Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
647 |
270.1 |
21258240 |
98.4% |
20918108 |
94.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,751,091 |
G→C |
A426P (GCT→CCT) |
recN → |
RecN |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,751,091 | 0 | G | C | 100.0%
| 1064.0
/ NA
| 302 | A426P (GCT→CCT) | recN | RecN |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base C (162/140); total (162/140) |
Only 100 of 313 total aligned reads displayed.
CGATGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATT‑GAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGGCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAACCCCGGCAC > NC_000913/2751000‑2751181
|
cgatGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATT‑GTGCTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCt > 2:5271383/1‑94 (MQ=255)
cgatGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATT‑GAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCt > 2:4233905/1‑94 (MQ=255)
cgatGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATT‑GAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCt > 2:6101970/1‑94 (MQ=255)
cgatGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATT‑GAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCt > 1:365934/1‑94 (MQ=255)
gatGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATT‑GAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTa > 2:2611698/1‑94 (MQ=255)
atGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATT‑GAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTAt < 2:4728224/94‑1 (MQ=255)
atGTTAAATTTAACGAGCATCGCCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATT‑GAGTTTCGGGTAACCCCCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTAt < 1:5536597/94‑1 (MQ=255)
tGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATT‑GAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTAtt > 2:7366292/1‑94 (MQ=255)
tttAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATT‑GAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTg < 1:3512946/93‑1 (MQ=255)
gTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATT‑GAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTg < 2:9240217/94‑1 (MQ=255)
gTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATT‑GAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTg < 1:6809832/94‑1 (MQ=255)
gTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATT‑GAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCAAATGCAGCCTAttc > 2:207962/1‑93 (MQ=255)
ttAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATT‑GAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGc < 2:9076675/94‑1 (MQ=255)
ttAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATT‑GAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGc > 1:1837380/1‑94 (MQ=255)
tAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATT‑GAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGcc > 2:3118520/1‑94 (MQ=255)
tttGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATT‑GAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAg < 2:434254/94‑1 (MQ=255)
tttGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATT‑GAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAg > 1:7236568/1‑94 (MQ=255)
tttGACGAGCATCACCTGGG‑GCTGGCGGGGCCGATCGGATTGGGGTTTCGGGAACCCACCAA‑CCAGGGCAGGCAATGCAACCTATTGGCAAAGt > 2:5683552/1‑94 (MQ=255)
gACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATT‑GAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCg < 2:9639414/94‑1 (MQ=255)
gCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATT‑GAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATcc < 2:1384228/94‑1 (MQ=255)
gCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATT‑GAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATcc < 2:5082084/94‑1 (MQ=255)
cATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATT‑GAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCg > 1:4877444/1‑94 (MQ=255)
aTCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATT‑GAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCgg > 1:10558177/1‑94 (MQ=255)
aTCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATT‑GAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCgg < 2:1233864/94‑1 (MQ=255)
aTCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATT‑GAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCgg < 1:2148607/94‑1 (MQ=255)
cACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATT‑GAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCggtg < 2:2770549/94‑1 (MQ=255)
cACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATT‑GAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCggtg > 2:1046145/1‑94 (MQ=255)
cccTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATT‑GAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCggtgg < 2:9811407/93‑1 (MQ=255)
tGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATT‑GAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGgaga > 2:6555856/1‑94 (MQ=255)
tGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATT‑GAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGa > 2:8919894/1‑94 (MQ=255)
tGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATT‑GAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCCGTGGTGa > 1:2402462/1‑94 (MQ=255)
gggCGCTGACGGTGCCGATCGTATT‑GAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGaa < 1:8806671/94‑1 (MQ=255)
ggCGCTGACGGTGCCGATCGTATT‑GAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAAt < 1:8241058/94‑1 (MQ=255)
cgcTGACGGTTCCGAACGTACT‑GAGTTTCGGGAAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATGGCCAAAGTCCCATCCGGTGGTGAATTg > 1:5632786/1‑94 (MQ=255)
gcTGACGGTGCCGATCGTATT‑GAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGt > 2:9835267/1‑94 (MQ=255)
cTGACGGTGCCGATCGTATT‑GAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTc < 1:1326387/94‑1 (MQ=255)
tGACGGTGCCGATCGTATT‑GAGTTTCCGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCTTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTcc < 2:1106015/94‑1 (MQ=255)
ggACGGTGCCGATCGTATT‑GAGGTTCGGGTAACCACCAACCCAGGGCAGCCAATGCAGCCCATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGCGAATTGGcc > 1:9411471/2‑94 (MQ=255)
gACGGTGCCGATCGTATT‑GAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTccc < 1:63757/94‑1 (MQ=255)
gACGGTGCCGATCGTATT‑GAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTccc < 2:2248505/94‑1 (MQ=255)
aCGGTGCCGATCGTATT‑GAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCg > 2:4021704/1‑94 (MQ=255)
tGCCGATCGTATT‑GAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCCTc > 1:3959107/1‑94 (MQ=255)
tGCCGATCGTATT‑GAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATc > 2:3832612/1‑94 (MQ=255)
ccGATCGTATT‑GAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGc > 1:9265572/1‑94 (MQ=255)
cGATCGTATT‑GAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCa > 2:2407080/1‑94 (MQ=255)
aTCGTATT‑GAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCATAGTCGCATCCGGTGGTGCATTGTCCCGCATCGCACt > 1:9932700/1‑94 (MQ=255)
aTCGTATT‑GAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACt > 1:8141553/1‑94 (MQ=255)
tCGTATT‑GAGTTTCGCGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTg < 2:8567737/94‑1 (MQ=255)
tATT‑GAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCa > 1:10239629/1‑94 (MQ=255)
tATT‑GAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCa > 1:4290078/1‑94 (MQ=255)
tATT‑GAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCa > 1:520966/1‑94 (MQ=255)
tATT‑GAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCa < 1:5424902/94‑1 (MQ=255)
aTT‑GAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCaa > 2:7851743/1‑94 (MQ=255)
tt‑GAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAAt > 2:776974/1‑94 (MQ=255)
gAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATcc < 1:5638972/94‑1 (MQ=255)
gAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATcc > 1:6694202/1‑94 (MQ=255)
gTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAg > 1:4434412/1‑94 (MQ=255)
gTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAg < 1:10507619/94‑1 (MQ=255)
ttCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGt < 1:738944/94‑1 (MQ=255)
cGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGtca < 2:1019086/94‑1 (MQ=255)
gTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGtcatca < 1:696676/94‑1 (MQ=255)
tAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCAc > 2:71739/1‑94 (MQ=255)
aaCCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACg > 1:8721741/1‑94 (MQ=255)
accaccAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACgg > 2:10352526/1‑94 (MQ=255)
accaccAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACgg > 1:3225518/1‑94 (MQ=255)
ccaccaACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGgc < 2:8218911/94‑1 (MQ=255)
ccaccaACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGgc > 1:9754476/1‑94 (MQ=255)
ccaccaACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGgc < 2:6743076/94‑1 (MQ=255)
ccaccaACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGgc < 1:62996/94‑1 (MQ=255)
ccaccaACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGgc > 1:8549474/1‑94 (MQ=255)
caccaACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGgcg < 1:5812200/94‑1 (MQ=255)
accaACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGgcgc > 2:8407187/1‑94 (MQ=255)
caACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGt > 2:3513256/1‑94 (MQ=255)
ccAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTaaaa > 2:1264336/1‑94 (MQ=255)
ccAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTaaaa > 1:5778805/1‑94 (MQ=255)
ccAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTaaaa > 2:1331602/1‑94 (MQ=255)
ccAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTaaaa < 1:2847235/94‑1 (MQ=255)
cAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAAt < 1:1527929/94‑1 (MQ=255)
cAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAAt < 2:10122411/94‑1 (MQ=255)
cAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAAt < 2:6492045/94‑1 (MQ=255)
cAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAAt > 1:7527762/1‑94 (MQ=255)
cAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAAt < 2:30550/94‑1 (MQ=255)
cAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAAt < 2:493319/94‑1 (MQ=255)
aGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATg > 1:7477032/1‑94 (MQ=255)
aGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATg > 1:10044013/1‑94 (MQ=255)
gTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGa > 2:1906870/1‑94 (MQ=255)
tCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGaa < 2:6948574/94‑1 (MQ=255)
cAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGaaa > 1:4648114/1‑94 (MQ=255)
aGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAAc < 2:4441718/94‑1 (MQ=255)
aGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAAc > 2:7598152/1‑94 (MQ=255)
aGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAAc < 1:3003354/94‑1 (MQ=255)
gCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAAcc < 1:438990/94‑1 (MQ=255)
cAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAAcccc > 2:1722109/1‑94 (MQ=255)
cAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAAcccc > 1:9160799/1‑94 (MQ=255)
aaTGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAACCCCg < 2:7238238/94‑1 (MQ=255)
aTGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAACCCCgg < 2:5814265/94‑1 (MQ=255)
aTGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAACCCCgg < 1:3398994/94‑1 (MQ=255)
aTGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAACCCCgg < 1:10414330/94‑1 (MQ=255)
cAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAACCCCGGCAc < 1:7854462/94‑1 (MQ=255)
cAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACGGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAACCCCGGCAc > 1:2643626/1‑94 (MQ=255)
|
CGATGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATT‑GAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGGCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAACCCCGGCAC > NC_000913/2751000‑2751181
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
ATCGATGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGGCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAACCCCGGCACTGA > NC_000913/2750998‑2751184
|
ATCGATGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGC < SRR4302545.177578/94‑1 (MQ=60)
CGATGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCT > SRR4302545.5782549/1‑94 (MQ=60)
CGATGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCT > SRR4302545.7295249/1‑94 (MQ=60)
CGATGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCT > SRR4302545.6384518/1‑94 (MQ=60)
CGATGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCT > SRR4302545.373926/1‑94 (MQ=60)
CGATGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCT < SRR4302545.3498807/94‑1 (MQ=60)
CGATGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGAAGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCT > SRR4302545.1420855/1‑94 (MQ=60)
GATGGTAAATTTGACGAGCATCGCCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTA < SRR4302545.9430131/94‑1 (MQ=60)
ATGTTAAATTTAACGAGCATCGCCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCCCCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTAT < SRR4302545.5682778/94‑1 (MQ=60)
TGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATT > SRR4302545.7452700/1‑94 (MQ=60)
TTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTG < SRR4302545.3599113/94‑1 (MQ=60)
GTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTG < SRR4302545.3599114/94‑1 (MQ=60)
GTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTG < SRR4302545.6637321/94‑1 (MQ=60)
GTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTG < SRR4302545.6996978/94‑1 (MQ=60)
TTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGC > SRR4302545.1882070/1‑94 (MQ=60)
TTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGC > SRR4302545.1998272/1‑94 (MQ=60)
AATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAA > SRR4302545.10863339/1‑94 (MQ=60)
ATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAA > SRR4302545.4847734/1‑94 (MQ=60)
ATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAA > SRR4302545.1020486/1‑94 (MQ=60)
ATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAA < SRR4302545.5786468/94‑1 (MQ=60)
TTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAG > SRR4302545.7438903/1‑94 (MQ=60)
TTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAG < SRR4302545.8683682/94‑1 (MQ=60)
TTGACGAGCATCACCTGGGCACTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGAGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGT < SRR4302545.115915/94‑1 (MQ=60)
TGACGAGCATCACCTGGGCTCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTC < SRR4302545.3017639/94‑1 (MQ=60)
TGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTC < SRR4302545.5539316/94‑1 (MQ=60)
TGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTC < SRR4302545.10748953/94‑1 (MQ=60)
GACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCG < SRR4302545.1691896/94‑1 (MQ=60)
GACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCG < SRR4302545.930399/94‑1 (MQ=60)
GAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCAT > SRR4302545.2103409/1‑94 (MQ=60)
AGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATC < SRR4302545.708653/94‑1 (MQ=60)
CATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCG < SRR4302545.2490711/94‑1 (MQ=60)
CATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCG > SRR4302545.5001466/1‑94 (MQ=60)
ATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCGCCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGG > SRR4302545.6477931/1‑94 (MQ=60)
ATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGG < SRR4302545.2201190/94‑1 (MQ=60)
ATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGG > SRR4302545.590476/1‑94 (MQ=60)
ATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGG > SRR4302545.10869165/1‑94 (MQ=60)
ATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGG < SRR4302545.7421140/94‑1 (MQ=60)
ATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGG > SRR4302545.9020608/1‑94 (MQ=60)
CACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTG < SRR4302545.9862390/94‑1 (MQ=60)
ACCTGGGCGCTCACGGTGCCGATCGGATGGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGG < SRR4302545.10761393/94‑1 (MQ=60)
CCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGT < SRR4302545.7703436/94‑1 (MQ=60)
CCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGT > SRR4302545.10641003/1‑94 (MQ=60)
CTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTG < SRR4302545.493600/94‑1 (MQ=60)
TGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGTTGGTGA > SRR4302545.4303842/1‑94 (MQ=60)
TGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGA > SRR4302545.392939/1‑94 (MQ=60)
TGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCCGTGGTGA > SRR4302545.2460716/1‑94 (MQ=60)
GGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAA < SRR4302545.9062266/94‑1 (MQ=60)
GGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAAT < SRR4302545.10051608/94‑1 (MQ=60)
GGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAAT < SRR4302545.8479626/94‑1 (MQ=60)
CGCTGACGGTTCCGAACGTACTGAGTTTCGGGAAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATGGCCAAAGTCCCATCCGGTGGTGAATTG > SRR4302545.5782617/1‑94 (MQ=60)
CGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTG > SRR4302545.5782618/1‑94 (MQ=60)
GCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGT > SRR4302545.1272856/1‑94 (MQ=60)
CTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTC < SRR4302545.1355873/94‑1 (MQ=60)
TGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCC > SRR4302545.4306592/1‑94 (MQ=60)
GGACGGTGCCGATCGTATTGAGGTTCGGGTAACCACCAACCCAGGGCAGCCAATGCAGCCCATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGCGAATTGGCC > SRR4302545.9687809/1‑94 (MQ=60)
GACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCC < SRR4302545.6568846/94‑1 (MQ=60)
GACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCC < SRR4302545.65187/94‑1 (MQ=60)
ACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCG < SRR4302545.7749886/94‑1 (MQ=60)
GGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCA > SRR4302545.9522475/1‑94 (MQ=60)
GTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCAT < SRR4302545.2855857/94‑1 (MQ=60)
TGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCCTC > SRR4302545.4058061/1‑94 (MQ=60)
GCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCG < SRR4302545.5297658/94‑1 (MQ=60)
GCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCG > SRR4302545.4220883/1‑94 (MQ=60)
CCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGC > SRR4302545.9537212/1‑94 (MQ=60)
CCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGC > SRR4302545.7685256/1‑94 (MQ=60)
CGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCA > SRR4302545.5501523/1‑94 (MQ=60)
CGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCA < SRR4302545.9169615/94‑1 (MQ=60)
CGATCGTATTGAGTTTAGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCA < SRR4302545.5621913/94‑1 (MQ=60)
ATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCATAGTCGCATCCGGTGGTGCATTGTCCCGCATCGCACT > SRR4302545.10227635/1‑94 (MQ=60)
ATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACT < SRR4302545.2101252/94‑1 (MQ=60)
ATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACT > SRR4302545.8445806/1‑94 (MQ=60)
ATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACT > SRR4302545.8376761/1‑94 (MQ=60)
ATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACT < SRR4302545.7700666/94‑1 (MQ=60)
ATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACG > SRR4302545.8376762/1‑94 (MQ=60)
TCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCTCTG > SRR4302545.10848674/1‑94 (MQ=60)
TCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTG < SRR4302545.160971/94‑1 (MQ=60)
TCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTG > SRR4302545.5883374/1‑94 (MQ=60)
CGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGG > SRR4302545.4530137/1‑94 (MQ=60)
CGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGG > SRR4302545.4486616/1‑94 (MQ=60)
CGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGCTGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGG > SRR4302545.4486618/1‑94 (MQ=60)
GTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGC > SRR4302545.5619665/1‑94 (MQ=60)
GTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGC > SRR4302545.4025708/1‑94 (MQ=60)
GTATTGAGTTGCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGC < SRR4302545.2918952/94‑1 (MQ=60)
TATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCA > SRR4302545.10541985/1‑94 (MQ=60)
TATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCA > SRR4302545.4397960/1‑94 (MQ=60)
TATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCA > SRR4302545.532612/1‑94 (MQ=60)
TATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCA < SRR4302545.5566721/94‑1 (MQ=60)
ATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCAAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATAGCACTGGCAA > SRR4302545.3560861/1‑94 (MQ=60)
TTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAAT < SRR4302545.2220531/94‑1 (MQ=60)
GAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCC > SRR4302545.6877736/1‑94 (MQ=60)
GAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCC < SRR4302545.5789048/94‑1 (MQ=60)
GTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAG < SRR4302545.10817299/94‑1 (MQ=60)
GTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAG < SRR4302545.6954790/94‑1 (MQ=60)
GTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAG < SRR4302545.893789/94‑1 (MQ=60)
GTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAG > SRR4302545.4547198/1‑94 (MQ=60)
GTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAG < SRR4302545.9844811/94‑1 (MQ=60)
TTTGGGGTAACCTCCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTAGTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGG < SRR4302545.3158797/94‑1 (MQ=60)
TTCGGGTCACCACCAACCCAGGTCAGCCGATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGT < SRR4302545.9616873/94‑1 (MQ=60)
TTCGGGTAACCACCACCCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGT < SRR4302545.453218/94‑1 (MQ=60)
TTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGT < SRR4302545.755560/94‑1 (MQ=60)
TCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTC > SRR4302545.8621590/1‑94 (MQ=60)
GGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCAT > SRR4302545.8122646/1‑94 (MQ=60)
GGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCAT < SRR4302545.6997340/94‑1 (MQ=60)
GTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCC > SRR4302545.7630714/1‑94 (MQ=60)
GTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCA < SRR4302545.712299/94‑1 (MQ=60)
GTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCA < SRR4302545.152982/94‑1 (MQ=60)
TAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCAC < SRR4302545.2790642/94‑1 (MQ=60)
TAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCAC > SRR4302545.7964322/1‑94 (MQ=60)
TAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCAC > SRR4302545.2538941/1‑94 (MQ=60)
AACCACCATCCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACG < SRR4302545.4712904/94‑1 (MQ=60)
AACCACCAACCCGGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGGGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACG > SRR4302545.6379234/1‑94 (MQ=60)
AACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACG > SRR4302545.8974842/1‑94 (MQ=60)
AACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACG < SRR4302545.10677543/94‑1 (MQ=60)
ACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGG > SRR4302545.3304687/1‑94 (MQ=60)
CCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGC > SRR4302545.8796675/1‑94 (MQ=60)
CCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGC > SRR4302545.10044702/1‑94 (MQ=60)
CCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGC < SRR4302545.64401/94‑1 (MQ=60)
CCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGC < SRR4302545.3379737/94‑1 (MQ=60)
CACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCG < SRR4302545.5968566/94‑1 (MQ=60)
CACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCG < SRR4302545.5968567/94‑1 (MQ=60)
CCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCG < SRR4302545.3348899/94‑1 (MQ=60)
CAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGT > SRR4302545.9659623/1‑94 (MQ=60)
CCCAGGTCAGCAAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAA < SRR4302545.2420804/94‑1 (MQ=60)
CCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAA > SRR4302545.5934155/1‑94 (MQ=60)
CCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAA < SRR4302545.2916088/94‑1 (MQ=60)
CGGGTCAACCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAAT < SRR4302545.10372713/94‑1 (MQ=60)
CAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAAT < SRR4302545.1563637/94‑1 (MQ=60)
CAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAAT > SRR4302545.7740723/1‑94 (MQ=60)
AGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATG > SRR4302545.10341466/1‑94 (MQ=60)
AGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATG > SRR4302545.7688673/1‑94 (MQ=60)
AGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATG > SRR4302545.3249665/1‑94 (MQ=60)
GTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGA > SRR4302545.5945230/1‑94 (MQ=60)
GTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGA < SRR4302545.5682910/94‑1 (MQ=60)
GTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGAGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTACAATGGA > SRR4302545.1319529/1‑94 (MQ=60)
CAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAA > SRR4302545.4766858/1‑94 (MQ=60)
CAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAA > SRR4302545.4766859/1‑94 (MQ=60)
AGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAAC > SRR4302545.6913924/1‑94 (MQ=60)
AGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAAC > SRR4302545.8018330/1‑94 (MQ=60)
AGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAAC < SRR4302545.3076643/94‑1 (MQ=60)
AGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAAC < SRR4302545.10524915/94‑1 (MQ=60)
GCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAACC > SRR4302545.6526468/1‑94 (MQ=60)
GCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAACC < SRR4302545.448750/94‑1 (MQ=60)
CCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAACCC > SRR4302545.5510126/1‑94 (MQ=60)
CCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAACCC > SRR4302545.6535666/1‑94 (MQ=60)
CCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGAACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAACCC > SRR4302545.3697455/1‑94 (MQ=60)
CCAATGCAGCCTATTACCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAACCC > SRR4302545.3697456/1‑94 (MQ=60)
CAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAACCCC < SRR4302545.8970164/94‑1 (MQ=60)
CAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAACCCC < SRR4302545.8970165/94‑1 (MQ=60)
CAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAACCCC > SRR4302545.9429675/1‑94 (MQ=60)
AATGCAGCCTATTGCCAAAGTCTCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATTCAGGTCATCACGGCGCGCAAAATGTAAACCCCG > SRR4302545.9673833/1‑94 (MQ=60)
ATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAACCCCGG < SRR4302545.10721265/94‑1 (MQ=60)
ATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAACCCCGG < SRR4302545.3481860/94‑1 (MQ=60)
ATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAACCCCGG > SRR4302545.4414599/1‑94 (MQ=60)
TGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGTTCATCACGGCACGTAAAATGGAAAGCCCGGA > SRR4302545.7443217/1‑94 (MQ=60)
TGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAACCCCGGC > SRR4302545.10120298/1‑94 (MQ=60)
GCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAACCCCGGCA < SRR4302545.5238432/94‑1 (MQ=60)
GCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGC‑ATTCAGGTCAACACGGCGGGTAAAATGGGAACCCCGGCAC > SRR4302545.8257513/1‑94 (MQ=60)
CAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAACCCCGGCAC < SRR4302545.8077219/94‑1 (MQ=60)
CAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACGGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAACCCCGGCAC > SRR4302545.2707246/1‑94 (MQ=60)
AGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAACCCCGGCACT > SRR4302545.1115696/1‑94 (MQ=60)
AGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAACCCCGGCACT > SRR4302545.519352/1‑94 (MQ=60)
GCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAACCCCGGCACTG > SRR4302545.4027205/1‑94 (MQ=60)
GCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAACCCCGGCACTG > SRR4302545.6670022/1‑94 (MQ=60)
CCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAACCCCGGCACTGA > SRR4302545.6276553/1‑94 (MQ=60)
CCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAACCCCGGCACTGA < SRR4302545.2553949/94‑1 (MQ=60)
|
ATCGATGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGGCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAACCCCGGCACTGA > NC_000913/2750998‑2751184
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
