Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1624 |
250.6 |
12620048 |
98.0% |
12367647 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,370,890 |
T→C |
V105A (GTG→GCG) |
b4533 → |
hypothetical protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,370,890 | 0 | T | C | 100.0%
| 697.7
/ NA
| 215 | V105A (GTG→GCG) | b4533 | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (94/121); total (94/121) |
Only 100 of 219 total aligned reads displayed.
TCTGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGCGTTCATTATTGGCGGCATTGTGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGTGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCTCAGTTGCGCAATTAAGCCTGGGTTTTGC > NC_000913/2370800‑2370979
|
cTGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGAt < 2:3644828/93‑1 (MQ=255)
tGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGGATTGCGATc > 2:1846706/1‑93 (MQ=255)
tGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATc > 1:4556446/1‑93 (MQ=255)
gggTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATcc > 1:3870889/1‑93 (MQ=255)
gggTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATcc < 2:5953925/93‑1 (MQ=255)
gggTGACGCGGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATcc < 2:1770500/93‑1 (MQ=255)
ggTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGGATTGCGATCCt > 2:3077904/1‑93 (MQ=255)
ggTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCt > 1:4829196/1‑93 (MQ=255)
gTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTc < 2:5720673/93‑1 (MQ=255)
gACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCgg < 1:1277197/93‑1 (MQ=255)
gACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCgg < 1:1368212/93‑1 (MQ=255)
aCGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCggg > 2:1866184/1‑93 (MQ=255)
aCGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCggg < 2:5528286/93‑1 (MQ=255)
cGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGa < 1:1230214/93‑1 (MQ=255)
tggctgCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGCGTa > 2:1020487/1‑93 (MQ=255)
tggctgCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTa > 2:1250438/1‑93 (MQ=255)
tggctgCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTa < 1:783386/93‑1 (MQ=255)
tgCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGgt < 1:1006685/93‑1 (MQ=255)
aaaaCTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATg > 2:2952217/1‑93 (MQ=255)
aaaaCTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGCGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGGGTAATg > 1:4449337/1‑93 (MQ=255)
aaaCTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATgg > 2:6115123/1‑93 (MQ=255)
aaCTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATggg > 1:5359670/1‑93 (MQ=255)
aaCTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATggg > 2:4241531/1‑93 (MQ=255)
aCTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGc > 2:1639276/1‑93 (MQ=255)
cTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGcc < 1:5858802/93‑1 (MQ=255)
tgtgGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCt < 1:5527755/93‑1 (MQ=255)
tgGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGa < 2:3755612/93‑1 (MQ=255)
ggCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGAt < 2:1429555/93‑1 (MQ=255)
cACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGAtgc < 2:1073274/93‑2 (MQ=255)
cACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGAtgc < 1:2974519/93‑2 (MQ=255)
cACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGAtgc < 2:209364/93‑2 (MQ=255)
cACGAACCGGTACCGCCGCGTCACTGATGTGGGGTGGTGTTCATTATGGGCGGTATTGCGATCCTCGGGATTACGTTGTAATGGGCCTGAtgc < 2:657942/93‑2 (MQ=255)
cGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCgg < 1:3162158/93‑1 (MQ=255)
gAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCggg < 1:3451689/93‑1 (MQ=255)
gAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCggg < 2:721297/93‑1 (MQ=255)
aaCCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCgggg > 2:21533/1‑93 (MQ=255)
aaCCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCgggg > 1:2025684/1‑93 (MQ=255)
aaCCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCgggg < 1:1943405/93‑1 (MQ=255)
aaCCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTACTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCgggg > 1:3377730/1‑93 (MQ=255)
aCCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGa < 1:3771612/93‑1 (MQ=255)
aCCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGa < 1:4347254/93‑1 (MQ=255)
cGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGatt < 2:4882965/93‑1 (MQ=255)
ggTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGatta < 2:3939607/93‑1 (MQ=255)
ggTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGatta < 2:4478593/93‑1 (MQ=255)
ggTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGatta < 2:501006/93‑1 (MQ=255)
ggTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGatta > 1:2115874/1‑93 (MQ=255)
aTCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTc > 2:454122/1‑93 (MQ=255)
tCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCa < 1:1416885/93‑1 (MQ=255)
tCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCa < 1:3548295/93‑1 (MQ=255)
tCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCa < 1:5476817/93‑1 (MQ=255)
tCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCa > 2:5225108/1‑93 (MQ=255)
cgccgcGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAg < 2:4125341/93‑1 (MQ=255)
cgccgcGTCACTGGTGTGGGGTAGTGTTCATTATGGGCGGCACTGCGATCCTCGGGTGTGCGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAg < 2:5423523/93‑1 (MQ=255)
gccgcGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGc < 2:2518643/93‑1 (MQ=255)
gccgcGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGc < 1:5597181/93‑1 (MQ=255)
gcgTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTc > 2:1401832/1‑93 (MQ=255)
gcgTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTc > 2:5617501/1‑93 (MQ=255)
tCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCatt > 1:2912145/1‑93 (MQ=255)
cACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCatta > 2:6030240/1‑93 (MQ=255)
aCTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCattat < 1:4078041/93‑1 (MQ=255)
aCTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCattat > 1:365809/1‑93 (MQ=255)
aCTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCattat > 1:6223821/1‑93 (MQ=255)
cTGGTGTGGTGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCattatt < 1:743884/93‑1 (MQ=255)
cTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCattatt < 1:6197161/93‑1 (MQ=255)
gtgtGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGcc > 1:6162706/1‑93 (MQ=255)
tgtgGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCt > 2:2926524/1‑93 (MQ=255)
gtgGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCTc < 2:1009057/93‑1 (MQ=255)
gtgGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCTc < 1:3105271/93‑1 (MQ=255)
ggggTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCTCAg > 1:5292150/1‑93 (MQ=255)
ggggTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCTCAg > 1:5810694/1‑93 (MQ=255)
gggTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCTCAGt > 2:1776446/1‑93 (MQ=255)
gggTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCTCAGt < 2:1994185/93‑1 (MQ=255)
gggTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCTCAGt < 1:6260783/93‑1 (MQ=255)
tGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCTCAGTTgc < 2:4591930/93‑1 (MQ=255)
tGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCTCAGTTgc < 2:5780531/93‑1 (MQ=255)
gTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCTCAGTTGCGCaa > 1:2065773/1‑93 (MQ=255)
ttCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCTCAGTTGCGCAAt > 1:3959587/1‑93 (MQ=255)
ttCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCTCAGTTGCGCAAt > 1:258368/1‑93 (MQ=255)
tCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCTCAGTTGCGCAAtt < 1:421938/93‑1 (MQ=255)
cATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCTCAGTTGCGCAATTa < 2:1467118/93‑1 (MQ=255)
cATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCTCAGTTGCGCAATTa < 2:5920849/93‑1 (MQ=255)
cATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCTCAGTTGCGCAATTa < 1:3688/93‑1 (MQ=255)
attGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCTCAGTTGCGCAATTAAGcc < 1:2766413/93‑1 (MQ=255)
ttGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCTCAGTTGCGCAATTAAGCCt < 2:5829274/93‑1 (MQ=255)
ttGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCTCAGTTGCGCAATTAAGCCt < 1:2804593/93‑1 (MQ=255)
ttGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCTCAGTTGCGCAATTAAGCCt > 2:2610938/1‑93 (MQ=255)
ttGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCTCAGTTGCGCAATTAAGCCt > 2:2834089/1‑93 (MQ=255)
tGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGTGATTATTCAGCGTCATTATTGCCTCAGTTGCGCAATTAAGCCTg < 1:602318/93‑1 (MQ=255)
ggcggcATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCTCAGTTGCGCAATTAAGCCTgg > 1:492573/1‑93 (MQ=255)
gcggcATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCTCAGTTGCGCAATTAAGCCTggg < 2:1938614/93‑1 (MQ=255)
gcggcATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCTCAGTTGCGCAATTAAGCCTggg > 1:275286/1‑93 (MQ=255)
cggcATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCTCAGTTGCGCAATTAAGCCTGGGt < 1:1833900/93‑1 (MQ=255)
cggcATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCTCAGTTGCGCAATTAAGCCTGGGt < 2:3202575/93‑1 (MQ=255)
cATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCTCAGTTGCGCAATTAAGCCTGGGtttt < 2:4760525/93‑1 (MQ=255)
cATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCTCAGTTGCGCAATTAAGCCTGGGtttt < 2:1719148/93‑1 (MQ=255)
ttGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCTCAGTTGCGCAATTAAGCCTGGGTTTTgc < 1:2045544/93‑1 (MQ=255)
ttGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCTCAGTTGCGCAATTAAGCCTGGGTTTTgc > 2:810792/1‑93 (MQ=255)
ttGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCTCAGTTGCGCAATTAAGCCTGGGTTTTgc > 2:5112414/1‑93 (MQ=255)
ttGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCTCAGTTGCGCAATTAAGCCTGGGTTTTgc < 1:4694051/93‑1 (MQ=255)
ttGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCTCAGTTGCGCAATTAAGCCTGGGTTTTgc < 1:5635641/93‑1 (MQ=255)
|
TCTGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGCGTTCATTATTGGCGGCATTGTGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGTGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCTCAGTTGCGCAATTAAGCCTGGGTTTTGC > NC_000913/2370800‑2370979
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
TTGTCTGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGCGTTCATTATTGGCGGCATTGTGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGTGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCTCAGTTGCGCAATTAAGCCTGGGTTTTGCGGC > NC_000913/2370797‑2370982
|
TTGTGTGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGC > SRR4302533.6036408/1‑94 (MQ=60)
TTGTCTGGGAGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGC > SRR4302533.738518/1‑94 (MQ=60)
TGTCGGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCG < SRR4302533.6308108/94‑1 (MQ=60)
CTGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATC > SRR4302533.4584079/1‑94 (MQ=60)
TGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCC > SRR4302533.3894516/1‑94 (MQ=60)
GGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCT < SRR4302533.3822451/94‑1 (MQ=60)
GGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCT > SRR4302533.4858462/1‑94 (MQ=60)
GGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCT < SRR4302533.2964820/94‑1 (MQ=60)
TGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGG < SRR4302533.1423034/94‑1 (MQ=60)
TGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGG < SRR4302533.4050933/94‑1 (MQ=60)
GACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGTGATCCTCGGG > SRR4302533.4666130/1‑94 (MQ=60)
GACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGG > SRR4302533.550275/1‑94 (MQ=60)
GACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGG < SRR4302533.1376439/94‑1 (MQ=60)
GACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGG < SRR4302533.1284873/94‑1 (MQ=60)
CGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAG < SRR4302533.1237577/94‑1 (MQ=60)
GCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGT < SRR4302533.6138962/94‑1 (MQ=60)
GCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGT > SRR4302533.2169811/1‑94 (MQ=60)
TGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTAC < SRR4302533.787993/94‑1 (MQ=60)
TGGCTGAAGTAAAACTTTGGCACGAACCGGTATCGCTGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTAC < SRR4302533.2899009/94‑1 (MQ=60)
GGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACG < SRR4302533.2724057/94‑1 (MQ=60)
GCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGG < SRR4302533.838384/94‑1 (MQ=60)
TGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTG < SRR4302533.1012576/94‑1 (MQ=60)
TGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTG > SRR4302533.1890131/1‑94 (MQ=60)
CAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTA < SRR4302533.1756732/94‑1 (MQ=60)
CAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTA > SRR4302533.6219361/1‑94 (MQ=60)
TAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATG < SRR4302533.4858205/94‑1 (MQ=60)
TAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGCGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGGGTAATG > SRR4302533.4476245/1‑94 (MQ=60)
AAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGG > SRR4302533.5391854/1‑94 (MQ=60)
AACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGC > SRR4302533.2061628/1‑94 (MQ=60)
ACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCC < SRR4302533.1848135/94‑1 (MQ=60)
CTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCT < SRR4302533.777694/94‑1 (MQ=60)
CTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCT < SRR4302533.5894221/94‑1 (MQ=60)
TGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTG < SRR4302533.5520444/94‑1 (MQ=60)
TGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTG > SRR4302533.3452732/1‑94 (MQ=60)
TGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTG < SRR4302533.5561125/94‑1 (MQ=60)
TGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTG > SRR4302533.3019929/1‑94 (MQ=60)
CACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCG > SRR4302533.5821342/1‑94 (MQ=60)
CACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCG < SRR4302533.2992719/94‑1 (MQ=60)
CACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCG > SRR4302533.6288393/1‑94 (MQ=60)
CACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGGACGGTGTAATGGGCCTGATGCG > SRR4302533.5345241/1‑94 (MQ=60)
ACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGG < SRR4302533.5573845/94‑1 (MQ=60)
CGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGG < SRR4302533.3181619/94‑1 (MQ=60)
GAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGG > SRR4302533.4628914/1‑94 (MQ=60)
GAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGG < SRR4302533.3473002/94‑1 (MQ=60)
GAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGG > SRR4302533.129471/1‑94 (MQ=60)
GAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGG > SRR4302533.2038190/1‑94 (MQ=60)
GAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTACTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGG > SRR4302533.3398583/1‑94 (MQ=60)
AACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGA < SRR4302533.1955260/94‑1 (MQ=60)
AACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGA < SRR4302533.3266079/94‑1 (MQ=60)
ACCGGTATCTCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGAT < SRR4302533.630198/94‑1 (MQ=60)
ACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGAT < SRR4302533.4373461/94‑1 (MQ=60)
ACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGAT < SRR4302533.3794733/94‑1 (MQ=60)
CCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATT < SRR4302533.4491896/94‑1 (MQ=60)
CGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTA > SRR4302533.2128923/1‑94 (MQ=60)
CGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTA < SRR4302533.3146698/94‑1 (MQ=60)
GGTATCGCCGCGTCACTGGTGTNGGGTGGTGTTCATTNTTGGCGGCATTGCNATNCTCGGGAGNACGGTGTANGNGGCCTNANGCNGNGNTNAT > SRR4302533.973216/1‑94 (MQ=60)
GGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTAT > SRR4302533.4080167/1‑94 (MQ=60)
GTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATT < SRR4302533.2778147/94‑1 (MQ=60)
ATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCA < SRR4302533.4239428/94‑1 (MQ=60)
TCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAG < SRR4302533.1425457/94‑1 (MQ=60)
TCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAG < SRR4302533.353302/94‑1 (MQ=60)
TCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAG < SRR4302533.5509830/94‑1 (MQ=60)
TCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAG < SRR4302533.3570162/94‑1 (MQ=60)
CGCCGCGTCACTGGTGTGGGGAGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGGACGGGGTAGTGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGC > SRR4302533.1403174/1‑94 (MQ=60)
GCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCG < SRR4302533.5630998/94‑1 (MQ=60)
CGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTATGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTC > SRR4302533.357577/1‑94 (MQ=60)
CGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTC > SRR4302533.2174872/1‑94 (MQ=60)
GCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCA > SRR4302533.2001600/1‑94 (MQ=60)
CGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCAT < SRR4302533.3685777/94‑1 (MQ=60)
GTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCATT > SRR4302533.2930019/1‑94 (MQ=60)
CACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCATTAT > SRR4302533.6261118/1‑94 (MQ=60)
CACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCATTAT < SRR4302533.4951125/94‑1 (MQ=60)
CACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCATTAT < SRR4302533.3586695/94‑1 (MQ=60)
CACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCATTAT > SRR4302533.368025/1‑94 (MQ=60)
ACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCATTATT < SRR4302533.5915335/94‑1 (MQ=60)
ACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCATTATT > SRR4302533.2079727/1‑94 (MQ=60)
ACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCATTATT < SRR4302533.4102867/94‑1 (MQ=60)
CTGGTGTGGTGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCATTATTG < SRR4302533.748262/94‑1 (MQ=60)
CTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCATTATTG < SRR4302533.6234340/94‑1 (MQ=60)
GGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCC > SRR4302533.6199760/1‑94 (MQ=60)
TGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCTC < SRR4302533.3950524/94‑1 (MQ=60)
GTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCTCA < SRR4302533.3124360/94‑1 (MQ=60)
TGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCTCAG > SRR4302533.5323832/1‑94 (MQ=60)
TGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCTCAG > SRR4302533.5845781/1‑94 (MQ=60)
GGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCTCAGT > SRR4302533.3717146/1‑94 (MQ=60)
GGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCTCAGTT > SRR4302533.5475271/1‑94 (MQ=60)
GGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCTCAGTT < SRR4302533.6298214/94‑1 (MQ=60)
GTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCTCAGTTGC > SRR4302533.635754/1‑94 (MQ=60)
TGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCTCAGTTGCG < SRR4302533.1028824/94‑1 (MQ=60)
TGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCTCAGTTGCG > SRR4302533.1264327/1‑94 (MQ=60)
GGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGGGAACGGGGTAATGGGCCTGTTGCGGGGATTATCCAGCGCCTTTATTGCTTCAGTTGGGC > SRR4302533.3590082/1‑94 (MQ=30)
GGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCTCAGTTGCGC > SRR4302533.2047038/1‑94 (MQ=60)
GTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCTCAGTTGCGCA > SRR4302533.4441984/1‑94 (MQ=60)
GTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCTCAGTTGCGCA > SRR4302533.2792240/1‑94 (MQ=60)
TGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCTCAGTTGCGCAA > SRR4302533.2078504/1‑94 (MQ=60)
GTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCTCAGTTGCGCAAT > SRR4302533.5035930/1‑94 (MQ=60)
GTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCTCAGTTGCGCAAT > SRR4302533.259941/1‑94 (MQ=60)
GTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCTCAGTTGCGCAAT > SRR4302533.3983716/1‑94 (MQ=60)
TTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCTCAGTTGCGCAATT > SRR4302533.6020360/1‑94 (MQ=60)
TCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCTCAGTTGCGCAATTA < SRR4302533.424462/94‑1 (MQ=60)
CATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCTCAGTTGCGCAATTAA < SRR4302533.3720/94‑1 (MQ=60)
ATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCTCAGTTGCGCAATTAAG > SRR4302533.2945481/1‑94 (MQ=60)
TATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCTCAGTTGCGCAATTAAGCC > SRR4302533.5848582/1‑94 (MQ=60)
ATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCTCAGTTGCGCAATTAAGCCT < SRR4302533.2783372/94‑1 (MQ=60)
TTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCTCAGTTGCGCAATTAAGCCTG < SRR4302533.2821853/94‑1 (MQ=60)
TGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGTGATTATTCAGCGTCATTATTGCCTCAGTTGCGCAATTAAGCCTGG < SRR4302533.605859/94‑1 (MQ=60)
TGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCTCAGTTGCGCAATTAAGCCTGG > SRR4302533.495517/1‑94 (MQ=60)
GGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCTCAGTTGCGCAATTAAGCCTGGG > SRR4302533.276961/1‑94 (MQ=60)
CGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCTCAGTTGCGCAATTAAGCCTGGGTT < SRR4302533.1845094/94‑1 (MQ=60)
CGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCTCAGTTGCGCAATTAAGCCTGGGTT < SRR4302533.5654203/94‑1 (MQ=60)
GGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCTCAGTTGCGCAATTAAGCCTGGGTTT < SRR4302533.6252334/94‑1 (MQ=60)
GGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCTCAGTTGCGCAATTAAGCCTGGGTTT > SRR4302533.4272098/1‑94 (MQ=60)
TTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCTCAGTTGCGCAATTAAGCCTGGGTTTTGCG < SRR4302533.5669721/94‑1 (MQ=60)
TTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCTCAGTTGCGCAATTAAGCCTGGGTTTTGCG < SRR4302533.4722495/94‑1 (MQ=60)
TTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCTCAGTTGCGCAATTAAGCCTGGGTTTTGCG < SRR4302533.2058154/94‑1 (MQ=60)
GCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCTCAGTTGCGCAATTAAGCCTGGGTTTTGCGGC < SRR4302533.6216465/94‑1 (MQ=60)
|
TTGTCTGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGCGTTCATTATTGGCGGCATTGTGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGTGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCTCAGTTGCGCAATTAAGCCTGGGTTTTGCGGC > NC_000913/2370797‑2370982
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
