Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
647 |
270.1 |
21258240 |
98.4% |
20918108 |
94.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
854,026 |
T→C |
intergenic (+38/+21) |
ybiR → / ← ybiS |
hypothetical protein/hypothetical protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 854,026 | 0 | T | C | 100.0%
| 802.7
/ NA
| 231 | intergenic (+38/+21) | ybiR/ybiS | hypothetical protein/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (122/109); total (122/109) |
Only 100 of 241 total aligned reads displayed.
TTGTGGGCGGCGTTGGTGGGATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCTTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCATCAAGAACAACCTGGTCAACATCT > NC_000913/853935‑854116
|
ttgtGGGCGGCGTTGGTGGGATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCctt > 2:4906989/1‑94 (MQ=255)
gtgtgGGCGGCGTTGGTGGGATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCctt < 1:6843893/93‑1 (MQ=255)
tgtgGGCGGCGTTGGTGGGATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCcttt < 2:6951182/94‑1 (MQ=255)
tgtgGGCGGCGTTGGTGGGATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCcttt < 1:49003/94‑1 (MQ=255)
gtgGGCGGCGTTGGTGGGATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTg < 1:1722579/94‑1 (MQ=255)
gtgGGCGCCCTTGGTGGGATATTTTTTCTTAGTCATCCTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAACAAAGCCGGATTATGAGTCCGCCCTTTg < 2:5481563/94‑1 (MQ=255)
gtggcgtcGTTGGTGGGATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGc < 1:323063/92‑1 (MQ=255)
gggCGGCGTTGGTGGGATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCt < 2:4708711/94‑1 (MQ=255)
gggCGGCGTTGGTGGGATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCt > 1:1457675/1‑94 (MQ=255)
ggcggcGTTGGTGGGATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCtt < 2:6815234/94‑1 (MQ=255)
ggcggcGTTGGTGGGATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCtt > 2:5542335/1‑94 (MQ=255)
ggcgTTGGTGGGATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTaa > 1:6190664/1‑94 (MQ=255)
ggcgTTGGTGGGATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTaa > 2:9679296/1‑94 (MQ=255)
gcgTTGGTGGGATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAg < 2:1648296/94‑1 (MQ=255)
gcgTTGGTGGGATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAg < 2:644478/94‑1 (MQ=255)
cgTTGGTGGGATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGt > 1:1166119/1‑94 (MQ=255)
gTTGGTGGGATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGtt < 1:601454/94‑1 (MQ=255)
gTTGGTGGGATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGtt > 1:9328342/1‑94 (MQ=255)
ttGGTGGGATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGttt < 1:6541275/94‑1 (MQ=255)
gtggGATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGa < 1:7945191/94‑1 (MQ=255)
gtggGATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGa > 1:4727946/1‑94 (MQ=255)
gggATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAg > 1:7344786/1‑94 (MQ=255)
gggATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAg < 2:3920893/94‑1 (MQ=255)
gggATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAg > 1:951605/1‑94 (MQ=255)
gggATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAg < 2:5751260/94‑1 (MQ=255)
gggATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAg > 2:4323327/1‑94 (MQ=255)
gggATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAg < 2:9398807/94‑1 (MQ=255)
gATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGAt > 1:8454227/1‑94 (MQ=255)
atatGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGCTTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGAtt > 2:809330/1‑94 (MQ=255)
tGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGCGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAAt > 2:10227136/1‑94 (MQ=255)
tGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAAt > 2:9816836/1‑94 (MQ=255)
tGTTTTGTTAGTAATACTCCCGGCCGACTGGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGAtcgat > 1:8991274/1‑90 (MQ=255)
gTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAAtt < 2:819306/94‑1 (MQ=255)
tttGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTGAGTTTTGAAGATTAATTCa < 2:7251063/94‑1 (MQ=255)
tttGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCa < 2:5948225/94‑1 (MQ=255)
gttagttaTACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGAc < 1:3727650/94‑1 (MQ=255)
gttagttaTACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGAc < 1:7920500/94‑1 (MQ=255)
tataCTCCCTGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACTAACCg < 1:8632208/94‑1 (MQ=255)
ataCTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCgg < 2:10494364/94‑1 (MQ=255)
taCTCCCGTCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGTTTAGGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGc < 1:4901198/94‑1 (MQ=255)
taCTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGc > 1:2557306/1‑94 (MQ=255)
taCTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGc > 2:3338071/1‑94 (MQ=255)
cTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCAt > 1:5691085/1‑94 (MQ=255)
cTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCAt < 2:6267581/94‑1 (MQ=255)
cTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCAt < 1:10163096/94‑1 (MQ=255)
cccGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATcc > 1:4315584/1‑94 (MQ=255)
ccGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATccc < 2:2293057/94‑1 (MQ=255)
cGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCg < 1:1920329/94‑1 (MQ=255)
gCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGa > 1:5900012/1‑94 (MQ=255)
ccAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAg > 1:3420034/1‑94 (MQ=255)
cAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGc > 2:8798683/1‑94 (MQ=255)
aaCTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCg > 1:7179989/1‑94 (MQ=255)
aaCTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCg > 2:1855049/1‑94 (MQ=255)
aCTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGGATCCCGGAGCgg < 2:975297/94‑1 (MQ=255)
aCTAGGGTCTGGCAAATAAAAAACGCGGATGATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCgg < 1:5836381/94‑1 (MQ=255)
aGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGttt < 2:8639010/94‑1 (MQ=255)
aGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGttt > 1:5051971/1‑94 (MQ=255)
tCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTaa < 2:5849921/94‑1 (MQ=255)
tCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTaa < 1:3356913/94‑1 (MQ=255)
cTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAAt > 1:2752691/1‑94 (MQ=255)
tGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATc > 2:10277165/1‑94 (MQ=255)
tGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATc < 2:2586192/94‑1 (MQ=255)
tGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATc > 1:8772484/1‑94 (MQ=255)
ggCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCg > 1:2178484/1‑94 (MQ=255)
ggCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCg < 2:6730734/94‑1 (MQ=255)
gCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGATTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGc < 2:9551190/94‑1 (MQ=255)
cAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCt > 1:3140407/1‑94 (MQ=255)
aaaTAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCtt > 2:3804050/1‑94 (MQ=255)
aaaTAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCtt > 2:7757727/1‑94 (MQ=255)
aaTAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTtc > 2:6633954/1‑94 (MQ=255)
aaTAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTtc < 1:9225299/94‑1 (MQ=255)
tAAAAAATGTGGATTATGAGTCCGACCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTtcat < 2:9327253/94‑1 (MQ=255)
tAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTtcat > 1:10094694/1‑94 (MQ=255)
aaaaaaGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTtcatc < 1:1441171/94‑1 (MQ=255)
aaaaaaGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTtcatc > 2:4548553/1‑94 (MQ=255)
aaaaaGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTtcatca < 1:10602802/94‑1 (MQ=255)
aaaGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCATCAAg < 2:3492462/94‑1 (MQ=255)
aGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCATCAAGaa > 2:9046639/1‑94 (MQ=255)
aGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCATCAAGaa > 1:8335187/1‑94 (MQ=255)
aGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCATCAAGaa > 1:670370/1‑94 (MQ=255)
gCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCATCAAGaaca < 2:2089272/94‑1 (MQ=255)
cGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCATCAAGaacaa > 1:10414460/1‑94 (MQ=255)
ggATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCATCAAGcacaac > 2:7972692/1‑94 (MQ=255)
ggATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCATCAAGaacaac < 2:2731456/94‑1 (MQ=255)
gATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCATCAAGAACAAcc < 2:4086597/94‑1 (MQ=255)
gATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCATCAAGAACAAcc > 2:5575029/1‑94 (MQ=255)
gATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCATCAAGAACAAcc < 1:206596/94‑1 (MQ=255)
aTTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCATCAAGAACAACCt > 2:10083479/1‑94 (MQ=255)
aTTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCATCAAGAACAACCt > 2:5569160/1‑94 (MQ=255)
tATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCATCAAGAACAACCTgg > 2:827822/1‑94 (MQ=255)
tATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCATCAAGAACAACCTgg > 1:9895192/1‑94 (MQ=255)
tATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCATCAAGAACAACCTgg > 1:10029901/1‑94 (MQ=255)
tATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCATCAAGAACAACCTgg > 1:5482766/1‑94 (MQ=255)
aTGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCATCAAGAACAACCTGGt < 2:7163279/94‑1 (MQ=255)
gAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCATCAAGAACAACCTGGTCa < 1:693594/94‑1 (MQ=255)
gAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCATCAAGAACAACCTGGTCa < 2:1474770/94‑1 (MQ=255)
aGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCATCAAGAACAACCTGGTCaa > 2:7654717/1‑94 (MQ=255)
gTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCATCAAGAACAACCTGGTCAAc > 1:1829975/1‑94 (MQ=255)
cGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCATCAAGAACAACCTGGTCAACATc > 2:5187938/1‑94 (MQ=255)
gCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCATCAAGAACAACCTGGTCAACATCt < 2:4731499/94‑1 (MQ=255)
|
TTGTGGGCGGCGTTGGTGGGATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCTTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCATCAAGAACAACCTGGTCAACATCT > NC_000913/853935‑854116
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
TGTTGTGGGCGGCGTTGGTGGGATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCTTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCATCAAGAACAACCTGGTCAACATCTGGC > NC_000913/853933‑854119
|
TGTTGTGGGCGGCGTTGGTGGGATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCC > SRR4302545.4624540/1‑94 (MQ=60)
TGTTGTGGGCGGCGTTGGTGGGATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCC > SRR4302545.1106535/1‑94 (MQ=60)
TGTTGTGGGCGGCGTTGGTGGGATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCC > SRR4302545.10626969/1‑94 (MQ=60)
TGTTGTGGGCGGCGTTGGTGGGATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCC > SRR4302545.7272751/1‑94 (MQ=60)
GTTGTGGGCGGCGTTGGTGGGATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCT < SRR4302545.10424361/94‑1 (MQ=60)
GTTGTGGGCGGCGTTGGTGGGATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCT > SRR4302545.10897729/1‑94 (MQ=60)
TTGTGGGCGGCGTTGGTGGGATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTT < SRR4302545.7031873/94‑1 (MQ=60)
TTGTGGGCGGCGTTGGTGGGATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTT < SRR4302545.1854253/94‑1 (MQ=60)
GTGTGGGCGGCGTTGGTGGGATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTT < SRR4302545.7031870/94‑1 (MQ=60)
TGTGGGCGGCGTTGGTGGGATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTT < SRR4302545.50126/94‑1 (MQ=60)
GTGGGCGGCGTTGGTGGGATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTG < SRR4302545.1763612/94‑1 (MQ=60)
GTGGGCGGCGTTGGTGGGATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTG < SRR4302545.10714504/94‑1 (MQ=60)
gtggcgtCGTTGGTGGGATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGC < SRR4302545.329923/87‑1 (MQ=60)
GGGCGGCGTTGGTGGGATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCT > SRR4302545.1491007/1‑94 (MQ=60)
GGCGGCGTTGGTGGGATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTT < SRR4302545.1975156/94‑1 (MQ=60)
CGGCGTTGGTGGGATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTA < SRR4302545.10720037/94‑1 (MQ=60)
CGGCGTTGGTGGGATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTA > SRR4302545.6214279/1‑94 (MQ=60)
GGCGTTGGTGGGATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAA > SRR4302545.6359137/1‑94 (MQ=60)
CGTTGGTGGGATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGT > SRR4302545.3015823/1‑94 (MQ=60)
CGTTGGTGGGATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGT > SRR4302545.1191891/1‑94 (MQ=60)
GTTGGTGGGATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTT < SRR4302545.615007/94‑1 (MQ=60)
GTTGGTGGGATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTT > SRR4302545.9601841/1‑94 (MQ=60)
TTGGTGGGATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTT < SRR4302545.6720225/94‑1 (MQ=60)
TGGTGGGATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTT > SRR4302545.6802836/1‑94 (MQ=60)
TGGTGGGATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTT > SRR4302545.8484407/1‑94 (MQ=60)
GTGGTATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGA < SRR4302545.8170945/94‑1 (MQ=60)
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GTGGGATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGA > SRR4302545.4848522/1‑94 (MQ=60)
GTGGGATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGA > SRR4302545.899374/1‑94 (MQ=60)
GGGATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAG > SRR4302545.7551029/1‑94 (MQ=60)
GGGATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAG > SRR4302545.972974/1‑94 (MQ=60)
GATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGAT > SRR4302545.1557744/1‑94 (MQ=60)
GATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGAT > SRR4302545.6259996/1‑94 (MQ=60)
GATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGAT > SRR4302545.8698594/1‑94 (MQ=60)
TGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAAT < SRR4302545.9842518/94‑1 (MQ=60)
TGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAAT < SRR4302545.4897423/94‑1 (MQ=60)
TGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAAT < SRR4302545.3341323/94‑1 (MQ=60)
TGTTTTGTTAGTAATACTCCCGGCCGACTGGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATcgat > SRR4302545.9253028/1‑90 (MQ=60)
TTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAG > SRR4302545.1690138/1‑94 (MQ=60)
TTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAG < SRR4302545.1955864/94‑1 (MQ=60)
GTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGAC < SRR4302545.8145381/94‑1 (MQ=60)
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GTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGAC < SRR4302545.3819285/94‑1 (MQ=60)
TAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGA > SRR4302545.10116592/1‑94 (MQ=60)
GTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAAC > SRR4302545.2451793/1‑94 (MQ=60)
GTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAAC > SRR4302545.5025341/1‑94 (MQ=60)
GTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAAC > SRR4302545.6799164/1‑94 (MQ=60)
TTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACC < SRR4302545.7259843/94‑1 (MQ=60)
TTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACC > SRR4302545.1488742/1‑94 (MQ=60)
TATACTCCCTGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACTAACCG < SRR4302545.8882522/94‑1 (MQ=60)
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CTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCAT > SRR4302545.5843378/1‑94 (MQ=60)
CTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCAT < SRR4302545.8697561/94‑1 (MQ=60)
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CCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAAGTCAGACGAACCGGCATCCCGGAG > SRR4302545.6005110/1‑94 (MQ=60)
AACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCG > SRR4302545.7379559/1‑94 (MQ=60)
AACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCG > SRR4302545.7379560/1‑94 (MQ=60)
ACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAACGCGGATGATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGG < SRR4302545.5993499/94‑1 (MQ=60)
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AGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTT > SRR4302545.5180458/1‑94 (MQ=60)
AGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTT > SRR4302545.4966718/1‑94 (MQ=60)
GTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTA > SRR4302545.7489834/1‑94 (MQ=60)
TCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAA > SRR4302545.3450712/1‑94 (MQ=60)
TCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAA < SRR4302545.3438842/94‑1 (MQ=60)
CTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAAT > SRR4302545.2819102/1‑94 (MQ=60)
TGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATC > SRR4302545.9027072/1‑94 (MQ=60)
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CAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCT > SRR4302545.3217774/1‑94 (MQ=60)
AATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTC < SRR4302545.9495762/94‑1 (MQ=60)
ATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCA < SRR4302545.6944724/94‑1 (MQ=60)
TAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCAT > SRR4302545.10393220/1‑94 (MQ=60)
TAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCAT > SRR4302545.10393219/1‑94 (MQ=60)
AAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCATC < SRR4302545.1473969/94‑1 (MQ=60)
AAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCATC < SRR4302545.1133642/94‑1 (MQ=60)
AAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCATCA < SRR4302545.10915007/94‑1 (MQ=60)
AAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCATCAA < SRR4302545.1304457/94‑1 (MQ=60)
AAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCATCAA < SRR4302545.1952526/94‑1 (MQ=60)
AAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCATCAAG < SRR4302545.4566940/94‑1 (MQ=60)
AAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCATCAAG < SRR4302545.5157290/94‑1 (MQ=60)
AAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTCCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGTCGAACCGGACTCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCATCAca > SRR4302545.2174586/1‑92 (MQ=60)
AAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCATCAAGA < SRR4302545.6168820/94‑1 (MQ=60)
AGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCATCAAGAA > SRR4302545.685302/1‑94 (MQ=60)
AGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCATCAAGAA > SRR4302545.8576718/1‑94 (MQ=60)
GGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCATCAAGAAC < SRR4302545.9540405/94‑1 (MQ=60)
CGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCATCAAGAACAA > SRR4302545.10721399/1‑94 (MQ=60)
GATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCATCAAGAACAACC > SRR4302545.2126066/1‑94 (MQ=60)
GATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCATCAAGAACAACC < SRR4302545.210895/94‑1 (MQ=60)
ATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCATCAAGAACAACCT > SRR4302545.758376/1‑94 (MQ=60)
TATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCATCAAGAACAACCTGG > SRR4302545.5585339/1‑94 (MQ=60)
TATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCATCAAGAACAACCTGG > SRR4302545.5626827/1‑94 (MQ=60)
TATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCATCAAGAACAACCTGG > SRR4302545.10327069/1‑94 (MQ=60)
TATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCATCAAGAACAACCTGG > SRR4302545.10189182/1‑94 (MQ=60)
TGAGTCCGACCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCATCAAGAACAACCTGGTC < SRR4302545.9776010/94‑1 (MQ=60)
GAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCATCAAGAACAACCTGGTCA < SRR4302545.709130/94‑1 (MQ=60)
AGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCATCAAGAACAACCTGGTCAA > SRR4302545.3450610/1‑94 (MQ=60)
GTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCATCAAGAACAACCTGGTCAAC > SRR4302545.1874437/1‑94 (MQ=60)
GTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTGGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCATCAAGAACAACCTGGTCAAC < SRR4302545.10734274/94‑1 (MQ=60)
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CGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCATCAAGAACAACCTGGTCAACATC > SRR4302545.3917137/1‑94 (MQ=60)
GCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCATCAAGAACAACCTGGTCAACATCT < SRR4302545.8939054/94‑1 (MQ=60)
CCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCATCAAGAACAACCTGGTCAACATCTG > SRR4302545.544248/1‑94 (MQ=60)
CCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCATCAAGAACAACCTGGTCAACATCTGG > SRR4302545.8874245/1‑94 (MQ=60)
CCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCATCAAGAACAACCTGGTCAACATCTGG > SRR4302545.324655/1‑94 (MQ=60)
CTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCATCAAGAACAACCTGGTCAACATCTGGC < SRR4302545.8326184/94‑1 (MQ=60)
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TGTTGTGGGCGGCGTTGGTGGGATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCTTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCATCAAGAACAACCTGGTCAACATCTGGC > NC_000913/853933‑854119
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
