Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1624 |
250.6 |
12620048 |
98.0% |
12367647 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,751,091 |
G→C |
A426P (GCT→CCT) |
recN → |
RecN |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,751,091 | 0 | G | C | 99.5%
| 664.5
/ NA
| 203 | A426P (GCT→CCT) | recN | RecN |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base C (95/107); minor base A (1/0); total (96/107) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.73e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 207 total aligned reads displayed.
GATGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGGCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAACCCCGGC > NC_000913/2751001‑2751179
|
atGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTa < 1:2933112/93‑1 (MQ=255)
tGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTAt < 2:2901629/93‑1 (MQ=255)
tGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTAt < 1:4810503/93‑1 (MQ=255)
gTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTAtt < 2:4042316/93‑1 (MQ=255)
ttAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTg > 1:5518855/1‑93 (MQ=255)
tAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGc < 2:1983285/93‑1 (MQ=255)
aaTTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCa < 2:1177107/93‑1 (MQ=255)
aaTTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCa < 2:1038034/93‑1 (MQ=255)
aaTTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTACTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCa > 1:3388886/1‑93 (MQ=255)
aTTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCaa < 2:2064983/93‑1 (MQ=255)
tttGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCaaa < 2:6113939/93‑1 (MQ=255)
tttGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCaaa < 2:1779958/93‑1 (MQ=255)
tGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGt < 1:779250/93‑1 (MQ=255)
gACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTc < 2:5734404/93‑1 (MQ=255)
gACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTc < 1:3591442/93‑1 (MQ=255)
aCGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCg > 2:817449/1‑93 (MQ=255)
cGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGc < 2:4401732/93‑1 (MQ=255)
gAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCa < 2:5684905/93‑1 (MQ=255)
aGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCAt < 2:5451377/93‑1 (MQ=255)
gCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATc > 2:3166547/1‑93 (MQ=255)
gCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATc < 2:594799/93‑1 (MQ=255)
tCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCgg > 2:2075748/1‑93 (MQ=255)
tCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGGATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCgg > 2:1675165/1‑93 (MQ=255)
cACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCGAAAGTCGCATCCggt < 2:3953381/93‑1 (MQ=255)
cACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGCCGCATCCggt < 2:3854651/93‑1 (MQ=255)
ccTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCggtgg < 2:2329952/93‑1 (MQ=255)
cTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCggtggt > 1:2106085/1‑93 (MQ=255)
cTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCggtggt < 2:45028/93‑1 (MQ=255)
gggCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGa < 2:286306/93‑1 (MQ=255)
aCGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTccc < 2:5307466/93‑1 (MQ=255)
tGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCAt < 1:4698002/93‑1 (MQ=255)
gCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCGTCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATc > 1:2545317/1‑93 (MQ=255)
gCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATc < 1:4228219/93‑1 (MQ=255)
ccGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGACTTGTCCCGCATCg < 2:6190685/93‑1 (MQ=255)
ccGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCg > 1:258161/1‑93 (MQ=255)
ccGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCg > 1:969244/1‑93 (MQ=255)
cGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGc < 2:5816864/93‑1 (MQ=255)
cGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGc < 1:369123/93‑1 (MQ=255)
gATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCa > 1:2727210/1‑93 (MQ=255)
gATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCa > 1:3417603/1‑93 (MQ=255)
aTCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCAc > 1:531887/1‑93 (MQ=255)
tCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACt > 1:2854892/1‑93 (MQ=255)
tCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACt < 2:4199214/93‑1 (MQ=255)
tCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACt < 1:6204370/93‑1 (MQ=255)
tCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACt > 1:68957/1‑93 (MQ=255)
cGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTg > 2:4655214/1‑93 (MQ=255)
cGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTg < 1:147784/93‑1 (MQ=255)
gTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTgg > 1:1056126/1‑93 (MQ=255)
gTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTgg > 2:5192244/1‑93 (MQ=255)
gTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCACACTgg < 2:3420115/93‑1 (MQ=255)
tATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGc > 2:2665119/1‑93 (MQ=255)
tATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGc < 2:6237706/93‑1 (MQ=255)
aTTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCGGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCa > 2:3461607/1‑93 (MQ=255)
aTTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCa < 1:564812/93‑1 (MQ=255)
aTTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCa < 2:3793768/93‑1 (MQ=255)
ttGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTgccga > 1:1720410/1‑89 (MQ=255)
ttGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCaa < 1:4454798/93‑1 (MQ=255)
tGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAAt < 2:1615120/93‑1 (MQ=255)
tGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAAt > 1:4414498/1‑93 (MQ=255)
tGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAAt < 2:2359127/93‑1 (MQ=255)
tGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAAt < 1:3843752/93‑1 (MQ=255)
gAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATc < 1:1001326/93‑1 (MQ=255)
gAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATc > 1:5862086/1‑93 (MQ=255)
gTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCa < 2:4587321/93‑1 (MQ=255)
tttCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAg > 1:3528235/1‑93 (MQ=255)
tttCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAg > 1:2296830/1‑93 (MQ=255)
tCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGt < 1:2976152/93‑1 (MQ=255)
tCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGt > 1:1816439/1‑93 (MQ=255)
gggTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGtca > 2:4717161/1‑93 (MQ=255)
ggTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGtcat > 2:2814695/1‑93 (MQ=255)
ggTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGtcat > 1:5063731/1‑93 (MQ=255)
gTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGtcatc < 1:1512244/93‑1 (MQ=255)
ccaccaACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACgg < 1:931482/93‑1 (MQ=255)
ccaccaACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACgg < 1:5990767/93‑1 (MQ=255)
caccaACCAAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGgc > 2:5002727/1‑93 (MQ=255)
accaACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGgcg < 1:3775615/93‑1 (MQ=255)
accaACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGgcg > 1:1423686/1‑93 (MQ=255)
aCCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTa < 2:1829223/93‑1 (MQ=255)
aCCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTa < 1:3471293/93‑1 (MQ=255)
cccAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTaa > 2:3289971/1‑93 (MQ=255)
cAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTaaaa < 2:5635531/93‑1 (MQ=255)
cAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTaaaa < 1:1282270/93‑1 (MQ=255)
aGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTaaaag > 1:371295/1‑92 (MQ=255)
aGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAAt < 1:4471241/93‑1 (MQ=255)
gTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATgg > 2:4235860/1‑93 (MQ=255)
gTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGT‑CCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGa > 1:4987431/1‑93 (MQ=255)
aGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGaaa < 2:1289112/93‑1 (MQ=255)
aGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGaaa > 2:3656969/1‑93 (MQ=255)
gCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAAc > 2:2729949/1‑93 (MQ=255)
cAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAAccc > 1:5747173/1‑93 (MQ=255)
cAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAAccc > 1:564494/1‑93 (MQ=255)
cAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAAccc > 2:2956671/1‑93 (MQ=255)
cAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAAccc > 1:3185821/1‑93 (MQ=255)
cAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAAccc > 2:4912235/1‑93 (MQ=255)
caTGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAAcccc < 1:1603048/92‑1 (MQ=255)
aaTGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAAcccc < 2:2279534/93‑1 (MQ=255)
aaTGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAAcccc > 2:2824894/1‑93 (MQ=255)
aaTGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAAcccc > 1:5380978/1‑93 (MQ=255)
aaTGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAAcccc < 1:1862328/93‑1 (MQ=255)
tGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAACCCCgg < 1:2025457/93‑1 (MQ=255)
|
GATGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGGCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAACCCCGGC > NC_000913/2751001‑2751179
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GATGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGGCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAACCCCGGCACTG > NC_000913/2751001‑2751183
|
GATGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTA < SRR4302533.5679454/94‑1 (MQ=60)
ATGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTAT < SRR4302533.2951048/94‑1 (MQ=60)
TGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATT < SRR4302533.4839660/94‑1 (MQ=60)
GTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTG > SRR4302533.5552178/1‑94 (MQ=60)
AAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCA > SRR4302533.2898063/1‑94 (MQ=60)
AAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTACTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCA > SRR4302533.3409814/1‑94 (MQ=60)
TTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAG < SRR4302533.3973992/94‑1 (MQ=60)
TGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTC < SRR4302533.783839/94‑1 (MQ=60)
GACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCG < SRR4302533.3613549/94‑1 (MQ=60)
GAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCAT < SRR4302533.3612118/94‑1 (MQ=60)
AGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATC > SRR4302533.1575189/1‑94 (MQ=60)
GCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCC < SRR4302533.362345/94‑1 (MQ=60)
CATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAACGTCGCATCCG > SRR4302533.684936/1‑94 (MQ=60)
CATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCG > SRR4302533.583346/1‑94 (MQ=60)
CATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCG < SRR4302533.1746453/94‑1 (MQ=60)
CCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGT > SRR4302533.2119071/1‑94 (MQ=60)
CCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGT > SRR4302533.476109/1‑94 (MQ=60)
CTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTG > SRR4302533.5352769/1‑94 (MQ=60)
GGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAA < SRR4302533.1292733/94‑1 (MQ=60)
GGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAAT > SRR4302533.5937657/1‑94 (MQ=60)
GCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATT > SRR4302533.1721850/1‑94 (MQ=60)
CTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTC < SRR4302533.5446073/94‑1 (MQ=60)
GACGGTGCCTATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCC < SRR4302533.5308731/94‑1 (MQ=60)
ACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCG < SRR4302533.798641/94‑1 (MQ=60)
GTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCAT < SRR4302533.5747236/94‑1 (MQ=60)
TGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCACCCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATC < SRR4302533.1910392/94‑1 (MQ=60)
TGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCGTCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATC > SRR4302533.2560978/1‑94 (MQ=60)
TGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATC < SRR4302533.4726479/94‑1 (MQ=60)
TGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATC < SRR4302533.4120330/94‑1 (MQ=60)
TCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCG < SRR4302533.4393261/94‑1 (MQ=60)
GCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCG > SRR4302533.974932/1‑94 (MQ=60)
GCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCG < SRR4302533.4253782/94‑1 (MQ=60)
GCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCG > SRR4302533.259730/1‑94 (MQ=60)
CGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCA > SRR4302533.3865216/1‑94 (MQ=60)
CGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCA > SRR4302533.2743941/1‑94 (MQ=60)
CGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCA < SRR4302533.371351/94‑1 (MQ=60)
CGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCA > SRR4302533.3438722/1‑94 (MQ=60)
GATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCAC > SRR4302533.535050/1‑94 (MQ=60)
ATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACT > SRR4302533.2872460/1‑94 (MQ=60)
ATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACT > SRR4302533.3222725/1‑94 (MQ=60)
ATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACT > SRR4302533.69407/1‑94 (MQ=60)
TCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTG < SRR4302533.6241578/94‑1 (MQ=60)
CGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGG > SRR4302533.4984945/1‑94 (MQ=60)
CGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGG > SRR4302533.1062335/1‑94 (MQ=60)
CGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGG < SRR4302533.148730/94‑1 (MQ=60)
TATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCA < SRR4302533.1857488/94‑1 (MQ=60)
TATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCA > SRR4302533.2960572/1‑94 (MQ=60)
ATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGccga > SRR4302533.1730843/1‑90 (MQ=60)
ATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAA < SRR4302533.568159/94‑1 (MQ=60)
TTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAAT > SRR4302533.4441154/1‑94 (MQ=60)
TTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAAT < SRR4302533.4481732/94‑1 (MQ=60)
TGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATC < SRR4302533.3867230/94‑1 (MQ=60)
TGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATC > SRR4302533.5897530/1‑94 (MQ=60)
GAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCC < SRR4302533.1007172/94‑1 (MQ=60)
AGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCA > SRR4302533.3537490/1‑94 (MQ=60)
GTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAG > SRR4302533.5080556/1‑94 (MQ=60)
GTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAG > SRR4302533.3549982/1‑94 (MQ=60)
GTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAG > SRR4302533.1487330/1‑94 (MQ=60)
GTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAG > SRR4302533.2311055/1‑94 (MQ=60)
TTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGT > SRR4302533.1827528/1‑94 (MQ=60)
TTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGT > SRR4302533.2109988/1‑94 (MQ=60)
TCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTC < SRR4302533.5806523/94‑1 (MQ=60)
TCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTC < SRR4302533.2994363/94‑1 (MQ=60)
CGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCA > SRR4302533.3426118/1‑94 (MQ=60)
GGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCAT > SRR4302533.3715296/1‑94 (MQ=60)
GGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCAT > SRR4302533.5094323/1‑94 (MQ=60)
GGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCAT < SRR4302533.4548758/94‑1 (MQ=60)
GGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATC < SRR4302533.3468698/94‑1 (MQ=60)
GTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCA < SRR4302533.1521357/94‑1 (MQ=60)
AACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACG < SRR4302533.97779/94‑1 (MQ=60)
CCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGC > SRR4302533.6209763/1‑94 (MQ=60)
CCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGC < SRR4302533.936950/94‑1 (MQ=60)
CCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGC < SRR4302533.6027055/94‑1 (MQ=60)
CACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCG > SRR4302533.1432297/1‑94 (MQ=60)
ACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGC < SRR4302533.3798759/94‑1 (MQ=60)
ACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAA < SRR4302533.2662361/94‑1 (MQ=60)
ACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAA < SRR4302533.3492719/94‑1 (MQ=60)
ACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAA > SRR4302533.2789295/1‑94 (MQ=60)
CCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAA > SRR4302533.1012296/1‑94 (MQ=60)
CAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAAT < SRR4302533.1283708/94‑1 (MQ=60)
CAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAAT < SRR4302533.1289986/94‑1 (MQ=60)
CAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAAT < SRR4302533.734917/94‑1 (MQ=60)
CAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAAT < SRR4302533.2564087/94‑1 (MQ=60)
CAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAAT < SRR4302533.447929/94‑1 (MQ=60)
CAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAAG > SRR4302533.373535/1‑94 (MQ=60)
AGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATG < SRR4302533.2700983/94‑1 (MQ=60)
AGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATG < SRR4302533.959504/94‑1 (MQ=60)
AGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATG < SRR4302533.4498281/94‑1 (MQ=60)
GGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGG < SRR4302533.5616674/94‑1 (MQ=60)
GGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGG > SRR4302533.1467485/1‑94 (MQ=60)
GGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGT‑CCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGA > SRR4302533.5017671/1‑94 (MQ=60)
GTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGA > SRR4302533.3786014/1‑94 (MQ=60)
CAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAA < SRR4302533.4482322/94‑1 (MQ=60)
CCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAACCC < SRR4302533.239274/94‑1 (MQ=60)
CCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAACCC > SRR4302533.567837/1‑94 (MQ=60)
CCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAACCC > SRR4302533.3205414/1‑94 (MQ=60)
CCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAACCC > SRR4302533.5781849/1‑94 (MQ=60)
CAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAACCCC > SRR4302533.5413307/1‑94 (MQ=60)
CAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAACCCC < SRR4302533.3174539/94‑1 (MQ=60)
CATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAACCCCG < SRR4302533.1612754/94‑1 (MQ=60)
AATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAACCCCG < SRR4302533.1873684/94‑1 (MQ=60)
TGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAACCCCGGC < SRR4302533.2037961/94‑1 (MQ=60)
TGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCAAGGCGCGTAAAATGGAAACCCCGGC > SRR4302533.2288981/1‑94 (MQ=60)
AGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAACCCCGGCACT > SRR4302533.6058705/1‑94 (MQ=60)
AGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAACCCCGGCACT > SRR4302533.4700739/1‑94 (MQ=60)
GCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAACCCCGGCACTG > SRR4302533.931442/1‑94 (MQ=60)
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GATGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGGCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAACCCCGGCACTG > NC_000913/2751001‑2751183
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
