Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate | Predicted Mutations | Mean Coverage | Total Reads | Percent Mapped | Mapped Reads | Average Read Length |
|---|---|---|---|---|---|---|
| A1 F1 I2 R1 | 1624 | 250.6 | 12620048 | 98.0% | 12367647 | 93.0 |
Breseq alignment
| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,991,539 | T→C | N45S (AAT→AGT) I26T (ATT→ACT) |
cyaY ← b3808 → |
hypothetical protein hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,991,539 | 0 | T | C | 100.0% | 869.1 / NA | 263 | N45S (AAT→AGT) I26T (ATT→ACT) | cyaY b3808 | hypothetical protein hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (127/136); total (127/136) | |||||||||||
Only 100 of 273 total aligned reads displayed.
CCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCATTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCGTCCAGGCGTTCTTCAATGGTC > NC_000913/3991449‑3991628 | ccTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACtc < 1:1003007/93‑1 (MQ=255)ccTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACtc < 2:3212708/93‑1 (MQ=255) tttCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACtctc > 1:1280618/1‑93 (MQ=255) tttCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACtctc > 2:3600750/1‑93 (MQ=255) tttCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGCTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACtctc < 2:155849/93‑1 (MQ=255) tCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCaa < 1:1415711/93‑1 (MQ=255) tCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCaa < 1:851682/93‑1 (MQ=255) cAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCaaa < 2:2899095/93‑1 (MQ=255) aGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGTCACTCTCCAAg > 1:3063601/1‑93 (MQ=255) aGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAg > 2:2430071/1‑93 (MQ=255) gTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGt > 1:2517887/1‑93 (MQ=255) gTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGt < 1:709769/93‑1 (MQ=255) gTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGt > 1:3751357/1‑93 (MQ=255) cAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTaa < 1:1925715/93‑1 (MQ=255) cAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTaa > 2:2659917/1‑93 (MQ=255) aaaaTGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAAt < 2:5955327/93‑1 (MQ=255) aaTGGTAGCCGCCTTGTTTGGTGGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATgg < 1:51294/93‑1 (MQ=255) aaTGGTAGCCGCCCTGTTTGGTGGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATgg < 1:776084/93‑1 (MQ=255) tGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTc < 2:2040836/93‑1 (MQ=255) tGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTc < 2:5452647/93‑1 (MQ=255) tGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTc > 1:3038068/1‑93 (MQ=255) gttAGCCGCCCTGTTGGTTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCa < 2:794832/91‑1 (MQ=255) gTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTATTGGTCAg > 1:2631741/1‑93 (MQ=255) gTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAg > 1:3454485/1‑93 (MQ=255) gTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAg > 1:5844811/1‑93 (MQ=255) gTAGCCGCCCTGTTTGGTGGCCAGCCATGCCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAg < 1:6123652/93‑1 (MQ=255) aGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTa < 2:4314610/93‑1 (MQ=255) aGCCGCCCTGTTTGATTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTa < 2:2546957/93‑1 (MQ=255) gccgccCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGGTTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTAc > 1:46228/1‑93 (MQ=255) gcccccCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTAc < 2:5711952/93‑1 (MQ=255) ccgccCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTAcg < 2:6237067/93‑1 (MQ=255) gccCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTAcgcc > 1:3783259/1‑93 (MQ=255) gccCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTAcgcc > 2:4001523/1‑93 (MQ=255) cccTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTAcgccg > 1:4387409/1‑93 (MQ=255) cccTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTAcgccg > 1:4917913/1‑93 (MQ=255) ccTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTAcgccgc > 2:2976724/1‑93 (MQ=255) cTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACgccgcc > 2:3280130/1‑93 (MQ=255) tgtttgttTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGccgccg < 1:5747320/93‑1 (MQ=255) ttttGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGt < 2:4626317/92‑1 (MQ=255) ggTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGAt > 2:1723075/1‑93 (MQ=255) ttcccagccaTACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGAttt < 2:3461640/90‑1 (MQ=255) ttGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGAttt < 2:2924250/93‑1 (MQ=255) tcccagccaTACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTc < 2:4793902/91‑1 (MQ=255) ccagccaTACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGc > 2:209168/1‑93 (MQ=255) agccaTACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAg < 1:1803173/93‑1 (MQ=255) gccaTACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGACTTCGCAGt < 2:6117908/93‑1 (MQ=255) caTACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCg > 2:3577193/1‑93 (MQ=255) aTACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGa > 2:578840/1‑93 (MQ=255) tcccTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGat < 1:3343945/91‑1 (MQ=255) ccTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGatat > 2:6004073/1‑93 (MQ=255) cTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATc > 1:1506679/1‑93 (MQ=255) cTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATc > 2:2379326/1‑93 (MQ=255) cTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATc > 2:1646465/1‑93 (MQ=255) cTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATc < 1:1331178/93‑1 (MQ=255) ggTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGc < 1:2390792/93‑1 (MQ=255) ggTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGc < 1:5477327/93‑1 (MQ=255) gTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCt < 2:5322307/93‑1 (MQ=255) gTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCt < 2:2226319/93‑1 (MQ=255) gTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCt < 2:4847619/93‑1 (MQ=255) gTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCt < 1:2875375/93‑1 (MQ=255) tGCAGCGGCTCCTGGCGTTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTg < 2:2715119/93‑1 (MQ=255) gCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGt < 1:6245623/93‑1 (MQ=255) gCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGt < 1:3966335/93‑1 (MQ=255) gCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGc > 1:4085618/1‑93 (MQ=255) gCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGc > 1:5668886/1‑93 (MQ=255) cGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGcc < 2:3655504/93‑1 (MQ=255) ggCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCa < 1:6084240/93‑1 (MQ=255) ggCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCa < 1:5949662/93‑1 (MQ=255) ggCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCa < 2:386402/93‑1 (MQ=255) gCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCAt > 1:1873274/1‑93 (MQ=255) tCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATcc < 1:4339649/93‑1 (MQ=255) ctgggCGGTTGATAATTATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAACGGTCAGTACGCCGCCTTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATccc < 1:52286/90‑1 (MQ=255) cTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCa < 2:2787931/93‑1 (MQ=255) cTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCa > 2:834014/1‑93 (MQ=255) cTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCa < 1:5330391/93‑1 (MQ=255) ggCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAgt < 1:5056575/93‑1 (MQ=255) cGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAgtca < 2:927301/93‑2 (MQ=255) ggTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAgtcat > 1:1089238/1‑91 (MQ=255) ggTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAgtcat > 1:5630212/1‑91 (MQ=255) gTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAgtcatc > 1:213732/1‑93 (MQ=255) gTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAgtcatc < 2:3120027/93‑1 (MQ=255) gTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAgtcatc < 1:2997058/93‑1 (MQ=255) ttGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATcc < 1:4193030/93‑1 (MQ=255) tGATAATGATTTTGCTGTCACTCTCAAAGGTAACGGTCAGTACGCCGCCGTTGATGGCGTAGTCGATATCTCTGTCGCCATCCCAGTCATCCa > 2:6304089/1‑93 (MQ=255) tGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCa < 2:4179804/93‑1 (MQ=255) tGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCa < 2:4471221/93‑1 (MQ=255) tGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCa < 2:2326188/93‑1 (MQ=255) gATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAg > 2:404394/1‑93 (MQ=255) gATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAg < 1:2460832/93‑1 (MQ=255) aaTGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCg > 2:5556179/1‑93 (MQ=255) tGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGtt > 1:3603412/1‑93 (MQ=255) aTTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGttct > 1:2227772/1‑93 (MQ=255) tttGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGttcttc < 1:508062/93‑1 (MQ=255) tttGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGttcttc < 1:2693711/93‑1 (MQ=255) tgctgcCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGTTCTTCaa > 2:2438621/1‑93 (MQ=255) gctgcCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGTTCTTCAAt < 2:5006918/93‑1 (MQ=255) ctgcCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGTTCTTCAATg > 1:4515403/1‑93 (MQ=255) tgcCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGTTCTTCAATgg > 2:3408403/1‑93 (MQ=255) ccACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGTTCTTCAATGGTc < 2:1040592/93‑1 (MQ=255) ccACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGTTCTTCAATGGTc < 2:2584561/93‑1 (MQ=255) | CCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCATTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCGTCCAGGCGTTCTTCAATGGTC > NC_000913/3991449‑3991628 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
CGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCATTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCGTCCAGGCGTTCTTCAATGGTCAGCC > NC_000913/3991447‑3991632 | CGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACT < SRR4302533.168161/94‑1 (MQ=60)CGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACT > SRR4302533.4126171/1‑94 (MQ=60) GCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTC > SRR4302533.1850699/1‑94 (MQ=60) GCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTC < SRR4302533.3700761/94‑1 (MQ=60) CCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCT > SRR4302533.5632302/1‑94 (MQ=60) CCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCT < SRR4302533.5681382/94‑1 (MQ=60) CCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCT < SRR4302533.4187477/94‑1 (MQ=60) CCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCT < SRR4302533.1008869/94‑1 (MQ=60) CTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTC > SRR4302533.1288318/1‑94 (MQ=60) CTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTC > SRR4302533.3566524/1‑94 (MQ=60) CTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTC > SRR4302533.569994/1‑94 (MQ=60) TTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCA > SRR4302533.302434/1‑94 (MQ=60) TCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAA < SRR4302533.856668/94‑1 (MQ=60) TCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAA < SRR4302533.1424276/94‑1 (MQ=60) CAGGTCAAAATGTTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAG < SRR4302533.5030127/94‑1 (MQ=60) CAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGTCACTCTCCAAG > SRR4302533.3082410/1‑94 (MQ=60) CAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAG < SRR4302533.4239987/94‑1 (MQ=60) AGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGG > SRR4302533.6093703/1‑94 (MQ=60) GGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGT > SRR4302533.3774358/1‑94 (MQ=60) GGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGT > SRR4302533.2533401/1‑94 (MQ=60) GGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGT < SRR4302533.2507856/94‑1 (MQ=60) GGTCAAAAGGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGT < SRR4302533.1069790/94‑1 (MQ=60) GTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTA < SRR4302533.1603749/94‑1 (MQ=60) GTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTA < SRR4302533.713961/94‑1 (MQ=60) GTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTA > SRR4302533.6276788/1‑94 (MQ=60) GTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTA > SRR4302533.1515057/1‑94 (MQ=60) CAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAAT < SRR4302533.1937461/94‑1 (MQ=60) CAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAAT < SRR4302533.2250323/94‑1 (MQ=60) CAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAAT < SRR4302533.3779310/94‑1 (MQ=60) AAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATG > SRR4302533.111555/1‑94 (MQ=60) AAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGG < SRR4302533.3357962/94‑1 (MQ=60) AAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGG > SRR4302533.5244911/1‑94 (MQ=60) AAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGG < SRR4302533.5857521/94‑1 (MQ=60) AATGGTAGCCGCCTTGTTTGGTGGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGT < SRR4302533.51642/94‑1 (MQ=60) AATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGT < SRR4302533.6128682/94‑1 (MQ=60) AATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTGGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGT < SRR4302533.780644/94‑1 (MQ=60) ATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTC > SRR4302533.3056658/1‑94 (MQ=60) GGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTATTGGTCAG > SRR4302533.2647913/1‑94 (MQ=60) GGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAG > SRR4302533.5880146/1‑94 (MQ=60) GGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAG > SRR4302533.3475808/1‑94 (MQ=60) GGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAG < SRR4302533.701581/94‑1 (MQ=60) GTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGT < SRR4302533.908656/94‑1 (MQ=60) GTAGCCGCCCTGTTTGGTGGCCAGCCATGCCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGT < SRR4302533.6160567/94‑1 (MQ=60) TAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTA < SRR4302533.2175160/94‑1 (MQ=60) AGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGGTTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTAC > SRR4302533.46548/1‑94 (MQ=60) AGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTAC > SRR4302533.5326200/1‑94 (MQ=60) AGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTAC > SRR4302533.5938419/1‑94 (MQ=60) GCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACG < SRR4302533.3977921/94‑1 (MQ=60) CCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGC > SRR4302533.509681/1‑94 (MQ=60) CGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCC > SRR4302533.3806426/1‑94 (MQ=60) GCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCG < SRR4302533.5732216/94‑1 (MQ=60) GCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCG > SRR4302533.4413896/1‑94 (MQ=60) GCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCG > SRR4302533.4947704/1‑94 (MQ=60) CCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGC > SRR4302533.252044/1‑94 (MQ=60) CCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCC > SRR4302533.4410620/1‑94 (MQ=60) CCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCC > SRR4302533.3802152/1‑94 (MQ=60) CTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCG > SRR4302533.6341066/1‑94 (MQ=60) TGTTTGTTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGT < SRR4302533.5781996/94‑1 (MQ=60) GTTTGTTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTT < SRR4302533.371896/94‑1 (MQ=60) TTTGGTTTCCAGCCATATCTGCTGCAGCGTCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCGCTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTG < SRR4302533.1093452/94‑1 (MQ=60) TTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGA > SRR4302533.421601/1‑94 (MQ=60) TGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGAT < SRR4302533.851518/94‑1 (MQ=60) TTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTC < SRR4302533.5348399/94‑1 (MQ=60) TTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTC < SRR4302533.1870152/94‑1 (MQ=60) CCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCA > SRR4302533.4840143/1‑94 (MQ=60) CCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCA > SRR4302533.4624380/1‑94 (MQ=60) CAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAG > SRR4302533.2084106/1‑94 (MQ=60) CAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAG > SRR4302533.3240575/1‑94 (MQ=60) AGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGT < SRR4302533.1814150/94‑1 (MQ=60) GCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTC < SRR4302533.3024263/94‑1 (MQ=60) CCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCG < SRR4302533.1242180/94‑1 (MQ=60) CCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCG < SRR4302533.1311633/94‑1 (MQ=60) ATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGAT > SRR4302533.2177781/1‑94 (MQ=60) ATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGAT > SRR4302533.2365848/1‑94 (MQ=60) TCCCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATA < SRR4302533.3364607/94‑1 (MQ=60) ACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATAT < SRR4302533.2721079/94‑1 (MQ=60) ACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATAT < SRR4302533.4598357/94‑1 (MQ=60) CCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGctctc > SRR4302533.283100/1‑89 (MQ=60) CCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATC > SRR4302533.1515762/1‑94 (MQ=60) CTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCG < SRR4302533.1339163/94‑1 (MQ=60) TGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGC < SRR4302533.777000/94‑1 (MQ=60) GGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCT < SRR4302533.5510342/94‑1 (MQ=60) GGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCT < SRR4302533.1383096/94‑1 (MQ=60) GGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCT < SRR4302533.2405554/94‑1 (MQ=60) GTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTG < SRR4302533.2893068/94‑1 (MQ=60) GCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTC < SRR4302533.6283003/94‑1 (MQ=60) GCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTC < SRR4302533.3990498/94‑1 (MQ=60) AGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCTGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGC > SRR4302533.5018037/1‑94 (MQ=60) AGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGC > SRR4302533.1903614/1‑94 (MQ=60) AGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGC > SRR4302533.5703130/1‑94 (MQ=60) AGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGC > SRR4302533.4110490/1‑94 (MQ=60) GGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCAT < SRR4302533.5985646/94‑1 (MQ=60) GGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCAT > SRR4302533.1884692/1‑94 (MQ=60) GGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCAT < SRR4302533.6121025/94‑1 (MQ=60) GGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCAT > SRR4302533.4917200/1‑94 (MQ=60) TCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCC < SRR4302533.4365805/94‑1 (MQ=60) ctgGGCGGTTGATAATTATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAACGGTCAGTACGCCGCCTTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCA < SRR4302533.52640/91‑1 (MQ=60) CCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCA > SRR4302533.748335/1‑94 (MQ=60) CCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCA < SRR4302533.401882/94‑1 (MQ=60) CCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGCAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCA > SRR4302533.6219465/1‑94 (MQ=60) CTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCTGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAG < SRR4302533.2677442/94‑1 (MQ=60) CTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAG < SRR4302533.5795411/94‑1 (MQ=60) CTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAG < SRR4302533.5362338/94‑1 (MQ=60) CTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAG < SRR4302533.2954076/94‑1 (MQ=60) GGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTC < SRR4302533.5087139/94‑1 (MQ=60) GCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCA < SRR4302533.4374690/94‑1 (MQ=60) CCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCA < SRR4302533.1747925/94‑1 (MQ=60) CGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCAT > SRR4302533.253602/1‑94 (MQ=60) CGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCAT > SRR4302533.5664260/1‑94 (MQ=60) CGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCAT > SRR4302533.1095667/1‑94 (MQ=60) CGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCAT < SRR4302533.307419/94‑1 (MQ=60) GGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATC > SRR4302533.215077/1‑94 (MQ=60) GTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCC > SRR4302533.521148/1‑94 (MQ=60) GTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCC < SRR4302533.3015384/94‑1 (MQ=60) GTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCC > SRR4302533.3444659/1‑94 (MQ=60) TTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCA < SRR4302533.5955783/94‑1 (MQ=60) TTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCA < SRR4302533.4218408/94‑1 (MQ=60) TTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCA > SRR4302533.3392240/1‑94 (MQ=60) TTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCA > SRR4302533.1432063/1‑94 (MQ=60) TGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAG < SRR4302533.3508653/94‑1 (MQ=60) GATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGG < SRR4302533.2476017/94‑1 (MQ=60) ATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGC < SRR4302533.5144336/94‑1 (MQ=60) ATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGC > SRR4302533.1289440/1‑94 (MQ=60) TAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCG > SRR4302533.5634746/1‑94 (MQ=60) AATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGT > SRR4302533.2999959/1‑94 (MQ=60) ATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGTT > SRR4302533.3625590/1‑94 (MQ=60) GATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGTTCT > SRR4302533.2241521/1‑94 (MQ=60) GATTTTCCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGTTCT < SRR4302533.3928445/94‑1 (MQ=60) ATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGTTCTT > SRR4302533.2141837/1‑94 (MQ=60) TTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGTTCTTC > SRR4302533.6009898/1‑94 (MQ=60) TTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGTTCTTCA < SRR4302533.2710215/94‑1 (MQ=60) TTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGTTCTTCA < SRR4302533.511078/94‑1 (MQ=60) TGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGTTCTTCAAT > SRR4302533.958134/1‑94 (MQ=60) TGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGTTCTTCAAT < SRR4302533.5385279/94‑1 (MQ=60) GCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGTTCTTCAATG > SRR4302533.4542744/1‑94 (MQ=60) CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGGCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGTTCTTCAATGG < SRR4302533.5154445/94‑1 (MQ=60) CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGTTCTTCAATGG < SRR4302533.2833107/94‑1 (MQ=60) TGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGTTCTTCAATGGT < SRR4302533.2642750/94‑1 (MQ=60) TGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGTTCTTCAATGGT > SRR4302533.2435973/1‑94 (MQ=60) GCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGTTCTTCAATGGTC > SRR4302533.4354461/1‑94 (MQ=60) CCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGTTCTTCAATGGTCA < SRR4302533.4519422/94‑1 (MQ=60) CCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGTTCTTCAATGGTCA > SRR4302533.2564115/1‑94 (MQ=60) CCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGTTCTTCAATGGTCA > SRR4302533.2225810/1‑94 (MQ=60) CACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGTTCTTCAATGGTCAG < SRR4302533.201376/94‑1 (MQ=60) ACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGTTCTTCAATGGTCAGC > SRR4302533.5531634/1‑94 (MQ=60) CTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGTTCTTCAATGGTCAGCC > SRR4302533.4182823/1‑94 (MQ=60) CTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGTTCTTCAATGGTCAGCC < SRR4302533.5379873/94‑1 (MQ=60) | CGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCATTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCGTCCAGGCGTTCTTCAATGGTCAGCC > NC_000913/3991447‑3991632 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |