Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1624 |
250.6 |
12620048 |
98.0% |
12367647 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,035,940 |
T→C |
I79V (ATC→GTC) |
yedV ← |
putative 2‑component sensor protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,035,940 | 0 | T | C | 100.0%
| 734.1
/ NA
| 222 | I79V (ATC→GTC) | yedV | putative 2‑component sensor protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (121/101); total (121/101) |
Only 100 of 223 total aligned reads displayed.
TCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGATATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTACCCCATCAATTAACAACTGCTTGATCTGCGCTG > NC_000913/2035850‑2036029
|
tctcACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGacat > 1:1838067/1‑93 (MQ=255)
ctcACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATc < 1:1296006/93‑1 (MQ=255)
ctcACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATc < 2:194619/93‑1 (MQ=255)
tcACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATcc > 2:4440903/1‑93 (MQ=255)
tcACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATcc > 1:5947749/1‑93 (MQ=255)
cTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGa > 1:3902508/1‑93 (MQ=255)
tAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGAc > 2:6102790/1‑93 (MQ=255)
tAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGAc > 2:4622118/1‑93 (MQ=255)
aGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGGTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACt > 2:1396906/1‑93 (MQ=255)
aGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGGCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAAc > 2:3133896/1‑93 (MQ=255)
gTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAAcat > 1:5658335/1‑93 (MQ=255)
tATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAAcatc < 1:1435980/93‑1 (MQ=255)
tATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCCATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAAcatc > 1:757280/1‑93 (MQ=255)
aTGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAAcatcc < 1:3239764/93‑1 (MQ=255)
aTGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAAcatcc > 2:4867742/1‑93 (MQ=255)
tGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAAcatcca < 1:1550242/93‑1 (MQ=255)
gTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAAcatccat < 2:1057571/93‑1 (MQ=255)
ttATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAAcatccatc > 1:797735/1‑93 (MQ=255)
ttATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAAcatccatc < 2:110946/93‑1 (MQ=255)
ttATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAAcatccatc > 2:2887469/1‑93 (MQ=255)
ttATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAAcatccatc < 1:853387/93‑1 (MQ=255)
tATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCcatca < 1:6146379/93‑1 (MQ=255)
aTTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCcatcat < 2:1836646/93‑1 (MQ=255)
tttAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCatcatc < 2:3393719/93‑1 (MQ=255)
tAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCg > 1:1719500/1‑93 (MQ=255)
aCATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGt > 1:3208103/1‑93 (MQ=255)
aTGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTa < 2:4253032/93‑1 (MQ=255)
ccATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAg < 2:3637604/93‑1 (MQ=255)
ccATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAg > 1:2476357/1‑93 (MQ=255)
ccATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAg > 2:5152821/1‑93 (MQ=255)
cATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTACAGt > 2:662373/1‑93 (MQ=255)
cATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGt < 1:1870178/93‑1 (MQ=255)
cATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGt > 2:1179768/1‑93 (MQ=255)
cATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGt > 1:3253756/1‑93 (MQ=255)
aTCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTa > 2:4388909/1‑93 (MQ=255)
tCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTac > 2:5674629/1‑93 (MQ=255)
cACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTaca > 2:5812602/1‑93 (MQ=255)
cACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTaca > 2:3961520/1‑93 (MQ=255)
aCTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTacac > 1:2941111/1‑93 (MQ=255)
aCTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTacac < 2:2208260/93‑1 (MQ=255)
cTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTAcaca > 2:554997/1‑93 (MQ=255)
cATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTa < 2:4813718/93‑1 (MQ=255)
aTTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTaa > 2:309060/1‑93 (MQ=255)
aTTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTaa > 2:1866259/1‑93 (MQ=255)
aTTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTaa < 1:2655448/93‑1 (MQ=255)
tttGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAAc > 2:1041311/1‑93 (MQ=255)
tttGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAAc > 2:3186124/1‑93 (MQ=255)
tGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGt < 2:159395/93‑1 (MQ=255)
gTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTa < 1:4423174/93‑1 (MQ=255)
gTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTa > 2:5877632/1‑93 (MQ=255)
tCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTAt > 1:4940021/1‑93 (MQ=255)
ccGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATc < 1:4920269/93‑1 (MQ=255)
ccGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATc < 1:5276911/93‑1 (MQ=255)
cGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCt > 1:22979/1‑93 (MQ=255)
ggTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTg > 1:3429097/1‑93 (MQ=255)
gTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTgg < 1:1005096/93‑1 (MQ=255)
ttAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGa > 1:3138329/1‑93 (MQ=255)
tAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGAt < 1:4494232/93‑1 (MQ=255)
tAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGAt > 1:5518791/1‑93 (MQ=255)
aaCAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGAtt > 2:2827353/1‑93 (MQ=255)
cAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTa < 1:6016192/93‑1 (MQ=255)
aaTTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTAc > 2:2058991/1‑93 (MQ=255)
aTTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTAcc > 2:5717864/1‑93 (MQ=255)
aTTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTAcc < 1:2203890/93‑1 (MQ=255)
ttttATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTAccc > 2:2612318/1‑93 (MQ=255)
ttttATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTAccc < 1:4660130/93‑1 (MQ=255)
tttATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTAcccc < 2:3214674/93‑1 (MQ=255)
ttATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTACCCCa > 2:3721901/1‑93 (MQ=255)
tATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTACCCCAt < 1:3719817/93‑1 (MQ=255)
tATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTACCCCAt > 2:5539454/1‑93 (MQ=255)
tATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTACCCCAt > 1:6106942/1‑93 (MQ=255)
aTTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTACCCCATc < 1:4302799/93‑1 (MQ=255)
ttGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTACCCCATCa > 1:1637528/1‑93 (MQ=255)
ttGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTACCCCATCa > 1:5051552/1‑93 (MQ=255)
ttGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTACCCCATCa < 1:5343065/93‑1 (MQ=255)
aTGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTACCCCATCAAtt < 2:5248219/93‑1 (MQ=255)
gCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTACCCCATCAATTaa > 1:2105119/1‑93 (MQ=255)
cTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTACCCCATCAATTaac < 2:1259285/93‑1 (MQ=255)
tATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTACCCCATCAATTaaca > 1:3969132/1‑93 (MQ=255)
tATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTACCCCATCAATTaaca > 1:2537224/1‑93 (MQ=255)
aTCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTACCCCATCAATTaacaa < 1:5195619/93‑1 (MQ=255)
aTCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTACCCCATCAATTaacaa > 1:3069198/1‑93 (MQ=255)
tCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTACCCCATCAATTaacaac < 1:5476452/93‑1 (MQ=255)
tCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTACCCCATCAATTaacaac < 1:5783283/93‑1 (MQ=255)
tCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTACCCCATCAATTaacaac < 2:2136072/93‑1 (MQ=255)
cACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTACCCCATCAATTAACAACt < 2:3862539/93‑1 (MQ=255)
cACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTACCCCATCAATTAACAACt < 2:3674119/93‑1 (MQ=255)
aTGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTACCCCATCAATTAACAACTGCtt < 2:2563206/93‑1 (MQ=255)
tGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTACCCCATCAATTAACAACTGCTTg > 1:1515508/1‑93 (MQ=255)
aataatCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTACCCCATCAATTAACAACTGCTTGAt < 1:4622118/93‑1 (MQ=255)
taatCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTACCCCATCAATTAACAACTGCTTGATCt > 2:5034412/1‑93 (MQ=255)
taatCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTACCCCATCAATTAACAACTGCTTGATCt < 2:790247/93‑1 (MQ=255)
aatCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTACCCCATCAATTAACAACTGCTTGATCTg > 1:4042931/1‑93 (MQ=255)
aatCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTACCCCATCAATTAACAACTGCTTGATCTg < 2:4670042/93‑1 (MQ=255)
aatCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTACCCCATCAATTAACAACTGCTTGATCTg > 2:6195368/1‑93 (MQ=255)
tCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTACCCCATCAATTAACAACTGCTTGATCTgcg > 1:1761744/1‑93 (MQ=255)
aaGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTACCCCATCAATTAACAACTGCTTGATCTGCGCt > 2:325110/1‑93 (MQ=255)
aGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTACCCCATCAATTAACAACTGCTTGATCTGCGCTg < 1:636832/93‑1 (MQ=255)
aGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTACCCCATCAATTAACAACTGCTTGATCTGCGCTg > 2:6302879/1‑93 (MQ=255)
aGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTACCCCATCAATTAACAACTGCTTGATCTGCGCTg > 1:3628841/1‑93 (MQ=255)
|
TCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGATATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTACCCCATCAATTAACAACTGCTTGATCTGCGCTG > NC_000913/2035850‑2036029
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
TTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGATATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTACCCCATCAATTAACAACTGCTTGATCTGCGCTGTCCG > NC_000913/2035847‑2036033
|
TTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGAC < SRR4302533.5853622/94‑1 (MQ=60)
TGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACA < SRR4302533.2788225/94‑1 (MQ=60)
TGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACA > SRR4302533.407395/1‑94 (MQ=60)
GTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACAT > SRR4302533.1849277/1‑94 (MQ=60)
CTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCC < SRR4302533.1303809/94‑1 (MQ=60)
CTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCC > SRR4302533.5983724/1‑94 (MQ=60)
CACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTG < SRR4302533.5200520/94‑1 (MQ=60)
CACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTG < SRR4302533.159593/94‑1 (MQ=60)
ACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGA > SRR4302533.3926340/1‑94 (MQ=60)
CTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGAC < SRR4302533.5331707/94‑1 (MQ=60)
CTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGAC < SRR4302533.6006923/94‑1 (MQ=60)
AGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTA > SRR4302533.4419560/1‑94 (MQ=60)
AGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACA > SRR4302533.2580005/1‑94 (MQ=60)
AGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACA > SRR4302533.1851275/1‑94 (MQ=60)
GGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACAT > SRR4302533.5692526/1‑94 (MQ=60)
GGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACAT > SRR4302533.2355303/1‑94 (MQ=60)
GTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATC > SRR4302533.1800617/1‑94 (MQ=60)
GTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATC > SRR4302533.2973776/1‑94 (MQ=60)
GTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCCATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATC > SRR4302533.761736/1‑94 (MQ=60)
TATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCC < SRR4302533.1444649/94‑1 (MQ=60)
TATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCC < SRR4302533.5541005/94‑1 (MQ=60)
ATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCA > SRR4302533.1587782/1‑94 (MQ=60)
ATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCA > SRR4302533.3134773/1‑94 (MQ=60)
ATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCA < SRR4302533.6183231/94‑1 (MQ=60)
ATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCA > SRR4302533.730947/1‑94 (MQ=60)
ATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCA < SRR4302533.3259729/94‑1 (MQ=60)
ATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCA > SRR4302533.745634/1‑94 (MQ=60)
TGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCAT < SRR4302533.1559584/94‑1 (MQ=60)
GTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATC > SRR4302533.802429/1‑94 (MQ=60)
TTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCT > SRR4302533.5614002/1‑94 (MQ=60)
TTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCA < SRR4302533.858384/94‑1 (MQ=60)
TATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCAT < SRR4302533.6183384/94‑1 (MQ=60)
ATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATC > SRR4302533.1913852/1‑94 (MQ=60)
TTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCG > SRR4302533.1729925/1‑94 (MQ=60)
AACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGT > SRR4302533.3227860/1‑94 (MQ=60)
ATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAA > SRR4302533.1473072/1‑94 (MQ=60)
GCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAG > SRR4302533.2491630/1‑94 (MQ=60)
CCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGT < SRR4302533.25458/94‑1 (MQ=60)
CCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGT > SRR4302533.3273821/1‑94 (MQ=60)
CATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTA < SRR4302533.1881581/94‑1 (MQ=60)
ATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTAC < SRR4302533.5499855/94‑1 (MQ=60)
CACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACAC > SRR4302533.2959073/1‑94 (MQ=60)
TGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGG < SRR4302533.1763370/94‑1 (MQ=60)
GACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGT < SRR4302533.2765114/94‑1 (MQ=60)
GACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGT > SRR4302533.3778811/1‑94 (MQ=60)
ACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTA > SRR4302533.5266412/1‑94 (MQ=60)
ATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAAC < SRR4302533.2671759/94‑1 (MQ=60)
ATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAAC > SRR4302533.1540999/1‑94 (MQ=60)
TTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACG < SRR4302533.2160951/94‑1 (MQ=60)
TGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTA > SRR4302533.5526934/1‑94 (MQ=60)
GTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTAT < SRR4302533.3270923/94‑1 (MQ=60)
GTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTAT < SRR4302533.4449915/94‑1 (MQ=60)
GTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTAT < SRR4302533.2229943/94‑1 (MQ=60)
GTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTAT > SRR4302533.4969928/1‑94 (MQ=60)
GTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTAT > SRR4302533.3106613/1‑94 (MQ=60)
CCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCT > SRR4302533.23133/1‑94 (MQ=60)
CCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCT < SRR4302533.3669657/94‑1 (MQ=60)
CCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCT < SRR4302533.5308546/94‑1 (MQ=60)
CCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCT < SRR4302533.4950075/94‑1 (MQ=60)
CGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTG > SRR4302533.3450282/1‑94 (MQ=60)
GGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGG < SRR4302533.3966706/94‑1 (MQ=60)
GTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGA > SRR4302533.3157623/1‑94 (MQ=60)
GTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGA < SRR4302533.1010974/94‑1 (MQ=60)
TTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGAT > SRR4302533.5552114/1‑94 (MQ=60)
TAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATT < SRR4302533.938772/94‑1 (MQ=60)
TAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATT > SRR4302533.4537224/1‑94 (MQ=60)
TAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATT < SRR4302533.4521448/94‑1 (MQ=60)
CAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTAC > SRR4302533.4210827/1‑94 (MQ=60)
CAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTAC > SRR4302533.343555/1‑94 (MQ=60)
CAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTAC < SRR4302533.6052647/94‑1 (MQ=60)
AATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTACC < SRR4302533.4981317/94‑1 (MQ=60)
ATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTACCC > SRR4302533.5745258/1‑94 (MQ=60)
ATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTACCC < SRR4302533.2217474/94‑1 (MQ=60)
TTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTACCCC < SRR4302533.4688372/94‑1 (MQ=60)
TTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTACCCCAT > SRR4302533.6143814/1‑94 (MQ=60)
TATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTACCCCATC > SRR4302533.5826204/1‑94 (MQ=60)
TATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTACCCCATC < SRR4302533.3742649/94‑1 (MQ=60)
ATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTACCCCATCA > SRR4302533.1647442/1‑94 (MQ=60)
ATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTACCCCATCA > SRR4302533.5082098/1‑94 (MQ=60)
ATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTACCCCATCA < SRR4302533.4328686/94‑1 (MQ=60)
TTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTACCCCATCAA < SRR4302533.6065644/94‑1 (MQ=60)
TTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTACCCCATCAA < SRR4302533.5375106/94‑1 (MQ=60)
GATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTACCCCATCAATT < SRR4302533.3495904/94‑1 (MQ=60)
ATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTACCCCATCAATTA > SRR4302533.1022736/1‑94 (MQ=60)
ATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTACCCCATCAATTA < SRR4302533.3279171/94‑1 (MQ=60)
ATGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTACCCCATCAATTA < SRR4302533.797325/94‑1 (MQ=60)
TGCTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTACCCCATCAATTAA > SRR4302533.2118100/1‑94 (MQ=60)
CTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTACCCCATCAATTAACA > SRR4302533.2552845/1‑94 (MQ=60)
CTATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTACCCCATCAATTAACA > SRR4302533.3993308/1‑94 (MQ=60)
TATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTACCCCATCAATTAACAA > SRR4302533.4873651/1‑94 (MQ=60)
TATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTACCCCATCAATTAACAA > SRR4302533.3088043/1‑94 (MQ=60)
ATCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTACCCCATCAATTAACAAC < SRR4302533.5226954/94‑1 (MQ=60)
TCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTACCCCATCAATTAACAACT < SRR4302533.5509465/94‑1 (MQ=60)
TCACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTACCCCATCAATTAACAACT < SRR4302533.5818212/94‑1 (MQ=60)
CACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTACCCCATCAATTAACAACTG > SRR4302533.186270/1‑94 (MQ=60)
CACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTACCCCATCAATTAACAACTG > SRR4302533.3997061/1‑94 (MQ=60)
CACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTACCCCATCAATTAACAACTG < SRR4302533.3248751/94‑1 (MQ=60)
ACCATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTACCCCATCAATTAACAACTGC > SRR4302533.6000623/1‑94 (MQ=60)
CATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTACCCCATCAATTAACAACTGCTT > SRR4302533.1343067/1‑94 (MQ=60)
ATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTACCCCATCAATTAACAACTGCTTG > SRR4302533.1524636/1‑94 (MQ=60)
ATGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTACCCCATCAATTAACAACTGCTTG < SRR4302533.804923/94‑1 (MQ=60)
TGAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTACCCCATCAATTAACGACTGCTTGA < SRR4302533.4683180/94‑1 (MQ=60)
GAATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTACCCCATCAATTAACAACTGCTTGAT > SRR4302533.498971/1‑94 (MQ=60)
AATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTACCCCATCAATTAACAACTGCTTGATC < SRR4302533.4650130/94‑1 (MQ=60)
ATAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTACCCCATCAATTAACAACTGCTTGATCT > SRR4302533.4610087/1‑94 (MQ=60)
TAATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTACCCCATCAATTAACAACTGCTTGATCTG > SRR4302533.4067540/1‑94 (MQ=60)
AATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTACCCCATCAATTAACAACTGCTTGATCTGC > SRR4302533.6200242/1‑94 (MQ=60)
ATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTACCCCATCAATTAACAACTGCTTGATCTGCG > SRR4302533.1772478/1‑94 (MQ=60)
ATCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTACCCCATCAATTAACAACTGCTTGATCTGCG > SRR4302533.1700892/1‑94 (MQ=60)
TCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTACCCCATCAATTAACAACTGCTTGATCTGCGC < SRR4302533.4506959/94‑1 (MQ=60)
TCAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTACCCCATCAATTAACAACTGCTTGATCTGCGC > SRR4302533.4957839/1‑94 (MQ=60)
CAAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTACCCCATCAATTAACAACTGCTTGATCTGCGCT > SRR4302533.3995256/1‑94 (MQ=60)
AAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTACCCCATCAATTAACAACTGCTTGATCTGCGCTG > SRR4302533.2507057/1‑94 (MQ=60)
AAGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTACCCCATCAATTAACAACTGCTTGATCTGCGCTG > SRR4302533.3651170/1‑94 (MQ=60)
AGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTACCCCATCAATTAACAACTGCTTGATCTGCGCTGT < SRR4302533.640580/94‑1 (MQ=60)
AGACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTACCCCATCAATTAACAACTGCTTGATCTGCGCTGT < SRR4302533.3174172/94‑1 (MQ=60)
GACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTACCCCATCAATTAACAACTGCTTGATCTGCGCTGTC < SRR4302533.3327723/94‑1 (MQ=60)
ACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTACCCCATCAATTAACAACTGCTTGATCTGCGCTGTCC < SRR4302533.601658/94‑1 (MQ=60)
ACATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTACCCCATCAATTAACAACTGCTTGATCTGCGCTGTCC < SRR4302533.2738968/94‑1 (MQ=60)
CATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTACCCCATCAATTAACAACTGCTTGATCTGCGCTGTCCG < SRR4302533.2691534/94‑1 (MQ=60)
|
TTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGATATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTACCCCATCAATTAACAACTGCTTGATCTGCGCTGTCCG > NC_000913/2035847‑2036033
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
