Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
882 |
254.4 |
12957588 |
98.0% |
12698436 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
854,026 |
T→C |
intergenic (+38/+21) |
ybiR → / ← ybiS |
hypothetical protein/hypothetical protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 854,026 | 0 | T | C | 99.5%
| 642.7
/ NA
| 183 | intergenic (+38/+21) | ybiR/ybiS | hypothetical protein/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (80/102); minor base A (0/1); total (80/103) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 197 total aligned reads displayed.
TGTGGGCGGCGTTGGTGGGATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCTTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCATCAAGAACAACCTGGTCAACATCTGG > NC_000913/853936‑854118
|
tgtgGGCGGCGTTGGTGGGATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCctt < 2:2959346/93‑1 (MQ=255)
tgtgGGCGGCGTTGGTGGGATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCctt < 2:3349900/93‑1 (MQ=255)
gtgGGCGGCGTTGGTGGGATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCcttt < 1:477360/93‑1 (MQ=255)
gtgGGCGGCGTTGGTGGGATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCcttt < 2:3778106/93‑1 (MQ=255)
gtgGGCGGCGTTGGTGGGATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCcttt < 1:5051097/93‑1 (MQ=255)
tgGGCGGCGTTGGTGGGATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGACCTTTg < 1:1309420/93‑1 (MQ=255)
tgGGCGGCGTTGGTGGGATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGACTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTg > 2:1068457/1‑93 (MQ=255)
gggCGGCGTTGGTGGGATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGc < 1:5228496/93‑1 (MQ=255)
gggCGGCGTTGGTGGGATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGc < 2:3831464/93‑1 (MQ=255)
gggCGGCGTTGGTGGGATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGc < 1:6032084/93‑1 (MQ=255)
ggcggcGTTGGTGGGATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCt < 2:4943115/93‑1 (MQ=255)
gcggcgTTGGTGGGATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCtt < 2:3718407/93‑1 (MQ=255)
cggcgTTGGTGGGATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCttt < 1:876368/93‑1 (MQ=255)
cggcgTTGGTGGGATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCttt < 2:389494/93‑1 (MQ=255)
ggcgTTGGTGGGATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTa > 2:5227017/1‑93 (MQ=255)
gTTGGTGGGATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGt < 1:5066263/93‑1 (MQ=255)
gTTGGTGGGATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGt > 2:3486145/1‑93 (MQ=255)
gTTGGTGGGATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGt < 1:1258083/93‑1 (MQ=255)
ttGGTGGGATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATTAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGtt < 1:2181746/93‑1 (MQ=255)
ttGGTGGGATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGtt < 2:62973/93‑1 (MQ=255)
tggtggGATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGttt < 1:569202/93‑1 (MQ=255)
tggtggGATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGttt < 1:2669221/93‑1 (MQ=255)
ggtggGATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGtttt < 2:432684/93‑1 (MQ=255)
gtggGATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTg > 2:1620362/1‑93 (MQ=255)
ggATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAg > 2:6428480/1‑93 (MQ=255)
gATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGa > 1:586327/1‑93 (MQ=255)
gATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGa > 2:5068865/1‑93 (MQ=255)
gATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGa > 2:1756165/1‑93 (MQ=255)
atatGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGAt < 1:390020/93‑1 (MQ=255)
atatGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGAt < 1:4656299/93‑1 (MQ=255)
tatGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGAtt > 1:4578271/1‑93 (MQ=255)
tatGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGAtt < 2:821604/93‑1 (MQ=255)
atGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTa < 1:2127822/93‑1 (MQ=255)
tGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTaa > 1:4932676/1‑93 (MQ=255)
tGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTaa > 1:1778131/1‑93 (MQ=255)
gTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAAt < 1:2596473/93‑1 (MQ=255)
gTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAAt < 1:5363366/93‑1 (MQ=255)
ttttGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAAtt > 2:511302/1‑93 (MQ=255)
tttGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTc < 2:4778103/93‑1 (MQ=255)
ttGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCa < 1:4903957/93‑1 (MQ=255)
tGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAg < 2:1856739/93‑1 (MQ=255)
gttagttaTACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGa < 2:5640136/93‑1 (MQ=255)
tagttaTACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACg > 1:4687084/1‑93 (MQ=255)
tagttaTACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACg < 1:1506970/93‑1 (MQ=255)
agttaTACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGa > 1:5332824/1‑93 (MQ=255)
gttaTACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGCTTAATTCAGACGaa > 1:2340313/1‑93 (MQ=255)
ttaTACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAAc < 2:3334719/93‑1 (MQ=255)
ttaTACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAAc < 2:1977468/93‑1 (MQ=255)
ttaTACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAAc < 2:1503554/93‑1 (MQ=255)
tataCTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAAcc < 2:4230737/93‑1 (MQ=255)
tataCTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAAcc < 1:6159631/93‑1 (MQ=255)
tataCTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAAcc > 2:6174697/1‑93 (MQ=255)
tataCTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAAcc > 1:3497721/1‑93 (MQ=255)
ataCTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCg < 2:4830459/93‑1 (MQ=255)
taCTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCgg > 1:3945618/1‑93 (MQ=255)
aCTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGc < 1:4180889/93‑1 (MQ=255)
cTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCa > 1:2786997/1‑93 (MQ=255)
cTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCa > 1:5776437/1‑93 (MQ=255)
ccGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATcc < 2:5696988/93‑1 (MQ=255)
cAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAg > 1:5492803/1‑93 (MQ=255)
cAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAg < 2:760902/93‑1 (MQ=255)
aaCTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGc < 1:1615809/93‑1 (MQ=255)
aCTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCg > 2:5838028/1‑93 (MQ=255)
aCTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCg > 1:6070640/1‑93 (MQ=255)
aCTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCg > 2:2358310/1‑93 (MQ=255)
cTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCgg < 2:3552497/93‑1 (MQ=255)
aGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGtt < 2:974289/93‑1 (MQ=255)
aGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGtt < 1:1092476/93‑1 (MQ=255)
tCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTa < 1:1854522/93‑1 (MQ=255)
tCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTa < 2:6020813/93‑1 (MQ=255)
ttGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTaa < 1:3139290/92‑1 (MQ=255)
cTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTaa < 2:3532186/93‑1 (MQ=255)
cTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTaa > 2:677299/1‑93 (MQ=255)
tGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAAt < 2:2037712/93‑1 (MQ=255)
ggCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCTCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATc < 2:3771538/93‑1 (MQ=255)
gCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCg > 2:5592931/1‑93 (MQ=255)
cAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGc < 2:6432024/93‑1 (MQ=255)
aaTAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCtt < 1:2498939/93‑1 (MQ=255)
tAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTtca > 2:669950/1‑93 (MQ=255)
aaaaaaGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTtcat > 1:3568099/1‑93 (MQ=255)
aaaaGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTtcatca < 1:1136669/93‑1 (MQ=255)
aaaGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCATCaa < 2:3140557/93‑1 (MQ=255)
aaaGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCATCaa < 2:3060349/93‑1 (MQ=255)
aGGCGGATTATGAGCCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCATCAAGa < 2:1431270/93‑1 (MQ=255)
ggCGGGTTAGGGGTCCCCCCTTTGCTTTACGGTTTGAAGATTAATTCAGCGGAACCGGCATGCAGGAGCGGATTTTAATCGCCACAGCAAgca > 2:4067730/1‑91 (MQ=255)
ggCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCATCAAGaa < 2:4496282/93‑1 (MQ=255)
gCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCATCAAGaac < 2:1730631/93‑1 (MQ=255)
ggATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCATCAAGaacaa > 2:6465180/1‑93 (MQ=255)
gATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCATCAAGaacaac > 1:5626018/1‑93 (MQ=255)
ttATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCATCAAGAACAACCt > 1:2856239/1‑93 (MQ=255)
ttATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCATCAAGAACAACCt < 1:3050295/93‑1 (MQ=255)
tATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCATCAAGAACAACCTg > 2:4670721/1‑93 (MQ=255)
aTGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCATCAAGAACAACCTgg < 1:302690/93‑1 (MQ=255)
gAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCATCAAGAACAACCTGGTc < 1:560878/93‑1 (MQ=255)
gTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGGTTTTAATCGCTTCATCAAGAACAACCTGGTCaa > 2:113510/1‑93 (MQ=255)
tCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCATCAAGAACAACCTGGTCAAc > 1:4010850/1‑93 (MQ=255)
gCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCATCAAGAACAACCTGGTCAACATc > 1:2236156/1‑93 (MQ=255)
gCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCATCAAGAACAACCTGGTCAACATc < 1:3258501/93‑1 (MQ=255)
gCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCATCAAGAACAACCTGGTCAACATc < 1:657701/93‑1 (MQ=255)
gCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCATCAAGAACAACCTGGTCAACATc < 2:3605007/93‑1 (MQ=255)
|
TGTGGGCGGCGTTGGTGGGATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCTTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCATCAAGAACAACCTGGTCAACATCTGG > NC_000913/853936‑854118
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
TGTTGTGGGCGGCGTTGGTGGGATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCTTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCATCAAGAACAACCTGGTCAACATCTGG > NC_000913/853933‑854118
|
TGTTGTGGGCGGCGTTGGTGGGATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCC > SRR4302537.4053900/1‑94 (MQ=60)
GTTGTGGGCGGCGTTGGTGGGATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCT < SRR4302537.3095114/94‑1 (MQ=60)
GTTGTGGGCGGCGTTGGTGGGATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCT < SRR4302537.2682346/94‑1 (MQ=60)
GTTGTGGGCGGCGTTGGTGGGATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCT > SRR4302537.2482482/1‑94 (MQ=60)
TGTGGGCGGCGTTGGTGGGATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTT > SRR4302537.2142129/1‑94 (MQ=60)
TGTGGGCGGCGTTGGTGGGATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTT < SRR4302537.1232364/94‑1 (MQ=60)
GTGGGCGGCGTTGGTGGGATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTG < SRR4302537.480622/94‑1 (MQ=60)
GTGGGCGGCGTTGGTGGGATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTG > SRR4302537.2728407/1‑94 (MQ=60)
GTGGGCGGCGTTGGTGGGATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTG < SRR4302537.5085874/94‑1 (MQ=60)
TGGGCGGCGTTGGTGGGATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGACCTTTGC < SRR4302537.1318536/94‑1 (MQ=60)
GGGCGGCGTTGGTGGGATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCT < SRR4302537.6073532/94‑1 (MQ=60)
GGGCGGCGTTGGTGGGATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCT < SRR4302537.5264453/94‑1 (MQ=60)
GCGGCGTTGGTGGGATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTT < SRR4302537.5846198/94‑1 (MQ=60)
CGGCGTTGGTGGGATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTA < SRR4302537.882397/94‑1 (MQ=60)
GCGTTGGTGGGATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAG < SRR4302537.5563182/94‑1 (MQ=60)
GCGTTGGTGGGATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAG < SRR4302537.5652628/94‑1 (MQ=60)
GTTGGTGGGATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTT < SRR4302537.2405724/94‑1 (MQ=60)
GTTGGTGGGATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTT < SRR4302537.5101140/94‑1 (MQ=60)
GTTGGTGGGATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTT < SRR4302537.1266841/94‑1 (MQ=60)
TTGGTGGGATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATTAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTT < SRR4302537.2197113/94‑1 (MQ=60)
TGGTGGGATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTT < SRR4302537.573113/94‑1 (MQ=60)
TGGTGGGATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTT < SRR4302537.2687867/94‑1 (MQ=60)
TGGGATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAA > SRR4302537.130188/1‑94 (MQ=60)
GGATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGA > SRR4302537.590329/1‑94 (MQ=60)
GGATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGA < SRR4302537.1330675/94‑1 (MQ=60)
ATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATT < SRR4302537.4688490/94‑1 (MQ=60)
ATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATT < SRR4302537.392715/94‑1 (MQ=60)
ATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATT > SRR4302537.4609950/1‑94 (MQ=60)
ATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAA > SRR4302537.6093123/1‑94 (MQ=60)
ATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAA < SRR4302537.2142787/94‑1 (MQ=60)
ATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAA > SRR4302537.1790519/1‑94 (MQ=60)
ATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAA > SRR4302537.4966674/1‑94 (MQ=60)
GTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATT < SRR4302537.2614636/94‑1 (MQ=60)
GTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATT < SRR4302537.5400078/94‑1 (MQ=60)
TTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTC < SRR4302537.5270325/94‑1 (MQ=60)
TTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTC < SRR4302537.5784664/94‑1 (MQ=60)
TTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCA > SRR4302537.4945576/1‑94 (MQ=60)
TTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAG < SRR4302537.915686/94‑1 (MQ=60)
TTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAG < SRR4302537.4937806/94‑1 (MQ=60)
TGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTACGTCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGA > SRR4302537.2325666/1‑94 (MQ=60)
GTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGAC < SRR4302537.2158522/94‑1 (MQ=60)
TTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACG > SRR4302537.4719509/1‑94 (MQ=60)
TAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGA > SRR4302537.5369399/1‑94 (MQ=60)
TAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGA < SRR4302537.1517485/94‑1 (MQ=60)
AGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGCTTAATTCAGACGAA > SRR4302537.2356805/1‑94 (MQ=60)
GTTATCCTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAAC < SRR4302537.2921552/94‑1 (MQ=60)
GTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAAC < SRR4302537.2807831/94‑1 (MQ=60)
TTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACC > SRR4302537.3522467/1‑94 (MQ=60)
TATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCG < SRR4302537.6202021/94‑1 (MQ=60)
TATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCG > SRR4302537.657617/1‑94 (MQ=60)
ATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGG > SRR4302537.3973217/1‑94 (MQ=60)
ACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCA < SRR4302537.4210072/94‑1 (MQ=60)
ACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCA > SRR4302537.3095790/1‑94 (MQ=60)
ACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCA > SRR4302537.5816033/1‑94 (MQ=60)
ACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCA > SRR4302537.2806487/1‑94 (MQ=60)
CCCGGCCAACTAGTGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCC < SRR4302537.6006948/94‑1 (MQ=60)
CCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAG > SRR4302537.5530299/1‑94 (MQ=60)
AACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCG > SRR4302537.6112349/1‑94 (MQ=60)
AACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCG < SRR4302537.1627096/94‑1 (MQ=60)
AACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCG > SRR4302537.5382683/1‑94 (MQ=60)
ACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGG > SRR4302537.3371052/1‑94 (MQ=60)
ACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGG > SRR4302537.1742711/1‑94 (MQ=60)
ACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGG > SRR4302537.3068228/1‑94 (MQ=60)
ACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGG > SRR4302537.5701624/1‑94 (MQ=60)
CTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGT > SRR4302537.2234368/1‑94 (MQ=60)
AGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTT < SRR4302537.1100019/94‑1 (MQ=60)
GTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTA > SRR4302537.5489368/1‑94 (MQ=60)
GTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTA > SRR4302537.77141/1‑94 (MQ=60)
GTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTA > SRR4302537.3577569/1‑94 (MQ=60)
TCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAA < SRR4302537.1867417/94‑1 (MQ=60)
TTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAAT < SRR4302537.3161324/94‑1 (MQ=60)
GGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCG < SRR4302537.6194211/94‑1 (MQ=60)
AAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTT > SRR4302537.4736408/1‑94 (MQ=60)
AATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTC < SRR4302537.2516523/94‑1 (MQ=60)
AATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTC > SRR4302537.5119672/1‑94 (MQ=60)
AATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTC < SRR4302537.4689112/94‑1 (MQ=60)
ATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCA < SRR4302537.4684930/94‑1 (MQ=60)
TAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCAT > SRR4302537.3593260/1‑94 (MQ=60)
AAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCATC < SRR4302537.3634631/94‑1 (MQ=60)
AAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCATCA > SRR4302537.506456/1‑94 (MQ=60)
AAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCATCA > SRR4302537.2630244/1‑94 (MQ=60)
AAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCATCAA > SRR4302537.400056/1‑94 (MQ=60)
AAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCATCAA < SRR4302537.4408423/94‑1 (MQ=60)
AAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCATCAA < SRR4302537.1144566/94‑1 (MQ=60)
AAAGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCATCAAG > SRR4302537.4891534/1‑94 (MQ=60)
AGGCGGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCATCAAGAA < SRR4302537.1806993/94‑1 (MQ=60)
GGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCATCAAGAACAAC > SRR4302537.5664491/1‑94 (MQ=60)
GGATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCATCAAGAACAAC < SRR4302537.4169518/94‑1 (MQ=60)
ATTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCATCAAGAACAACCT > SRR4302537.2876265/1‑94 (MQ=60)
TTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCATCAAGAACAACCTG < SRR4302537.3071548/94‑1 (MQ=60)
TTATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCATCAAGAACAACCTG > SRR4302537.325679/1‑94 (MQ=60)
TATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCATCAAGAACAACCTGG < SRR4302537.2607876/94‑1 (MQ=60)
ATGAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCATCAAGAACAACCTGGT < SRR4302537.304798/94‑1 (MQ=60)
GAGTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCATCAAGAACAACCTGGTCA < SRR4302537.564740/94‑1 (MQ=60)
GTCCGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCATCAAGAACAACCTGGTCAAC > SRR4302537.4038938/1‑94 (MQ=60)
CGCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCATCAAGAACAACCTGGTCAACATC > SRR4302537.2251926/1‑94 (MQ=60)
GCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCATCAAGAACAACCTGGTCAACATCT < SRR4302537.3281477/94‑1 (MQ=60)
GCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCATCAAGAACAACCTGGTCAACATCT < SRR4302537.3969647/94‑1 (MQ=60)
GCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCATCAAGAACAACCTGGTCAACATCT < SRR4302537.662183/94‑1 (MQ=60)
GCCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCATCAAGAACAACCTGGTCAACATCT > SRR4302537.1648038/1‑94 (MQ=60)
CCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCATCAAGAACAACCTGGTCAACATCTG > SRR4302537.4059637/1‑94 (MQ=60)
CCCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATGCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCATCAAGAACAACCTGGTCAACATCTG < SRR4302537.4224465/94‑1 (MQ=60)
CTTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCATCAAGAACAACCTGGTCAACATCTGG > SRR4302537.1544284/1‑94 (MQ=60)
CCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCATCAAGAACAACCTGGTCAACATCTGG > SRR4302537.5973078/1‑94 (MQ=60)
CCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCATCAAGAACAACCTGGTCAACATCTGG < SRR4302537.674026/94‑1 (MQ=60)
CCTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATACAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCATCAAGAACAACCTGGTCAACATCTGG < SRR4302537.3079163/94‑1 (MQ=60)
|
TGTTGTGGGCGGCGTTGGTGGGATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATGAGTCCGCCTTTTGCTTTAAGTTTTGAAGATTAATTCAGACGAACCGGCATCCCGGAGCGGTTTTTAATCGCTTCATCAAGAACAACCTGGTCAACATCTGG > NC_000913/853933‑854118
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
