Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
882 |
254.4 |
12957588 |
98.0% |
12698436 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,364,726 |
T→C |
I394V (ATC→GTC) |
b4139 ← |
aspartate ammonia‑lyase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,364,726 | 0 | T | C | 100.0%
| 1118.8
/ NA
| 316 | I394V (ATC→GTC) | b4139 | aspartate ammonia‑lyase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (150/166); total (150/166) |
Only 100 of 318 total aligned reads displayed.
CGTTGTGGTGACCGATGAACGGGTTCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGATGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACATGGCCTGGCCAATGACCGGCTCCA > NC_000913/4364636‑4364815
|
gTTGTGGTGACCGATGAACGGGTTCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGcc < 1:4148344/93‑1 (MQ=255)
gTTGTGGTGACCGATGAACGGGTTCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGcc > 2:3010210/1‑93 (MQ=255)
gTTGTGGTGACCGATGAACGGGTTCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGcc < 1:2772766/93‑1 (MQ=255)
ttGTGGTGACCGATGAACGGGTTCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCg > 2:331771/1‑93 (MQ=255)
ttGTGGTGACCGATGAACGGGTTCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCg > 2:5893761/1‑93 (MQ=255)
ttGTGGTGACCGATGAACGGGTTCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCg < 1:6443133/93‑1 (MQ=255)
tgtgGTGACCGATGAACGGGTTCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGt < 1:2910797/93‑1 (MQ=255)
ttggtgACCGATGAACGGGTTCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGtt < 2:2180866/92‑1 (MQ=255)
gtggtgACCGATGAACGGGTTCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGtt < 2:5417168/93‑1 (MQ=255)
tggtgACCGATGAACGGGTTCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTa < 2:126139/93‑1 (MQ=255)
ggtgACCGATGAACGGGTTCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTaa < 2:3575358/93‑1 (MQ=255)
ggtgACCGATGAACGGGTTCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTaa < 2:31339/93‑1 (MQ=255)
gtgACCGATGAACGGGTTCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAAt < 2:4352273/93‑1 (MQ=255)
gtgACCGATGAACGGGTTCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAAt > 1:1943196/1‑93 (MQ=255)
tgACCGATGAACGGGTTCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATg > 2:6403108/1‑93 (MQ=255)
gACCGATGAACGGGTTCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGc > 2:614411/1‑93 (MQ=255)
aCCGATGAACGGGTTCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCa > 2:3195688/1‑93 (MQ=255)
cGATGAACGGGTTCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCAtt < 2:1402556/93‑1 (MQ=255)
gATGAACGGGTTCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCAttt < 1:2525356/93‑1 (MQ=255)
gATGAACGGGTTCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCAttt > 1:2054132/1‑93 (MQ=255)
aTGAACGGGTTCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCAtttt < 2:2324338/93‑1 (MQ=255)
tGAACGGGTTCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCAttttt < 2:3842744/93‑1 (MQ=255)
tGAACGGGTTCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCAttttt < 1:5272230/93‑1 (MQ=255)
tGAACGGGTTCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCAttttt > 1:5181759/1‑93 (MQ=255)
tGAACGGGTTCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCAttttt < 1:4837777/93‑1 (MQ=255)
aCGGGTTCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCca < 2:2512112/93‑1 (MQ=255)
aCGGGTTCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCca < 1:1017346/93‑1 (MQ=255)
cGGGTTCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGAAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCcag > 1:3921738/1‑93 (MQ=255)
gggTTCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCcagc > 2:5750296/1‑93 (MQ=255)
gTTCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCcagcag > 2:4229869/1‑93 (MQ=255)
ttCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAgg < 2:1435947/93‑1 (MQ=255)
tCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGt < 2:4592532/93‑1 (MQ=255)
tCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGt < 1:1314837/93‑1 (MQ=255)
cAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGtt < 1:3445425/93‑1 (MQ=255)
gtaagtaaCGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTa < 1:2275360/93‑1 (MQ=255)
gtaagtaaCGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTa < 1:816152/93‑1 (MQ=255)
aaCGATACCGATATAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGc < 1:3691753/93‑1 (MQ=255)
aTACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTg > 1:6293580/1‑93 (MQ=255)
aTACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTg > 1:3980869/1‑93 (MQ=255)
tACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTgt > 1:943873/1‑92 (MQ=255)
tACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTgg > 1:3014676/1‑93 (MQ=255)
ccGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCTGGTTGTAGCAAGCGGTGGTc > 2:3384507/1‑93 (MQ=255)
cGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCa > 2:4668799/1‑93 (MQ=255)
aTAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCCTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGa > 2:5618771/1‑93 (MQ=255)
tAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACTCTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGaa < 1:2128853/93‑1 (MQ=255)
tAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGaa > 1:2067059/1‑93 (MQ=255)
tAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGaa < 2:6003747/93‑1 (MQ=255)
agagTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAAt < 2:2156662/93‑1 (MQ=255)
gagTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAAtg > 2:3237415/1‑93 (MQ=255)
gagTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAAtg < 2:4110901/93‑1 (MQ=255)
agTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAAtgt < 2:228447/93‑1 (MQ=255)
ttGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGa > 1:6126774/1‑93 (MQ=255)
ttGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGa > 1:1576998/1‑93 (MQ=255)
ttGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGa < 2:6473973/93‑1 (MQ=255)
tGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGaa < 2:4847528/93‑1 (MQ=255)
tGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGaa < 2:916188/93‑1 (MQ=255)
tGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGaa < 2:415679/93‑1 (MQ=255)
gTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAAc > 2:2003146/1‑93 (MQ=255)
gTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTGTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATGTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAAc < 2:2726326/93‑1 (MQ=255)
tAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACg < 2:806014/93‑1 (MQ=255)
aaaCGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACgg > 2:3501149/1‑93 (MQ=255)
aaCGTAACCTCCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGa < 2:1216687/93‑1 (MQ=255)
cGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGAtt < 1:5796214/93‑1 (MQ=255)
cGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGAtt > 1:238044/1‑93 (MQ=255)
tAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCg > 1:4524485/1‑93 (MQ=255)
tAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCg > 2:6213077/1‑93 (MQ=255)
aaCCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGa > 1:549614/1‑93 (MQ=255)
aaCCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGGGACGCCGGTAATCCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAAAATGTGAACGGATTCGa > 1:1800496/1‑93 (MQ=255)
aCCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGaa < 2:455191/93‑1 (MQ=255)
aCCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGaa > 1:120483/1‑93 (MQ=255)
aCCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGaa > 1:600169/1‑93 (MQ=255)
ccTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAAc > 1:3474496/1‑93 (MQ=255)
ccTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAAc < 2:4020324/93‑1 (MQ=255)
ccTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAAc > 1:4687630/1‑93 (MQ=255)
ccTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAAc > 2:5230419/1‑93 (MQ=255)
cTTCGCACCCTTCTTTGTTACCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACa > 2:6327552/1‑93 (MQ=255)
cTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCTAACa > 2:2477033/1‑93 (MQ=255)
ttCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACAt < 2:3702109/93‑1 (MQ=255)
tCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACAtg < 1:5365428/93‑1 (MQ=255)
tCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACAtg < 1:1365168/93‑1 (MQ=255)
tCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACAtg < 2:4950874/93‑1 (MQ=255)
cacaCTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACAtggcc > 1:3263660/1‑93 (MQ=255)
cacaCTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACAtggcc > 1:4975189/1‑93 (MQ=255)
ctcttcttTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACAtggcctg < 2:3428649/91‑1 (MQ=255)
cacTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACAtggcctg > 2:1863467/1‑93 (MQ=255)
acTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACAtggcctgg < 1:4310169/93‑1 (MQ=255)
cttcttTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACAtggcctggc < 2:2456057/93‑1 (MQ=255)
tcttTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACATGGCCTGGCCa > 1:6209279/1‑93 (MQ=255)
ttttGTTAGCATTGACGCCGTTAATTCTTTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCTGAATGTGAACGGATTCGAACATGGCCTGGCCaa < 2:3039418/92‑1 (MQ=255)
cttTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACATGGCCTGGCCaa < 2:2633641/93‑1 (MQ=255)
tttGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACATGGCCTGGCCCAt > 1:5009370/1‑93 (MQ=255)
tttGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACATGGCCTGGCCAAt > 1:2695066/1‑93 (MQ=255)
tttGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACATGGCCTGGCCAAt > 2:1627124/1‑93 (MQ=255)
tGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACATGGCCTGGCCAATGa < 2:735587/93‑1 (MQ=255)
gTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACATGGCCTGGCCAATGAc > 2:4447667/1‑93 (MQ=255)
ttAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACATGGCCTGGCCAATGAcc > 1:6406780/1‑93 (MQ=255)
tAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACATGGCCTGGCCAATGACCg < 2:546878/93‑1 (MQ=255)
aGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACATGGCCTGGCCAATCACCGGCTc > 1:5598590/1‑93 (MQ=255)
tGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACATGGCCTGGCCAATGACCGGCTCCa > 2:5156024/1‑93 (MQ=255)
tGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACATGGCCTGGCCAATGACCGGCTCCa < 2:1044452/93‑1 (MQ=255)
|
CGTTGTGGTGACCGATGAACGGGTTCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGATGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACATGGCCTGGCCAATGACCGGCTCCA > NC_000913/4364636‑4364815
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CACCGTTGTGGTGACCGATGAACGGGTTCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGATGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACATGGCCTGGCCAATGACCGGCTCCATAAC > NC_000913/4364633‑4364819
|
CACCGTTGTGGTGACCGATGAACGGGTTCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGAC > SRR4302537.2694427/1‑94 (MQ=60)
ACCGTTGTGGTGACCGATGAACGGGTTCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACG < SRR4302537.5332858/94‑1 (MQ=60)
ACCGTTGTGGTGACCGATGAACGGGTTCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACG > SRR4302537.5495469/1‑94 (MQ=60)
ACCGTTGTGGTGACCGATGAACGGGTTCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACG < SRR4302537.38799/94‑1 (MQ=60)
CGTTGTGGTGACCGATGAACGGGTTCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCC > SRR4302537.3350679/1‑94 (MQ=60)
CGTTGTGGTGACCGATGAACGGGTTCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCC < SRR4302537.2131903/94‑1 (MQ=60)
GTTGTGGTGACCGATGAACGGGTTCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCG < SRR4302537.2792144/94‑1 (MQ=60)
GTTGTGGTGACCGATGAACGGGTTCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCG > SRR4302537.2771067/1‑94 (MQ=60)
GTTGTGGTGACCGATGAACGGGTTCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCG < SRR4302537.4177296/94‑1 (MQ=60)
TTGTGGTGACCGATGAACGGGTTCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGT < SRR4302537.6486852/94‑1 (MQ=60)
TTGTGGTGACCGATGAACGGGTTCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGT < SRR4302537.2763141/94‑1 (MQ=60)
TGTGGTGACCGATGAACGGGTTCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTT < SRR4302537.2931247/94‑1 (MQ=60)
GTGGTGACCGATGAACGGGTTCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTA > SRR4302537.3172505/1‑94 (MQ=60)
GGTGACCGATGAACGGGTTCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAAT < SRR4302537.804479/94‑1 (MQ=60)
GGTGACCGATGAACGGGTTCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAAT > SRR4302537.1956707/1‑94 (MQ=60)
GTGACCGATGAACGGGTTCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATG < SRR4302537.4049907/94‑1 (MQ=60)
GACCGATGAACGGGTTCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCA > SRR4302537.5302747/1‑94 (MQ=60)
GCCGATGAACGGGTTCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCAT < SRR4302537.3489750/94‑1 (MQ=60)
CGATGAACGGGTTCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACCCTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTT > SRR4302537.2068545/1‑94 (MQ=60)
CGATGAACGGGTTCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTT > SRR4302537.2332291/1‑94 (MQ=60)
CGATGAACGGGTTCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTT > SRR4302537.2068544/1‑94 (MQ=60)
GATGAACGGGTTCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTT < SRR4302537.2543084/94‑1 (MQ=60)
GATGAACGGGTTCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTT > SRR4302537.6316037/1‑94 (MQ=60)
ATGAACGGGTTCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTT > SRR4302537.5217416/1‑94 (MQ=60)
ATGAACGGGTTCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTT > SRR4302537.242089/1‑94 (MQ=60)
ATGAACGGGTTCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTT < SRR4302537.212307/94‑1 (MQ=60)
TGAACGGGTTCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTC < SRR4302537.5308513/94‑1 (MQ=60)
TGAACGGGTTCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTC < SRR4302537.4871177/94‑1 (MQ=60)
GAACGGGTTCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCC < SRR4302537.882205/94‑1 (MQ=60)
GAACGGGTTCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGATTTTTTCC > SRR4302537.4972716/1‑94 (MQ=60)
ACGGGTTCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAG < SRR4302537.1024349/94‑1 (MQ=60)
ACGGGTTCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGAAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAG > SRR4302537.3949145/1‑94 (MQ=60)
GGTTCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAG < SRR4302537.5820125/94‑1 (MQ=60)
TCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTT < SRR4302537.6021069/94‑1 (MQ=60)
TCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTT > SRR4302537.6077797/1‑94 (MQ=60)
TCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTT < SRR4302537.1323995/94‑1 (MQ=60)
CAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTG < SRR4302537.3469798/94‑1 (MQ=60)
CAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTG < SRR4302537.1827904/94‑1 (MQ=60)
GTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAG < SRR4302537.2291423/94‑1 (MQ=60)
GTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAG < SRR4302537.3569210/94‑1 (MQ=60)
GTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAG < SRR4302537.1823970/94‑1 (MQ=60)
GTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAG < SRR4302537.821757/94‑1 (MQ=60)
TAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGC > SRR4302537.190044/1‑94 (MQ=60)
TAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGC < SRR4302537.6061908/94‑1 (MQ=60)
TAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGC < SRR4302537.4805868/94‑1 (MQ=60)
GTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTCGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAG < SRR4302537.4577407/94‑1 (MQ=60)
GTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAG > SRR4302537.4332496/1‑94 (MQ=60)
GTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAG < SRR4302537.5554918/94‑1 (MQ=60)
TAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGC < SRR4302537.6474346/94‑1 (MQ=60)
TAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGC > SRR4302537.5087394/1‑94 (MQ=60)
TAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGC < SRR4302537.41427/94‑1 (MQ=60)
AACGATACCGATATAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCG < SRR4302537.3717731/94‑1 (MQ=60)
AACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCG > SRR4302537.4676775/1‑94 (MQ=60)
AACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCG < SRR4302537.1343910/94‑1 (MQ=60)
AACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCG < SRR4302537.2968317/94‑1 (MQ=60)
ACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCCGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGT < SRR4302537.3493909/94‑1 (MQ=60)
CGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTT < SRR4302537.540960/94‑1 (MQ=60)
GATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTG > SRR4302537.6336700/1‑94 (MQ=60)
GATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTG > SRR4302537.4008737/1‑94 (MQ=60)
ATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGT > SRR4302537.950394/1‑94 (MQ=60)
ATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGG > SRR4302537.3035693/1‑94 (MQ=60)
TACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGT < SRR4302537.4250357/94‑1 (MQ=60)
CCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCA > SRR4302537.1212483/1‑94 (MQ=60)
CCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCA > SRR4302537.5875714/1‑94 (MQ=60)
CGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGGAAGCGTTGGTCAG > SRR4302537.6233990/1‑94 (MQ=60)
CGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAG > SRR4302537.962353/1‑94 (MQ=60)
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GATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGA > SRR4302537.3706512/1‑94 (MQ=60)
ATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAA > SRR4302537.1470187/1‑94 (MQ=60)
ATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAA > SRR4302537.2081577/1‑94 (MQ=60)
ATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAA > SRR4302537.6392104/1‑94 (MQ=60)
TAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACTCTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAAT < SRR4302537.2143827/94‑1 (MQ=60)
TAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAAT < SRR4302537.3280655/94‑1 (MQ=60)
AGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATG > SRR4302537.2942891/1‑94 (MQ=60)
AGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATG < SRR4302537.5036310/94‑1 (MQ=60)
AGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATG > SRR4302537.4110130/1‑94 (MQ=60)
AGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATG > SRR4302537.331179/1‑94 (MQ=60)
AGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATG > SRR4302537.3928371/1‑94 (MQ=60)
GAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGT < SRR4302537.2576587/94‑1 (MQ=60)
GAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACGTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGT < SRR4302537.2810464/94‑1 (MQ=60)
AGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGATGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTG > SRR4302537.6465968/1‑94 (MQ=60)
GTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGA > SRR4302537.1587994/1‑94 (MQ=60)
GTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGA > SRR4302537.6168886/1‑94 (MQ=60)
TTGTAAACGTAACCTTCGCACCCTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAA < SRR4302537.5392368/94‑1 (MQ=60)
TGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAAC < SRR4302537.1355039/94‑1 (MQ=60)
TGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAAC < SRR4302537.269560/94‑1 (MQ=60)
GTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACG < SRR4302537.2037779/94‑1 (MQ=60)
GTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACG < SRR4302537.2196012/94‑1 (MQ=60)
TAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGG > SRR4302537.1084908/1‑94 (MQ=60)
TAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGG < SRR4302537.4905780/94‑1 (MQ=60)
TAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGG < SRR4302537.3197408/94‑1 (MQ=60)
AAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGA > SRR4302537.3849105/1‑94 (MQ=60)
AAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGA > SRR4302537.5770251/1‑94 (MQ=60)
ACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATT > SRR4302537.239726/1‑94 (MQ=60)
CGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTC < SRR4302537.5835953/94‑1 (MQ=60)
GTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCG > SRR4302537.4555786/1‑94 (MQ=60)
TAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGA > SRR4302537.553397/1‑94 (MQ=60)
TAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGGGACGCCGGTAATCCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAAAATGTGAACGGATTCGA > SRR4302537.1813058/1‑94 (MQ=60)
AACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAA > SRR4302537.121346/1‑94 (MQ=60)
AACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAA > SRR4302537.604274/1‑94 (MQ=60)
ACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAAC < SRR4302537.1307143/94‑1 (MQ=60)
ACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAAC > SRR4302537.3499082/1‑94 (MQ=60)
ACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAAC < SRR4302537.3974610/94‑1 (MQ=60)
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CTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACAT < SRR4302537.4854459/94‑1 (MQ=60)
CTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACAT > SRR4302537.5485123/1‑94 (MQ=60)
TCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACATGG < SRR4302537.5402144/94‑1 (MQ=60)
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CGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACATGGC > SRR4302537.2451307/1‑94 (MQ=60)
CGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACATGGC > SRR4302537.6182053/1‑94 (MQ=60)
GCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACATGGCC > SRR4302537.5009485/1‑94 (MQ=60)
GCACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACATGGCC > SRR4302537.3286682/1‑94 (MQ=60)
CACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACATGGCCT > SRR4302537.5133930/1‑94 (MQ=60)
ACACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACATGGCCTG > SRR4302537.1779565/1‑94 (MQ=60)
CACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACATGGCCTGG > SRR4302537.6326365/1‑94 (MQ=60)
ACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACATGGCCTGGC < SRR4302537.4340125/94‑1 (MQ=60)
ACTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACATGGCCTGGC > SRR4302537.5041437/1‑94 (MQ=60)
CTTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACATGGCCTAGCC > SRR4302537.5298524/1‑94 (MQ=60)
TTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACATGGCCTGGCCA > SRR4302537.6252060/1‑94 (MQ=60)
TTCTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACATGGCCTGGCCA > SRR4302537.1252158/1‑94 (MQ=60)
CTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACATGGCCTGGCCCAT > SRR4302537.5043881/1‑94 (MQ=60)
CTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACATGGCCTGGCCAAT > SRR4302537.2713899/1‑94 (MQ=60)
CTTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACATGGCCTGGCCAAT < SRR4302537.2341118/94‑1 (MQ=60)
TTTGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACATGGCCTGGCCAATG < SRR4302537.441061/94‑1 (MQ=60)
TGTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACATGGCCTGGCCAATGAC < SRR4302537.869821/94‑1 (MQ=60)
GTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACATGGCCTGGCCAATGACC > SRR4302537.6450383/1‑94 (MQ=60)
GTTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACATGGCCTGGCCAATGACC < SRR4302537.2078575/94‑1 (MQ=60)
TTAGCAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACATGGCCTGGCCAATGACCG < SRR4302537.224026/94‑1 (MQ=60)
CAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACATGGCCTGGCCAATGACCGGCTC > SRR4302537.6322898/1‑94 (MQ=60)
CAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACATGGCCTGGCCAATGACCGGCTC > SRR4302537.5389751/1‑94 (MQ=60)
CAGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACATGGCCTGGCCAATCACCGGCTC > SRR4302537.5636866/1‑94 (MQ=60)
AGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACATGGCCTGGCCAATGACCGGCTCC > SRR4302537.3981387/1‑94 (MQ=60)
AGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACATGGCCTGGCCAATGACCGGCTCC > SRR4302537.5607671/1‑94 (MQ=60)
AGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACATGGCCTGGCCAATGACCGGCTCC < SRR4302537.685626/94‑1 (MQ=60)
AGTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACATGGCCTGGCCAATGACCGGCTCC > SRR4302537.1789401/1‑94 (MQ=60)
GTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACATGGCCTGGCCAATGACCGGCTCCA > SRR4302537.4901141/1‑94 (MQ=60)
GTGACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACATGGCCTGGCCAATGACCGGCTCCA < SRR4302537.5545758/94‑1 (MQ=60)
GACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACATGGCCTGGCCAATGACCGGCTCCATA < SRR4302537.2214554/94‑1 (MQ=60)
ACGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACATGGCCTGGCCAATGACCGGCTCCATAA < SRR4302537.41514/94‑1 (MQ=60)
CGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACATGGCCTGGCCAATGACCGGCTCCATAAC < SRR4302537.4486923/94‑1 (MQ=60)
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CACCGTTGTGGTGACCGATGAACGGGTTCAGGTAAGTAACGATACCGATAGAGTTGTAAACGTAACCTTCGCACACTTCTTTGTTAGCAGTGATGCCGTTAATGCATTTTTCCAGCAGGTTGTAGCAAGCGTTGGTCAGAATGTGAACGGATTCGAACATGGCCTGGCCAATGACCGGCTCCATAAC > NC_000913/4364633‑4364819
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
