Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
647 |
270.1 |
21258240 |
98.4% |
20918108 |
94.0 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GATGCTGTTTCTGGTGCCGGGTAATGCCTTTGGCTGGCTGTTACCTGCAGGCAGTCTCGGCGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCCGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATGTTACTGGCGGGGATGGCGTTAAGCACCGCGTTCACCATGCTTTTGATGATGTTGCAGGCA > NC_000913/172772‑172958
|
GATGCTGTTTCTGGTGCCGGGTAATGCCTTTGGCTGGCTGTTACCTGCAGGCAGTCTCGGCGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCT > SRR4302545.380990/1‑94 (MQ=60)
GATGCTGTTTCTGGTGCCGGGTAATGCCTTTGGCTGGCTGTTACCTGCAGGCAGTCTCGGCGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCC > SRR4302545.4584270/1‑94 (MQ=60)
GATGCTGTTTCTGGTGCCGGGTAATGCCTTTGGCTGGCTGTTACCTGCAGGCAGTCTCGGCGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCC > SRR4302545.6523090/1‑94 (MQ=60)
ATGCTGTTTCTGGTGCCGGGTAATGCCTTTGGCTGGCTGTTACCTGCAGGCAGTCTCGGCGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCCG > SRR4302545.10154560/1‑94 (MQ=60)
ATGCTGTTTCTGGTGCCGGGTAATGCCTTTGGCTGGCTGTTACCTGCAGGCAGTCTCGGCGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCCG < SRR4302545.743362/94‑1 (MQ=60)
GCTGTTTCTGGTGCCGGGTAATGCCTTTGGCTGGCTGTTACCTGCAGGCAGTCTCGGCGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCTGCC < SRR4302545.4717489/94‑1 (MQ=60)
GCTGTTTCTGGTGCCGGGTAATGCCTTTGGCTGGCTGTTACCTGCAGGCAGTCTCGGCGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCCGCC > SRR4302545.7504239/1‑94 (MQ=60)
GCTGTTTCTGGTGCCGGGTAATGCCTTTGGCTGGCTGTTACCTGCAGGCAGTCTCGGCGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCCGCC < SRR4302545.3154254/94‑1 (MQ=60)
CTGTTTCTGGTGCCGGGTAATGCCTTTGGCTGGCTGTTACCTGCAGGCAGTCTCGGCGCGGCGGTTACGCTGTTGATCATTATGATCGCTGCCG < SRR4302545.3890740/94‑1 (MQ=60)
CTGTTTCTGGTGCCGGGTAATGCCTTTGGCTGGCTGTTACCTGCAGGCAGTCTCGGCGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCTGCCG > SRR4302545.7559251/1‑94 (MQ=60)
CTGTTTCTGGTGCCGGGTAATGCCTTTGGCTGGCTGTTACCTGCAGGCAGTCTCGGCGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCTGCCG > SRR4302545.7343965/1‑94 (MQ=60)
CTGTTTCTGGTGCCGGGTAATGCCTTTGGCTGGCTGTTACCTGCAGGCAGTCTCGGCGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCCGCCG > SRR4302545.2598789/1‑94 (MQ=60)
CTGTTTCTGGTGCCGGGTAATGCCTTTGGCTGGCTGTTACCTGCAGGCAGTCTCGGCGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCCGCCG > SRR4302545.8406818/1‑94 (MQ=60)
TGTTTCTGGTGCCGGGTAATGCCTTTGGCTGGCTGTTCCCTGCAGGCAGGCTCGGCGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCTGCCGG < SRR4302545.9248634/94‑1 (MQ=60)
TGTTTCTGGTGCCGGGTAATGCCTTTGGCTGGCTGTTACCTGCAGGCAGTCTCGGCGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCTGCCGG < SRR4302545.4758671/94‑1 (MQ=60)
TGTTTCTGGTGCCGGGTAATGCCTTTGGCTGGCTGTTACCTGCAGGCAGTCTCGGCGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCTGCCGG < SRR4302545.6433932/94‑1 (MQ=60)
TGTTTCTGGTGCCGGGTAATGCCTTTGGCTGGCTGTTACCTGCAGGCAGTCTCGGCGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCTGCCGG < SRR4302545.9881892/94‑1 (MQ=60)
TGTTTCTGGTGCCGGGTAATGCCTTTGGCTGGCTGTTACCTGCAGGCAGTCTCGGCGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCCGCCGG < SRR4302545.3540357/94‑1 (MQ=60)
TGTTTCTGGTGCCAGGTAATGCCTTTGGCTGGCGGTTGCCTTCAGGCAGACTCGGCGCGGCTGTGACGCTGATGATCATGATGGTCGCTGCCGG < SRR4302545.10125138/94‑1 (MQ=42)
GTTTCTGGTGCCGGGTAATGCCTTTGGCTGGCTGTTACCTGCAGGCAGTCTCGGCGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCTGCCGGC > SRR4302545.6454787/1‑94 (MQ=60)
GTTTCTGGTGCCGGGTAATGCCTTTGGCTGGCTGTTACCTGCAGGCAGTCTCGGCGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCCGCCGGC > SRR4302545.10029248/1‑94 (MQ=60)
TTCTGGTGCCGGGTAATGCCTTTGGCTGGCTGTTACCTGCAGGCAGTCTCGGCGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCCGCCGGCCG < SRR4302545.3147063/94‑1 (MQ=60)
TCTGGTTGCGGGTAATGCCGTTGGCTGGCTGTTGCCTGCAGGCAGTCTCGGCGGGGCGGTGTCGCTGTTGATCATTATGATCGCTGCCGGCCGC < SRR4302545.3480268/94‑1 (MQ=60)
TCTGGTGCCGGGTAATGCCTTTGGCTGGCTGTTACCTGCAGGCAGTCTCGGCGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCTGCCGGCCGC < SRR4302545.1311668/94‑1 (MQ=60)
TCTGGTGCCGGGTAATGCCTTTGGCTGGCTGTTACCTGCAGGCAGTCTCGGCGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCTGCCGGCCGC < SRR4302545.2870923/94‑1 (MQ=60)
TCTGGTGCCGGGTAATGCCTTTGGCTGGCTGTTACCTGCAGGCAGTCTCGGCGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCCGCCGGCCGC < SRR4302545.387287/94‑1 (MQ=60)
CTGGTGCCGGGTAATTCCTTTGGGTGGCTGTTACCTGCAGGCAGTCTCGGCGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCCGCCGGCCGCG < SRR4302545.6065003/94‑1 (MQ=60)
CTGGTGCCGGGTAATGCCTTTGGCTGGCTGTTACCTGCAGGCAGTCTCGGCGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCTGCCGGCCGCG > SRR4302545.2222704/1‑94 (MQ=60)
TGGTGCCGGGTAATGCCTTTGGCTGGCTGTTACCTGCAGGCAGTCTCGGCGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCTGGCGGCCGCGG > SRR4302545.4061137/1‑94 (MQ=60)
TGGTGCCGGGTAATGCCTTTGGCTGGCTGTTACCTGCAGGCAGTCTCGGCGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCTGCCGGCCGCGG < SRR4302545.10892867/94‑1 (MQ=60)
TGGTGCCGGGTAATGCCTTTGGCTGGCTGTTACCTGCAGGCAGTCTCGGCGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCTGCCGGCCGCGG < SRR4302545.742477/94‑1 (MQ=60)
GGTGCCGGGTAATGCCTTTGGCTGGGTGTTACGTGCAGGCAGTCTCGGCGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCCGCCGGCCGCGGT < SRR4302545.3981722/94‑1 (MQ=60)
GTGCCGGGTAATGCCTTTGGCTGGCTGTTACCTGCAGGCAGTCTCGGCGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCCGCCGGCCGCGGTG < SRR4302545.5080596/94‑1 (MQ=60)
TGCCGGGTAATGCCTTTGGCTGGCTGATACCTGCAGGCAGTCTCGGCGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCCACCGGCCGCGGGGG > SRR4302545.419692/1‑94 (MQ=60)
GCCGTGTAATGCCTGTGGCTGGCTGTTACCTGCAGGCAGTCTCGGCGCGGCGGTGACGCTAGTGATCATTATGATCGCTGCCGGTCGCGGTGGA < SRR4302545.5376024/94‑1 (MQ=60)
CCGTGTAATGCCTTTGGCTGGCTGTTACCTGCAGGCAGTCTCGGCGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCCGCCGGCCGCGGTGGAT < SRR4302545.2657372/94‑1 (MQ=60)
CCGGGTAATGCCTTTGGCTGGCTGTTACCTGCAGGCAGTCTCGGCGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCTGCCGGCCGCGGTGGAT > SRR4302545.10362231/1‑94 (MQ=60)
CGGGTAATGCCTTTGGCTGGCTGTTACCTGCAGGCAGTCTCGGCGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCTGGCGGCGGCGGTGGATT > SRR4302545.2769522/1‑94 (MQ=60)
CGGGTAATGCCTTTGGCTGGCTGTTACCTGCAGGCAGTCTCGGCGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCCGCCGGCCGCGGTGGATT > SRR4302545.2678486/1‑94 (MQ=60)
GGGTAATGCCTTTGGCTGGCTGTTACCTGCAGGCAGTCTCGGCGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCTGCCGGCCGCGGTGGATTT > SRR4302545.713063/1‑94 (MQ=60)
GGGTAATGCCTTTGGCTGGCTGTTACCTGCAGGCAGTCTCGGCGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCTGCCGGCCGCGGTGGATTT < SRR4302545.8507198/94‑1 (MQ=60)
GGTAATGCCTTTGGCTGGCTGTTACCTGCAGGCAGTCTCGGCGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCTGCCGGCCGCGGTGGATTTT > SRR4302545.10869408/1‑94 (MQ=60)
GGTAATGCCTTTGGCTGGCTGTTACCTGCAGGCAGTCTCGGCGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCTGCCGGCCGCGGTGGATTTT > SRR4302545.3964369/1‑94 (MQ=60)
GGTAATGCCTTTGGCTGGCTGTTACCTGCAGGCAGTCTCGGCGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCTGCCGGCCGCGGTGGATTTT > SRR4302545.1326773/1‑94 (MQ=60)
GGTAATGCCTTTGGCTGGCTGTTACCTGCAGGCAGTCTCGGCGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCTGCCGGCCGCGGTGGATTTT < SRR4302545.690968/94‑1 (MQ=60)
GTAATGCCTTTGGCTGGCTGTTACCTGCAGGCAGTCTCGGCGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCTGCCGGCCGCGGTGGATTTTC > SRR4302545.10086334/1‑94 (MQ=60)
GTAATGCCTTTGGCTGGCTGTTACCTGCAGGCAGTCTCGGCGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCTGCCGGCCGCGGTGGATTTTC < SRR4302545.7419155/94‑1 (MQ=60)
GTAATGCCTTTGGCTGGCTGTTACCTGCAGGCAGTCTCGGCGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCCGCCGGCCGCGGTGGATTTTC > SRR4302545.1516018/1‑94 (MQ=60)
TAATGCCTTTGGCTGGCTGTTACCTGCAGGCAGTCTCGGCGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCTGCCGGCCGCGGTGGATTTTCC > SRR4302545.10413729/1‑94 (MQ=60)
TAATGCCTTTGGCTGGCTGTTACCTGCAGGCAGTCTCGGCGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCCGCCGGCCGCGGTGGATTTTCC < SRR4302545.410294/94‑1 (MQ=60)
TGCCTTTGGCTGGCTGTTACCTGCAGGCAGTCTCGGCGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCTGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCA > SRR4302545.10281343/1‑94 (MQ=60)
GCCTTTGGCTGGCTGTTACCTGCAGGCAGTCTCGGCGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCTGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCAC < SRR4302545.2724333/94‑1 (MQ=60)
GCCTTTGGCTGGCTGTTACCTGCAGGCAGTCTCGGCGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCCGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCAC > SRR4302545.6920525/1‑94 (MQ=60)
TTTGGCTGTCTGTTACCTGCAGGCAGTCTCGGCGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCCGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACC < SRR4302545.5801073/94‑1 (MQ=60)
TTTGGCTGGCTGTTACCTGCAGGCAGTCTCGGCGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCTGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACC < SRR4302545.2102671/94‑1 (MQ=60)
GCTGGCTGTTACCTGCAGGCAGTCTCGGCGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCCGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTAT > SRR4302545.2125848/1‑94 (MQ=60)
CTGGCTGTTGCCTGCAGGCAGTCTCGGCGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCCGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATG < SRR4302545.3160569/94‑1 (MQ=60)
CTGGCTGTTACCTGCAGGCAGTCTCGGCGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCCGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATG > SRR4302545.5390233/1‑94 (MQ=60)
CTGGCTGTTACCTGCAGGCAGTCTCGGCGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCCGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATG > SRR4302545.4611378/1‑94 (MQ=60)
TGGCTGTTACCTGCAGGCAGTCTCGGCGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCTGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATGT < SRR4302545.2421882/94‑1 (MQ=60)
TGGCTGTTACCTGCAGGCAGTCTCGGCGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCCGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATGT > SRR4302545.5780339/1‑94 (MQ=60)
TGGCTGTTACCTGCAGGCAGTCTCGGCGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCCGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATGT > SRR4302545.9280510/1‑94 (MQ=60)
TGGCTGTTACCTGCAGGCAGTCTCGGCGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCCGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATGT > SRR4302545.892586/1‑94 (MQ=60)
TGGCTGTTACCTGCAGGCAGTCTCGGCGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATAGCTGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATGT > SRR4302545.4515051/1‑94 (MQ=60)
GGCTGTTACCTGCAGGCAGTCTCGGCGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCTGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATGTT > SRR4302545.3899923/1‑94 (MQ=60)
GGCTGTTACCTGCAGGCAGTCTCGGCGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCCGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATGTT < SRR4302545.4840999/94‑1 (MQ=60)
GCTGTTACCTGCAGGCAGTCTCGGCGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCTGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATGTTA < SRR4302545.4136868/94‑1 (MQ=60)
TGTTACCTGCAGGCAGTCTCGGCGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCTGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATGTTACT > SRR4302545.8708857/1‑94 (MQ=60)
TGTTACCTGCAGGCAGTCTCGGCGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCCGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATGTTACT < SRR4302545.8076739/94‑1 (MQ=60)
TGATACCTGCAGGCAGTCTCGGCGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCTGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATGTTACT < SRR4302545.1875308/94‑1 (MQ=60)
gttaccctccgggagtcgccgccCGGCGGTTACGCTGTTGATCATTATGATCCCCGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATGTTACTG < SRR4302545.2920457/71‑1 (MQ=60)
GTTACCTGCAGGCAGTCTCGGCGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCTGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATGTTACTG < SRR4302545.1545632/94‑1 (MQ=60)
GTTACCTGCAGGCAGTCTCGGCGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCCGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATGTTACTG < SRR4302545.11540/94‑1 (MQ=60)
TTACCTGCAGGCAGTCTCGGCGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCTGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATGTTACTGG < SRR4302545.10811560/94‑1 (MQ=60)
TTACCTGCAGGCAGTCTCGGCGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCTGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATGTTACTGG < SRR4302545.10811771/94‑1 (MQ=60)
TTACCTGCAGGCAGTCTCGGCGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCCGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATGTTACTGG > SRR4302545.10139160/1‑94 (MQ=60)
TACCTGCAGGCAGTCTCGGCGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCCGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATGTTACTGGC < SRR4302545.1079145/94‑1 (MQ=60)
CTGCAGGCAGTCTCGGCGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCTGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATGTTACTGGCGGG < SRR4302545.8911097/94‑1 (MQ=60)
CTGCAGGCAGTCTCGGCGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCTGCCGGCCGCGGAGGATTTTCCCCACACCGTATGTTACTGGCGGG > SRR4302545.10291228/1‑94 (MQ=60)
CTGCAGGCAGTCTCGGCGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCCGCCGGCCGAGGTGGATTTTCCCCACACCGTATGTTACTGGCGGG > SRR4302545.5428320/1‑94 (MQ=60)
CAGGCAGTCTCGGCGCGGCGGTGCCGCTGTTGATCATTATGATCGCCGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATGTTACTGGCGGGGAT < SRR4302545.5994581/94‑1 (MQ=60)
CAGGCAGTCTCGGCGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCCGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATGTTACTGGCGGGGgg > SRR4302545.2222920/1‑92 (MQ=60)
CAGGCAGTCTCGGCGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCCGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATGTTACTGGCGGGGAT < SRR4302545.1301467/94‑1 (MQ=60)
CAGGCAGTCTCGGCGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCCGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATGTTACTGGCGGGGAG > SRR4302545.6310666/1‑94 (MQ=60)
CAGGCAGGCTCGGCGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCCGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATGTTACTGGCGGGGAT < SRR4302545.7007362/94‑1 (MQ=60)
AGGCAGTCTCGGCGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCTGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATGTTACTGGCGGGGggg > SRR4302545.8102221/1‑91 (MQ=60)
AGGCAGTCTCGGCGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCTGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATGTTACTGGCGGGGATG > SRR4302545.1381008/1‑94 (MQ=60)
AGGCAGTCTCGGCGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCTGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATGTTACTGGCGGGGATG < SRR4302545.3672830/94‑1 (MQ=60)
AGGCAGTCTCGGCGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCCGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATGTTACTGGCGGGGATG < SRR4302545.10287908/94‑1 (MQ=60)
AGGCAGTCTCGGCGCGGCGGCGACGCTGTTGATCATTATGATCGCCGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATGTTACTGGCCGGGGTG > SRR4302545.8909549/1‑94 (MQ=60)
GGCAGTCTCGGCGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCTGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATGTTACTGGCGGGGATGG < SRR4302545.6053385/94‑1 (MQ=60)
CAGTTTCGGCGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCTGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATGTTACTGGCGGGGAGGGCG > SRR4302545.2311641/1‑94 (MQ=60)
CAGTCTCGGCGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCTGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATGTTACTGGCGGGGGTGGCG > SRR4302545.67485/1‑94 (MQ=60)
CAGTCTCGGCGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCTGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATGTTACTGGCGGGGAggggg > SRR4302545.2311916/1‑89 (MQ=60)
CAGTCTCGGCGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCCGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATGTTACTGGCGGGGGTGGGG > SRR4302545.2189798/1‑94 (MQ=60)
AGTCTCGGCGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCCGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATGTTACTGGCGGGGgggggcg > SRR4302545.4460593/1‑87 (MQ=60)
AGTCTCGGCGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCCGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATGTTACTGGCGGGGGTGGCGT > SRR4302545.5055985/1‑94 (MQ=60)
AGTCTCGGCGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCCGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATGTTACTGGCGGGGGTGGCGT > SRR4302545.3068713/1‑94 (MQ=60)
GTCTCGGCGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCTGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATGTTACTGGCGGGGGTGGGGTT > SRR4302545.7707317/1‑94 (MQ=60)
GTCTCGGCGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCCGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATGTTACTGGCGGGGGTGGCGGT > SRR4302545.390534/1‑94 (MQ=60)
GTCTCGGCGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCCGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATGTTACTGGCGGGGATGGCGTT < SRR4302545.4949452/94‑1 (MQ=60)
GTCTCGGCGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCCGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATGTTACTGGCGGGGATGGCGTT < SRR4302545.1338076/94‑1 (MQ=60)
TCTCGGCGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCTGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATGTTACTGGCGGGGATGGCGTTA < SRR4302545.2283925/94‑1 (MQ=60)
TCTCGGCGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCCGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATGTTACTGGCGGGGATGGCGGTA > SRR4302545.9869686/1‑94 (MQ=60)
TCGGCGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCTGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATGTTACTGGCGGGGATGGCGTTAAG < SRR4302545.3982076/94‑1 (MQ=60)
TCGGCGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCTGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATGTTACTGGCGGGGATGGCGTTAAG < SRR4302545.5687225/94‑1 (MQ=60)
CGGCGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCTGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATGTTACTGGCGGGGATGGCGTTAAGC < SRR4302545.3693252/94‑1 (MQ=60)
CGGCGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCCGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATGTTACTGGCGGGGAGGGCGGTAAGC > SRR4302545.3709486/1‑94 (MQ=60)
GGCGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCTGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATGTTACTGGCGGGGATGGCGTTAAGCA < SRR4302545.111071/94‑1 (MQ=60)
GGCGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCCGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATGTTACTGGCGGGGGTGGCGTTAAGCA > SRR4302545.982263/1‑94 (MQ=60)
GCGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCTGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATGTTACTGGCGGGGATGGCGGTAAGCAC > SRR4302545.6343327/1‑94 (MQ=60)
GCGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCCGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATGTTACTGGCGGGGGTGGCGGTTAGCAC > SRR4302545.8440905/1‑94 (MQ=60)
GCGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCCGCCGGCCGCGGCGGATTTTGCCCTCACCGCATCTTACTGGAGGGGATGacgtgtcaccg > SRR4302545.4504421/1‑83 (MQ=60)
CGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCCGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATGTTACTGGCGGGGATGGCGTTAAGCACC < SRR4302545.2835312/94‑1 (MQ=60)
GCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCTGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATGTTACTGGCGGGGATGGCGTTAAGCACCG < SRR4302545.8745718/94‑1 (MQ=60)
CGGCGGTGACTCTGTTGATCATTATGATCGCTGCCGGCCGCGGTGGTTTTTCCCCACACCGTATGTTACTGGCGGGGATGGCGTTAAGCACCGC < SRR4302545.4375980/94‑1 (MQ=60)
CGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCCGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATGTTACTGGCGGGGATGGCGTTAAGCACCGC < SRR4302545.10296492/94‑1 (MQ=60)
GGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCCGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATGTTACTCGCGGGGGTGGCGTTAAGAACCGCG > SRR4302545.7891158/1‑94 (MQ=60)
GCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCCGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATGTTACTGGCGGGGATGGCGTTAAGCACCGCGT < SRR4302545.3001056/94‑1 (MQ=60)
CGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCTGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATGTTACTGGCGGGGATGGCGTTAAGCACCGCGTT < SRR4302545.5803405/94‑1 (MQ=60)
CGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCCGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATGTTACTGGCGGGGGTGGCGGTAAGCgcggggtt > SRR4302545.3698523/1‑86 (MQ=60)
GGTGGCGCTGTTGATCATTATGATCGCTGCCGGCCGAGGTGGCCTTTCCCCTCACCGTATGTTACTGGCGGGGcgtggggtatgacaaggggtt > SRR4302545.4722035/1‑73 (MQ=50)
GGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCTGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATGTTACTGGCGGGGGTGGGGTTAAGCACCGCGTTC > SRR4302545.4722034/1‑94 (MQ=60)
GGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCTGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATGTTACTGGCGGGGATGGCGTTAAGCAGCGCGTTC > SRR4302545.9870561/1‑94 (MQ=60)
GGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCCGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATGTTACTGGCGGGGATGGGGTTAAGCACCGCGTTC > SRR4302545.8610617/1‑94 (MQ=60)
TGACGCTGTTGATCATTATGATCGCTGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATGTTACTGGCGGGGAcgggggtaactaccccggtttc > SRR4302545.7829235/1‑72 (MQ=60)
TGACGCTGTTGATCATTATGATCGCCGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATGTTACTGGCGGGGGTGGGGTTGAGCACCGCGGTCAC > SRR4302545.5876724/1‑94 (MQ=60)
GACGCTGTTGATCATTATGATCGCCGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATGTTACTGGCGGGGATGGCGTTAAGCACCGCGTTCACC > SRR4302545.9123871/1‑94 (MQ=60)
ACGCTGTTGATCATTATGATCGCCGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATGTTACTGGCGGGGGTGGCGctaagtctcgcggttacca > SRR4302545.5936502/1‑75 (MQ=60)
ACGCTGTTGATCATTATGATCGCCGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATGTTACTGGCGGGGGTGGCGGTAAGGACCGCGcttaaca > SRR4302545.5936496/1‑87 (MQ=60)
ACGCTGTTGATCATTATGATCGCCGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATGTTACTGGCGGGGATGGCGTTAAGCACCGCGTTCACCA < SRR4302545.9311515/94‑1 (MQ=60)
CGCTGTTGATCATTATGATCGCTGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATGTTACTGGCGGGGATGGCGTTAAGCACCGCGTTCACCAT < SRR4302545.3997364/94‑1 (MQ=60)
CGCTGTTGATCATTATGATCGCCGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATGTTACTGGCGGGGGTGGCGTTAAGCACCGCGTTCACCAT > SRR4302545.8218231/1‑94 (MQ=60)
GCTGTTGATCATTATGATCGCCGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATGTTACTGGCGGGGATGGCGTTAAGCACCGCGTTCACCATG < SRR4302545.7205540/94‑1 (MQ=60)
CTGTTGATCATTATGATCGCTGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATGTTACTGGCGGGGGGGGCGTTAAGCACCGCGGTCACCATGC > SRR4302545.312569/1‑94 (MQ=60)
CTGTTGATCATTATGATCGCCGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATGTTACTGGCGGGGggggggttaagcaccacggtccaccttt > SRR4302545.6244400/1‑66 (MQ=60)
CTGTTGATCATTATGATCGCCGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATGTTACTGGCGGGGATTGCGTTtaaccacgcgctcaccatgt > SRR4302545.6244399/1‑74 (MQ=60)
TGTTGATCATTATGATCGCTGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATGTTACTGGCGGGGATGGCGTTAAGCACCGCGTTCACCATGCT < SRR4302545.1832748/94‑1 (MQ=60)
GTTGATCATTATGATCGCTGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATGTTACTGGCGGGGATGGCGTTAAGCACCGCGTTCACCATTCTT > SRR4302545.8902337/1‑94 (MQ=60)
GTTGATCATTATGATCGCTGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATGTTACTGGCGGGGATGGCGTTAAGCACCGCGTTCACCATGCTT < SRR4302545.3164540/94‑1 (MQ=60)
TTGATCATTATGATCGCTGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATGTTACTGGCGGGGGTGGCGTTAAGCACCGCGTTCACCATGCTTT > SRR4302545.7236913/1‑94 (MQ=60)
TGATCATTATGATCGCCGCCGGCCGCGGTGGATTTTACCCACACCGTATGTTACTGGCGGGGATGGTGTTGAGCGTCGCGTTTAACATGCTTTT > SRR4302545.1230710/1‑94 (MQ=60)
GATCATTATGATCGCTGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATGTTACTGGCGGGGATGGCGTTAAGCACCGCGTTCACCATGCTTTTG < SRR4302545.5643640/94‑1 (MQ=60)
ATCATTATGATCGCTGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATGTTACTGGCGGGGATGGCGTTAAGCACCGCGTTCACCATGCTTTTGA < SRR4302545.5191513/94‑1 (MQ=60)
gcatgATGATCGCTGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATGTTACTGGCGGGGATGGCGTTAAGCACCGCGTTCACCATGCTTTTGAT < SRR4302545.5201091/89‑1 (MQ=60)
gcatgATGATCGCTGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTAGGTTACTGGCGGGGATGGCGTTAAGCACCGCGTTCACCATGCTTTTGAT < SRR4302545.5201090/89‑1 (MQ=60)
TCATTATGATCGCTGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATGTTACTGGCGGGGATGGCGTTAAGCACCGCGTTCACCATGCTTTTGAT < SRR4302545.8678345/94‑1 (MQ=60)
TCATTATGATCGCCGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATGTTACTGGCGGGGATGGCGTTAAGCACCGCGTTCACCATGCTTTTGAT < SRR4302545.3073476/94‑1 (MQ=60)
CATTATGATCGCTGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATGTTACTGGCGGGGGTGGGGTTAAGCACCGCGgtaaccatcattttggtg > SRR4302545.9894282/1‑76 (MQ=60)
CATTATGATCGCTGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATGTTACTGGCGGGGGTGGCGGTTAGCACCGCGTTTACCATGCTTTTGATG > SRR4302545.9894281/1‑94 (MQ=60)
CATTATGATCGCCGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATGTTACTGGCGGGGGTGGCGTTAAGCACCGCGTTCCCCATGCTTTTTATG > SRR4302545.4187260/1‑94 (MQ=60)
CATTATGATCGCCGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATGTTACTGGCGGGGATGGCGTTAAGCACCGCGTTCACCATGCTTTTGATG > SRR4302545.5580731/1‑94 (MQ=60)
ATTATGATCGCCGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATGTTACTGGCGGGGGTGGCGTTAAGCACCGCGCTCACCATGCTTTTtttga > SRR4302545.6841709/1‑89 (MQ=60)
ATTATGATCGCCGCCGGCCACGGTGGATTTTCCCCACACCGTATGTTACTGGCGGGGATGGCGTTAAGCACCGCGTTCACCATGCTTTTGATGA < SRR4302545.8993433/94‑1 (MQ=60)
TATGATCGCTGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATGTTACTGGCGGGGGTGGCGTTAAGCACAGCGTTCACCCTGCTTTTTATGATG > SRR4302545.2442859/1‑94 (MQ=60)
ATGATCGCTGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATGTTACTGGCGGGGGTGGCGTTAAGCACCGCGGTCACCCTGCTTTTGATGATGT > SRR4302545.2259470/1‑94 (MQ=60)
GATCGCTGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATGTTACTGGCGGGGATGGCGTTAAGCACCGCGTTCACCATGCTTTTGATGATGTTG < SRR4302545.7961272/94‑1 (MQ=60)
GATCGCTGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATGTTACTGGCGGGGATGGCGTTAAGCACCGCGTTCACCATGCTTTTGATGATGTTG < SRR4302545.3334902/94‑1 (MQ=60)
GATCGCTGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATGTTACTGGCGGGGATGGCGTTAAGCACCGCGTTCACCATGCTTTTGATGATGTTG > SRR4302545.4489380/1‑94 (MQ=60)
ATCGCTGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATGTTACTGGCGGGGGGGGCGGTAAGCAACGCGTTCACCATGATTTTGATGATGTTGC > SRR4302545.1150144/1‑94 (MQ=60)
TCGCTGCTGGCCGCGGTGTATTTTGCCCACACCGTATGTTACTGGCGGGGATGGCGTTAAGCACCGCGTTCACCATGCTTTTGATGATGTTGCA < SRR4302545.953971/94‑1 (MQ=60)
TCGCTGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATGTTACTGGCGGGGATGGCGTTAAGCACCGCGTTCACCATGCTTTTGATGATGTTGCA < SRR4302545.6736673/94‑1 (MQ=60)
TCGCCGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATGTTACTGGCGGGGATGGCGTTAAGCACCGCGTTCACCATGCTTTTGATGATGTTGCA > SRR4302545.3799212/1‑94 (MQ=60)
CGCTGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATGTTACTGGCGGGGATGGCGTTAAGCACCGCGGTCACCATGCTTTTGATGATGTTGCAG > SRR4302545.211488/1‑94 (MQ=60)
CGCCGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATGTTACTGGCGGGGGTTGGGTTAAGCCCCGCGTTCACCATGTTTTTGATGATGTTGCAG > SRR4302545.4042672/1‑94 (MQ=60)
CGCCGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATGTTACTGGCGGGGATGGCGTTAAGCACCGCGTTCACCATGCTTTTGATGATGTTGCAG < SRR4302545.409673/94‑1 (MQ=60)
CGCCGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATGTTACTGGCGGGGATGGCGTTAAGCACCGCGTTCACCATGCTTTTGATGATGTTGCAG > SRR4302545.2020528/1‑94 (MQ=60)
GCCGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATGTTACTGGCGGGGGTGGCGTTAAGCACCGCGTTCACCATGCTTTTGATGATGTTGTAGG > SRR4302545.9083373/1‑94 (MQ=60)
CCCGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATGTTACTGGCGGGGATGGCGTTAAGCACCGCGTTCACCATGCTTTTGATGATGTTGCAGG < SRR4302545.4124406/94‑1 (MQ=60)
CTGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATGTTACTGGCGGGGATGGCGTTAAGCACCGCGTTCACCATGCTTTTGATGATGTTGCAGGC < SRR4302545.8259419/94‑1 (MQ=60)
CCGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATGTTACTGGCGGGGGTGGCGTTAAGGACCGCGTTCACCCTGCTTTTGATGATGTTGCAGGC > SRR4302545.1459400/1‑94 (MQ=60)
CCGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATGTTACTGGCGGGGATGGCGTTAAGCAACGCGTTCACCATGCTTTTTATGATGTTGCAGGC > SRR4302545.259205/1‑94 (MQ=60)
TGCCGGCCGCGGGGGATTTTTCCCACACCGTATGTTACTGGCGGGGATGGggattagaaacgccttcaccatgcctttgctgatgttgaagcca > SRR4302545.5255385/1‑50 (MQ=59)
|
GATGCTGTTTCTGGTGCCGGGTAATGCCTTTGGCTGGCTGTTACCTGCAGGCAGTCTCGGCGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCCGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATGTTACTGGCGGGGATGGCGTTAAGCACCGCGTTCACCATGCTTTTGATGATGTTGCAGGCA > NC_000913/172772‑172958
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
