Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
647 |
270.1 |
21258240 |
98.4% |
20918108 |
94.0 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 375 total aligned reads displayed.
CACCGTTGTGGTGACCGATGAACGGGTTCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGATGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACATGGCCTGGCCAATGACCGGCTCCATAAC > NC_000913/4364633‑4364819
|
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CACCGTTGTGGTGACCGATGAACGGGTTCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGAC < SRR4302545.4462522/94‑1 (MQ=60)
CACCGTTGTGGTGACAGATGAACGGGTTCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGAT < SRR4302545.1392761/94‑1 (MQ=60)
ccgGTTGTGGTGACCGATGAACGTTTTCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGATG < SRR4302545.6727991/91‑1 (MQ=60)
CCGTTGTGGTGACCGATGAACGGGTTCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGATGC > SRR4302545.4218602/1‑94 (MQ=60)
CCGTTGTGGTGACCGATGAACGGGTTCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGC > SRR4302545.10177165/1‑94 (MQ=60)
CCGTTGTGGTGACCGATGAACGGGTTCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGC > SRR4302545.9819519/1‑94 (MQ=60)
CCGTTGTGGTGACCGATGAACGGGTTCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGC < SRR4302545.917154/94‑1 (MQ=60)
CCGTTGTGGTGACCGATGAACGGGTTCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGC > SRR4302545.1005935/1‑94 (MQ=60)
CGTTGTGGTGACCGATGAACGGGTTCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGATGCC < SRR4302545.5839265/94‑1 (MQ=60)
GTTGTGGTGACCGATGAACGGGTTCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGATGCCG < SRR4302545.6059518/94‑1 (MQ=60)
GTTGTGGTGACCGATGAACGGGTTCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCG < SRR4302545.1446234/94‑1 (MQ=60)
GTTGTGGTGACCGATGAACGGGTTCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCG > SRR4302545.4275484/1‑94 (MQ=60)
TTGTGGTGACCGATGAACGGGTTCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGATGCCGT < SRR4302545.2990213/94‑1 (MQ=60)
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TGGTGACCGATGAACGGGTTCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGATGCCGTTAA < SRR4302545.10111935/94‑1 (MQ=60)
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TGGTGACCGATGAACGGGTTCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAA < SRR4302545.4905779/94‑1 (MQ=60)
GGGTGACCGATGAACGGGTTCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAA < SRR4302545.7828016/94‑1 (MQ=60)
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GGTGACCGATGAACGGGTTCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAAT < SRR4302545.9593893/94‑1 (MQ=60)
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GTGACCGATGAACGGGTTCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGATGCCGTTAATG < SRR4302545.4382697/94‑1 (MQ=60)
TGACCGATGAACGGGTTCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGATGCCGTTAATGC < SRR4302545.3290169/94‑1 (MQ=60)
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GACCGATGAACGGGTTCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCA < SRR4302545.1377770/94‑1 (MQ=60)
GACCGATGAACGGGTTCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCA < SRR4302545.4990540/94‑1 (MQ=60)
CCGATGAACGGGTTCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGATGCCGTTAATGCATT > SRR4302545.5423878/1‑94 (MQ=60)
CCGATGAACGGGTTCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATT > SRR4302545.10777948/1‑94 (MQ=60)
CGATGAACGGGTTCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTA < SRR4302545.2728381/94‑1 (MQ=60)
GATGAACGGGTTCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGATGCCGTTAATGCATTTT > SRR4302545.9167765/1‑94 (MQ=60)
GATGAACGGGTTCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTGCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTT > SRR4302545.10912939/1‑94 (MQ=60)
ATGAACGGGTTCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGATGCCGTTAATGCATTTTT < SRR4302545.7940569/94‑1 (MQ=60)
ATGAACGGGTTCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTT > SRR4302545.1757391/1‑94 (MQ=60)
ATGAACGGGTTCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTT < SRR4302545.7388268/94‑1 (MQ=60)
ATGAACGGGTTCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTT < SRR4302545.3086996/94‑1 (MQ=60)
GAACGGGTTCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCC > SRR4302545.1725592/1‑94 (MQ=60)
GAACGGGTTCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAATGATGCCGTTAATGCATTTTTCC > SRR4302545.5997930/1‑94 (MQ=60)
AACGGGTTCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGATGCCGTTAATGCATTTTTCCA < SRR4302545.951886/94‑1 (MQ=60)
CGGGTTAAGGTAGGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGC < SRR4302545.9671854/94‑1 (MQ=60)
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GGGTTCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGATGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCA > SRR4302545.3611158/1‑94 (MQ=60)
GGGTTCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCA > SRR4302545.8918882/1‑94 (MQ=60)
GTTCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGG < SRR4302545.7311882/94‑1 (MQ=60)
GTTCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGG < SRR4302545.4049284/94‑1 (MQ=60)
TTCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGT < SRR4302545.950072/94‑1 (MQ=60)
TTCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGT > SRR4302545.1845650/1‑94 (MQ=60)
AGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGATGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGT < SRR4302545.5021636/94‑1 (MQ=60)
AGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGATGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGT < SRR4302545.2017266/94‑1 (MQ=60)
AGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGATGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTCT < SRR4302545.6650770/94‑1 (MQ=60)
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GGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTA < SRR4302545.6051699/94‑1 (MQ=60)
GTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAG > SRR4302545.4430746/1‑94 (MQ=60)
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AAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGATGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCA < SRR4302545.8618213/94‑1 (MQ=60)
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AGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGATGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAA < SRR4302545.2691227/94‑1 (MQ=60)
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GTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAG < SRR4302545.9572433/94‑1 (MQ=60)
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CGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTT > SRR4302545.3034759/1‑94 (MQ=60)
CGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTT > SRR4302545.137446/1‑94 (MQ=60)
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GATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTG < SRR4302545.6932788/94‑1 (MQ=60)
GATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTG > SRR4302545.9283537/1‑94 (MQ=60)
GATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTG > SRR4302545.8851639/1‑94 (MQ=60)
ATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGATGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGG < SRR4302545.219432/94‑1 (MQ=60)
ATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGATGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGG < SRR4302545.8495179/94‑1 (MQ=60)
ATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTTG > SRR4302545.9783425/1‑94 (MQ=60)
TACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGT < SRR4302545.3941759/94‑1 (MQ=60)
TACCGATAGAGTGGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGT < SRR4302545.2421720/94‑1 (MQ=60)
ACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTC < SRR4302545.4108028/94‑1 (MQ=60)
ACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTC < SRR4302545.10758046/94‑1 (MQ=60)
ACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTA > SRR4302545.3535215/1‑94 (MQ=60)
CCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGATGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCA < SRR4302545.9605133/94‑1 (MQ=60)
CCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCA < SRR4302545.9123532/94‑1 (MQ=60)
CGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGATGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAG > SRR4302545.8431352/1‑94 (MQ=60)
CGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAG > SRR4302545.8431353/1‑94 (MQ=60)
CGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAG < SRR4302545.4587944/94‑1 (MQ=60)
CGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAG < SRR4302545.6265579/94‑1 (MQ=60)
GATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGATGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGA > SRR4302545.3868756/1‑94 (MQ=60)
GATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGA > SRR4302545.115772/1‑94 (MQ=60)
GATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGA > SRR4302545.10282689/1‑94 (MQ=60)
ATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAA < SRR4302545.5531920/94‑1 (MQ=60)
ATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAA > SRR4302545.1493969/1‑94 (MQ=60)
TAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGATGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAAT < SRR4302545.3872204/94‑1 (MQ=60)
TAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAAT < SRR4302545.10242520/94‑1 (MQ=60)
TAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAAT > SRR4302545.8968339/1‑94 (MQ=60)
TAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAAT > SRR4302545.3250534/1‑94 (MQ=60)
AGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGATGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATG < SRR4302545.7413125/94‑1 (MQ=60)
AGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATG < SRR4302545.988098/94‑1 (MQ=60)
AGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATG > SRR4302545.3260343/1‑94 (MQ=60)
GAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGT > SRR4302545.2476191/1‑94 (MQ=60)
AGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGATGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTG > SRR4302545.10524097/1‑94 (MQ=60)
AGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTG > SRR4302545.345630/1‑94 (MQ=60)
AGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACGTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTG > SRR4302545.10452848/1‑94 (MQ=60)
GTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGA > SRR4302545.3238968/1‑94 (MQ=60)
GTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGA < SRR4302545.7208919/94‑1 (MQ=60)
TTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGATGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAA > SRR4302545.6732764/1‑94 (MQ=60)
TTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGATGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGCAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAA > SRR4302545.4521826/1‑94 (MQ=60)
TTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAA > SRR4302545.5910724/1‑94 (MQ=60)
TTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAA < SRR4302545.7538058/94‑1 (MQ=60)
TGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGATGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAAC < SRR4302545.10808931/94‑1 (MQ=60)
TGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGATGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAAC > SRR4302545.8910326/1‑94 (MQ=60)
TGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGATGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAAC < SRR4302545.2178744/94‑1 (MQ=60)
TGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAAC > SRR4302545.7665902/1‑94 (MQ=60)
TGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAAC < SRR4302545.4778573/94‑1 (MQ=60)
TGTAAACATAACCTTCGCCCACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATTTGAAC < SRR4302545.8178277/94‑1 (MQ=60)
GTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGATGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTCGTCAGAATGTGAACG < SRR4302545.8232000/94‑1 (MQ=60)
GTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACG > SRR4302545.5086783/1‑94 (MQ=60)
TAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGG < SRR4302545.9982985/94‑1 (MQ=60)
AACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGAT < SRR4302545.5162796/94‑1 (MQ=60)
AACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGAT > SRR4302545.109453/1‑94 (MQ=60)
ACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATT < SRR4302545.9433675/94‑1 (MQ=60)
GTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCG < SRR4302545.7633818/94‑1 (MQ=60)
GTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCG < SRR4302545.3077459/94‑1 (MQ=60)
GTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCG > SRR4302545.1311295/1‑94 (MQ=60)
TAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGA > SRR4302545.5110018/1‑94 (MQ=60)
TAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGA > SRR4302545.2017123/1‑94 (MQ=60)
AACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGATGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAA < SRR4302545.5235798/94‑1 (MQ=60)
AACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGATGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAA < SRR4302545.6760851/94‑1 (MQ=60)
AACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGATGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAA < SRR4302545.7019602/94‑1 (MQ=60)
AACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGATGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAA > SRR4302545.4016955/1‑94 (MQ=60)
AACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAA > SRR4302545.1148892/1‑94 (MQ=60)
CCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACA > SRR4302545.9603430/1‑94 (MQ=60)
CTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGATGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACAT < SRR4302545.6430412/94‑1 (MQ=60)
CTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACAT < SRR4302545.8944450/94‑1 (MQ=60)
TTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACATG > SRR4302545.7892447/1‑94 (MQ=60)
TTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACATG > SRR4302545.3467346/1‑94 (MQ=60)
TTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACATG < SRR4302545.7515905/94‑1 (MQ=60)
TCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGATGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACATGG < SRR4302545.62048/94‑1 (MQ=60)
TCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACATGG < SRR4302545.9204492/94‑1 (MQ=60)
TCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACATGG < SRR4302545.8541006/94‑1 (MQ=60)
TCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACATGG < SRR4302545.8973736/94‑1 (MQ=60)
TCGCACACTTCGTTGTTAGCAGTGATGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACATGG < SRR4302545.3648989/94‑1 (MQ=60)
CGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGATGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGATGTAGCAAGCGATCGTCAGCATGTGAACGGATTCGAACATGGC > SRR4302545.7624047/1‑94 (MQ=60)
CGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACATGGC > SRR4302545.1903928/1‑94 (MQ=60)
CGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACATGGC < SRR4302545.2606704/94‑1 (MQ=60)
GCACACTTCTTTGTTAGCAGTGATGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACATGGCC < SRR4302545.1775984/94‑1 (MQ=60)
GCACACTTCTTTGTTAGCAGTGATGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACATGGCC > SRR4302545.6559251/1‑94 (MQ=60)
GCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACATGGCC < SRR4302545.7413333/94‑1 (MQ=60)
GCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACATGGCC > SRR4302545.948003/1‑94 (MQ=60)
CACACTTCTTTGTTAGCAGTGATGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACATGGCCT < SRR4302545.3722619/94‑1 (MQ=60)
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CACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACATGGCCT < SRR4302545.4126066/94‑1 (MQ=60)
ACACTTCTTTGTTAGCAGTGATGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACATGGCCTG > SRR4302545.10359077/1‑94 (MQ=60)
CACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACATGGCCTGG < SRR4302545.7019686/94‑1 (MQ=60)
ACTTCTTTGTTAGCAGTGATGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACATGGCCTGGC > SRR4302545.10932726/1‑94 (MQ=60)
TTTTGTTAGCAGTGATGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACATGGCCTGGCCAAT < SRR4302545.8625209/94‑1 (MQ=60)
CTTTGTTAGCAGTGATGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACATGGCCTGGCCAAT > SRR4302545.8078504/1‑94 (MQ=60)
CTTTGTTAGCAGTGATGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACATGGCCTGGCCAAT < SRR4302545.2365992/94‑1 (MQ=60)
CTTTGTTAGCAGTGATGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACATGGCCTGGCCAAT < SRR4302545.6299516/94‑1 (MQ=60)
CTTTGTTAGCAGTGATGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACCGATTCGAACATGGCCTGGCCAAT > SRR4302545.5991903/1‑94 (MQ=60)
CTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGTACGGATTCGAACATGGCCTGGCCAAT > SRR4302545.6824593/1‑94 (MQ=60)
TTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACATGGCCTGGCCAATG > SRR4302545.5860718/1‑94 (MQ=60)
TTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACATGGCCTGGCCAATG < SRR4302545.1272271/94‑1 (MQ=60)
TTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACATGGCCTGGCCAATGA < SRR4302545.1962763/94‑1 (MQ=60)
TGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACATGGCCTGGCCAATGAC < SRR4302545.5453432/94‑1 (MQ=60)
TGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACATGGCCTGGCCAATGAC < SRR4302545.5453430/94‑1 (MQ=60)
GTTAGCAGTGATGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACATGGCCTGGCCAATGACC > SRR4302545.6359127/1‑94 (MQ=60)
TTAGCAGTGATGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACATGGCCTGGCCAATGACCG < SRR4302545.2395998/94‑1 (MQ=60)
TTAGCAGTGATGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACATGGCCTGGCCAATGACCG > SRR4302545.2111939/1‑94 (MQ=60)
TTAGCAGTGATGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACATGGCCTGGCCAATGACCG > SRR4302545.3220474/1‑94 (MQ=60)
TTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACATGGCCTGGCCAATGACCG > SRR4302545.5385264/1‑94 (MQ=60)
TAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACATGGCCTGGCCCATGACCGG > SRR4302545.4512349/1‑94 (MQ=60)
TAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACATGGCCTGGCCAATGACCGG < SRR4302545.10409417/94‑1 (MQ=60)
AGCAGTGATGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACATGGCCTGGCCAATGACCGGC < SRR4302545.8732343/94‑1 (MQ=60)
AGCAGTGATGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACATGGCCTGGCCAATGACCGGC < SRR4302545.8732040/94‑1 (MQ=60)
AGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACATGGCCTGGCCAATGACCGGC > SRR4302545.5748054/1‑94 (MQ=60)
GCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACATGGCCTGGCCAATGACCGGCT > SRR4302545.2954769/1‑94 (MQ=60)
CAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACATGGCCTGGCCAATGACCGGCTC < SRR4302545.5924756/94‑1 (MQ=60)
AGTGATGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACATGGCCTGGCCAATGACCGGCTCC > SRR4302545.6480605/1‑94 (MQ=60)
AGTGATGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACATGGCCTGGCCAATGACCGGCTCC < SRR4302545.2266040/94‑1 (MQ=60)
AGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACATGGCCTGGCCAATGACCGGCTCC < SRR4302545.2886849/94‑1 (MQ=60)
TGATTCCGTTAATTCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACATGGCCTGGCCAATGACCGGCTCCAT < SRR4302545.1002914/94‑1 (MQ=60)
TGATGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACATGGCCTGGCCAATGACCGGCTCCAT < SRR4302545.1594340/94‑1 (MQ=60)
TGATGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACATGGCCTGGCCAATGACCGGCTCCAT < SRR4302545.7375091/94‑1 (MQ=60)
TGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACATGGCCTGGCCAATGACCGGCTCCAT > SRR4302545.2795733/1‑94 (MQ=60)
GATGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACATGGCCTGGCCAATGACCGGCTCCATA < SRR4302545.6931292/94‑1 (MQ=60)
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GACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACATGGCCTGGCCAATGACCGGCTCCATA > SRR4302545.6382423/1‑94 (MQ=60)
ATGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCTGGATGTAGCAAGCGTTGGacactatggagaaagattcgaaaatcgcgcgggaaatgcacctgctcataa > SRR4302545.2870109/1‑43 (MQ=60)
ATGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACATGGCCTGGCCAATGACCGGCTCCATAA < SRR4302545.378045/94‑1 (MQ=60)
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ACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACATGGCCTGGCCAATGACCGGCTCCATAA < SRR4302545.2856697/94‑1 (MQ=60)
TGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACATGGCCTGGCCAATGACCGGCTCCATAAC > SRR4302545.472644/1‑94 (MQ=60)
CGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACATGGCCTGGCCAATGACCGGCTCCATAAC > SRR4302545.451727/1‑94 (MQ=60)
CGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACATGGCCTGGCCAATGACCGGCTCCATAAC < SRR4302545.7958773/94‑1 (MQ=60)
CGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACATGGCCTGGCCAATGACCGGCTCCATAAC < SRR4302545.2564851/94‑1 (MQ=60)
|
CACCGTTGTGGTGACCGATGAACGGGTTCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGATGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACATGGCCTGGCCAATGACCGGCTCCATAAC > NC_000913/4364633‑4364819
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
