Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1624 |
250.6 |
12620048 |
98.0% |
12367647 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,312,469 |
C→T |
A321V (GCG→GTG) |
yojN → |
putative 2‑component sensor protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,312,469 | 0 | C | T | 98.9%
| 671.3
/ NA
| 184 | A321V (GCG→GTG) | yojN | putative 2‑component sensor protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (98/84); minor base G (2/0); total (100/84) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.01e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 209 total aligned reads displayed.
GCCTGGTCTGGCAGGTTCCTTATGGCACCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGCGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGAAAACGTCCCCAGCACGGCGGTCAATAACGAATTGC > NC_000913/2312379‑2312558
|
gcCTGGTCTGGCAGGTTCCTTATGGCACCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTTCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTgctggggc > 1:2184888/1‑93 (MQ=255)
gcCTGGTCTGGCAGGTTCCTTATGGCACCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTgctggtgc > 2:3157458/1‑93 (MQ=255)
cTGGTCTGGCAGGTTCCTTATGGCACCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTgctggtgctg < 1:6153027/93‑1 (MQ=255)
cTGGTCTGGCAGGTTCCTTATGGCACCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTgctggtgctg > 1:5304/1‑93 (MQ=255)
cTGGTCTGGCAGGTTCCTTATGGCACCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTgctggtgctg > 2:1357297/1‑93 (MQ=255)
cTGGTCTGGCAGGTTCCTTATGGCACCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTgctggtgctg > 2:5260033/1‑93 (MQ=255)
cTGGTCTGGCAGGTTCCTTATGGCACCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTgctggtgctg < 1:3109037/93‑1 (MQ=255)
tGGTCTGGCAGGTTCCTTATGGCACCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTtgctggtgctgg < 2:1647260/93‑1 (MQ=255)
ggTCTGGCAGGTTCCTTATGGCACCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTgctggtgctggc < 1:2091700/93‑1 (MQ=255)
ggTCTGGCAGGTTCCTTATGGCACCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTgctggtgctggc < 1:3214680/93‑1 (MQ=255)
tGGCAGGTTCCTTATGGCACCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTa > 2:2528339/1‑93 (MQ=255)
ggCAGGTTCCTTATGGCACCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTAt > 2:1567881/1‑93 (MQ=255)
gaaGGTTCCTTATGGCACCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCTGTTTGCTGGTGCTGGCGTTAtt > 2:3296549/3‑93 (MQ=255)
gCAGGTTCCTTATGGCACCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTAtt > 2:1247579/1‑93 (MQ=255)
cAGGTTCCTTATGGCACCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTAttt < 2:2706746/93‑1 (MQ=255)
cAGGTTCCTTATGGCACCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTAttt > 1:6160345/1‑93 (MQ=255)
aGGTTCCTTATGGCACCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTg > 2:1701556/1‑93 (MQ=255)
aGGTTCCTTATGGCACCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTg > 1:5680908/1‑93 (MQ=255)
aGGTTCCTTATGGCACCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGNTTGCTGGTGCTGGCGTTATNTg > 1:4382849/1‑93 (MQ=255)
gTTCCTTATGGCACCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGc < 2:1199568/93‑1 (MQ=255)
ttCCTTATGGCACCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCt > 1:3915866/1‑93 (MQ=255)
tCCTTATGGCACCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCta > 2:4036931/1‑93 (MQ=255)
tCCTTATGGCACCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCta < 2:3691172/93‑1 (MQ=255)
ccTTATGGCACCTTATTGCTGGATACGTCGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCtat < 1:6061626/93‑1 (MQ=255)
cTTATGGCACCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCtata < 1:3431481/93‑1 (MQ=255)
ttATGGCACCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATAc < 1:3020526/93‑1 (MQ=255)
ttATGGCACCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATAc > 1:2444957/1‑93 (MQ=255)
ttATGGCACCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATAc < 2:4280738/93‑1 (MQ=255)
ttATGGCACCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATAc < 1:1283/93‑1 (MQ=255)
ttATGGCACCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATAc > 2:2843293/1‑93 (MQ=255)
aTGGCACCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACca < 1:2756379/93‑1 (MQ=255)
tGGCACCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACcac < 2:730581/93‑1 (MQ=255)
tGGCACCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACcac > 1:2217984/1‑93 (MQ=255)
ggCACCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACcaca < 2:1001571/93‑1 (MQ=255)
gCACCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACAt < 2:2890019/93‑1 (MQ=255)
aCCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTc > 1:1909338/1‑93 (MQ=255)
ccTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTcc > 2:2203401/1‑93 (MQ=255)
cTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCg > 1:4507970/1‑93 (MQ=255)
cTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCg > 1:3750041/1‑93 (MQ=255)
ttATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGc < 1:511011/93‑1 (MQ=255)
ttATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGc > 1:2949771/1‑93 (MQ=255)
tATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGcc < 2:279226/93‑1 (MQ=255)
tATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGcc > 2:473578/1‑93 (MQ=255)
tATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGcc > 2:6237868/1‑93 (MQ=255)
aTTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCa > 2:4124105/1‑93 (MQ=255)
aTTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCa > 2:837475/1‑93 (MQ=255)
ttGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGccct > 1:3257073/1‑91 (MQ=255)
ttGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCAt > 1:5288926/1‑93 (MQ=255)
ttGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCAt < 1:1806856/93‑1 (MQ=255)
gCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCAttt < 2:6151087/93‑1 (MQ=255)
gCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCAttt > 2:1068999/1‑93 (MQ=255)
gCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCAttt < 1:3160965/93‑1 (MQ=255)
cTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTtc < 2:3569236/93‑1 (MQ=255)
ggATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTtctc > 2:2331029/1‑93 (MQ=255)
ggATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTtctc < 1:2569817/93‑1 (MQ=255)
gATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTcc < 1:1029626/93‑1 (MQ=255)
gATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTcc < 1:5558886/93‑1 (MQ=255)
gATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTcc < 1:5455049/93‑1 (MQ=255)
gATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTcc < 1:2287162/93‑1 (MQ=255)
aTACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCa < 1:2579609/93‑1 (MQ=255)
tACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAg < 1:5633485/93‑1 (MQ=255)
tACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAg > 2:3505675/1‑93 (MQ=255)
tGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCa < 1:4229446/93‑1 (MQ=255)
aaaaCATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTa > 1:4626131/1‑93 (MQ=255)
aaaCATTCTGCTGCCACTGCTGCTGCACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTAc > 2:5612556/1‑93 (MQ=255)
aaaCATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTAc < 1:608489/93‑1 (MQ=255)
aCATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGGTTGCTGGGGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAg > 2:4967053/1‑93 (MQ=255)
cATTTTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGa < 2:1877045/93‑1 (MQ=255)
cATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGa > 1:5943945/1‑93 (MQ=255)
cATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGa < 1:5201365/93‑1 (MQ=255)
tCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGaaaa < 1:416691/93‑1 (MQ=255)
tCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGaaaa < 2:4427322/93‑1 (MQ=255)
tgcCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGAAAACGTcc < 1:3796928/93‑1 (MQ=255)
gcCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGAAAACGTccc > 1:1619722/1‑93 (MQ=255)
ccACTTCTGCTGAACATGGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGAAAACGTcccc < 2:2263039/93‑1 (MQ=255)
ccACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGAAAACGTcccc < 2:5845200/93‑1 (MQ=255)
ccACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGAAAACGTcccc < 1:757241/93‑1 (MQ=255)
ccACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGAAAACGTcccc < 1:5276227/93‑1 (MQ=255)
aCTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGAAAACGTCCCCAg > 1:2608147/1‑93 (MQ=255)
aCTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGAAAACGTCCCCAg > 1:3311047/1‑93 (MQ=255)
tgctgctgAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGAAAACGTCCCCAGCa < 1:4550370/93‑1 (MQ=255)
tgctgctgAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGAAAACGTCCCCAGCa < 2:5423963/93‑1 (MQ=255)
gctgctgAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGAAAACGTCCCCAGCAc < 2:5223536/93‑1 (MQ=255)
ctgctgAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGAAAACGTCCCCAGCAcg > 2:5925574/1‑93 (MQ=255)
ctgctgAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGAAAACGTCCCCAGCAcg < 2:5364148/93‑1 (MQ=255)
tgctgAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGAAAACGTCCCCAGCAcgg < 2:5767284/93‑1 (MQ=255)
tctgAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTATCCAGCCGCAGTACAGAAAACGTCCCCAGCAcggc < 2:2981392/92‑1 (MQ=255)
gctgAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGAAAACGTCCCCAGCAcggc < 2:2475827/93‑1 (MQ=255)
tgAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGAAAACGTTCCCAGCAcggcgg > 2:4353008/1‑93 (MQ=255)
tgAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGAAAACGTCCCCAGCAcggcgg > 1:1457390/1‑93 (MQ=255)
gAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGAAAACGTCCCCAGCACGGCGGt > 2:4002582/1‑93 (MQ=255)
aCATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGAAAACGTCCCCAGCACGGCGGTCa > 1:4031812/1‑93 (MQ=255)
aCATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGAAAACGTCCCCAGCACGGCGGTCa > 2:5730070/1‑93 (MQ=255)
aTCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGAAAACGTCCCCAGCACGGCGGTCAAt > 1:3627407/1‑93 (MQ=255)
cGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGAAAACGTCCCCAGCACGGCGGTCAATaa < 2:1962406/93‑1 (MQ=255)
cGGTTTGCGGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGAAAACGTCCCCAGCACGGCGGTCAATaa < 2:3220519/93‑1 (MQ=255)
ggTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGAAAACGTCCCCAGCACGGCGGTCAATAAc < 1:1228448/93‑1 (MQ=255)
gTTTGCTGGGGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGAAAACGTCCCCAGCACGGCGGTCAATAACg > 2:4480699/1‑93 (MQ=255)
tgctggtgctggCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGAAAACGTCCCCAGCACGGCGGTCAATAACGAAt < 2:1829373/93‑1 (MQ=255)
tggtgctggcgTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGAAAACGTCCCCAGCACGGCGGTCAATAACGAATTgc > 1:5766097/1‑93 (MQ=255)
|
GCCTGGTCTGGCAGGTTCCTTATGGCACCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGCGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGAAAACGTCCCCAGCACGGCGGTCAATAACGAATTGC > NC_000913/2312379‑2312558
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GCGCCTGGTCTGGCAGGTTCCTTATGGCACCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGCGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGAAAACGTCCCCAGCACGGCGGTCAATAACGAATTGCGC > NC_000913/2312377‑2312560
|
GCGCCTGGTCTGGCAGGTTCCTTATGGCACCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTG < SRR4302533.6247457/94‑1 (MQ=60)
CGCCTGGTCTGGCAGGTTCCTTATGGCACCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTTCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGGGC > SRR4302533.2198357/1‑94 (MQ=60)
CGCCTGGTCTGGCAGGTTCCTTATGGCACCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGC > SRR4302533.3593740/1‑94 (MQ=60)
CCTGGTCTGGCAGGTTCCTTATGGCACCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTG > SRR4302533.5629747/1‑94 (MQ=60)
CCTGGTCTGGCAGGTTCCTTATGGCACCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTG > SRR4302533.5354/1‑94 (MQ=60)
CCTGGTCTGGCAGGTTCCTTATGGCACCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTG < SRR4302533.293553/94‑1 (MQ=60)
CTGGTCTGGCAGGTTCCTTATGGCACCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGG < SRR4302533.3128148/94‑1 (MQ=60)
CTGGTCTGGCAGGTTCCTTATGGCACCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGG > SRR4302533.3826727/1‑94 (MQ=60)
CTGGTCTGGCAGGTTCCTTATGGCACCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGG < SRR4302533.6190056/94‑1 (MQ=60)
CTGGTCTGGCAGGTTCCTTATGGCACCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGG > SRR4302533.4223036/1‑94 (MQ=60)
TGGTCTGGCAGGTTCCTTATGGCACCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGC > SRR4302533.52894/1‑94 (MQ=60)
GGTCTGGCAGGTTCCTTATGGCACCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCG < SRR4302533.3234499/94‑1 (MQ=60)
GGTCTGGCAGGTTCCTTATGGCACCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCG < SRR4302533.2104582/94‑1 (MQ=60)
GGTCTGGCAGGTTCCTTATGGCACCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCG > SRR4302533.6322415/1‑94 (MQ=60)
GTCTGGCAGGTTCCTTATGGCACCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGT > SRR4302533.1426053/1‑94 (MQ=60)
CTGGCAGGTTCCTTATGGCACCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTA > SRR4302533.2195067/1‑94 (MQ=60)
CTGGCAGGTTCCTTATGGCACCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTA > SRR4302533.4362707/1‑94 (MQ=60)
GCAGGTTCCTTATGGCACCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTT > SRR4302533.6197393/1‑94 (MQ=60)
CAGGTTCCTTATGGCACCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTG > SRR4302533.5715221/1‑94 (MQ=60)
CAGGTTCCTTATGGCACCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGNTTGCTGGTGCTGGCGTTATNTG > SRR4302533.4409309/1‑94 (MQ=60)
GTTCCTTATGGCACCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCT < SRR4302533.3081003/94‑1 (MQ=60)
GTTCCTTATGGCACCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCT > SRR4302533.3939782/1‑94 (MQ=60)
TCCTTATGGCACCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTAT > SRR4302533.1929512/1‑94 (MQ=60)
TCCTTATGGCACCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTAT > SRR4302533.5142733/1‑94 (MQ=60)
CCTTATGGCACCTTATTGCTGGATACGTCGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATA < SRR4302533.6098321/94‑1 (MQ=60)
CTTATGGCACCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATAC > SRR4302533.2460050/1‑94 (MQ=60)
CTTATGGCACCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATAC < SRR4302533.3452678/94‑1 (MQ=60)
CTCATGGCACCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATAC > SRR4302533.6126908/1‑94 (MQ=60)
TTATGGCACCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACC < SRR4302533.1296/94‑1 (MQ=60)
TTATGGCACCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACC < SRR4302533.3039014/94‑1 (MQ=60)
ATGGCACCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCAC < SRR4302533.2773284/94‑1 (MQ=60)
ATGGCACCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCAC > SRR4302533.2231676/1‑94 (MQ=60)
CACCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTC > SRR4302533.6057436/1‑94 (MQ=60)
CACCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTC > SRR4302533.1920985/1‑94 (MQ=60)
CACCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTC > SRR4302533.3977636/1‑94 (MQ=60)
CCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCG > SRR4302533.3773031/1‑94 (MQ=60)
CCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCG > SRR4302533.4535273/1‑94 (MQ=60)
CCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCG < SRR4302533.4650809/94‑1 (MQ=60)
CTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGC > SRR4302533.2967810/1‑94 (MQ=60)
TTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCC < SRR4302533.514049/94‑1 (MQ=60)
TTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCC > SRR4302533.4606449/1‑94 (MQ=60)
ATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCCT > SRR4302533.3277160/1‑94 (MQ=60)
ATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCAT > SRR4302533.5320601/1‑94 (MQ=60)
TTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATT < SRR4302533.3271580/94‑1 (MQ=60)
TTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATT > SRR4302533.5390480/1‑94 (MQ=60)
TTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATT < SRR4302533.1817852/94‑1 (MQ=60)
TGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTT > SRR4302533.4513995/1‑94 (MQ=60)
TGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTT > SRR4302533.6115652/1‑94 (MQ=60)
TGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTT > SRR4302533.1569665/1‑94 (MQ=60)
GCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTC < SRR4302533.3180417/94‑1 (MQ=60)
CTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCT > SRR4302533.3292476/1‑94 (MQ=60)
TGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTC < SRR4302533.3154484/94‑1 (MQ=60)
TGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTC < SRR4302533.1761962/94‑1 (MQ=60)
GGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCC < SRR4302533.2585631/94‑1 (MQ=60)
GGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCC > SRR4302533.3771170/1‑94 (MQ=60)
GATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCA < SRR4302533.873342/94‑1 (MQ=60)
GATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCA < SRR4302533.5487913/94‑1 (MQ=60)
GATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCA < SRR4302533.5592483/94‑1 (MQ=60)
GATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCA < SRR4302533.1035678/94‑1 (MQ=60)
GATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCA < SRR4302533.2301316/94‑1 (MQ=60)
ATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAG < SRR4302533.2595483/94‑1 (MQ=60)
TACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGC < SRR4302533.5667552/94‑1 (MQ=60)
CGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCG > SRR4302533.5684235/1‑94 (MQ=60)
CGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCG > SRR4302533.2309191/1‑94 (MQ=60)
GTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGC > SRR4302533.3412046/1‑94 (MQ=60)
TGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAG < SRR4302533.4133778/94‑1 (MQ=60)
TGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAG < SRR4302533.4255015/94‑1 (MQ=60)
TGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAG < SRR4302533.2216772/94‑1 (MQ=60)
GCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGT < SRR4302533.4698989/94‑1 (MQ=60)
CAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTA > SRR4302533.4654168/1‑94 (MQ=60)
AAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACA < SRR4302533.612068/94‑1 (MQ=60)
AAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACA > SRR4302533.2289358/1‑94 (MQ=60)
AAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACA > SRR4302533.3224117/1‑94 (MQ=60)
ACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGA > SRR4302533.5979893/1‑94 (MQ=60)
CATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGAA < SRR4302533.6193396/94‑1 (MQ=60)
CATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGAA < SRR4302533.5232716/94‑1 (MQ=60)
TCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGAAAAC < SRR4302533.419193/94‑1 (MQ=60)
TGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGAAAACGT > SRR4302533.5968731/1‑94 (MQ=60)
CTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGAAAACGTCC > SRR4302533.4570307/1‑94 (MQ=60)
CTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGAAAACGTCC < SRR4302533.1258313/94‑1 (MQ=60)
TGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGAAAACGTCCC > SRR4302533.1629535/1‑94 (MQ=60)
TGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGAAAACGTCCC < SRR4302533.3820171/94‑1 (MQ=60)
CCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGAAAACGTCCCCA < SRR4302533.5307860/94‑1 (MQ=60)
CCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGAAAACGTCCCCA > SRR4302533.1079434/1‑94 (MQ=60)
CCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGAAAACGTCCCCA < SRR4302533.761697/94‑1 (MQ=60)
CACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGAAAACGTCCCCAG > SRR4302533.2675092/1‑94 (MQ=60)
CACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGAAAACGTCCCCAG < SRR4302533.2575156/94‑1 (MQ=60)
CACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGAAAACGTCCCCAG > SRR4302533.2624164/1‑94 (MQ=60)
CACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGAAAACGTCCCCAG > SRR4302533.3331492/1‑94 (MQ=60)
ACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGAAAACGTCCCCAGC > SRR4302533.5963711/1‑94 (MQ=60)
CTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGAAAACGTCCCCAGCA > SRR4302533.2971374/1‑94 (MQ=60)
TGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGAAAACGTCCCCAGCAC < SRR4302533.4577963/94‑1 (MQ=60)
GCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGAAAACGTCCCCAGCACGGCG < SRR4302533.3779151/94‑1 (MQ=60)
CTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGAAAACGTCCCCAGCACGGCGG > SRR4302533.1466179/1‑94 (MQ=60)
CAGAACATCGGTTGGCGGGTGCTGGCGTGATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTGCTCCAGCCGCAGTACAGAAAACGTCCCCAGCACGGCGG < SRR4302533.1873445/94‑1 (MQ=60)
TGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGAAAACGTCCCCAGCACGGCGGT > SRR4302533.2585664/1‑94 (MQ=60)
GAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGAAAACGTCCCCAGCACGGCGGTC < SRR4302533.260442/94‑1 (MQ=60)
GAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGAAAACGTCCCCAGCACGGCGGTC < SRR4302533.5312169/94‑1 (MQ=60)
AACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGAAAACGTCCCCAGCACGGCGGTCA > SRR4302533.4056356/1‑94 (MQ=60)
CATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGAAAACGTCCCCAGCACGGCGGTCAAT > SRR4302533.5534268/1‑94 (MQ=60)
CATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGAAAACGTCCCCAGCACGGCGGTCAAT > SRR4302533.3649727/1‑94 (MQ=60)
CGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGAAAACGTCCCCAGCACGGCGGTCAATAAC > SRR4302533.1841313/1‑94 (MQ=60)
CGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCAATTTCTCCAGCCGCAGTACAGAAAACGTCCCCAGCACGGCGGTCAATAAC > SRR4302533.3404896/1‑94 (MQ=60)
GGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGAAAACGTCCCCAGCACGGCGGTCAATAACG < SRR4302533.1235801/94‑1 (MQ=60)
GTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGAAAACGTCCCCAGCACGGCGGTCAATAACGA < SRR4302533.5326377/94‑1 (MQ=60)
TTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGAAAACGTCCCCAGCACGGCGGTCAATAACGAA < SRR4302533.2532752/94‑1 (MQ=60)
GCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGAAAACGTCCCCAGCACGGCGGTCAATAACGAATTG > SRR4302533.5732955/1‑94 (MQ=60)
CTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGAAAACGTCCCCAGCACGGCGGTCAATAACGAATTGC > SRR4302533.5800910/1‑94 (MQ=60)
GGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGAAAACGTCCCCAGCACGGCGGTCAATAACGAATTGCGC < SRR4302533.3095007/94‑1 (MQ=60)
|
GCGCCTGGTCTGGCAGGTTCCTTATGGCACCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGCGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGAAAACGTCCCCAGCACGGCGGTCAATAACGAATTGCGC > NC_000913/2312377‑2312560
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
