Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
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647 |
270.1 |
21258240 |
98.4% |
20918108 |
94.0 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 302 total aligned reads displayed.
CCGCCAGATAGTTCGCCATCTGGCAATATTGCGCGACAGAGATATTTTCCGCTCGCATCGCCGGGTCGATCCCCATTCCCGTTAACACCTCGACGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTAAAGGCTTCGGTGGTGATGCGGCTCAACACACGAACATCTTTAAC > NC_000913/51635‑51821
|
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CCGCAAGATAGTTCGCGATCTGGCAATATTGCGCGACAGAGATATTTTCCGCTCGCAGCGCCGGGTCGATCCCCATTCCCGTTAACACCTCGAC < SRR4302545.10474501/94‑1 (MQ=60)
CGCCAGATAGTTCGCCATCTGGCAATATTGCGCGACAGAGATATTTTCCGCTCGCATCGCCGGGTCGATCCCCATTCCCGTTAACACCTCGACG < SRR4302545.7806171/94‑1 (MQ=60)
CCCCAGATAGTTCGCCATCTGGCAATATTGCGAAACAGAGTTTTTTCCCGCCCGCATCCCCGGGTCTATCCCCATTCCCGTTAACACCTCGACG < SRR4302545.9834146/94‑1 (MQ=60)
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GCCAGATAGTTCGCCATCTGGCAATATTGCGCGACAGAGATATTTTCCGCTCGCATCGCCGGGTCGATCCCCATTCCCGTTAACACCTCGACGC > SRR4302545.982857/1‑94 (MQ=60)
CCAGATAGTTCGCCATCTGGCAATATTGCGCGACAGAGATATTTTCCGCTCGCATCGCCGGGTCGATCCCCATTCCCGTTAACACCTCGATGCT < SRR4302545.5802123/94‑1 (MQ=60)
CCAGATAGTTCGCCATCTGGCAATATTGCGCGACAGAGATATTTTCCGCTCGCATCGCCGGGTCGATCCCCATTCCCGTTAACACCTCGATGCT > SRR4302545.22955/1‑94 (MQ=60)
CCAGATAGTTCGCCATCTGGCAATATTGCGCGACAGAGATATTTTCCGCTCGCATCGCCGGGTCGATCCCCATTCCCGTTAACACCTCGACGCT > SRR4302545.7768907/1‑94 (MQ=60)
CAGATAGTTCGCCATCTGGCAATATTGCGCGACAGAGATATTTTCCGCTCGCATCGCCGGGTCGATCCCCATTCCCGTTAACACCTCGATGCTA > SRR4302545.1404164/1‑94 (MQ=60)
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AGTTCGCCATCTGGCAATATTGCGCGACAGAGATATTTTCCGCTCGCATCGCCGGGTCGATCCCCATTCCCGTTAACACCTCGACGCTAAACAG < SRR4302545.8026114/94‑1 (MQ=60)
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TCGCCATCTGGCAATATTGCGCGACAGAGATATTTTCCGCTCGCATCGCCGGGTCGATCCCCATTCCCGTTAACACCTCGACGCTAAACAGGTT > SRR4302545.10618523/1‑94 (MQ=60)
CCGCCATCTGGCAATATTGCGCGACAGAGATATTTTCCGCTCGCAACGCCGGGTCGACCCCCATACCCGTTAACACCTCGACGCTAAACAGGcg > SRR4302545.9663771/1‑92 (MQ=60)
CGCCATCTGGCAATATTGCGCGACAGAGATATTTTCCGCTCGCATCGCTGGGTCGATCCCCATTCCCGTTAACACCTCGACGCTAAACAGGTTG < SRR4302545.5534267/94‑1 (MQ=60)
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GCCATCTGGCAATATTGCGCGACAGAGATATTTTCCGCTCGCATCGCCGGGTCGATCCCCATTCCCGTTAACACCTCGACGCTAAACAGGTTGC < SRR4302545.3747278/94‑1 (MQ=60)
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CCATCTGGCAATATTGCGCGACAGAGATATTTTCCGCTCGCATCGCCGGGTCGATCCCCATTCCCGTTAACACCTCGACGCTAAACAGGTTGCC < SRR4302545.8474209/94‑1 (MQ=60)
CCATCTGGCAATATTGCGCGACAGAGATATTTTCCGCTCGCATCGCCGGGTCGATCCCCATTCCCGTTAACACCTCGACGCTAAACAGGTTGCC > SRR4302545.1176863/1‑94 (MQ=60)
CCATCTGGCAATATTGCGCGACAGAGATAATTTCCGCTCGCATCGCCGGGTCGATCCCCATTCCCGTTAACACCTCGACGCTAAACAGGTTGCC > SRR4302545.9484752/1‑94 (MQ=60)
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CATCTGGCAATATTGCGCGACAGAGATATTTTCCGCTCGCATCGCCGGGTCGATCCCCATTCCCGTTAACACCTCGACGCTAAACAGGTTGCCG > SRR4302545.1161670/1‑94 (MQ=60)
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GGCAATATTGCGCGACAGAGATATTTTCCGCTCGCATCGCCGGGTCGATCCCCATTCCCGTTAACACCTCGATGCTAAACAGGTTGCCGAGGCT < SRR4302545.3685961/94‑1 (MQ=60)
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TGCGCGACAGAGATATTTTCCGCTCGCATCGCCGGGTCGATCCCCATTCCCGTTAACACCTCGATGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAA < SRR4302545.2242244/94‑1 (MQ=60)
TGCGCGACAGAGATATTTTCCGCTCGCATCGCCGGGGCGATCCCCATTCCCGTTAACACCTCGACGCTAAACAGGGTGCCGGGGCTGTTACGAA > SRR4302545.4868785/1‑94 (MQ=60)
GCGCGACAGAGATATTTTCCGCTCGCATCGCCGGGTCGATCCCCATTCCCGTTAACACCTCGATGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAAT < SRR4302545.7010227/94‑1 (MQ=60)
GCGCGACAGAGATATTTTCCGCTCGCATCGCCGGGTCGATCCCCATTCCCGTTAACACCTCGACGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAAT < SRR4302545.10827740/94‑1 (MQ=60)
CGCGACAGAGATATTTTCCGCTCGCATCGCCGGGTCGATCCCCATTCCCGTTAACACCTCGACGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATG < SRR4302545.2029551/94‑1 (MQ=60)
GCGACAGAGATATTTTCCGCTCGCATCGCCGGGTCGATCCCCATTCCCGTTAACACCTCGATGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGG < SRR4302545.1862436/94‑1 (MQ=60)
GCGACAGAGATATTTTCCGCTCGCATCGCCGGGTCGATCCCCATTCCCGTTAACACCTCGACGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGG < SRR4302545.8260497/94‑1 (MQ=60)
CGACAGAGATATTTTCCGCTCGCATCGCCGGGTCGATCCCCATTCCCGTTAACACCTCGATGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGT > SRR4302545.1524444/1‑94 (MQ=60)
CGACAGAGATATTTTCCGCTCGCATCGCCGGGTCGATCCCCATTCCCGTTAACACCTCGATGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGT > SRR4302545.3876428/1‑94 (MQ=60)
CGACAGAGATATTTTCCGCTCGCATCGCCGGGTCGATCCCCATTCCCGTTAACACCTCGACGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGT > SRR4302545.5508831/1‑94 (MQ=60)
CGACAGAGATATTTTCCGCTCGCATCGCCGGGTCGATCCCCATTCCCGTTAACACCTCGACGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGT > SRR4302545.995177/1‑94 (MQ=60)
GACAGAGATATTTTCCGCTCGCATCGCCGGGTCGATCCCCATTCCCGTTAACACCTCGATGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTT > SRR4302545.3158927/1‑94 (MQ=60)
GACAGAGATATTTTCCGCTCGCATCGCCGGGTCGATCCCCATTCCCGTTAACACCTCGATGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTT > SRR4302545.3158929/1‑94 (MQ=60)
ACAGAGATATTTTCCGCTCGCATCGCCGGGTCGATCACCATTCCCGTTAACACCTCGACGCTAGACAGGTTGCCGAGGCTGTTCCGAATGGTTT > SRR4302545.3633940/1‑94 (MQ=60)
CAGAGATATTTTCCGCTCGCATCGCCGGGTCGATCCCCATTCCCGTTAACACCTCGATGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTT < SRR4302545.623891/94‑1 (MQ=60)
CAGAGATATTTTCCGCTCGCATCGCCGGGTCGATCCCCATTCCCGTTAACACCTCGATGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTT < SRR4302545.51562/94‑1 (MQ=60)
CAGAGATATTTTCCGCTCGCATCGCCGGGTCGATCCCCATTCCCGTTAACACCTCGATGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTT > SRR4302545.5193393/1‑94 (MQ=60)
CAGAGATATTTTCCGCTCGCATCGCCGGGTCGATCCCCATTCCCGTTAACACCTCGACGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTT > SRR4302545.3399246/1‑94 (MQ=60)
CAGAGATATTTTCCGCTCGCATCGCCGGGTCGATCCCCATTCCCGTTAACACCTCGACGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTT < SRR4302545.6748738/94‑1 (MQ=60)
GAGATATTTTCCGCTCGCATCGCCGGGTCGATCCCCATTCCCGTTAACACCTCGACGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTTAC < SRR4302545.3191579/94‑1 (MQ=60)
GATATTTTCCGCTCGCATCGCCGGGTCGATCCCCATTCCCGTTAACACCTCGATGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTTACGA < SRR4302545.685929/94‑1 (MQ=60)
ATATTTTCCGCTCGCATCGCCGGGTCGATCCCCATTCCCGTTAACACCTCGATGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTTACGAC < SRR4302545.913160/94‑1 (MQ=60)
ATATTTTCCGCTCGCATCGCCGGGTCGATCCCCATTCCCGTTAACACCTCGATGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTTACGAC < SRR4302545.10226949/94‑1 (MQ=60)
ATATTTTCCGCTCGCATCGCCGGGTCGATCCCCATTCCCGTTAACACCTCGATGCTAAACAGGCTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTTACGAC > SRR4302545.9632477/1‑94 (MQ=60)
TATTTTCCGCTCGCATCGCCGGGTCGATCCCCATTCCCGTTAACACCTCGATGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACG > SRR4302545.3034067/1‑94 (MQ=60)
TATTTTCCGCTCGCATCGCCGGGTCGATCCCCATTCCCGTTAACACCTCGATGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACG < SRR4302545.6756935/94‑1 (MQ=60)
TATTTGCCCCTCGCATCGCGGGGTCGAGCCCCATGCCCATTATCTCCGCGATGCTAAGCAGGGTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACG < SRR4302545.571381/94‑1 (MQ=25)
ATTTTCCGCTCGCATCGCCGGGTCGATCCCCATTCCCGTTAACACCTCGATGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTTACGCCGC > SRR4302545.2519285/1‑94 (MQ=60)
TTTTCCGCTCGCATCGCCGGGTCGATCCCCATTCCCGTTAACACCTCGATGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCT < SRR4302545.2354162/94‑1 (MQ=60)
TTTCCGCTCGCATCGCCGGGTCGATCCCCATTCCCGTTAACACCTCGATGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTG < SRR4302545.2632024/94‑1 (MQ=60)
TTCCGCTCGCATCGCCGGGTCGATCCCCATTCCCGTTAACACCTCGATGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGG < SRR4302545.9924412/94‑1 (MQ=60)
TTCCGCTCGCATCGCCGGGTCGATCCCCATTCCCGTTAACACCTCGATGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGG > SRR4302545.3341399/1‑94 (MQ=60)
TCCGCTCGCATCGCCGGGTCGATCCCCATTCCCGTTAACACCTCGATGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTCACGACGCTGGT > SRR4302545.121612/1‑94 (MQ=60)
TCCGCTCGCATCGCCGGGTCGATCCCCATTCCCGTTAACACCTCGACGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGT > SRR4302545.797298/1‑94 (MQ=60)
CCGCTCGCATCGCCGGGTCGATCCCCATTCCCGTTAACGCCTCGATGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTTACGCCGCTGGTT < SRR4302545.5305912/94‑1 (MQ=60)
CCGCTCGCATCGCCGGGTCGATCCCCATTCCCGTTAACACCTCGACGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTT < SRR4302545.8347202/94‑1 (MQ=60)
CCGCTCGCATCGCCGGGTCGATCCCCATTCCCGTTAACACCTCGACGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTT < SRR4302545.782894/94‑1 (MQ=60)
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CGCTCGCATCGCCGGGGCGATCCCCATTCCCGTTAACACCTCGATGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTA > SRR4302545.1863390/1‑94 (MQ=60)
GCTCGCATCGCCGGGTCGATCCCCATTCCCGTTAACACCTCGATGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTAA > SRR4302545.4491383/1‑94 (MQ=60)
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CTCGCATCGCCGGGTCGATCCCCATTCCCGTTAACACCTCGATGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGGTTTACGACGCTGGTTAAA > SRR4302545.8561564/1‑94 (MQ=60)
CTCGCATCGCCGGGTCGATCCCCATTCCCGTTAACACCTCGACGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTAAA > SRR4302545.4380548/1‑94 (MQ=60)
CTCGCATCGCCGGGTCGATCCCCATTCCCGTTAACACCTCGACGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTAAA < SRR4302545.6977476/94‑1 (MQ=60)
TCGCATCGCCGGGTCGATCCCCATTCCCGTTAACACCTCGATGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTAAAG < SRR4302545.2030067/94‑1 (MQ=60)
TCGCATCGCCGGGTCGATCCCCATTCCCGTTAACACCTCGACGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTAAAG < SRR4302545.565642/94‑1 (MQ=60)
CGCATCGCCGGGTCGATCCCCATTCCCGTTAACACCTCGATGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTAAAGG < SRR4302545.10190232/94‑1 (MQ=60)
CGCATCGCCGGGTCGATCCCCATTCCCGTTAACACCTCGACGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTAAAGG > SRR4302545.3911455/1‑94 (MQ=60)
GCATCCCCGGGTCGATCCCCATTCCCGTTAACACCTCGATGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTAAAGGC < SRR4302545.2091150/94‑1 (MQ=60)
CCATCTCCGGGTTGATCCCCATTCCCGGTAACACCTCGATTCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTAAAGGC < SRR4302545.1514536/94‑1 (MQ=60)
CATCGCCGGGTCGATCCCCATTCCCGTTAACACCTCGATGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTAAAGGCT > SRR4302545.219321/1‑94 (MQ=60)
CATCGCCGGGTCGATCCCCATTCCCGTTAACACCTCGACGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCCGGTTAAAGGCT < SRR4302545.7054136/94‑1 (MQ=60)
ATCGCCGGGTCGATCCCCATTCCCGTTAACACCTCGATGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTAAAGGCTT > SRR4302545.7407365/1‑94 (MQ=60)
ATCGCCGGGTCGATCCCCATTCCCGTTAACACCTCGACGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTAAAGGCTT > SRR4302545.1319101/1‑94 (MQ=60)
ATCGCCGGGTCGATCCCCATTCCCGTTAACACCTCGACGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTAAAGGCTT > SRR4302545.3514071/1‑94 (MQ=60)
ATCGCCGGGTCGATCCCCATTCCCGTTAACACCTCGACGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTAAAGGCTT < SRR4302545.1488071/94‑1 (MQ=60)
TCGCCGGGTCGATCCCCATTCCCGTTAACACCTCGATGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTAAAGGCTTC < SRR4302545.3727987/94‑1 (MQ=60)
TCGCCGGGTCGATCCCCATTCCCGTTAACACCTCGATGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTAAAGGCTTC > SRR4302545.6007775/1‑94 (MQ=60)
CGCCGGGTCGATCCCCATTCCCGTTAACACCTCGATGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTAAAGGCTTCG < SRR4302545.10721297/94‑1 (MQ=60)
CGCCGGGTCGATCCCCATTCCCGTTAACACCTCGATGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTAAAGGCTTCG > SRR4302545.364633/1‑94 (MQ=60)
CGCCGGGTCGATCCCCATTCCCGTTAACACCTCGACGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTAAAGGCTTCG > SRR4302545.9776890/1‑94 (MQ=60)
cgCGGGTCGATCCCCATTCCCGTTAACACCTCGATGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTAAAGGCTTCGG < SRR4302545.8924642/92‑1 (MQ=60)
GCCGGGTCGATCCCCATTCCCGTTAACACCTCGATGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTAAAGGCTTCGG > SRR4302545.8295102/1‑94 (MQ=60)
GCCGGGTCGATCCCCATTCCCGTTAACACCTCGACGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTAAAGGCTTCGG > SRR4302545.7758359/1‑94 (MQ=60)
CCGGGTCGATCCCCATTCCCGTTAACACCTCGACGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTAAAGGCTTCGGT < SRR4302545.7864095/94‑1 (MQ=60)
CCGGGTCGATCCCCATTCCCGTTAACACCTCGACGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTAAAGGCTTCGGT < SRR4302545.2383402/94‑1 (MQ=60)
CGGGTCGATCCCCATTCCCGTTAACACCTCGACGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTAAAGGCTTCGGTG > SRR4302545.457457/1‑94 (MQ=60)
CGGGTCGATCCCCATTCCCGTTAACACCTCGACGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTAAAGGCTTCGGTG < SRR4302545.6050266/94‑1 (MQ=60)
CGGGCCGATCCCCATTCCCGTTAACAGCTCGACGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTAAAGGCTTCGGTG < SRR4302545.5917765/94‑1 (MQ=60)
GGGTCGATCCCCATTCCCGTTAACACCTCGACGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTAAAGGCTTCGGTGG < SRR4302545.3547188/94‑1 (MQ=60)
GGTCGATCCCCATTCCCGTTAACACCTCGATGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTAAAGGCTTCGGTGGT > SRR4302545.5924443/1‑94 (MQ=60)
GGTCGATCCCCATTCCCGTTAACACCTCGATGCTAAACAGGGTGCCGAGGCTGCTACGCATGGCTTTACGACGCTAGTTAAAGGCTTCGGTAGT > SRR4302545.7236137/1‑94 (MQ=60)
GTCGATCCCCATTCCCGTTAACACCTCGATGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTAAAGGCTTCGGTGGTG < SRR4302545.85753/94‑1 (MQ=60)
GTCGATCCCCATTCCCGTTAACACCTCGATGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTAAAGGCTTCGGTGGTG < SRR4302545.4487696/94‑1 (MQ=60)
GTCGATCCCCATTCCCGTTAACACCTCGATGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTAAAGGCTTCGGTGGTG > SRR4302545.10334985/1‑94 (MQ=60)
GTCGATCCCCATTCCCGTTAACACCTCGATGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGGTTTACGACGCTGGTTAAAGGCTTCGGTGGTG > SRR4302545.10334981/1‑94 (MQ=60)
GTCGATCCCCATTCCCGTTAACACCTCGACGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTAAAGGCTTCGGTGGTG > SRR4302545.5093665/1‑94 (MQ=60)
CGATCCCCATTCCCGTTAACACCTCGATGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTAAAGGCTTCGGTGGTGAT < SRR4302545.10385321/94‑1 (MQ=60)
CGATCCCCATTCCCGTTAACACCTCGATGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGATGGTTAAAGGCTTCGGTGGTGAG > SRR4302545.3033258/1‑94 (MQ=60)
CGATCCCCATTCCCGTTAACACCTCGACGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTAAAGGCTTCGGTGGTGAT < SRR4302545.7261702/94‑1 (MQ=60)
CGATCCCCATTCCCGTTAACACCTCGACGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTAAAGGCTTCGGTGGTGAT > SRR4302545.9200669/1‑94 (MQ=60)
CGATCCCCATTCCCGTTAACACCTCGACGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTAAAGGCTTCGGCGGGGAT > SRR4302545.6834353/1‑94 (MQ=60)
caaCCCCATTCCCGTTAACCCCTCGGCGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGATGGTTAAAGGCTTCGGTGGTGATG < SRR4302545.5603590/91‑1 (MQ=60)
GATCCCCATTCCCGTTAACACCTCGATGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTAAAGGCTTCGGTGGTGATG > SRR4302545.4349572/1‑94 (MQ=60)
GATCCCCATTCCCGTTAACACCTCGATGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTAAAGGCTTCGGTGGTGATG > SRR4302545.4349576/1‑94 (MQ=60)
ATCCCCATTCCCGTTAACACCTCGACGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTAAAGGCTTCGGTGGTGATGC > SRR4302545.5777803/1‑94 (MQ=60)
TCCCCATTCCCGTTAACACCTCGATGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTAAAGGCTTCGGTGGTGATGCG > SRR4302545.4207176/1‑94 (MQ=60)
TCCCCATTCCCGTTAACACCTCGACGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTAAAGGCTTCGGTGGTGATGCG > SRR4302545.4971085/1‑94 (MQ=60)
TCCCCATTCCCGTTAACACCTCGACGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTAAAGGCTTCGGTGGTGATGCG < SRR4302545.6559188/94‑1 (MQ=60)
TCCCCATTCCCGTTAACACCTCGACGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTAAAGGCTTCGGTGGTGATGCG > SRR4302545.7587615/1‑94 (MQ=60)
CCCCATTCCCGTTAACACCTCGATGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTAAAGGCTTCGGTGGTGATGCGG < SRR4302545.7439335/94‑1 (MQ=60)
CCCCATTCCCGTTAACACCTCGACGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTAAAGGCTTCGGTGGTGATGCGG < SRR4302545.7537910/94‑1 (MQ=60)
CCCATTCCCGTTAACACCTCGACGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTAAAGGCTTCGGTGGTGATGCGGC < SRR4302545.10843647/94‑1 (MQ=60)
CACATTCCCGTTAACACCTCGACGCTAAACAGGTGGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTAAAGGCTTCGGTGGTGATGCGGC < SRR4302545.10843648/94‑1 (MQ=60)
CCATTCCCGTTAACACCTCGATGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTAAAGGCTTCGGTGGTGATGCGGCT < SRR4302545.1643982/94‑1 (MQ=60)
ATTCCCGTTAACACCTCGATGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTAAAGGCTTCGGTGGTGATGCGGCTCA > SRR4302545.6025610/1‑94 (MQ=60)
ATTCCCGTTAACACCTCGATGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTAAAGGCTTCGGTGGTGATGCGGCTCA > SRR4302545.3508026/1‑94 (MQ=60)
ATTCCCGTTAACACCTCGATGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTAAAGGCTTCGGTGGTGATGCGGCTCA > SRR4302545.3458363/1‑94 (MQ=60)
ATTCCCGTTAACACCTCGATGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTAAAGGCTTCGGTGGTGATGCGGCTCA > SRR4302545.2895038/1‑94 (MQ=60)
TCCCGTTAACACCTCGATGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTAAAGGCTTCGGTGGTGATGCGGCTCAAC > SRR4302545.5207293/1‑94 (MQ=60)
TCCCGTTAACACCTCGATGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTAAAGGCTTCGGTGGTGATGCGGCTCAAC > SRR4302545.5207292/1‑94 (MQ=60)
TCCCGTTAACACCTCGACGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTAAAGGCTTCGGTGGTGATGCGGCTCACC > SRR4302545.10564781/1‑94 (MQ=60)
CCCGTTAACACCTCGATGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTAAAGGCTTCGGTGGTGATGCGGCTCAACA > SRR4302545.3889862/1‑94 (MQ=60)
CCGTTAACACCTCGACGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTAAAGGCTTCGGTGGTGATGCGGCTCAACAC < SRR4302545.2889551/94‑1 (MQ=60)
CGTTAACACCTCGATGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTAAAGGCTTCGGTGGTGATGCGGCTCAACACA > SRR4302545.9773758/1‑94 (MQ=60)
CGTTAACACCTCGATGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTAAAGGCTTCGGTGGTGATGCGGCTCAACACA > SRR4302545.8602509/1‑94 (MQ=60)
CGTTAACACCTCGATGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTAAAGGCTTCGGTGGTGATGCGGCTCAACACA > SRR4302545.7896581/1‑94 (MQ=60)
CGTTAACACCTCGACGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTAAAGGCTTCGGTGGTGATGCGGCTCAACACA > SRR4302545.2715773/1‑94 (MQ=60)
GTTAACACCTCGATGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTAAAGGCTTCGGTGGTGATGCGGCTCAACACAC < SRR4302545.8944423/94‑1 (MQ=60)
TTAACACCTCGATGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTAAAGGCTTCGGTGGTGATGCGGCTCAACACACG > SRR4302545.10112081/1‑94 (MQ=60)
TTAACACCTCGACGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTAAAGGCTTCGGTGGTGATGCGGCTCAACACACG < SRR4302545.6921461/94‑1 (MQ=60)
TTAACACCTCGACGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTAAAGGCTTCGGTGGTGATGCGGCTCAACACACG > SRR4302545.10340284/1‑94 (MQ=60)
TAACACCTCGATGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTAAAGGCTTCGGTGGTGATGCGGCTCAACACACGA > SRR4302545.430695/1‑94 (MQ=60)
AACACCTCGATGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTAAAGGCTTCGGTGGTGATGCGGCTCAACACACGAA > SRR4302545.5090492/1‑94 (MQ=60)
ACACCTCGATGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTAAAGGCTTCGGTGGTGATGCGGCTCAACACACGAAC > SRR4302545.2124186/1‑94 (MQ=60)
CCCTCGACGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTAAAGGCTTCGGTGGTGATGCGGCTCAACACACGAACAT < SRR4302545.8036647/94‑1 (MQ=60)
ACCTCGATGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTAAAGGCTTCGGTGGTGATGCGGCTCAACACACGAACAT < SRR4302545.10545022/94‑1 (MQ=60)
ACCTCGATGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTAAAGGCTTCGGTGGTGATGCGGCTCAACACACGAACAT < SRR4302545.5691019/94‑1 (MQ=60)
ACCTCAACGCTAAACAGGATGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTTACTACGCTGGTTAAAGGCTTCGGTGGTGATGCGGCTCAACACACGAACAT > SRR4302545.10248592/1‑94 (MQ=60)
TCGATGCTAAACAGGTTGCCGAGCCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTAAAGGCTTCGGTGGTGATGCGGCTCAACACACGAACATCTT < SRR4302545.7428260/94‑1 (MQ=60)
TCGACGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTAAAGGCTTCGGTGGTGATGCGGCTCAACACACGAACATCTT < SRR4302545.1787258/94‑1 (MQ=60)
TCGACGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTAAAGGCTTCGGTGGTGATGCGGCTCAACACACGAACATCTT < SRR4302545.3715413/94‑1 (MQ=60)
CGACGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTAAAGGCTTCGGTGGTGATGCGGCTCAACACACGAACATCTTT < SRR4302545.8372981/94‑1 (MQ=60)
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ATGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTAAAGGCTTCGGTGTGGATGCGGCTAGACACACGAACATCTTTAA > SRR4302545.525514/1‑94 (MQ=60)
ATGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTAAAGGCTTCGGTGGTGATGCGGCTCAACACACGAACATCTTTAA > SRR4302545.460520/1‑94 (MQ=60)
ACGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTAAAGGCTTCGGTGGTGATGCGGCTCAACACACGAACATTTTTAA > SRR4302545.8168845/1‑94 (MQ=60)
TGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTAAAGGCTTCGGTGGTGATGCGGCTCCACACACGAACATCTTTAAC > SRR4302545.8091929/1‑94 (MQ=60)
CGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTAAAGGCTTCGGTGGTGATGCGGCTCAACACACGAACATCTTTAAC > SRR4302545.2441163/1‑94 (MQ=60)
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CCGCCAGATAGTTCGCCATCTGGCAATATTGCGCGACAGAGATATTTTCCGCTCGCATCGCCGGGTCGATCCCCATTCCCGTTAACACCTCGACGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTAAAGGCTTCGGTGGTGATGCGGCTCAACACACGAACATCTTTAAC > NC_000913/51635‑51821
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
