Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
882 |
254.4 |
12957588 |
98.0% |
12698436 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
419,777 |
C→T |
L321L (CTC→CTT) |
brnQ → |
branched chain amino acid transport system II carrier protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 419,777 | 0 | C | T | 100.0%
| 599.2
/ NA
| 169 | L321L (CTC→CTT) | brnQ | branched chain amino acid transport system II carrier protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (97/72); total (97/72) |
Only 100 of 190 total aligned reads displayed.
CCTGGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTG > NC_000913/419687‑419866
|
cctgGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTtgg < 1:2021119/93‑1 (MQ=255)
ctgGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTtggc < 2:3862184/93‑1 (MQ=255)
ctgGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTtggc < 1:3320855/93‑1 (MQ=255)
ctgGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTtggc < 2:4959121/93‑1 (MQ=255)
ggTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTtggcgg > 1:140636/1‑93 (MQ=255)
ggTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTtggcgg > 2:3226805/1‑93 (MQ=255)
ggTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTtggcgg > 1:2833595/1‑93 (MQ=255)
ggTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTtggcgg > 2:3729528/1‑93 (MQ=255)
gTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTggcggc < 1:1532207/93‑1 (MQ=255)
gTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTggcggc < 2:4815020/93‑1 (MQ=255)
gaaCGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCt < 1:1106625/92‑1 (MQ=255)
aCGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTtc < 1:3418678/93‑1 (MQ=255)
aCGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTtc > 1:2619995/1‑93 (MQ=255)
cGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTtct > 1:2331886/1‑93 (MQ=255)
aGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGAt > 2:465924/1‑93 (MQ=255)
gCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGAtggtgg < 1:187344/93‑1 (MQ=255)
gCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGAtggtgg > 2:4269222/1‑93 (MQ=255)
ccTGGCCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATggtggt < 2:1407906/93‑1 (MQ=255)
cTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGtt < 1:2209420/93‑1 (MQ=255)
tGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGttt > 2:927526/1‑93 (MQ=255)
gACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTc > 2:1595959/1‑93 (MQ=255)
gACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTc < 1:4728704/93‑1 (MQ=255)
aCCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCt > 1:4323420/1‑93 (MQ=255)
cTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTaa < 1:3784148/93‑1 (MQ=255)
gtgCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAAcc > 2:2362589/1‑93 (MQ=255)
gtgCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAAcc > 2:1162915/1‑93 (MQ=255)
gtgCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAAcc > 2:3391635/1‑93 (MQ=255)
tgCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCCAACCt > 1:5441775/1‑93 (MQ=255)
cTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCg > 2:523960/1‑93 (MQ=255)
ttGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCgg < 1:355470/93‑1 (MQ=255)
ttGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCgg > 1:5735560/1‑93 (MQ=255)
ttGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCgg > 2:5828610/1‑93 (MQ=255)
ttGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGCTTCTAACCTccg > 1:5026005/1‑91 (MQ=255)
tgtgCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGc > 1:3912867/1‑93 (MQ=255)
gtgCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTTGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCt < 2:5551624/93‑1 (MQ=255)
gtgCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCt > 2:2881152/1‑93 (MQ=255)
gtgCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCt < 1:5590807/93‑1 (MQ=255)
gCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTa > 2:6413778/1‑93 (MQ=255)
gCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTa > 1:3677650/1‑93 (MQ=255)
cAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTaa < 2:4780141/93‑1 (MQ=255)
cAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTaa < 1:891627/93‑1 (MQ=255)
aGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAg > 1:419933/1‑93 (MQ=255)
gAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGc < 1:3015025/93‑1 (MQ=255)
aaTTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGcc < 2:1118251/93‑1 (MQ=255)
aaTTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGcc > 1:6310958/1‑93 (MQ=255)
ttCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAg < 1:1863350/93‑1 (MQ=255)
ttCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAAACTCGGCTTAAGCCAg > 1:2659870/1‑93 (MQ=255)
cTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGcc > 1:4869157/1‑92 (MQ=255)
ttGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGa < 2:1448326/93‑1 (MQ=255)
ttGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGGTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGa > 1:1584808/1‑93 (MQ=255)
ccAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCa > 2:5323189/1‑93 (MQ=255)
ccAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCa < 2:796671/93‑1 (MQ=255)
ccAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCa < 1:2686326/93‑1 (MQ=255)
cAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAg > 2:2315940/1‑93 (MQ=255)
aGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGa < 1:3645091/93‑1 (MQ=255)
aGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGa > 1:2852316/1‑93 (MQ=255)
aGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGa > 2:436508/1‑93 (MQ=255)
gtacgtacCTCTCGCTTATCGGCCGGAGGTGTTTATCCTTGGCGCCGTCTCGATGGTGGTTTCGAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGAt < 2:3569383/93‑1 (MQ=255)
gtacgtacCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGAt > 1:2985624/1‑93 (MQ=255)
tacgtacCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGAtc > 1:6457987/1‑93 (MQ=255)
cgtacCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGAtctc < 2:4515718/93‑1 (MQ=255)
cgtacCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGAtctc < 2:90067/93‑1 (MQ=255)
gtacCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTcc < 2:2643477/93‑1 (MQ=255)
gtacCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTcc < 1:1780631/93‑1 (MQ=255)
tacCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCg > 1:2703923/1‑93 (MQ=255)
tacCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCg < 2:3089904/93‑1 (MQ=255)
acCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGt < 1:4760450/93‑1 (MQ=255)
acCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGt > 2:4092744/1‑93 (MQ=255)
ccGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTa > 2:459360/1‑93 (MQ=255)
gCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTAcc < 1:2522629/93‑1 (MQ=255)
cgctctTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCg < 1:4572928/91‑1 (MQ=255)
tctctTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCgg < 2:158850/93‑1 (MQ=255)
ctctTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCTATCCAGATCTCCGTACCGGt < 1:4411282/93‑1 (MQ=255)
ctTATCGTGCGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTCCTCGATGGTGGTTTCTACCCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGc < 2:5636295/93‑1 (MQ=255)
ctTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGc > 1:1728063/1‑93 (MQ=255)
ttATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCt > 2:5029228/1‑93 (MQ=255)
tATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCGCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTg < 1:3928358/93‑1 (MQ=255)
aTCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGa > 1:6187955/1‑93 (MQ=255)
tCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTAGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGAc > 1:4668262/1‑93 (MQ=255)
cGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGAcc < 1:6359084/93‑1 (MQ=255)
gTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCg > 1:1249381/1‑93 (MQ=255)
gTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCg > 1:3096306/1‑93 (MQ=255)
gTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCg > 1:5804965/1‑93 (MQ=255)
tACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGc < 1:4872303/93‑1 (MQ=255)
aCGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCt < 2:271656/93‑1 (MQ=255)
gCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTACCCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTAt < 2:4446260/93‑1 (MQ=255)
gCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTAt > 2:5515467/1‑93 (MQ=255)
cTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTAtt > 2:3826987/1‑93 (MQ=255)
tGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTAttt > 1:5084551/1‑93 (MQ=255)
ggTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTa > 1:746329/1‑93 (MQ=255)
ggTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTa > 2:1023621/1‑93 (MQ=255)
tgtTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATc < 1:5249326/93‑1 (MQ=255)
gtTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATcc > 2:2609053/1‑93 (MQ=255)
ttATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATccgc < 2:494573/93‑1 (MQ=255)
ttATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATccgc > 1:2808860/1‑93 (MQ=255)
aTCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATccgccg < 1:309772/93‑1 (MQ=255)
tCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCgt > 2:6146843/1‑93 (MQ=255)
tCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCgt > 2:2826768/1‑93 (MQ=255)
ccTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCgtg > 1:4360434/1‑93 (MQ=255)
ccTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCgtg < 2:6025857/93‑1 (MQ=255)
|
CCTGGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTG > NC_000913/419687‑419866
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CTGCCTGGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTAT > NC_000913/419684‑419869
|
CTGCCTGGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTT > SRR4302537.5426275/1‑94 (MQ=60)
CTGCCTGGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTT < SRR4302537.3431575/94‑1 (MQ=60)
TGCCTGGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTG > SRR4302537.4736011/1‑94 (MQ=60)
TGCCTGGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTG > SRR4302537.1748400/1‑94 (MQ=60)
GCCTGGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGG > SRR4302537.1487221/1‑94 (MQ=60)
CCTGGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGC < SRR4302537.2035221/94‑1 (MQ=60)
CTGGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCG < SRR4302537.3344344/94‑1 (MQ=60)
TGGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGG > SRR4302537.2853408/1‑94 (MQ=60)
TGGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGG < SRR4302537.3265580/94‑1 (MQ=60)
TGGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGG > SRR4302537.141637/1‑94 (MQ=60)
GGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGC > SRR4302537.4513734/1‑94 (MQ=60)
GGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGC > SRR4302537.1782533/1‑94 (MQ=60)
GTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCT < SRR4302537.1542914/94‑1 (MQ=60)
GAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTT < SRR4302537.1114267/94‑1 (MQ=60)
AACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTC > SRR4302537.2638310/1‑94 (MQ=60)
ACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCT < SRR4302537.3442877/94‑1 (MQ=60)
ACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCT > SRR4302537.2348325/1‑94 (MQ=60)
ACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGCACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCT < SRR4302537.2566893/94‑1 (MQ=60)
CGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTC < SRR4302537.284535/94‑1 (MQ=60)
CGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTC < SRR4302537.6012395/94‑1 (MQ=60)
CAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGAT < SRR4302537.938194/94‑1 (MQ=60)
CAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGAT > SRR4302537.4394013/1‑94 (MQ=60)
AGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATG > SRR4302537.5034887/1‑94 (MQ=60)
AGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATG < SRR4302537.4673555/94‑1 (MQ=60)
AGTGGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATG < SRR4302537.1544455/94‑1 (MQ=60)
TTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGT < SRR4302537.50802/94‑1 (MQ=60)
GCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGT < SRR4302537.188675/94‑1 (MQ=60)
CTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTT < SRR4302537.2225001/94‑1 (MQ=60)
TGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTC > SRR4302537.2857615/1‑94 (MQ=60)
GACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCT < SRR4302537.4761387/94‑1 (MQ=60)
GACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCT > SRR4302537.4353481/1‑94 (MQ=60)
GACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCT > SRR4302537.3518801/1‑94 (MQ=60)
ACCTGTGCTTGTGCGGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTA > SRR4302537.273566/1‑94 (MQ=60)
ACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTA > SRR4302537.518234/1‑94 (MQ=60)
CTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAAC < SRR4302537.3810716/94‑1 (MQ=60)
GTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCCAACCT > SRR4302537.5478896/1‑94 (MQ=60)
TGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTC < SRR4302537.3713292/94‑1 (MQ=60)
TGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTC < SRR4302537.2022376/94‑1 (MQ=60)
GCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCG > SRR4302537.5615674/1‑94 (MQ=60)
CTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGG > SRR4302537.3061560/1‑94 (MQ=60)
CTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGG > SRR4302537.2073240/1‑94 (MQ=60)
CTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGG > SRR4302537.5774829/1‑94 (MQ=60)
CTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGCTTCTAACCTCCG > SRR4302537.5060618/1‑94 (MQ=60)
TTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGC > SRR4302537.3940224/1‑94 (MQ=60)
TTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGC < SRR4302537.357941/94‑1 (MQ=60)
TGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCT > SRR4302537.470522/1‑94 (MQ=60)
TGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCT < SRR4302537.643188/94‑1 (MQ=60)
GTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTT < SRR4302537.5629028/94‑1 (MQ=60)
TGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTA > SRR4302537.3703521/1‑94 (MQ=60)
CAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAG > SRR4302537.1389508/1‑94 (MQ=60)
CAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAG > SRR4302537.422844/1‑94 (MQ=60)
CAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAG < SRR4302537.897770/94‑1 (MQ=60)
GAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCC > SRR4302537.6354163/1‑94 (MQ=60)
GAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCC < SRR4302537.3036045/94‑1 (MQ=60)
ATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAG < SRR4302537.4371321/94‑1 (MQ=60)
ATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAAACTCGGCTTAAGCCAG > SRR4302537.2678453/1‑94 (MQ=60)
TTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGC < SRR4302537.1876326/94‑1 (MQ=60)
TTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGC > SRR4302537.576099/1‑94 (MQ=60)
TTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGC < SRR4302537.4030920/94‑1 (MQ=60)
TCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCC > SRR4302537.4902759/1‑94 (MQ=60)
CTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCG > SRR4302537.627022/1‑94 (MQ=60)
CTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCG > SRR4302537.3666924/1‑94 (MQ=60)
CTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCG > SRR4302537.2677487/1‑94 (MQ=60)
TTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGGTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGA > SRR4302537.1595886/1‑94 (MQ=60)
TGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATC < SRR4302537.79286/94‑1 (MQ=60)
CCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAG < SRR4302537.2705075/94‑1 (MQ=60)
CAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGA > SRR4302537.2872300/1‑94 (MQ=60)
AGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGAT < SRR4302537.3670755/94‑1 (MQ=60)
AGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGAT > SRR4302537.3006485/1‑94 (MQ=60)
GTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATC > SRR4302537.6501755/1‑94 (MQ=60)
GTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATC > SRR4302537.1714675/1‑94 (MQ=60)
TACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGCTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGTCCATCCAGATCT > SRR4302537.5628856/1‑94 (MQ=60)
ACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGGTGGTGGgttttatccctcgctctattgacaccatacacacctc > SRR4302537.1610974/1‑57 (MQ=60)
GTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCG > SRR4302537.2722801/1‑94 (MQ=60)
GTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCG > SRR4302537.654531/1‑94 (MQ=60)
GTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCG < SRR4302537.1793039/94‑1 (MQ=60)
ACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTA > SRR4302537.5780957/1‑94 (MQ=60)
ACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTA < SRR4302537.4793329/94‑1 (MQ=60)
CGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACC > SRR4302537.3810896/1‑94 (MQ=60)
CGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACC < SRR4302537.1839386/94‑1 (MQ=60)
CGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACC < SRR4302537.2986802/94‑1 (MQ=60)
GCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCG < SRR4302537.2540340/94‑1 (MQ=60)
CTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGG > SRR4302537.4265386/1‑94 (MQ=60)
CGCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGG < SRR4302537.4604581/94‑1 (MQ=60)
CTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCTATCCAGATCTCCGTACCGGTG < SRR4302537.4441720/94‑1 (MQ=60)
TCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGC > SRR4302537.1740132/1‑94 (MQ=60)
TATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGA > SRR4302537.6230582/1‑94 (MQ=60)
TATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGA > SRR4302537.5465837/1‑94 (MQ=60)
TATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCGCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGA < SRR4302537.3955807/94‑1 (MQ=60)
ATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGAC > SRR4302537.4888694/1‑94 (MQ=60)
ATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTAGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGAC > SRR4302537.4700560/1‑94 (MQ=60)
TCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGTCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACC < SRR4302537.3402247/94‑1 (MQ=60)
TCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACC > SRR4302537.188191/1‑94 (MQ=60)
CGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCG < SRR4302537.6402473/94‑1 (MQ=60)
CGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCG > SRR4302537.5844771/1‑94 (MQ=60)
CGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCG > SRR4302537.1258081/1‑94 (MQ=60)
CGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCG > SRR4302537.2687086/1‑94 (MQ=60)
CGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCG > SRR4302537.3117915/1‑94 (MQ=60)
GTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGC < SRR4302537.4765983/94‑1 (MQ=60)
TACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCT < SRR4302537.4905930/94‑1 (MQ=60)
CGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTAT < SRR4302537.3685053/94‑1 (MQ=60)
CTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTT > SRR4302537.5119544/1‑94 (MQ=60)
TGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTA > SRR4302537.751420/1‑94 (MQ=60)
TGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCC < SRR4302537.5285450/94‑1 (MQ=60)
GTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCG < SRR4302537.2421105/94‑1 (MQ=60)
TTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGC < SRR4302537.2710004/94‑1 (MQ=60)
TTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGC > SRR4302537.2828495/1‑94 (MQ=60)
TTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCC > SRR4302537.3118820/1‑94 (MQ=60)
ATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGT < SRR4302537.311917/94‑1 (MQ=60)
TCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTG > SRR4302537.4390607/1‑94 (MQ=60)
CTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTA > SRR4302537.3147712/1‑94 (MQ=60)
TTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCCGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTAT < SRR4302537.1632404/94‑1 (MQ=60)
|
CTGCCTGGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTAT > NC_000913/419684‑419869
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
