQ=60)
TAGCAGTGACGAAAGCGGCGGAGAACTGCCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTG < SRR4302533.2830482/94‑1 (MQ=60)
AGCAGTGACGAAAGCGGCGGAGAACTGCCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGC > SRR4302533.2599458/1‑94 (MQ=60)
CAGTGACGAAAGCGGCGGAGAACTGCCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGATGGCACTGCTG > SRR4302533.4674910/1‑94 (MQ=60)
AGTGACGAAAGCGGCGGAGAACTGCCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGG > SRR4302533.2844525/1‑94 (MQ=60)
GACGAAAGCGGCGGAGAACTGCCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGG < SRR4302533.3709891/94‑1 (MQ=60)
GAAAGCGGCGGAGAACTGCCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGT > SRR4302533.3263251/1‑94 (MQ=60)
AAAGCGGCGGAGAACTGCCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTG < SRR4302533.5933637/94‑1 (MQ=60)
AAAGCGGCGGAGAACTGCCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTG > SRR4302533.3470152/1‑94 (MQ=60)
AAAGCGGCGGAGAACTGCCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTG > SRR4302533.3470316/1‑94 (MQ=60)
AAAGCGGCGGAGAACTGCCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTG < SRR4302533.565269/94‑1 (MQ=60)
GCGGCGGAGAACTGCCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCT > SRR4302533.3446979/1‑94 (MQ=60)
GCGGCGGAGAACTGCCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCT < SRR4302533.5825240/94‑1 (MQ=60)
CGGCGGAGAACTGCCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTG > SRR4302533.1730471/1‑94 (MQ=60)
GGCGGAGAACTGCCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGC < SRR4302533.4543469/94‑1 (MQ=60)
GGAGAACTGCCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGT > SRR4302533.5799164/1‑94 (MQ=60)
AGAACTGCCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGG > SRR4302533.4243012/1‑94 (MQ=60)
AGAACTGCCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGG < SRR4302533.5611217/94‑1 (MQ=60)
AGAACTGCCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGG > SRR4302533.1098817/1‑94 (MQ=60)
TGCCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGGA > SRR4302533.5519178/1‑94 (MQ=60)
TGCCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAA < SRR4302533.4343592/94‑1 (MQ=60)
TGCCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAA > SRR4302533.3922926/1‑94 (MQ=60)
CCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAG < SRR4302533.1179682/94‑1 (MQ=60)
CCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAG > SRR4302533.2023145/1‑94 (MQ=60)
CCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAG > SRR4302533.1139268/1‑94 (MQ=60)
CCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAG > SRR4302533.3807457/1‑94 (MQ=60)
CCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCACTGGTTGCTGGCACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAG > SRR4302533.1229910/1‑94 (MQ=60)
CATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGC < SRR4302533.607206/94‑1 (MQ=60)
CATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGC < SRR4302533.6133369/94‑1 (MQ=60)
ATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCG < SRR4302533.2240267/94‑1 (MQ=60)
ATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCG < SRR4302533.1645240/94‑1 (MQ=60)
ATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCG < SRR4302533.2499563/94‑1 (MQ=60)
ATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCG > SRR4302533.5996008/1‑94 (MQ=60)
TTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGG < SRR4302533.166536/94‑1 (MQ=60)
TCTGTCACCAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGTCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGT < SRR4302533.5601763/94‑1 (MQ=60)
CTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGGAAGTGGTA > SRR4302533.2811337/1‑94 (MQ=60)
CTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTA < SRR4302533.5806437/94‑1 (MQ=60)
GGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACG < SRR4302533.2192481/94‑1 (MQ=60)
GGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACG > SRR4302533.2033726/1‑94 (MQ=60)
CAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTC > SRR4302533.1888862/1‑94 (MQ=60)
AACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCC < SRR4302533.3131016/94‑1 (MQ=60)
AACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCC > SRR4302533.3037266/1‑94 (MQ=60)
AACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCC < SRR4302533.1269400/94‑1 (MQ=60)
ACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCG > SRR4302533.4766736/1‑94 (MQ=60)
AGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGGACGTCCGCA > SRR4302533.1807048/1‑94 (MQ=60)
AAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCT < SRR4302533.5792347/94‑1 (MQ=60)
AAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCT > SRR4302533.4093741/1‑94 (MQ=60)
AGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTA > SRR4302533.4270176/1‑94 (MQ=60)
GCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAA < SRR4302533.1776729/94‑1 (MQ=60)
CGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAAC > SRR4302533.4357773/1‑94 (MQ=60)
CGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAAC > SRR4302533.598649/1‑94 (MQ=60)
CGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAAC > SRR4302533.620266/1‑94 (MQ=60)
GTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACA > SRR4302533.4047853/1‑94 (MQ=60)
GTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCCGTACGTCCGCAGCTAACA > SRR4302533.3984013/1‑94 (MQ=60)
TTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACAA > SRR4302533.1607503/1‑94 (MQ=60)
TTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACG < SRR4302533.128341/94‑1 (MQ=60)
TATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGT > SRR4302533.4966917/1‑94 (MQ=60)
TATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGT > SRR4302533.5319944/1‑94 (MQ=60)
ATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTC > SRR4302533.5162976/1‑94 (MQ=60)
ATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTC < SRR4302533.5511146/94‑1 (MQ=60)
TCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCG < SRR4302533.2361751/94‑1 (MQ=60)
TCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCG < SRR4302533.3257031/94‑1 (MQ=60)
CGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGC > SRR4302533.6030957/1‑94 (MQ=60)
CGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGC > SRR4302533.1613131/1‑94 (MQ=60)
CGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGC > SRR4302533.3613403/1‑94 (MQ=60)
CGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGC > SRR4302533.3132060/1‑94 (MQ=60)
ATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGC > SRR4302533.937653/1‑94 (MQ=60)
ATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGC > SRR4302533.2641630/1‑94 (MQ=60)
ataagTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCT < SRR4302533.5148774/89‑1 (MQ=60)
TCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCT > SRR4302533.1235644/1‑94 (MQ=60)
TCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCT > SRR4302533.1225460/1‑94 (MQ=60)
TCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCT > SRR4302533.1075033/1‑94 (MQ=60)
TCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCT < SRR4302533.3590430/94‑1 (MQ=60)
GTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAG > SRR4302533.787944/1‑94 (MQ=60)
GTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAG > SRR4302533.6201869/1‑94 (MQ=60)
GTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAG > SRR4302533.5071753/1‑94 (MQ=60)
GTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAG < SRR4302533.4685044/94‑1 (MQ=60)
TTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGG > SRR4302533.4321161/1‑94 (MQ=60)
TTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGG < SRR4302533.1413155/94‑1 (MQ=60)
TTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGG < SRR4302533.6072976/94‑1 (MQ=60)
TACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGC > SRR4302533.4659693/1‑94 (MQ=60)
TGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATG > SRR4302533.1851068/1‑94 (MQ=60)
GCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGA > SRR4302533.2762347/1‑94 (MQ=60)
CTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAA > SRR4302533.3373967/1‑94 (MQ=60)
TGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAA < SRR4302533.67536/94‑1 (MQ=60)
TGCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAA > SRR4302533.448594/1‑94 (MQ=60)
TGCCGGTCGCTGGATGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTTCGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGCAA > SRR4302533.3684493/1‑94 (MQ=60)
GCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAG < SRR4302533.5404011/94‑1 (MQ=60)
GCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAG > SRR4302533.5758875/1‑94 (MQ=60)
GCCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTAGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAG < SRR4302533.1967224/94‑1 (MQ=60)
CCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGC > SRR4302533.6090625/1‑94 (MQ=60)
CCGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGC > SRR4302533.3612982/1‑94 (MQ=60)
CGGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGCT > SRR4302533.2002044/1‑94 (MQ=60)
GGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGCTG > SRR4302533.5476066/1‑94 (MQ=60)
GGTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGCTG > SRR4302533.2187730/1‑94 (MQ=60)
GTCGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGCTGT < SRR4302533.4673690/94‑1 (MQ=60)
CGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGCTGTAC > SRR4302533.3433694/1‑94 (MQ=60)
CGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGCTGTAC > SRR4302533.1789862/1‑94 (MQ=60)
CGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGCTGTAC > SRR4302533.575260/1‑94 (MQ=60)
CGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGCTGTAC > SRR4302533.1808085/1‑94 (MQ=60)
CGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGCTGTAC > SRR4302533.1826447/1‑94 (MQ=60)
CGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGCTGTAC > SRR4302533.701370/1‑94 (MQ=60)
CGCTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGCTGTAC < SRR4302533.1479663/94‑1 (MQ=60)
CTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGCTGTACAG > SRR4302533.1911943/1‑94 (MQ=60)
CTGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGCTGTACAG > SRR4302533.5407449/1‑94 (MQ=60)
TGGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGCTGTACAGC > SRR4302533.5076179/1‑94 (MQ=60)
GGTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGCTGTACAGCA > SRR4302533.620206/1‑94 (MQ=60)
GTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGCTGTACAGCAA < SRR4302533.5982776/94‑1 (MQ=60)
GTTGCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGCTGTACAGCAA > SRR4302533.1965228/1‑94 (MQ=60)
GCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGCGGCGATGAGAGCTGCACAGCAACAG > SRR4302533.5303255/1‑94 (MQ=60)
GCTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGCTGTACAGCAACAG < SRR4302533.4241137/94‑1 (MQ=60)
CTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGCTGTACAGCAACAGG > SRR4302533.2571462/1‑94 (MQ=60)
CTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGCTGTACAGCAACAGG < SRR4302533.1703492/94‑1 (MQ=60)
CTGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGCTGTACAGCAACAGG > SRR4302533.5086643/1‑94 (MQ=60)
TGGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGCTGTACAGCAACAGGC > SRR4302533.3371278/1‑94 (MQ=60)
GGCACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGCTGTACAGCAACAGGCG < SRR4302533.350487/94‑1 (MQ=60)
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TCAATAGCAGTGACGAAAGCGGCGGAGAACTGCCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGCTGTACAGCAACAGGCG > NC_000913/2012536‑2012720
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
