Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
647 |
270.1 |
21258240 |
98.4% |
20918108 |
94.0 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 320 total aligned reads displayed.
TTCGGTGCCGGATTTACGCAGCAACACGCGTCCACGGTTGCCCAGCGCAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTTTCATGCCGCTGCAAAGGTCGTGCAGGCTCATATGGTTA > NC_000913/3320464‑3320650
|
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TCGGTGCCGGATTTACGCAGCAACACGCGTCCACGGTTGCCCAGCGCAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGCG < SRR4302545.2553501/94‑1 (MQ=60)
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CGGTGCCGGATTTACGCAGCAACACGCGTCCACGGTTGCCCAGCGCAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGCGG < SRR4302545.1165573/94‑1 (MQ=60)
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CGGATTTACGCAGCAACACGCGTCCACGGTTGCCCAGCGCAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGCGGATCGCC < SRR4302545.5628586/94‑1 (MQ=60)
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ATTTACGCAGCAACACGCGTCCACGGTTGCCCAGCGCAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGCGGATCGCCGCT < SRR4302545.3979762/94‑1 (MQ=60)
ATTTACGCAGCAACACGCGTCCACGGTTGCCCAGCGCAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGCGGATCGCCGCT < SRR4302545.505095/94‑1 (MQ=60)
TTTACGCAGCAACACGCGTCCACGGTTGCCCAGCGCAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTA > SRR4302545.9389431/1‑94 (MQ=60)
TTTACGCAGCAACACGCGTCCACGGTTGCCCAGCGCAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGCGGATCGCCGCTA < SRR4302545.6801500/94‑1 (MQ=60)
TTACGCAGCAACACGCGTCCACGGTTGCCCAGCGCAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTAC < SRR4302545.5436783/94‑1 (MQ=60)
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TACGCAGCAACACGCGTCCACGGTTGCCCAGCGCAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGCGGATCGCCGCTACC > SRR4302545.9178811/1‑94 (MQ=60)
ACGCAGCAACACGCGTCCACGGTTGCCCAGCGCAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGCGGATCGCCGCTACCT < SRR4302545.5676876/94‑1 (MQ=60)
ACGCAGCAACACGCGTCCACGGTTGCCCAGCGCAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGCGGATCGCCGCTACCT > SRR4302545.10017914/1‑94 (MQ=60)
ACGCAGCAACACGCGTCCACGGTTGCCCAGCGCAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGCGGATCGCCGCTACCT < SRR4302545.7658106/94‑1 (MQ=60)
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CGCAGCAACACGCGTCCACGGTTGCCCAGCGCAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGCGGATCGCCGCTACCTG < SRR4302545.271246/94‑1 (MQ=60)
CGCAGCAACACGCGTCCACGGTTGCCCAGCGCAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGCGGATCGCCGCTACCTG > SRR4302545.8368913/1‑94 (MQ=60)
CGCAGCAACACGCGTACACGGTTGCCCAGCGCAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTACCTG > SRR4302545.10864256/1‑94 (MQ=60)
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CAGCAACGCGCGTCCACGGTTGCCCAGCGCAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTCCCTGCG < SRR4302545.5903685/94‑1 (MQ=60)
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GCAACACGCGTCCACGGTTGCCCAGCGCAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTACCTGCGGT > SRR4302545.10244028/1‑94 (MQ=60)
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GCAACACGCGTCCACGGTTGCCCAGCGCAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGCGGATCGCCGCTACCTGCGGG > SRR4302545.8622888/1‑94 (MQ=60)
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AACACGCGTCCACGGTTGCCCAGCGCAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTACCTGCGGTGT < SRR4302545.4065743/94‑1 (MQ=60)
AACACGCGTCCACGGTTGCCCAGCGCAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGCGGATCGCCGCTACCTGCGGTGT < SRR4302545.8600977/94‑1 (MQ=60)
AACACGCGTCCACGGTTGCCCAGCGCAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGCGGATCGCCGCTACCTGCGGTGT > SRR4302545.10863372/1‑94 (MQ=60)
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CACGCGTCCACGGTTGCCCAGCGCAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAA > SRR4302545.2256688/1‑94 (MQ=60)
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ACGCGTCCACGGTTGCCCAGCGCAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGCGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAAC < SRR4302545.1147437/94‑1 (MQ=60)
ACGCGTCCACGGTTGCCCAGCGCAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGCGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAAC > SRR4302545.9526795/1‑94 (MQ=60)
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CGCGTCCACGGTTGCCCAGCGCAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGCGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACG > SRR4302545.215738/1‑94 (MQ=60)
CGCGTCCACGGTTGCCCAGCGCAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGCGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACG > SRR4302545.589981/1‑94 (MQ=60)
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CGTCCACGGTTGCCCAGCGCAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGCGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTA < SRR4302545.5012345/94‑1 (MQ=60)
GTCCACGGTTGCCCAGCGCAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTAC < SRR4302545.7860283/94‑1 (MQ=60)
GTCCACGGTTGCCCAGCGCAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGCGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTAC < SRR4302545.799950/94‑1 (MQ=60)
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TCCACGGTTGCCCAGCGCAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACG > SRR4302545.10305091/1‑94 (MQ=60)
TCCACGGTTGCCCAGCGCAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGCATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACG < SRR4302545.1304434/94‑1 (MQ=60)
CCACGGTTGCCCAGCGCAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAGCGTACGT > SRR4302545.9895076/1‑94 (MQ=60)
CCACGGTTGCCCAGCGCAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGCGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGT < SRR4302545.6787338/94‑1 (MQ=60)
CCACGGTTGCCCAGCGCAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGCGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGT < SRR4302545.10464321/94‑1 (MQ=60)
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CCACGGTTGCCCAGCGCAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGCGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGT > SRR4302545.3858887/1‑94 (MQ=60)
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CACGGTTGCCCAGCGCAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTT < SRR4302545.4118341/94‑1 (MQ=60)
CACGGTTGCCCAGCGCAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGCGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTT < SRR4302545.8555596/94‑1 (MQ=60)
CACGGTTGCCCAGCGCAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGCGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTT > SRR4302545.5278789/1‑94 (MQ=60)
CACGGTTGCCCAGCGCAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGCGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTT > SRR4302545.6108069/1‑94 (MQ=60)
CACGGTTGCCCAGCGCAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGCGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTT > SRR4302545.3436445/1‑94 (MQ=60)
ACGGTTGCCCAGCGCAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTA < SRR4302545.5734404/94‑1 (MQ=60)
ACGGTTGCCCAGCGCAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTA < SRR4302545.5734403/94‑1 (MQ=60)
ACGGTTGCCCAGCGCAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTA > SRR4302545.2399131/1‑94 (MQ=60)
ACGGTTGCCCAGCGCAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGCGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTA < SRR4302545.5160911/94‑1 (MQ=60)
ACGGTTGCCCAGCGCAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGCGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTA < SRR4302545.5160910/94‑1 (MQ=60)
CGGTTGCCCAGCGCAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAA < SRR4302545.9418552/94‑1 (MQ=60)
CGGTTGCCCAGCGCAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAA > SRR4302545.8106758/1‑94 (MQ=60)
CGGTTGCCCAGCGCAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGCGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAA < SRR4302545.8814526/94‑1 (MQ=60)
GGTTGCCCAGCGCAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAAC > SRR4302545.8154057/1‑94 (MQ=60)
GGTTGCCCAGCGCAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAAC > SRR4302545.8514564/1‑94 (MQ=60)
GTTGCCCAGCGCAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACC < SRR4302545.6318686/94‑1 (MQ=60)
GTTGCCCAGCGCAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGCGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACC < SRR4302545.4771460/94‑1 (MQ=60)
TTGCCCAGCGCAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGCGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCA < SRR4302545.8398123/94‑1 (MQ=60)
TTGCCCAGCGCAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGCGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCA < SRR4302545.4807634/94‑1 (MQ=60)
TGCCCAGCGCAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGATCGCAGCTACCTGCGGTGTAACGGACGTTAAacaa > SRR4302545.1615888/1‑90 (MQ=60)
TGCCCAGCGCAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGCGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAG < SRR4302545.3272081/94‑1 (MQ=60)
GCCCAGCGCAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGCGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGA < SRR4302545.5675423/94‑1 (MQ=60)
CCCAGCGCAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGCGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAA < SRR4302545.794259/94‑1 (MQ=60)
CCCAGCGCAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGCGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAA < SRR4302545.6664657/94‑1 (MQ=60)
CCCAGCGCAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGCGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAA > SRR4302545.4399260/1‑94 (MQ=60)
CCAGCGCAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGCGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAAT < SRR4302545.3371099/94‑1 (MQ=60)
CCAGCGCAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGCGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAAT < SRR4302545.2503863/94‑1 (MQ=60)
CCAGCGCAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGCGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAAT < SRR4302545.4017030/94‑1 (MQ=60)
CCAGCGCAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGCGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAAT < SRR4302545.806317/94‑1 (MQ=60)
CAGCGCAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATC > SRR4302545.7439799/1‑94 (MQ=60)
AGCGCAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCT < SRR4302545.9263729/94‑1 (MQ=60)
AGCGCAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCT > SRR4302545.2172703/1‑94 (MQ=60)
AGCGCAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGCGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCT < SRR4302545.10749168/94‑1 (MQ=60)
AGCGCAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGCGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCACAATCT > SRR4302545.5377388/1‑94 (MQ=60)
AGCGCAGCTTCAACCTATGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGCGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCT < SRR4302545.10363056/94‑1 (MQ=60)
GCGCAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTG < SRR4302545.10566946/94‑1 (MQ=60)
GCGCAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGCGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTG < SRR4302545.3025764/94‑1 (MQ=60)
CGCAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGCGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGC > SRR4302545.3713749/1‑94 (MQ=60)
GCAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGCGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCG < SRR4302545.1657284/94‑1 (MQ=60)
GCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGA < SRR4302545.1502014/94‑1 (MQ=60)
GCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGA < SRR4302545.10849515/94‑1 (MQ=60)
GCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGCGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGA < SRR4302545.7440307/94‑1 (MQ=60)
TTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAAC < SRR4302545.3734958/94‑1 (MQ=60)
TTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGCGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAAC < SRR4302545.7496771/94‑1 (MQ=60)
TTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGCGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAAC > SRR4302545.7084092/1‑94 (MQ=60)
TCCACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGCGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACA < SRR4302545.8240819/94‑1 (MQ=60)
TCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACA > SRR4302545.3157264/1‑94 (MQ=60)
TCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGCGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACA < SRR4302545.2233521/94‑1 (MQ=60)
TCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGCGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACA < SRR4302545.5606126/94‑1 (MQ=60)
CAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACAT < SRR4302545.5425893/94‑1 (MQ=60)
CAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGCGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACAT > SRR4302545.519055/1‑94 (MQ=60)
AACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGCGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATT < SRR4302545.2987798/94‑1 (MQ=60)
ACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTT > SRR4302545.8990573/1‑94 (MQ=60)
ACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTT < SRR4302545.3848244/94‑1 (MQ=60)
CCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGCGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTTT < SRR4302545.1585382/94‑1 (MQ=60)
CTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTTTC < SRR4302545.3443569/94‑1 (MQ=60)
CTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGCGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTTTC < SRR4302545.10105150/94‑1 (MQ=60)
TCTGCGGTCTCGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTTTCA < SRR4302545.23424/94‑1 (MQ=60)
CTGGGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGCGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTTTCAT < SRR4302545.6085823/94‑1 (MQ=60)
TGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGCGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTTTCATG < SRR4302545.6441487/94‑1 (MQ=60)
GCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTTTCATGC > SRR4302545.4397560/1‑94 (MQ=60)
CGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTTTCATGCC > SRR4302545.7388520/1‑94 (MQ=60)
CGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGCGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTTTCATGCC < SRR4302545.3636460/94‑1 (MQ=60)
CGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGCGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTTTCATGCC > SRR4302545.9187554/1‑94 (MQ=60)
CGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGCGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTTTCATGCC < SRR4302545.443169/94‑1 (MQ=60)
GGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGCGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTTTCATGCCG < SRR4302545.6155518/94‑1 (MQ=60)
GTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTTTCATGCCGC < SRR4302545.5533451/94‑1 (MQ=60)
TCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTTTCATGCCGCT < SRR4302545.9750226/94‑1 (MQ=60)
TCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGCGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTTTCATGCCGCT < SRR4302545.10349758/94‑1 (MQ=60)
TCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGCGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTTTCATGCCGCT < SRR4302545.10569305/94‑1 (MQ=60)
CGGCTTTACCTGACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTTTCATGCCGCTGCA < SRR4302545.7502699/94‑1 (MQ=60)
CGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTTTCATGCCGCTGCA < SRR4302545.786694/94‑1 (MQ=60)
GGCTTTAACTGACTCATGCTCAATTGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTTTCATGCCGCTGCAA < SRR4302545.5382298/94‑1 (MQ=60)
GGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTTTCATGCCGCTGCAA > SRR4302545.9135371/1‑94 (MQ=60)
GGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGCGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACCTTTTCATGCCGCTGCAA < SRR4302545.7211840/94‑1 (MQ=60)
GGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGCGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTTTCATGCCGCTGCAA < SRR4302545.7585362/94‑1 (MQ=60)
GTTTAACCGACTCATGATCAAGCCGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACACTTTCATGCCGCTGCAAAG < SRR4302545.9341681/94‑1 (MQ=60)
CTTTAACTGACTCATGCTCAAGCGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTTTCATGCCGCTGCAAAG > SRR4302545.9337270/1‑94 (MQ=60)
CTTTAACTGACTCATGCTCAAGCGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTTTCATGCCGCTGCAAAG < SRR4302545.2648974/94‑1 (MQ=60)
TTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTTTCATGCCGCTGCAAAGG < SRR4302545.2710983/94‑1 (MQ=60)
TTTAACTGACTCATGCTCAAGCGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTTTCATGCCGCTGCAAAGG > SRR4302545.3235888/1‑94 (MQ=60)
TTTAACTGACTCATGCTCAAGCGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATATGCGGGAACATTTTCATGCCGCTGCAAAGG < SRR4302545.6708209/94‑1 (MQ=60)
TTTAACGGACTCATGCTCAAGCGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTTTCATGCCGCTGCAAAGG < SRR4302545.6708212/94‑1 (MQ=60)
TTAACTGACTCATGCTCAAGCGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTTTCATGCCGCTGCAAAGGG > SRR4302545.8866475/1‑94 (MQ=60)
TAACTGACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTTTCATGCCGCTGCCAAGGTC > SRR4302545.4449928/1‑94 (MQ=60)
TAACTGACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTTTCATGCCGCTGCAAAGGTC > SRR4302545.392884/1‑94 (MQ=60)
TAACTGACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTTTCATGCCGCTGCAAAGGTC < SRR4302545.9134941/94‑1 (MQ=60)
TAACTGACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTTTCATGCCGCTGCAAAGGTC < SRR4302545.8559406/94‑1 (MQ=60)
TAACTGACTCATGCTCAAGCGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTTTCATGCCGCTGCAAAGGTC < SRR4302545.10812752/94‑1 (MQ=60)
TAACTGACTCATGCTCAAGCGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTTTCATGCCGCTGCAAAGGTC > SRR4302545.9594542/1‑94 (MQ=60)
TAACTGACTCATGCTCAAGCGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTTTCATGCCGCTGCAAAGGTC < SRR4302545.8551984/94‑1 (MQ=60)
AACTGACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTTTCATGCCGCTGCAAAGGTCG < SRR4302545.5273148/94‑1 (MQ=60)
AACTGACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTTTCATGCCGCTGCAAAGGTCG < SRR4302545.3358951/94‑1 (MQ=60)
ACTGACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTTTCATGCCGCTGCAAAGGTCGT < SRR4302545.10612766/94‑1 (MQ=60)
ACTGACTCATGCTCAAGCGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTTTCATGCCGCTGCAAAGGCCGT > SRR4302545.8198598/1‑94 (MQ=60)
CTGACTCATGCTCAAGCGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTTTCATGCCGCTGCAAAGGTCGTG < SRR4302545.5546872/94‑1 (MQ=60)
TGACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTTTCATGCCGCTGCAAAGGTCGTGC < SRR4302545.10486856/94‑1 (MQ=60)
TGACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTTTCATGCCGCTGCAAAGGTCGTGC > SRR4302545.6150538/1‑94 (MQ=60)
GACTCATGCTCAAGTGGATCGCCTCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTTTCATGCCGCTGCAAAGGTCGTGCA < SRR4302545.5964246/94‑1 (MQ=60)
GACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTTTCATGCCGCTGCAAAGGTCGTGCG > SRR4302545.2485671/1‑94 (MQ=60)
GACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTTTCATGCCGCTGCAAAGGTCGTGCA < SRR4302545.3345313/94‑1 (MQ=60)
ACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTTTCATGCCGCTGCAAAGGTCGTGCAG > SRR4302545.4684492/1‑94 (MQ=60)
ACTCATGCTCAAGCGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTTTCATGCCGCTGCAAAGGTCGTGCAG > SRR4302545.2828703/1‑94 (MQ=60)
ACTCATGCTCAAGCGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTTTCATGCCGCTGCAAAGGTCGTGCAG < SRR4302545.4707660/94‑1 (MQ=60)
CTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTTTCATGCCGCTGCAAAGGTCGTGCAGG > SRR4302545.10447033/1‑94 (MQ=60)
ATGCTCAAGCGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTTTCATGCCGCTGCAAAGGTCGTGCAGGCTC > SRR4302545.7063264/1‑94 (MQ=60)
ATGCTCAAGCGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTTTCATGCCGCTGCAAAGGTCGTGCAGGCTC > SRR4302545.2642405/1‑94 (MQ=60)
TGCTCAAGTGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTTTCATGCCGCTGCAAAGGTCGTGCAGGCTCA > SRR4302545.8749515/1‑94 (MQ=60)
TGCTCAAGCGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTTTCATGCCGCTGCAAAGGTCGTGCAGGCTCA < SRR4302545.6250666/94‑1 (MQ=60)
GCTCAAGCGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTTTCATGCCGCTGCAAAGGTCGTGCAGGCTCAT < SRR4302545.759360/94‑1 (MQ=60)
TCAAGCGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTTTCATGCCGCTGCAAAGGTCGTGCAGGCTCATAT < SRR4302545.7350682/94‑1 (MQ=60)
CAAGCGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTTTCATGCCGCTGCAAAGGTCGTGCAGGCTCATATG < SRR4302545.10666775/94‑1 (MQ=60)
CAAGCGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTTTCATGCCGCTGCAAAGGTCGTGCAGGCTCATATG > SRR4302545.1380006/1‑94 (MQ=60)
AAGCGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTTTCATGCCGCTGCAAAGGTCGTGCAGGCTCATATGG < SRR4302545.3639736/94‑1 (MQ=60)
AGTGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTTTCATGCCGCTGCAAAGGTCGTGCAGGCTCATATGGT < SRR4302545.9480149/94‑1 (MQ=60)
AGCGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTTTCATGCCGCTGCACAGGCCGTGCAGGCTCATATGGT > SRR4302545.5785322/1‑94 (MQ=60)
AGCGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTTTCATGCCGCTGCAAAGGTCGTGCAGGCTCATATGGT > SRR4302545.2218171/1‑94 (MQ=60)
AGCGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTTTCATGCCGCTGCAAAGGTCGTGCAGGCTCATATGGT < SRR4302545.7070590/94‑1 (MQ=60)
AGCGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTTTCATGCCGCTGCAAAGGTCGTGCAGGCTCATATGGT < SRR4302545.5637772/94‑1 (MQ=60)
GCGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTTTCATGCCGCTGCAAAGGTCGTGCAGGCTCATATGGTT < SRR4302545.6728375/94‑1 (MQ=60)
TGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTTTCATGCCGCTGCAAAGGTCGTGCAGGCTCATATGGTTA > SRR4302545.4761117/1‑94 (MQ=60)
CGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTTTCATGCCGCTGCATAGGTCGTGCAGGCTCATATGGTTA > SRR4302545.2614701/1‑94 (MQ=60)
|
TTCGGTGCCGGATTTACGCAGCAACACGCGTCCACGGTTGCCCAGCGCAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTTTCATGCCGCTGCAAAGGTCGTGCAGGCTCATATGGTTA > NC_000913/3320464‑3320650
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
