Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
A1 F1 I1 R1
|
647 |
270.1 |
21258240 |
98.4% |
20918108 |
94.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
RA |
NC_000913 |
419,777 |
C→T |
L321L (CTC→CTT) |
brnQ → |
branched chain amino acid transport system II carrier protein |
|
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
* | NC_000913 | 419,777 | 0 | C | T | 98.5%
| 1247.2
/ ‑0.3
| 326 | L321L (CTC→CTT) | brnQ | branched chain amino acid transport system II carrier protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (5/0); new base T (192/129); total (197/129) |
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.61e-01 |
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.03e-01 |
Only 100 of 358 total aligned reads displayed.
CTGCCTGGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGT > NC_000913/419684‑419867
|
tgGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTtggcgg > 1:9820203/1‑94 (MQ=255)
tgGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTtggcgg > 2:2816773/1‑94 (MQ=255)
ggTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACACTGGTGTTTATCCTTggcggc > 1:5306172/1‑94 (MQ=255)
gTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCt < 2:694853/94‑1 (MQ=255)
gTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCt > 2:6753407/1‑94 (MQ=255)
tAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCtt < 1:359219/94‑1 (MQ=255)
aCGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTtct > 1:3729196/1‑94 (MQ=255)
cGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTtctc < 1:9954906/94‑1 (MQ=255)
ggCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCg > 2:4697681/1‑94 (MQ=255)
ggCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCg < 1:819845/94‑1 (MQ=255)
cAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGAt > 2:6431841/1‑94 (MQ=255)
cAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGAt > 1:10473197/1‑94 (MQ=255)
aGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGAtg > 1:2138478/1‑94 (MQ=255)
aGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGAtg > 1:9570549/1‑94 (MQ=255)
gTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGAtgg > 1:2791897/1‑94 (MQ=255)
ttGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGAtggt > 2:7223856/1‑94 (MQ=255)
ccTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGtt > 1:4039003/1‑94 (MQ=255)
ccTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGtt < 1:10013582/94‑1 (MQ=255)
cTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGttt > 1:5620302/1‑94 (MQ=255)
gACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGTTGGTGGGTTCt > 1:7839181/1‑94 (MQ=255)
gACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCt > 1:8409777/1‑94 (MQ=255)
ccTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTaa < 2:6116524/94‑1 (MQ=255)
ccTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTaa > 2:1229022/1‑94 (MQ=255)
ttgCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCt < 2:7356271/93‑1 (MQ=255)
tgCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTc < 2:1054201/94‑1 (MQ=255)
cTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCgg < 2:1587304/94‑1 (MQ=255)
cTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCgg < 1:8544926/94‑1 (MQ=255)
cTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCgg < 1:4891551/94‑1 (MQ=255)
cTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGCTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCgg > 1:1249282/1‑94 (MQ=255)
ttGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGc < 2:822798/94‑1 (MQ=255)
tgtgCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCt > 2:8385600/1‑94 (MQ=255)
tgtgCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCt > 2:6652006/1‑94 (MQ=255)
tgtgCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCt < 2:7448479/94‑1 (MQ=255)
gtgCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCtt > 2:314095/1‑94 (MQ=255)
gCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTaa > 1:734704/1‑94 (MQ=255)
cAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAAGCTCGGCTTAAg > 2:705025/1‑94 (MQ=255)
cAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAg < 1:6822024/94‑1 (MQ=255)
gAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGcc < 2:7559648/94‑1 (MQ=255)
gAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGcc > 1:2985096/1‑94 (MQ=255)
gAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGcc < 1:6893061/94‑1 (MQ=255)
aTTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAg > 1:7027751/1‑94 (MQ=255)
ttCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGc < 1:268784/94‑1 (MQ=255)
atCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGc < 2:549107/93‑1 (MQ=255)
tCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGcc < 1:8311543/94‑2 (MQ=255)
cTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGccg > 1:10351587/1‑92 (MQ=255)
cTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTg > 2:8077747/1‑94 (MQ=255)
ttGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGAt < 1:7445899/94‑1 (MQ=255)
tGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTCTCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGAGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACTTCGGACTAAGACAGCCGATc > 2:10094542/1‑94 (MQ=255)
tGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATc < 1:809923/94‑1 (MQ=255)
gCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATcc > 2:3359938/1‑94 (MQ=255)
gCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATcc > 1:5965265/1‑94 (MQ=255)
gCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATcc < 1:5771047/94‑1 (MQ=255)
cccAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCa < 2:4460088/94‑1 (MQ=255)
ccAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAg > 1:4103024/1‑94 (MQ=255)
ccAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAg < 1:1379439/94‑1 (MQ=255)
ccAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAg > 1:6563298/1‑94 (MQ=255)
cAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGa > 1:7305398/1‑94 (MQ=255)
aGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGAt > 2:5849013/1‑94 (MQ=255)
aGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGAt > 1:2058037/1‑94 (MQ=255)
gtacgtacCGCTCTTTTGTCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGAtc < 1:6082010/94‑1 (MQ=255)
tacgtacCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACTTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGAtct < 1:1011900/94‑1 (MQ=255)
tacgtacCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGAtct < 1:6372089/94‑1 (MQ=255)
cgtacCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTcc > 2:10038137/1‑94 (MQ=255)
cgtacCGCCCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCGAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTcc < 1:4821992/94‑1 (MQ=255)
gtacCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCg > 2:2115361/1‑94 (MQ=255)
gtacCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCg < 2:5074640/94‑1 (MQ=255)
tacCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGt > 2:4925579/1‑94 (MQ=255)
cGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTAcc < 2:361434/94‑1 (MQ=255)
cGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTAcc > 2:2512563/1‑94 (MQ=255)
gCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCg < 2:949229/94‑1 (MQ=255)
tctctTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGt > 1:7602623/1‑94 (MQ=255)
tctTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGc > 2:3724893/1‑94 (MQ=255)
tctTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGc > 2:8747211/1‑94 (MQ=255)
tctTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGc > 2:779528/1‑94 (MQ=255)
ctTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCt > 2:7688935/1‑94 (MQ=255)
ctTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCt < 2:3908882/94‑1 (MQ=255)
ttATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTg > 2:4270561/1‑94 (MQ=255)
aTCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGGTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGCGCCGAc > 1:4486889/1‑94 (MQ=255)
cGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCg < 1:6239812/94‑1 (MQ=255)
cGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCg > 2:8474717/1‑94 (MQ=255)
gTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGc > 2:2283642/1‑94 (MQ=255)
tACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCt < 1:3127331/94‑1 (MQ=255)
tACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCt > 2:9007514/1‑94 (MQ=255)
gCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTAtt > 2:2961658/1‑94 (MQ=255)
gCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTACTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTAtt < 2:5268474/94‑1 (MQ=255)
cTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTAttt > 2:8881050/1‑94 (MQ=255)
cTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTAttt < 2:2557685/94‑1 (MQ=255)
gtgtTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATc < 2:4075725/94‑1 (MQ=255)
gtgtTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATc > 2:5590130/1‑94 (MQ=255)
tgtTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGTTGCTGACCGCTATTTATcc > 1:1743854/1‑94 (MQ=255)
tgtTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATcc < 2:7579899/94‑1 (MQ=255)
ttATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATccgcc < 1:8691735/94‑1 (MQ=255)
ttATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATccgcc < 2:9668077/94‑1 (MQ=255)
tATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATccgccg > 1:3254650/1‑94 (MQ=255)
tATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATccgccg < 1:8496259/94‑1 (MQ=255)
tATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATccgccg < 1:9250561/94‑1 (MQ=255)
aTCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCgt < 2:7848771/94‑1 (MQ=255)
tCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCgtg > 2:860966/1‑94 (MQ=255)
tCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCgtg < 1:8911341/94‑1 (MQ=255)
ccTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCgtgt > 1:5406359/1‑94 (MQ=255)
|
CTGCCTGGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGT > NC_000913/419684‑419867
|
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 203 total aligned reads displayed.
CTGCCTGGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATC > NC_000913/419684‑419870
|
CTGCCTGGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTT > SRR4302545.10024718/1‑94 (MQ=60)
CTGCCTGGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTT < SRR4302545.6994903/94‑1 (MQ=60)
CTGCCTGGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTT > SRR4302545.5914439/1‑94 (MQ=60)
CTGCCTGGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTT < SRR4302545.5621490/94‑1 (MQ=60)
CTGCCTGGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTT > SRR4302545.4870363/1‑94 (MQ=60)
CTGCCTGGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTT > SRR4302545.3894102/1‑94 (MQ=60)
CTGCCTGGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTT > SRR4302545.3894101/1‑94 (MQ=60)
TGCCTGGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTG < SRR4302545.850737/94‑1 (MQ=60)
TGCCTGGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTG > SRR4302545.8255553/1‑94 (MQ=60)
TGCCTGGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTG > SRR4302545.3037763/1‑94 (MQ=60)
TGCCTGGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTG < SRR4302545.10506947/94‑1 (MQ=60)
GCCTGGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGG < SRR4302545.2471522/94‑1 (MQ=60)
GCCTGGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGG > SRR4302545.280074/1‑94 (MQ=60)
CCTGGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGC > SRR4302545.3245108/1‑94 (MQ=60)
CTGGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCG < SRR4302545.8729077/94‑1 (MQ=60)
CTGGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCG < SRR4302545.4635285/94‑1 (MQ=60)
CTGGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCG < SRR4302545.5089809/94‑1 (MQ=60)
CTGGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCG > SRR4302545.3101555/1‑94 (MQ=60)
CTGGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCG > SRR4302545.6070953/1‑94 (MQ=60)
CTGGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCG > SRR4302545.7626743/1‑94 (MQ=60)
TGGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGG > SRR4302545.3034458/1‑94 (MQ=60)
TGGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGG > SRR4302545.10111982/1‑94 (MQ=60)
GGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGC > SRR4302545.9524174/1‑94 (MQ=60)
GGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACACTGGTGTTTATCCTTGGCGGC > SRR4302545.5443743/1‑94 (MQ=60)
GTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCT < SRR4302545.6704924/94‑1 (MQ=60)
GTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCT < SRR4302545.6260183/94‑1 (MQ=60)
TAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTGTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTT > SRR4302545.5722134/1‑94 (MQ=60)
TAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTT < SRR4302545.367017/94‑1 (MQ=60)
AACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTC < SRR4302545.7842261/94‑1 (MQ=60)
AACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTC > SRR4302545.8380185/1‑94 (MQ=60)
acgggagtttgccctgcccgttgttgtggcagaattctttcccaggtcgttaccccccCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCT < SRR4302545.2243743/36‑1 (MQ=60)
ACGGCATGTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGGGTTTATCCGTGGCGGCTTCT > SRR4302545.666407/1‑94 (MQ=60)
ACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCT > SRR4302545.3820879/1‑94 (MQ=60)
ACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCT < SRR4302545.1958708/94‑1 (MQ=60)
CTGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTC < SRR4302545.8661746/94‑1 (MQ=60)
CGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTC < SRR4302545.2811663/94‑1 (MQ=60)
CGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTC < SRR4302545.10250309/94‑1 (MQ=60)
CGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTC > SRR4302545.8904697/1‑94 (MQ=60)
GGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCG < SRR4302545.838227/94‑1 (MQ=60)
GGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCG < SRR4302545.402698/94‑1 (MQ=60)
GGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCG > SRR4302545.8149069/1‑94 (MQ=60)
GGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCG > SRR4302545.10471783/1‑94 (MQ=60)
CAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGAT > SRR4302545.10781954/1‑94 (MQ=60)
CAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGAT > SRR4302545.10781955/1‑94 (MQ=60)
AGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATG > SRR4302545.2190870/1‑94 (MQ=60)
GTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGG < SRR4302545.10172211/94‑1 (MQ=60)
GTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGG > SRR4302545.2859365/1‑94 (MQ=60)
GTTGGCCTGACCTGTGCTTGGGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGG < SRR4302545.4165058/94‑1 (MQ=60)
TTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGT < SRR4302545.6206811/94‑1 (MQ=60)
TTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATCCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGT > SRR4302545.10639334/1‑94 (MQ=60)
TGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTG < SRR4302545.3759477/94‑1 (MQ=60)
TGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTG < SRR4302545.6417634/94‑1 (MQ=60)
TGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTG < SRR4302545.10927705/94‑1 (MQ=60)
gaccgcACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGG < SRR4302545.289705/88‑1 (MQ=60)
CCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTT > SRR4302545.8826911/1‑94 (MQ=60)
CCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTT > SRR4302545.4140138/1‑94 (MQ=60)
CCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTT > SRR4302545.7731503/1‑94 (MQ=60)
CCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTT > SRR4302545.9816569/1‑94 (MQ=60)
CCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTT < SRR4302545.10310392/94‑1 (MQ=60)
CTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTT > SRR4302545.5398105/1‑94 (MQ=60)
CTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTT > SRR4302545.8467231/1‑94 (MQ=60)
CTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTT > SRR4302545.5769631/1‑94 (MQ=60)
TGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTC < SRR4302545.7656243/94‑1 (MQ=60)
TGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTC > SRR4302545.327701/1‑94 (MQ=60)
TGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTC < SRR4302545.5976895/94‑1 (MQ=60)
GACGTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGGGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCCATAGTGGTTTCG < SRR4302545.2207701/94‑1 (MQ=60)
GACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGTTGGTGGGTTCT > SRR4302545.8061415/1‑94 (MQ=60)
GACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCT > SRR4302545.8985798/1‑94 (MQ=60)
GACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCT > SRR4302545.8985797/1‑94 (MQ=60)
GACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCT > SRR4302545.8653093/1‑94 (MQ=60)
CCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTTGATCGCGGTTTCTCA > SRR4302545.10190155/1‑94 (MQ=60)
CTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGTCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGCTTATCCTTGGCAGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAAC > SRR4302545.4577832/1‑94 (MQ=60)
CTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAAC > SRR4302545.7266361/1‑94 (MQ=60)
CTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAAC < SRR4302545.9387744/94‑1 (MQ=60)
TGGGCTTGGGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACC > SRR4302545.1710972/1‑94 (MQ=60)
GTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCT < SRR4302545.3446920/94‑1 (MQ=60)
TGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTC > SRR4302545.9377357/1‑94 (MQ=60)
GCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCG > SRR4302545.6821176/1‑94 (MQ=60)
GCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCG < SRR4302545.7051620/94‑1 (MQ=60)
GCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCG < SRR4302545.7051621/94‑1 (MQ=60)
CTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGG < SRR4302545.5015799/94‑1 (MQ=60)
CTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGG > SRR4302545.3912280/1‑94 (MQ=60)
CTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGG < SRR4302545.8791980/94‑1 (MQ=60)
CTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGCTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGG > SRR4302545.1277346/1‑94 (MQ=60)
CTTGGGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGG < SRR4302545.8063746/94‑1 (MQ=60)
GTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTT > SRR4302545.5804852/1‑94 (MQ=60)
GTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTT < SRR4302545.8224509/94‑1 (MQ=60)
GCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAA > SRR4302545.751232/1‑94 (MQ=60)
CAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAG < SRR4302545.7009484/94‑1 (MQ=60)
CAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAG > SRR4302545.2420012/1‑94 (MQ=60)
GAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCC < SRR4302545.7082713/94‑1 (MQ=60)
GAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCC > SRR4302545.7353005/1‑94 (MQ=60)
GAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCC > SRR4302545.3057847/1‑94 (MQ=60)
GAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCC < SRR4302545.10084707/94‑1 (MQ=60)
GAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCC < SRR4302545.10084706/94‑1 (MQ=60)
GAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCC < SRR4302545.2433727/94‑1 (MQ=60)
AATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCA < SRR4302545.1357700/94‑1 (MQ=60)
ATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAG > SRR4302545.7221773/1‑94 (MQ=60)
ATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAG > SRR4302545.7221771/1‑94 (MQ=60)
ATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAG < SRR4302545.6205278/94‑1 (MQ=60)
ATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAG < SRR4302545.3331065/94‑1 (MQ=60)
TTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGC < SRR4302545.3757734/94‑1 (MQ=60)
TTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGC < SRR4302545.274341/94‑1 (MQ=60)
TCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCC < SRR4302545.8552393/94‑1 (MQ=60)
TCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCC < SRR4302545.5712916/94‑1 (MQ=60)
CTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCG > SRR4302545.10656693/1‑94 (MQ=60)
TTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGAT < SRR4302545.7656695/94‑1 (MQ=60)
TTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGAT < SRR4302545.4668723/94‑1 (MQ=60)
TGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATC > SRR4302545.487366/1‑94 (MQ=60)
TGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATC > SRR4302545.1772759/1‑94 (MQ=60)
TGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATC < SRR4302545.828104/94‑1 (MQ=60)
TGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATC < SRR4302545.512301/94‑1 (MQ=60)
GCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCC < SRR4302545.5926139/94‑1 (MQ=60)
GCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCC > SRR4302545.6126198/1‑94 (MQ=60)
CCAGTCCGTACCTCTCTATTATCGTATGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTTTAACCTCGGCTTAAGCCAGATGATCCAG < SRR4302545.1410361/94‑1 (MQ=60)
CCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAG < SRR4302545.1410360/94‑1 (MQ=60)
CCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAG > SRR4302545.4205723/1‑94 (MQ=60)
CCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAG < SRR4302545.10777213/94‑1 (MQ=60)
CCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAG > SRR4302545.6742882/1‑94 (MQ=60)
CAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGTGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGA > SRR4302545.7510254/1‑94 (MQ=60)
CAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGA > SRR4302545.4600526/1‑94 (MQ=60)
CAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGA > SRR4302545.7510253/1‑94 (MQ=60)
AGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCCGAT > SRR4302545.10261904/1‑94 (MQ=60)
AGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGAT > SRR4302545.3411902/1‑94 (MQ=60)
AGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGAT > SRR4302545.10384089/1‑94 (MQ=60)
AGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGAT > SRR4302545.2108740/1‑94 (MQ=60)
AGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTGCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGAT < SRR4302545.7547467/94‑1 (MQ=60)
GTACGTACCGCTCTTTTGTCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATC < SRR4302545.6247197/94‑1 (MQ=60)
GTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGCTC > SRR4302545.8501666/1‑94 (MQ=60)
TACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTTACATCGGCTTAAGCCAGCCGATGGAGATCT > SRR4302545.4199834/1‑94 (MQ=60)
TACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACTTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCT < SRR4302545.1034251/94‑1 (MQ=60)
TACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCT > SRR4302545.2123495/1‑94 (MQ=60)
TACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCT < SRR4302545.6546243/94‑1 (MQ=60)
CGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCC < SRR4302545.5452900/94‑1 (MQ=60)
CGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCC < SRR4302545.5452899/94‑1 (MQ=60)
CGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCC > SRR4302545.2036743/1‑94 (MQ=60)
CGTACCGCCCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCGAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCC < SRR4302545.4945105/94‑1 (MQ=60)
GTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATtcagttcgcgg > SRR4302545.6461281/1‑83 (MQ=60)
GTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCG < SRR4302545.8377890/94‑1 (MQ=60)
GTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCG > SRR4302545.876616/1‑94 (MQ=60)
GTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCG > SRR4302545.6461282/1‑94 (MQ=60)
GTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCG > SRR4302545.4961037/1‑94 (MQ=60)
GTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCG > SRR4302545.8630995/1‑94 (MQ=60)
ACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTA < SRR4302545.5722227/94‑1 (MQ=60)
ACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTA > SRR4302545.4084233/1‑94 (MQ=60)
CGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACC < SRR4302545.2859967/94‑1 (MQ=60)
CGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACC > SRR4302545.10787569/1‑94 (MQ=60)
GCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCG < SRR4302545.5009793/94‑1 (MQ=60)
GCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCG > SRR4302545.7895995/1‑94 (MQ=60)
GCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCG > SRR4302545.1380628/1‑94 (MQ=60)
CCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCG < SRR4302545.2119816/94‑1 (MQ=60)
CTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGG > SRR4302545.10609/1‑94 (MQ=60)
TCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGT > SRR4302545.7817684/1‑94 (MQ=60)
TCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGT > SRR4302545.7817683/1‑94 (MQ=60)
CTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTG > SRR4302545.3435064/1‑94 (MQ=60)
TCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGCTCTCCGTACCGGTGC > SRR4302545.2997236/1‑94 (MQ=60)
TTATGGTACGCTGGTGTTTATCCTTGTCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTG < SRR4302545.85123/94‑1 (MQ=60)
TTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTG > SRR4302545.6878023/1‑94 (MQ=60)
TATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGA > SRR4302545.8520704/1‑94 (MQ=60)
ATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGAC < SRR4302545.10509795/94‑1 (MQ=60)
ATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGGTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGCGCCGAC > SRR4302545.4601542/1‑94 (MQ=60)
TCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACC < SRR4302545.3132761/94‑1 (MQ=60)
TCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACC > SRR4302545.10283418/1‑94 (MQ=60)
CGTACTCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCG < SRR4302545.6409880/94‑1 (MQ=60)
CGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCG < SRR4302545.7592807/94‑1 (MQ=60)
CGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCG < SRR4302545.6409882/94‑1 (MQ=60)
CGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCG > SRR4302545.6226313/1‑94 (MQ=60)
CGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCG < SRR4302545.8769544/94‑1 (MQ=60)
CGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCG < SRR4302545.8769543/94‑1 (MQ=60)
GTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGC > SRR4302545.184937/1‑94 (MQ=60)
TACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCT > SRR4302545.9743092/1‑94 (MQ=60)
TACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCT < SRR4302545.3204472/94‑1 (MQ=60)
TACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCT > SRR4302545.10287323/1‑94 (MQ=60)
GCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATT > SRR4302545.5856879/1‑94 (MQ=60)
TGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTA > SRR4302545.8040046/1‑94 (MQ=60)
GTGTTTATCCTTGGCGCCTTCTGGATGGTGGTTTCTAACCTCGCTTTAAGCCGGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATC < SRR4302545.10370504/94‑1 (MQ=60)
TGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGTTGCTGACCGCTATTTATCC > SRR4302545.1785558/1‑94 (MQ=60)
GTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCG > SRR4302545.10375548/1‑94 (MQ=60)
TTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCC < SRR4302545.8943835/94‑1 (MQ=60)
TATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCG < SRR4302545.8741788/94‑1 (MQ=60)
TATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCG < SRR4302545.8741789/94‑1 (MQ=60)
TATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCG < SRR4302545.7403602/94‑1 (MQ=60)
TATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCG > SRR4302545.3334536/1‑94 (MQ=60)
TATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCG < SRR4302545.9521780/94‑1 (MQ=60)
TATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCG < SRR4302545.5944142/94‑1 (MQ=60)
TATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCG > SRR4302545.7188500/1‑94 (MQ=60)
TATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCCGTGCGGACCGCTATTTATCCGCCG > SRR4302545.7188501/1‑94 (MQ=60)
ATCCTTGGCGGCTTCTCGGTGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGCACCGGCGCTGAACGCTTTTTATCCGCCGT > SRR4302545.8264183/1‑94 (MQ=60)
ATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGT > SRR4302545.10120915/1‑94 (MQ=60)
TCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCTAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTTCTGACCGCTATTTATCCGCCGTG < SRR4302545.9170391/94‑1 (MQ=60)
TCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTG > SRR4302545.16359/1‑94 (MQ=60)
TCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTG < SRR4302545.9170392/94‑1 (MQ=60)
CCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGT < SRR4302545.4454523/94‑1 (MQ=60)
CCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGT > SRR4302545.5547396/1‑94 (MQ=60)
CTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTA < SRR4302545.5038787/94‑1 (MQ=60)
CTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTA > SRR4302545.1178509/1‑94 (MQ=60)
TTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTAT < SRR4302545.6602667/94‑1 (MQ=60)
TGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATC > SRR4302545.5894831/1‑94 (MQ=60)
TGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATC > SRR4302545.436276/1‑94 (MQ=60)
TGGCGGCTTCGCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATC < SRR4302545.2727093/94‑1 (MQ=60)
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CTGCCTGGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATC > NC_000913/419684‑419870
|
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |