Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
882 |
254.4 |
12957588 |
98.0% |
12698436 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,751,091 |
G→C |
A426P (GCT→CCT) |
recN → |
RecN |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,751,091 | 0 | G | C | 99.5%
| 756.7
/ NA
| 215 | A426P (GCT→CCT) | recN | RecN |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base C (106/108); minor base A (1/0); total (107/108) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.98e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 220 total aligned reads displayed.
GATGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGGCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAACCCCGGCA > NC_000913/2751001‑2751180
|
atGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTa > 1:1987693/1‑93 (MQ=255)
atGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTa > 1:5479553/1‑93 (MQ=255)
tGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTAt > 1:557991/1‑93 (MQ=255)
tGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGACTAt > 2:4763400/1‑93 (MQ=255)
gTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTAtt < 1:2866559/93‑1 (MQ=255)
ttAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTg > 2:2246997/1‑93 (MQ=255)
aaaTTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGcc > 2:453362/1‑93 (MQ=255)
aTTTGACGAGCATCACCTGGGCGTTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGTTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCaa < 2:3129979/93‑1 (MQ=255)
aTTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCaa > 1:4707971/1‑93 (MQ=255)
ttGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAg < 1:500184/93‑1 (MQ=255)
tGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGt < 1:6422098/93‑1 (MQ=255)
tGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGt < 1:6316242/93‑1 (MQ=255)
tGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGt < 1:4014970/93‑1 (MQ=255)
gACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTc < 1:336799/93‑1 (MQ=255)
gACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTc > 2:5223350/1‑93 (MQ=255)
aCGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCg < 2:4260691/93‑1 (MQ=255)
aCGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCg > 1:5391851/1‑93 (MQ=255)
gAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCa > 2:3875885/1‑93 (MQ=255)
gAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGGAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCa > 2:4379882/1‑93 (MQ=255)
aGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCAt > 1:1654906/1‑93 (MQ=255)
gCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAGCCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATc < 2:3213140/93‑1 (MQ=255)
gCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATc < 2:4313034/93‑1 (MQ=255)
cATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATcc < 2:4733525/93‑1 (MQ=255)
aTCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCg > 2:1526971/1‑93 (MQ=255)
tCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCgg > 2:484381/1‑93 (MQ=255)
tCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCgg < 2:3926139/93‑1 (MQ=255)
tCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACAAACCCAGGTCAGCAAATGCAGGCTATTGCCAAAGTCGCATCCgg > 1:4924571/1‑93 (MQ=255)
tCACCTGGACGCTGACGGTGGCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCgg > 2:6328027/1‑93 (MQ=255)
cACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCggt > 1:1137439/1‑93 (MQ=255)
cACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCggt < 1:1175249/93‑1 (MQ=255)
aCCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCggtg < 2:3164231/93‑1 (MQ=255)
ccTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCggtgg < 2:4558895/93‑1 (MQ=255)
ccTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCggtgg < 2:4017339/93‑1 (MQ=255)
gcgcTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAAt < 1:6109277/93‑1 (MQ=255)
cgcTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAAtt < 1:6293473/93‑1 (MQ=255)
cgcTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCACATCCGGTGGTGAAtt > 2:442330/1‑93 (MQ=255)
gcTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTg > 1:4389992/1‑93 (MQ=255)
cTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGTTGGTGAATTGt < 2:5831274/93‑1 (MQ=255)
cTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTgc > 1:1891409/1‑92 (MQ=255)
tGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTc < 2:3651627/93‑1 (MQ=255)
tGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTc < 2:5268741/93‑1 (MQ=255)
tGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTc > 1:3286918/1‑93 (MQ=255)
tGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTc > 2:2479535/1‑93 (MQ=255)
gACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTcc < 2:3267571/93‑1 (MQ=255)
aCGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTccc > 2:14132/1‑93 (MQ=255)
aCGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACAAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTccc < 1:4902792/93‑1 (MQ=255)
tGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCAt < 1:1600118/93‑1 (MQ=255)
ccGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCg > 1:4308663/1‑93 (MQ=255)
cGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGc > 1:4478408/1‑93 (MQ=255)
gATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCa > 2:6460030/1‑93 (MQ=255)
aTCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCAc > 1:778132/1‑93 (MQ=255)
aTCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCAc < 1:3881037/93‑1 (MQ=255)
tCGTATTGAGTTTCGGGTAACCCCCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCACACTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCCCt > 2:3093476/1‑93 (MQ=255)
tCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACt > 2:721501/1‑93 (MQ=255)
tCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACt < 2:2863235/93‑1 (MQ=255)
tCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGGCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCGTCCGTTGGTGAATTGTCCCCCATCCCAcg > 2:5784011/1‑92 (MQ=255)
gTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTgg > 1:5876460/1‑93 (MQ=255)
gTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTgg < 2:4678969/93‑1 (MQ=255)
gTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTgg > 2:2714523/1‑93 (MQ=255)
tATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGc < 2:4202303/93‑1 (MQ=255)
tATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGc > 1:702575/1‑93 (MQ=255)
aTTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCa > 2:3748206/1‑93 (MQ=255)
ttGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCaa < 1:4105740/93‑1 (MQ=255)
ttGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCaa > 2:1093043/1‑93 (MQ=255)
gAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATc < 1:5627539/93‑1 (MQ=255)
aGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAATGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATcc < 2:2579689/93‑1 (MQ=255)
aGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATcc < 1:5507778/93‑1 (MQ=255)
aGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATcc > 2:1169926/1‑93 (MQ=255)
aGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATcc < 2:5971287/93‑1 (MQ=255)
gTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCa < 2:5022637/93‑1 (MQ=255)
tttCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAg > 1:5198043/1‑93 (MQ=255)
tttCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAg < 1:2892184/93‑1 (MQ=255)
gggTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGtca < 2:1943935/93‑1 (MQ=255)
ggTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGtcat > 2:6164220/1‑93 (MQ=255)
gTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGtcatc < 2:1356637/93‑1 (MQ=255)
gTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGtcatc < 1:3541/93‑1 (MQ=255)
tAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGtcatca < 1:5640428/93‑1 (MQ=255)
accaccAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACg > 2:5712822/1‑93 (MQ=255)
accaccAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACg < 1:3944327/93‑1 (MQ=255)
ccaccaACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACgg > 1:5900288/1‑93 (MQ=255)
ccaACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGgcgc < 1:6326120/93‑1 (MQ=255)
caACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGcgcg < 2:4084474/93‑1 (MQ=255)
aaCCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGt > 1:2436314/1‑93 (MQ=255)
aaCCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGt > 1:921642/1‑93 (MQ=255)
cAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTaaaa > 1:831933/1‑93 (MQ=255)
cAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTaaaa < 1:1099671/93‑1 (MQ=255)
aGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAAt < 2:212878/93‑1 (MQ=255)
tCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTTCCGCATCGCACTGGCAATACAGGTCATCACGGCGCGTAAAATAGa > 2:1037870/1‑93 (MQ=255)
tCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGa < 1:4341804/93‑1 (MQ=255)
tCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGa < 2:4176838/93‑1 (MQ=255)
cAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGaa < 2:5179430/93‑1 (MQ=255)
cAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGaa > 1:3689100/1‑93 (MQ=255)
cAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGaa > 1:4967139/1‑93 (MQ=255)
ccAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAAcc < 1:4635929/93‑1 (MQ=255)
ccAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAAcc > 2:6018116/1‑93 (MQ=255)
cAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAAccc < 1:2087461/93‑1 (MQ=255)
aaTGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAAcccc > 2:5438823/1‑93 (MQ=255)
aaTGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAAcccc > 1:2226055/1‑93 (MQ=255)
aTGCAGCCTATTGCCAACGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAACCCCg > 2:2341216/1‑93 (MQ=255)
tGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAACCCCgg < 1:5290588/93‑1 (MQ=255)
|
GATGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGGCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAACCCCGGCA > NC_000913/2751001‑2751180
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
TCGATGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGGCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAACCCCGGCACTGA > NC_000913/2750999‑2751184
|
TCGATGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCC < SRR4302537.6011186/94‑1 (MQ=60)
CGATGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCT < SRR4302537.4176959/94‑1 (MQ=60)
GATGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGATTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTA < SRR4302537.4699256/94‑1 (MQ=60)
GATGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTA < SRR4302537.2064022/94‑1 (MQ=60)
GATGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTA > SRR4302537.2001513/1‑94 (MQ=60)
GATGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTA > SRR4302537.5516963/1‑94 (MQ=60)
GATGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTA < SRR4302537.4670549/94‑1 (MQ=60)
ATGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTAT > SRR4302537.561833/1‑94 (MQ=60)
ATGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTAT < SRR4302537.5340486/94‑1 (MQ=60)
TGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATT < SRR4302537.4322270/94‑1 (MQ=60)
GTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTG < SRR4302537.4026843/94‑1 (MQ=60)
GTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTG > SRR4302537.1991869/1‑94 (MQ=60)
GTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTG < SRR4302537.2886669/94‑1 (MQ=60)
AATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAA > SRR4302537.4740544/1‑94 (MQ=60)
AATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGCATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAA > SRR4302537.2526357/1‑94 (MQ=60)
ATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAA > SRR4302537.2311261/1‑94 (MQ=60)
TTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGT < SRR4302537.767919/94‑1 (MQ=60)
TTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGT < SRR4302537.5786718/94‑1 (MQ=60)
TTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGT < SRR4302537.503625/94‑1 (MQ=60)
TGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTC < SRR4302537.4043084/94‑1 (MQ=60)
TGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTC < SRR4302537.6465750/94‑1 (MQ=60)
TGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTC < SRR4302537.6359469/94‑1 (MQ=60)
GACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCG < SRR4302537.565338/94‑1 (MQ=60)
GACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCG < SRR4302537.339128/94‑1 (MQ=60)
GACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCG > SRR4302537.5428681/1‑94 (MQ=60)
GAGCATCACCTTGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCAT > SRR4302537.3691049/1‑94 (MQ=60)
GAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCAT > SRR4302537.1666503/1‑94 (MQ=60)
AGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATC < SRR4302537.4382901/94‑1 (MQ=60)
CATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCG > SRR4302537.5274308/1‑94 (MQ=60)
ATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACAAACCCAGGTCAGCAAATGCAGGCTATTGCCAAAGTCGCATCCGG > SRR4302537.4958526/1‑94 (MQ=60)
TCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGT > SRR4302537.6367407/1‑94 (MQ=60)
TCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGT > SRR4302537.1145341/1‑94 (MQ=60)
CAGCTGGGCGCTGACGCTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTG < SRR4302537.5674941/94‑1 (MQ=60)
CACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTG < SRR4302537.1183421/94‑1 (MQ=60)
CCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGT > SRR4302537.141204/1‑94 (MQ=60)
CTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTG < SRR4302537.4182338/94‑1 (MQ=60)
GCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAGGTCGCATCCGGTGGTGAATT > SRR4302537.2103475/1‑94 (MQ=60)
GCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATT < SRR4302537.65426/94‑1 (MQ=60)
GCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATT < SRR4302537.6151261/94‑1 (MQ=60)
CGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTG > SRR4302537.4420265/1‑94 (MQ=60)
CGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTG > SRR4302537.4420264/1‑94 (MQ=60)
CGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTG < SRR4302537.6336592/94‑1 (MQ=60)
GCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGT > SRR4302537.5224371/1‑94 (MQ=60)
GCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGT > SRR4302537.1695072/1‑94 (MQ=60)
GCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGC > SRR4302537.1904557/1‑94 (MQ=60)
CTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTACCCACCAGCCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTC < SRR4302537.5926971/94‑1 (MQ=60)
CTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTC > SRR4302537.3310149/1‑94 (MQ=60)
ACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACAAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCG < SRR4302537.4936633/94‑1 (MQ=60)
TGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATC < SRR4302537.881503/94‑1 (MQ=60)
TGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATC < SRR4302537.1611302/94‑1 (MQ=60)
TGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATC < SRR4302537.4354132/94‑1 (MQ=60)
GCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCG > SRR4302537.4338610/1‑94 (MQ=60)
GCCGATCGTATGGAGTGTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCG < SRR4302537.3378828/94‑1 (MQ=60)
CCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGC > SRR4302537.4509387/1‑94 (MQ=60)
GATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCAC > SRR4302537.783472/1‑94 (MQ=60)
GATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCAC > SRR4302537.179560/1‑94 (MQ=60)
ATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACT < SRR4302537.3908184/94‑1 (MQ=60)
atGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTG < SRR4302537.5175558/92‑1 (MQ=60)
CGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGG > SRR4302537.5916779/1‑94 (MQ=60)
CGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGG < SRR4302537.5541401/94‑1 (MQ=60)
GTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGC < SRR4302537.61115/94‑1 (MQ=60)
GTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGC > SRR4302537.707385/1‑94 (MQ=60)
TATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCA < SRR4302537.4948978/94‑1 (MQ=60)
TATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCA < SRR4302537.2989095/94‑1 (MQ=60)
ATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAA > SRR4302537.4792954/1‑94 (MQ=60)
TTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAAT < SRR4302537.4134418/94‑1 (MQ=60)
TGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATC > SRR4302537.2896392/1‑94 (MQ=60)
GAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCC < SRR4302537.5666037/94‑1 (MQ=60)
AGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCA < SRR4302537.5545395/94‑1 (MQ=60)
AGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCA < SRR4302537.5005330/94‑1 (MQ=60)
AGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCA > SRR4302537.3954623/1‑94 (MQ=60)
GTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAG < SRR4302537.6313409/94‑1 (MQ=60)
GTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAG < SRR4302537.1117213/94‑1 (MQ=60)
GTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAG > SRR4302537.5233804/1‑94 (MQ=60)
TTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGG < SRR4302537.2912489/94‑1 (MQ=60)
TTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGG < SRR4302537.4964166/94‑1 (MQ=60)
CGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCA < SRR4302537.4128583/94‑1 (MQ=60)
GGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGCGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCAT > SRR4302537.4585550/1‑94 (MQ=60)
GGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATC > SRR4302537.284677/1‑94 (MQ=60)
GTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCA < SRR4302537.3572/94‑1 (MQ=60)
GTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCA > SRR4302537.1645317/1‑94 (MQ=60)
TAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCAC < SRR4302537.3625333/94‑1 (MQ=60)
TAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCAC < SRR4302537.5679030/94‑1 (MQ=60)
ACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGG > SRR4302537.5940776/1‑94 (MQ=60)
ACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGG < SRR4302537.3971915/94‑1 (MQ=60)
CCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCG < SRR4302537.6369388/94‑1 (MQ=60)
CAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGT > SRR4302537.2453475/1‑94 (MQ=60)
CAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGT > SRR4302537.684427/1‑94 (MQ=60)
CAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGT > SRR4302537.928005/1‑94 (MQ=60)
CCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGGATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAA > SRR4302537.6350532/1‑94 (MQ=60)
CCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAA > SRR4302537.3835724/1‑94 (MQ=60)
CCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAA > SRR4302537.837623/1‑94 (MQ=60)
CAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAAT < SRR4302537.1107267/94‑1 (MQ=60)
TCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAA > SRR4302537.3715045/1‑94 (MQ=60)
TCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAA < SRR4302537.4371921/94‑1 (MQ=60)
TCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAA > SRR4302537.5001375/1‑94 (MQ=60)
CGGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGGCGGATCCGCTGGTGCATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCCTACAATGGAAA > SRR4302537.6138423/1‑94 (MQ=60)
CAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAA > SRR4302537.34523/1‑94 (MQ=60)
AGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAAC > SRR4302537.6089118/1‑94 (MQ=60)
CCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAACCC < SRR4302537.4667996/94‑1 (MQ=60)
CCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAACCC > SRR4302537.1152007/1‑94 (MQ=60)
CAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAACCCC > SRR4302537.2241754/1‑94 (MQ=60)
CAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAACCCC < SRR4302537.2102184/94‑1 (MQ=60)
AATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAACCCCG > SRR4302537.5603367/1‑94 (MQ=60)
ATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAACCCCGG < SRR4302537.5515243/94‑1 (MQ=60)
ATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAACCCCGG > SRR4302537.813133/1‑94 (MQ=60)
ATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAACCCCGG > SRR4302537.6460088/1‑94 (MQ=60)
TGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAACCCCGGC < SRR4302537.5326945/94‑1 (MQ=60)
GCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAACCCCGGCA > SRR4302537.5575793/1‑94 (MQ=60)
CAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAACCCCGGCAC > SRR4302537.985381/1‑94 (MQ=60)
AGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAACCCCGGCACT > SRR4302537.5437609/1‑94 (MQ=60)
CCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAACCCCGGCACTGA > SRR4302537.1434800/1‑94 (MQ=60)
|
TCGATGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGGCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAACCCCGGCACTGA > NC_000913/2750999‑2751184
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
