Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
A0 F0 I1 R1
|
245 |
579.6 |
28867798 |
97.7% |
28203838 |
96.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
RA |
NC_000913 |
704,236 |
T→C |
L357S (TTG→TCG) |
nagE → |
PTS system, N‑acetylglucosamine‑specific enzyme IIABC |
|
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
* | NC_000913 | 704,236 | 0 | T | C | 99.8%
| 2353.3
/ NA
| 596 | L357S (TTG→TCG) | nagE | PTS system, N‑acetylglucosamine‑specific enzyme IIABC |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/1); new base C (330/264); total (331/265) |
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.45e-01 |
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 614 total aligned reads displayed.
TGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTTGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGAAGCCAACAGCAACACTGAAGAAG > NC_000913/704143‑704328
|
tGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCATCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCgg > 2:14097386/1‑96 (MQ=255)
aTGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGtt < 2:13496018/96‑1 (MQ=255)
tataACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATc > 1:12665557/1‑96 (MQ=255)
ataACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATcc > 1:1905980/1‑96 (MQ=255)
aaCCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGGGTTCAGTTCGGTTATCCGc > 2:4880622/1‑96 (MQ=255)
cTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATg > 1:3239343/1‑96 (MQ=255)
tGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGt < 1:2206170/96‑1 (MQ=255)
tGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGt < 2:3334819/96‑1 (MQ=255)
cggccgCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCa < 2:8039299/96‑1 (MQ=255)
cggccgCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCa < 1:6971257/96‑1 (MQ=255)
ggccgCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCaa > 2:7684313/1‑96 (MQ=255)
ggccgCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCaa > 2:3692506/1‑96 (MQ=255)
ggccgCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCaa > 1:1474106/1‑96 (MQ=255)
gccgccAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATCTTCAAc < 2:13686708/96‑1 (MQ=255)
ccgccAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAAcc < 2:1450211/96‑1 (MQ=255)
ccgccAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAAcc < 2:12948591/96‑1 (MQ=255)
cgccAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTTGAGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATATACTTCGTGGTGATCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCt > 1:11096545/1‑96 (MQ=255)
cgccAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATTTTCAACCt > 2:6152229/1‑96 (MQ=255)
gccagccaGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTg > 2:2697775/1‑96 (MQ=255)
gccagccaGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTg > 2:7344218/1‑96 (MQ=255)
gccagccaGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTg < 1:784104/96‑1 (MQ=255)
gccagccaGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTg < 2:9160328/96‑1 (MQ=255)
ccagccagAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGa < 1:13297234/96‑1 (MQ=255)
ccagccagAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGa > 2:9467290/1‑96 (MQ=255)
cagcctgAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGaa > 1:6112399/1‑96 (MQ=255)
cagccagAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGaa > 1:10046633/1‑96 (MQ=255)
cagccagAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGaa > 1:8884077/1‑96 (MQ=255)
cagccagAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGaa < 1:9531335/96‑1 (MQ=255)
cagccagAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGGGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTGCAACCTGaa > 2:8624720/1‑96 (MQ=255)
agccagAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGaaa > 1:7636965/1‑96 (MQ=255)
gAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCACCCTGAAAACGcc < 1:6803898/96‑1 (MQ=255)
gAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGcc < 2:10845487/96‑1 (MQ=255)
cGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCggg > 1:12047360/1‑96 (MQ=255)
gTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCgggc > 2:6629317/1‑95 (MQ=255)
tCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTc < 1:4783144/96‑1 (MQ=255)
tCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTc > 1:12392224/1‑96 (MQ=255)
tCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTc < 1:13133113/96‑1 (MQ=255)
cTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCg > 2:5496079/1‑96 (MQ=255)
gATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGa > 1:14090607/1‑96 (MQ=255)
gATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGa > 1:2557080/1‑96 (MQ=255)
aTGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGaa > 1:5954187/1‑96 (MQ=255)
aTGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGaa > 1:10804793/1‑96 (MQ=255)
tgctgcTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAg < 1:1732848/96‑1 (MQ=255)
tgctgcTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAg < 2:4175686/96‑1 (MQ=255)
ctgctgGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGAt < 1:2824384/96‑1 (MQ=255)
tgctgGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATa < 2:171691/96‑1 (MQ=255)
gctgGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATaa < 2:1942666/96‑1 (MQ=255)
gctgGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGATATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATaa > 1:6351615/1‑96 (MQ=255)
tgGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAaag > 2:2521689/1‑96 (MQ=255)
tgGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAaag > 2:8323390/1‑96 (MQ=255)
ggTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAaaga > 2:1143757/1‑96 (MQ=255)
ggTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAaaga < 2:9578331/96‑1 (MQ=255)
gTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAaagaa < 2:3963077/96‑1 (MQ=255)
tGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAaagaag < 1:4483308/96‑1 (MQ=255)
gATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAagaaga > 1:990921/1‑96 (MQ=255)
gATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAagaaga > 1:8129286/1‑96 (MQ=255)
tGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACg < 2:7888032/96‑1 (MQ=255)
gggCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGActt < 1:11673035/96‑3 (MQ=255)
gggCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACga > 2:5108468/1‑96 (MQ=255)
ggCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACgag > 1:9160685/1‑96 (MQ=255)
cGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGAt > 1:8644419/1‑96 (MQ=255)
gTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATc > 1:3054567/1‑96 (MQ=255)
gTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATc < 1:8278181/96‑1 (MQ=255)
gTTATCTTCTTCGCTATCCACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATc < 2:11623425/96‑1 (MQ=255)
tATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAACAAGACGAGATCgg < 1:11378753/96‑2 (MQ=255)
aTCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGtt < 2:12665557/96‑1 (MQ=255)
tcttctTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGtca < 1:11823156/96‑3 (MQ=255)
tcttctTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTa > 2:10606913/1‑96 (MQ=255)
tcttctTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTa > 1:1058454/1‑96 (MQ=255)
ttcttcGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAGAGAAGACGCGATCGTTACt > 1:14259247/1‑96 (MQ=255)
ttcttcGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACt > 2:4439592/1‑96 (MQ=255)
ttcttcGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACt > 2:11044304/1‑96 (MQ=255)
cttcGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTGGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTga > 1:11228895/1‑96 (MQ=255)
cttcGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTga > 1:5377309/1‑96 (MQ=255)
cttcGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTga > 1:6590936/1‑96 (MQ=255)
ttcGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACTCCGGGTCGTGAAGATAAAGCAGACGAGATCTTTACTgaa > 1:9619144/1‑96 (MQ=255)
ttcGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTgaa > 2:453768/1‑96 (MQ=255)
gCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTgaagaa > 1:4311159/1‑96 (MQ=255)
cTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGaagaag > 1:13642275/1‑96 (MQ=255)
cTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGaagaag < 1:3692506/96‑1 (MQ=255)
tATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGAAGc > 2:5826730/1‑96 (MQ=255)
aTCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAACCGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGAAGcc < 2:11200543/96‑1 (MQ=255)
cTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGAAGCCaa > 2:30553/1‑96 (MQ=255)
tACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGAAGCCAAc < 2:7189093/96‑1 (MQ=255)
ttCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGAAGCCAACAGc > 1:10318923/1‑96 (MQ=255)
tCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGAAGCCAACAGCa < 2:2110904/96‑1 (MQ=255)
cGTGGGGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGAAGCCAACAGCaa > 2:13764647/1‑96 (MQ=255)
gtggtgTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGAAGCCAACAGCAac > 1:3933950/1‑96 (MQ=255)
tggtgTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGAAGCCAACAGCAaca < 1:5032700/96‑1 (MQ=255)
tggtgTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGAAGCCAACAGCAaca < 2:13344113/96‑1 (MQ=255)
tggtgTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGACAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGAAGCCAACAGCAaca > 2:12483078/1‑96 (MQ=255)
ggtgTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGAAGCCAACAGCAacac > 2:12199809/1‑96 (MQ=255)
tgtTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGAAGCCAACAGCAACACTg < 1:7109625/96‑1 (MQ=255)
ttCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGAAGCCAACAGCAACACTgaa < 2:5337787/96‑1 (MQ=255)
ttCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGAAGCCAACAGCAACACTgaa < 1:7334412/96‑1 (MQ=255)
ttCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGAAGCCAACAGCAACACTgaa < 1:5770405/96‑1 (MQ=255)
cAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGAAGCCAACAGCAACACTgaaga < 2:12002227/96‑1 (MQ=255)
aGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGAAGCCAACAGCAACACTgaagaa > 2:10269104/1‑96 (MQ=255)
gTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGAAGCCAACAGCAACACTGaagaag < 2:7084945/96‑1 (MQ=255)
gTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGAAGCCAACAGCAACACTGaagaag > 2:8916611/1‑96 (MQ=255)
|
TGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTTGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGAAGCCAACAGCAACACTGAAGAAG > NC_000913/704143‑704328
|
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 353 total aligned reads displayed.
TACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTTGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGAAGCCAACAGCAACACTGAAGAAGGTCTGACT > NC_000913/704136‑704336
|
TACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTC < SRR4302518.7322865/101‑1 (MQ=60)
TACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGGGGGGTTCAGTTC > SRR4302518.3785827/1‑101 (MQ=60)
NNNGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTC < SRR4302518.14894997/101‑1 (MQ=60)
NNNGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTC < SRR4302518.14839860/101‑1 (MQ=60)
ACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTNNN > SRR4302518.14268734/1‑101 (MQ=60)
CGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGACAGAACGTGTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTATTCGCTATATACTTGGTGGTGTTCAGTTAGG > SRR4302518.2304463/1‑101 (MQ=60)
NNNTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGT < SRR4302518.8352518/101‑1 (MQ=60)
GCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGGCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGT > SRR4302518.2210282/1‑101 (MQ=60)
NNNTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTT < SRR4302518.10033770/101‑1 (MQ=60)
CGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTT > SRR4302518.5104973/1‑101 (MQ=60)
nnnatttatatCCTGCCGCCCGCCAGCAAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCCTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTAT < SRR4302518.8541298/90‑1 (MQ=60)
NNNATGTATCACCTGCCTGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTCTCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTAT < SRR4302518.11294692/101‑1 (MQ=60)
NNNATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTTCTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTAT < SRR4302518.12773458/101‑1 (MQ=60)
TGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGTGCGTTATCTTCTTCGGTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATC > SRR4302518.6604229/1‑101 (MQ=60)
NNNTGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATC < SRR4302518.13874634/101‑1 (MQ=60)
NNNGTATACCCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATGC < SRR4302518.14922693/101‑1 (MQ=60)
GATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCC < SRR4302518.3368921/101‑1 (MQ=60)
NNNTATAACCTGCCGGCCGGCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCG < SRR4302518.14827386/101‑1 (MQ=60)
ATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCG < SRR4302518.6729557/101‑1 (MQ=60)
AGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGAGATGTGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGAGTTCATTTCGGTTATCNNN > SRR4302518.11880882/1‑101 (MQ=60)
TATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCAT > SRR4302518.2128112/1‑101 (MQ=60)
tccacttagcagccgccagttAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGTCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTACGTGGTTTTTAGTTCGTTTATCCGCATG < SRR4302518.6504424/80‑1 (MQ=60)
NNNACCGGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATG < SRR4302518.10952888/101‑1 (MQ=60)
ATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCNNN > SRR4302518.12098563/1‑101 (MQ=60)
ATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATG > SRR4302518.1992423/1‑101 (MQ=60)
NNNCCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGT < SRR4302518.10135027/101‑1 (MQ=60)
AGCCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATNNN > SRR4302518.11052933/1‑101 (MQ=60)
AACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATNNN > SRR4302518.7642091/1‑101 (MQ=60)
AACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTT < SRR4302518.2797427/101‑1 (MQ=60)
ctcgattggcaattgccagatACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTC > SRR4302518.1875798/22‑101 (MQ=60)
NNNTGCCGGCCGCCCGCCAGCACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGCTATCCGCATGTTC < SRR4302518.11496667/101‑1 (MQ=60)
ACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGGGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTga > SRR4302518.4782314/1‑99 (MQ=60)
GCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGAGGTGGCTGGTGGTGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCA < SRR4302518.6803142/101‑1 (MQ=60)
CCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCA < SRR4302518.7341649/101‑1 (MQ=60)
CCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTNNN > SRR4302518.8283903/1‑101 (MQ=60)
NNNCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAAC < SRR4302518.9612597/101‑1 (MQ=60)
NNNGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAATC < SRR4302518.12234569/101‑1 (MQ=60)
GCCGTGCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCATTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACC < SRR4302518.5806657/101‑1 (MQ=60)
CCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGcacaannn > SRR4302518.13484170/1‑93 (MQ=60)
CCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAANNN > SRR4302518.11370576/1‑101 (MQ=60)
CCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAANNN > SRR4302518.11189015/1‑101 (MQ=60)
CCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCT > SRR4302518.4152297/1‑101 (MQ=60)
ccgccccccGCCAGAACGTCTAGATGCTGCTGGTGATTGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTG < SRR4302518.1847839/92‑1 (MQ=60)
NNNCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGA < SRR4302518.13909752/101‑1 (MQ=60)
GGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGA > SRR4302518.3919321/1‑101 (MQ=60)
NNNGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAA < SRR4302518.9993069/101‑1 (MQ=60)
GCCGCCAGCCAGAGCGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAA < SRR4302518.6266258/101‑1 (MQ=60)
GCCGCCAGCCAGAACGTCTGGGTGCTGCTGGTGAGGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGACGTTCAGTTATGTTATCCGCATGTTCAAGCTGAA > SRR4302518.5925193/1‑101 (MQ=60)
GCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAA < SRR4302518.3197784/101‑1 (MQ=60)
CCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGNNN > SRR4302518.7699956/1‑101 (MQ=60)
CCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAA < SRR4302518.5926359/101‑1 (MQ=60)
CCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAA < SRR4302518.4629219/101‑1 (MQ=60)
CGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGANNN > SRR4302518.7723646/1‑101 (MQ=60)
CGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGANNN > SRR4302518.8367019/1‑101 (MQ=60)
NNNAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAAC < SRR4302518.14424687/101‑1 (MQ=60)
GCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAAC < SRR4302518.3081679/101‑1 (MQ=60)
GCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAAC > SRR4302518.5243056/1‑101 (MQ=60)
GCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAAC < SRR4302518.4941462/101‑1 (MQ=60)
CAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAANNN > SRR4302518.10523329/1‑101 (MQ=60)
CAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGC > SRR4302518.1734114/1‑101 (MQ=60)
NNNCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGACGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCC < SRR4302518.13018909/101‑1 (MQ=60)
CGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCC < SRR4302518.6326167/101‑1 (MQ=60)
AGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCACCCTGAAAACGCC < SRR4302518.7162069/101‑1 (MQ=60)
AGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACNNN > SRR4302518.8620208/1‑101 (MQ=60)
AGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACNNN > SRR4302518.8026166/1‑101 (MQ=60)
AGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACNNN > SRR4302518.7941588/1‑101 (MQ=60)
GCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGNNN > SRR4302518.12244518/1‑101 (MQ=60)
CCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCNNN > SRR4302518.7443586/1‑101 (MQ=60)
CCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGG > SRR4302518.1479712/1‑101 (MQ=60)
CAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGG > SRR4302518.4408684/1‑101 (MQ=60)
CAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGG > SRR4302518.1178369/1‑101 (MQ=60)
AGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGNNN > SRR4302518.7961341/1‑101 (MQ=60)
NNNCGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTC < SRR4302518.12847405/101‑1 (MQ=60)
GAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTC < SRR4302518.303958/101‑1 (MQ=60)
GAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTC < SRR4302518.5033696/101‑1 (MQ=60)
GAACGTCTGGATGCTGATGGTGATGGCCGTTTTCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTC < SRR4302518.874520/101‑1 (MQ=60)
NNNGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACTCCGGGTCG < SRR4302518.13592195/101‑1 (MQ=60)
AACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCG < SRR4302518.4849083/101‑1 (MQ=60)
AACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGNNN > SRR4302518.8110272/1‑101 (MQ=60)
ACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGG > SRR4302518.4104249/1‑101 (MQ=60)
NNNCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTG < SRR4302518.10051781/101‑1 (MQ=60)
CGTGTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCNNN > SRR4302518.8863042/1‑101 (MQ=60)
CGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGAGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTG > SRR4302518.6182878/1‑101 (MQ=60)
GTCTGGATGCGGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGGGGTGTTCAGTTCGGGTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGGGA > SRR4302518.3192323/1‑101 (MQ=60)
TCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTNNN > SRR4302518.12976470/1‑101 (MQ=60)
NNNGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAA < SRR4302518.8939264/101‑1 (MQ=60)
CTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAG < SRR4302518.1810002/101‑1 (MQ=60)
CTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGGTCAACCTGAACACGCCGGGTCGTGNNN > SRR4302518.10220065/1‑101 (MQ=60)
NNNTGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGAT < SRR4302518.14195560/101‑1 (MQ=60)
GGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAANNN > SRR4302518.11697621/1‑101 (MQ=60)
GGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGAT < SRR4302518.2957983/101‑1 (MQ=60)
GATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGNNN > SRR4302518.14735893/1‑101 (MQ=60)
GATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGAGA > SRR4302518.2679863/1‑101 (MQ=60)
nnntcttccgatctGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAG < SRR4302518.14307499/87‑1 (MQ=60)
TGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAA < SRR4302518.13985/101‑1 (MQ=60)
TGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAA > SRR4302518.7186736/1‑101 (MQ=60)
gctgatgatctgatctgTCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAG < SRR4302518.5654127/84‑1 (MQ=60)
NNNGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAG < SRR4302518.9595592/101‑1 (MQ=60)
NNNGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAG < SRR4302518.11997664/101‑1 (MQ=60)
GCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAG > SRR4302518.5393290/1‑101 (MQ=60)
GCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAG < SRR4302518.4716136/101‑1 (MQ=60)
nnnctATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGAA < SRR4302518.11886220/96‑1 (MQ=60)
TGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGAC > SRR4302518.1612686/1‑101 (MQ=60)
TGGTGATGGGCGTTATCTTATTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGAC < SRR4302518.1550754/101‑1 (MQ=60)
NNNATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACtt < SRR4302518.12222974/101‑3 (MQ=60)
nnngggtgctgTCTTCTTCGCTATCTCCTTCGTGGTGTTCCGTTCGGTTTTCCGCATGTTCAACCTGAAACCGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAAA < SRR4302518.11601979/90‑1 (MQ=60)
GATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGNNN > SRR4302518.9279031/1‑101 (MQ=60)
GATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGNNN > SRR4302518.8532618/1‑101 (MQ=60)
GATGGGCGTTATCCTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGNNN > SRR4302518.14517914/1‑101 (MQ=60)
ATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGAT > SRR4302518.6846702/1‑101 (MQ=60)
TGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGACAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGATGACGAGAcg > SRR4302518.7145801/1‑99 (MQ=60)
TGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATC < SRR4302518.639392/101‑1 (MQ=60)
TGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATC > SRR4302518.6748380/1‑101 (MQ=60)
TGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGGGAAGATAAAGAAGACGAGAGC > SRR4302518.4231187/1‑101 (MQ=60)
NNNGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATC < SRR4302518.8686187/101‑1 (MQ=60)
GGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCG > SRR4302518.5067034/1‑101 (MQ=60)
NNNGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAACAAGACGAGATCGG < SRR4302518.11911866/101‑1 (MQ=60)
GGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAACACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATNNN > SRR4302518.7421452/1‑101 (MQ=60)
GGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATNNN > SRR4302518.9602389/1‑101 (MQ=60)
GGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGT < SRR4302518.1371810/101‑1 (MQ=60)
GGCGTCATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGT < SRR4302518.2511571/101‑1 (MQ=60)
NNNTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTT < SRR4302518.8129838/101‑1 (MQ=60)
NNNTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTT < SRR4302518.9260545/101‑1 (MQ=60)
NNNTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGCT < SRR4302518.11163862/101‑1 (MQ=60)
GCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTT > SRR4302518.2772715/1‑101 (MQ=60)
cgacgctcttccgatctTCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTA < SRR4302518.6220359/84‑1 (MQ=60)
NNNTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTCA < SRR4302518.12385724/101‑1 (MQ=60)
CGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTA > SRR4302518.987627/1‑101 (MQ=60)
CGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGNNN > SRR4302518.11684154/1‑101 (MQ=60)
CGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGATGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTA < SRR4302518.685370/101‑1 (MQ=60)
GTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTAC > SRR4302518.5193597/1‑101 (MQ=60)
GTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTAC > SRR4302518.4526967/1‑101 (MQ=60)
GATATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTNNN > SRR4302518.10785441/1‑101 (MQ=60)
TTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTNNN > SRR4302518.8629124/1‑101 (MQ=60)
TATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTG < SRR4302518.2423852/101‑1 (MQ=60)
NNNCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTG < SRR4302518.10944887/101‑1 (MQ=60)
ATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGA > SRR4302518.1908501/1‑101 (MQ=60)
ATCTTCTTCGCTAGCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACNNN > SRR4302518.14058019/1‑101 (MQ=60)
TCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAGCGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTNNN > SRR4302518.10728255/1‑101 (MQ=60)
TCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTNNN > SRR4302518.13020715/1‑101 (MQ=60)
NNNCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAG < SRR4302518.10574686/101‑1 (MQ=60)
CTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGNNN > SRR4302518.7532460/1‑101 (MQ=60)
TTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGGAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAATA > SRR4302518.2101814/1‑101 (MQ=60)
TTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATGGTTACTGACGA > SRR4302518.4608501/1‑101 (MQ=60)
TTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGANNN > SRR4302518.10339921/1‑101 (MQ=60)
TTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGANNN > SRR4302518.12548236/1‑101 (MQ=60)
TTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGA > SRR4302518.6451574/1‑101 (MQ=60)
NNNTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGAA < SRR4302518.10981246/101‑1 (MQ=60)
CTTCGCTCTCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGAAG < SRR4302518.2824399/101‑1 (MQ=60)
CTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGAAG > SRR4302518.6929984/1‑101 (MQ=60)
CTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGAAG < SRR4302518.3865816/101‑1 (MQ=60)
TTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGAAGC < SRR4302518.3699680/101‑1 (MQ=60)
TTCGCTATCTACTTCGTGGTGGTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGANNN > SRR4302518.11674957/1‑101 (MQ=60)
NNNGCTATCTACTTCGTTGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCACCCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGAAGC < SRR4302518.15003760/101‑1 (MQ=60)
CGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGAAGNNN > SRR4302518.12460545/1‑101 (MQ=60)
NNNATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGAAGCCAA < SRR4302518.13167900/101‑1 (MQ=60)
GCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGAAGCCAA > SRR4302518.6250711/1‑101 (MQ=60)
GCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGAAGCCAA > SRR4302518.4525545/1‑101 (MQ=60)
TATCTACTTCGTGGTGTTCATTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAACACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGAAGCCAACA < SRR4302518.3547457/101‑1 (MQ=60)
TATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGAAGCCANNN > SRR4302518.9134856/1‑101 (MQ=60)
atttcCTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGAAGCCAACAG < SRR4302518.7074557/96‑1 (MQ=60)
ATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGAAGCCAANNN > SRR4302518.8074740/1‑101 (MQ=60)
ATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGAAGCCAACAG < SRR4302518.1853315/101‑1 (MQ=60)
TCTACTTCGGGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATTGTTACTGAAGAAGCCAACNNN > SRR4302518.9352063/1‑101 (MQ=60)
NNNACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGAAGCCAACAGC < SRR4302518.9035462/101‑1 (MQ=60)
CTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGAAGCCAACAGCA > SRR4302518.4762670/1‑101 (MQ=60)
NNNTTCGTGGTGTTCAGTTCCGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGAAGCCAACAGCAA < SRR4302518.10192999/101‑1 (MQ=60)
NNNTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGAAGCCAACAGCATC < SRR4302518.11613958/101‑1 (MQ=60)
NNNTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGAAGCCAACAGCAAC < SRR4302518.12754109/101‑1 (MQ=60)
ACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGAAGCCAACAGCAAC < SRR4302518.333588/101‑1 (MQ=60)
CTTGGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGAAGCCAACAGCAACA < SRR4302518.5293741/101‑1 (MQ=60)
TTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGAAGCCAACAGCAACAC > SRR4302518.5134598/1‑101 (MQ=60)
TTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGAAGCCAACAGCAACAC > SRR4302518.4034236/1‑101 (MQ=60)
NNNGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGAAGCCAACAGCAACAC < SRR4302518.9472124/101‑1 (MQ=60)
ACGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAAATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGAAGCCAACAGCAACNNN > SRR4302518.11866488/1‑101 (MQ=60)
NNNGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGAAGCCAACAGCAACACTG < SRR4302518.7484449/101‑1 (MQ=60)
CGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGAAGACAACAGCAACANNN > SRR4302518.13700416/1‑101 (MQ=60)
GTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGAAGCCAACAGCAACACTGA > SRR4302518.4121671/1‑101 (MQ=60)
GTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGAAGCCAACAGCAACACTGA < SRR4302518.6633896/101‑1 (MQ=60)
GTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGAAGCCAACAGCAACACNNN > SRR4302518.10304351/1‑101 (MQ=60)
GTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGAAGCCAACAGCAACACNNN > SRR4302518.13775262/1‑101 (MQ=60)
TGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGAAGCCAACAGCAACACTGAA < SRR4302518.6062784/101‑1 (MQ=60)
TGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTAATGAAGAAGCCAACAGCAACACTGAA < SRR4302518.2313479/101‑1 (MQ=60)
NNNGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGAAGCCAACAGCAACACTGAAG < SRR4302518.12588614/101‑1 (MQ=60)
GTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGAAGCCAACAGCAACACTGAAGA > SRR4302518.6387159/1‑101 (MQ=60)
GTGTTCAGTGCGGTTATCCGCATGTTCAACCTAAAACCGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGAAGCCAACAGCAACACTGAAGA < SRR4302518.5313222/101‑1 (MQ=60)
TGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGAAGCCAACAGCAACACTGAANNN > SRR4302518.10005622/1‑101 (MQ=60)
TGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGAAGCCAACAGCAACACTGAAGAA > SRR4302518.5713148/1‑101 (MQ=60)
agTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGAAGCCAACAGCAACACTGAAGNNN > SRR4302518.12336756/3‑101 (MQ=60)
GTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAACAAGCCAACAGCAACACTGAAGAAG > SRR4302518.7271607/1‑101 (MQ=60)
TTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGAAGCCAACAGCAACACTGAAGANNN > SRR4302518.15027528/1‑101 (MQ=60)
TTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGAAGCCAACAGCAACACTGAAGAAGG > SRR4302518.2263715/1‑101 (MQ=60)
NNNGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGAAGCCAACAGCAACACTGAAGAAGGT < SRR4302518.9193398/101‑1 (MQ=60)
CAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGAAGCCAACAGCAACACTGAAGAAGGTC > SRR4302518.5476766/1‑101 (MQ=60)
AGTTCTGTTATCCGCATGTTTAGCCTTAAAACGCCGGGGCGTGGAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAATAGCAAACAGCAGCACTGAAGgcggtcg > SRR4302518.830445/1‑94 (MQ=40)
TTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGAAGCCAACAGCAACACTGAAGAAGGTCTGA > SRR4302518.1494115/1‑101 (MQ=60)
TTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGAAGCCAACAGCAACACTGAAGAAGGTCTGA < SRR4302518.2559363/101‑1 (MQ=60)
TTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGAAGCCAACAGCAACACTGAAGAAGGCCTGA > SRR4302518.3740503/1‑101 (MQ=60)
CGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGAAGCCAACAGCAACACTGAAGAAGGTCTGACT > SRR4302518.1163959/1‑101 (MQ=60)
CGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGAAGCCAACAGCAACACTGAAGAAGGTCTGACT > SRR4302518.1645661/1‑101 (MQ=60)
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TACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTTGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGAAGCCAACAGCAACACTGAAGAAGGTCTGACT > NC_000913/704136‑704336
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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |