Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1624 |
250.6 |
12620048 |
98.0% |
12367647 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,037,342 |
T→C |
V122A (GTG→GCG) |
b1970 → |
hypothetical protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,037,342 | 0 | T | C | 100.0%
| 684.9
/ NA
| 211 | V122A (GTG→GCG) | b1970 | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (117/94); total (117/94) |
Only 100 of 214 total aligned reads displayed.
GGGACTATTTCAAGAAACAAAATCTTGAAAGTTTCTTCCCTGAGATCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGTGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCAGTTAATGCATAAATATGTAAAAGCAGATCTCTGCTACTGTTAGGG > NC_000913/2037252‑2037431
|
gggACTATTTCAAGAAACAAAATCTTGAAAGTTTCTTCCCTGAGATCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATgcgc > 2:6249911/1‑93 (MQ=255)
ggACTATTTCAAGAAACAAAATCTTGAAAGTTTCTTCCCTGAGATCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGcc > 1:5256338/1‑93 (MQ=255)
gACTATTTCAAGAAACAAAATCTTGAAAGTTTCTTCCCTGAGATCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCt > 1:1605575/1‑93 (MQ=255)
gACTATTTCAAGAAACAAAATCTTGAAAGTTTCTTCCCTGAGATCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCt < 1:617114/93‑1 (MQ=255)
gACTATTTCAAGAAACAAAATCTTGAAAGTTTCTTCCCTGAGATCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCt > 2:555177/1‑93 (MQ=255)
tATTTCAAGAAACAAAATCTTGAAAGTTTCTTCCCTGAGATCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTtta < 2:4400750/93‑1 (MQ=255)
aTTTCAAGAAACAAAATCTTGAAAGTTTCTTCCCTGAGATCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTttat > 2:2922054/1‑93 (MQ=255)
aTTTCAAGAAACAAAATCTTGAAAGTTTCTTCCCTGAGATCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTttat > 2:2211634/1‑93 (MQ=255)
aTTTCAAGAAACAAAATCTTGAAAGTTTCTTCCCTGAGATCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTttat < 2:1398346/93‑1 (MQ=255)
aTTTCAAGAAACAAAATCTTGAAAGTTTCTTCCCTGAGATCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTttat < 2:4815513/93‑1 (MQ=255)
aTTTCAAGAAACAAAATCTTGAAAGTTTCTTCCCTGAGATCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTttat < 1:5533152/93‑1 (MQ=255)
aTTTCAAGAAACAAAATCTTGAAAGTTTCTTCCCTGAGATCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTttat > 1:3214388/1‑93 (MQ=255)
aaGAAACAAAATCTTGAAAGTTTCTTCCCTGAGATCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACtt > 1:5703932/1‑93 (MQ=255)
aaGAAACAAAATCTTGAAAGTTTCTTCCCTGAGATCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACtt > 1:356785/1‑93 (MQ=255)
aGAAACAAAATCTTGAAAGTTTCTTCCCTGAGATCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTa < 2:3119398/93‑1 (MQ=255)
aGAAACAAAATCTTGAAAGTTTCTTCCCTGAGATCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTa < 1:1729641/93‑1 (MQ=255)
aaaCAAAATCTTGAAAGTTTCTTCCCTGAGATCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGc > 2:4604556/1‑93 (MQ=255)
cAAAATCTTGAAAGTTTCTTCCCTGAGATCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCaa < 2:4535555/93‑1 (MQ=255)
aaaaTCTTGAAAGTTTCTTCCCTGAGATCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAat > 1:1067815/1‑93 (MQ=255)
aaaTCTTGAAAGTTTCTTCCCTGAGATCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAata > 2:6134834/1‑93 (MQ=255)
aaaTCTTGAAAGTTTCTTCCCTGAGATCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAata > 2:1632743/1‑93 (MQ=255)
aaTCTTGAAAGTTTCTTCCCTGAGATCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAatat < 1:1281756/93‑1 (MQ=255)
cTTGAAAGTTTCTTCCCTGAGATCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATggg < 1:639613/93‑1 (MQ=255)
cTTGAAAGTTTCTTCCCTGAGATCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATggg < 1:2717316/93‑1 (MQ=255)
cTTGAAAGTTTCTTCCCTGAGATCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATggg < 2:801669/93‑1 (MQ=255)
gAAAGTTTCTTCCCTGAGATCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTAt > 2:2455763/1‑93 (MQ=255)
gAAAGTTTCTTCCCTGAGATCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTAt < 1:4489113/93‑1 (MQ=255)
aaaGTTTCTTCCCTGAGATCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTAtt < 1:547836/93‑1 (MQ=255)
aaaGTTTCTTCCCTGAGATCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTAtt > 1:4717095/1‑93 (MQ=255)
aGTTTCTTCCCTGAGATCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTAttta > 2:1009036/1‑91 (MQ=255)
gTTTCTTCCCTGAGATCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCaa < 1:5680285/93‑1 (MQ=255)
tttCTTCCCTGAGATCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGCTATTCAAc > 2:2610677/1‑93 (MQ=255)
ttcttcCCTGAGATCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAAcc < 1:1488745/93‑1 (MQ=255)
tcttcCCTGAGATCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCt < 2:5403028/93‑1 (MQ=255)
tcttcCCTGAGATCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCt > 2:4223592/1‑93 (MQ=255)
tcttcCCTGAGATCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCt > 1:3858954/1‑93 (MQ=255)
cttcCCTGAGATCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTa < 2:1262899/93‑1 (MQ=255)
ccTGAGATCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGt < 1:2755365/93‑1 (MQ=255)
cTGAGATCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTg < 1:6033705/93‑1 (MQ=255)
cTGAGATCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTg < 1:5860083/93‑1 (MQ=255)
cTGAGATCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTCATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTg < 2:4646660/93‑1 (MQ=255)
tGAGATCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTgg < 2:3543416/93‑1 (MQ=255)
agaTCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCa > 1:5727604/1‑93 (MQ=255)
agaTCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCa > 2:5899110/1‑93 (MQ=255)
gaTCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCAg > 1:1335722/1‑93 (MQ=255)
gaTCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCAg < 2:5172099/93‑1 (MQ=255)
aTCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCAGt < 2:269872/93‑1 (MQ=255)
tCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCAGtt > 2:4732157/1‑93 (MQ=255)
tCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCAGtt > 1:517222/1‑93 (MQ=255)
tCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCAGtt < 1:907233/93‑1 (MQ=255)
ccccGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCAGTTa > 1:2864673/1‑93 (MQ=255)
cccGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCAGTTaa > 1:3164483/1‑93 (MQ=255)
cccGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCAGTTaa < 2:5672128/93‑1 (MQ=255)
ccGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCAGTTAAt < 2:2041791/93‑1 (MQ=255)
ccGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCAGTTAAt > 2:4461352/1‑93 (MQ=255)
ccGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCAGTTAAt > 1:5848809/1‑93 (MQ=255)
cGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCAGTTAATg > 2:1331764/1‑93 (MQ=255)
gTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCGATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCAGTTAATGc > 1:1713513/1‑93 (MQ=255)
gTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCAGTTAATGc < 1:931456/93‑1 (MQ=255)
gTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCAGTTAATGc > 2:5438945/1‑93 (MQ=255)
gTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCAGTTAATGc > 1:4883966/1‑93 (MQ=255)
ttGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCAGTTAATGCa < 2:5934159/93‑1 (MQ=255)
ttGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCAGTTAATGCa > 1:2112300/1‑93 (MQ=255)
gAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCAGTTAATGCATa < 1:88624/93‑1 (MQ=255)
gAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCAGTTAATGCATa > 2:5073318/1‑93 (MQ=255)
aaTTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCAGTTAATGCATaa > 1:4114169/1‑93 (MQ=255)
tttCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCAGTTAATGCATAAat > 1:2492193/1‑93 (MQ=255)
tttCATATTAATAAAGTGAACGAGAATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCAGTTAATGCATAAat > 1:5744959/1‑93 (MQ=255)
ttCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCAGTTAATGCATAAata < 1:3933592/93‑1 (MQ=255)
tCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCAGTTAATGCATAAatat > 1:510464/1‑93 (MQ=255)
atatTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCAGTTAATGCATAAATATGt > 2:879843/1‑93 (MQ=255)
atatTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCAGTTAATGCATAAATATGt > 1:3112484/1‑93 (MQ=255)
atatTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCAGTTAATGCATAAATATGt > 1:4335236/1‑93 (MQ=255)
tatTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCAGTTACTGCATAAATATGTa > 2:4683495/1‑93 (MQ=255)
tatTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCAGTTAATGCATAAATATGTa > 2:738947/1‑93 (MQ=255)
tatTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCAGTTAATGCATAAATATGTa < 2:1504816/93‑1 (MQ=255)
atTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCAGTTAATGCATAAATATGTaa > 1:267195/1‑93 (MQ=255)
taataaAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCAGTTAATGCATAAATATGTaaaa < 1:3272557/93‑1 (MQ=255)
aataaAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCAGTTAATGCATAAATATGTAAAAg > 2:3028553/1‑93 (MQ=255)
aataaAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCAGTTAATGCATAAATATGTAAAAg < 1:4650589/93‑1 (MQ=255)
aataaAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCAGTTAATGCATAAATATGTAAAAg < 1:6225287/93‑1 (MQ=255)
ataaAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCAGTTAATGCATACATATGTAAAAGc > 1:3849623/1‑93 (MQ=255)
ataaAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCAGTTAATGCATAAATATGTAAAAga > 2:2981902/1‑92 (MQ=255)
ataaAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCAGTTAATGCATAAATATGTAAAAGc > 1:3499119/1‑93 (MQ=255)
taaAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCAGTTAATGCATAAATATGTAAAAGCa < 1:2945408/93‑1 (MQ=255)
aaaGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCAGTTAATGCATAAATATGTAAAAGCAg < 2:1919650/93‑1 (MQ=255)
aaGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCAGTTAATGCATAAATATGTAAAAGCAGa > 1:2397854/1‑93 (MQ=255)
aGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCAGTTAATGCATAAATATGTAAAAGCAGAt < 1:4245990/93‑1 (MQ=255)
aGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTAATCAACCTATCGTGGCAGTTAATGCATAAATATGTAAAAGCAGAt < 2:196771/93‑1 (MQ=255)
aaCGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCAGTTAATGCATAAATATGTAAAAGCAGATctct < 1:1872403/93‑1 (MQ=255)
aGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCAGTTAATGCATAAATATGTAAAAGCAGATCTCTGCTa > 1:5822581/1‑93 (MQ=255)
ttATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCAGTTAATGCATAAATATGTAAAAGCAGATCTCTGCTACTGt > 1:3282085/1‑93 (MQ=255)
ttATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCAGTTAATGCATAAATATGTAAAAGCAGATCTCTGCTACTGt < 2:3815521/93‑1 (MQ=255)
ttATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCAGTTAATGCATAAATATGTAAAAGCAGATCTCTGCTACTGt > 2:6064395/1‑93 (MQ=255)
ttATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCAGTTAATGCATAAATATGTAAAAGCAGATCTCTGCTACTGt > 2:4336912/1‑93 (MQ=255)
ttATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCAGTTAATGCATAAATATGTAAAAGCAGATCTCTGCTACTGt > 2:5616468/1‑93 (MQ=255)
aTCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCAGTTAATGCATAAATATGTAAAAGCAGATCTCTGCTACTGTTa < 2:3204350/93‑1 (MQ=255)
tCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCAGTTAATGCATAAATATGTAAAAGCAGATCTCTGCTACTGTTAg > 1:5785289/1‑93 (MQ=255)
tCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCAGTTAATGCATAAATATGTAAAAGCAGATCTCTGCTACTGTTAg < 1:776819/93‑1 (MQ=255)
aTGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCAGTTAATGCATAAATATGTAAAAGCAGATCTCTGCTACTGTTAggg > 2:854882/1‑93 (MQ=255)
|
GGGACTATTTCAAGAAACAAAATCTTGAAAGTTTCTTCCCTGAGATCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGTGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCAGTTAATGCATAAATATGTAAAAGCAGATCTCTGCTACTGTTAGGG > NC_000913/2037252‑2037431
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CCGGGGACTATTTCAAGAAACAAAATCTTGAAAGTTTCTTCCCTGAGATCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGTGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCAGTTAATGCATAAATATGTAAAAGCAGATCTCTGCTACTGTTAGGGAG > NC_000913/2037249‑2037433
|
CCGGGGACTATTTCAAGAAACAAAATCTTGAAAGTTTCTTCCCTGAGATCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGC < SRR4302533.4070763/94‑1 (MQ=60)
CGGGGACTATTTCAAGAAACAAAATCTTGAAAGTTTCTTCCCTGAGATCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCG < SRR4302533.4274458/94‑1 (MQ=60)
CGGGGACTATTTCAAGAAACAAAATCTTGAAAGTTTCTTCCCTGAGATCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCG < SRR4302533.5245071/94‑1 (MQ=60)
CGGGGACTATTTCAAGAAACAAAATCTTGAAAGTTTCTTCCCTGAGATCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCG > SRR4302533.5766010/1‑94 (MQ=60)
GGGGACTATTTCAAGAAACAAAATCTTGAAAGTTTCTTCCCTGAGATCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGC > SRR4302533.3586553/1‑94 (MQ=60)
GGGACTATTTCAAGAAACAAAATCTTGAAAGTTTCTTCCCTGAGATCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCC > SRR4302533.5287908/1‑94 (MQ=60)
GGACTATTTCAAGAAACAAAATCTTGAAAGTTTCTTCCCTGAGATCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCT > SRR4302533.1615294/1‑94 (MQ=60)
GGACTATTTCAAGAAACAAAATCTTGAAAGTTTCTTCCCTGAGATCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCT > SRR4302533.6018090/1‑94 (MQ=60)
GACTATTTCAAGAAACAAAATCTTGAAAGTTTCTTCCCTGAGATCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTT > SRR4302533.1492628/1‑94 (MQ=60)
GACTATTTCAAGAAACAAAATCTTGAAAGTTTCTTCCCTGAGATCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTT < SRR4302533.620734/94‑1 (MQ=60)
CTATTTCAAGAAACAAAATCTTGAAAGTTTCTTCCCTGAGATCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTA < SRR4302533.1305739/94‑1 (MQ=60)
CTATTTCAAGAAACAAAATCTTGAAAGTTTCTTCCCTGAGATCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTA > SRR4302533.2480251/1‑94 (MQ=60)
TATTTCAAGAAACAAAATCTTGAAAGTTTCTTCCCTGAGATCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTAT > SRR4302533.3234206/1‑94 (MQ=60)
ATTTCAAGAAACAAAATCTTGAAAGTTTCTTCCCTGAGATCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATT < SRR4302533.5566559/94‑1 (MQ=60)
TCAAGAAACAAAATCTTGAAAGTTTCTTCCCTGAGATCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACT > SRR4302533.5861302/1‑94 (MQ=60)
CAAGAAACAAAATCTTGAAAGTTTCTTCCCTGAGATCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTT > SRR4302533.5738385/1‑94 (MQ=60)
CAAGAAACAAAATCTTGAAAGTTTCTTCCCTGAGATCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTT > SRR4302533.358960/1‑94 (MQ=60)
AAGAAACAAAATCTTGAAAGTTTCTTCCCTGAGATCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTA > SRR4302533.2754347/1‑94 (MQ=60)
AGAAACAAAATCTTGAAAGTTTCTTCCCTGAGATCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAG < SRR4302533.193916/94‑1 (MQ=60)
AGAAACAAAATCTTGAAAGTTTCTTCCCTGAGATCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAG < SRR4302533.4714491/94‑1 (MQ=60)
AGAAACAAAATCTTGAAAGTTTCTTCCCTGAGATCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAG < SRR4302533.1740128/94‑1 (MQ=60)
AGAAACAAAATCTTGAAAGTTTCTTCCCTGAGATCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAG < SRR4302533.5820910/94‑1 (MQ=60)
AGAAACAAAATCTTGAAAGTTTCTTCCCTGAGATCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAG < SRR4302533.3210501/94‑1 (MQ=60)
AAACAAAATCTTGAAAGTTTCTTCCCTGAGATCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCC > SRR4302533.2296874/1‑94 (MQ=60)
AAACAAAATCTTGAAAGTTTCTTCCCTGAGATCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCC < SRR4302533.1908413/94‑1 (MQ=60)
AACAAAATCTTGAAAGTTTCTTCCCTGAGATCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCA > SRR4302533.4378670/1‑94 (MQ=60)
ACAAAATCTTGAAAGTTTCTTCCCTGAGATCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAA > SRR4302533.1244949/1‑94 (MQ=60)
CAAAATCTTGAAAGTTTCTTCCCTGAGATCCGCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAAT < SRR4302533.324269/94‑1 (MQ=60)
CAAAATCTTGAAAGTTTCTTCCCTGAGATCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAAT > SRR4302533.1074096/1‑94 (MQ=60)
CAAAATCTTGAAAGTTTCTTCCCTGAGATCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAAT < SRR4302533.869658/94‑1 (MQ=60)
AAAATCTTGAAAGTTTCTTCCCTGAGATCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATA > SRR4302533.6158481/1‑94 (MQ=60)
AAATCTTGAAAGTTTCTTCCCTGAGATCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATAT < SRR4302533.2851026/94‑1 (MQ=60)
AATCTTGAAAGTTTCTTCCCTGAGATCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATG < SRR4302533.1289470/94‑1 (MQ=60)
AATCTTGAAAGTTTCTTCCCTGAGATCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATG < SRR4302533.4333852/94‑1 (MQ=60)
TCTTGAAAGTTTCTTCCCTGAGATCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGG < SRR4302533.5889904/94‑1 (MQ=60)
CTTGAAAGTTTCTTCCCTGAGATCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGT < SRR4302533.5182991/94‑1 (MQ=60)
CTTGAAAGTTTCTTCCCTGAGATCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGT < SRR4302533.643377/94‑1 (MQ=60)
CTTGAAAGTTTCTTCCCTGAGATCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGT < SRR4302533.2733999/94‑1 (MQ=60)
TTGAAAGTTTCTTCCCTGAGATCCCCGTTGAATTTCGTATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTG < SRR4302533.3179281/94‑1 (MQ=60)
TTGAAAGTTTCTTCCCTGAGATCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTA < SRR4302533.778647/94‑1 (MQ=60)
TGAAAGTTTCTTCCCTGAGATCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTAT > SRR4302533.3541283/1‑94 (MQ=60)
TGAAAGTTTCTTCCCTGAGATCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTAT < SRR4302533.5803414/94‑1 (MQ=60)
GAAAGTTTCTTCCCTGAGATCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATT < SRR4302533.4516288/94‑1 (MQ=60)
GAAAGTTTCTTCCCTGAGATCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATT > SRR4302533.4745695/1‑94 (MQ=60)
GAAAGTTTCTTCCCTGAGATCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATT > SRR4302533.418388/1‑94 (MQ=60)
AAAGTTTCTTCCCTGAGATCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTC < SRR4302533.551088/94‑1 (MQ=60)
GTTTCTTCCCTGAGATCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAAC < SRR4302533.5714593/94‑1 (MQ=60)
TTCTTCCCTGAGATCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCT < SRR4302533.1497725/94‑1 (MQ=60)
TTCTTCCCTGAGATCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCT > SRR4302533.3882514/1‑94 (MQ=60)
TCTTCCCTGAGATCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTA < SRR4302533.899989/94‑1 (MQ=60)
CTTCCCTGAGATCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTAT < SRR4302533.683146/94‑1 (MQ=60)
CTTCCCTGAGATCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTAT < SRR4302533.3296813/94‑1 (MQ=60)
CCTGAGATCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTG < SRR4302533.2772262/94‑1 (MQ=60)
CTGAGATCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGG < SRR4302533.5895510/94‑1 (MQ=60)
CTGAGATCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGG > SRR4302533.5761628/1‑94 (MQ=60)
CTGAGATCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGG < SRR4302533.6070268/94‑1 (MQ=60)
GAGATCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCA > SRR4302533.5762191/1‑94 (MQ=60)
AGATCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCAG > SRR4302533.1343739/1‑94 (MQ=60)
GATCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCAGT > SRR4302533.5851430/1‑94 (MQ=60)
GATCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCAGT < SRR4302533.5230751/94‑1 (MQ=60)
ATCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCAGTT < SRR4302533.2704659/94‑1 (MQ=60)
ATCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCAGTT > SRR4302533.520293/1‑94 (MQ=60)
ATCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCAGTT > SRR4302533.1732079/1‑94 (MQ=60)
TCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCAGTTA < SRR4302533.912553/94‑1 (MQ=60)
TCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCAGTTA > SRR4302533.2882296/1‑94 (MQ=60)
CCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCAGTTAA > SRR4302533.3183960/1‑94 (MQ=60)
CCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCAGTTAAT > SRR4302533.5884168/1‑94 (MQ=60)
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ATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCAGTTAATGCATAAAT > SRR4302533.2507541/1‑94 (MQ=60)
ATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGAATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCAGTTAATGCATAAAT > SRR4302533.5779625/1‑94 (MQ=60)
TTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCAGTTAATGCATAAATAT > SRR4302533.3876244/1‑94 (MQ=60)
TTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCAGTTAATGCATAAATAT < SRR4302533.3957603/94‑1 (MQ=60)
TTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCAGTTAATGCATAAATAT > SRR4302533.513499/1‑94 (MQ=60)
CATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCAGTTAATGCATAAATATGT > SRR4302533.3131621/1‑94 (MQ=60)
CATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCAGTTAATGCATAAATATGT > SRR4302533.3783456/1‑94 (MQ=60)
CATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCAGTTAATGCATAAATATGT > SRR4302533.4361357/1‑94 (MQ=60)
TATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCAGTTAATGCATAAATATGTAA > SRR4302533.268818/1‑94 (MQ=60)
TATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCAGTTAATGCATAAATATGTAA < SRR4302533.2982208/94‑1 (MQ=60)
TAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCAGTTAATGCATAAATATGTAAAAG < SRR4302533.3292754/94‑1 (MQ=60)
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AATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCAGTTAATGCATACATATGTAAAAGC > SRR4302533.3873132/1‑94 (MQ=60)
AATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCAGTTAATGCATAAATATGTAAAAGC < SRR4302533.6262586/94‑1 (MQ=60)
AATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCAGTTAATGCATAAATATGTAAAAGC > SRR4302533.3520697/1‑94 (MQ=60)
AATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCAGTTAATGCATAAATATGTAAAAGC < SRR4302533.4989515/94‑1 (MQ=60)
AATAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCAGTTAATGCATAAATATGTAAAAGC < SRR4302533.4678766/94‑1 (MQ=60)
TAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCAGTTAATGCATAAATATGTAAAAGCAG < SRR4302533.2963423/94‑1 (MQ=60)
TAAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCAGTTAATGCATAAATATGTAAAAGCAG > SRR4302533.6299942/1‑94 (MQ=60)
AAAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCAGTTAATGCATAAATATGTAAAAGCAGA > SRR4302533.2412656/1‑94 (MQ=60)
AAGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCAGTTAATGCATAAATATGTAAAAGCAGAT < SRR4302533.3442140/94‑1 (MQ=60)
AGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCAGTTAATGCATAAATATGTAAAAGCAGATC < SRR4302533.2939947/94‑1 (MQ=60)
AGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCAGTTAATGCATAAATATGTAAAAGCAGATC < SRR4302533.4271621/94‑1 (MQ=60)
AGTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCAGTTAATGCATAAATATGTAAAAGCAGATC < SRR4302533.169814/94‑1 (MQ=60)
AGNGAANGAGCATTATCATGCGNNTTTATTACTTAGCCAATATGGNTATTCAACCTATCGTGGCAGTTAATGCATAAATATGTAAAAGCAGATC < SRR4302533.4854506/94‑1 (MQ=60)
GTGAACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCAGTTAATGCATAAATATGTAAAAGCAGATCT > SRR4302533.6229430/1‑94 (MQ=60)
AACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCAGTTAATGCATAAATATGTAAAAGCAGATCTCTG > SRR4302533.5726630/1‑94 (MQ=60)
AACGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCAGTTAATGCATAAATATGTAAAAGCAGATCTCTG < SRR4302533.1883819/94‑1 (MQ=60)
CGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCAGTTAATGCATAAATATGTAAAAGCAGATCTCTGCT < SRR4302533.5396388/94‑1 (MQ=60)
CGAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCAGTTAATGCATAAATATGTAAAAGCAGATCTCTGCT > SRR4302533.2508760/1‑94 (MQ=60)
GAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCAGTTAATGCATAAATATGTAAAAGCAGATCTCTGCTA > SRR4302533.3964945/1‑94 (MQ=60)
GAGCATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCAGTTAATGCATAAATATGTAAAAGCAGATCTCTGCTA > SRR4302533.5857751/1‑94 (MQ=60)
CATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCAGTTAATGCATAAATATGTAAAAGCAGATCTCTGCTACTG > SRR4302533.184400/1‑94 (MQ=60)
ATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCAGTTAATGCATAAATATGTAAAAGCAGATCTCTGCTACTGT > SRR4302533.3302349/1‑94 (MQ=60)
ATTATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCAGTTAATGCATAAATATGTAAAAGCAGATCTCTGCTACTGT > SRR4302533.5696759/1‑94 (MQ=60)
TATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCAGTTAATGCATAAATATGTAAAAGCAGATCTCTGCTACTGTTA > SRR4302533.5562255/1‑94 (MQ=60)
ATCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCAGTTAATGCATAAATATGTAAAAGCAGATCTCTGCTACTGTTAG > SRR4302533.5820229/1‑94 (MQ=60)
TCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCAGTTAATGCATAAATATGTAAAAGCAGATCTCTGCTACTGTTAGG < SRR4302533.463108/94‑1 (MQ=60)
TCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCAGTTAATGCATAAATATGTAAAAGCAGATCTCTGCTACTGTTAGG < SRR4302533.781387/94‑1 (MQ=60)
TCATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCAGTTAATGCATAAATATGTAAAAGCAGATCTCTGCTACTGTTAGG < SRR4302533.91557/94‑1 (MQ=60)
CATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCAGTTAATGCATAAATATGTAAAAGCAGATCTCTGCTACTGTTAGGG < SRR4302533.5459876/94‑1 (MQ=60)
ATGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCAGTTAATGCATAAATATGTAAAAGCAGATCTCTGCTACTGTTAGGGA > SRR4302533.1490285/1‑94 (MQ=60)
TGCGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCAGTTAATGCATAAATATGTAAAAGCAGATCTCTGCTACTGTTAGGGAG < SRR4302533.4879981/94‑1 (MQ=60)
|
CCGGGGACTATTTCAAGAAACAAAATCTTGAAAGTTTCTTCCCTGAGATCCCCGTTGAATTTCATATTAATAAAGTGAACGAGCATTATCATGTGCCTTTATTACTTAGCCAATATGGGTATTCAACCTATCGTGGCAGTTAATGCATAAATATGTAAAAGCAGATCTCTGCTACTGTTAGGGAG > NC_000913/2037249‑2037433
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
