Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1624 |
250.6 |
12620048 |
98.0% |
12367647 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,041,927 |
A→G |
Y50C (TAC→TGC) |
b3861 → |
putative GTP‑binding protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,041,927 | 0 | A | G | 99.5%
| 602.9
/ ‑5.0
| 186 | Y50C (TAC→TGC) | b3861 | putative GTP‑binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); new base G (101/84); total (102/84) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.70e-01 |
Only 100 of 189 total aligned reads displayed.
ACATGGTACACAGGTACGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTACGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTGCACCCG > NC_000913/4041839‑4042016
|
acaTGGTACACAGGTACGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGat < 2:432964/93‑1 (MQ=255)
caTGGTACACAGGTACGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGata > 1:6145881/1‑93 (MQ=255)
caTGGTACACAGGTACGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGata > 2:388164/1‑93 (MQ=255)
caTGGTACACAGGTACGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGata > 2:5494793/1‑93 (MQ=255)
tGGTACACAGGTACGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATg < 1:3523526/93‑1 (MQ=255)
tGGTACACAGGTACGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATg > 1:4228665/1‑93 (MQ=255)
ggTACACAGGTACGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGa < 1:975616/93‑1 (MQ=255)
gTACACAGGTACGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGAc < 2:4055375/93‑1 (MQ=255)
tACACAGGTACGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACg > 1:2282565/1‑93 (MQ=255)
acacAGGTACGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGt > 2:4830370/1‑93 (MQ=255)
cacaGGTACGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGtt < 1:335888/93‑1 (MQ=255)
caGGTACGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTaa < 2:273789/93‑1 (MQ=255)
aGGTACGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAg > 1:4718306/1‑93 (MQ=255)
aGGTACGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAg > 2:2889461/1‑93 (MQ=255)
ggTACGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGt < 2:81351/93‑1 (MQ=255)
ggTACGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGt > 1:3717806/1‑93 (MQ=255)
tACGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTa > 2:4955044/1‑93 (MQ=255)
tACGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTa > 2:5815299/1‑93 (MQ=255)
cGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATc > 2:5124359/1‑93 (MQ=255)
cGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATc > 2:3012857/1‑93 (MQ=255)
cGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATc < 1:1440220/93‑1 (MQ=255)
gCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCa > 1:4479728/1‑93 (MQ=255)
cAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCaa > 1:4729514/1‑93 (MQ=255)
cAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCaa > 1:2070730/1‑93 (MQ=255)
aaaTTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCaaa < 1:3589534/93‑1 (MQ=255)
aaaTTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCaaa > 1:559888/1‑93 (MQ=255)
aaTTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCaaaa > 1:839363/1‑93 (MQ=255)
aaTTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCaaaa < 2:1772352/93‑1 (MQ=255)
aTTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAAt < 2:1705440/93‑1 (MQ=255)
aTTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAAt > 1:2677279/1‑93 (MQ=255)
ttCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAAtt > 1:6242263/1‑93 (MQ=255)
tCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAAttt < 2:419544/93‑1 (MQ=255)
tGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACaa > 1:19129/1‑93 (MQ=255)
ggTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACaaa > 1:1077270/1‑93 (MQ=255)
ggTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACaaa < 1:5376321/93‑1 (MQ=255)
gtgtCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAg > 1:3908401/1‑93 (MQ=255)
gtgtCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAg < 2:69386/93‑1 (MQ=255)
gtCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGc < 2:4550893/93‑1 (MQ=255)
tCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCt < 2:3482526/93‑1 (MQ=255)
gAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCttt > 2:3632282/1‑93 (MQ=255)
aaaaaTTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCtttt < 1:113711/93‑1 (MQ=255)
aaaaaTTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCtttt < 1:1460834/93‑1 (MQ=255)
aaaaTTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCttttt > 1:6036624/1‑93 (MQ=255)
aaaTTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGGCAAAGGCtttttt < 2:1579859/93‑1 (MQ=255)
aaaTTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCtttttt > 2:3042645/1‑93 (MQ=255)
aaaTTTATTAAAGATTTGAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCtttttt < 2:5198584/93‑1 (MQ=255)
aaTTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTa > 2:1658487/1‑93 (MQ=255)
aaTTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTa > 2:1712156/1‑93 (MQ=255)
aaTTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGATATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTa > 2:4229565/1‑93 (MQ=255)
aTTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGTCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTaa > 1:4542884/1‑93 (MQ=255)
tattaAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTc > 1:1964844/1‑93 (MQ=255)
tattaAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTc > 2:221373/1‑93 (MQ=255)
tattaAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGACTGCGATATGCCGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTc > 1:2008644/1‑93 (MQ=255)
attaAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGACTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTcc < 2:593431/93‑1 (MQ=255)
taAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCg < 2:2955404/93‑1 (MQ=255)
aaaGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTcccat < 2:1290336/93‑3 (MQ=255)
aaaGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGt > 2:2272532/1‑93 (MQ=255)
aaGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGtt < 2:1421103/93‑1 (MQ=255)
aaGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGtt > 2:4655217/1‑93 (MQ=255)
aTTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTc > 2:560315/1‑93 (MQ=255)
ttttAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTca > 2:2698877/1‑93 (MQ=255)
tttAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTcaa > 2:1167860/1‑93 (MQ=255)
ttAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTcaaa > 1:5777424/1‑93 (MQ=255)
cGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTcaaatgca > 2:6253750/1‑93 (MQ=255)
gATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTcaaatgcaa > 1:5775706/1‑93 (MQ=255)
aTGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTcaaatgcaaa > 2:3421499/1‑93 (MQ=255)
aTGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTcaaatgcaaa > 2:6171269/1‑93 (MQ=255)
tGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTcaaatgcaaat < 1:2534308/93‑1 (MQ=255)
gCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTcaaatgcaaatg < 2:2134023/93‑1 (MQ=255)
cTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGa > 1:3049978/1‑93 (MQ=255)
cTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGa < 1:170304/93‑1 (MQ=255)
cTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGa < 2:5694141/93‑1 (MQ=255)
tAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGAc > 2:553008/1‑93 (MQ=255)
aaaaaGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACa < 2:110514/93‑1 (MQ=255)
aaaaGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACAt > 1:4360741/1‑93 (MQ=255)
aaaaGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACAt > 1:1798385/1‑93 (MQ=255)
aaagaaagGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACAtt < 1:2335954/93‑1 (MQ=255)
aaagaaagATGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACAtt < 2:3138715/93‑1 (MQ=255)
aagaaagGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTc < 2:5064754/93‑1 (MQ=255)
aagaaagGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTc < 2:522707/93‑1 (MQ=255)
aagaaagGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTc < 2:1023799/93‑1 (MQ=255)
agaaagGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCg > 1:5158019/1‑93 (MQ=255)
gaaagGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGa > 2:5905506/1‑93 (MQ=255)
gaaagGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGa < 1:2002757/93‑1 (MQ=255)
aaagGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGAt > 1:1265462/1‑93 (MQ=255)
ggTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAAc > 2:4784632/1‑93 (MQ=255)
ggTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAAc > 2:3907152/1‑93 (MQ=255)
ggTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAAc < 2:2794190/93‑1 (MQ=255)
ggTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAAc < 1:5301631/93‑1 (MQ=255)
ggTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAAc > 1:786393/1‑93 (MQ=255)
tGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACgg < 2:1089536/93‑1 (MQ=255)
gAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGt > 1:3465848/1‑93 (MQ=255)
aaCATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTg > 1:4930607/1‑93 (MQ=255)
aCATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTGc < 1:5716678/93‑1 (MQ=255)
cATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTGCa > 2:4453573/1‑93 (MQ=255)
cATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTGCa > 2:6036705/1‑93 (MQ=255)
cATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTGCa > 1:5811801/1‑93 (MQ=255)
cATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTGCa > 1:729573/1‑93 (MQ=255)
aTGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTGCAc > 2:3699003/1‑93 (MQ=255)
tGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTGCAcc > 1:3182848/1‑93 (MQ=255)
|
ACATGGTACACAGGTACGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTACGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTGCACCCG > NC_000913/4041839‑4042016
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
ACATGGTACACAGGTACGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTACGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTGCACCCGATC > NC_000913/4041839‑4042019
|
ACATGGTACACAGGTACGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATA > SRR4302533.6182883/1‑94 (MQ=60)
CATGGTACACAGGTACGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTACGATAT > SRR4302533.2630975/1‑94 (MQ=60)
ATGGTACACAGGTACGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATG > SRR4302533.4254232/1‑94 (MQ=60)
TGGTACACAGGTACGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGA < SRR4302533.3545242/94‑1 (MQ=60)
GGTACACAGGTACGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGAC < SRR4302533.981339/94‑1 (MQ=60)
GGTACACAGGTACGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGAC < SRR4302533.1536338/94‑1 (MQ=60)
GTACACAGGTACGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACG > SRR4302533.2296695/1‑94 (MQ=60)
CACAGGTACGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTA < SRR4302533.337941/94‑1 (MQ=60)
CAGGTACGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAG > SRR4302533.4746919/1‑94 (MQ=60)
AGGTACGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGT > SRR4302533.3740625/1‑94 (MQ=60)
AGGTACGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGT < SRR4302533.5865148/94‑1 (MQ=60)
GGTACGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTT < SRR4302533.5515025/94‑1 (MQ=60)
TACGCAAATTCAGCCTGTTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTAT < SRR4302533.1972162/94‑1 (MQ=60)
CGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCA < SRR4302533.1448909/94‑1 (MQ=60)
CGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCA > SRR4302533.4506828/1‑94 (MQ=60)
CGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCA < SRR4302533.894144/94‑1 (MQ=60)
GCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTACAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGcggttcagttataaa > SRR4302533.4757998/1‑79 (MQ=60)
GCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAA > SRR4302533.2083483/1‑94 (MQ=60)
GCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAA > SRR4302533.4758186/1‑94 (MQ=60)
CAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAA > SRR4302533.563212/1‑94 (MQ=60)
AAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAA < SRR4302533.3611633/94‑1 (MQ=60)
AAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAA > SRR4302533.844276/1‑94 (MQ=60)
AAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAA > SRR4302533.5106242/1‑94 (MQ=60)
AATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAAT > SRR4302533.2693693/1‑94 (MQ=60)
ATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATT < SRR4302533.4494656/94‑1 (MQ=60)
ATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATT > SRR4302533.5233073/1‑94 (MQ=60)
ATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATT > SRR4302533.6279632/1‑94 (MQ=60)
CTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAA > SRR4302533.19256/1‑94 (MQ=60)
TGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAA > SRR4302533.1083622/1‑94 (MQ=60)
GGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAG < SRR4302533.5408633/94‑1 (MQ=60)
GGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAG > SRR4302533.3932270/1‑94 (MQ=60)
GTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGG > SRR4302533.2049283/1‑94 (MQ=60)
GTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCT < SRR4302533.5808413/94‑1 (MQ=60)
CGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTT > SRR4302533.1732869/1‑94 (MQ=60)
AAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTT < SRR4302533.114434/94‑1 (MQ=60)
AAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTT > SRR4302533.6073206/1‑94 (MQ=60)
AAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTT < SRR4302533.1469639/94‑1 (MQ=60)
AAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTT > SRR4302533.800908/1‑94 (MQ=60)
AATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGTCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAA > SRR4302533.4570396/1‑94 (MQ=60)
AATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAA > SRR4302533.3689210/1‑94 (MQ=60)
TTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTC > SRR4302533.1976844/1‑94 (MQ=60)
TTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGACTGCGATATGCCGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTC > SRR4302533.2021014/1‑94 (MQ=60)
TTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCG < SRR4302533.4131274/94‑1 (MQ=60)
TAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGT < SRR4302533.2345213/94‑1 (MQ=60)
TAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGT < SRR4302533.3160422/94‑1 (MQ=60)
TAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGT < SRR4302533.436332/94‑1 (MQ=60)
AAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTT > SRR4302533.684790/1‑94 (MQ=60)
TTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAA > SRR4302533.5812319/1‑94 (MQ=60)
TAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATG > SRR4302533.1922412/1‑94 (MQ=60)
AACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGC < SRR4302533.2158390/94‑1 (MQ=60)
ACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCA > SRR4302533.6150472/1‑94 (MQ=60)
CGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAA > SRR4302533.5810588/1‑94 (MQ=60)
GATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAA > SRR4302533.2359918/1‑94 (MQ=60)
TGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATG < SRR4302533.2549909/94‑1 (MQ=60)
GCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGA < SRR4302533.1461923/94‑1 (MQ=60)
GCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGA > SRR4302533.3068645/1‑94 (MQ=60)
CTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGAC < SRR4302533.171376/94‑1 (MQ=60)
CTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGAC > SRR4302533.3332199/1‑94 (MQ=60)
CTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGAC < SRR4302533.621878/94‑1 (MQ=60)
AAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACAT > SRR4302533.4387064/1‑94 (MQ=60)
AAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACAT < SRR4302533.2907224/94‑1 (MQ=60)
AAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACAT > SRR4302533.1362754/1‑94 (MQ=60)
AAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACAT > SRR4302533.1809327/1‑94 (MQ=60)
AAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTC < SRR4302533.2350412/94‑1 (MQ=60)
AAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTC < SRR4302533.5845557/94‑1 (MQ=60)
AAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTC > SRR4302533.3567161/1‑94 (MQ=60)
AAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCG > SRR4302533.5189157/1‑94 (MQ=60)
AAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCG > SRR4302533.763763/1‑94 (MQ=60)
AGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGA < SRR4302533.4560789/94‑1 (MQ=60)
GAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGAT < SRR4302533.2015094/94‑1 (MQ=60)
GAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGAT < SRR4302533.2015093/94‑1 (MQ=60)
GAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGAT > SRR4302533.1273034/1‑94 (MQ=60)
AAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATA < SRR4302533.4958832/94‑1 (MQ=60)
AGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAAC > SRR4302533.791013/1‑94 (MQ=60)
GGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACG < SRR4302533.5333393/94‑1 (MQ=60)
GTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGG > SRR4302533.1180844/1‑94 (MQ=60)
GTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGG > SRR4302533.3811867/1‑94 (MQ=60)
TGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGT > SRR4302533.3487239/1‑94 (MQ=60)
GAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTG > SRR4302533.4960466/1‑94 (MQ=60)
ACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTGCA > SRR4302533.5846902/1‑94 (MQ=60)
ACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTGCA < SRR4302533.5751203/94‑1 (MQ=60)
ACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTGCA > SRR4302533.5383051/1‑94 (MQ=60)
ACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTGCA > SRR4302533.733876/1‑94 (MQ=60)
ATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTGCACC > SRR4302533.3202430/1‑94 (MQ=60)
ATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTGCACC < SRR4302533.3540904/94‑1 (MQ=60)
GCCTGCGATACGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTGCACCCG < SRR4302533.5678322/94‑1 (MQ=60)
CCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTGCACCCGA > SRR4302533.4376153/1‑94 (MQ=60)
CTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTGCACCCGAT > SRR4302533.3644403/1‑94 (MQ=60)
TGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTGCACCCGATC > SRR4302533.2803613/1‑94 (MQ=60)
|
ACATGGTACACAGGTACGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTACGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTGCACCCGATC > NC_000913/4041839‑4042019
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
