Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
647 |
270.1 |
21258240 |
98.4% |
20918108 |
94.0 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 216 total aligned reads displayed.
TAAACAATAACAATCCATTACTGGAATCATTTGGAATCTTTACATTATGCCGTGCACGTCTGCTGCTACGCTTTTTGTCATTTGTAGCACAAGTAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCACACTTGCCCGGTAATTAACGACGAAAGAAAAGTAAGGTGGATGAACAATGAGTGCGTCGTTGGCGATCCTG > NC_000913/406489‑406675
|
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ATTACTGGAATCATTTGGAATCTTTACATTATGCCGTGCACGTCTGCTGCTACGCTTTTTGTCATTTGTAGCACAAGCAAGTGTCAGCAGTGGT > SRR4302545.1813610/1‑94 (MQ=60)
ATTACTGGAATCATTTGGAATCTTTACATTATGCCGTGCACGTCTGCTGCTACGCTTTTTGTCATTTGTAGCACAAGCAAGTGTCAGCAGTGGT < SRR4302545.2380907/94‑1 (MQ=60)
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GAATCATTTGGAATCTTTACATTATGCCGTGCACGTCTGCTGCTACGCTTTTTGTCATTTGTAGCACAAGTAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCAC > SRR4302545.6170363/1‑94 (MQ=60)
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TCATTTGGAATCTTTACATTATGCCGTGCACGTCTGCTGCTACGCTTTTTGTCATTTGTAGCACAAGCAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCACACT > SRR4302545.8429349/1‑94 (MQ=60)
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TTTGGAATCTTTACATTATGCCGTGCACGTCTGCTGCTACGCTTTTTGTCATTTGTAGCACAAGTAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCACACTTGC > SRR4302545.7699335/1‑94 (MQ=60)
TTTGGAATCTTTACATTATGCCGTGCACGTCTGCTGCTACGCTTTTTGTCATTTGTAGCACAAGTAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCACACTTGC > SRR4302545.9409638/1‑94 (MQ=60)
TTGGAATCTTTACATTATGCCGTGCACGTCTGCTGCTACGCTTTTTGTCATTTGTAGCACAAGTAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCACACTTGCC > SRR4302545.2232774/1‑94 (MQ=60)
TGGAATCTTTACATTATGCCGTGCACGTCTGCTGCTACGCTTTTTGTCATTTGTAGCACAAGTAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCACACTTGCCC < SRR4302545.7346063/94‑1 (MQ=60)
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GGAATCTTTACATTATGCCGTGCACGTCTGCTGCTACGCTTTTTGTCATTTGTAGCACAAGTAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCACACTTGCCCG > SRR4302545.2186278/1‑94 (MQ=60)
GGAATCTTTACATTATGCCGTGCACGTCTGCTGCTACGCTTTTTGTCATTTGTAGCACAAGTAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCACACTTGCCCG < SRR4302545.8913994/94‑1 (MQ=60)
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GAATCTTTACATTATGCCGTGCACGTCTGCTGCTACGCTTTTTGTCATTTGTAGCACAAGCAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCACACTTGCCCGG < SRR4302545.5377943/94‑1 (MQ=60)
AATCTTTACATTATGCCGTTCACGTCTGCTGCTACGCTTTTTGTCATTTGTAGCACAAGTAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCACACTTGCCCGGT < SRR4302545.10629109/94‑1 (MQ=60)
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TCTTTACATTATGCCGTGCACGTCTGCTGCTACGCTTTTTGTCATTTGTAGCACAAGCAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCACACTTGCCCGGTAA > SRR4302545.513126/1‑94 (MQ=60)
CTTTACATTATGCCGTGCACGTCTGCTGCTACGCTTTTTGTCATTTGTAGCACAAGCAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCACACTTGCCCGGTAAT < SRR4302545.2336019/94‑1 (MQ=60)
TTTACATTATGCCGTGCACGTCTGCTGCTACGCTTTTTGTCATTTGTAGCACAAGTAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCACACTTGCCCGGTAATT < SRR4302545.10413020/94‑1 (MQ=60)
TTTACATTATGCCGTGCACGTCTGCTGCTACGCTTTTTGTCATTTGTAGCACAAGCAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCACACTTGCCCGGTAATT < SRR4302545.2808602/94‑1 (MQ=60)
TTTACATTATGCCGTGCACGTCTGCTGCTACGCTTTTTGTCATTTGTAGCACAAGCAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCACACTTGCCCGGTAATT < SRR4302545.9555265/94‑1 (MQ=60)
TTTACATTATGCCGTGCACGTCTGCTGCTACGCTTTTTGTCATTTGTAGCACAAGCAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCACACTTGCCCGGTAATT < SRR4302545.9555264/94‑1 (MQ=60)
TTACATTATGCCGTGCACGTCTGCTGCTACGCTTTTTGTCATTTGTAGCACAAGCAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCACACTTGCCCGGTAATTA > SRR4302545.8670492/1‑94 (MQ=60)
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TACATTATGCCGTGCACGTCTGCTGCTACGCTTTTTGTCATTTGTAGCACAAGCAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCACACTTGCCCGGTAATTAA < SRR4302545.8203830/94‑1 (MQ=60)
TACATTATGCCGTGCACGTCTGCTGCTACGCTTTTTGTCATTTGTAGCACAAGCAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCACACTTGCCCGGTAATTAA > SRR4302545.5868550/1‑94 (MQ=60)
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ACATTATGCCGTGCACGTCTGCTGCTACGCTTTTTGTCATTTGTAGCACAAGCAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCACACTTGCCCGGTAATTAAC < SRR4302545.7248047/94‑1 (MQ=60)
CATTATGCCGTGCACGTCTGCTGCTACGCTTTTTGTCATTTGTAGCACAAGTAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCACACTTGCCCGGTAATTAACG < SRR4302545.4672144/94‑1 (MQ=60)
ATTATGCCGTGCACGTCTGCTGCTACGCTTTTTGTCATTTGTAGCACAAGCAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCACACTTGCCCGGTAATTAACGA > SRR4302545.5537304/1‑94 (MQ=60)
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TTATGCCGTGCACGTCTGCTGCTACGCTTTTTGTCATTTGTAGCACAAGCAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCACACTTGCCCGGTAATTAACGAC < SRR4302545.10329475/94‑1 (MQ=60)
TATGCCGTGCACGTCTGCTGCTACGCTTTTTGTCATTTGTAGCACAAGTAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCACACTTGCCCGGTAATTAACGACG > SRR4302545.3280034/1‑94 (MQ=60)
ATGCCGTGCACGTCTGCTGCTACGCTTTTTGTCATTTGTAGCACAAGTAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCACACTTGCCCGGTAATTAACGACGA > SRR4302545.258550/1‑94 (MQ=60)
ATGCCGTGCACGTCTGCTGCTACGCTTTTTGTCATTTGTAGCACAAGTAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCACACTTGCCCGGTAATTAACGACGA < SRR4302545.8733683/94‑1 (MQ=60)
CCGTGCACGTCTGCTGCTACGCTTTTTGTCATTTGTAGCACAAGTAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCACACTTGCCCGGTAATTAACGACGAAAG > SRR4302545.3152081/1‑94 (MQ=60)
CGTGCACGTCTGCTGCTACGCTTTTTGTCATTTGTAGCACAAGTAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCACACTTGCCCGGTAATTAACGACGAAAGA > SRR4302545.10372034/1‑94 (MQ=60)
CGTGCACGTCTGCTGCTACGCTTTTTGTCATTTGTAGCACAAGCAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCACACTTGCCCGGTAATTAACGACGAAAGA < SRR4302545.3784516/94‑1 (MQ=60)
CGTGCACGTCTGCTGCTACGCGTTTTGTGATTTGTAGCACAAGTAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCACACTTGCCCGGTAATTGACGACGAAAGA > SRR4302545.9613181/1‑94 (MQ=60)
GTGCACGTCTGCTGCTACGCTTTTTGTCATTTGTAGCACAAGTAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCACACTTGCCCGGTAATTAACGACGAAAGAA > SRR4302545.4123852/1‑94 (MQ=60)
GTGCACGTCTGCTGCTACGCTTTTTGTCATTTGTAGCACAAGCAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCACACTTGCCCGGTAATTAACGACGAAAGAA > SRR4302545.10781321/1‑94 (MQ=60)
GTGCACGTCTGCTGCTACGCTTTTTGTCATTTGTAGCACAAGCAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCACACTTGCCCGGTAATTAACGACGAAAGAA > SRR4302545.10600596/1‑94 (MQ=60)
GTGCACGTCTGCTGCTACGCTTTTTGTCATTTGTAGCACAAGCAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCACACTTGCCCGGTAATTAACGACGAAAGAA < SRR4302545.4497482/94‑1 (MQ=60)
GTGCACGTCTGCTGCTACGCTTTTTGTCATTTGTAGCACAAGCAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCACACTTGCCCGGTAATTAACGACGAAAGAA > SRR4302545.8360297/1‑94 (MQ=60)
TGCACGTCTGCTGCTACGCTTTTTGTCATTTGTAGCACAAGTAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCACACTTGCCCGGTAATTAACGACGAAAGAAA > SRR4302545.85509/1‑94 (MQ=60)
GCACGTCTGCTGCTACGCTTTTTGTCATTTGTAGCACAAGTAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCACACTTGCCCGGTAATTAACGACGAAAGAAAA > SRR4302545.9288177/1‑94 (MQ=60)
GCACGTCTGCTGCTACGCTTTTTGTCATTTGTAGCACAAGCAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCACACTTGCCCGGTAATTAACGACGAAAGAAAA < SRR4302545.4363683/94‑1 (MQ=60)
ACGTCTGCTGCTACGCTTTTTGTCATTTGTAGCACAAGTCAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCACACTTGCCCGGTAATTAACGACGAAAGAAAAGT > SRR4302545.10453265/1‑94 (MQ=60)
ACGTCTGCTGCTACGCTTTTTGTCATTTGTAGCACAAGTAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCACACTTGCCCGGTAATTAACGACGAAAGAAAAGT < SRR4302545.10612570/94‑1 (MQ=60)
ACGTCTGCTGCTACGCTTTTTGTCATTTGTAGCACAAGTAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCACACTTGCCCGGTAATTAACGACGAAAGAAAAGT > SRR4302545.3179206/1‑94 (MQ=60)
ACGTCTGCTGCTACGCTTTTTGTCATTTGTAGCACAAGTAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCACACTTGCCCGGTAATTAACGACGAAAGAAAAGA > SRR4302545.3031583/1‑94 (MQ=60)
CGTCTGCTGCTACGCTTTTTGTCATTTGTAGCACAAGCAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCACCCTTGCCCGGTAATTAACGACGAAAGAAAAGTA < SRR4302545.3677726/94‑1 (MQ=60)
GTCTGCTGCTACGCTTTTTGTCATTTGTAGCACAAGTAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCACACTTGCCCGGTAATTAACGACGAAAGAAAAGTAA > SRR4302545.4553085/1‑94 (MQ=60)
TCTGCTGCTACGCTTTTTGTCATTTGTAGCACAAGCAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCACACTTGCCCGGTAATTAACGACGAAAGAAAAGTAAG < SRR4302545.8360510/94‑1 (MQ=60)
GCTGCTGCTACGCTTTTTGTCATTTGTAGCACAAGCAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCACACTTGCCCGGTAATTAACGACGAAAGAAAAGTAAG < SRR4302545.4942837/94‑1 (MQ=60)
CTGCTGCTACGCTTTTTGTCATTTGTAGCACAAGCAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCACACTTGCCCGGTAATTAACGACGAAAGAAAAGTAAGG > SRR4302545.10131178/1‑94 (MQ=60)
CTGCTGCTACGCTTTTTGTCATTTGTAGCACAAGCAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCACACTTGCCCGGTAATTAACGACGAAAGAAAAGTAAGG > SRR4302545.6760587/1‑94 (MQ=60)
TGCTGCTACGCTTTTTGTCATTTGTAGCACAAGTAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCACACTTGCCCGGTAATTAACGACGAAAGAAAAGTAAGGT < SRR4302545.9159707/94‑1 (MQ=60)
TGCTGCTACGCTTTTTGTCATTTGTAGCACAAGTAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCACACTTGCCCGGTAATTAACGACGAAAGAAAAGTAAGGT > SRR4302545.662432/1‑94 (MQ=60)
TGCTGCTACGCTTTTTGTCATTTGTAGCACAAGTAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCACACTTGCCCGGTAACTAACGACGAAAGAAAAGTAAGGT < SRR4302545.9159709/94‑1 (MQ=60)
GCTGCTACGCTTTTTGTCATTTGTAGCACAAGCAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCACACTTGCCCGGTAATTAACGACGAAAGAAAAGTAAGGTG > SRR4302545.4519359/1‑94 (MQ=60)
CTGCTACGCTTTTTGTCATTTGTAGCACAAGCAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCACACTTGCCCGGTAATTAACGACGAAAGAAAAGTAAGGTGG > SRR4302545.10904279/1‑94 (MQ=60)
TGCTACGCTTTTTGTCATTTGTAGCACAAGTAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCACACTTGCCCGGTAATTAACGACGAAAGAAAAGTAAGGTGGA > SRR4302545.5525492/1‑94 (MQ=60)
TGCTACGCTTTTTGTCATTTGTAGCACAAGCAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCACACTTGCCCGGTAATTAACGACGAAAGAAAAGTAAGGTGGA > SRR4302545.9890548/1‑94 (MQ=60)
GCTACGCTTTTTGTCATTTGTAGCACAAGTAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCACACTTGCCCGGTAATTAACGACGAAAGAAAAGTAAGGTGGAT < SRR4302545.1229608/94‑1 (MQ=60)
GCTACGCTTTTTGTCATTTGTAGCACAAGTAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCACACTTGCCCGGTAATTAACGACGAAAGAAAAGTAAGGTGGAT > SRR4302545.8222809/1‑94 (MQ=60)
GCTACGCTTTTTGTCATTTGTAGCACAAGCAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCACACTTGCCCGGTAATTAACGACGAAAGAAAAGTAAGGTGGAT < SRR4302545.6778994/94‑1 (MQ=60)
CTACGCTTTTTGTCATTTGTAGCACAAGTAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCACACTTGCCCGGTAATTAACGACGAAAGAAAAGTAAGGTGGATG > SRR4302545.2681598/1‑94 (MQ=60)
CTACGCTTTTTGTCATTTGTAGCACAAGTAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCACACTTGCCCGGTAATTAACGACGAAAGAAAAGTAAGGTGGATG > SRR4302545.2681599/1‑94 (MQ=60)
CTACGCTTTTTGTCATTTGTAGCACAAGTAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCACACTTGCCCGGTAATTAACGACGAAAGAAAAGTAAGGTGGATG > SRR4302545.5899721/1‑94 (MQ=60)
TACGCTTTTTGTCATTTGTAGCACAAGTAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCACACTTGCCCGGTAATTAACGACGAAAGAAAAGTAAGGTGGATGA > SRR4302545.7032993/1‑94 (MQ=60)
TACGCTTTTTGTCATTTGTAGCACAAGCAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCACACTTGCCCGGTAATTAACGACGAAAGAAAAGTAAGGTGGATGA < SRR4302545.7017664/94‑1 (MQ=60)
TACGCTTTTTGTCATTTGTAGCACAAGCAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCACACTTGCCCGGTAATTAACGACGAAAGAAAAGTAAGGTGGATGA < SRR4302545.7630349/94‑1 (MQ=60)
TACGCTTTTTGTCATTTGTAGCACAAGCAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCACACTTGCCCAGTAATTAACGACGAAAGAAAAGTAAGGTGGATGA > SRR4302545.6566263/1‑94 (MQ=60)
ACGCTTTTTGTCATTTGTAGCACAAGTAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCACACTTGCCCGGTAATTAACGACGAAAGAAAAGTAAGGTGGATGAA > SRR4302545.4181131/1‑94 (MQ=60)
ACGCTTTTTGTCATTTGTAGCACAAGCAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCACACTTGCCCGGTAATTAACGACGAAAGAAAcaaaaggaggttgac > SRR4302545.10905798/1‑79 (MQ=60)
CGCTTTTTGTCATTTGTAGCACAAGTAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCACACTTGCCCGGTAATTAACGACGAAAGAAAAGTAAGGTGGATGAAC > SRR4302545.7439867/1‑94 (MQ=60)
CGCTTTTTGTCATTTGTAGCACAAGTAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCACACTTGCCCGGTAATTAACGACGAAAGAAAAGTAAGGTGGATGAAC < SRR4302545.7684139/94‑1 (MQ=60)
CGCTTTTTGTCATTTGTAGCACAAGTAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCACACTTGCCCGGTAATTAACGACGAAAGAAAAGTAAGGTGGATGAAC < SRR4302545.3514061/94‑1 (MQ=60)
CGCTTTTTGTCATTTGTAGCACAAGCAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCACACTTGCCCGGTAATTAACGACGAAAGAAAAGTAAGGTGGATGAAC < SRR4302545.8805306/94‑1 (MQ=60)
GCTTTTTGTCATTTGTAGCACAAGTAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCACACTTGCCCGGTAATTAACGACGAAAGAAAAGTAAGGTGGATGAACA < SRR4302545.4976711/94‑1 (MQ=60)
GCTTTTTGTCATTTGTAGCACAAGCAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCACACTTGCCCGGTAATTAACGACGAAAGAAAAGTAAGGTGGATGAACA < SRR4302545.9253519/94‑1 (MQ=60)
CTTTTTGTCATTTGTAGCACAAGTAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCACACTTGCCCGGTAATTAACGACGAAAGAAAAGTAAGGTGGATGAACAA > SRR4302545.7415249/1‑94 (MQ=60)
TTGTCATTTGTAGCACAAGCAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCACACTTGCCCGGTAATTAACGACGAAAGAAAAGTAAGGTGGATGAACAATGAG > SRR4302545.2680842/1‑94 (MQ=60)
TTGTCATTTGTAGCACAAGCAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCACACTTGCCCGGTAATTAACGACGAAAGAAAAGTAAGGTGGATGAACAATGAG < SRR4302545.6611177/94‑1 (MQ=60)
TTGTCATTTGTAGCACAAGCAAGTGTCAGCAGTGGCGCTTCACACTTGCCCGGTAATTAACGACGAAAGAAAAGTAAGGTGGATGAACAATGAG < SRR4302545.6611176/94‑1 (MQ=60)
TGTCATTTGTAGCACAAGCAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCACACTTGCCCGGTAATTAACGACGAAAGAAAAGTAAGGTGGATGAACAATGAGT < SRR4302545.5433591/94‑1 (MQ=60)
TGTCATTTGTAGCACAAGCAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCACACTTGCCCGGTAATTAACGACGAAAGAAAAGTAAGGTGGATGAACAATGAGT > SRR4302545.5437012/1‑94 (MQ=60)
TCATTTGTAGCACAAGTAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCACACTTGCCCGGTAATTAACGACGAAAGAAAAGTAAGGTGGATGAACAATGAGTGC > SRR4302545.3516494/1‑94 (MQ=60)
TCATTTGTAGCACAAGTAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCACACTTGCCCGGTAATTAACGACGAAAGAAAAGTAAGGTGGATGAACAATGAGTGC > SRR4302545.1751069/1‑94 (MQ=60)
TCATTTGTAGCACAAGTAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCACACTTGCCCGGTAATTAACGACGAAAGAAAAGTAAGGTGGATGAACAATGAGTGC > SRR4302545.4790687/1‑94 (MQ=60)
TCATTTGTAGCACAAGTAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCACACTTGCCCGGTAATTAACGACGAAAGAAAAGTAAGGTGGATGAACAATGAGTGC > SRR4302545.1751068/1‑94 (MQ=60)
TCATTTGTAGCACAAGCAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCACACTTGCCCGGTAATTAACGCCGAAAGAAAAGTAAGGGGGATGAACAATGAGTGC > SRR4302545.8393693/1‑94 (MQ=60)
TCATTTGTAGCACAAGCAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCACACTTGCCCGGTAATTAACGACGAAAGAAAAGTAAGGTGGATGAACAATGAGTGC < SRR4302545.4435970/94‑1 (MQ=60)
TCATTTGTAGCACAAGCAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCACACTTGCCCGGTAATTAACGACGAAAGAAAAGTAAGGTGGATGAACAATGAGTGC < SRR4302545.1536577/94‑1 (MQ=60)
CATTTGTAGCACAAGTAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCACACTTGCCCGGTAATTAACGACGAAAGAAAAGTAAGGTGGATGAACAATGAGTGCG > SRR4302545.7282857/1‑94 (MQ=60)
CATTTGTAGCACAAGCAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCACACTTGCCCGGTAATTAACGACGAAAGAAAAGTAAGGTGGATGAACAATAAGTGCG > SRR4302545.7179186/1‑94 (MQ=60)
ATTTGTAGCACAAGCAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCACACTTGCCCGGTAATTAACGACGAAAGAAAAGTAAGGTGGATGAACACTGAGTGAGT > SRR4302545.148646/1‑94 (MQ=60)
ATTTGTAGCACAAGCAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCACACTTGCCCGGTAATTAACGACGAAAGAAAAGTAAGGTGGATGAACAATGAGTGCGT > SRR4302545.9127513/1‑94 (MQ=60)
ATTTGTAGCACAAGCAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCACACTTGCCCGGTAATTAACGACGAAAGAAAAGTAAGGTGGATGAACAATGAGGGCGT > SRR4302545.9127510/1‑94 (MQ=60)
TTTGTAGCACAAGTAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCACACTTGCCCGGTAATTAACGACGAAAGAAAAGTAAGGTGGATGAACAATGAGTGCGTC > SRR4302545.9954602/1‑94 (MQ=60)
TTGTAGCACAAGTAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCACACTTGCCCGGTAATTAACGACGAAAGAAAAGTAAGGTGGATGAACAATGAGTGCGTCG > SRR4302545.4128302/1‑94 (MQ=60)
TTGTAGCACAAGCAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCACACTTGCCCGGTAATTAACGACGAAAGAAAAGTAAGGTGGATGAACAATGAGTGCGTCG > SRR4302545.4892209/1‑94 (MQ=60)
TGTAGCACAAGCAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCACACTTGCCCGGTAATTAACGACGAAAGAAAAGTAAGGTGGATGAACAATGAGTGCGTCGT > SRR4302545.423314/1‑94 (MQ=60)
TGTAGCACAAGCAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCACACTTGCCCGGTAATTAACGACGAAAGAAAAGTAAGGTGGATGAACAATGAGTGCGTCGT > SRR4302545.7855626/1‑94 (MQ=60)
GTAGCACAAGTAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCACACTTGCCCGGTAATTAACGACGAAAGAAAAGTAAGGTGGATGAACAATGAGTGCGTCGTT > SRR4302545.5746848/1‑94 (MQ=60)
TAGCACAAGTAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCACACTTGCCCGGTAATTAACGACGAAAGAAAAGTAAGGTGGATGAACAATGAGTGCGTCGTTG < SRR4302545.7967828/94‑1 (MQ=60)
TAGCACAAGCAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCACACTTGCCCGGTAATTAACGACGAAAGAAAAGTAAGGTGGATGAACAATGAGTGCGTCGTTG < SRR4302545.1304967/94‑1 (MQ=60)
TAGCACAAGCAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCACACTTGCCCGGTAATTAACGACGAAAGAAAAGTAAGGTGGATGAACAATGAGTGCGTCGTTG < SRR4302545.3154644/94‑1 (MQ=60)
GCACAAGTAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCACACTTGCCCGGTAATTAACGACGAAAGAAAAGTAAGGTGGATGAACAATGAGTGCGTCGTTGGC < SRR4302545.7069119/94‑1 (MQ=60)
CACAAGTAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCACACTTGCCCGGTAATTAACGACGAAAGAAAAGTAAGGTGGATGAACAATGAGTGCGTCGTTGGCG > SRR4302545.4151994/1‑94 (MQ=60)
CAAGCAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCACACTTGCCCGGTAATTAATGACGAAAGAAAAGTAAGGTGGATGAACAATGAGTGCGTCGTTGGCGAT > SRR4302545.791464/1‑94 (MQ=60)
CAAGCAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCACACTTGCCCGGTAATTAACGACGAAAGAAAAGTAAGGTGGATGAACAATGAGTGCGTCGTTGGCGAT > SRR4302545.624725/1‑94 (MQ=60)
CAAGCAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTAACACTTGCCCGGTAATTAACGACGAAAGAAAAGTAAGGTGGATGAACAATGAGTGCGTCGTTGGCGAT > SRR4302545.7134117/1‑94 (MQ=60)
AAGTAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCACACTTGCCCGGTAATTAATGACGAAAGAAAAGTAAGGTGGATGAACAATGAGTGCGTCGTTGGCGATC > SRR4302545.4660013/1‑94 (MQ=60)
AAGCAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTTACACTTGCCCGGTAATTAACGACGAAAGAAAAGTAAGGTGGATGAACAATGAGTGCGTCGTTGGCGATC > SRR4302545.7628412/1‑94 (MQ=60)
AAGCAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCACACTTGCCCGGTAATTAACGACGAAAGAAAAGTAAGGTGGATGAACAATGAGTGCGTTGTTGGCGATC > SRR4302545.7197656/1‑94 (MQ=60)
AAGCAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCACACTTGCCCGGTAATTAACGACGAAAGAAAAGTAAGGTGGATGAACAATGAGTGCGTCGTTGGCGATC < SRR4302545.6935833/94‑1 (MQ=60)
AAGCAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCACACTTGCCCGGTAATTAACGACGAAAGAAAAGTAAGGTGGATGAACAATGAGTGCGTCGTTGGCGATC > SRR4302545.1207879/1‑94 (MQ=60)
AGCAAGTGTCAGCAGTGGGGCTTCATACTTGCCCGGTAATTAACGACGAAAGAAAAGTAAGGTGGAGGAACAATGAGGGCGTCGTTGGCGATCC > SRR4302545.9665538/1‑94 (MQ=60)
TAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCACACTTGCCCGGTAATTAACGACGAAAGAAAAGTAAGGTGGATGAACAATGAGTGCGTCGTTGGCGATCCTG < SRR4302545.9530380/94‑1 (MQ=60)
TAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCACACTTGCCCGGTAATTAACGACGAAAGAAAAGTAAGGTGGATGAACAATGAGTGCGTCGTTGGCGATCCTG > SRR4302545.10827593/1‑94 (MQ=60)
CAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCACACTTGCCCGGTAATTAACGACGAAAGAAAAGTAAGGTGGATGAACAATGAGTGCGTCGTTGGCGATCCTG > SRR4302545.10773363/1‑94 (MQ=60)
|
TAAACAATAACAATCCATTACTGGAATCATTTGGAATCTTTACATTATGCCGTGCACGTCTGCTGCTACGCTTTTTGTCATTTGTAGCACAAGTAAGTGTCAGCAGTGGTGCTTCACACTTGCCCGGTAATTAACGACGAAAGAAAAGTAAGGTGGATGAACAATGAGTGCGTCGTTGGCGATCCTG > NC_000913/406489‑406675
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
