Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
647 |
270.1 |
21258240 |
98.4% |
20918108 |
94.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,102,336 |
A→G |
W66R (TGG→CGG) |
wbbK ← |
putative glucose transferase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,102,336 | 0 | A | G | 99.5%
| 647.2
/ ‑5.4
| 186 | W66R (TGG→CGG) | wbbK | putative glucose transferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); new base G (113/72); total (114/72) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 |
Only 100 of 189 total aligned reads displayed.
GTAATATCATGCAGACAAATCCAATGCGTAGCATTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCACGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGGACTAATGCGATAAAACT > NC_000913/2102245‑2102426
|
gTAATATCATGCAGACAAATCCAATGCGTAGCATTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCcgcg > 2:7583885/1‑94 (MQ=255)
cATGCAGACAAATCCAATGCGTAGCATTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCttt > 2:288204/1‑94 (MQ=255)
tGCAGACAAATCCAATGCGTAGCATTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTaa < 2:271520/94‑1 (MQ=255)
gCAGACAAATCCAATGCGTAGCATTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAAc > 2:3311463/1‑94 (MQ=255)
aGACAAATCCAATGCGTAGCATTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCt > 2:8876671/1‑94 (MQ=255)
gACAAATCCAATGCGTAGCATTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTc < 1:7037382/94‑1 (MQ=255)
cAAATCCAATGCGTAGCATTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAg > 1:10123079/1‑94 (MQ=255)
aaaTCCAATGCGTAGCATTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAgg > 2:7639049/1‑94 (MQ=255)
aTCCAATGCGTAGCATTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGaa > 1:4663955/1‑94 (MQ=255)
aTCCAATGCGTAGCATTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGaa > 2:1008390/1‑94 (MQ=255)
cAATGCGTAGCATTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACt < 2:127154/94‑1 (MQ=255)
aaTGCGTAGCATTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTc > 2:3001736/1‑94 (MQ=255)
gCGTAGCATTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAAt > 1:8032473/1‑94 (MQ=255)
cGTAGCATTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATg > 2:9027596/1‑94 (MQ=255)
cGTAGCATTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATg > 2:112888/1‑94 (MQ=255)
gTAGCATTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGa > 1:3058799/1‑94 (MQ=255)
gTAGCATTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGa > 2:2361669/1‑94 (MQ=255)
cATTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAAttt > 2:212493/1‑94 (MQ=255)
aTTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTa < 1:3547294/94‑1 (MQ=255)
aTTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTa > 1:3710370/1‑94 (MQ=255)
aTTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTa < 1:8519877/94‑1 (MQ=255)
aTTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTa > 2:502971/1‑94 (MQ=255)
ttCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTaa > 2:454303/1‑94 (MQ=255)
ttCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTaa > 1:1553263/1‑94 (MQ=255)
ttCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTaa < 1:5353459/94‑1 (MQ=255)
cAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAAcc < 1:10108989/94‑1 (MQ=255)
aGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAAccc > 1:4347785/1‑94 (MQ=255)
aGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAAccc < 1:4229644/94‑1 (MQ=255)
ctctTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCAt < 2:205108/94‑1 (MQ=255)
ctctTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCAt > 1:7781973/1‑94 (MQ=255)
tctTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATg > 2:4384226/1‑94 (MQ=255)
tctTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATg < 2:349174/94‑1 (MQ=255)
ctTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGACACTCAATGAATTTAACCCATgg > 1:5296692/1‑94 (MQ=255)
ctTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATgg > 1:2666811/1‑94 (MQ=255)
ttttGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGa < 2:4213130/94‑1 (MQ=255)
tttGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGAt > 1:9026629/1‑94 (MQ=255)
ttGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATa < 1:7868595/94‑1 (MQ=255)
tGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATaa > 1:2102570/1‑94 (MQ=255)
tGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATaa > 1:8774472/1‑94 (MQ=255)
gAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAAc > 2:9693120/1‑94 (MQ=255)
gAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAAc > 2:3788591/1‑94 (MQ=255)
aaaGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAAct > 2:6096106/1‑94 (MQ=255)
aaaGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAAct > 1:1050517/1‑94 (MQ=255)
aGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAActtt > 1:336539/1‑94 (MQ=255)
gTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAActttc < 2:6754108/94‑1 (MQ=255)
gTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAActttc > 2:8219724/1‑94 (MQ=255)
ttttttACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAAgtttct > 2:6075434/1‑94 (MQ=255)
tttttACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAActttctt < 1:70726/94‑1 (MQ=255)
tttttACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATCAATTTAACCCATGGATAActttctt < 1:1333685/94‑1 (MQ=255)
tttACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCtttt > 1:932470/1‑94 (MQ=255)
ttACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTa > 1:2413739/1‑94 (MQ=255)
aCAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAAc > 2:10457734/1‑94 (MQ=255)
aCAAACTACATATTCAAAGTACAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTCACCCATGGATAACTTTCTTTTAAc < 1:9075902/94‑1 (MQ=255)
aaaCTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAActt > 2:2590775/1‑93 (MQ=255)
aaaCTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAAACTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAActt > 2:9621182/1‑93 (MQ=255)
aCTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCtt < 2:9632039/94‑1 (MQ=255)
cTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCttt > 1:9437082/1‑94 (MQ=255)
cTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCttt > 2:2095636/1‑94 (MQ=255)
cTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCttt < 1:3423882/94‑1 (MQ=255)
tACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTa < 1:5962414/94‑1 (MQ=255)
aCATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAg > 1:2921037/1‑94 (MQ=255)
cATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGc > 2:5589251/1‑94 (MQ=255)
cATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGc < 2:9862722/94‑1 (MQ=255)
cATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGc > 2:3279719/1‑94 (MQ=255)
atatTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCa > 2:730885/1‑94 (MQ=255)
atatTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCa > 1:3768588/1‑94 (MQ=255)
tatTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAg > 2:9329446/1‑94 (MQ=255)
tatTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAg > 1:7968084/1‑94 (MQ=255)
tatTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAg < 2:10570725/94‑1 (MQ=255)
atTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGa > 1:5204593/1‑94 (MQ=255)
ttCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAAGTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGaa > 1:7218833/1‑94 (MQ=255)
tCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAAt < 1:2849872/94‑1 (MQ=255)
tCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAAt < 2:7773443/94‑1 (MQ=255)
cAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATg > 2:1544905/1‑94 (MQ=255)
aaaGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGTAGAATgg > 2:1587082/1‑94 (MQ=255)
aaaGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATgg < 2:9526810/94‑1 (MQ=255)
aGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGGAc > 2:4735646/1‑94 (MQ=255)
gTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGGACt < 1:1811040/94‑1 (MQ=255)
gTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGGACt < 1:9101857/94‑1 (MQ=255)
gTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGGACt < 1:5356997/94‑1 (MQ=255)
gTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGGACt > 1:866358/1‑94 (MQ=255)
gTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGGACt < 2:8140970/94‑1 (MQ=255)
tGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGGACTa > 1:5451836/1‑94 (MQ=255)
tGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGGACTa > 1:6204509/1‑94 (MQ=255)
gCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGGACTaa < 2:4934315/94‑1 (MQ=255)
gCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGGACTaa > 2:10284047/1‑94 (MQ=255)
cAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGGACTAAt > 2:4389122/1‑94 (MQ=255)
cAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGGACTAAt > 2:8311394/1‑94 (MQ=255)
aaaCGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGGACTAATg > 2:4427242/1‑94 (MQ=255)
aCGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGGACTAATGCg < 1:5605522/94‑1 (MQ=255)
cGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGGACTAATGCGa < 1:363039/94‑1 (MQ=255)
gTTTTAGCCGCGACTCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGGACTAATGCGAt > 2:339249/1‑94 (MQ=255)
gTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGGACTAATGCGAt > 1:4444552/1‑94 (MQ=255)
gTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGGACTAATGCGAt > 1:6084363/1‑94 (MQ=255)
gTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGGACTAATGCGAt > 1:1341352/1‑94 (MQ=255)
ttttAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGGACTAATGCGATa > 1:10037472/1‑94 (MQ=255)
tttAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGGACTAATGCGATaa > 1:9732077/1‑94 (MQ=255)
ttAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGGACTAATGCGATaaa < 1:4048771/94‑1 (MQ=255)
tAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGGACTAATGCGATaaaa < 2:6374209/94‑1 (MQ=255)
gCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGGACTAATGCGATAAAACt < 2:584852/94‑1 (MQ=255)
|
GTAATATCATGCAGACAAATCCAATGCGTAGCATTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCACGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGGACTAATGCGATAAAACT > NC_000913/2102245‑2102426
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CCGTAATATCATGCAGACAAATCCAATGCGTAGCATTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCACGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGGACTAATGCGATAAAACTGAC > NC_000913/2102243‑2102429
|
CCGTAATATCATGCAGACAAATCCAATGCGTAGCATTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCG > SRR4302545.5172693/1‑94 (MQ=60)
CCGTAATATCATGCAGACAAATCCAATGCGTAGCATTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCG > SRR4302545.3501263/1‑94 (MQ=60)
CCGTAATATCATGCAGACAAATCCAATGCGTAGCATTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCG > SRR4302545.3501262/1‑94 (MQ=60)
CCGTAATATCATGCAGACAAATCCAATGCGTAGCATTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCG < SRR4302545.8594338/94‑1 (MQ=60)
CGTAATATCATGCAGACAAATCCAATGCGTAGCATTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGC > SRR4302545.3485661/1‑94 (MQ=60)
CGTAATATCATGCAGACAAATCCAATGCGTAGCATTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGC > SRR4302545.6020245/1‑94 (MQ=60)
TAATATCATGCAGACAAATCCAATGCGTAGCATTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGA > SRR4302545.2031236/1‑94 (MQ=60)
TGCAGACAAATCCAATGCGTAGCATTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAA > SRR4302545.9598566/1‑94 (MQ=60)
GACAAATCCAATGCGTAGCATTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTC < SRR4302545.4160500/94‑1 (MQ=60)
GACAAATCCAATGCGTAGCATTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTC < SRR4302545.7231745/94‑1 (MQ=60)
GACAAATCCAATGCGTAGCATTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTC < SRR4302545.7231747/94‑1 (MQ=60)
CAAATCCAATGCGTAGCATTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAG > SRR4302545.10422437/1‑94 (MQ=60)
ATCCAATGCGTAGCATTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAA > SRR4302545.4783038/1‑94 (MQ=60)
CCAATGCGTAGCATTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAAC < SRR4302545.10409497/94‑1 (MQ=60)
CAATGCGTAGCATTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACT < SRR4302545.7188126/94‑1 (MQ=60)
TGCGTAGCATTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAA < SRR4302545.4137941/94‑1 (MQ=60)
GCGTAGCATTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAAT > SRR4302545.810070/1‑94 (MQ=60)
GCGTAGCATTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAAT > SRR4302545.8261329/1‑94 (MQ=60)
GTAGCATTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGA > SRR4302545.3133799/1‑94 (MQ=60)
CATTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTT > SRR4302545.8958957/1‑94 (MQ=60)
ATTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTA < SRR4302545.3634079/94‑1 (MQ=60)
ATTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTA > SRR4302545.10749359/1‑94 (MQ=60)
ATTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTA > SRR4302545.3273265/1‑94 (MQ=60)
ATTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTA > SRR4302545.3801422/1‑94 (MQ=60)
ATTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTA < SRR4302545.8766030/94‑1 (MQ=60)
TTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAA > SRR4302545.2375189/1‑94 (MQ=60)
TTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAA < SRR4302545.5492576/94‑1 (MQ=60)
TTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAA < SRR4302545.6141904/94‑1 (MQ=60)
TTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAA > SRR4302545.1589785/1‑94 (MQ=60)
CAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACC < SRR4302545.10407981/94‑1 (MQ=60)
AGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCC > SRR4302545.9249902/1‑94 (MQ=60)
AGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCC < SRR4302545.4335341/94‑1 (MQ=60)
AGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCC > SRR4302545.4457544/1‑94 (MQ=60)
GCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCA < SRR4302545.6334179/94‑1 (MQ=60)
CTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCAT > SRR4302545.1228668/1‑94 (MQ=60)
CTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCAT > SRR4302545.8002263/1‑94 (MQ=60)
CTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGACACTCAATGAATTTAACCCATGG > SRR4302545.5433893/1‑94 (MQ=60)
CTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGG > SRR4302545.5433892/1‑94 (MQ=60)
CTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGG < SRR4302545.5719436/94‑1 (MQ=60)
CTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGG > SRR4302545.2731067/1‑94 (MQ=60)
TTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGA > SRR4302545.8297611/1‑94 (MQ=60)
TTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGAT > SRR4302545.9289623/1‑94 (MQ=60)
TTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGAT > SRR4302545.1838905/1‑94 (MQ=60)
TTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATA < SRR4302545.8091824/94‑1 (MQ=60)
TTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATA > SRR4302545.8232837/1‑94 (MQ=60)
TGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAA > SRR4302545.3119354/1‑94 (MQ=60)
TGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAA > SRR4302545.2982413/1‑94 (MQ=60)
TGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAA > SRR4302545.2154239/1‑94 (MQ=60)
TGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAA > SRR4302545.9029114/1‑94 (MQ=60)
AAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACT > SRR4302545.1073389/1‑94 (MQ=60)
AGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTT > SRR4302545.343709/1‑94 (MQ=60)
AGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTT < SRR4302545.9731550/94‑1 (MQ=60)
AGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCACGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTT > SRR4302545.9302418/1‑94 (MQ=60)
TTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCT < SRR4302545.8033325/94‑1 (MQ=60)
TTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCT > SRR4302545.10070435/1‑94 (MQ=60)
TTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCT > SRR4302545.3655960/1‑94 (MQ=60)
TTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTT < SRR4302545.72311/94‑1 (MQ=60)
TTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATCAATTTAACCCATGGATAACTTTCTT < SRR4302545.1363379/94‑1 (MQ=60)
TTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTT > SRR4302545.953376/1‑94 (MQ=60)
TTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTT < SRR4302545.3568236/94‑1 (MQ=60)
TTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTA > SRR4302545.2472238/1‑94 (MQ=60)
TACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAA > SRR4302545.7357330/1‑94 (MQ=60)
ACAAACTACATATTCAAAGTACAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTCACCCATGGATAACTTTCTTTTAAC < SRR4302545.9341263/94‑1 (MQ=60)
ACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTT < SRR4302545.5987858/94‑1 (MQ=60)
ACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTT > SRR4302545.4343532/1‑94 (MQ=60)
CTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTT < SRR4302545.3507537/94‑1 (MQ=60)
CTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTT > SRR4302545.1364535/1‑94 (MQ=60)
CTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTT > SRR4302545.9714354/1‑94 (MQ=60)
TACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTA < SRR4302545.2874239/94‑1 (MQ=60)
TACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTA < SRR4302545.6123259/94‑1 (MQ=60)
TACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTA > SRR4302545.5435055/1‑94 (MQ=60)
ACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAG > SRR4302545.446377/1‑94 (MQ=60)
ACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAG > SRR4302545.2991954/1‑94 (MQ=60)
ACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAG < SRR4302545.372480/94‑1 (MQ=60)
CATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGC < SRR4302545.5104949/94‑1 (MQ=60)
ATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCA > SRR4302545.3861612/1‑94 (MQ=60)
TATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAG > SRR4302545.8194604/1‑94 (MQ=60)
ATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGA > SRR4302545.5338665/1‑94 (MQ=60)
TTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAAGTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAA > SRR4302545.7420140/1‑94 (MQ=60)
TCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAAT < SRR4302545.2918771/94‑1 (MQ=60)
AAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGG > SRR4302545.9438931/1‑94 (MQ=60)
AAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGG < SRR4302545.1583894/94‑1 (MQ=60)
GTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGGACT < SRR4302545.9368670/94‑1 (MQ=60)
GTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGGACT < SRR4302545.1854904/94‑1 (MQ=60)
GTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGGACT < SRR4302545.5496220/94‑1 (MQ=60)
GTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGGACT > SRR4302545.885793/1‑94 (MQ=60)
TGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGGACTA > SRR4302545.6373384/1‑94 (MQ=60)
TGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGGACTA > SRR4302545.5594602/1‑94 (MQ=60)
CAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGGACTAAT < SRR4302545.3481715/94‑1 (MQ=60)
CAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGGACTAAT < SRR4302545.4614519/94‑1 (MQ=60)
ACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGGACTAATGCG < SRR4302545.5754290/94‑1 (MQ=60)
ACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGGACTAATGCG > SRR4302545.5581395/1‑94 (MQ=60)
CGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGGACTAATGCGA < SRR4302545.370956/94‑1 (MQ=60)
GTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGGACTAATGCGAT > SRR4302545.1371233/1‑94 (MQ=60)
GTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGGACTAATGCGAT > SRR4302545.4557756/1‑94 (MQ=60)
GTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGGACTAATGCGAT > SRR4302545.6249611/1‑94 (MQ=60)
TTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGGACTAATGCGATA > SRR4302545.10334771/1‑94 (MQ=60)
TTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGGACTAATGCGATAA > SRR4302545.10021830/1‑94 (MQ=60)
TTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGGACTAATGCGATAAA < SRR4302545.8769262/94‑1 (MQ=60)
TTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGGACTAATGCGATAAA < SRR4302545.4150138/94‑1 (MQ=60)
CGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGGACTAATGCGATAAAACTGA > SRR4302545.106168/1‑94 (MQ=60)
GCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGGACTAATGCGATAAAACTGAC < SRR4302545.2275676/94‑1 (MQ=60)
GCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGGACTAATGCGATAAAACTGAC < SRR4302545.5308860/94‑1 (MQ=60)
|
CCGTAATATCATGCAGACAAATCCAATGCGTAGCATTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCACGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGGACTAATGCGATAAAACTGAC > NC_000913/2102243‑2102429
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
