Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
647 |
270.1 |
21258240 |
98.4% |
20918108 |
94.0 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
ATTAACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGTGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGAGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAACGACACCGATTTAACAGTCGCATGACC > NC_000913/2627179‑2627363
|
ATTAACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTG < SRR4302545.9995385/94‑1 (MQ=60)
ATTAACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTG > SRR4302545.9584811/1‑94 (MQ=60)
ATTAACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTG > SRR4302545.9584499/1‑94 (MQ=60)
ATTAACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTG < SRR4302545.7891661/94‑1 (MQ=60)
ATTAACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTG > SRR4302545.7072549/1‑94 (MQ=60)
ATTAACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTG > SRR4302545.2026518/1‑94 (MQ=60)
TTAACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTGC > SRR4302545.2683635/1‑94 (MQ=60)
TTAACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTGC > SRR4302545.1629100/1‑94 (MQ=60)
TTAACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTAC < SRR4302545.4882143/94‑1 (MQ=60)
TAACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTGCC < SRR4302545.10572202/94‑1 (MQ=60)
TAACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTGCC > SRR4302545.3489935/1‑94 (MQ=60)
TAACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACC > SRR4302545.10170718/1‑94 (MQ=60)
TAACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACC < SRR4302545.8819643/94‑1 (MQ=60)
AACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTGCCG > SRR4302545.3989697/1‑94 (MQ=60)
AACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTGCCG > SRR4302545.7596/1‑94 (MQ=60)
AACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTGCCG < SRR4302545.9189401/94‑1 (MQ=60)
AACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCG > SRR4302545.283587/1‑94 (MQ=60)
ACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGT < SRR4302545.1087801/94‑1 (MQ=60)
CTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTGCCGTC > SRR4302545.3050825/1‑94 (MQ=60)
CTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTC > SRR4302545.5074043/1‑94 (MQ=60)
CTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTC > SRR4302545.1525374/1‑94 (MQ=60)
TTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCC < SRR4302545.2545519/94‑1 (MQ=60)
TTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCC < SRR4302545.10854127/94‑1 (MQ=60)
TCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCA > SRR4302545.2654498/1‑94 (MQ=60)
CATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTGCCGTCCACA > SRR4302545.3597983/1‑94 (MQ=60)
CATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTGCCGTCCACA > SRR4302545.8161576/1‑94 (MQ=60)
CATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTGCCGTCCACA > SRR4302545.8161577/1‑94 (MQ=60)
CATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACA > SRR4302545.4322902/1‑94 (MQ=60)
ATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTGCCGTCCACAG > SRR4302545.1725889/1‑94 (MQ=60)
ATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTGCCGTCCACAG > SRR4302545.1725888/1‑94 (MQ=60)
ATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAG < SRR4302545.5850766/94‑1 (MQ=60)
ATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAG < SRR4302545.3435473/94‑1 (MQ=60)
ATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAG > SRR4302545.3232166/1‑94 (MQ=60)
TAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGC > SRR4302545.9215944/1‑94 (MQ=60)
AACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAGGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTGCCGTCCACAGCG < SRR4302545.8177225/94‑1 (MQ=60)
AACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTATGTGCCGTCCACAGCG > SRR4302545.9670749/1‑94 (MQ=60)
AACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTGCCGTCCACAGCG < SRR4302545.8176908/94‑1 (MQ=60)
AACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTGCCGTCCACAGCG < SRR4302545.10732504/94‑1 (MQ=60)
AACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCG < SRR4302545.5340424/94‑1 (MQ=60)
AACATAAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCG < SRR4302545.5340693/94‑1 (MQ=60)
ACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTGCCGTCCACAGCGT < SRR4302545.10713199/94‑1 (MQ=60)
CATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTGCCGTCCACAGCGTG > SRR4302545.1838000/1‑94 (MQ=60)
ATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTGCCGTCCACAGCGTGG > SRR4302545.7758580/1‑94 (MQ=60)
TTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTGCCGTCCACAGCGTGGG > SRR4302545.9409513/1‑94 (MQ=60)
TTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTGCCGTCCACAGCGTGGG > SRR4302545.4293820/1‑94 (MQ=60)
TAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTGCCGTCCACAGCGTGGGA < SRR4302545.2234351/94‑1 (MQ=60)
AAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTGCCGTCCACAGCGTGGGAC > SRR4302545.5884618/1‑94 (MQ=60)
AAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGAC > SRR4302545.4292912/1‑94 (MQ=60)
AAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGAC > SRR4302545.3979517/1‑94 (MQ=60)
AATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTGCCGTCCACAGCGTGGGACAT > SRR4302545.10278992/1‑94 (MQ=60)
ATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTGCCGTCCACAGCGTGGGACATA < SRR4302545.5844528/94‑1 (MQ=60)
ATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATA > SRR4302545.3327516/1‑94 (MQ=60)
ATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATA > SRR4302545.6342699/1‑94 (MQ=60)
TATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTGCCGTCCACAGCGTGGGACATAC < SRR4302545.8464582/94‑1 (MQ=60)
ATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTGCCGTCCACAGCGTGGGACATACT > SRR4302545.1889847/1‑94 (MQ=60)
TGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTGCCGTCCACAGCGTGGGACATACTT < SRR4302545.10624797/94‑1 (MQ=60)
GTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTGCCGTCCACAGCGTGGGACATACTTC > SRR4302545.2840383/1‑94 (MQ=60)
GTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTGCCGTCCACAGCGTGGGACATACTTC < SRR4302545.8267020/94‑1 (MQ=60)
GTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTGCCGTCCACAGCGTGGGACATACTTC > SRR4302545.2840382/1‑94 (MQ=60)
TATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTGCCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCA > SRR4302545.6368560/1‑94 (MQ=60)
ATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTGCCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAA > SRR4302545.9919248/1‑94 (MQ=60)
ATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTGCCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAA < SRR4302545.2313758/94‑1 (MQ=60)
ATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAA < SRR4302545.4985862/94‑1 (MQ=60)
TCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTGCCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAG > SRR4302545.319201/1‑94 (MQ=60)
TCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAG < SRR4302545.10356241/94‑1 (MQ=60)
CCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTGCCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGG < SRR4302545.2412656/94‑1 (MQ=60)
CCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGG < SRR4302545.571148/94‑1 (MQ=60)
CACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGA < SRR4302545.4892025/94‑1 (MQ=60)
ACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTGCCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAA > SRR4302545.6036571/1‑94 (MQ=60)
ACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAataa > SRR4302545.3246162/1‑90 (MQ=60)
ACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAA < SRR4302545.8390169/94‑1 (MQ=60)
CTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAAC < SRR4302545.3639423/94‑1 (MQ=60)
TGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTGCCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACC > SRR4302545.7441909/1‑94 (MQ=60)
TGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTGCCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACC < SRR4302545.3576600/94‑1 (MQ=60)
TGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTGCCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACC < SRR4302545.3905582/94‑1 (MQ=60)
GACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCT > SRR4302545.6985361/1‑94 (MQ=60)
ACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTGCCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTT < SRR4302545.6592489/94‑1 (MQ=60)
ACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTT > SRR4302545.6765790/1‑94 (MQ=60)
CGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTGCCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTT < SRR4302545.9411552/94‑1 (MQ=60)
CGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTGCCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGAAACCTGT > SRR4302545.6329496/1‑94 (MQ=60)
GCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTT < SRR4302545.621032/94‑1 (MQ=60)
GCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTT < SRR4302545.747795/94‑1 (MQ=60)
GCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTT < SRR4302545.1774377/94‑1 (MQ=60)
CTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTGCCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTG < SRR4302545.7495286/94‑1 (MQ=60)
CTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTGCCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTG > SRR4302545.2647812/1‑94 (MQ=60)
CTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTGCCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTG > SRR4302545.9507037/1‑94 (MQ=60)
CTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTGCCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTG > SRR4302545.559641/1‑94 (MQ=60)
TTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGT < SRR4302545.7466358/94‑1 (MQ=60)
TTTTTACATAACGAAGTATTGACCTTTTTGTCCTGTTGCGTCTTATTGTAAGTACTGTCCACAGCGTGGGACATACTTCTAGTAACTTTTTGTG > SRR4302545.9959329/1‑94 (MQ=53)
TTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTGCCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTG > SRR4302545.259426/1‑94 (MQ=60)
TTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTGCCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTG > SRR4302545.521368/1‑94 (MQ=60)
TTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTG > SRR4302545.10076847/1‑94 (MQ=60)
TTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTGCCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGG < SRR4302545.1248431/94‑1 (MQ=60)
TTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTGCCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGG > SRR4302545.1317893/1‑94 (MQ=60)
TTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTGCCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGG > SRR4302545.10650385/1‑94 (MQ=60)
TTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTGCCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGG < SRR4302545.7740156/94‑1 (MQ=60)
TTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGG > SRR4302545.5126074/1‑94 (MQ=60)
TTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTGCCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGGG < SRR4302545.2687063/94‑1 (MQ=60)
TTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGGG > SRR4302545.8880530/1‑94 (MQ=60)
TACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTGCCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGGGTC > SRR4302545.8313794/1‑94 (MQ=60)
TACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGGGTC < SRR4302545.5901766/94‑1 (MQ=60)
TACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGGGCCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGggtg > SRR4302545.9072404/1‑90 (MQ=60)
ATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTGCCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGGGTCAGG < SRR4302545.8110747/94‑1 (MQ=60)
ATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGGGTCAGG < SRR4302545.7204580/94‑1 (MQ=60)
ATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGGGTCAGG < SRR4302545.7204579/94‑1 (MQ=60)
TAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTGCCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGGGTCAGGC > SRR4302545.8143851/1‑94 (MQ=60)
AACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTGCCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGGGTCAGGCA < SRR4302545.7923466/94‑1 (MQ=60)
AACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAATGCCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGGGTCAGGCA < SRR4302545.4867681/94‑1 (MQ=60)
ACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTGCCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGGGTCAGGCAA > SRR4302545.6261551/1‑94 (MQ=60)
GAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGGGTCAGGCAACC > SRR4302545.9614656/1‑94 (MQ=60)
AGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTGCCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGGGTCAGGCAACCAG > SRR4302545.8750236/1‑94 (MQ=60)
AGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTGCCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGGGTCAGGCAACCAG > SRR4302545.7328413/1‑94 (MQ=60)
AGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTGCCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGGGTCAGGCAACCAG < SRR4302545.3249041/94‑1 (MQ=60)
AGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTGCCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGGGTCAGGCAACCAG < SRR4302545.8422851/94‑1 (MQ=60)
AGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTGCCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGGGTCAGGCAACCAG > SRR4302545.8750237/1‑94 (MQ=60)
AGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTGCCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGGGTCAGGAAACCAG > SRR4302545.3779579/1‑94 (MQ=60)
AGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGGGTCAGGCAACCAG > SRR4302545.5848454/1‑94 (MQ=60)
AGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGGGTCAGGCAACCAG > SRR4302545.9417420/1‑94 (MQ=60)
GAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTGCCGTCCACAGCGTGGGACATGCTTCAAGGAACCTTTTGTGGGTCAGGCAACCAGT < SRR4302545.115010/94‑1 (MQ=60)
GAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTGCCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGGGTCAGGCAACCAGT < SRR4302545.9533788/94‑1 (MQ=60)
ATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTGCCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGGGTCAGGCAACCAGTAT < SRR4302545.3871745/94‑1 (MQ=60)
ATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTGCCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGGGTCAGGCAACCAGTAT > SRR4302545.4241372/1‑94 (MQ=60)
ATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGGGTCAGGCAACCAGTAT < SRR4302545.5758886/94‑1 (MQ=60)
TTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTGCCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGGGTCAGGCAACCAGTATG < SRR4302545.351285/94‑1 (MQ=60)
TTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGGGTCAGGCAACCAGTATG < SRR4302545.2798518/94‑1 (MQ=60)
TGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTGCCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGGGTCAGGCAACCAGTATGC < SRR4302545.5123638/94‑1 (MQ=60)
TGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTGCCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGGGTCAGGCAACCAGTATGC < SRR4302545.5123637/94‑1 (MQ=60)
ACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTGCCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGGGTCAGGCAACCAGTATGCGA < SRR4302545.10703955/94‑1 (MQ=60)
ACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGGGTCAGGCAACCAGTATGCGA > SRR4302545.3968465/1‑94 (MQ=60)
CATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTGCCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGGGTCAGGCAACCAGTATGCGAAA > SRR4302545.3955704/1‑94 (MQ=60)
ATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTGCCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGGGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAA > SRR4302545.6668734/1‑94 (MQ=60)
TTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTGCCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGGGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAAC < SRR4302545.9045683/94‑1 (MQ=60)
TTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTGCCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGGGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAAC < SRR4302545.8396219/94‑1 (MQ=60)
TTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTGCCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGGGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAAC < SRR4302545.8396220/94‑1 (MQ=60)
TTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTGCCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGGGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAAC < SRR4302545.1329467/94‑1 (MQ=60)
TTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTGCCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGGGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAAC < SRR4302545.8055877/94‑1 (MQ=60)
TTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTGCCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGGGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAAC < SRR4302545.4065767/94‑1 (MQ=60)
TTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGGGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAAC < SRR4302545.4548600/94‑1 (MQ=60)
TGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTGCCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGGGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAACGAC < SRR4302545.9795670/94‑1 (MQ=60)
GTCCTTTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGCGTCAGGCAACCAGTATGCGAActggaca > SRR4302545.5478631/1‑87 (MQ=60)
GTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTGCCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGGGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAACGACA < SRR4302545.8993562/94‑1 (MQ=60)
GTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGGGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAACGACA > SRR4302545.3901745/1‑94 (MQ=60)
TCCTGTTGTGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGCCATACTTCAAGGAACCTTTTGTGAGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAACGACAC > SRR4302545.10717801/1‑94 (MQ=60)
CCTGTTGCGCTTTAATGTAAGTGCCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGGGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAACGACACC > SRR4302545.3047211/1‑94 (MQ=60)
CCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTGCCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGGGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAACGACACC < SRR4302545.1904321/94‑1 (MQ=60)
CCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGGGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAACGACACC < SRR4302545.8146977/94‑1 (MQ=60)
CTGTTGCGCCTTAATGTAAGTGCCGTCCATAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGGGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAACGACACCG > SRR4302545.7251314/1‑94 (MQ=60)
CTGTTGCGCCTTAATGTAAGTGCCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGGGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAACGACACCG < SRR4302545.2010788/94‑1 (MQ=60)
GTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGGGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAACGACACCGAT < SRR4302545.2933817/94‑1 (MQ=60)
TTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGGGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAACGACACCGATT < SRR4302545.9472042/94‑1 (MQ=60)
TGCGCCTTAATGTAAGTGCCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGGGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAACGACACCGATTT > SRR4302545.8491157/1‑94 (MQ=60)
GCGCCTTAATGTAAGTGCCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGGGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAACGACACCGATTTA < SRR4302545.6826042/94‑1 (MQ=60)
GCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGTGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGGGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAACGACACCGATTTA < SRR4302545.925929/94‑1 (MQ=60)
CGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGGGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAACGACACCGATTTAA < SRR4302545.3314349/94‑1 (MQ=60)
GCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGGGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAACGACACCGATTTAAC > SRR4302545.8469521/1‑94 (MQ=60)
CTTAATGTAAGTGCCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGGGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAACGACACCGATTTAACAG > SRR4302545.2751827/1‑94 (MQ=60)
CTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGGGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAACGACACCGATTTAACAG < SRR4302545.5421162/94‑1 (MQ=60)
TTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGGGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAACGACACCGATTTAACAGT < SRR4302545.6241059/94‑1 (MQ=60)
TTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGGGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAACGACACCGATTTAACAGT < SRR4302545.5010959/94‑1 (MQ=60)
TTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGGGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAACGACACCGATTTAACAGT < SRR4302545.6241061/94‑1 (MQ=60)
TTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGGGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAACGACACCGATTTAACAGT < SRR4302545.6241060/94‑1 (MQ=60)
TTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGGGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAACGACACCGATTTAACAGT > SRR4302545.3374673/1‑94 (MQ=60)
AATGTAAGTGCCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGGGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAACGACACCGATTTAACAGTCG < SRR4302545.4745737/94‑1 (MQ=60)
AATGTAAGTGCCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGGGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAACGACACCGATTTAACAGTCG > SRR4302545.7334452/1‑94 (MQ=60)
AATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAGCCTTTTGTGGGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAACGACACCGATTTAACAGTCG < SRR4302545.4134262/94‑1 (MQ=60)
AATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGGGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAACGACACCGATTTAACAGTCG < SRR4302545.6737659/94‑1 (MQ=60)
AATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGGGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAACGACACCGATTTAACAGTCG < SRR4302545.6737658/94‑1 (MQ=60)
ATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGGGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAACGACACCGATTTAACAGTCGC < SRR4302545.3182295/94‑1 (MQ=60)
GTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGGGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAACGACACCGATTTAACAGTCGCAT < SRR4302545.368929/94‑1 (MQ=60)
TAAGTGCCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTCGTGTGGGTCAGGCAACCAGTATGCGAAACCGACACCGATTTAACAGTCGCATG < SRR4302545.1693188/94‑1 (MQ=60)
TAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGGGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAACGACACCGATTTAACAGTCGCATG > SRR4302545.3311032/1‑94 (MQ=60)
AGTGCCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGGGTCAGGCAACCAGTATGCGATAACGACACCGATTTAACAGTCGCATGAC > SRR4302545.1399763/1‑94 (MQ=60)
AGTGCCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGGGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAACGACACCGATTTAACAGTCGCATGAC > SRR4302545.1399764/1‑94 (MQ=60)
AGTGCCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGGGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAACGACACCGATTTAACAGTCGCATGAC > SRR4302545.116356/1‑94 (MQ=60)
AGTGCCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGGGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAACGACACCGATTTAACAGTCGCATGAC > SRR4302545.2936726/1‑94 (MQ=60)
GTGCCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGGGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAACGACACCGATTTAACAGTCGCATGACC < SRR4302545.5662699/94‑1 (MQ=60)
GTGCCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGGGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAACGACACCGATTTAACAGTCGCATGACC < SRR4302545.1662646/94‑1 (MQ=60)
GTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGGGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAACGACACCGATTTAACAGTCGCATGACC < SRR4302545.9900835/94‑1 (MQ=60)
GTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGGGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAACGACACCGATTTAACAGTCGCATGACC < SRR4302545.9900836/94‑1 (MQ=60)
|
ATTAACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGTGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGAGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAACGACACCGATTTAACAGTCGCATGACC > NC_000913/2627179‑2627363
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
