Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
882 |
254.4 |
12957588 |
98.0% |
12698436 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
643,426 |
A→G |
G267G (GGT→GGC) |
rna ← |
RNase I |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 643,426 | 0 | A | G | 99.6%
| 932.3
/ ‑6.1
| 265 | G267G (GGT→GGC) | rna | RNase I |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (148/116); minor base C (1/0); total (149/116) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 276 total aligned reads displayed.
ATTCCTCAATGCAGCGCATTATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAACCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGATGGC > NC_000913/643336‑643515
|
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ttCCTCAATGCAGCGCATTATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGccc > 1:1401076/1‑93 (MQ=255)
tCCTCAATGCAGCGCATTATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCg > 1:946198/1‑93 (MQ=255)
tCCTCAATGCAGCGCATTATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCg > 2:5026303/1‑93 (MQ=255)
tCCTCAATGCAGCGCATTATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCg < 1:659315/93‑1 (MQ=255)
tCCTCAATGCAGCGCATTATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCg < 2:4421260/93‑1 (MQ=255)
cTCAATGCAGCGCATTATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCt > 2:6134575/1‑93 (MQ=255)
tCAATGCAGCGCATTATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCtt > 1:5786769/1‑93 (MQ=255)
aaTGCAGCGCATTATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTa < 1:2758731/93‑1 (MQ=255)
aaTGCAGCGCATTATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTa > 2:640973/1‑93 (MQ=255)
aTGCAGCGCATTATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTat < 2:535614/93‑1 (MQ=255)
tGCAGCGCATTATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTatc < 2:5139575/93‑1 (MQ=255)
tGCAGCGCATTATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTatc > 1:2101610/1‑93 (MQ=255)
tGCAGCGCATTATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTatc < 2:5888967/93‑1 (MQ=255)
gCAGCGCATTATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGCTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTatca > 1:4511999/1‑93 (MQ=255)
cAGCGCATTATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTatcaa > 2:3058223/1‑93 (MQ=255)
gcgcATTATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTatcaatc > 1:5656746/1‑93 (MQ=255)
gcATTATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATcac > 2:5267619/1‑93 (MQ=255)
gcATTATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATcac > 2:3996950/1‑93 (MQ=255)
gcATTATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATcac > 2:4695887/1‑93 (MQ=255)
cATTATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATcaca < 1:481499/93‑1 (MQ=255)
cATTATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATcaca > 1:5221672/1‑93 (MQ=255)
aTTATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACaa > 1:5017687/1‑93 (MQ=255)
aTTATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACaa > 2:5542108/1‑93 (MQ=255)
ttATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACaaa < 2:5784888/93‑1 (MQ=255)
ttATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACaaa > 2:1014465/1‑93 (MQ=255)
tATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATACCCCGCTTTATCAATCACAAAg > 1:1534495/1‑93 (MQ=255)
aTGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAgg < 2:4442508/93‑1 (MQ=255)
aTGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAgg < 1:1475318/93‑1 (MQ=255)
aTGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAgg < 2:2691247/93‑1 (MQ=255)
tGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGt < 1:3838370/93‑1 (MQ=255)
tGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGt > 2:1351708/1‑93 (MQ=255)
tGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGt > 1:2113828/1‑93 (MQ=255)
tGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGt > 1:1095399/1‑93 (MQ=255)
tataAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGttt > 2:3834978/1‑93 (MQ=255)
tataAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGttt < 2:4767128/93‑1 (MQ=255)
ataAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGtttt < 1:4328006/93‑1 (MQ=255)
aaTCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGcc > 1:4212284/1‑93 (MQ=255)
cTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCcaca < 2:1085703/93‑1 (MQ=255)
cTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCcaca < 1:5978915/93‑1 (MQ=255)
cTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCcaca > 1:6158639/1‑93 (MQ=255)
ttAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAg > 1:3228957/1‑93 (MQ=255)
aTCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTa < 1:2140363/93‑1 (MQ=255)
aTCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTa < 2:5449055/93‑1 (MQ=255)
tCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTAc > 2:1946056/1‑93 (MQ=255)
gCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCt < 1:4731144/93‑1 (MQ=255)
gCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCt < 1:1577573/93‑1 (MQ=255)
ccTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTg > 2:2323394/1‑93 (MQ=255)
ccTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTg > 2:2583184/1‑93 (MQ=255)
cTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTgg > 1:1001479/1‑93 (MQ=255)
ttGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTggg > 1:2055506/1‑93 (MQ=255)
ttGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTggg < 2:1650704/93‑1 (MQ=255)
gTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGa < 1:5088566/93‑1 (MQ=255)
gTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGa < 2:2884800/93‑1 (MQ=255)
gTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGa > 2:3310394/1‑93 (MQ=255)
aTGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGtt < 1:1838484/93‑1 (MQ=255)
gAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTtgtg > 2:4151068/1‑93 (MQ=255)
aGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGc > 1:2562601/1‑93 (MQ=255)
gAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGa < 1:848207/93‑1 (MQ=255)
aTTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAAt < 1:4061234/93‑1 (MQ=255)
tAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGa < 1:5193153/93‑1 (MQ=255)
aGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAg > 1:1357970/1‑93 (MQ=255)
aGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAg < 1:2252191/93‑1 (MQ=255)
gCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGt > 1:5405579/1‑93 (MQ=255)
cGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGtt < 2:1230795/93‑1 (MQ=255)
cGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGtt < 1:3024279/93‑1 (MQ=255)
gtgtTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGttt < 1:5515402/93‑1 (MQ=255)
gtgtTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGttt > 1:3645262/1‑93 (MQ=255)
gtgtTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGttt > 1:4433571/1‑93 (MQ=255)
tgtTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTg > 2:1500602/1‑93 (MQ=255)
tttGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAg > 1:2967871/1‑93 (MQ=255)
ttGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGa > 2:3169397/1‑93 (MQ=255)
ttGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGa < 1:4895810/93‑1 (MQ=255)
ttGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGa > 2:5153432/1‑93 (MQ=255)
tGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGaa < 2:481894/93‑1 (MQ=255)
gTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGaaa < 2:879458/93‑1 (MQ=255)
gTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGaaa < 2:3436736/93‑1 (MQ=255)
gTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGaaa > 2:3903392/1‑93 (MQ=255)
gTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGaaa < 1:3514401/93‑1 (MQ=255)
tAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAg > 2:648438/1‑93 (MQ=255)
tAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTCGCAGAAAg > 2:3673238/1‑93 (MQ=255)
aaaTCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGc < 2:2013095/93‑1 (MQ=255)
aaTCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCg > 1:1202083/1‑93 (MQ=255)
aaTCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCg > 2:2507476/1‑93 (MQ=255)
aaTCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCg > 1:1701269/1‑93 (MQ=255)
aTCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCgg < 1:107027/93‑1 (MQ=255)
aTCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCgg < 2:6312070/93‑1 (MQ=255)
cAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAg > 2:2842831/1‑93 (MQ=255)
tgatTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGtt > 2:6266343/1‑93 (MQ=255)
atTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGa < 1:6122105/93‑1 (MQ=255)
ttAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGAt > 1:886655/1‑93 (MQ=255)
ttAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGAt < 1:2614425/93‑1 (MQ=255)
ttAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGAt > 2:2140809/1‑93 (MQ=255)
ttAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGAt < 2:3332635/93‑1 (MQ=255)
taatagCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGATg < 1:3586619/93‑1 (MQ=255)
taatagCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGATg < 2:600993/93‑1 (MQ=255)
aatagCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACGTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATAAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGATgc < 2:295499/93‑2 (MQ=255)
aatagCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGATgg < 2:1740836/93‑1 (MQ=255)
atagCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGATGGc < 2:5452833/93‑1 (MQ=255)
atagCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGATGGc > 1:3129592/1‑93 (MQ=255)
|
ATTCCTCAATGCAGCGCATTATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAACCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGATGGC > NC_000913/643336‑643515
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GGAATTCCTCAATGCAGCGCATTATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAACCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGATGGCGTCA > NC_000913/643333‑643519
|
GGAATTCCTCAATGCAGCGCATTATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAG > SRR4302537.304612/1‑94 (MQ=60)
GGAATTCCTCAATGCAGCGCATTATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAG < SRR4302537.93799/94‑1 (MQ=60)
GGAATTCCTCAATGCAGCGCATTATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAG < SRR4302537.5721712/94‑1 (MQ=60)
GAATTCCTCAATGCAGCGCATTATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGC < SRR4302537.4058473/94‑1 (MQ=60)
GAATTCCTCAATGCAGCGCATTATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGC > SRR4302537.6416699/1‑94 (MQ=60)
GAATTCCTCAATGCAGCGCATTATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGC < SRR4302537.445676/94‑1 (MQ=60)
AATTCCTCAATGCAGCGCATTATGTATAAATCTTAATCGCCTTTGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCC > SRR4302537.4590015/1‑94 (MQ=60)
AATTCCTCAATGCAGCGCATTATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCC > SRR4302537.2940288/1‑94 (MQ=60)
AATTCCTCAATGCAGCGCATTATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCC > SRR4302537.2924934/1‑94 (MQ=60)
AATTCCTCAATGCAGCGCATTATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCC < SRR4302537.583284/94‑1 (MQ=60)
ATTCCTCAATGCAGCGCATTATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCC > SRR4302537.1410839/1‑94 (MQ=60)
TTCCTCAATGCAGCGCATTATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCG > SRR4302537.952738/1‑94 (MQ=60)
TCCTCAATGCAGCGCATTATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGC < SRR4302537.663808/94‑1 (MQ=60)
CCTCAATGCAGCGCATTATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCT > SRR4302537.1924735/1‑94 (MQ=60)
CCTCAATGCAGCGCATTATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCT > SRR4302537.2139988/1‑94 (MQ=60)
CTCAATGCAGCGCATTATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTT > SRR4302537.5826448/1‑94 (MQ=60)
CTCAATGCAGCGCATTATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTT > SRR4302537.2331718/1‑94 (MQ=60)
CAATGCAGCGCATTATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTA > SRR4302537.5549940/1‑94 (MQ=60)
AATGCAGCGCATTATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTAT < SRR4302537.2777988/94‑1 (MQ=60)
AATGCAGCGCATTATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTAT > SRR4302537.2773212/1‑94 (MQ=60)
ATGCAGCGCATTATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATC > SRR4302537.2116432/1‑94 (MQ=60)
TGCAGCGCATTATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCA < SRR4302537.1568180/94‑1 (MQ=60)
TGCAGCGCATTATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGCTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCA > SRR4302537.4543201/1‑94 (MQ=60)
GCAGCGCATTATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAA < SRR4302537.3205547/94‑1 (MQ=60)
CAGCGCATTATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAAT > SRR4302537.3585854/1‑94 (MQ=60)
AGCGCATTATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATC > SRR4302537.5695453/1‑94 (MQ=60)
GCGCATTATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCA < SRR4302537.6113602/94‑1 (MQ=60)
CGCATTATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCAC > SRR4302537.1526577/1‑94 (MQ=60)
CGCATTATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCAC > SRR4302537.851974/1‑94 (MQ=60)
CGCATTATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCAC < SRR4302537.3577838/94‑1 (MQ=60)
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CATTATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAA < SRR4302537.484797/94‑1 (MQ=60)
CATTATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAA < SRR4302537.2120616/94‑1 (MQ=60)
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TTATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATACCCCGCTTTATCAATCACAAAG > SRR4302537.1545215/1‑94 (MQ=60)
TTATGTATAAATCTAAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAG > SRR4302537.5512226/1‑94 (MQ=60)
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ATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGT > SRR4302537.2128723/1‑94 (MQ=60)
ATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGT < SRR4302537.3012280/94‑1 (MQ=60)
ATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGT > SRR4302537.3777935/1‑94 (MQ=60)
ATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGT < SRR4302537.1485570/94‑1 (MQ=60)
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TATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTT < SRR4302537.1402033/94‑1 (MQ=60)
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ATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTG < SRR4302537.4467833/94‑1 (MQ=60)
TAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGC < SRR4302537.258493/94‑1 (MQ=60)
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ATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTAC < SRR4302537.1845475/94‑1 (MQ=60)
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GCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTG < SRR4302537.862801/94‑1 (MQ=60)
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GCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTG < SRR4302537.1588577/94‑1 (MQ=60)
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TGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTG > SRR4302537.3162256/1‑94 (MQ=60)
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GGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGA > SRR4302537.5712958/1‑94 (MQ=60)
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GTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAG < SRR4302537.5123597/94‑1 (MQ=60)
TTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGT < SRR4302537.4805926/94‑1 (MQ=60)
TATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTT < SRR4302537.5331262/94‑1 (MQ=60)
ATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTG < SRR4302537.721644/94‑1 (MQ=60)
ATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTG < SRR4302537.1851278/94‑1 (MQ=60)
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GGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTG < SRR4302537.3056313/94‑1 (MQ=60)
GAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGG < SRR4302537.4108079/94‑1 (MQ=60)
GAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGG < SRR4302537.5250401/94‑1 (MQ=60)
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GACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAA > SRR4302537.4289006/1‑94 (MQ=60)
ACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAG < SRR4302537.1028690/94‑1 (MQ=60)
GAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAA < SRR4302537.854016/94‑1 (MQ=60)
GAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAA > SRR4302537.1976704/1‑94 (MQ=60)
AATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAAT > SRR4302537.2179014/1‑94 (MQ=60)
ATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATG < SRR4302537.4089612/94‑1 (MQ=60)
ATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATG > SRR4302537.2150362/1‑94 (MQ=60)
TTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGA < SRR4302537.866812/94‑1 (MQ=60)
TTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGA > SRR4302537.5242592/1‑94 (MQ=60)
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TTGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAA < SRR4302537.4929613/94‑1 (MQ=60)
TGTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAA > SRR4302537.2078013/1‑94 (MQ=60)
GTAAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAG < SRR4302537.3539265/94‑1 (MQ=60)
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AAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCG > SRR4302537.1210441/1‑94 (MQ=60)
AAATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCG > SRR4302537.1713161/1‑94 (MQ=60)
AATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGG > SRR4302537.1516962/1‑94 (MQ=60)
AATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGG > SRR4302537.2653391/1‑94 (MQ=60)
AATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGG > SRR4302537.49184/1‑94 (MQ=60)
ATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGA > SRR4302537.919882/1‑94 (MQ=60)
ATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGA > SRR4302537.6023026/1‑94 (MQ=60)
ATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGA < SRR4302537.107804/94‑1 (MQ=60)
ATCAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGCTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGA > SRR4302537.5161832/1‑94 (MQ=60)
CAGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGC < SRR4302537.5992644/94‑1 (MQ=60)
AGATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTGGTGGCAAGATTGAGTTGCCAGAAAGCGaacgt > SRR4302537.1196231/1‑89 (MQ=60)
GATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGT > SRR4302537.2850052/1‑94 (MQ=60)
ATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTT > SRR4302537.1082752/1‑94 (MQ=60)
ATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTT > SRR4302537.4382999/1‑94 (MQ=60)
ATGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTT < SRR4302537.1152343/94‑1 (MQ=60)
TGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTG > SRR4302537.1196446/1‑94 (MQ=60)
TGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTG < SRR4302537.3629869/94‑1 (MQ=60)
TGATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTG < SRR4302537.2958038/94‑1 (MQ=60)
GATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGA > SRR4302537.5752443/1‑94 (MQ=60)
ATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGAT > SRR4302537.1307380/1‑94 (MQ=60)
ATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGAT < SRR4302537.6164187/94‑1 (MQ=60)
ATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGAT < SRR4302537.5028682/94‑1 (MQ=60)
ATTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGAT > SRR4302537.892757/1‑94 (MQ=60)
TTAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGATG < SRR4302537.2632712/94‑1 (MQ=60)
TAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGATGG > SRR4302537.5064178/1‑94 (MQ=60)
TAATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGATGG < SRR4302537.3611906/94‑1 (MQ=60)
AATAGCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGATGGC > SRR4302537.3151530/1‑94 (MQ=60)
GCCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGATGGCGTCA < SRR4302537.6036420/94‑1 (MQ=60)
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GGAATTCCTCAATGCAGCGCATTATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAACCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGATGGCGTCA > NC_000913/643333‑643519
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
