Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
882 |
254.4 |
12957588 |
98.0% |
12698436 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,102,336 |
A→G |
W66R (TGG→CGG) |
wbbK ← |
putative glucose transferase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,102,336 | 0 | A | G | 100.0%
| 695.3
/ NA
| 197 | W66R (TGG→CGG) | wbbK | putative glucose transferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (113/84); total (113/84) |
Only 100 of 198 total aligned reads displayed.
AATATCATGCAGACAAATCCAATGCGTAGCATTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCACGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGGACTAATGCGATAAAAC > NC_000913/2102247‑2102425
|
aaTATCATGCAGACAAATCCAATGCGTAGCATTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGa > 1:1582399/1‑93 (MQ=255)
atatCATGCAGACAAATCCAATGCGTAGCATTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGAc < 2:5623304/93‑1 (MQ=255)
tatCATGCAGACAAATCCAATGCGTAGCATTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGAcc > 1:2048851/1‑93 (MQ=255)
atCATGCAGACAAATCCAATGCGTAGCATTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGAccc < 1:2357400/93‑1 (MQ=255)
gACAAATCCAATGCGTAGCATTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCt > 1:2509994/1‑93 (MQ=255)
aCAAATCCAATGCGTAGCATTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTc < 2:5738253/93‑1 (MQ=255)
aCAAATCCAATGCGTAGCATTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTc > 2:4997147/1‑93 (MQ=255)
cAAATCCAATGCGTAGCATTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCa < 2:2184668/93‑1 (MQ=255)
aaTCCAATGCGTAGCATTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAgg > 2:4700780/1‑93 (MQ=255)
aaTCCAATGCGTAGCATTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAgg > 1:2103289/1‑93 (MQ=255)
tCCAATGCGTAGCATTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGaa < 1:870535/93‑1 (MQ=255)
tCCAATGCGTAGCATTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGaa > 2:4863960/1‑93 (MQ=255)
cAATGCGTAGCATTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAAc < 1:4275997/93‑1 (MQ=255)
cAATGCGTAGCATTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAAc > 2:5329926/1‑93 (MQ=255)
aaTGCGTAGCATTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACt > 1:1150926/1‑93 (MQ=255)
aaTGCGTAGCATTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACt > 1:2931989/1‑93 (MQ=255)
aTGCGTAGCATTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTc > 2:4420340/1‑93 (MQ=255)
gTAGCATTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATg > 2:5862794/1‑93 (MQ=255)
gTAGCATTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATg > 2:1938195/1‑93 (MQ=255)
gTAGCATTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATg > 2:2574958/1‑93 (MQ=255)
gTAGCATTCAGCTCTTTTGAAAGCTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGACGCGACCCTTTAACCTCAGCATACTCAAta > 1:3604916/1‑92 (MQ=255)
tAGCATTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGa > 2:5426122/1‑93 (MQ=255)
tAGCATTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGa > 2:3631296/1‑93 (MQ=255)
gCATTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAAt > 2:1016323/1‑93 (MQ=255)
gCATTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAAt < 2:5849997/93‑1 (MQ=255)
cATTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAAtt < 2:694496/93‑1 (MQ=255)
aTTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAAttt < 1:631460/93‑1 (MQ=255)
aTTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAAttt > 1:744557/1‑93 (MQ=255)
ctctTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCa < 1:1616981/93‑1 (MQ=255)
ctTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATg > 2:3516588/1‑93 (MQ=255)
ctTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATg > 2:2798307/1‑93 (MQ=255)
ctTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATg < 2:2312326/93‑1 (MQ=255)
ttttGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATgg > 2:5546495/1‑93 (MQ=255)
tttGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGa < 1:4158481/93‑1 (MQ=255)
tttGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGa > 2:3996926/1‑93 (MQ=255)
ttGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGAt > 1:2228262/1‑93 (MQ=255)
tGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATa > 1:4513373/1‑93 (MQ=255)
gAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATaa < 1:3537316/93‑1 (MQ=255)
gAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATaa < 2:4402223/93‑1 (MQ=255)
aaaGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAAc > 2:4677696/1‑93 (MQ=255)
aaGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAAct > 2:3992877/1‑93 (MQ=255)
aaGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAAct < 2:826765/93‑1 (MQ=255)
gTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAActtt < 2:3684033/93‑1 (MQ=255)
tttttACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGCTAActttct > 1:1571011/1‑93 (MQ=255)
tttttACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAActttct > 2:6353245/1‑93 (MQ=255)
tttACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATATctttcttt < 2:6311080/93‑1 (MQ=255)
tttACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAActttcttt > 2:2932009/1‑93 (MQ=255)
ttACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCtttt > 2:3548041/1‑93 (MQ=255)
aCAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTaa < 2:5030141/93‑1 (MQ=255)
aaaCTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAAct < 1:664034/93‑1 (MQ=255)
aaaCTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAAct < 1:3321254/93‑1 (MQ=255)
aaaCTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAAct > 2:1784840/1‑93 (MQ=255)
aaCTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAActc < 1:3946514/93‑1 (MQ=255)
aCTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAActct > 2:1441623/1‑93 (MQ=255)
aCTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAActct < 1:4027242/93‑1 (MQ=255)
aCTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAActct < 1:939449/93‑1 (MQ=255)
tACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCttt < 2:1089427/93‑1 (MQ=255)
aCATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTa > 2:1625083/1‑93 (MQ=255)
cATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAg > 1:1710065/1‑93 (MQ=255)
cATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAg > 1:2954770/1‑93 (MQ=255)
atatTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGc < 2:6059780/93‑1 (MQ=255)
atTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAg > 2:539421/1‑93 (MQ=255)
atTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAg > 1:6433974/1‑93 (MQ=255)
atTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAg > 2:2963832/1‑93 (MQ=255)
atTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAg > 2:182679/1‑93 (MQ=255)
ttCAAAGTGCAAACTTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGa > 1:3119260/1‑93 (MQ=255)
ttCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGa > 1:229085/1‑93 (MQ=255)
ttCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGa < 1:4658586/93‑1 (MQ=255)
ttCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAAATTTCTTTTAACTCTTTAGCAGa > 1:1813280/1‑93 (MQ=255)
tCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGaa < 1:4771466/93‑1 (MQ=255)
cAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAAt > 1:5807085/1‑93 (MQ=255)
cAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAAt < 1:1129302/93‑1 (MQ=255)
aaaGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATg < 1:3406747/93‑1 (MQ=255)
aaaGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATg > 2:4151465/1‑93 (MQ=255)
aaaGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATg < 2:336737/93‑1 (MQ=255)
aaaGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATg < 1:5366614/93‑1 (MQ=255)
gTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGGAc < 1:1212324/93‑1 (MQ=255)
gTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGGAc > 2:1065897/1‑93 (MQ=255)
gTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGGAc > 1:1857702/1‑93 (MQ=255)
tGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGGACt < 2:5986062/93‑1 (MQ=255)
tGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGGACt > 2:3120576/1‑93 (MQ=255)
tGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGGACt > 2:2494313/1‑93 (MQ=255)
aaaCGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGGACTAAt < 2:1571458/93‑1 (MQ=255)
aaaCGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGGACTAAt < 2:2699159/93‑1 (MQ=255)
aaaCGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGGACTAAt < 2:5831415/93‑1 (MQ=255)
aaaCGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACGCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGGACTAAt < 2:4273151/93‑1 (MQ=255)
aaCGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGGACTAATg > 2:136913/1‑93 (MQ=255)
aCGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGGACTAATGc > 1:5469261/1‑93 (MQ=255)
cGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGGACTAATGCg < 1:4852642/93‑1 (MQ=255)
gTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCTATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGGACTAATGCGa < 1:4189856/93‑1 (MQ=255)
gTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGGACTAATGCGa > 2:1542462/1‑93 (MQ=255)
ttttAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGGACTAATGCGAt > 1:2437723/1‑93 (MQ=255)
ttttAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGGACTAATGCGAt > 2:5254828/1‑93 (MQ=255)
ttttAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGGACTAATGCGAt > 1:1308906/1‑93 (MQ=255)
ttAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGGACTAATGCGATaa > 1:2690325/1‑93 (MQ=255)
ttAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGGACTAATGCGATaa < 2:4245183/93‑1 (MQ=255)
tAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGGACTAATGCGATaaa > 2:3299152/1‑93 (MQ=255)
aGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGGACTAATGCGATaaaa < 2:5201941/93‑1 (MQ=255)
gCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGGACTAATGCGATAAAAc > 1:1665721/1‑93 (MQ=255)
gCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGGACTAATGCGATAAAAc < 1:2882244/93‑1 (MQ=255)
|
AATATCATGCAGACAAATCCAATGCGTAGCATTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCACGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGGACTAATGCGATAAAAC > NC_000913/2102247‑2102425
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CCGTAATATCATGCAGACAAATCCAATGCGTAGCATTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCACGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGGACTAATGCGATAAAACTGAC > NC_000913/2102243‑2102429
|
CCGTAATATCATGCAGACAAATCCAATGCGTAGCATTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCG < SRR4302537.2716921/94‑1 (MQ=60)
CCGTAATATCATGCAGACAAATCCAATGCGTAGCATTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCC > SRR4302537.4481560/1‑94 (MQ=60)
CGTAATATCATGCAGACAAATCCAATGCGTAGCATTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACCAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGC > SRR4302537.6283545/1‑94 (MQ=60)
CGTAATATCATGCAGACAAATCCAATGCGTAGCATTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGC > SRR4302537.3512027/1‑94 (MQ=60)
GTAATATCATGCAGACAAATCCAATGCGTAGCATTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCG < SRR4302537.2913611/94‑1 (MQ=60)
TAATATCATGCAGACAAATCCAATGCGTAGCATTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGA > SRR4302537.1593461/1‑94 (MQ=60)
TAATATCATGCAGACAAATCCAATGCGTAGCATTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGA > SRR4302537.1686501/1‑94 (MQ=60)
TAATATCATGCAGACAAATCCAATGCGTAGCATTCAGCTCTTTAGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGA > SRR4302537.3481722/1‑94 (MQ=60)
AATATCATGCAGACAAATCCAATGCGTAGCATTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGAC > SRR4302537.6510948/1‑94 (MQ=60)
ATATCATGCAGACAAATCCAATGCGTAGCATTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACC > SRR4302537.2063218/1‑94 (MQ=60)
ATCATGCAGACAAATCCAATGCGTAGCATTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCT < SRR4302537.2374028/94‑1 (MQ=60)
TGCAGACAAATCCAATGCGTAGCATTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAA > SRR4302537.2966132/1‑94 (MQ=60)
AGACAAATCCAATGCGTAGCATTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCT > SRR4302537.2527649/1‑94 (MQ=60)
AAATCCAATGCGTAGCATTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGG > SRR4302537.2118119/1‑94 (MQ=60)
AAATCCAATGCGTAGCATTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGG > SRR4302537.2269477/1‑94 (MQ=60)
TCCAATGCGTAGCATTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAA < SRR4302537.876514/94‑1 (MQ=60)
CAATGCGTAGCATTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACT > SRR4302537.293240/1‑94 (MQ=60)
CAATGCGTAGCATTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACT > SRR4302537.2952577/1‑94 (MQ=60)
CAATGCGTAGCATTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACT < SRR4302537.4305714/94‑1 (MQ=60)
CAATGCGTAGCATTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACT > SRR4302537.1158927/1‑94 (MQ=60)
ATGCGTAGCATTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCA > SRR4302537.3711921/1‑94 (MQ=60)
CGTAGCATTCAGCTCTTTTGAAAGCTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGACGCGACCCTTTAACCTCAGCATACTCAATA > SRR4302537.3630322/1‑94 (MQ=60)
GTAGCATTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGA > SRR4302537.1643568/1‑94 (MQ=60)
GTAGCATTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGA > SRR4302537.2323325/1‑94 (MQ=60)
CATTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTT > SRR4302537.4267532/1‑94 (MQ=60)
CATTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTT > SRR4302537.749632/1‑94 (MQ=60)
ATTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTA < SRR4302537.635752/94‑1 (MQ=60)
ATTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTA > SRR4302537.1865689/1‑94 (MQ=60)
CAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACC < SRR4302537.978161/94‑1 (MQ=60)
CAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACC > SRR4302537.943336/1‑94 (MQ=60)
AGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCC < SRR4302537.3426187/94‑1 (MQ=60)
CTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCAT < SRR4302537.1628276/94‑1 (MQ=60)
CTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGG > SRR4302537.3129963/1‑94 (MQ=60)
CTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGG > SRR4302537.4436783/1‑94 (MQ=60)
TTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGAT < SRR4302537.4187520/94‑1 (MQ=60)
TTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGAT > SRR4302537.2243975/1‑94 (MQ=60)
TTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATA > SRR4302537.4544581/1‑94 (MQ=60)
TGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAA > SRR4302537.5758756/1‑94 (MQ=60)
GAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAAC < SRR4302537.3562303/94‑1 (MQ=60)
GTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTC > SRR4302537.4193452/1‑94 (MQ=60)
TTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGCTAACTTTCT > SRR4302537.1581973/1‑94 (MQ=60)
TTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTT > SRR4302537.5989633/1‑94 (MQ=60)
TTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTT > SRR4302537.3323295/1‑94 (MQ=60)
TTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTA > SRR4302537.3566467/1‑94 (MQ=60)
TACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAA < SRR4302537.1585071/94‑1 (MQ=60)
TACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAA < SRR4302537.2088312/94‑1 (MQ=60)
ACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAAC < SRR4302537.6471514/94‑1 (MQ=60)
ACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAAC < SRR4302537.1199071/94‑1 (MQ=60)
AAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTC < SRR4302537.3344747/94‑1 (MQ=60)
AAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTC < SRR4302537.668556/94‑1 (MQ=60)
AACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCT > SRR4302537.853082/1‑94 (MQ=60)
AACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCT > SRR4302537.695867/1‑94 (MQ=60)
AACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCT < SRR4302537.2754317/94‑1 (MQ=60)
AACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCT < SRR4302537.3974119/94‑1 (MQ=60)
AACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTATAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCT > SRR4302537.4702394/1‑94 (MQ=60)
ACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTT < SRR4302537.4055435/94‑1 (MQ=60)
ACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTT < SRR4302537.945929/94‑1 (MQ=60)
ACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAG > SRR4302537.1722010/1‑94 (MQ=60)
ACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAG > SRR4302537.2975504/1‑94 (MQ=60)
CATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTGAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGC < SRR4302537.48278/94‑1 (MQ=60)
ATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCA > SRR4302537.4169119/1‑94 (MQ=60)
TATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAG > SRR4302537.6477667/1‑94 (MQ=60)
TATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAA > SRR4302537.4966852/1‑94 (MQ=60)
ATTCAAAGTGCAAACTTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGA > SRR4302537.3141060/1‑94 (MQ=60)
ATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGA > SRR4302537.230706/1‑94 (MQ=60)
ATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGA > SRR4302537.1262761/1‑94 (MQ=60)
ATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAAATTTCTTTTAACTCTTTAGCAGA > SRR4302537.1825920/1‑94 (MQ=60)
TTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAA < SRR4302537.4690793/94‑1 (MQ=60)
TCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAAT < SRR4302537.4804411/94‑1 (MQ=60)
TCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAAT > SRR4302537.5846907/1‑94 (MQ=60)
CAAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATG < SRR4302537.1137138/94‑1 (MQ=60)
AAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGG < SRR4302537.5403334/94‑1 (MQ=60)
AAAGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGG < SRR4302537.3430881/94‑1 (MQ=60)
AGTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGGAC > SRR4302537.1870641/1‑94 (MQ=60)
GTGCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGGACT < SRR4302537.1220758/94‑1 (MQ=60)
GCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGGACTAA < SRR4302537.2477878/94‑1 (MQ=60)
GCAAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGGACTAA > SRR4302537.3980686/1‑94 (MQ=60)
AAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGGACTAATG > SRR4302537.1778982/1‑94 (MQ=60)
AAACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGGACTAATG > SRR4302537.1335868/1‑94 (MQ=60)
AACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGGACTAATGC > SRR4302537.5472327/1‑94 (MQ=60)
AACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGGACTAATGC > SRR4302537.5506568/1‑94 (MQ=60)
ACGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGGACTAATGCG < SRR4302537.4661322/94‑1 (MQ=60)
CGTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGGACTAATGCGA < SRR4302537.4886120/94‑1 (MQ=60)
GTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCTATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGGACTAATGCGAT < SRR4302537.4219123/94‑1 (MQ=60)
GTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGGACTAATGCGAT > SRR4302537.1318018/1‑94 (MQ=60)
GTTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGGACTAATGCGAT > SRR4302537.2454895/1‑94 (MQ=60)
TTTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGGACTAATGCGATA < SRR4302537.2662935/94‑1 (MQ=60)
TTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGGACTAATGCGATAA < SRR4302537.2425414/94‑1 (MQ=60)
TTTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGGACTAATGCGATAA > SRR4302537.2709098/1‑94 (MQ=60)
TTAGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGGACTAATGCGATAAA < SRR4302537.1621838/94‑1 (MQ=60)
AGCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGGACTAATGCGATAAAAC > SRR4302537.1677392/1‑94 (MQ=60)
AGCCGAGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGGACTAATGCGATAAAAC > SRR4302537.3991409/1‑94 (MQ=60)
GCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGGACTAATGCGATAAAACT < SRR4302537.2902473/94‑1 (MQ=60)
GCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGGACTAATGCGATAAAACT < SRR4302537.218098/94‑1 (MQ=60)
GCCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTACCAGAATGGACTAATGCGATAAAACT > SRR4302537.962641/1‑94 (MQ=60)
GCCGCGACCCTTTAACCTCAGCAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGGACTAATGCGATAAAACT < SRR4302537.206244/94‑1 (MQ=60)
CCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGGACTAATGCGATAAAACTG < SRR4302537.5053996/94‑1 (MQ=60)
CCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGGACTAATGCGATAAAACTG < SRR4302537.4151930/94‑1 (MQ=60)
CCGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGGACTAATGAGATAAAACTG > SRR4302537.6039689/1‑94 (MQ=60)
CGCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGGACTAATGCGATAAAACCGA > SRR4302537.5139310/1‑94 (MQ=60)
GCGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGGACTAATGCGATAAAACTGAC < SRR4302537.4997378/94‑1 (MQ=60)
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CCGTAATATCATGCAGACAAATCCAATGCGTAGCATTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATATTCAAAGTGCAAACGTTTTAGCCACGACCCTTTAACCTCAGGAAACTCAATGAATTTAACCCATGGATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGGACTAATGCGATAAAACTGAC > NC_000913/2102243‑2102429
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
