Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1624 |
250.6 |
12620048 |
98.0% |
12367647 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,600,037 |
(C)7→6 |
coding (200/2019 nt) |
hyfB → |
hydrogenase 4 membrane subunit |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,600,031 | 0 | C | . | 94.4%
| 721.9
/ 26.6
| 178 | coding (194/2019 nt) | hyfB | hydrogenase 4 membrane subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (2/8); new base . (67/101); total (69/109) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.20e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.36e-01 |
Only 100 of 202 total aligned reads displayed.
TTCCGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGCCCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTT > NC_000913/2599939‑2600119
|
ttCCGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTCTAGTCGCCCGTTTTGc > 1:6011633/1‑93 (MQ=255)
tCCGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGcc < 2:1677983/93‑1 (MQ=255)
tCCGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGcc < 2:3122425/93‑1 (MQ=255)
tCCGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGcc < 2:4802655/93‑1 (MQ=255)
ggCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGccccc > 1:3758496/1‑93 (MQ=255)
gCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGcccccc > 2:5147183/1‑93 (MQ=255)
cATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGcccccct < 1:1635025/93‑2 (MQ=255)
cATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGcccccct < 2:5373445/93‑2 (MQ=255)
aTCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGcccccctt < 1:4199142/93‑3 (MQ=255)
tCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGCCCCCCttt > 1:5984336/1‑93 (MQ=255)
cacaTCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGCCCCCCtttt < 2:4962529/93‑1 (MQ=255)
cacaTCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGCCCCCCtttt < 1:5002863/93‑1 (MQ=255)
acaTCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGCCCCCCttttg < 1:1450053/93‑2 (MQ=255)
acaTCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGCCCCCCttttg > 2:4718741/1‑92 (MQ=255)
caTCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGa > 2:5678644/1‑93 (MQ=255)
aTCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGaa > 1:5855758/1‑93 (MQ=255)
tCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAAt > 1:1373791/1‑93 (MQ=255)
tCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAAt > 1:273014/1‑93 (MQ=255)
tCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAAt < 2:3835524/93‑1 (MQ=255)
gCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAAttt > 2:2020830/1‑93 (MQ=255)
tggtggGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGc < 2:5607903/93‑1 (MQ=255)
tggtggGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGc < 2:2587374/93‑1 (MQ=255)
ggtggGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGcc > 1:116624/1‑93 (MQ=255)
tggGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGa < 2:3556918/93‑1 (MQ=255)
tggGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGa < 1:2016373/93‑1 (MQ=255)
ggcggcGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGAtt < 1:625781/93‑1 (MQ=255)
gcggcgTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGAttt < 1:3330955/93‑1 (MQ=255)
gcggcgTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGAttt < 1:1021477/93‑1 (MQ=255)
gcggcgTGATTGGCATCATCAGCGGAAGTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGAttt < 1:1995675/93‑1 (MQ=255)
gcgTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAAc > 1:4602160/1‑93 (MQ=255)
gcgTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAAc < 1:2679520/93‑1 (MQ=255)
gcgTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAAc > 2:5095494/1‑93 (MQ=255)
gcgTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAAc < 1:1946229/93‑1 (MQ=255)
cgTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAAcc < 2:1654463/93‑1 (MQ=255)
gTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAAccc < 1:5380996/93‑1 (MQ=255)
gATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTg < 2:2391639/93‑1 (MQ=255)
aTTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGc < 2:4255520/93‑1 (MQ=255)
aTTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGc < 2:5462286/93‑1 (MQ=255)
aTTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGc > 2:872846/1‑93 (MQ=255)
ttGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCg < 2:1130727/93‑1 (MQ=255)
catcatCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATg > 2:5784737/1‑93 (MQ=255)
atcatcAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATgg < 1:1599741/93‑1 (MQ=255)
atcatcAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATgg < 2:3801217/93‑1 (MQ=255)
atcatcAGCGAAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATgg < 2:1764098/93‑1 (MQ=255)
catcaGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGAt < 1:4527392/93‑1 (MQ=255)
atcaGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATa > 2:318/1‑93 (MQ=255)
atcaGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATa < 2:118105/93‑1 (MQ=255)
aGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGcc < 1:3288869/93‑1 (MQ=255)
ggAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCctct < 2:3617015/93‑1 (MQ=255)
gAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCtctc < 1:4475633/93‑1 (MQ=255)
gAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCtctc < 1:4920083/93‑1 (MQ=255)
aaTTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCg < 2:398662/93‑1 (MQ=255)
aaTTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCg > 2:1575426/1‑93 (MQ=255)
tACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCa > 1:757501/1‑93 (MQ=255)
cGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCAtt < 1:2935407/93‑1 (MQ=255)
gCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCAttt > 1:3309381/1‑93 (MQ=255)
gCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCAttt < 1:5549173/93‑1 (MQ=255)
cAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTa < 1:126000/93‑1 (MQ=255)
aaTTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTAt > 2:3406018/1‑93 (MQ=255)
aaTTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTAt > 2:2503822/1‑93 (MQ=255)
aTTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATg < 2:3871625/93‑1 (MQ=255)
aTTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATg > 1:4022364/1‑93 (MQ=255)
aTTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATg > 2:2425452/1‑93 (MQ=255)
ttACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATgg < 2:5524743/93‑1 (MQ=255)
cATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGc < 1:2481527/93‑1 (MQ=255)
tGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTg > 2:2270632/1‑93 (MQ=255)
tGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTg < 1:914119/93‑1 (MQ=255)
gCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTgg > 2:2287845/1‑93 (MQ=255)
cTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGt < 1:3434529/93‑1 (MQ=255)
cTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGt > 2:6233230/1‑93 (MQ=255)
ggTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTa > 2:5628628/1‑93 (MQ=255)
ggTGTAACTCTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCAGCATTTATGGTGCTGGTTa < 2:652927/93‑1 (MQ=255)
gtgtAGCTTTAGTCGCCAGTGTTG‑CCCCGCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTAt < 1:1711252/93‑1 (MQ=255)
tgtAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTAtc < 1:5596531/93‑1 (MQ=255)
tgtAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTAtc > 1:2538993/1‑93 (MQ=255)
tgtAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTAtc > 2:3094412/1‑93 (MQ=255)
tAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTAtctc > 2:3265525/1‑93 (MQ=255)
aCTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCt < 1:2191728/93‑1 (MQ=255)
cTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCtt < 1:3884002/93‑1 (MQ=255)
tttAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGGGAATGGAAAGCCTCTCGGCATTTTTGGGGTTGGTTTTTTCCttc > 1:1138671/1‑92 (MQ=255)
tttAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTACGGTGCTGGTTATCTCCTTg < 2:6080205/93‑1 (MQ=255)
ttAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGc < 1:5217044/93‑1 (MQ=255)
ttAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGc < 1:3542753/93‑1 (MQ=255)
ttAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGc > 2:1332175/1‑93 (MQ=255)
ttAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGc > 2:1592572/1‑93 (MQ=255)
tAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCt < 2:2646436/93‑1 (MQ=255)
tAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCt < 1:1543740/93‑1 (MQ=255)
gTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCtgg < 1:5580315/93‑1 (MQ=255)
gTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCtgg < 2:5752669/93‑1 (MQ=255)
cGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCtggtg < 1:2818931/93‑1 (MQ=255)
cccGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCtggtggt < 2:1666887/93‑1 (MQ=255)
cccGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCtggtggt > 1:4676852/1‑93 (MQ=255)
ccGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCtggtggtg < 2:209182/93‑1 (MQ=255)
ccGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCtggtggtg > 2:2969790/1‑93 (MQ=255)
gTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCCTTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTggtggtggt > 2:708619/1‑93 (MQ=255)
gTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTggtggtggt > 2:5495225/1‑93 (MQ=255)
ttttG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGtt < 1:1764019/93‑1 (MQ=255)
ttttG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGtt > 1:210290/1‑93 (MQ=255)
ttttG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGtt < 1:4804149/93‑1 (MQ=255)
ttttG‑CCCCCCTTTTGAATGTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGtt < 1:6021137/93‑1 (MQ=255)
|
TTCCGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGCCCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTT > NC_000913/2599939‑2600119
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGCCCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTA > NC_000913/2599944‑2600130
|
GCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGCCCCCCT > SRR4302533.2867819/1‑94 (MQ=60)
CATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGCCCCCCTT > SRR4302533.5615644/1‑94 (MQ=60)
CATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGCCCCCCTT < SRR4302533.5970338/94‑1 (MQ=60)
CATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGCCCCCCTT < SRR4302533.1644927/94‑1 (MQ=60)
ATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGCCCCCCTTT < SRR4302533.4224554/94‑1 (MQ=60)
ATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGCCCCCCTTT > SRR4302533.333374/1‑94 (MQ=60)
ATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGCCCCCCTTT > SRR4302533.6020578/1‑94 (MQ=60)
TCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGCCCCCCTTTT < SRR4302533.3997514/94‑1 (MQ=60)
CACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTG < SRR4302533.5213413/94‑1 (MQ=60)
CACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTG < SRR4302533.5033186/94‑1 (MQ=60)
ACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGA < SRR4302533.1458803/94‑1 (MQ=60)
CATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAA > SRR4302533.5891159/1‑94 (MQ=60)
ATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAAT > SRR4302533.4515703/1‑94 (MQ=60)
ATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAAT > SRR4302533.1382055/1‑94 (MQ=60)
ATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAAT > SRR4302533.274675/1‑94 (MQ=60)
CTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGC < SRR4302533.4623635/94‑1 (MQ=60)
CTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGC < SRR4302533.4839573/94‑1 (MQ=60)
TGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCC > SRR4302533.117367/1‑94 (MQ=60)
TGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGAT < SRR4302533.3479465/94‑1 (MQ=60)
TGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGAT < SRR4302533.2028795/94‑1 (MQ=60)
GGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTT < SRR4302533.629456/94‑1 (MQ=60)
GGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTT > SRR4302533.2500196/1‑94 (MQ=60)
GCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTA < SRR4302533.1027479/94‑1 (MQ=60)
GCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTA < SRR4302533.3351545/94‑1 (MQ=60)
GCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAAGTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTA < SRR4302533.2007930/94‑1 (MQ=60)
CGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAA > SRR4302533.4242522/1‑94 (MQ=60)
CGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAA < SRR4302533.1813092/94‑1 (MQ=60)
GGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAAC > SRR4302533.4630043/1‑94 (MQ=60)
GGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAAC > SRR4302533.3858410/1‑94 (MQ=60)
GCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACC < SRR4302533.2695944/94‑1 (MQ=60)
GCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACC < SRR4302533.1958095/94‑1 (MQ=60)
GTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCT > SRR4302533.1392770/1‑94 (MQ=60)
GTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCT < SRR4302533.5413325/94‑1 (MQ=60)
ATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCG < SRR4302533.499410/94‑1 (MQ=60)
GCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATG < SRR4302533.4677877/94‑1 (MQ=60)
CATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGG > SRR4302533.6181183/1‑94 (MQ=60)
CATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGG < SRR4302533.3386664/94‑1 (MQ=60)
CATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGG > SRR4302533.4074096/1‑94 (MQ=60)
ATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGA > SRR4302533.6050906/1‑94 (MQ=60)
ATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGA < SRR4302533.1609425/94‑1 (MQ=60)
TCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGAT < SRR4302533.1477671/94‑1 (MQ=60)
TCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGAT > SRR4302533.6318392/1‑94 (MQ=60)
CATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATA < SRR4302533.4554804/94‑1 (MQ=60)
ATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAG < SRR4302533.4777714/94‑1 (MQ=60)
TCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGC > SRR4302533.1118891/1‑94 (MQ=60)
CAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCC < SRR4302533.2126623/94‑1 (MQ=60)
AGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCT < SRR4302533.3309172/94‑1 (MQ=60)
CGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCT > SRR4302533.3312381/1‑94 (MQ=60)
GAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCG < SRR4302533.4502695/94‑1 (MQ=60)
GAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCG < SRR4302533.4949887/94‑1 (MQ=60)
TTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCA > SRR4302533.761960/1‑94 (MQ=60)
CGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTT < SRR4302533.2953352/94‑1 (MQ=60)
CGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTT > SRR4302533.3329817/1‑94 (MQ=60)
GCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTA < SRR4302533.5582682/94‑1 (MQ=60)
GCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTA > SRR4302533.2003708/1‑94 (MQ=60)
CAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTAT < SRR4302533.126787/94‑1 (MQ=60)
AATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATG > SRR4302533.4046856/1‑94 (MQ=60)
CATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCT < SRR4302533.2496831/94‑1 (MQ=60)
CATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGAGAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCT < SRR4302533.1202027/94‑1 (MQ=60)
CATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTATG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAGCCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCT < SRR4302533.5606486/94‑1 (MQ=60)
TGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGG < SRR4302533.919494/94‑1 (MQ=60)
GCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGT < SRR4302533.1658922/94‑1 (MQ=60)
CTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTT > SRR4302533.2014763/1‑94 (MQ=60)
CTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTT < SRR4302533.3455745/94‑1 (MQ=60)
TGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTA < SRR4302533.2716412/94‑1 (MQ=60)
GGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTAT < SRR4302533.6040337/94‑1 (MQ=60)
GTGTAGCTTTAGTCGCCAGTGTTG‑CCCCGCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATC < SRR4302533.1721621/94‑1 (MQ=60)
GTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATC > SRR4302533.2554625/1‑94 (MQ=60)
TGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCT < SRR4302533.5630345/94‑1 (MQ=60)
TGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCT < SRR4302533.5703244/94‑1 (MQ=60)
GTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTC < SRR4302533.795289/94‑1 (MQ=60)
GTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTC < SRR4302533.5514369/94‑1 (MQ=60)
AACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCT > SRR4302533.1589855/1‑94 (MQ=60)
AACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCT < SRR4302533.2043481/94‑1 (MQ=60)
ACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTT < SRR4302533.1161419/94‑1 (MQ=60)
ACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTT < SRR4302533.2205233/94‑1 (MQ=60)
CTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGGGAATGGAAAGCCTCTCGGCATTTttggggttggttttttccttc > SRR4302533.1145447/1‑73 (MQ=60)
CTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTG < SRR4302533.3907700/94‑1 (MQ=60)
TTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCT < SRR4302533.5248452/94‑1 (MQ=60)
TTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCT < SRR4302533.3564587/94‑1 (MQ=60)
TAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTG < SRR4302533.2663378/94‑1 (MQ=60)
TAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTG < SRR4302533.1553038/94‑1 (MQ=60)
GTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGT < SRR4302533.5614038/94‑1 (MQ=60)
CGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGG < SRR4302533.2836277/94‑1 (MQ=60)
GCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGT > SRR4302533.4705196/1‑94 (MQ=60)
CCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGG < SRR4302533.2453559/94‑1 (MQ=60)
GTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTTCTTGCTGGTGGTGGTT > SRR4302533.529414/1‑94 (MQ=60)
GTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTT > SRR4302533.211618/1‑94 (MQ=60)
TTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTT > SRR4302533.1029172/1‑94 (MQ=60)
TTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTT < SRR4302533.1335303/94‑1 (MQ=60)
TTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTT < SRR4302533.173675/94‑1 (MQ=60)
TTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTT < SRR4302533.4833242/94‑1 (MQ=60)
TTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTT < SRR4302533.1774760/94‑1 (MQ=60)
TTTTG‑CCCCCCTTTTGAATGTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTT < SRR4302533.6057623/94‑1 (MQ=60)
TTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTG < SRR4302533.3496600/94‑1 (MQ=60)
TTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTG < SRR4302533.4317014/94‑1 (MQ=60)
TTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTG < SRR4302533.4169135/94‑1 (MQ=60)
tgCCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTT < SRR4302533.4854790/92‑1 (MQ=60)
tgCCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTT > SRR4302533.885226/3‑94 (MQ=60)
tgCCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTT > SRR4302533.2288658/3‑94 (MQ=60)
CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCT > SRR4302533.3117265/1‑94 (MQ=60)
CTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTA < SRR4302533.5644982/94‑1 (MQ=60)
CTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTA < SRR4302533.2730668/94‑1 (MQ=60)
CTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTA < SRR4302533.5608080/94‑1 (MQ=60)
|
GCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGCCCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTA > NC_000913/2599944‑2600130
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
