Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1624 |
250.6 |
12620048 |
98.0% |
12367647 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,236,786 |
A→G |
Y525C (TAC→TGC) |
yjbH → |
hypothetical protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,236,786 | 0 | A | G | 100.0%
| 855.5
/ NA
| 263 | Y525C (TAC→TGC) | yjbH | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (129/134); total (129/134) |
Only 100 of 270 total aligned reads displayed.
TGCGCGAGTATGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTACGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGTCTGGATG > NC_000913/4236696‑4236875
|
tgCGCGAGTATGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCg < 1:145627/93‑1 (MQ=255)
tgCGCGAGTATGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCg > 1:1772556/1‑93 (MQ=255)
tgCGCGAGTATGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCg > 1:714941/1‑93 (MQ=255)
gcgAGTATGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCggtg > 2:2430251/1‑93 (MQ=255)
gcgAGTATGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGACAGGTCTGCggtg > 1:3600973/1‑93 (MQ=255)
gAGTATGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCggtggt > 2:3326520/1‑93 (MQ=255)
gAGTATGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCggtggt > 2:3052689/1‑93 (MQ=255)
aGTATGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGtt < 2:5274977/93‑1 (MQ=255)
gTATGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTa < 2:3571651/93‑1 (MQ=255)
gTATGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTa < 2:1910342/93‑1 (MQ=255)
gTATGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTa > 2:4692719/1‑93 (MQ=255)
gTATGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTa < 1:5269163/93‑1 (MQ=255)
aTGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTAATTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTAtc < 2:74702/93‑1 (MQ=255)
tgtgCAGAACGATGTCTATGTGAATAGCCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTAtct < 1:3227994/93‑1 (MQ=255)
gtgCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTAtctc < 1:5853235/93‑1 (MQ=255)
gCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGa < 2:1454196/93‑1 (MQ=255)
aGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGAAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACTGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGaaa > 1:5466855/1‑93 (MQ=255)
gAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAAc > 2:5751948/1‑93 (MQ=255)
aCGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCa < 1:3902626/93‑1 (MQ=255)
cGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCAt < 1:1255652/93‑1 (MQ=255)
cGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCAt < 2:1663596/93‑1 (MQ=255)
cGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCAt < 2:4205685/93‑1 (MQ=255)
gATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATg > 1:2215051/1‑93 (MQ=255)
gATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATg > 1:4470750/1‑93 (MQ=255)
aTGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGt > 1:834782/1‑93 (MQ=255)
tGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGtt > 1:3068738/1‑93 (MQ=255)
tGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGtt < 2:1261882/93‑1 (MQ=255)
tATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGc > 1:4539277/1‑93 (MQ=255)
tATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGc > 1:5792444/1‑93 (MQ=255)
tATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGc > 2:5032043/1‑93 (MQ=255)
tATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGc < 2:5960487/93‑1 (MQ=255)
aTGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCg < 1:3277103/93‑1 (MQ=255)
aTGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTAACTCGAAACCATGTTTGGCg < 2:6121820/93‑1 (MQ=255)
gtgAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCggg > 1:4674406/1‑92 (MQ=255)
tgAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTg < 2:454752/93‑1 (MQ=255)
gAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGc > 1:5172367/1‑93 (MQ=255)
gAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGc < 1:1424898/93‑1 (MQ=255)
aaTAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCg < 2:1251342/93‑1 (MQ=255)
aaTAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAAACATGTTTGGCGGTGCg > 2:5667067/1‑93 (MQ=255)
aaTAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATATGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTAGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCg > 2:6187875/1‑93 (MQ=255)
tAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCggg < 1:5571222/93‑1 (MQ=255)
tAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCggg < 2:4336086/93‑1 (MQ=255)
aaaCCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCggg < 1:1910791/92‑1 (MQ=255)
aaCCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCgggg < 2:286483/93‑1 (MQ=255)
aaCCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCgggg < 1:212425/93‑1 (MQ=255)
aaCCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCgggg < 2:5504003/93‑1 (MQ=255)
aaCCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCgggg < 1:396668/93‑1 (MQ=255)
aCCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCggggg > 1:5041063/1‑93 (MQ=255)
aCCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCggggg > 2:5398975/1‑93 (MQ=255)
ccTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGc > 2:6039481/1‑93 (MQ=255)
cTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCa > 2:1750440/1‑93 (MQ=255)
tGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCCACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCCGGGGCAg > 2:3092651/1‑93 (MQ=255)
gCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGa < 1:2674671/93‑1 (MQ=255)
cAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAATCCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAgga > 2:104339/1‑91 (MQ=255)
cAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGaa < 2:2149420/93‑1 (MQ=255)
aaGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAg > 1:5532532/1‑93 (MQ=255)
ccAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAgtgt < 2:3446004/93‑1 (MQ=255)
cAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGtgtt > 2:5115687/1‑93 (MQ=255)
actactTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGtgttgt < 1:3427585/93‑1 (MQ=255)
ctgctTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTa < 2:4896570/90‑1 (MQ=255)
ctactTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTa > 1:1584676/1‑93 (MQ=255)
actTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATc < 1:5353064/93‑1 (MQ=255)
ttCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGc > 2:2067115/1‑93 (MQ=255)
tCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGcc < 2:4104757/93‑1 (MQ=255)
tCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGcc > 1:2987516/1‑93 (MQ=255)
cAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGCAGTGTTGTATCGCCCg > 1:2348002/1‑93 (MQ=255)
cAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCg > 2:46740/1‑93 (MQ=255)
cAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCg > 2:4446758/1‑93 (MQ=255)
cAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCg < 1:2461256/93‑1 (MQ=255)
aTCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTgg > 2:5168108/1‑93 (MQ=255)
tCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGa > 2:1995275/1‑93 (MQ=255)
tCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGa > 2:2716145/1‑93 (MQ=255)
tCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGa < 1:1973157/93‑1 (MQ=255)
cTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGGCCTCTGGAc > 1:2395863/1‑93 (MQ=255)
cTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGAc < 1:4640370/93‑1 (MQ=255)
tGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACa > 1:6160679/1‑93 (MQ=255)
gggCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAg < 1:889929/93‑1 (MQ=255)
ggCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGc < 1:379451/93‑1 (MQ=255)
gCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCa > 1:2236852/1‑93 (MQ=255)
cAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGTTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCaa < 2:5607083/93‑1 (MQ=255)
aCGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACt > 1:1715173/1‑93 (MQ=255)
aCGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACt < 1:3537389/93‑1 (MQ=255)
aCGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACt > 2:1622274/1‑93 (MQ=255)
aCGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACt > 1:5104739/1‑93 (MQ=255)
cGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCATCTg > 1:6303632/1‑93 (MQ=255)
cGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTg > 1:4844108/1‑93 (MQ=255)
ggCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTgg < 2:5804778/93‑1 (MQ=255)
ggCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTgg < 1:6262970/93‑1 (MQ=255)
ttCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCg > 1:1071882/1‑93 (MQ=255)
tCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGt > 2:413729/1‑93 (MQ=255)
tCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGt > 1:64302/1‑93 (MQ=255)
cTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGtt < 1:5579902/93‑1 (MQ=255)
tACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGttt > 2:3812216/1‑93 (MQ=255)
tACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGttt < 2:363477/93‑1 (MQ=255)
tCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGTCt > 2:2629228/1‑93 (MQ=255)
cAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGTCTg < 1:948633/93‑1 (MQ=255)
ggTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGTCTGGa < 2:32314/93‑1 (MQ=255)
gTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGTCTGGAt > 2:2256863/1‑93 (MQ=255)
gTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGTCTGGAt < 1:2712405/93‑1 (MQ=255)
tCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGTCTGGATg > 1:1190994/1‑93 (MQ=255)
|
TGCGCGAGTATGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTACGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGTCTGGATG > NC_000913/4236696‑4236875
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
ATGTGCGCGAGTATGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTACGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGTCTGGATGCCA > NC_000913/4236693‑4236878
|
ATGTGCGCGAGTATGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTG > SRR4302533.5292786/1‑94 (MQ=60)
ATGTGCGCGAGTATGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTG > SRR4302533.4906531/1‑94 (MQ=60)
GTGCGCGAGTATGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCG > SRR4302533.1783350/1‑94 (MQ=60)
GTGCGCGAGTATGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCG > SRR4302533.719159/1‑94 (MQ=60)
GTGCGCGAGTATGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCG < SRR4302533.5306590/94‑1 (MQ=60)
TGCGCGAGTATGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGG < SRR4302533.146557/94‑1 (MQ=60)
CGCGAGTATGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTG > SRR4302533.2410989/1‑94 (MQ=60)
CGCGAGTATGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTG > SRR4302533.793106/1‑94 (MQ=60)
CGCGAGTATGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTG < SRR4302533.82832/94‑1 (MQ=60)
CGCGAGTATGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGACAGGTCTGCGGTG > SRR4302533.3623131/1‑94 (MQ=60)
CGAGTATGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGT < SRR4302533.6242285/94‑1 (MQ=60)
GTATGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTAT < SRR4302533.5881558/94‑1 (MQ=60)
GTATGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTAT < SRR4302533.5300769/94‑1 (MQ=60)
TATGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATC < SRR4302533.1199011/94‑1 (MQ=60)
ATGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCT < SRR4302533.2561281/94‑1 (MQ=60)
TGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAGCCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTC < SRR4302533.3247894/94‑1 (MQ=60)
TGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTC > SRR4302533.5095172/1‑94 (MQ=60)
GTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCG < SRR4302533.5888624/94‑1 (MQ=60)
GCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAA < SRR4302533.3107575/94‑1 (MQ=60)
CAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAA < SRR4302533.898926/94‑1 (MQ=60)
CAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGAAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACTGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAA > SRR4302533.5499806/1‑94 (MQ=60)
AGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAAC > SRR4302533.2365267/1‑94 (MQ=60)
AGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAAC < SRR4302533.6300734/94‑1 (MQ=60)
AGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGCCTGCGGAGGTTATCTCGAAAC > SRR4302533.696553/1‑94 (MQ=60)
GAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACC > SRR4302533.4700222/1‑94 (MQ=60)
GAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACC > SRR4302533.5198217/1‑94 (MQ=60)
AACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCA > SRR4302533.2441801/1‑94 (MQ=60)
AACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCA > SRR4302533.1167396/1‑94 (MQ=60)
ACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCAT < SRR4302533.3926460/94‑1 (MQ=60)
CGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATG > SRR4302533.2228723/1‑94 (MQ=60)
CGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATG > SRR4302533.4497787/1‑94 (MQ=60)
CGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATG < SRR4302533.1263159/94‑1 (MQ=60)
GATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGT > SRR4302533.839676/1‑94 (MQ=60)
GATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCAGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGT < SRR4302533.3732632/94‑1 (MQ=60)
ATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTT < SRR4302533.5836333/94‑1 (MQ=60)
ATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTT > SRR4302533.3087581/1‑94 (MQ=60)
TGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTT > SRR4302533.3543785/1‑94 (MQ=60)
GTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTG < SRR4302533.233602/94‑1 (MQ=60)
GTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTG < SRR4302533.26053/94‑1 (MQ=60)
CTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGC > SRR4302533.1511534/1‑94 (MQ=60)
CTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGC > SRR4302533.4566760/1‑94 (MQ=60)
CTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGC > SRR4302533.5827437/1‑94 (MQ=60)
ATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTAGTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGGTATCTCGAAACCATGTTTAGCGG > SRR4302533.3065940/1‑94 (MQ=60)
ATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGG < SRR4302533.64122/94‑1 (MQ=60)
ATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGG < SRR4302533.3297342/94‑1 (MQ=60)
TGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGT < SRR4302533.2819993/94‑1 (MQ=60)
TGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGG > SRR4302533.4702728/1‑94 (MQ=60)
TGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGC > SRR4302533.861491/1‑94 (MQ=60)
TGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGC > SRR4302533.5203576/1‑94 (MQ=60)
TAATAACCTGCAAGACAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGTGCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCG < SRR4302533.5068957/94‑1 (MQ=60)
GAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCG > SRR4302533.3861207/1‑94 (MQ=60)
GAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCG < SRR4302533.1433516/94‑1 (MQ=60)
ATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGG > SRR4302533.2723379/1‑94 (MQ=60)
TAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGG < SRR4302533.5604895/94‑1 (MQ=60)
TAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGG < SRR4302533.2027570/94‑1 (MQ=60)
AAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGG < SRR4302533.1922447/94‑1 (MQ=60)
AACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGG < SRR4302533.399068/94‑1 (MQ=60)
AACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGG < SRR4302533.213762/94‑1 (MQ=60)
AACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGG > SRR4302533.5071574/1‑94 (MQ=60)
CCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCA > SRR4302533.3324074/1‑94 (MQ=60)
CCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCA > SRR4302533.5235405/1‑94 (MQ=60)
CCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCA < SRR4302533.2327963/94‑1 (MQ=60)
CTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAG > SRR4302533.3077844/1‑94 (MQ=60)
TGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGA > SRR4302533.5476957/1‑94 (MQ=60)
GCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAA < SRR4302533.4296325/94‑1 (MQ=60)
GCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAA < SRR4302533.2691075/94‑1 (MQ=60)
CAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAG < SRR4302533.4825263/94‑1 (MQ=60)
CAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAG > SRR4302533.5565934/1‑94 (MQ=60)
GCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGT < SRR4302533.4126667/94‑1 (MQ=60)
CCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTT < SRR4302533.5610671/94‑1 (MQ=60)
CAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTG > SRR4302533.1875475/1‑94 (MQ=60)
CAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTG > SRR4302533.2240889/1‑94 (MQ=60)
CAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAATGTTG > SRR4302533.2189806/1‑94 (MQ=60)
AACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGT < SRR4302533.5571730/94‑1 (MQ=60)
ACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTA < SRR4302533.2113513/94‑1 (MQ=60)
ACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTA < SRR4302533.3448760/94‑1 (MQ=60)
ACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTA > SRR4302533.1594224/1‑94 (MQ=60)
CTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTAT < SRR4302533.197918/94‑1 (MQ=60)
ACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCG < SRR4302533.5247757/94‑1 (MQ=60)
ACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCG < SRR4302533.5385191/94‑1 (MQ=60)
ACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCG < SRR4302533.3656933/94‑1 (MQ=60)
CTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGC > SRR4302533.5659690/1‑94 (MQ=60)
TTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCC > SRR4302533.3005793/1‑94 (MQ=60)
TCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCC > SRR4302533.3253364/1‑94 (MQ=60)
CCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGCAGTGTTGTATCGCCCG > SRR4302533.2362531/1‑94 (MQ=60)
CAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGC < SRR4302533.2476442/94‑1 (MQ=60)
CAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGC > SRR4302533.4800954/1‑94 (MQ=60)
GCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTG < SRR4302533.5512957/94‑1 (MQ=60)
CATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGG < SRR4302533.3347075/94‑1 (MQ=60)
CATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGG < SRR4302533.6310858/94‑1 (MQ=60)
ATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGA > SRR4302533.2782570/1‑94 (MQ=60)
ATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGA < SRR4302533.543472/94‑1 (MQ=60)
TCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGGCCTCTGGAC > SRR4302533.2410651/1‑94 (MQ=60)
TCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGAC < SRR4302533.1985234/94‑1 (MQ=60)
CTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACA > SRR4302533.6197728/1‑94 (MQ=60)
CTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACA < SRR4302533.4668486/94‑1 (MQ=60)
CTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACA > SRR4302533.5574263/1‑94 (MQ=60)
TGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAG > SRR4302533.5351656/1‑94 (MQ=60)
TGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAG > SRR4302533.6268424/1‑94 (MQ=60)
GGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGC < SRR4302533.895155/94‑1 (MQ=60)
GGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGC > SRR4302533.3953215/1‑94 (MQ=60)
GGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCA > SRR4302533.1221556/1‑94 (MQ=60)
GGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCA < SRR4302533.2242197/94‑1 (MQ=60)
GGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCA > SRR4302533.2250680/1‑94 (MQ=60)
GGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCA < SRR4302533.381737/94‑1 (MQ=60)
CAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAAC > SRR4302533.1363204/1‑94 (MQ=60)
CAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAAC > SRR4302533.3461889/1‑94 (MQ=60)
AACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACT > SRR4302533.5135576/1‑94 (MQ=60)
AACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACT > SRR4302533.1462236/1‑94 (MQ=60)
AACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACT > SRR4302533.1725572/1‑94 (MQ=60)
ACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCATCTG > SRR4302533.6341315/1‑94 (MQ=60)
ACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTG > SRR4302533.4873467/1‑94 (MQ=60)
ACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTG < SRR4302533.3559190/94‑1 (MQ=60)
CGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGG < SRR4302533.5160551/94‑1 (MQ=60)
CGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGG < SRR4302533.1693288/94‑1 (MQ=60)
GGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGG < SRR4302533.4923546/94‑1 (MQ=60)
GGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGG < SRR4302533.5565376/94‑1 (MQ=60)
GGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGG < SRR4302533.6300406/94‑1 (MQ=60)
GGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGG > SRR4302533.4549860/1‑94 (MQ=60)
GCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGC < SRR4302533.1780788/94‑1 (MQ=60)
CTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCG > SRR4302533.1078197/1‑94 (MQ=60)
CTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCG < SRR4302533.4522474/94‑1 (MQ=60)
TTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGT > SRR4302533.5623052/1‑94 (MQ=60)
TTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGT > SRR4302533.64719/1‑94 (MQ=60)
TTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGT > SRR4302533.1622842/1‑94 (MQ=60)
CTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTT < SRR4302533.3168867/94‑1 (MQ=60)
CTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTT > SRR4302533.4590856/1‑94 (MQ=60)
CTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTT < SRR4302533.5613623/94‑1 (MQ=60)
TACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTG > SRR4302533.879551/1‑94 (MQ=60)
TACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTG > SRR4302533.6006441/1‑94 (MQ=60)
CGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGT < SRR4302533.4582376/94‑1 (MQ=60)
GGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGTC > SRR4302533.1928225/1‑94 (MQ=60)
GGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGTC > SRR4302533.3892556/1‑94 (MQ=60)
GTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGTCT > SRR4302533.1386573/1‑94 (MQ=60)
CAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGTCTGG < SRR4302533.954206/94‑1 (MQ=60)
AGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGTCTGGA < SRR4302533.675984/94‑1 (MQ=60)
AGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGTCTGGA < SRR4302533.1853297/94‑1 (MQ=60)
GGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGTCTGGAT < SRR4302533.3611060/94‑1 (MQ=60)
GTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGTCTGGATG < SRR4302533.1502013/94‑1 (MQ=60)
GTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGTCTGGATG > SRR4302533.1198150/1‑94 (MQ=60)
GTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGTCTGGATG < SRR4302533.2729059/94‑1 (MQ=60)
CTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGTCTGGATGCC > SRR4302533.6288003/1‑94 (MQ=60)
TGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGTCTGGATGCCA > SRR4302533.423622/1‑94 (MQ=60)
|
ATGTGCGCGAGTATGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTACGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGTCTGGATGCCA > NC_000913/4236693‑4236878
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
